Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-08T16:46:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 714423 bytes, checksum: bc1948f40319228c93b1c76e8757235d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-08T16:46:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 714423 bytes, checksum: bc1948f40319228c93b1c76e8757235d (MD5) Previous issue date: 2000-11-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os objetivos deste trabalho foram elevar a produtividade de grãos e a capacidade de expansão (CE) de uma população de milho pipoca, dentro de um programa de melhoramento intrapopulacional com base em progênies de meios-irmãos, e obter informações sobre as eficiências dos processos de seleção entre e de seleção dentro de famílias de meios-irmãos, realizados no inverno, fechando um ciclo em apenas um ano. Foi utilizada a população Beija- Flor, originária do Banco de Germoplasma do Programa de Melhoramento de Milho do Departamento de Biologia Geral da Universidade Federal de Viçosa. Os dados obtidos no teste de progênies foram utilizados na estimação de parâmetros genéticos, como variância genotípica entre famílias, variância aditiva, herdabilidade, correlações simples e parciais entre os caracteres, visando avaliar o potencial da população para melhoramento e a eficiência da seleção entre famílias. A seleção das 20 melhores famílias, utilizadas no lote de recombinação, foi feita com base em CE e produtividade, considerando o índice livre de pesos ou parâmetros propostos por Elston, sendo os limites estabelecidos para CE acima de 26 ml/g e para produtividade acima de 3.180 kg/ha. No lote de recombinação, foram obtidos dados que permitiram a estimação de parâmetros genéticos, como variância genotípica entre e dentro de famílias de meios-irmãos, variância genética aditiva, variância devido à dominância, herdabilidades em sentido amplo e restrito em nível de indivíduo, para uso na seleção massal, e de indivíduo dentro de família, com o objetivo de avaliar a eficiência da seleção dentro de famílias. Estimativas de ganhos para produção de grãos, considerando seleção massal e seleção dentro de famílias, também foram obtidas, caso esta característica fosse utilizada para seleção no lote de recombinação. Ademais, foi realizado teste de competição envolvendo as populações obtidas neste trabalho e uma série de outras testemunhas. De acordo com os resultados, foi possível verificar para os caracteres CE, peso de cem grãos e produtividade, a possibilidade de se realizar melhoramento na população e, para os demais caracteres, foi verificada estatisticamente uma uniformidade entre as médias das famílias avaliadas. O índice utilizado apresentou ganhos para CE e produtividade. O uso de seleção massal no lote de recombinação proporcionou estimativas de ganhos na característica CE equivalentes a uma seleção dentro de famílias. Verificou-se que, para se obter ganhos simultâneos para CE e produtividade no lote de recombinação, devem ser utilizados índices de seleção. Foi constatada a possibilidade de se realizar um ciclo de melhoramento com seleção entre e dentro de famílias de meios-irmãos, no período de um ano, com seleção dentro com base em CE, no inverno. / The objective of this work was to increase grain yield and the expansion capacity (EC) of a popcorn population in an intrapopulational breeding program using half-sib progenies and to obtain information on bout the efficiency of selection among and within half-sib families in the winter during one-year cycle. The Beija-Flor population from the Maize Breeding Program Germplasm Bank at the Universidade Federal de Viçosa-MG was used in the experiment. The data obtained were used to estimate genetic parameters such as genotypic variance between families, additive genetic variance, heritability, and simple and partial correlations between the traits, aiming to evaluate the breeding potential of Beija-Flor and the efficiency of the selection among families. The selection of the best twenty families in a recombination sample was based on parameters EC and proposed yield, by considering the free index of weights and Elston, with the limits being established over 26 ml/g for EC and over 3180kg/ha for productivity. The data obtained in the recombination sample allowed the estimation of genetic parameters such as genotypic variance among and within half-sib families, additive genetic variance, dominance variance, and heritabilities in a broad and narrow sense at individual levels to be used in mass selection and at in individual level within, families, in order to evaluate the efficiency of selection within families. Gain estimates for grain production, considering mass selection and within family selection were also obtained, in case this trait was used for selection in the recombination sample. Moreover, a competition test was conducted involving the populations obtained in this research and a number of other population controls. The results showed that it was possible to develop a population breeding program for the traits EC, 100-grain weight and yield. For the remaining traits, uniform averages were statistically found among the families evaluated. The index used presented EC and yield gains. Mass selection in the recombination sample has provided gain estimates for EC similar to those obtained in the selection within families. Selection indicess must be used to obtain simultaneous gains for EC and yield in the recombination sample. It was found that it is possible to carry out a breeding cycle withe selection among and within half-sib families, during one year, with within-family selection for EC, in the winter season. / Dissertação importada do Alexandria

