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Micro-motion detection by optical coherence tomography (OCT) and its clinical applications

Guan, Guangying January 2015 (has links)
Detection of micro-motion on biological tissues has various applications such as ultrasound elastography and magnetic resonance elastography (MRE). Ultrasound transducers, the most commonly used tool to detect endogenous and exogenous micro-motions, have a number of drawbacks: including the requirements of the physical contact with the sample and limited spatial resolution (millimetre scale). The aim of this thesis is to develop a non-contact phase-sensitive imaging technique which is suitable for functional imaging in the micron range which also has the potential for quantitative analysis of relative properties resulting from an appropriate image processing. Concerning imaging techniques, this thesis focused on optical coherence tomography (OCT) and in particular on phase-sensitive optical coherence tomography (PhS-OCT). In this thesis, a PhS-OCT system is developed for micro-motion detection and a dual camera PhS-OCT system is developed to double the imaging acquiring speed and improve the sensitivity to small phase change. Two applications of PhS-OCT combining micro-motions detection are preformed: 1) Photo-thermal OCT (PT-OCT) system is developed to detect the photo-thermal phenomenon of nanoparticles. A mathematic model is proposed to analyse and reconstruct the distribution of nanoparticles in biological tissues. 2) A quantitative 3D optical coherence elastography (OCE) system and algorithm are developed to analysis the mechanical property of tissue. A feasibility study is carried for the diagnosis of prostate cancer (PCa) using this technique. Results show that PhS-OCT is a powerful tool for the detection of micro-motions (micron range). Functional OCT based on it such as PT-OCT and OCE offers potential in diagnostic and therapeutic in clinical applications, e.g. PT-OCT can be used to detect and map the distribution and concentration of dye and drug in tissues or organs. 3D OCE can provide useful information for early localization and diagnosis of cancer.
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Multiple path configurations for optical coherence tomography at 1050 nm

Neagu, Liviu January 2011 (has links)
No description available.
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Desenvolvimento de um algoritimo otimizado para caracterização de fluxos microfluídicos utilizando padrões de speckle presentes no sinal de Tomografia por Coerência Óptica / Development of an optimized algorithm for the characterization of microflow using speckle patterns present in optical coherence tomography signal

Pretto, Lucas Ramos de 20 March 2015 (has links)
O presente trabalho abordou o sistema de Tomografia por Coerência Óptica (OCT) e sua aplicação à área de microfluídica. Para tanto, foram realizados testes de caracterização física de circuitos microfluídicos, utilizando modelos 3D (tridimensionais) construídos a partir de imagens de OCT destes circuitos. A técnica foi, assim, avaliada como potencial ferramenta de auxílio na aferição de microcanais. Indo além, este trabalho estuda e desenvolve técnicas de análise para fluxos microfluídicos, em especial técnicas baseadas no padrão de speckle. Em primeiro momento, métodos já existentes foram estudados e aprimorados, como o Speckle Variance OCT, em que foi obtido um ganho de 31% em tempo de processamento. Outros métodos, como o LASCA (Laser speckle Contrast Analysis), baseados na autocorrelação de speckle, são adaptados às imagens de OCT. Derivado do LASCA, o método de análise desenvolvido baseado na autocorrelação de intensidade motivou o desenvolvimento de um arranjo de OCT próprio e software de aquisição customizado, com taxa de amostragem da ordem de 8 kHz. O método proposto foi, então, capaz de distinguir fluxos volumétricos variados, e seus limites de detecção foram testados, comprovando sua viabilidade de aplicação para análise de movimento browniano e fluxos volumétricos abaixo de 10 μl/min. / This work discusses the Optical Coherence Tomography system (OCT) and its application to the microfluidics area. To this end, physical characterization of microfluidic circuits were performed using 3D (three-dimensional) models constructed from OCT images of such circuits. The technique was thus evaluated as a potential tool to aid in the inspection of microchannels. Going further, this workpaper studies and develops analytical techniques for microfluidic flow, in particular techniques based on speckle pattern. In the first instance, existing methods were studied and improved, such as Speckle Variance - OCT, where a gain of 31% was obtained in processing time. Other methods, such as LASCA (Laser Speckle Contrast Analysis), based on speckle autocorrelation, are adapted to OCT images. Derived from LASCA, the developed analysis technique based on intensity autocorrelation motivated the development of a custom OCT system as well as an optimized acquisition software, with a sampling rate of 8 kHz. The proposed method was, then, able to distinguish different flow rates, and limits of detection were tested, proving its feasibility for implementation on Brownian motion analysis and flow rates below 10 μl/min.
