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[en] WORKFLOW FOR BIOINFORMATICS / [pt] WORKFLOW PARA BIOINFORMÁTICA

MELISSA LEMOS 11 February 2005 (has links)
[pt] Os projetos para estudo de genomas partem de uma fase de sequenciamento onde são gerados em laboratório dados brutos, ou seja, sequências de DNA sem significado biológico. As sequências de DNA possuem códigos responsáveis pela produção de proteínas e RNAs, enquanto que as proteínas participam de todos os fenômenos biológicos, como a replicação celular, produção de energia, defesa imunológica, contração muscular, atividade neurológica e reprodução. As sequências de DNA, RNA e proteínas são chamadas nesta tese de biossequências. Porém, o grande desafio destes projetos consiste em analisar essas biossequências, e obter informações biologicamente relevantes. Durante a fase de análise, os pesquisadores usam diversas ferramentas, programas de computador, e um grande volume de informações armazenadas em fontes de dados de Biologia Molecular. O crescente volume e a distribuição das fontes de dados e a implementação de novos processos em Bioinformática facilitaram enormemente a fase de análise, porém criaram uma demanda por ferramentas e sistemas semi-automáticos para lidar com tal volume e complexidade. Neste cenário, esta tese aborda o uso de workflows para compor processos de Bioinformática, facilitando a fase de análise. Inicialmente apresenta uma ontologia modelando processos e dados comumente utilizados em Bioinformática. Esta ontologia foi derivada de um estudo cuidadoso, resumido na tese, das principais tarefas feitas pelos pesquisadores em Bioinformática. Em seguida, a tese propõe um framework para um sistema de gerência de análises em biossequências, composto por dois sub-sistemas. O primeiro é um sistema de gerência de workflows de Bioinformática, que auxilia os pesquisadores na definição, validação, otimização e execução de workflows necessários para se realizar as análises. O segundo é um sistema de gerência de dados em Bioinformática, que trata do armazenamento e da manipulação dos dados envolvidos nestas análises. O framework inclui um gerente de ontologias, armazenando ontologias para Bioinformática, nos moldes da apresentada anteriormente. Por fim, a tese descreve instanciações do framework para três tipos de ambiente de trabalho comumente encontrados e sugestivamente chamados de ambiente pessoal, ambiente de laboratório e ambiente de comunidade. Para cada um destes ambientes, a tese discute em detalhe os aspectos particulares da execução e otimização de workflows. / [en] Genome projects usually start with a sequencing phase, where experimental data, usually DNA sequences, is generated, without any biological interpretation. DNA sequences have codes which are responsible for the production of protein and RNA sequences, while protein sequences participate in all biological phenomena, such as cell replication, energy production, immunological defense, muscular contraction, neurological activity and reproduction. DNA, RNA and protein sequences are called biosequences in this thesis. The fundamental challenge researchers face lies exactly in analyzing these sequences to derive information that is biologically relevant. During the analysis phase, researchers use a variety of analysis programs and access large data sources holding Molecular Biology data. The growing number of Bioinformatics data sources and analysis programs indeed enormously facilitated the analysis phase. However, it creates a demand for systems that facilitate using such computational resources. Given this scenario, this thesis addresses the use of workflows to compose Bioinformatics analysis programs that access data sources, thereby facilitating the analysis phase. An ontology modeling the analysis program and data sources commonly used in Bioinformatics is first described. This ontology is derived from a careful study, also summarized in the thesis, of the computational resources researchers in Bioinformatics presently use. A framework for biosequence analysis management systems is next described. The system is divided into two major components. The first component is a Bioinformatics workflow management system that helps researchers define, validate, optimize and run workflows combining Bioinformatics analysis programs. The second component is a Bioinformatics data management system that helps researchers manage large volumes of Bioinformatics data. The framework includes an ontology manager that stores Bioinformatics ontologies, such as that previously described. Lastly, instantiations for the Bioinformatics workflow management system framework are described. The instantiations cover three types of working environments commonly found and suggestively called personal environment, laboratory environment and community environment. For each of these instantiations, aspects related to workflow optimization and execution are carefully discussed.