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-12-17T08:16:44Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 450456 bytes, checksum: 7908ee0c11628a893a9ef8b97ec1d3fc (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-17T08:16:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 450456 bytes, checksum: 7908ee0c11628a893a9ef8b97ec1d3fc (MD5) Previous issue date: 2015-08-13 / O objetivo deste trabalho foi avaliar os parâmetros genéticos e diversidade genética de Coffea canephora (grupo Robusta e Conilon) genotipados com marcadores moleculares SNPs. Os dados fenotípicos foram analisados utilizando a metodologia de modelos mistos (REML/BLUP) por meio do programa Selegen. Os resultados mostraram uma baixa variabilidade genética entre os clones de Robusta e Conilon para todas as características avaliadas. Por outro lado, coeficiente de variação relativamente elevado foi observado para a maioria das características, o que implica que estas características parecem ser altamente influenciadas pela variação ambiental. A repetibilidade estimada para a maioria das características foi menor, indicando a irregularidade da superioridade dos indivíduos entre as medições para esses caracteres no caso de ambos os clones com elevada irregularidade do desempenho por meio de medição, o que demonstra que a seleção do genótipo com base nessas características é uma estratégia não confiável. Em geral, para ambos os grupos, houve baixa interação com ano, como foi observado por meio da correlação entre genótipos de medição (rgmed) para a maioria dos caracteres avaliados. Esse resultado demonstrou que a seleção pode ser realizada em qualquer fase de desenvolvimento usada para a medição. Para estudo de diversidade genética foi utilizado 46074 marcadores SNP polimórficos que cobrem todo o genoma de 50 clones de C. canephora (24 Conilon e 26 Robusta). A estimativa de similaridade genética entre cada par de indivíduos foi calculada pelo coeficiente de Jaccard e diversidade entre clones foi obtida pela construção do dendrograma pelo método UPGMA (Unweighted Pair- Group Method with Arithmetic Mean) usando o programa NTSYS pc2.1. Por meio do dendograma, os clones form dividos em seis grupos. A análise mostrou que os genótipos de C. canephora foram divididos em grupos de diversidade que podem ser usados para outros programas de melhoramento genético. / The objective of this work was to assess the genetic parameters in Coffea canephora (Robusta and Conilon groups) and to analyze the genetic diversity of C. canephora accessions, which were genotyped with SNPs molecular markers. The phenotypic data were analyzed using the mixed model methodology (REML/BLUP) through the Selegen software for estimation of genetic parameters. The results showed a low genetic variability (CVg%) among the clones of Robusta and Conilon for all the evaluated traits. On the other hand, relatively high residual coefficients of variation (CV%) for most of the traits were recorded implying that these traits seem to be highly influenced by the environmental variation. The estimated repeatability for most of the traits was lowest indicating the irregularity of the superiority of the individuals among the measurements for these characters in the case of both clones showing high irregularity of the performance across measurement, which demonstrate that genotype selection based on those traits is not reliable strategy. Generally, for both groups of clones, there was low interaction with year, as observed by the genotypic correlation across measurement (rgmed) for most of the characters evaluated demonstrating that selection can be performed at any of the development stages used for measurement. Genetic diversity was investigated using 46074 polymorphic SNP markers covering the entire genome of 50 C. canephora clones (24 Conilon and 26 Robusta). The genetic similarity between each pair of clones was calculated by the Jaccard coefficient and information about diversity among clones was inferred by means of the dendrogram built using UPGMA method (Unweighted Pair-Group Method with Arithmetic Mean) with the program NTSYS pc2.1. Hence, the dendrogram divided the clones into six groups. Generally, the analysis showed that the C. canephora genotypes were clearly divided into diversity groups that can be used for breeding programs.