USAID / Se identifica la expresión diferencial de genes efectores tipo RXLR en dos cepas aisladas del centro de los andes peruanos de P. infestans EC-1 mediante secuenciamiento del transcriptoma de la interacción papa-P.infestans de los primeros días después de la infección, siendo confirmada por qRT-PCR. Los genes efectores fueron silenciados en una cepa para Avr-vnt1 en POX109 y para el homólogo Avh9.1 en POX067, pero expresados en la otra. Además, los resultados de transcriptoma fueron comparados con tres cepas adicionales del linaje EC-1. En el análisis de SNPs de Avr-blb1, Avr-blb2 y Avr-vnt1, la variabilidad alélica no tuvo predominancia frente a la variabilidad de expresión de genes. Asimismo, debido al silenciamiento génico de Avr-vnt1 se evaluó la expresión de estos en plantas transgénicas [Rpi-vnt1.1] a fin de encontrar si la resistencia transgénica era funcional. Encontrando que en ambas cepas en todos los eventos y en el control susceptible Yungay se expresan, a diferencia del resultado anterior. El descubrimiento de efectores silenciados en las poblaciones del patógeno pueden guiar al uso de genes R específicos en los programas de mejoramiento genético. Pudiendo el gen Rpi-vnt1 no ser recomendado. / Tesis

Memoria para optar al título profesional de Ingeniera Agrónoma / Al desarrollarse en el suelo, las larvas de Agrotis bilitura (Lepidoptera: Noctuidae) se alimentan tanto de plántulas como de las partes subterráneas de plantas en cultivos hortícolas. Los estadíos L3-L6 son los más dañinos, provocando pérdidas de hasta el 100% en ataques severos. El control de esta plaga con insecticidas es ineficiente, debido a los refugios que ofrece el suelo. En este contexto, los nematodos entomopatógenos (NEP) pueden ser una alternativa de gran valor en el control de ésta y otros insectos plaga que utilizan este hábitat, por su habilidad de moverse activamente en el perfil del suelo en busca de hospederos. Los NEP del género Steinernema (Steinernematidae) cuentan con un estado infectivo (IJ), el que ingresa al cuerpo del hospedero por heridas o aberturas naturales, liberando en su interior una bacteria simbionte del género Xenorhabdus (Enterobacteriaceae), la cual provoca la muerte del insecto por septicemia en un período de 24 a 48 horas.

En las zonas productoras de papa (Solanum tuberosum Linneo) del Perú, una especie de polilla de la papa (PTM): Symmetrischema tangolias Gyen (Lepidoptera: Gelechiidae) viene desplazando en predominancia a Phthorimaea operculella Zeller (Lepidoptera: Gelechiidae). El objetivo de esta investigación fue desarrollar una fórmula bioinsecticida eficaz contra ambas plagas, basado en PoGV, Btk o la combinación de ambos. El tratamiento de tubérculos de papa (cv. “Peruanita”) con fórmulas de patógenos fue por inmersión o impregnación; e inoculadas con larvas neonatales de ambas especies. Los bioensayos se desarrollaron a: 25°C (P. operculella), 20°C (S. tangolias) y condiciones naturales en almacenes de papa. Las fórmulas en talco mejoraron la eficacia de los patógenos, alcanzando niveles CL50 con menores concentraciones de PoGV (16 veces) y Btk (5-6 veces) al compararse con sus respectivas aplicaciones acuosas (1,55×107 gránulos/mL; IC95%: 1,26×107-2,14×107 y 1321 mg/L; IC95%: 1084-1555) obtenidas contra P. operculella; asi mismo fueron 2-4 veces menores respecto a aplicaciones acuosas de Btk (3095 mg/L; IC95% 1711 - 3575) en S. tangolias. La interacción PoGV-Btk contra P. operculella fue mixta, tendiendo al antagonismo ante concentraciones altas de ambos patógenos y sinérgicos a bajas concentraciones. Dos fórmulas: Btk y Btk+PoGV, desarrollados y aplicados en almacenes de papa, permitieron incrementos poblacionales, 90 días después, solo en S. tangolias (3,0 y 2,7%) (larvas-pupas/100 tubérculos); luego de disminuirlos a niveles de 1,7% (30 días). No resulta conveniente utilizar fórmulas combinadas de Btk+PoGV por no conseguirse sinergísmos importantes; recomendándose el producto Btk en talco, por su efectividad contra ambas especies de PTM. / In the areas of potato productions (Solanum tuberosum Linneo) from Peru, a species of potato tuber moth (PTM): Symmetrischema tangolias Gyen (Lepidoptera: Gelechiidae) it comes displacing in predominance to Phthorimaea operculella Zeller (Lepidoptera: Gelechiidae). The objective of this investigation was to develop an effective bioinsecticide formule against both pests, based on PoGV, Btk or the combination of both. The treatment of the potato tubers (cv. “Peruanita”) was realized by immersion when was used one solution formulated or by covers when the powder formulation was, over, which was, inoculated the neonatal larvae. The laboratory bioassays were developed at control condition 25°C (P. operculella), 20°C (S. tangolias) and at room condition for the potato storage. Due the effects of some inert material over the mortality, the talcum formulation of both pathogens tested showed better efficacy than aqueous solution formulated. Reaching the CL50 level using less concentration of PoGV (16 times) and Btk (5 to 6 times) in comparison with the respective aqueous applications (1,55×107 granules/mL; IC95%: 1,26×107- 2,14×107 and 1321 mg/L; IC95%: 1084-1555) against P. operculella. The difference was 2 to 4 time minor in S. tangolias concerning aqueous applications of Btk (3095 mg/L; IC95% 1711-3575). The PoGV-Btk interaction against P. operculella results mixed, reaching to the antagonism in front of high concentrations of both pathogens and synergistic to low concentrations. Two formulations: Btk and Btk+PoGV was developed and applied in potato storage, permitting increments populations 90 days later, only in S. tangolias (3,0 2,7%) (larvae and pupae/100 tubers), then of diminishing them to levels of 1,7% (30 days). With this results is not recommended the use formulations combined of Btk+PoGV by not getting important synergism; recommending the use of the talcum Btk product, for their high affectivity against both species of potato tuber moth.