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Desenvolvimento de biofilme formado por Candida albicans in vitro para estudo do efeito fotodinâmico / Candida albicans BIOFILM DEVELOPMENT IN VITRO FOR PHOTODYNAMIC THERAPY STUDY

Suzuki, Luis Claudio 25 September 2009 (has links)
A terapia fotodinâmica, do inglês photodynamic therapy (PDT) é uma fototerapia baseada na utilização de um fotossensibilizador (FS) na presença da luz em baixa intensidade em comprimento de onda ressonante à absorção do FS e que podem sensibilizar sistemas biológicos, gerando espécies reativas de oxigênio. Estudos mostram que a PDT apresenta um efeito letal em Candida albicans. O biofilme formado por C. albicans é a causa mais freqüente de infecções associadas a cateteres, possuindo uma comprovada resistência a antifúngicos, sendo que a remoção do cateter colonizado é quase sempre necessária. No entanto, poucos trabalhos na literatura relatam o comportamento e a resposta de C. albicans organizado em biofilme frente à PDT. Os objetivos deste trabalho foram desenvolver uma metodologia para formação in vitro de biofilme de C. albicans, verificar a sensibilidade do biofilme de C. albicans frente à terapia fotodinâmica antimicrobiana utilizando como FS o azul de metileno (AM) e a hipocrelina B:La+3 e analisar o biofilme através da Tomografia de Coerência Óptica (OCT) antes e depois da PDT. Para a formação do biofilme, foram confeccionados discos de silicone elastomérico oriundos de cateteres. Os fotossensibilizadores foram diluídos em solução de PBS, sendo que o AM teve duas concentrações diferentes testadas no biofilme: 100M e 1mM e a HBLa+3 somente uma de 10M. A irradiação de ambos os corantes com os microrganismos foi feita através de dois LEDs diferentes, um vermelho com = 630nm ± 20nm e outro azul com = 460nm ± 30nm. Foi realizada uma curva de fração de sobrevivência em função do tempo de irradiação de cada amostra com biofilme e de suspensão do microrganismo em formato de leveduras para verificar a susceptibilidade destes frente à PDT. As leveduras apresentaram 100% de redução em ambos os fotossensibilizadores, porém em tempos de irradiação diferentes (30s para a HBLa+3 e 6 min para o AM na concentração de 100M). Quando a terapia foi aplicada em biofilme, o AM em 100M não apresentou nenhuma redução significativa, enquanto que em concentração de 1mM houve redução de 100% após 6 min de irradiação. Já a HBLa+3 mostrou pouca redução em biofilme na concentração de 10M (menos de 1 log de redução. Concluímos que o microrganismo C. albicans se organizou em biofilme padronizado nos discos elastoméricos oriundos de cateteres e através do OCT, o biofilme medido apresentou 110m de espessura, informando uma mudança óptica ao ser submetido pela PDT com o AM 1mM. / Photodynamic therapy (PDT) is a phototherapy based on the use of a photosensitizer (PS) in the presence of low intensity light with resonant wavelength of absorption of the PS and biological systems that can raise awareness, generating reactive oxygen species. Studies show that PDT has a lethal effect on Candida albicans. The biofilm formed by C. albicans is the cause of infections associated with medical devices such as catheters, with a proven resistance to antifungal agents, and the removal of the catheter colonized almost always is necessary. However, few studies in literature report the behavior and response of biofilm organized by C. albicans against PDT. The aims of this study were to develop a methodology for in vitro biofilm formation of C. albicans, evaluate the sensitivity of the biofilm of C. albicans to antimicrobial photodynamic therapy using PS as the methylene blue (MB) and hypocrellin B: La+3 (HBLa+3) and analyze the biofilm by Optical Coherence Tomography (OCT). For biofilm formation, discs were made from elastomeric silicone catheters. The PS were dissolved in solution of PBS, and the MB had two different concentrations tested in the biofilm: 100M and 1mM; HBLa+3 only one of 10M. The irradiation of both dyes with the microorganism was done by two different LEDs, one with red emission at = 630nm ± 20nm and the other one blue emission at = 460nm ± 30nm. We performed a curve of survival fraction versus time of irradiation of each sample with biofilm and suspension of the microorganism