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-05-31Bitstream added on 2014-06-13T20:43:07Z : No. of bitstreams: 1 aspilcuetaborquis_rr_dr_jabo.pdf: 608014 bytes, checksum: fec77d6e9cf690a6db8e92476a753c54 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Foram estimados parâmetros genéticos para a produção de leite, gordura e proteína no dia do controle de primeiras lactações de búfalas leiteiras por meio de análises uni e multicaracterística de regressão aleatória. Para os modelos de regressão aleatória unicaracterística foram analisadas as 1.433 primeiras lactações de búfalas. Para as características em estudo, foram considerados nos modelos utilizados, os efeitos aleatórios genético aditivo, de ambiente permanente e o residual. Como efeitos fixos, foram considerados o grupo contemporâneo e o número de ordenha (1 ou 2 ordenhas). Os efeitos linear e quadrático da covariável idade da vaca ao parto e a curva média de lactação da população, estão modelados por polinômios ortogonais de Legendre de terceira ordem. Os efeitos aleatórios genético aditivo e de ambiente permanente foram estimados por meio de regressão aleatória sobre polinômio ortogonais de Legendre de terceira à sexta ordem. Os resultados indicam que são requeridos polinômios de Legendre de baixa ordem para modelar a estrutura de (co)variância genética e de ambiente permanente. As estimativas de herdabilidade das características em estudo foram moderadas, o que poderia ajudar no processo de seleção dos animais para obtenção de ganhos genéticos. As estimativas das correlações genéticas foram altas entre controles, indicando que seja qual for o critério de seleção adotado, ganhos genéticos indiretos são esperados em toda a curva de lactação. Para o modelo de regressão aleatória multivariada foi analisado o mesmo banco de dados e as mesmas pressuposições do modelo unicaracaterística. No que se refere à modelagem dos efeitos aleatórios, utilizouse, em todas as características, polinômios de Legendre de terceira... / Genetic parameters for milk, fat and protein yields in the test day were estimated for the first lactations of dairy buffaloes by using single- and multiple-trait random regression analyses. To the single-trait analyses were analyzed 1,433 first lactations. The models included as random effects: additive genetic, permanent environment and residual and as fixed effects: contemporary group, number of milkings (one or two), linear and quadratic effects of the covariable age of the buffalo at birth and mean lactation curve of the population, modeled using Legendre orthogonal polynomials of third order. The random regression effects of genetic and permanent environment were estimated by random regression with Legendre orthogonal polynomials from third to sixth orders. The results indicate that low order polynomials are required to model the structure of genetic and permanent environment (co)variances. The heritability estimates of the traits studied were moderated, it permits to do selection of animals to obtain genetic gain. The genetic correlation estimates were high among test-days, indicating that the selection aims may be different, but indirect genetic gain for all the lactation curve was expected. To the model of multiple-trait random regression, the same data was analyzed, with the same presuppositions of the single-trait model. To model the random effects, Legendre polynomials of third and fourth order were used, to genetic effects and permanent environment, respectively. The residual variances were modeled considering four residual classes grouped as: 1, 2-3, 4-8, 9-10 months of lactation. The results indicate that the heritabilities estimates of the traits presented enough genetic variance to be selected. The estimates of the variance components may be used to implement a BLUP evaluation in a Brazilian buffalo population. The genetic correlations among test-days for a trait ... (Complete abstract click electronic access below)

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, 2018. / Submitted by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-09-24T21:52:57Z No. of bitstreams: 1 2018_AlexandreCesarPalermo.pdf: 7779427 bytes, checksum: 91804ca8b5c55be16b216ae3fdeba60a (MD5) / Approved for entry into archive by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-09-25T19:41:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_AlexandreCesarPalermo.pdf: 7779427 bytes, checksum: 91804ca8b5c55be16b216ae3fdeba60a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-25T19:41:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_AlexandreCesarPalermo.pdf: 7779427 bytes, checksum: 91804ca8b5c55be16b216ae3fdeba60a (MD5) Previous issue date: 2018-09-19 / O mosaico vegetacional do Cerrado possui composição florística única para cada área observada. Além disso, com a presente redução da cobertura vegetal do Cerrado, diversas espécies arbóreas têm suas áreas de ocorrência diminuídas e como consequência perdem parte de sua diversidade genética. Nesse aspecto, a espécie Annona crassiflora que possui importância econômica e social sofre com a redução de sua área de ocorrência, polinização e dispersão deficientes e consequente perda de diversidade genética. O objetivo deste trabalho foi avaliar diferenças nos padrões espaciais de Annona crassiflora em quatro populações do Brasil Central, investigar a diversidade genética populacional de Annona crassiflora por meio de dados morfométricos de frutos e sementes e simular uma seleção genética por meio de parâmetros de variância por usando o programa Selegen-REML/BLUP. Os padrões de distribuição foram relacionados com o grau de antropização das áreas mostrando efeitos negativos da degradação nas populações estudadas. O aumento da endogamia gerado pela degradação culmina na redução da diversidade genética da população. De forma geral as maiores dimensões foram encontradas nas populações de Planaltina e Buritis. Diante disso as análises indicam alta diversidade genética e frutos/sementes com dimensões maiores nos locais com melhor estado de conservação. Tanto a análise de variância quanto a análise de deviance empregadas mostraram grande