Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-04-20T13:29:55Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2004951 bytes, checksum: af2cf655612e0926ca2affdb10ed2ec7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-20T13:29:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2004951 bytes, checksum: af2cf655612e0926ca2affdb10ed2ec7 (MD5) Previous issue date: 2015-07-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A importância da couve é crescente no Brasil, porém, há poucos trabalhos na literatura que visam obter informações para o melhoramento genético desta cultura. Objetivou-se avaliar famílias de meios irmãos de couve a fim de obter informações sobre: O efeito da transformação indicada pela metodologia Box-Cox na normalidade dos resíduos, homocedasticidade, nas estimativas de parâmetros e valores genéticos em famílias de meios irmãos de couve; As possíveis consequências da seleção truncada nas principais características de interesse agronômico pelo estudo da análise de trilha; As estimativas de parâmetros genéticos e valores genéticos aditivos individuais em famílias de meios irmãos de couve; Os ganhos esperados com a seleção simultânea baseando nas médias dos ranks; O número mínimo de avaliações para a seleção de famílias de meios irmãos de couve; A obtenção de estratégias para o estudo da dissimilaridade genética considerando dados quantitativos e qualitativos coletados em nível de planta; e, determinar as famílias mais divergentes. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Viçosa (UFV) em blocos ao acaso com quatro repetições e cinco plantas por parcela. Foram avaliadas 24 famílias de meios irmãos de couve de folhas oriundas de acessos do banco de germoplasma da Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM) e duas testemunhas comerciais. Concluiu-se que: O uso da transformação Box-Cox não influencia na seleção dos melhores genótipos, na estimativa de parâmetros genéticos e que nem sempre garante o atendimento das pressuposições de normalidade e homocedasticidade; A seleção truncada para o número de folhas proporciona ganhos de seleção indiretos favoráveis para todas as características; O uso do índice de seleção baseada na média dos ranks indica a viabilidade da seleção simultânea para o melhoramento genético da população estudada; Com 8 colheitas é possível avaliar todas as características com um coeficiente de determinação superior a 85%. A conversão de matrizes de dissimilaridade do nível de planta para o nível de família apresenta grande potencial para estudos de dissimilaridade com dados multicategóricos obtidos em nível de planta; As cultivares comerciais e as família F13 são dissimilares em relação às demais famílias de meios irmãos, já as famílias F8, F12, F14 e F22 apresentam pequena dissimilaridade entre si. / The importance of kale has grown in Brazil; however, there are few studies aimed at obtaining information for the genetic improvement of this crop. The objectives of this study were to evaluate kale half-sib families in order to obtain information regarding: the effect of the transformation indicated by the Box-Cox methodology in normality of residuals, homoscedasticity, estimates of parameters, and genetic values in kale half-sib families; the possible consequences of truncated selection in the main characteristics of agronomic interest through the study of the path analysis; the estimates of genetic parameters and genetic individual additive values in kale half-sib families; the expected gains with the simultaneous selection based on the mean of ranks; the minimum number of evaluations for the selection of kale half-sib families; strategies for the study of genetic dissimilarity considering quantitative and qualitative data collected at plant level; and the determination of the most divergent families. The experiment was carried out at the Universidade Federal de Viçosa (UFV) in a randomized block design with four replications and five plants per plot. It was evaluated 24 kale half-sib families from the accesses of the Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri’s (UFVJM) germplasm bank, and two commercial checks. It was concluded that: the Box-Cox transformation does not influence the selection of the best genotypes, nor the estimate of genetic parameters, and it does not always meet the assumptions of normality and homoscedasticity; the truncated selection for number of leaves provides favorable indirect selection gains for all characteristics; the use of the selection index based on the mean of ranks indicates the feasibility of simultaneous selection for genetic improvement of the studied population; and that with eight harvests it is possible to evaluate all the characteristics with a coefficient of determination superior to 85%; the conversion of dissimilarity matrices from plant level to family level presents great potential for dissimilarity studies with multicategoric data obtained at plant level. The commercial cultivars and the F13 family are dissimilar in relation to the other half-sib families; on the other hand, F8, F12, F14 and F22 families have little dissimilarity among them.