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Reconhecimento de Atividades em casas inteligentes: uma abordagem não intrusiva explorando processamento semântico / Recognition Activities in Smart Home: A Non- Intrusive Approach Exploring Semantic Processing

Abreu, Eduardo Soares de 29 May 2017 (has links)
Submitted by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-04-19T12:36:54Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_eduardo_soares_de_abreu.pdf: 4224104 bytes, checksum: fc46a837bb512d7f07fb7941f7cd362d (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-04-19T14:43:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_eduardo_soares_de_abreu.pdf: 4224104 bytes, checksum: fc46a837bb512d7f07fb7941f7cd362d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-19T14:44:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_eduardo_soares_de_abreu.pdf: 4224104 bytes, checksum: fc46a837bb512d7f07fb7941f7cd362d (MD5) Previous issue date: 2017-05-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Nos últimos anos, as técnicas de Reconhecimento de Atividades têm atraído atenção crescente. Entre as muitas aplicações, um interesse especial está no domínio ubíquo da e-Health, onde o reconhecimento automático de atividades é usado em sistemas de reabilitação, gerenciamento de doenças crônicas, monitoramento de idosos, bem como em aplicações de bem-estar pessoal. Esse interesse tem tido como motivação o envelhecimento da população. Este envelhecimento resulta em significativos desafios socioeconômicos no setor da saúde pública, bem como na incidência de doenças crônico-degenerativas, sendo a demência uma das mais preocupantes. Uma alternativa que vem sendo amplamente proposta é a utilização de casas inteligentes (ambiente assistido de vivência), nos quais as residências das pessoas sob tratamento deverão contemplar serviços computacionais que possam auxiliá-las nas suas práticas diárias, de forma o mais transparente possível. Este trabalho tem como acrônimo EXEHDA-AR (EXEHDA-Activity Recognition), e seu objetivo principal é contribuir com o Subsistema de Reconhecimento de Contexto e Adaptação do middleware EXEHDA (Execution Environment for Highly Distributed Applications) capacitando-o para o atendimento das demandas do Reconhecimento de Atividades, explorando para isto uma abordagem baseada em Ciência de Contexto. O EXEHDA-AR explora processamento semântico para prover Reconhecimento de Atividades em Casas Inteligentes, para tanto foram propostos componentes a serem integrados ao middleware EXEHDA, bem como um modelo ontológico. Os dados de contexto coletados são agrupados segundo o conceito de janela de tempo deslizante. Quando avaliado o EXEHDA-AR obteve uma acurácia média de 94,36% no Reconhecimento de Atividades. Estes resultados apontam que métodos baseados em processamento semântico constituem uma alternativa viável para o reconhecimento de Atividades com baixo nível de intrusão, indicando a continuidade dos esforços de pesquisa. / In recent years, the techniques of Activity Recognition have attracted increasing attention. Among the many applications, special interest lies in the ubiquitous domain of e-Health, where automatic activity recognition is used in rehabilitation systems, chronic disease management, elderly monitoring, as well as in personal wellness applications. This interest has been motivated by the aging of the population. This aging results in significant socioeconomic challenges in the public health sector, as well as in the incidence of chronic-degenerative diseases, with dementia being one of the most worrying. An alternative that has been widely proposed is the use of intelligent houses (ambient assisted living), in which the residences of people under treatment should contemplate computational services that can assist them in their daily practices, in the most transparent way possible. This work has the acronym EXEHDA-AR (EXEHDA-Activity Recognition), and its main objective is to contribute with the Context Recognition and Adaptation Subsystem of the EXEHDA (Execution Environment for Highly Distributed Applications) middleware, enabling it to meet the demands Of Activity Recognition, using a Context Awareness approach. The EXEHDA-AR explores semantic processing to provide Activity Recognition in smart home, for which we have proposed components to be integrated with the EXEHDA middleware as well as an ontological model. The collected context data are grouped according to the concept of time-sliding window. When evaluated the EXEHDA-AR obtained an average accuracy of 94.36% in the Recognition of Activities. These results indicate that methods based on semantic processing constitute a viable alternative for the Recognition of Activities with low level of intrusion, indicating the continuity of research efforts.