diversidade genética interpopulacional que se refletiu no dendrograma obtido onde as matrizes formaram oito grupos distintos. A simulação de seleção das populações mostrou que as populações FAL, Planaltina e Buritis são as mais proeminentes e que não há um predomínio de uma população na simulação. Assim, a estratégia de seleção a ser utilizada deve levar em consideração esse cenário. / The Cerrado vegetative mosaic has a unique floristic composition for each area observed. In addition, with the present reduction of the vegetation cover of the Cerrado, several tree species have their areas of occurrence diminished and as a consequence they lose part of their genetic diversity. In this aspect, the species Annona crassiflora that has economic and social importance suffers with the reduction of its area of occurrence, pollination and dispersion deficient and consequent loss of genetic diversity. The objective of this work was to evaluate differences in the spatial patterns of Annona crassiflora in four populations of Central Brazil, to investigate the population genetic diversity of Annona crassiflora by means of morphometric data of fruits and seeds and to simulate a genetic selection by means of variance parameters by using the Selegen-REML / BLUP program. The distribution patterns were related to the degree of anthropization of the areas showing negative effects of the degradation in the populations studied. The increase in inbreeding generated by the degradation culminates in the reduction of the genetic diversity of the population. In general, the largest dimensions were found in the populations of Planaltina and Buritis. Therefore, the analyzes indicate high genetic diversity and fruits / seeds with larger dimensions in the best preserved state. Both the analysis of variance and the deviance analysis employed showed great interpopulational genetic diversity that was reflected in the dendrogram obtained where the matrices formed eight distinct groups. The simulation of population selection showed that the FAL, Planaltina and Buritis populations are the most prominent and that there is no predominance of a population in the simulation. Thus, the selection strategy to be used must take into account this scenario.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2018. / Submitted by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-08-22T19:33:34Z No. of bitstreams: 1 2018_RicardoMenesesSayd.pdf: 2343312 bytes, checksum: 8f083e0c024f093820a0aa626c23e89d (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-08-27T20:55:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_RicardoMenesesSayd.pdf: 2343312 bytes, checksum: 8f083e0c024f093820a0aa626c23e89d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-27T20:55:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_RicardoMenesesSayd.pdf: 2343312 bytes, checksum: 8f083e0c024f093820a0aa626c23e89d (MD5) Previous issue date: 2018-08-22 / A demanda por cultivares de cevada cervejeira adaptadas ao cultivo irrigado no Cerrado tem crescido de forma constante. Cultivares oriundas da região Sul do país têm sido introduzidas e avaliadas na região a fim de suprir essa demanda instantânea. Com o objetivo de fornecer melhores condições de cultivo ao sistema produtivo do Cerrado, esse trabalho propôs estimar os parâmetros genéticos em diferentes anos e locais a fim de subsidiar uma seleção criteriosa dos genótipos mais aptos a essas condições e analisar a variabilidade genética existente entre eles com base em dados agronômicos e moleculares. Primeiramente foram avaliadas seis características agronômicas (rendimento de grãos, classificação comercial de grãos, peso de mil sementes, altura de plantas, grau de acamamento e ciclo de espigamento) de 113 genótipos de cevada cervejeira em dois ambientes no Cerrado do Distrito Federal com o objetivo de estimar os parâmetros genéticos (valores de F, herdabilidade em sentido amplo, coeficiente de variação ambiental, genotípico e relativo e as correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais). A partir dos dados desse primeiro trabalho, foram selecionados 69 genótipos utilizando as características avaliadas. Em um segundo momento, foram avaliados os parâmetros genéticos dos 69 genótipos considerando três anos de avaliações utilizando as mesmas características agronômicas com intuito de verificar a influência dos anos agrícolas no comportamento dos genótipos. Baseado nos dados obtidos nos cinco ensaios realizados, os genótipos foram selecionados por um método proposto pelo melhorista (Seleção Combinada) que foi comparado a quatro índices de seleção (índice livre de pesos e parâmetros, índice dos ganhos desejados, soma de ranks e genótipoideótipo). Foram gerados índices de frequência de seleção e os métodos foram comparados em relação ao ganho de seleção em % para cada experimento. Foram selecionados 20 genótipos de alto rendimento agronômico além de quatro genótipos a serem utilizados como genitores em blocos de cruzamentos por apresentarem uma ou duas características importantes para o melhoramento de cevada. Foram realizados estudos de diversidade genética agronômica e molecular dos 24 genótipos selecionados acrescidos de cinco cultivares de cevada recomendadas para o Cerrado. Os dados agronômicos foram obtidos em dois locais do Distrito Federal utilizando a distância de Mahalanobis. Para a análise de diversidade genética