En las zonas productoras de papa (Solanum tuberosum Linneo) del Perú, una especie de polilla de la papa (PTM): Symmetrischema tangolias Gyen (Lepidoptera: Gelechiidae) viene desplazando en predominancia a Phthorimaea operculella Zeller (Lepidoptera: Gelechiidae). El objetivo de esta investigación fue desarrollar una fórmula bioinsecticida eficaz contra ambas plagas, basado en PoGV, Btk o la combinación de ambos. El tratamiento de tubérculos de papa (cv. “Peruanita”) con fórmulas de patógenos fue por inmersión o impregnación; e inoculadas con larvas neonatales de ambas especies. Los bioensayos se desarrollaron a: 25°C (P. operculella), 20°C (S. tangolias) y condiciones naturales en almacenes de papa. Las fórmulas en talco mejoraron la eficacia de los patógenos, alcanzando niveles CL50 con menores concentraciones de PoGV (16 veces) y Btk (5-6 veces) al compararse con sus respectivas aplicaciones acuosas (1,55×107 gránulos/mL; IC95%: 1,26×107-2,14×107 y 1321 mg/L; IC95%: 1084-1555) obtenidas contra P. operculella; asi mismo fueron 2-4 veces menores respecto a aplicaciones acuosas de Btk (3095 mg/L; IC95% 1711 - 3575) en S. tangolias. La interacción PoGV-Btk contra P. operculella fue mixta, tendiendo al antagonismo ante concentraciones altas de ambos patógenos y sinérgicos a bajas concentraciones. Dos fórmulas: Btk y Btk+PoGV, desarrollados y aplicados en almacenes de papa, permitieron incrementos poblacionales, 90 días después, solo en S. tangolias (3,0 y 2,7%) (larvas-pupas/100 tubérculos); luego de disminuirlos a niveles de 1,7% (30 días). No resulta conveniente utilizar fórmulas combinadas de Btk+PoGV por no conseguirse sinergísmos importantes; recomendándose el producto Btk en talco, por su efectividad contra ambas especies de PTM. / In the areas of potato productions (Solanum tuberosum Linneo) from Peru, a species of potato tuber moth (PTM): Symmetrischema tangolias Gyen (Lepidoptera: Gelechiidae) it comes displacing in predominance to Phthorimaea operculella Zeller (Lepidoptera: Gelechiidae). The objective of this investigation was to develop an effective bioinsecticide formule against both pests, based on PoGV, Btk or the combination of both. The treatment of the potato tubers (cv. “Peruanita”) was realized by immersion when was used one solution formulated or by covers when the powder formulation was, over, which was, inoculated the neonatal larvae. The laboratory bioassays were developed at control condition 25°C (P. operculella), 20°C (S. tangolias) and at room condition for the potato storage. Due the effects of some inert material over the mortality, the talcum formulation of both pathogens tested showed better efficacy than aqueous solution formulated. Reaching the CL50 level using less concentration of PoGV (16 times) and Btk (5 to 6 times) in comparison with the respective aqueous applications (1,55×107 granules/mL; IC95%: 1,26×107- 2,14×107 and 1321 mg/L; IC95%: 1084-1555) against P. operculella. The difference was 2 to 4 time minor in S. tangolias concerning aqueous applications of Btk (3095 mg/L; IC95% 1711-3575). The PoGV-Btk interaction against P. operculella results mixed, reaching to the antagonism in front of high concentrations of both pathogens and synergistic to low concentrations. Two formulations: Btk and Btk+PoGV was developed and applied in potato storage, permitting increments populations 90 days later, only in S. tangolias (3,0 2,7%) (larvae and pupae/100 tubers), then of diminishing them to levels of 1,7% (30 days). With this results is not recommended the use formulations combined of Btk+PoGV by not getting important synergism; recommending the use of the talcum Btk product, for their high affectivity against both species of potato tuber moth. / Tesis