in the yeast form to verify the susceptibility of the front PDT. The yeast showed 100% reduction using both PS, but at different times of irradiation (30s to HBLa+3 and 6 min for the MB at 100M). When the therapy was applied in biofilm, the MB 100M did not show any significant reduction, while at concentration of 1mM was reduced by 100% after 6 min of irradiation. The HBLa+3 biofilm group showed a lower reduction in the concentration of 10M in biofilm (less than 1 log reduction). OCT was performed for visualization and measurement of the thickness of the biofilm formed. The composition of the extracellular matrix of the biofilm polymer hindered the diffusion of PS inside, requiring higher concentrations of MB to disseminate it and to obtain satisfactory reduction for PDT. HBLa+3 group, in higher concentration, formed aggregates difficulting its use for PDT. We conclude that the organism C. albicans was organized in biofilms in a standardized way using elastomeric discs from catheters and the OCT showed that the biofilm measured 110m at thickness, showing an optical change when subjected to the PDT with MB 1mM.
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Desenvolvimento de um sistema de tomografia por coerência óptica no domínio de Fourier sinsível á polarização e sua utilização na determinação das matrizes de Mueller / Development of an Polarization Sensitive Fourier Domain Optical Coherence Tomography and it Utilization on the Mueller Matrix Determination

Raele, Marcus Paulo 02 October 2009 (has links)
Este estudo abordou os aspectos teóricos e experimentais relacionados ao desenvolvimento de um sistema de tomografia por coerência óptica (OCT) no domínio de Fourier sensível à polarização (PS-FD-OCT) e a sua utilização na determinação da Matriz de Mueller (MM-OCT). O estudo iniciou-se com uma revisão bibliográfica que abordou desde os primeiros estudos relacionados à técnica até o estado da arte, bem como o formalismo matemático da interferometria de baixa coerência no domínio espectral e polarização da luz. Realizaram-se estudos baseados em simulação numérica sobre três tipos diferentes de algoritmos, responsáveis pela recuperação do sinal de espalhamento, sendo eles: a Transformada de Fourier Direta; Interpolação e Zero-Filling. Ao fim dessa etapa concluiu-se que o algoritmo Zero-Filling 2N apresentou melhores características quando comparado aos outros algoritmos. Na parte experimental, primeiramente, diferentes arranjos OCT foram montados e medidas realizadas para verificação aspectos relacionados à teoria. Consecutivamente, utilizando uma amostra polimérica, realizaram-se imagens de birrefringência, que permitiram a determinação da birrefringência da amostra quantitativamente. Finalmente, imagens em diferentes estados de polarização foram realizadas, através delas determinou-se as imagens referentes aos elementos das Matrizes de Mueller, que foram analisadas individualmente. / This study approached theoretical and experimental aspects related with the development of a polarization sensitive, Fourier domain, optical coherence tomography system (PS-FD-OCT) and its utilization on the Mueller Matrix determination. This work began with a bibliographic revision, which describes since the early studies to the actual state of the art of the technique. The mathematical formalism of Fourier domain low coherence interferometry and light polarization was performed as well. Studies based on numerical simulations, of three different algorithm types, responsible to recover the scattering profile, were done. The implemented algorithms were: Direct Fourier Transform, Interpolation and Zero-Filling. By the end of the simulation study, was possible to conclude that the algorithm Zero-Filling 2N presented better characteristics when compared with the others. In the experimental part, firstly different OCT setups were assembled and measurements were done in order to verify aspects related with the theory. Then, using a polymeric sample, birefringence images were performed, which allowed determining the sample birefringence quantitatively. Finally, images taken of different polarization states were collected, and through then images related with the Mueller Matrix elements were calculated, which were analyzed individually.