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-30Bitstream added on 2014-06-13T18:29:28Z : No. of bitstreams: 1 buzanskas_me_me_jabo.pdf: 287295 bytes, checksum: 143c58eec91adb632f95592d8c22bf67 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / As características reprodutivas das fêmeas são de grande importância na exploração de bovinos de corte no Brasil, pois estas influenciam diretamente no número de bezerros produzidos. A habilidade de permanência de fêmeas no rebanho apresenta grande impacto nos custos das propriedades rurais, pois está diretamente ligada à capacidade das vacas em produzir determinado número de bezerros em um espaço de tempo. O objetivo deste trabalho foi estudar a habilidade de permanência de fêmeas no rebanho aos 76 meses de idade (HP) e suas associações genéticas com a idade ao primeiro parto (IPP), peso corporal de machos e de fêmeas aos 420 dias de idade (P420) e perímetro escrotal aos 420 dias de idade (PE420), para fornecer subsídios ao programa de avaliação genética da raça Canchim. Por se tratar de uma característica binária, definiu-se HP como sucesso (2) quando as fêmeas obtiveram no mínimo três bezerros até os 76 meses de idade e fracasso (1) para as demais. No modelo animal, foi incluído o efeito fixo de grupo de contemporâneos (GC) e os efeitos aleatórios aditivos direto e residual. Os dados foram analisados por meio de inferência Bayesiana, em análise bi-característica de HP com as demais características. Aos 76 meses de idade 40,77% das vacas obtiveram sucesso. As médias de IPP, P420 e PE420 foram iguais a 40,28 ± 7,85 meses, 254,92 ± 45,05 kg e 24,63 ± 3,84 cm, respectivamente. As estimativas de herdabilidade obtidas para HP, IPP, P420 e PE420 foram iguais a 0,03 ± 0,01; 0,04 ± 0,01; 0,24 ± 0,04 e 0,24 ± 0,06, respectivamente. As associações genéticas da característica HP com IPP, P420 e PE420 foram iguais a -0,63 ± 0,20; -0,09 ± 0,11 e 0,45 ± 0,21, respectivamente. As correlações ambientais, de HP com IPP e P420 foram iguais... / Improvement of female fertility has become of fundamental importance for profit maximization in the beef cattle herds in Brazil. The stayability trait was defined as whether or not a cow calved in a herd at a specific age. Therefore, the objectives of the present study are to analyze stayability (Stay) and its genetic association with age at first calving (AFC), body weight in males and females at 420 days of age (BW420) and scrotal circumference at 420 days of age (SC420), in Canchim cattle. In this research, Stay was defined as success (2) for females that had a minimum of three calves at 76 months of age and failure (1) for the others. Genetic parameters were estimated for all traits. The animal model included the fixed effect of contemporary group (CG) and the additive direct and residual random effects. The data was studied using Bayesian inference in two-trait analyses. At 76 months of age the percent of success was equal to 40.77%. The means for AFC, BW420 and SC420 were equal to 40.28 ± 7.85 months, 254.92 ± 45.05 kg e 24.63 ± 3.84 cm, respectively. The analyses provided heritability estimates of 0.03 ± 0.01, 0.04 ± 0.01, 0.24 ± 0.04 and 0.24 ± 0.06 for Stay, AFC, BW420 and SC420, respectively. The estimates of posterior genetic association were equal to -0.63 ± 0.20, -0.09 ± 0.11 and 0.45 ± 0.21 between Stay with AFC, BW420 and SC420, respectively. The environmental association between Stay with AFC and BW420 were 0.02 ± 0.01 and -0.06 ± 0.04, respectively, and for SC420 the environmental correlation was computed as zero. Selection for higher BW420 should not improve the Stayability trait. However, selection for SC420 should improve this trait and also contribute positively in Stayability. The improvement of age at first calving and Stayability should not be obtained by selection for these traits, but mainly, by changes in management and environmental conditions.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-16Bitstream added on 2014-06-13T18:29:30Z : No. of bitstreams: 1 guidolin_dgf_me_jabo.pdf: 239613 bytes, checksum: 25503ca97d099f8707e7f0c6cd325324 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A identificação de interação genótipo-ambiente em bovinos de corte pode auxiliar o processo de seleção, aumentando a eficiência da avaliação genética de reprodutores submetidos à ambientes distintos. Características medidas pós-desmame estão mais sujeitas aos efeitos da interação genótipoambiente do que na fase pré-desmame. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar a existência do efeito da interação genótipo-ambiente sobre os pesos corporais aos 365 (P365), 450 (P450) e aos 550 (P550) dias de idade de bovinos Nelore criados nos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais, Pará e São Paulo. Os componentes de (co)variância, parâmetros genéticos e os valores genéticos preditos foram estimados para cada característica, por estado e para o conjunto total de dados, pelo método da máxima verossimilhança restrita. Correlações de Spearman entre as classificações dos touros por estado quanto ao valor genético para cada característica ou considerando cada estado individualmente e em conjunto (todos os estados), assim como a correlação genética entre observações da mesma característica, medida em dois estados distintos foram utilizadas para avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre as características estudadas. Correlações de Spearman não significativas indicaram mudança de posição na classificação de touros e conseqüente existência de interação genótipo-ambiente. A ocorrência desta interação também foi constatada em algumas ocasiões por estimativas de correlação genética entre observações da mesma característica em estados diferentes, para P365 foi observada indícios de interação entre SP e GO (0,71), SP e MT (0,68) e também entre SP e PA (-0,11), para P450, MT e MG (-0,28), GO e PA (0,62) e SP e PA (0,66), para a característica P550, MT e MG (-0,38), MG e PA (0,73), MG e SP (-0,34) e para... / The properly identification of genotype-environment interaction in beef cattle herds can help the selection process and improve genetic evaluation of sires submitted in different environments. Post weaning traits may be more influenced by the genotype-environment interactions than others. So, this paper objective was verify genotype-environment interaction in, beef cattle, body weight at 365 (P365), 450 (P450) and 550 (P550) days of age in herds distributed in six Brazilian states, Goiás (GO), Mato Grosso (MT), Mato Grosso do Sul (MS), Minas Gerais (MG), Pará (PA) and São Paulo (SP). Genetic parameters, (co)variance components and genetic values were