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Análise estatística espacial na avaliação de produtividade no melhoramento genético do feijoeiro / Geostatistic analyses in the assessment the beans families productivity

Feres, Andréia Luiza Gonzaga 18 February 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 543381 bytes, checksum: 7509b9f65bfa864587d72692479be7a4 (MD5) Previous issue date: 2009-02-18 / Spatial dependence is a tendency that a variable´s value, observed in certain position, leads to approximate to its neighbors value than the value of the rest of the elements observed in the sample. The aim of this work was to evaluate the efficiency of some methods of geostatistic analyses to improve the experimental accuracy of tests that selects families for genetic improvement program of beans plantation. Date set were used to evaluate the productivity of eight experiments set in lattice design, located in Coimbra s Experimental Station controlled by the Plant Science Department at Federal University of Viçosa UFV. For each study was analyzed the neighborhood methods: Moving Means Method, Papadakis Method, Moving Means Replication, Papadakis Method Replication and the method that contains errors dependent in the comparison between traditional analyses in lattice which do not consider the spatial dependence among plots according to its fitting model, and the family classification in study. The existence of experiment s spatial dependence was observed through the Durbin-Watson s test, empirical and theoretical semivariogram with a geostatistic fitting model for residues checking the coherence of data and noticing the occurrence of spatial dependence in 6 out of 8 experiments in study (Chapter1). Five out of the six experiments showed spatial dependence for analyses in blocks and one for analyses in lattice and blocks, reaching 2.6 to 33.3m. In chapter 2, it was used the Durbin-Watson s test to observe the spatial dependence among residues for different methodologies, besides the Akaike Information Criteria (AIC) and the Maximum Likelihood Method to compare the fitting model. The variation coefficient and the relative efficiency were used to compare the efficiency of tested methodologies related to the analyses in lattice. The Spearman s Correlation Coefficient and the efficiency of selection were also used to compare the classification of beans plantation families acquired through the analyses in lattice and through the spatial analyses method. It was noticed that the spatial analyses method had a better fitting to the data than the methods that assume independent errors. The experiments accuracy, the analyses in lattice efficiency was higher compared to the analyses in blocks when there is higher spatial dependence. The spatial analyses method, Moving Means Method, Papadakis Method and the method with independent errors showed reasonable efficiency, while the proposed methodologies, Moving Means Replication and Papadakis were highly efficient than the analyses in lattice. Papadakis replication Method showed to be more efficient once its neighborhood is constituted by a superior and inferior plot compared to the reference plot. The tested methods showed reasonable concordance level compared to the selected families for analyses in lattice. The Moving Means Replication and Papadakis Replication methodologies showed highly efficient to improve the experiments accuracy, besides to guarantee the independence among residues, being an excellent alternative for analyses compared to the analyses in lattice. / A dependência espacial é a propensão pela qual o valor de uma variável observada em certa posição tende a assemelhar-se mais aos valores vizinhos do que ao restante das observações do conjunto amostral. O objetivo deste trabalho foi a avaliação da eficiência de alguns métodos de análise estatística espacial para melhorar a precisão experimental em ensaios de seleção de famílias em programa de melhoramento genético do feijoeiro. Foram utilizados dados para produtividade de oito experimentos montados em látice, conduzidos na estação experimental de Coimbra, pertencente ao Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa (UFV). Para cada análise, foram analisados os métodos de análise de vizinhança: método das médias móveis, método de Papadakis, reaplicação das médias móveis, reaplicação do método Papadakis e o método com erros dependentes em comparação com a análise tradicional em látice, que desconsidera a dependência espacial entre parcelas quanto ao ajuste dos modelos e à classificação das famílias avaliadas. Foi verificada a existência da dependência espacial nos experimentos pelo teste de Durbin-Watson, semivariograma empírico e teórico com o ajustamento de um modelo geoestatístico para resíduos, verificando a coerência dos dados e percebendo a ocorrência da dependência espacial em seis dos oito experimentos avaliados (capítulo 1). Dos seis experimentos, cinco apresentaram dependência espacial para análise em blocos e um para análise em látice e em blocos, com alcance variando de 2,6 a 33,3 m. No capítulo 2, foram utilizados o teste de Durbin-Watson para verificar a dependência espacial entre resíduos para as diferentes metodologias, além do critério de informação de Akaike (AIC) e do teste da razão da verossimilhança (LRT) para comparar o ajuste dos modelos. Utilizaram-se o coeficiente de variação e a eficiência relativa