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Estudo comparativo entre a angiografia por OCT e a angiografia aom fluoresceína sódica sa maculopatia isquêmica diabética / Comparison between OCT angiography and fluorescein angiography on diabetic macular ischemia diagnosis

Garcia, José Mauricio Botto de Barros 13 December 2016 (has links)
Submitted by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2016-12-16T12:50:27Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - José Mauricio Botto de Barros Garcia - 2016.pdf: 8123708 bytes, checksum: 41021cfcb75d07dae209731f1c85e1a6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2016-12-16T12:51:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - José Mauricio Botto de Barros Garcia - 2016.pdf: 8123708 bytes, checksum: 41021cfcb75d07dae209731f1c85e1a6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-16T12:51:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - José Mauricio Botto de Barros Garcia - 2016.pdf: 8123708 bytes, checksum: 41021cfcb75d07dae209731f1c85e1a6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-12-13 / The purpose of this study is to compare fluorescein angiography and optical coherence tomography (OCT) angiography images of foveal avascular zone (FAZ) in patients with diabetic retinopathy (DR) with and without diabetic macular ischemia. Regarding our methods, the Wilcoxon signedrank test was used to compare area measurements and P values of < 0.05 were considered statistically significant. Fluorescein angiography and OCT angiography images were independently graded by 2 observers that reached agreement regarding quantitative diabetic macular ischemia according established protocols. The ischemic area was divided into “moderate” and ‘‘large’’ macular ischemia (with diabetic macular ischemia) and ‘‘small’’ (without diabetic macular ischemia) groups. Quantitative analyses of the FAZ were performed using custom software (ImageJ64; National Institute of Health - NIH; http://rsbweb.nih.gov/ij/; public domain). Considering our results, thirty-four eyes from 34 diabetic patients were enrolled. Subjects with diabetic macular ischemia presented a mean area on fluorescein angiography and OCT angiography of 0.68 + 0.53 mm2 and 0.58 + 0.35 mm2, respectively (p = 0.1374). Patients without diabetic macular ischemia presented a mean area on fluorescein angiography and OCT angiography of 0.19 + 0.67 mm2 and 0.20 + 0.79 mm2, respectively (p = 0.9594). The ICC for the FAZ measurements between the 2 observers on fluorescein angiography and OCT angiography was 0.96 and 0.92, respectively. Thereby, OCT angiography may represent a novel technique for the diagnosis of diabetic macular ischemia and could become an alternative to FA for this purpose. / O objetivo do presente estudo é comparar as imagens da zona avascular foveal (ZAF) obtidas por meio da angiografia fluorescente e da angiografia por OCT em pacientes com retinopatia diabética (RD), com e sem maculopatia isquêmica diabética. Na metodologia, o Wilcoxon signed-rank test foi usado para comparar as medidas de área e o P valor menor que 0,05 foi considerado estatisticamente significativo. As imagens de angiografia fluorescente e angiografia por OCT foram classificadas de maneira independente por dois observadores. A área de isquemia foi dividida em isquemia macular “moderada” e “grande” (com maculopatia isquêmica diabética) e “pequena” (sem maculopatia isquêmica diabética). Análises quantitativas da ZAF foram realizadas usando software adequado (ImageJ64; (National Institute of Health - NIH; http://rsbweb.nih.gov/ij/ sob domínio público). De acordo com os nossos resultados, trinta e quatro olhos de 34 pacientes com retinopatia diabética foram avaliados. Indivíduos com maculopatia isquêmica diabética apresentaram uma área média na angiografia fluorescente e angiografia por OCT de 0,68 + 0,53 mm2 e 0,58 + 0,35 mm2, respectivamente (p = 0,1374). Pacientes sem maculopatia isquêmica diabética apresentaram uma área media na angiografia fluorescente e angiografia por OCT de 0,19 + 0,67 mm2 e 0,20 + 0,79 mm2 respectivamente (p = 0,9594). O ICC para as medidas de ZAF entre os dois examinadores usando angiografia fluorescente e angiografia por OCT foi de 0,96 e 0,92, respectivamente, demonstrando a concordância entre os examinadores nas medidas da ZAF. Concluiu-se que, a angiografia por OCT pode representar uma nova técnica para o diagnóstico de maculopatia isquêmica diabética, e pode vir a ser uma alternativa à angiografia fluorescente para este propósito.