xiv, 169 h. : il. ; 30 cm. / La papa es un cultivo destinado principalmente al consumo interno, contribuyendo a la seguridad alimentaria y llegándose a producir 4.47 millones de TM en el año 2012. De esta cantidad, menos del 4% fue utilizado en procesos de transformación, mientras que el resto se comercializó en fresco, principalmente a través de acopiadores que negocian el producto en los mercados mayoristas de Lima, así como en otras ciudades del país. Se ha desarrollado el planeamiento estratégico para la papa en el Perú, cubriendo todas sus presentaciones, como son la papa fresca, papa cortada en tiras, papa procesada congelada, hojuelas y el chuño o tunta. Se caracteriza por ser un cultivo con una gran dispersión geográfica y variabilidad en las tecnologías utilizadas; donde intervienen, acopiadores, mayoristas y minoristas. Los productores son mayoritariamente pequeños agricultores minifundistas ubicados en la sierra del Perú, quienes operan de manera informal sin acceso a insumos de calidad. A nivel de la comercialización se experimenta la amenaza de una disminución en el consumo per cápita, debido a la presencia de sustitutos en la dieta de los peruanos. Es por ello, que se tiene que motivar la demanda y el consumo de papa entre la población de todos los niveles socioeconómicos, resaltando sus cualidades y mejorando los sistemas de mercadeo, principalmente la presentación del producto, tanto en supermercados como en mercados tradicionales. Este planeamiento estratégico presenta una visión para el año 2023, en donde la papa seguirá siendo el producto líder en producción y consumo a nivel de Sudamérica, identificando al Perú como un país referente por la biodiversidad que ofrece el suelo peruano; utilizando tecnología de punta para mejorar el rendimiento del cultivo. Para alcanzar esta visión se incrementará la producción y las exportaciones, se aumentará la cantidad de papa transformada o procesada y se incrementará el consumo per cápita / The potato is a crop grown primarily for domestic consumption, contributing to food security. In 2012, 4.47 MT were produced and only less than 4% was processed or transformed, while the rest is sold fresh, mainly through middlemen who negotiate the product in wholesale markets in Lima and other big cities in the country. This strategic planning has been developed for potatoes, covering all products, such as fresh potatoes, shredded potatoes, frozen processed potatoes, chips and potato flour. It is characterized as a crop with a wide geographical spread and variability in the technologies used, which involves, collectors, wholesalers and retailers. Producers are mostly small farmers located in the highlands of Peru, who operate informally without access to quality seeds or any other inputs. In terms of marketing, the main threat is a decline in per capita consumption, due to the presence of substitutes in the diet of Peruvians as rice or pasta. That is why demand and potato consumption among the population of all socioeconomic levels have to be motivated, highlighting their strengths and improving marketing systems, mainly a more attractive and clean presentation of the product, both in supermarkets and traditional markets. This strategic plan presents a vision for the year 2023, the Peruvian potatowill the main product lead in production and food level in Latin America, recognized the Peru as a the country reference for biodiversity in the Peruvian land, used to high technology to better farming rates. To achieve this vision, production and exportswill be increased, encouraging production chains and raising the percentage of potatoes transformed or processed, and increasing per capita consumption / Tesis