para comparar a eficiência das metodologias testadas em relação à análise em látice. Também foram utilizados o coeficiente de correlação de Spearman e a eficiência de seleção para comparar as classificações de famílias do feijoeiro obtidas na análise em látice e pelos métodos de análise espacial. Verificou-se que os métodos de análise espacial ajustaram-se melhor aos dados em relação aos métodos que assumem erros independentes. Quanto à precisão experimental, a eficiência da análise em látice foi maior em relação à análise em blocos quando há maior dependência espacial. Os métodos de análise espacial, médias móveis, Papadakis e o método com erros dependentes apresentaram razoável eficiência, enquanto as metodologias propostas, reaplicações das médias móveis e Papadakis foram altamente eficientes em relação à análise em látice, sendo mais eficiente o método reaplicação de Papadakis cuja vizinhança é composta por uma parcela superior e uma inferior em relação à parcela referência. Os métodos testados apresentaram razoável nível de concordância em relação às famílias selecionadas na análise em látice. As metodologias de reaplicação de médias móveis e reaplicação de Papadakis mostram-se altamente eficientes para melhorar a precisão experimental, além de conseguir garantir a independência entre resíduos, sendo uma excelente alternativa de análise em relação à análise em látice.
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Parâmetros genéticos e fenotípicos em arroz irrigado estimados por método de análise espacial / Genetic and phenotypic parameters in rice crop estimated by method of spatial analysis

Guimarães, Paulo Henrique Ramos 28 February 2014 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-01-27T13:40:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Paulo Henrique Ramos Guimarães - 2014.pdf: 1517515 bytes, checksum: 862883b307a6231b2a7f63d38c9f03ea (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-01-28T11:19:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Paulo Henrique Ramos Guimarães - 2014.pdf: 1517515 bytes, checksum: 862883b307a6231b2a7f63d38c9f03ea (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-28T11:19:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Paulo Henrique Ramos Guimarães - 2014.pdf: 1517515 bytes, checksum: 862883b307a6231b2a7f63d38c9f03ea (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Some spatial analysis methods have been applied in order to mitigate environmental variation. The objective of this study was to evaluate the efficiency of spatial statistical, through the method of Papadakis, relative to the analysis to augmented blocks Federer in the correction of environmental variation. Were evaluated 198 progenies S0:2 of rice and four witnesses for augmented blocks of Federer. Data set were taken in the grain yield (GY, kg ha- 1) and plant height (PH, cm). The data set were subjected to variance analyses and were estimated the genetic and phenotypic parameters. The different approaches (BAF and Papadakis) were compared as to their estimates of genetic and phenotypic parameters. The ranking of adjusted means in the two models analyzed was performed, and calculated the Spearman correlation. There have been improvements in the statistics that depict the experimental accuracy when the spatial analysis was, that affect the estimates of genetic and phenotypic parameters. The use of the Papadakis method yielded fewer iterations compared to BAF for the same value of . Was able to gain direct selection for the AP and PG characters when the Papadakis method was used. With the use of spatial analysis selection was less influenced by the effect of environmental variation. Finally it was found that the spatial analysis methods were effective in the removal of environmental effects highlighting the Papadakis method, indicating that it can provide improvement / Alguns métodos de análise espacial têm sido aplicados objetivando reduzir a variação ambiental. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência da análise espacial, por meio do método de Papadakis, em relação ao delineamento de blocos aumentados de Federer na correção da variação ambiental. Foram avaliadas 198 progênies S0:2 de arroz irrigado e quatro testemunhas no delineamento de blocos aumentados de Federer. Os caracteres avaliados foram: produção de grãos (PG, kg ha-1) e de altura de plantas (AP, cm). Foi efetuada análise de variância para os caracteres estudados e estimados os componentes de variância e os parâmetros genéticos e fenotípicos. As diferentes abordagens (BAF e Papadakis) foram comparadas quanto às suas estimativas de parâmetros genéticos e fenotípicos e correlação de Spearman. Houve melhorias nas estatísticas que retratam a precisão experimental quando a análise espacial foi utilizada, isto influenciou as estimativas de parâmetros genéticos e fenótipos. O uso do método de Papadakis apresentou a necessidade de uso de menor número de repetições em relação ao BAF para o mesmo valor de . Houve ganho de seleção direto para os caracteres AP e PG quando o método de Papadakis foi utilizado. Com o uso da análise espacial a seleção foi menos influenciada pelo efeito da variação ambiental. Por fim verificou-se que o método de Papadakis foi eficiente na remoção dos efeitos ambientais, indicando que o mesmo pode proporcionar melhoria na precisão experimental, o que torna o processo seletivo mais eficiente.