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Desenvolvimento de um sistema de tomografia por coerência óptica no domínio de Fourier sinsível á polarização e sua utilização na determinação das matrizes de Mueller / Development of an Polarization Sensitive Fourier Domain Optical Coherence Tomography and it Utilization on the Mueller Matrix Determination

Marcus Paulo Raele 02 October 2009 (has links)
Este estudo abordou os aspectos teóricos e experimentais relacionados ao desenvolvimento de um sistema de tomografia por coerência óptica (OCT) no domínio de Fourier sensível à polarização (PS-FD-OCT) e a sua utilização na determinação da Matriz de Mueller (MM-OCT). O estudo iniciou-se com uma revisão bibliográfica que abordou desde os primeiros estudos relacionados à técnica até o estado da arte, bem como o formalismo matemático da interferometria de baixa coerência no domínio espectral e polarização da luz. Realizaram-se estudos baseados em simulação numérica sobre três tipos diferentes de algoritmos, responsáveis pela recuperação do sinal de espalhamento, sendo eles: a Transformada de Fourier Direta; Interpolação e Zero-Filling. Ao fim dessa etapa concluiu-se que o algoritmo Zero-Filling 2N apresentou melhores características quando comparado aos outros algoritmos. Na parte experimental, primeiramente, diferentes arranjos OCT foram montados e medidas realizadas para verificação aspectos relacionados à teoria. Consecutivamente, utilizando uma amostra polimérica, realizaram-se imagens de birrefringência, que permitiram a determinação da birrefringência da amostra quantitativamente. Finalmente, imagens em diferentes estados de polarização foram realizadas, através delas determinou-se as imagens referentes aos elementos das Matrizes de Mueller, que foram analisadas individualmente. / This study approached theoretical and experimental aspects related with the development of a polarization sensitive, Fourier domain, optical coherence tomography system (PS-FD-OCT) and its utilization on the Mueller Matrix determination. This work began with a bibliographic revision, which describes since the early studies to the actual state of the art of the technique. The mathematical formalism of Fourier domain low coherence interferometry and light polarization was performed as well. Studies based on numerical simulations, of three different algorithm types, responsible to recover the scattering profile, were done. The implemented algorithms were: Direct Fourier Transform, Interpolation and Zero-Filling. By the end of the simulation study, was possible to conclude that the algorithm Zero-Filling 2N presented better characteristics when compared with the others. In the experimental part, firstly different OCT setups were assembled and measurements were done in order to verify aspects related with the theory. Then, using a polymeric sample, birefringence images were performed, which allowed determining the sample birefringence quantitatively. Finally, images taken of different polarization states were collected, and through then images related with the Mueller Matrix elements were calculated, which were analyzed individually.