estimated for each trait, each state and for all states together, using maximum restricted likelihood method. Spearman correlations among sire’s classifications due to its genetic value, for each trait, by state individually or in group (using data from all states), genetic correlation between the same trait measured in two different states were used to evaluate genetic-environment interaction over the traits studied. Non significant Spearman’s correlation indicated position changes at sires classification and consequently genotype-environment interaction. This interaction occurrence was also observed between genetic correlations of the same trait measured in two different states. Genetic correlation for P365, between SP and GO states were (0, 71), SP and MT (0, 68) and also between SP and PA (-0, 11). For P450, MT and MG (-0, 28), GO and PA (0, 62) and SP and PA (0, 66). P550, MT and MG (-0, 38), MG and PA (0, 73), MG and SP (-0, 34) and SP and PA (-0, 86). There so, selection conduced considering data obtained in one state could be different than one based in others. Beef cattle summary organized by state would be indicated if this one would be economically viable.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-11Bitstream added on 2014-06-13T21:05:30Z : No. of bitstreams: 1 taveira_rz_dr_botfmvz.pdf: 263449 bytes, checksum: 25a9e90e6bbf0574c26236eb35b75feb (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Poucas informações encontram-se disponíveis acerca dos parâmetros genéticos de características reprodutivas em eqüinos. Sendo assim, conduziu-se um estudo utilizando informações provenientes de 7.278 éguas da raça Puro-Sangue Inglês, sendo 6.327 informações sobre a idade à primeira cobertura (IPC), 5.400 relativas a idade à primeira parição (IPP), 5.473 referentes ao primeiro período de gestação (PPG) e 4.404 relativas ao primeiro intervalo de partos (PIEP). Os dados foram analisados pelo método da máxima verossimilhança restrita, com a utilização do aplicativo MTDFREML para estimação dos componentes de variância e covariância. A idade média à primeira cobertura foi de 4,93 anos, com desvio padrão de 1,45 anos, mínimo de 2,07,anos máximo de 11,94 anos e estimativa de herdabilidade (h2) de 0,19. A idade média à primeira parição foi de 6,01 anos, com desvio padrão de 1,53 anos, mínimo de 3,01anos, máximo de 12,9 anos e estimativa de herdabilidade de 0,38. O primeiro período de gestação médio foi de 337,83 dias, com desvio padrão de 9,47 dias, mínimo de 302 dias, máximo de 396 dias e estimativa de herdabilidade de 0,16. O primeiro intervalo de partos médio foi de 490,18 dias, com desvio padrão de 192,02 dias, mínimo de 303 dias, máximo de 1.095 dias e estimativa de herdabilidade de 0,01. As correlações genéticas encontradas entre a IPC e o IPP, PIEP e PPG foram 1, 0,55 e - 0,13, respectivamente. As correlações genéticas da IPP com PIEP e PPG foram 0,52 e 0,35, respectivamente, enquanto que a correlação genética entre o PIEP e PPG foi de - 0,54. Das características avaliadas a IPP mostrou-se mais interessante para incorporação em programas de seleção que visem melhorar aspectos reprodutivos de eqüinos da raça Puro-Sangue Inglês no Brasil. / There is very little information on the genetic parameters of reproductive traits in equine. With that in mind, a study was conducted using information from 7,278 Thoroughbred mares, of which 6,327 entries were about age at first covering (AFC), 5,400 relating to age at first foaling (AFF), 5,473 relating to first gestation period (FGP) and 4,404 relating to first foaling interval (FFI). The data were analyzed by Maximum Restricted Likelihood, with the application of MTDFREML, to estimate variance and covariance components. Average age at first covering was 4.93 years, with a standard deviation of 1.45 years, minimum of 2.07 years, maximum of 11.94 years and heritability estimate (h2) of 0.19. Average age at first foaling was 6.01 years, with a standard deviation of 1.53 years, minimum of 3.01 years, maximum of 12.9 years and estimative of heritability of 0.38. The first average gestation period was 337.83 days, with a standard deviation of 9.47 days, minimum of 302 days, maximum of 396 days and estimative of heritability of 0.16. First foaling interval was 490.18 days, with a standard deviation of 192.02 days and minimum of 303 days, maximum of 1,095 days and estimative of hereditability of 0.01. Genetic correlations found between AFC and AFF, FFI and FGP were 1, 0.55 and - 0.13, respectively. Genetic correlations of AFF with FFI and FGP were 0.52 and 0.35, respectively, whereas the genetic correlation between FFI and FGP was - 0. 54. Among the evaluated traits, AFF was shown to be the most interesting to incorporate in selection programs whose aim is to improve reproductive traits in Thoroughbred horses in Brazil.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-17Bitstream added on 2014-06-13T20:06:57Z : No. of bitstreams: 1 garcia_fq_dr_ilha.pdf: 352246 bytes, checksum: 097f8549b6195af1104ffbbd10cb0141 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O milho é uma planta cultivada no mundo todo e de importância econômica mundial. Em função de sua importância, amplos programas de melhoramento são realizados nesta cultura. Das várias técnicas utilizadas, a seleção recorrente recíproca tem sido importante na melhoria do cruzamento entre duas populações e, consequentemente, na obtenção de melhores híbridos entre linhagens extraídas das mesmas. No entanto o sucesso da seleção recorrente recíproca depende da existência de variabilidade genética interpopulacional e heteroze. O objetivo deste trabalho foi verificar a existência de variabilidade genética nas populações de milho de porte baixo Isanão-VF1 e Isanão-VD1, em condições de espaçamento reduzido e alta densidade de plantas, visando o início de um programa de seleção recorrente recíproca. Foram estimados parâmetros