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Uma crítica fenomenológica à tese de Kant sobre o Ser: da linguagem-utensílo à linguagem-constituição / A phenomenological critique of Kant's thesis on Being

Fabricio Borges Macedo 28 February 2011 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho visa realizar os primeiros passos de um projeto mais longo, cujo objetivo é determinar o sentido daquilo que entendemos como pergunta pelo sentido do ser; junto a isso, se tem aqui igualmente o propósito de pensar a metodologia que acaso venha a ser adequada, isto é, o tratamento específico que possa alguma vez dar a tal questionamento um desenvolvimento legítimo. O caminho por nós adotado partirá de Kant por motivos estratégicos, principalmente pela razão de encontrarmos aí uma tese declarada sobre ser, que lhe concede um sentido unitário: ao comentá-la, reconstruindo-a por meio da apresentação de alguns de seus momentos, estaremos nos utilizando da mesma para apontar aquilo que acreditamos constituir uma corrupção de sentido nas suas próprias bases, permitindo compreender as dificuldades lançadas pela questão que, assim nos parece, são as mesmas que terminam por gerar as confusões que perfazem a própria história da metafísica. Isto significa que nossa discussão do caso kantiano - embora vise diretamente a filosofia crítica e todo projeto de uma teoria das faculdades - deverá cunhar resultados mais amplos, já mesmo porque, a partir dela, viremos mesmo a afirmar a total inadequação de uma abordagem do sentido do ser sob o ponto de vista do comportamento teórico. Por oposição a ele, procuraremos demonstrar que ser só pode ser abordado no interior de um campo de sentido que se apresente como o que chamaremos de atividade descritiva ou, poderíamos igualmente dizer, uma atividade de mostração. Este último ponto, conclusivo somente quanto à parte do caminho que nosso projeto mais geral nos exige percorrer, será explicitado com a ajuda de alguns dos conceitos apresentados por Husserl em suas Investigações Lógicas. / This work attempts to realize the first steps of a broader project, whose goal is to determine what we may call the question about the sense of Being; along with that, we confront ourselves also with the problem of an adequate methodology for that questioning, i.e., the specific treatment that could possibly render its development legitimate. The argument we propose here will start, for strategic reasons, from a discussion of the philosophy of Kants, mainly because we can find there a thesis on being which gives to it a unitary sense as position: commenting and reconstructing that thesis in some of its elementary moments, will render it possible for us to point to what seems to be - according to our terminology - a sense corruption, present in its own fundaments. That, in turn, will allow us to comprehend the difficulties faced by the so called question about the sense of Being which, we think, are the same difficulties that end up generating the confusions that constitute the history of metaphysics itself. That means that our discussion of Kants philosophy - though directly concerned with its specific views and with the project of a theory of faculties in general - allows us to arrive at further conclusions, with larger results, since we believe we will be then in the position to claim that all theoretical approach concerning the sense of Being must be inadequate. In opposition to this, we will try to demonstrate that Being can only be approached under a treatment whose proper sense is that of a showing, descriptive activity. This point - which concludes our discussion here and presents only a part of our broader project - will be best explained with the help of some of the concepts we can find in Husserls Logical Investigations.