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Desenvolvimento de biofilme formado por Candida albicans in vitro para estudo do efeito fotodinâmico / Candida albicans BIOFILM DEVELOPMENT IN VITRO FOR PHOTODYNAMIC THERAPY STUDY

Luis Claudio Suzuki 25 September 2009 (has links)
A terapia fotodinâmica, do inglês photodynamic therapy (PDT) é uma fototerapia baseada na utilização de um fotossensibilizador (FS) na presença da luz em baixa intensidade em comprimento de onda ressonante à absorção do FS e que podem sensibilizar sistemas biológicos, gerando espécies reativas de oxigênio. Estudos mostram que a PDT apresenta um efeito letal em Candida albicans. O biofilme formado por C. albicans é a causa mais freqüente de infecções associadas a cateteres, possuindo uma comprovada resistência a antifúngicos, sendo que a remoção do cateter colonizado é quase sempre necessária. No entanto, poucos trabalhos na literatura relatam o comportamento e a resposta de C. albicans organizado em biofilme frente à PDT. Os objetivos deste trabalho foram desenvolver uma metodologia para formação in vitro de biofilme de C. albicans, verificar a sensibilidade do biofilme de C. albicans frente à terapia fotodinâmica antimicrobiana utilizando como FS o azul de metileno (AM) e a hipocrelina B:La+3 e analisar o biofilme através da Tomografia de Coerência Óptica (OCT) antes e depois da PDT. Para a formação do biofilme, foram confeccionados discos de silicone elastomérico oriundos de cateteres. Os fotossensibilizadores foram diluídos em solução de PBS, sendo que o AM teve duas concentrações diferentes testadas no biofilme: 100M e 1mM e a HBLa+3 somente uma de 10M. A irradiação de ambos os corantes com os microrganismos foi feita através de dois LEDs diferentes, um vermelho com = 630nm ± 20nm e outro azul com = 460nm ± 30nm. Foi realizada uma curva de fração de sobrevivência em função do tempo de irradiação de cada amostra com biofilme e de suspensão do microrganismo em formato de leveduras para verificar a susceptibilidade destes frente à PDT. As leveduras apresentaram 100% de redução em ambos os fotossensibilizadores, porém em tempos de irradiação diferentes (30s para a HBLa+3 e 6 min para o AM na concentração de 100M). Quando a terapia foi aplicada em biofilme, o AM em 100M não apresentou nenhuma redução significativa, enquanto que em concentração de 1mM houve redução de 100% após 6 min de irradiação. Já a HBLa+3 mostrou pouca redução em biofilme na concentração de 10M (menos de 1 log de redução. Concluímos que o microrganismo C. albicans se organizou em biofilme padronizado nos discos elastoméricos oriundos de cateteres e através do OCT, o biofilme medido apresentou 110m de espessura, informando uma mudança óptica ao ser submetido pela PDT com o AM 1mM. / Photodynamic therapy (PDT) is a phototherapy based on the use of a photosensitizer (PS) in the presence of low intensity light with resonant wavelength of absorption of the PS and biological systems that can raise awareness, generating reactive oxygen species. Studies show that PDT has a lethal effect on Candida albicans. The biofilm formed by C. albicans is the cause of infections associated with medical devices such as catheters, with a proven resistance to antifungal agents, and the removal of the catheter colonized almost always is necessary. However, few studies in literature report the behavior and response of biofilm organized by C. albicans against PDT. The aims of this study were to develop a methodology for in vitro biofilm formation of C. albicans, evaluate the sensitivity of the biofilm of C. albicans to antimicrobial photodynamic therapy using PS as the methylene blue (MB) and hypocrellin B: La+3 (HBLa+3) and analyze the biofilm by Optical Coherence Tomography (OCT). For biofilm formation, discs were made from elastomeric silicone catheters. The PS were dissolved in solution of PBS, and the MB had two different concentrations tested in the biofilm: 100M and 1mM; HBLa+3 only one of 10M. The irradiation of both dyes with the microorganism was done by two different LEDs, one with red emission at = 630nm ± 20nm and the other one blue emission at = 460nm ± 30nm. We performed a curve of survival fraction versus time of irradiation of each sample with biofilm and suspension of the microorganism in the yeast form to verify the susceptibility of the front PDT. The yeast showed 100% reduction using both PS, but at different times of irradiation (30s to HBLa+3 and 6 min for the MB at 100M). When the therapy was applied in biofilm, the MB 100M did not show any significant reduction, while at concentration of 1mM was reduced by 100% after 6 min of irradiation. The HBLa+3 biofilm group showed a lower reduction in the concentration of 10M in biofilm (less than 1 log reduction). OCT was performed for visualization and measurement of the thickness of the biofilm formed. The composition of the extracellular matrix of the biofilm polymer hindered the diffusion of PS inside, requiring higher concentrations of MB to disseminate it and to obtain satisfactory reduction for PDT. HBLa+3 group, in higher concentration, formed aggregates difficulting its use for PDT. We conclude that the organism C. albicans was organized in biofilms in a standardized way using elastomeric discs from catheters and the OCT showed that the biofilm measured 110m at thickness, showing an optical change when subjected to the PDT with MB 1mM.