genéticos para oito caracteres, avaliando-se 80 progênies de meios irmãos interpopulacionais Isanão-VF1 e 72 Isanão-VD1, semeadas na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia, Campus de Ilha Solteira (UNESP), em Selvíria/MS. Foi encontrada variabilidade genética interpopulacional, expressa através dos caracteres florescimento feminino (FF), altura de plantas (AP), altura de espigas (AE) e rendimento de grãos (RG), com herdabilidades (em nível de médias de progênies) de 68,8%, 76,9%, 75,0% e 54,78%, respectivamente. Os índices de variação (coeficiente de variação genético/coeficiente de variação experimental) foram de 0,9; 1,1; 1,0 e 0,6, respectivamente para FF, AP, AE e RG. Espera-se um ganho de 10,76%/ciclo de seleção no RG do híbrido interpopulacional, 19 qualificando as populações Isanão-VF1 e Isanão-VD1 para serem submetidas a um programa de seleção recorrente recíproca. Com uma heterose de 38,2% do híbrido interpopulacional sobre as populações... / Maize is a cultivated crop around the globe, and of worldwide economic importance. Due to its importance, wide genetic breeding programs are constantly applied upon it. Among the techniques employed, reciprocal recurrent selection has been important in improving the cross between two populations and in obtaining superior hybrids of inbred lines originated from them. However, the success of reciprocal recurrent selection is dependent of interpopulation genetic variability. The objective of this research was to verify the presence of genetic variability in brachytic populations Isanão-VF1 and Isanão-VD1 maize, cultivated in reduced row spacing and high plant density, aiming at beginning a reciprocal recurrent selection breeding program. Were Genetic parameters estimated for eight traits, evaluated in 80 interpopulation half-sib progenies of Isanão-VF1 and 72 of Isanão-VD1, at the UNESP Research Farm, located in Selvíria, state of Mato Grosso do Sul, Brazil. Interpopulational genetic variability was expressed in the traits silk emergence (FF), plant height (AP), ear height (AE) and grain yield (RG). The coefficients of heritability progeny mean basic were 68.8%, 76.9%, 75.0% and 54.8%, respectively. Estimates of the index of variation (genetic variation coefficient/experimental variation coefficient) were 0.9, 1.1, 1.0 and 0.6, for SE, PH, EH and GY, respectively. A gain of 10.76%/cycle on GY is expected on the interpopulation hybrid, indicating Isanão-VF1 and Isanão-VD1 populations as base for a reciprocal recurrent selection progr am. The heterosis of 38.2% of the interpopulation hybrid over the parental populations qualify the latter as a sources of inbred lines, to be used us hybrid crosses more adapted the condition of high plant density and reduced row spacing.

Submitted by DANIELA BARRETO AMARAL TEIXEIRA null (danielabateixeira@hotmail.com) on 2016-07-09T12:26:08Z No. of bitstreams: 1 DissertaçãoDaniela.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-12T16:54:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 teixeira_dba_me_jabo.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T16:54:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 teixeira_dba_me_jabo.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) Previous issue date: 2016-06-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A habilidade de permanência (HP), que pode ser definida como a probabilidade de uma vaca parir numa determinada idade, dado que ela teve esta oportunidade, é uma característica reprodutiva de grande importância em bovinos de corte, estando diretamente relacionada à produtividade do rebanho. O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos e identificar possíveis regiões do genoma que estejam associadas com a expressão fenotípica da HP de vacas da raça Nelore. Os componentes de variância foram estimados por inferência bayesiana utilizando um modelo de limiar no qual foram considerados os efeitos sistemáticos de grupos de contemporâneos e precocidade sexual, e os efeitos aleatórios de animal e resíduo.Os efeitos dos SNPs foram estimados por meio da metodologia ssGBLUP, sendo utilizados na análise 2838 animais genotipados com o painel de alta densidade da Illumina (Bovine HD Assay Illumina, San Diego, CA, USA). A variância explicada por janelas formadas por 200 SNPs consecutivos foi utilizada na identificação das regiões de maior efeito sobre a expressão da característica HP. A herdabilidade encontrada utilizando a matriz A (pedigree) foi de 0,11±0,01 e utilizando a matriz H( matriz de parentesco que combina a informação de pedigree e dos SNPs) de 0,14±0,01. Foram encontrados 147 genes candidatos para a característica habilidade de permanência em regiões dos cromossomos 1, 2, 5, 6, 9, 20 e no cromossomo sexual X. Novas regiões candidatas para a característica habilidade de permanência foram detectadas e a maioria está relacionada a funções reprodutivas, imunológicas e ligadas ao sistema nervoso. / Stayability, which can be defined as the probability of a cow calving to a certain age since it has this opportunity, is a reproduction trait of great importance in beef cattle and is directly related to the productivity of the herd. The objective of this study was to estimate variance components through single-step G-BLUP methodology, and use the solutions of the SNPs effects to identify possible regions of the genome that are associated with the phenotypic expression of stayability in Nellore cows. The variance components were estimated by Bayesian inference using a threshold model in which were considered the fixed effects of precocity and contemporary groups, and the random effects of residue and animal. The effects of SNP were estimated by ssGBLUP methodology being used for the analysis 2838 animals genotyped with the Illumina panel of high density ( HD Assay Bovine Illumina, San Diego, CA , USA ). A Manhattan plot containing the variance explained by the windows formed by 200 SNPs consecutive was used to identify regions of greatest effect on the expression of stayability trait. The heritability found using the A matrix was 0.11 ± 0.01 and using the H matrix was 0.14 ± 0.01. 147 potential genes for stayability were found in regions of chromosomes 1,2,5,6,9,20 and sexual chromosome X. New candidate regions for stayability were detected and most of them are related to reproductive, immune and nervous system. / FAPESP: 2009/16118-5