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Análise formal no gerenciamento de competências: o emprego de ontologias e lógica de descrição

Dias, Luiz Gustavo 30 January 2018 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-02-23T12:55:26Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luiz Gustavo Dias - 2018.pdf: 24658970 bytes, checksum: e3353986b772fe9103c6a705f3aa4ee0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-02-23T12:56:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luiz Gustavo Dias - 2018.pdf: 24658970 bytes, checksum: e3353986b772fe9103c6a705f3aa4ee0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-23T12:56:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luiz Gustavo Dias - 2018.pdf: 24658970 bytes, checksum: e3353986b772fe9103c6a705f3aa4ee0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-01-30 / Nowadays to manage knowledge from corporate activities, competency management is increasingly effective in the process of defining organizational strategies. In this way, the present research had the purpose to use formal methods to verify if functions from positions, and competences coming from employees that occupy them, can interfere in the functioning of organizations. A long this lines, an ontology was developed using methodology 101, which had as its domain the educational sector, and served as an information base for the execution of queries elaborated from the description logic, in order to find possible inconsistencies as well as solutions. During the study of the case, were found inconsistencies related to qualification, training, stocking and compatibility of information from different sources that represented the same domain. As a result the research allowed the creation of correct knowledge and that can be used by managers, at different hierarchical levels, helping in the improvement of processes and decision making. / Com a necessidade de gerenciar o conhecimento advindo das atividades corporativas, a gerência de competências se mostra cada vez mais efetiva no processo de definição de estratégias Organizacionais. Desta forma a presente pesquisa objetivou utilizar métodos formais para verificar se funções advindas de cargos, e competências advindas de colaboradores que ocupam os mesmos, podem interferir no funcionamento de organizações. Tendo em vista essa necessidade, foi produzida nesta pesquisa uma ontologia utilizando a metodologia 101, que teve como domínio o setor educacional, e serviu de base de informações para a execução de consultas elaboradas a partir da lógica de descrição, a fim de encontrar possíveis inconsistências bem como soluções. Durante a realização do estudo de caso, foram encontradas inconsistências relacionadas a qualificação, capacitação, lotação e compatibilidade de informações advindas de fontes diferentes que representavam o mesmo domínio. Como resultado a pesquisa possibilitou a criação de conhecimento correto e que pode ser empregado por gestores, em diferentes níveis hierárquicos, auxiliando na melhoria de processos e tomadas de decisões.
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Vigotski: um estudo à luz da centralidade ontolÃgica do trabalho. / Vigotski: a study from the point of view of ontological centrality of labor.

Francisca Maurilene do Carmo 04 December 2008 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / O presente trabalho tem por objetivo resgatar o fundamento ontolÃgico da obra de Vigotski, indicando que a categoria trabalho como momento central na constituiÃÃo do mundo dos homens à absorvida e expressa pelo psicÃlogo soviÃtico, em consonÃncia com os mais legÃtimos preceitos da teoria marxiana. Nesse sentido, num primeiro momento, resgata-se a retomada efetuada por LukÃcs do conceito marxiano de trabalho, extraindo, por essa via, a dimensÃo ontolÃgica da obra de Marx e anunciando, para alÃm da tradiÃÃo metafÃsica e idealista, uma ontologia de novo tipo, a qual aponta de forma radical para a historicidade da essÃncia humana. Prossegue-se com o registro da trajetÃria intelectual de Vigotski e seu papel na construÃÃo de uma psicologia marxista, ao lado de Luria e Leontiev, no contexto da RÃssia do perÃodo revolucionÃrio inaugurado em 1917; assinalando as principais dificuldades relativas à reconstruÃÃo da obra de Vigotski, no contexto do stalinismo, bem como à introduÃÃo de seu pensamento no Ocidente, particularmente nos Estados Unidos e no Brasil. Apontam-se, nesse sentido, os desvios essenciais operados pelo neovigotskianismo, particularizando o tratamento atribuÃdo ao conjunto de categorias vigotskianas, como a linguagem, a cultura, a interaÃÃo, dentre outras, o qual, descolando do princÃpio marxiano do trabalho, distanciando o autor, por conseguinte da perspectiva da ontologia marxiana e, mais precisamente, do horizonte de destruiÃÃo do capital. Atribui-se especial atenÃÃo à anÃlise da obra Pensamento e Linguagem, fazendo-se, ainda, menÃÃo a outros textos selecionados do autor, como A transformaÃÃo socialista do homem, Psicologia concreta do homem, O significado histÃrico da crise da psicologia, dentre outros. Ao final do estudo, assevera-se que, nÃo obstante a valorizaÃÃo explÃcita atribuÃda à recuperaÃÃo do marxismo em sua dimensÃo metodolÃgica, està pressuposto na obra de Vigotski, o substrato ontolÃgico sobre o qual se funda o mÃtodo de Marx. / The study seeks to point out the ontological foundation of Vigotskiâs works, indicating that his theoretical construct as a whole is centered upon the category of labor as the complex which originated man as a social being in accordance with the basic principles of Marxism. In this sense, it emphasizes LukÃcsâ ontological retrieve of Marxâs legacy, announcing, therefore, a new kind of ontology, which goes far beyond the metaphysical and idealistic tradition to assert the radically historical character of human essence. It is, then, recovered Vigotskiâs intellectual trajectory, with emphasis on his central role in the process of constructing, alongside Luria and Leontiev, a Marxist psychology in the context of Russianâs revolutionary period opened up in 1917; and discussing the main difficulties in terms of reconstructing Vigotskiâs work, in the context of Stalinism; as well as those related to the introduction of his thought in the Western world, particularly in the United States and Brazil. It denounces the essential mistakes operated by the neovigotskian movement, which, treating vigotskian categories, such as language, culture and interaction, apart from the Marxist principle of work, ends up by isolating Vigotski from the Marxian ontological realm, and, more precisely, from the socialist project. The study places greater emphasis upon the analysis of Thinking and Speach, also reviewing in a lesser level of details, other selected texts, such as The socialist transformation of man; Concrete psychology; and The historical meaning of crisis in Psychology, among others. It is finally reassured that, despite the explicit relevance attributed by Vigotski to the methodological dimension of Marxism, it is presupposed in the context of his work, the ontological core which founds Marxâs method.