Ingeniero Civil en Computación / El trabajo desarrollado en esta memoria nace dentro del rubro de la industria agrónoma, en particular, con la empresa Semillas SZ, que es una empresa chilena dedicada al cultivo y venta de semillas certificadas de papas a lo largo del país. Actualmente tanto Semillas SZ como el mercado de la papa se encuentran en crecimiento, por lo cual un manejo eficaz de la información se torna un punto clave para mantenerse competitivo y escalar dentro de la industria. Los alcances del proyecto desarrollado en esta memoria involucran dos desafíos cruciales de gestión de información dentro de la industria agrónoma, los cuales se denominaron Crops y Markets, dando origen al título de esta memoria. Crops ataca el problema de que para cultivar semillas de papas, por motivos de la rotación de cultivos, es necesario plantar en predios diferentes todos los años. Esto trae consigo la necesidad de encontrar de manera rápida predios los cuales cumplan con una serie de características que permitan el cultivo de semillas de papas en esa zona, junto con posteriormente poder llevar un registro y mantener un seguimiento de las diferentes plantaciones realizadas. Por otro lado, Markets refiere a la gestión comercial de la empresa, en el aspecto de la identificación y clasificación ágil de los actuales y potenciales clientes, y a su vez el registro de las diferentes transacciones tanto físicas como valorizadas realizadas a cada uno de ellos. A partir de lo anterior, se creó una aplicación web la cual permite al usuario visualizar espacialmente y clasificar dinámicamente la información de tanto Crops como de Markets, junto con habilitar diversas entradas de datos, por medio de interfaces amigables y usando las últimas tecnologías en lo que a desarrollo web se refiere, con la finalidad de poder mejorar el manejo de información y la toma de decisiones de la empresa. El resultado final fue una aplicación operativa y extensible que cumplió con los objetivos planteados inicialmente en la memoria.

Evalúa la eficacia del ensayo molecular HRM (High Resolution Melting; en español, análisis de curvas de disociación de alta resolución) para la detección del número de copias del alelo resistente del gen Ryadg. Para lo cual se analizaron dos poblaciones resultantes del cruce de genotipos con distinto número de copias del alelo resistente del gen Ryadg: la población CT y la población TL. Se realizó el ensayo HRM con la sonda y los iniciadores diseñados a partir de las secuencias de los alelos del marcador molecular M6. Finalmente, se utilizó la prueba de bondad de ajuste del chi-cuadrado para comprobar que la segregación observada del alelo resistente del gen Ryadg, corresponde a la segregación esperada. El ensayo HRM diferencia los alelos susceptibles y resistentes del locus Ryadg, representados por dos picos bien definidos. Además, se distinguen cuatro genotipos: simplex, dúplex, triplex y nuliplex. Se esperaba que la segregación observada coincida con la teórica esperada; sin embargo, la prueba del chicuadrado indica que los resultados no se ajustan a esta segregación. Esta discrepancia podría ser explicada por un efecto adverso sobre el desarrollo de la planta, causado por la acumulación del número de copias del alelo resistente del gen Ryadg. En conclusión, el ensayo HRM es eficaz para la detección del número de copias del alelo resistente del gen Ryadg. / Tesis

El genotipo doble monoploide DM1-351644 de Solanum tuberosum Grupo phureja (DM) desarrollado por la Universidad de Virginia fue secuenciado por el Consorcio de Secuenciamiento del Genoma de la Papa (PGSC) en el Instituto de Genómica de Beijing teniendo como resultado una gran cantidad de super-scaffolds con posición genómica desconocida. Con el fin de contribuir a la orientación y posicionamiento de estos super-scaffolds se construyó un mapa genético. En este trabajo, se analizaron 100 nuevos marcadores microsatélites diseñados por el PGSC, de los cuales 37 marcadores se lograron posicionar en 12 grupos de ligamiento. Debido a la utilización de microsatélites con posición cromosómica conocida se pudo asignar estos grupos de ligamiento a los 12 cromosomas específicos de la papa. Con estos marcadores posicionados se pudieron ubicar 37 super-scaffolds, contribuyendo al conocimiento del orden de las secuencias genómicas con posición cromosómica desconocida productos del secuenciamiento del genoma de DM. El conocimiento del genoma será una herramienta importante para ser utilizada en los futuros programas de mejoramiento. Palabras claves: PGSC, super-scaffolds, microsatélites, polimofismo, segregación, distorsión, mapa genético. / --- A doubled monoploid DM1-351644 of Solanum tuberosum Grupo phureja (DM) developed by the University of Virginia was sequenced by the Potato Genome Sequencing Consortium (PGSC) at the Beijing Genomics Institute resulted in a lot of super-scaffolds with unknown genomic position. ´ In order to contribute to the orientation and positioning of these super-scaffolds, a genetic map was constructed. In this study, we analyzed 100 new microsatellite markers designed by PGSC, which 37 markers were achieved position in 12 linkage groups. Due to the use of microsatellites with known chromosomal position, these linkage groups could be assigned to the 12 specific chromosomes of potato. With these markers 37 super-scaffolds could be located, contributing to the knowledge of the order of genomic sequences from DM with unknown chromosomal position. The knowledge of the genome will be an important tool to be used in future breeding programs. Key words: PGSC, super-scaffolds, microsatellite, polymorphism, segregation, distortion, genetic map. / Tesis