Submitted by LUCAS HENRIQUE BRITO SALES null (lucash.b.s@hotmail.com) on 2017-07-31T16:19:43Z No. of bitstreams: 1 Dissertação FINAL_Lucas Brito.pdf: 2624281 bytes, checksum: 4b18f17d4f492f2f78b7d31bebab7f64 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-08-03T15:04:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 sales_lhb_me_jabo.pdf: 2624281 bytes, checksum: 4b18f17d4f492f2f78b7d31bebab7f64 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-03T15:04:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 sales_lhb_me_jabo.pdf: 2624281 bytes, checksum: 4b18f17d4f492f2f78b7d31bebab7f64 (MD5) Previous issue date: 2017-06-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A análise de componentes principais (PCA) e análise de fatores (FA) são amplamen-te utilizadas no processamento de dados visando a redução da dimensionalidade. No entanto, poucos são os estudos que empregou estes métodos em um conjunto de características importantes em bovinos da raça nelore com a finalidade de mode-lar a estrutura de (co)variância dos dados. O objetivo deste estudo foi estimar pa-râmetros genéticos para as características de crescimento, carcaça e qualidade da carne em machos Nelore, utilizando diferentes modelos multi-características visando a redução da dimensionalidade dos dados. Um total de 3.865; 4.121; 4.109; 4.188; 4.213; 3.320 e 16.575 registros de peso da carcaça quente (PCQ), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), escore de marmorização (MARM), maciez, mensurada pela força de cisalhamento (SF), lipídios (LP) e peso ao sobreano (PS), respectivamente, foram usados. As análises foram realizadas por meio de cinco modelos: multi-característica padrão, três modelos de posto reduzido ajustando os primeiros três (PC3), quatro (PC4) e cinco (PC5) componentes princi-pais genéticos e um modelo utilizando análise de fatores com três (FA3) fatores. Os modelos foram comparados pelo Critério de Informação de Akaike (AIC) e Critério Bayesiano de Schwarz (BIC), levando em consideração o número de parâmetros. Foram considerados para todos os modelos os efeitos aleatórios genético aditivo direto e residual, e os efeitos fixos do grupo de contemporâneos e o efeito linear da idade do animal ao abate como covariável, exceto para peso ao sobreano. Os mo-delos de análise de fatores e componentes principais genéticos selecionados por ambos os critérios de seleção foram o PC3 (BIC), PC4 (AIC) e o FA3 (AIC e BIC), com 46, 50 e 53 parâmetros, respectivamente. No entanto, o modelo que mais se aproximou do modelo multi-característica padrão foi o PC4, sendo então, o mais indicado devido a semelhança das estimativas de (co)variância. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,06 (LP) a 0,31 (AOL) com MV e 0,04 (LP) a 0,30 (AOL) com o PC4. As maiores estimativas de correlações genéticas foram entre as carac-terísticas PCQ x SF, PCQ x PS e MARM x LP, sendo similar nos modelos MV e PC4. As maiores estimativas de correlações fenotípicas foram entre as característi-cas de peso e AOL (PS x SF), (PS x AOL) e (SF x AOL). Em geral, foram necessá-rios quatro componentes principais para modelar a estrutura das (co)variâncias ge-néticas para as características de crescimento, carcaça e qualidade da carne. O modelo de posto reduzido indicado pelo o AIC (PC4) reduziu o número de parâme-tros a serem estimados em 21,4%, sem diminuir a qualidade do ajuste. / Principal component (PCA) and factor analysis (FA) are widely used in data processing to reduce dimensionality. However, few studies have used these methods in a set of important traits in Nelore cattle for the purpose of modeling the covariance structure data. The aim of this study was to estimate genetic parameters for growth, carcass and meat quality traits in Nellore males, using different multivariate models to reduce the dimensionality data. A total of 3.865; 4.121; 4.109; 4.188; 4.123 3.320 and 16.575 records, hot carcass weight (HCW), 12-13th rib eye area (REA), backfat thickness (BF), marbling score (MS), warner-wraztler wear force (WBSF), lipid content (LC), and weight at 550 days (W550), respectively, were used. The analyzes were performed using five models: standard multi-characteristic, three reduced-rank models, and adjusted the first three (PC3), four (PC4) and five (PC5) genetic main components, and a model using factor analysis with three (FA3) factors. The models were compared by the Akaike Information Criterion (AIC) and Schwarz Bayesian Criterion (BIC), taking into account the parameters number. The random effects of the direct and residual additive genetic and the fixed effects of the contemporaneous group and the linear effect of animal age on slaughter were considered as covariate, except for yearling weight. The analysis models of genetic factors and main components selected by both selection criteria were PC3 (BIC), PC4 (AIC) and FA3 (AIC and BIC), with 46, 50 and 53 parameters, respectively. However, the model that most approached the standard multi-characteristic model was PC4, and is therefore most appropriate due to the similarity of covariance estimates. Estimates of heritability ranged from 0.06 (LP) to 0.31 (AOL) with MV and 0.04 (LP) to 0.30 (AOL) with PC4. The highest estimates of genetic correlations were among the characteristics PCQ x SF, PCQ x PS and MARM x LP, being similar in the MV and PC4 models. The highest estimates of phenotypic correlations were among the weight and AOL (PS x SF), (PS x AOL) and (SF x AOL) traits. In general, four main components were required to model the structure of the genetic covariances for growth, carcass and meat quality traits. The reduced rank model indicated by the AIC (PC4) reduced the parameters number to be estimated by 21.4%, without decreasing the quality of the adjustment. / CNPq: 184428-1