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Uma solução para qualidade de contexto baseada em ontologia e lógica nebulosa com aplicação em monitoramento de sinais vitais em UTI / An approach for quality of context based on ontology and fuzzy logic: a case study on vital sign monitoring at ICU

Sena, Márcio Vinícius Oliveira 03 May 2016 (has links)
Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2016-08-10T13:23:57Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Márcio Vinicius Oliveira Sena - 2016.pdf: 1222160 bytes, checksum: ca880e6a18b3f494d8b0e578a83d6b24 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-10T13:40:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Márcio Vinicius Oliveira Sena - 2016.pdf: 1222160 bytes, checksum: ca880e6a18b3f494d8b0e578a83d6b24 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-10T13:40:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Márcio Vinicius Oliveira Sena - 2016.pdf: 1222160 bytes, checksum: ca880e6a18b3f494d8b0e578a83d6b24 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-05-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / More than a decade after the first training paradigm Computer Context Sensitive, the term Quality of Context (QoC) emerged in a setting filled with services that provide userapplication interactions seamlessly, highlighting the need for managers of information context. These infrastructures that handle context information, CMS (Context Management System), are full of inputs and outputs relevant data or not. The relevance of information is studied by many lines of sensitive computing the context, including QoC. Although there are a large number of QoC metrics, the literature still lacks general values to characterize the relevance of context information, ie from metrics produce an overall value that represents the importance of information. The objective of this work is to propose, from fuzzy logic, a combination of metrics in order to produce a QoC value for each information received, and possible disposal, if this information does not meet the expected relevance, described in this work by policies of QoC. In order to disseminate the context of consumers that information produced, this research proposes also, from an ontology domain independent QoC, annotate semantically the data that refer to the quality of information, thus avoiding the need for new measures in a short-term time. Finally, this paper presents the application of the solutions found in a case study of monitoring vital signs of patients in ICU. / Mais de uma década depois da primeira formulação do paradigma de Computação Sensível ao Contexto, o termo de Quality of Context (QoC) emergiu em um cenário repleto de serviços que proporcionam interações usuário-aplicação de forma transparente, evidenciando a necessidade de gerenciadores de informações de contexto. Estas infraestruturas que manipulam informações de contexto, CMS (Context Management System), estão repletas de entradas e saídas de dados relevantes ou não. A relevância das informações é objeto de estudo de muitas linhas da computação sensível a contexto, inclusive QoC. Embora haja uma infinidade de métricas de QoC, a literatura ainda carece de valores gerais para caracterizar a relevância de uma informação de contexto, ou seja, a partir de métricas, produzir um valor geral que represente a importância de uma informação. O objetivo deste trabalho é propor, a partir de Lógica Nebulosa, uma combinação de métricas, a fim de produzir um valor de QoC para cada informação recebida, sendo possível o descarte, caso essa informação não atenda a relevância esperada, descrita nesse trabalho por políticas de QoC. Buscando disseminar aos consumidores de contexto essas informações produzidas, esta pesquisa propôe também, a partir de uma ontologia de QoC independente de domínio, anotar semanticamente os dados que se referem a qualidade da informação, evitando assim a necessidade de novas medições em um prazo curto de tempo. Por fim, este trabalho apresenta a aplicação das soluções encontradas em um estudo de caso de monitoramento de sinais vitais de pacientes em UTIs.