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Desenvolvimento de um algoritimo otimizado para caracterização de fluxos microfluídicos utilizando padrões de speckle presentes no sinal de Tomografia por Coerência Óptica / Development of an optimized algorithm for the characterization of microflow using speckle patterns present in optical coherence tomography signal

Lucas Ramos de Pretto 20 March 2015 (has links)
O presente trabalho abordou o sistema de Tomografia por Coerência Óptica (OCT) e sua aplicação à área de microfluídica. Para tanto, foram realizados testes de caracterização física de circuitos microfluídicos, utilizando modelos 3D (tridimensionais) construídos a partir de imagens de OCT destes circuitos. A técnica foi, assim, avaliada como potencial ferramenta de auxílio na aferição de microcanais. Indo além, este trabalho estuda e desenvolve técnicas de análise para fluxos microfluídicos, em especial técnicas baseadas no padrão de speckle. Em primeiro momento, métodos já existentes foram estudados e aprimorados, como o Speckle Variance OCT, em que foi obtido um ganho de 31% em tempo de processamento. Outros métodos, como o LASCA (Laser speckle Contrast Analysis), baseados na autocorrelação de speckle, são adaptados às imagens de OCT. Derivado do LASCA, o método de análise desenvolvido baseado na autocorrelação de intensidade motivou o desenvolvimento de um arranjo de OCT próprio e software de aquisição customizado, com taxa de amostragem da ordem de 8 kHz. O método proposto foi, então, capaz de distinguir fluxos volumétricos variados, e seus limites de detecção foram testados, comprovando sua viabilidade de aplicação para análise de movimento browniano e fluxos volumétricos abaixo de 10 &mu;l/min. / This work discusses the Optical Coherence Tomography system (OCT) and its application to the microfluidics area. To this end, physical characterization of microfluidic circuits were performed using 3D (three-dimensional) models constructed from OCT images of such circuits. The technique was thus evaluated as a potential tool to aid in the inspection of microchannels. Going further, this workpaper studies and develops analytical techniques for microfluidic flow, in particular techniques based on speckle pattern. In the first instance, existing methods were studied and improved, such as Speckle Variance - OCT, where a gain of 31% was obtained in processing time. Other methods, such as LASCA (Laser Speckle Contrast Analysis), based on speckle autocorrelation, are adapted to OCT images. Derived from LASCA, the developed analysis technique based on intensity autocorrelation motivated the development of a custom OCT system as well as an optimized acquisition software, with a sampling rate of 8 kHz. The proposed method was, then, able to distinguish different flow rates, and limits of detection were tested, proving its feasibility for implementation on Brownian motion analysis and flow rates below 10 &mu;l/min.
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Concordance of objectively-detected retinal nerve fiber bundle defects in en face OCT images with conventional structural and functional changes in glaucoma.

Cheloni, Riccardo, Denniss, Jonathan 15 September 2022 (has links)
Yes / To assess how objectively-detected defects of retinal nerve fibre bundle (RNFB) reflectance in en face OCT images relate to circumpapillary retinal nerve fibre layer thickness (cpRNFLT) and visual field defects. Cross-sectional study. 16 participants with early-glaucoma and 29 age-similar healthy controls, among which 22 had usable en face images to establish normative levels of RNFB reflectance. All participants underwent cpRNFLT scans, visual field examination and wide-field OCT. En face reflectivity was assessed objectively using the Summary of Multiple Anatomically-Adjusted Slabs (SMAS) method. En face defects were deemed concordant with cpRNFLT when they had at least one cpRNFLT point with p

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