Submitted by Alejandro Barrera Carvajal null (alejandrobarreracarvajal@gmail.com) on 2017-10-05T04:26:06Z No. of bitstreams: 1 Dissertaçao_Alejandro_Barrera_Carvajal.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) / Approved for entry into archive by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com) on 2017-10-09T16:57:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 barreracarvajal_a_me_jabo.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-09T16:57:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 barreracarvajal_a_me_jabo.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O conhecimento da estrutura de uma população é importante quando se deseja manter a variabilidade genética em programas de melhoramento genético. As estimativas dos parâmetros genéticos permitem identificar as características de interesse econômico que podem responder a seleção direta ou indireta. Neste trabalho, objetivou-se avaliar a estrutura genética populacional e estimar os parâmetros genéticos para as características peso corporal da fêmea na entrada (PEP) e na saída (PSP) da primeira estação de monta, idade ao primeiro parto (IPP), peso corporal da vaca ao primeiro parto (PPP), peso corporal da vaca ao primeiro desmame (PPD) e perímetro escrotal aos 378 dias (PE378) em bovinos da raça Caracu, para avaliar critérios de seleção e os procedimentos de acasalamento para manter a variabilidade genética da população. A estrutura genética da população foi avaliada pelo tamanho efetivo (Ne), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa), intervalos de geração, coeficiente de endogamia (F), coeficiente de parentesco médio (AR) e integridade do pedigree. Os parâmetros genéticos foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML) por meio de modelo animal multi-característica. Os resultados obtidos para Ne na geração máxima, completa e equivalente, foram 180,90; 57,39; e 92,38, respectivamente. O valor para fe foi de 199 e para fa de 27. O coeficiente de endogamia médio e o parentesco médio foram 2,14% e 5,72%, respectivamente. Na avaliação da integridade do pedigree foram identificados 94,83% das mães e 93,82% dos pais com registros de origem. As estimativas de herdabilidade para as características de peso corporal variaram de 0,37 ± 0,09 (PPP) a 0,46 ± 0,08 (PPD). Para as características reprodutivas, as estimativas de herdabilidade foram 0,31 ± 0,10 para PE378 e 0,10 ± 0,06 para IPP. As correlações genéticas variaram de -0,37 ± 0,30 (PE378 e IPP) a 0,94 ± 0,06 (PSP e PPP). As correlações genéticas entre os pesos corporais medidos durante o primeiro ciclo reprodutivo e IPP indicaram que a seleção visando controlar o peso corporal nesse período não irá afetar a idade ao primeiro parto. A correlação genética favorável obtida entre PE378 e IPP (-0,37±0,30) indicou que a seleção para PE378 nos machos poderá favorecer a redução de idade ao primeiro parto das fêmeas. A partir dos parâmetros populacionais, concluiu-se que a variabilidade genética da população tem sido mantida, assim como os níveis de endogâmia, em decorrência do controle dos acasalamentos no decorrer das gerações. / The knowledge of the structure of the population is important to desired to maintain genetic variability in breeding programs. The genetic parameters estimates allow identifying economic interest traits that can respond to direct or indirect selection. The goal of this study was to evaluate the population genetic structure and to estimate the genetic parameters for the body weight of the cow at the beginning (WBF) and at the end (WEF) of the first breeding season, age at first calving (AFC), body weight of cow at first calving (WFC), body weight of cow at first weaning (WFW) and scrotal circumference measured at 378 days (SC378) in Caracu beef cattle, to assess the selection criteria and to indicate mating procedures to maintain the genetic diversity of the population. The genetic structure of the population was verified of the effective population size (Ne), the effective number of the founders (fe), the effective number of the ancestors (fa), the generational intervals, the inbreeding coefficient (F), the average relatedness (AR) and of the pedigree integrity. The restricted maximum likelihood method (REML) was used to estimate the genetic parameters under multitrait animal model. The maximum, complete and equivalent generation for Ne was 180.90; 57.39 and 92.38, respectively. For the fe were 199 and for fa 27. The average of the inbreeding coefficient and the AR were 2.14% and 5.72%, respectively. The integrity of the pedigree identified was 94.83% of the dam and 93.82% of the sire with known initial records Estimates of heritability for body weight traits ranged from 0.37 ± 0.09 (WFC) to 0.46 ± 0.08 (WFW). For the reproductive traits, the heritability estimates were 0.31 ± 0.10 for SC378 and 0.10 ± 0.06 for AFC. Genetic correlations ranged from -0.37 ± 0.30 (SC378 and AFC) to 0.94 ± 0.06 (WEF and WFC). Genetic correlations between body weights measured during the first reproductive cycle and the AFC indicated that selection to control body weight in this period will not affect age at first calving. The favorable genetic correlation obtained between SC378 and AFC (-0.37 ± 0.30) indicated that selection for SC378 of males may reduce the age at first calving of females. The population parameters showed that the genetic variability of the population has been maintained, as well as the levels of the inbreeding due to the control of mating during the generations.

Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2018-12-04T12:12:31Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Letycia Basso Garcia - 2017.pdf: 3161693 bytes, checksum: 8ea7726402d9acbdddc870e75a0b1cef (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-12-05T09:52:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Letycia Basso Garcia - 2017.pdf: 3161693 bytes, checksum: 8ea7726402d9acbdddc870e75a0b1cef (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-12-05T09:52:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Letycia Basso Garcia - 2017.pdf: 3161693 bytes, checksum: 8ea7726402d9acbdddc870e75a0b1cef (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-05-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Improving rice yield has been a big challenge for rice breeding programs around the world. One alternative to identify inbred lines with high yield potential, and discover genes related to yield and its components is to explore the genic pool of the population originated from crosses between cultivars not regularly used, as those introduced from another country. The objective of this study was characterizing a recombinant inbred lines population from the cross between Maninjau and Epagri 108. There were evaluated 296 RILs in experiments conducted in Goianira (GO), Boa Vista (RR) and Pelotas (RS), in 2016. In the experiments in GO and RR, the alpha lattice design (17x18) with two replications were used, and in Pelotas was applied the BAF design. Data were collected for yield (PD) and plant height (AP) in the three places, days to flowering (DF), in RR and GO, 100-grain weight (PG), in RS and GO and leaf blast resistance (BS), in GO. The data were analyzed by a mixed model with the deviance analysis. Variance components were estimated by REML/BLUP and the genetic parameters and correlation coefficients were calculated. The statistics parameters as CV e , CV g , CV r and selective accuracy were also estimated. The G x E interaction analysis was processed by the MHPRVG method. Also, the genetic distances between the progenies that had highest breeding values in each place and their relatives (Maninjau and Epagri 108), was estimated, using a 24 SSR markers panel. For Boa Vista and Goianira, most of the highest yield RILs were like the parental Epagri 108. Most of the random effects of the statistic model used in this study were significant. The RILs population showed genetic variability inside (σ g2 significant). The experimental precision in RR and GO was from good to excellent with accuracy over 90% and in RS it was moderate (~50%), probably because of the environmental effect action. Yield showed moderate heritability (0,67) and the characters DF, AP and PG showed high heritability (>0,90). Positive significant correlation was observed between the characters PD and PG, and DF and AP, however the last one showed negative correlation with yield. Nine RILs had the best performance by the MHPRVG, and it was above 30% of the general mean. They are recommended for the breeding program use. The RIL 105 were ranked as the best for stability, adaptability and yield, simultaneously. These results suggest that there is a significant genetic variation between the RILs evaluated. Therefore, this population might be used either in selection of high yield performance genotypes or for QTL mapping foragronomic traits in many environments. / O aumento da produtividade em arroz é um desafio para os programas de melhoramento do mundo todo. Uma alternativa para identificar linhagens mais produtivas, ou mesmo descobrir genes correlacionados à produtividade e seus componentes, é conhecer e explorar o pool gênico de populações provenientes de cruzamentos entre cultivares ainda pouco utilizadas, como materiais introduzidos. O objetivo desse trabalho foi caracterizar uma população de linhas puras recombinantes (RILs), provenientes do cruzamento entre Maninjau x Epagri 108. Foram avaliadas 296 RILs em experimentos conduzidos em Goianira (GO), Boa Vista (RR) e Pelotas (RS), no ano de 2016. Em GO e RR os ensaios foram implantados em delineamento alfa-látice (17x18) e em Pelotas foi utilizado BAF. Foram coletados dados referentes à produtividade (PD) e altura de plantas (AP) nos três locais, além de dias até o florescimento (DF), em RR e GO, peso de 100 grãos (PG), em RS e GO. Os dados foram analisados via modelos mistos, através da análise de deviance. Os componentes de variância foram estimados via REML/BLUP e foram estimados os parâmetros genéticos e coeficientes de correlação entre caracteres, bem como os parâmetros estatísticos CV e , CV g , CV r e acurácia seletiva. A análise de interação G x E foi feita com base no método da MHPRVG. Foram estimadas as distâncias genéticas entre as linhagens de maior valor genotípico em cada local e os parentais do cruzamento, através de um painel de 24 marcadores SSR, e para Boa Vista e Goianira, a maioria das linhagens mais produtivas foram mais similares ao genitor Epagri 108. A maioria dos efeitos aleatórios do modelo estatístico adotado foi significativa. A população de RILs apresentou variabilidade genética (σ g2 significativo). A precisão dos experimentos de RR e GO foi de boa à ótima, com acurácia maior que 90%, enquanto do RS foi moderada (~50%), provavelmente devido à maior ação do efeito ambiental. A produtividade se revelou com h2 moderada (0,67) e os caracteres DF, AP e PG apresentaram alta herdabilidade (>0,90). Foi verificada correlação positiva significativa entre os caracteres PD e PG e DF e AP, porém esses dois últimos têm correlação negativa significativa com a produtividade. Nove RILs se destacaram pela MHPRVG, com desempenho superior a 30% em relação à média geral. Elas são, portanto, recomendadas para uso do programa de melhoramento. A RIL 105 foi classificada como a de melhor estabilidade, adaptabilidade e produtividade, simultaneamente. Os resultados indicam que a população tem alta variabilidade genética e, pode ser utilizada tanto na seleção de genótipos de bom desempenho produtivo, quanto na detecção de QTLs para caracteres de interesse agronômico em múltiplos locais.