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Uma abordagem ontológica baseada em informações de contexto para representação de conhecimento de monitoramento de sinais vitais humanos / An ontological approach based on context information for knowledge representation and monitoring of human vital signs

Bastos, Alexsandro Beserra 21 October 2013 (has links)
Submitted by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-09-23T16:48:32Z No. of bitstreams: 2 Bastos, Alexsandro Beserra-2013-dissertação.pdf: 1520807 bytes, checksum: 5001709fca398fc1b01bbc57b11c8b76 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-09-23T18:07:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Bastos, Alexsandro Beserra-2013-dissertação.pdf: 1520807 bytes, checksum: 5001709fca398fc1b01bbc57b11c8b76 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-23T18:07:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Bastos, Alexsandro Beserra-2013-dissertação.pdf: 1520807 bytes, checksum: 5001709fca398fc1b01bbc57b11c8b76 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-10-21 / Monitoring vital signs in intensive care units (ICU) is an everyday activity of various health professionals, including doctors, nurses, technicians and nursing assistants. In most ICUs, monitoring and recording vital signs are performed in a manual fashion and in predefined time instants. The records of measurements of vital signs in ICUs are generally written on preprinted forms, and a health professional has to re-sort those forms when he wants to get some information about the clinical state of a patient. Besides, when an abnormal measurement of vital sign is detected, a multiparameter monitor triggers audible alarms, and that alarm may not be prompted detected by the medical staff, depending on the workflow within an ICU. In that sense, this work proposes a knowledge representation model of monitoring of vital signs of patients in ICUs. The model proposed exploits the expressiveness and the formality of ontologies, rules and semantic web technologies. This promotes the consensual comprehension, the sharing and the reuse of vital signs of patients. The aim is to develop context-aware applications for monitoring human vital signs, including the storage, query support and semantic alarms triggering. / O monitoramento de sinais vitais de pacientes em unidades de terapia intensiva (UTI) é uma atividade que faz parte da rotina de vários profissionais da área da Saúde, envolvendo médicos, enfermeiros, técnicos e auxiliares de enfermagem. Em várias UTIs, o acompanhamento e o registro dos monitoramentos de sinais vitais são realizados de forma manual e em instantes de tempo pré-definidos. Nesse cenário, os registros das medições dos sinais vitais são escritos em formulários pré-impressos, e quando um profissional da saúde deseja obter alguma informação sobre o estado clínico de um paciente, ele tem que recorrer a esses formulários. Além disso, quando ocorre alguma anormalidade no monitoramento do sinal vital do paciente, um monitor multiparamétrico emite alarmes sonoros e, dependendo do fluxo de trabalho dentro da UTI, esse alarme pode não ser percebido prontamente pela equipe médica. Nesse sentido, este trabalho propõe um modelo de representação do conhecimento relativo ao monitoramento de sinais vitais de pacientes em UTIs. O modelo proposto utiliza o potencial de expressividade e formalidade de ontologias, regras e tecnologias correlatas da Web Semântica, o que promove a compreensão consensual, o compartilhamento e a reutilização de informações de sinais vitais de pacientes. Com esse modelo, espera-se também viabilizar o desenvolvimento de aplicações sensíveis a contexto que envolvem o monitoramento de sinais vitais humanos, com armazenamento, consultas e produção de alarmes em casos de anormalidades detectadas nas medições desses sinais.
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Modelo de título para a próxima geração de Internet. / Title model for the next generation Internet.