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Variabilidade espacial e tamanho de parcela em experimentos com culturas olerícolas / Spatial variability and size of plot in experiments with vegetable crops

Santos, Daniel 20 February 2013 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The study aimed to test the efficiency of the method Papadakis on increasing the quality of experiments with snap beans, zucchini, peppers and lettuce, and having efficiency, determine how to estimate the covariate and plot size for use in experiments where apply the method. The definition of the form of estimated covariate that provides greater efficiency and calculation method Papadakis plot size adjusted for use in this method were made from the following blank experiments: two experiments with zucchini, lettuce with eight, five-bean pod and two peppers. In experiments with zucchini, pole beans and peppers, the variable was the weight of fruits and lettuce in experiments with variable mass was fresh shoot. The effectiveness of the use of analysis of covariance (ANCOVA) with the covariate estimated by Papadakis was tested from treatment experiments: one with the bell pepper crop, where the variable was the weight of fruit and one with lettuce crop where the variable was the fresh weight of shoots. The use of ANCOVA with the covariate estimated by Papadakis increases the quality of experiments with vegetable crops. The covariate that provides the highest efficiency ANCOVA is that which is determined considering a portion neighboring each side of the reference portion towards the row of plants. The plot size in the crop row, adjusted for method, is 10 plants (2.0 m) for snap beans, five plants (4.5 m) to zucchini, five plants (1.5 m ) for chili, and four plants (1.2 m) for lettuce. / O trabalho teve por objetivo testar a eficiência do método Papadakis no aumento da qualidade de experimentos com feijão-vagem, abobrinha italiana, pimentão e alface e, havendo eficiência, determinar a forma de estimativa da covariável e o tamanho de parcela para uso em experimentos onde se aplicará o método. A definição da forma de estimativa da covariável que proporciona maior eficiência do método Papadakis e o cálculo do tamanho de parcela ajustado para uso no mesmo foram realizados a partir dos seguintes experimentos em branco: dois experimentos com abobrinha italiana, oito com alface, cinco com feijão-vagem e dois com pimentão. Nos experimentos com abobrinha italiana, feijão-vagem e pimentão, a variável foi o peso de frutos e nos experimentos com alface a variável foi massa fresca da parte aérea. A eficácia do uso da análise de covariância (ANCOVA) com a covariável estimada pelo método Papadakis foi testada a partir de experimentos com tratamentos: um com a cultura do pimentão, onde a variável foi o peso de frutos e, um com a cultura da alface, onde a variável foi a massa fresca da parte aérea. O uso de ANCOVA com a covariável estimada pelo método Papadakis aumenta a qualidade de experimentos com culturas olerícolas. A covariável que proporciona a maior eficiência da ANCOVA é aquela que é estimada considerando uma parcela vizinha de cada lado da parcela de referência no sentido da linha de cultivo. O tamanho de parcela na linha de cultivo, ajustado para uso do método, é de 10 plantas (2,0 m) para feijão-vagem, de cinco plantas (4,5 m) para abobrinha italiana, cinco plantas (1,5 m) para pimentão, e de quatro plantas (1,2 m) para alface.

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