Señala que la papa (Solanum tuberosum L.) es un cultivo agrícola muy utilizado a nivel mundial. En el Perú, la producción y consumo de este tubérculo es alto. Perú cuenta con más de 600 000 agricultores de 19 departamentos de este cultivo, donde la producción disminuye a causa de la toxicidad de los fertilizantes químicos, fitopatógenos, la erosión de los suelos y otros problemas en su cultivo. En la presente investigación, se determinó la actividad antagónica de actinomicetos rizosféricos de papa nativa en el distrito de Cabana, provincia de Lucanas – Región Ayacucho, frente al Oomiceto Phytophthora infestans, causante de la enfermedad más hostil de la papa, conocida como Tizón Tardío. Mediante cultivos convencionales en el laboratorio se lograron aislar 32 cepas de actinomicetos utilizando agar Avena, agar Almidón Caseína, agar Czapeck y agar Asparragina. Las pruebas se realizaron en agar Avena y agar Centeno, en las que el 71,9% de las cepas de actinomicetos mostraron antagonismo a Phytophthora infestans en agar Avena, mientras que solo el 31,3% de actinomicetos inhibieron en agar Centeno. Se realizaron pruebas de hidrólisis de almidón e hidrólisis de celulosa, siendo el 100% de actinomicetos con capacidad amilolítica y solo el 50% celulolítica. Además, se realizaron ruebas de caracterización fisiológica a través del crecimiento a diferentes rangos de pH y temperatura, las cuales demostraron que crecen mejor a pH básicos de 7,5- 8,5 y a temperaturas de 28°C - 30°C. Se concluye que los actinomicetos rizosféricos de papa nativa producen metabolitos que inhiben el crecimiento de Phytophthora infestans, por lo que son microorganismos con potencial para ser usados en el control de enfermedades en la papa. / Tesis

Publicación a texto completo no autorizada por el autor / La marchitez bacteriana causada por Ralstonia solanacearum E.F. Smith es la más importante enfermedad bacteriana que ataca a cultivos agrícolas como papa, tomate, banana, etc. causando grandes pérdidas en la producción. Desafortunadamente, su control ha sido difícil por su amplio rango de hospederos alternativos, por su supervivencia en el suelo, por su variación biológica y genética, por su poca fuente de resistencia natural y por no contar con métodos químicos apropiados. La búsqueda de métodos que confieran resistencia en una variedad de importancia alimenticia y económica sería una ventaja muy significativa. Sin embargo, es necesario primero conocer cómo el patógeno logra desarrollar la enfermedad en su hospedero, como se comunica y que estrategia usa para ser virulento y causar daño en la planta. Ralstonia solanacearum posee un sistema quorum sensing para la regulación de la expresión de genes de virulencia, la molécula 3-OH-PAME es el autoregulador de esta señal. Adicionalmente se conoce que la molécula ΒHPMEH hidroliza a 3-OH-PAME anulando así la señal de virulencia y por tanto la comunicación quorum sensing en R. solanacearum. Con este objetivo se realizó la evaluación del gen βhpmeh. Para ello, se diseñaron dos vectores que expresen este gen los cuales fueron verificados por análisis de restricción y secuenciamiento para posteriormente, mediante técnicas de Agroinfiltración, observar su expresión y su efecto frente a R. solanacearum en hojas de papa Solanum tuberosum. Los resultados de la expresión transitoria muestran que el gen βhpmeh retrasó la aparición de síntomas de la marchitez bacteriana y por lo tanto es un candidato para la transformación genética de S. tuberosum. / Tesis