João Henrique de Souza Pereira 14 February 2012 (has links)
A Arquitetura TCP/IP consolidou-se como padrão nas redes de computadores e permanece em crescente expansão de uso. Apesar de seus protocolos principais terem sido especificados há cerca de 30 anos, ainda permanecem como os mais utilizados nas camadas 3 e 4 devido à sua alta qualidade de projeto, que resultou em elevada eficiência e flexibilidade de uso. A organização do TCP/IP em camadas, com especificações pelo IETF, consolidou-se na década de 1980, quando também tornou-se padrão o modelo de referência OSI, da ISO. Posteriormente, o TCP/IP firmou-se, de fato, como o padrão de protocolos para as redes de computadores e com maior utilização sobre o conjunto de protocolos da ISO e de outras instituições de padronização, visto que a Internet tornou-se o maior sistema aberto interconectado e há poucas redes que utilizam os protocolos OSI, embora vários sistemas abertos sejam baseados em seu modelo de referência em camadas. Há extensas pesquisas e discussões voltadas para alternativas de evolução desta arquitetura e, nesta área de estudos, este trabalho define o Modelo de Título para a próxima geração de Internet. Modelo este que permite a unificação de diferentes tipos de endereços utilizados, com possibilidade de reduzir as complexidades das redes de computadores e melhorar o suporte às necessidades de comunicação dessas redes. A partir de uma visão ontológica sobre as redes de computadores e as necessidades de comunicação no uso destas, este trabalho contribui para a evolução tecnológica da comunicação em rede, com melhoria no atendimento de tais necessidades pela aproximação semântica entre a camada superior e as inferiores. A possibilidade de contribuição nessa área da ciência motiva esta pesquisa, que também apresenta a ontologia do Modelo de Título para formalizar a compreensão semântica e o suporte às necessidades das entidades de comunicação, bem como suas possíveis alterações, conforme o contexto. / The TCP/IP architecture has become a standard on computer networks and remains in growing expansion of use. Despite its key protocols have been specified 30 years ago, they still remain the most used in layers 3 and 4, due to its high quality design, which resulted in high efficiency and flexibility of use. The TCP/IP layers model from the IETF has established itself in the 80\'s, when also has became a standard the OSI reference model from the ISO. Subsequently, the TCP/IP has become, the fact, the standard with greater use over the set of ISO protocols and the other institutions of standardization, since the Internet has become the largest open system interconnected and there are few networks that use OSI protocols, although several open systems are based on its layers reference model. Moreover, there is extensive research and discussions in alternatives for the evolution of this architecture and, in this study area, this Thesis defines the Title Model for the next generation Internet. This model allows the unification of the different types of addresses, with the possibility of reducing the complexities of computer networks and better support to the communication needs in computer networks. Based in one ontological view on computer networks and the needs in its use, this study has the intention to contribute to the technological evolution of network communication in order to better meet the entities communication needs and approximate the upper and lower layers. The possibility to contribute in this technological area motivates this research that also presents the ontology for the title model to increase the semantic comprehension for the support of the entities needs and their possible changes in the context.
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Modelagem e simulação de agentes com aspectos cognitivos para avaliação de comportamento social. / Modeling and simulation of agents with congnitive aspects to evaluate social behavior.