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-30T13:55:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Catiele Vieira Borges.pdf: 2168600 bytes, checksum: 760def8d1f1022788d69706082231712 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-30T13:55:28Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Catiele Vieira Borges.pdf: 2168600 bytes, checksum: 760def8d1f1022788d69706082231712 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-30T13:55:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Catiele Vieira Borges.pdf: 2168600 bytes, checksum: 760def8d1f1022788d69706082231712 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-30T13:55:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Catiele Vieira Borges.pdf: 2168600 bytes, checksum: 760def8d1f1022788d69706082231712 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The pupunheira (Bactris gasipaes Kunth, Palmae) is one of the few domesticated palm trees, whose heart of palm and fruits stand out in the diet, especially in the Amazon region. However, there are no cultivars developed for fruit production, which are still targeted either for subsistence of riverine populations or for municipal markets, different from the cultivation for heart of palm which is a growing agribusiness. The fruits of the pupunheira have a great natural variability of colors, flavors, oiliness and texture. However, this variability also limits its market, since the fruits suitable for consumption in natura, production of flour or oil, have different characteristics. Therefore, given the importance of pupunheira cultivation for fruit production, the objective of this research is to direct strategies of genetic improvement for production of pupunha fruits from the evaluation of agronomic characteristics, using techniques and biometric models. The progeny test was conducted in the experimental field of Embrapa Rondônia, where families of half-siblings of pupunheira were arranged, distributed in one hectare. The experiment was designed in randomized blocks with 14 families arranged in three blocks with eight plants per parcel, spaced 6x4m apart. Agronomic characters were evaluated, as well as the components of the production, based on the evaluation of data of three agricultural years, which is equivalent to seven years of cultivation. The REML/BLUP method (maximum restricted likelihood/best linear unbiased prediction) was used to estimate the components of variance and genetic values. Improvements in the cultivation conditions provided by liming and fertilization were observed from 2012 (fourth year of cultivation) on the 0 to 20 cm layer. From the seventh year of cultivation the production of pupunha tends to stabilize genotypically. The number and weight of bunches are the main characters associated with fruit production. The selection gain with the estimates of the genotypic effects of the selected plants had a greater influence on the response of the traits with a genetic progress of 59,57% in the seventh year of cultivation, evidencing greater possibilities of gains with asexual propagation. / A pupunheira (Bactris gasipaes Kunth, Palmae) é uma das poucas palmeiras domesticadas, cujo palmito e frutos se destacam na dieta alimentar, principalmente na região Amazônica. Porém, não existem cultivares desenvolvidas para a produção de frutos, que ainda são direcionados seja para subsistência de populações ribeirinhas e para mercados municipais, diferente do cultivo para palmito que é um agronegócio em crescente expansão. Os frutos da pupunheira possuem uma grande variabilidade natural de cores, sabores, oleosidade e textura. No entanto, essa variabilidade também limita o seu mercado, uma vez que os frutos adequados para consumo in natura, produção de farinha ou de óleo, têm diferentes características. Portanto, diante da relevância do cultivo da pupunheira para produção de frutos, objetiva-se com essa pesquisa direcionar estratégias de melhoramento genético para produção de frutos de pupunha a partir da avaliação de características agronômicas, fazendo uso de técnicas e modelos biométricos. O teste de progênies foi conduzido no campo experimental da Embrapa Rondônia, em que se encontram arranjadas famílias de meiosirmãos de pupunheira, distribuídas em um hectare. O experimento foi delineado em blocos ao acaso com 14 famílias dispostas em três blocos com oito plantas por parcela, em espaçamento 6x4 m. Foram avaliados caracteres agronômicos, assim como, os componentes da produção, a partir da avaliação de dados de três anos agrícolas, que equivale a sete anos de cultivo. O método REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita/melhor predição linear não viesada) foi utilizado para estimar os componentes de variância e os valores genéticos. Melhorias nas condições de cultivo proporcionadas pela calagem e adubação foram observadas a partir de 2012 (quarto ano de cultivo) na camada de 0 a 20 cm. A partir do sétimo ano de cultivo a produção de pupunha tende a estabilizar genotipicamente. O número e o peso de cachos são os principais caracteres associados a produção de frutos. O ganho de seleção com as estimativas dos efeitos genotípicos das plantas selecionadas, apresentaram maior influência na resposta das características com progresso genético de 59,57% no sétimo ano de cultivo, evidenciando maiores possibilidades de ganhos com a propagação assexuada.