Daniel Costa de Paiva 12 May 2011 (has links)
Este trabalho foi elaborado considerando conceitos de quatro áreas de pesquisa: ciência da computação, ciência cognitiva, ciência da informação e comunicação social. A contribuição principal aqui se dá em definir agentes minimamente cognitivos que participam ativamente na dinâmica do fluxo de informações, sofrendo influência das mensagens que recebem e também interferindo no que irá passar adiante. O modelo contempla tanto características relacionadas ao ambiente e sociedade, definidos usando ontologias, quanto à mente, arquitetura e funcionamento dos agentes. Cada personagem possui três módulos de decisão, podendo acessar meios de comunicação em massa, assimilar informações recebidas e também falar com seus amigos. Para o módulo de assimilação, estão apresentadas quatro formas que os agentes podem usar para avaliar as informações que recebem. Primeiramente foi elaborada uma função, depois foram definidas três máquinas de estados finitos, aumentando gradativamente a complexidade e a interdependência entre os parâmetros envolvidos em cada uma. Foi também elaborada uma função adaptativa, a qual a partir de uma regra definida pelo usuário para a troca entre as máquinas de estado que os agentes dispõem, propiciou resultados satisfatórios mesmo nos casos onde alguma das máquinas de estado apresentou deficiências. Visando reproduzir uma situação inspirada na vida real, estão apresentados resultados de uma versão combinada (definida pelo autor) onde foram considerados três grupos e a possibilidade de acesso a meios de comunicação em massa e/ou troca de mensagens entre amigos. Usando o modelo como base, um simulador foi desenvolvido onde é possível ter não só uma visão global da dinâmica que está acontecendo na sociedade, mas também o que alguns agentes ficam sabendo e que podem falar sobre. Os estudos de caso visaram comparar as diferentes formas de assimilação de informações que os agentes podem usar (elaboradas pelo autor), avaliar a influência da variação de alguns parâmetros e reproduzir a dinâmica do fluxo de informações em redes sociais, a comparando com o que acontece quando se tem a divulgação broadcast. / This work was developed considering concepts of four research areas: computer science, cognitive science, information science and social communication. The main contribution here is to define minimally cognitive agents who actively participate in dynamic of information flow interfering on the messages received and are being affected by them. The model consider characteristics related to the environment and the society, defined by using ontologies, and the \"mind\", architecture and functioning of the agents. Each character has three decision modules. They can access means of mass communication, assimilate information received and talk to their friends. To the assimilation module were presented four forms that agents can evaluate received information, a function, and three finite state machines (FSM). They were elaborated increasing the complexity. After, it was developed an adaptive function, in which using a rule the user define how to exchange between the finite state machines that agents have. This function provided satisfactory results even in cases where some of the FSMs presented problems. Aiming to reproduce a situation inspired in real life a combined version was defined by the author, in where were considered three groups that can access means of mass communication and / or talk to their friends. Based on the model, a simulator was developed in which there are not only an overview of the society dynamics, but also what agents learn and what they can talk about. The case studies were performed aiming to compare the different assimilation forms (developed by the author), to evaluate the influence of some parameters variation and to reproduce the dynamics of information flow, comparing the influence of a social network communication and the mass communication activity.
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As Possibilidades de um Di?logo: A Ontologia do Ser Social de Luk?cs e a Nova Sociologia Econ?mica de Granovetter / The Possibility of a Dialogue: The Ontology of Social Being of Luk?cs and New Economic Sociology of Granovetter

Araujo, Paulo Henrique Furtado de 07 May 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2016-04-28T20:13:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009 - Paulo Henrique Furtado de Araujo.pdf: 2150827 bytes, checksum: 9d6b16b730f9d2ae5ec11ad8ce781cc9 (MD5) Previous issue date: 2009-05-07 / The Marxist and Marxist thought is free challenge is charged that during the twentieth century ended obliterate its analytical capacity and intervention. And, by its own constitution, requires a permanent upgrade in the capture of the determinations of the real in constant motion. Building an Ontology for Luk?cs is in an important moment of the work of redemption of Marxist thought and resumed its ability to interpret and transform the real concrete. Dialogue with the New Economic Sociology of Granovetter makes room for an analysis that unveiling the meso level of human sociability. Interpersonal social networks as a manifestation of social being raised the possibility of a type of public policy that is result of Marxist theory and Marxist as scientific and ideological construct. / O pensamento marxiano e marxista tem por desafio libertar-se das imputa??es que ao longo do s?culo XX terminaram por obliterar sua capacidade anal?tica e de interven??o. E, por sua pr?pria constitui??o, exige uma atualiza??o permanente no processo de captura das determina??es do real em constante movimento. A constru??o de uma Ontologia por Luk?cs constitui-se num momento importante do trabalho de resgate do pensamento marxiano e de retomada da sua capacidade de interpretar e transformar o real concreto. O di?logo com a Nova Sociologia Econ?mica de Granovetter abre espa?o para uma an?lise que desvele o n?vel meso da sociabilidade humana. As redes sociais interpessoais, enquanto manifesta??o do ser social colocam a possibilidade de um tipo de pol?tica p?blica que seja decorr?ncia da teoria marxiana e marxista enquanto constructo cient?fico e ideol?gico.

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