molecular os dados foram obtidos utilizando marcadores moleculares RAPD, SSR e ISSR. A partir dos dados obtidos foram gerados dendrogramas e gráficos de dispersão tanto para a diversidade agronômica como para os dados moleculares, possibilitando através das análises indicar os cruzamentos que possam ter maior efeito heterótico. Os resultados indicaram a existência de variabilidade entre os acessos avaliados, assim como efeito da interação G x A tanto na comparação de locais como em anos. Os genótipos de origem colombiana mostraram-se mais aptos em relação aos demais. Verificou-se que é possível a seleção de acessos de cevada com alto rendimento e ciclo de espigamento precoce simultaneamente, fator decisivo no processo de escolha de genótipos a seguirem em futuros experimentos. No estudo de diversidade observouse a baixa correlação entre as distâncias genéticas, e que os marcadores ISSR correlacionouse positivamente com as distâncias agronômicas. É necessário a realização de estudo de diversidade complementar entre características agronômicas e marcadores moleculares para indicação dos melhores cruzamentos através de genótipos com a maior variabilidade possível. / A demand for breeding barley cultivars adapted as irrigated Cerrado conditions is constant. Cultivars from the southern area of the country have been tested in the Cerrado region aiming to supply this immediate demand. With the purpose of providing better conditions for this production system, this work proposes to estimate genetic parameters in different years and environments in order to promote a careful selection of more suitable genotypes to these conditions and to analyze the existing genetic variability among them based on agronomic and molecular data. First, six agronomic characteristics (grain yield, plumpness kernel, thousand seed weight, plant height, lodging degree and days to heading) of 113 brewery barley genotypes were evaluated in two environments in the Cerrado of the Distrito Federal, focusing on estimating the genetic parameters (F values, heritability in broad sense, environmental, genotypic and relative variation coefficients). Based on the data from the first trial, 69 genotypes were selected based on the evaluated characteristics. In a second experiment, the genetic parameters of the 69 genotypes were evaluated considering three years of evaluations using the same agronomic characteristics. Based on the data obtained in the five experiments, the genotypes were selected by a method proposed by the breeder and compared to four selection indices (free index of weights and parameters, desired earnings index, rankings sum and genotype-ideotype) that served as basis for the accomplished selection. Frequency indices of selection were generated, and methods were compared to the selection gain for each experiment. Twenty genotypes of high agronomic yield were selected, as well as four genotypes to be used as parents in crossbred blocks since they presented one or two important traits for barley breeding. Genetic diversity studies were carried out for the 24 selected genotypes plus five barley cultivars recommended for the Cerrado, based on agronomic data from two locations in the Federal District, using Mahalanobis distance. For the analysis of molecular genetic diversity, the data was obtained using molecular markers RAPD, ISSR and SSR. From the obtained data were generated dendrograms and dispersion graphs for both agronomic diversity and for the molecular data, allowing, through the analysis, to indicate the crosses that could have greater heterotic effect. The results indicated the existence of variability among the accessions, as well as the interaction effect G x E in both location and year comparisons. The genotypes of Colombian origins were more apt in relation to the others. It was verified that the selection of accessions of barley with high yield and early breeding cycle simultaneously is possible, which is a decisive factor in the process of choosing genotypes to survey in future experiments. The diversity study detected a low correlation between genetic distances, and that ISSR markers correlated positively with the agronomic distances. It is necessary to carry out a study of complementary diversity between agronomic traits and molecular markers to indicate the best crosses through genotypes with the greater variability.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-09-04Bitstream added on 2014-06-13T19:18:58Z : No. of bitstreams: 1 brizolla_tf_me_botfca.pdf: 254524 bytes, checksum: 7729f6929f3138aa2ec6cbf4147cd6b8 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A espécie Eucalyptus grandis Hill ex Maiden é a mais cultivada em estandes comerciais no Brasil e no mundo. A espécie é plantada como cultivar e também na forma de plantios clonais de seus híbridos interespecíficos. O trabalho é um estudo da variabilidade genética em progênies de polinização livre de Eucalyptus grandis de árvores selecionadas fenotipicamente em pomar de sementes por muda, cuja procedência é originária de Coff’s Harbour – Austrália. Este pomar, de propriedade da empresa Duratex S.A. encontra-se na Fazenda Morro D’Ouro, no Município de Botucatu. Tem também como objetivo analisar as correlações entre os diferentes caracteres nas diferentes idades e estudar as correlações entre as idades juvenis e de final de rotação da cultura, visando subsidiar a seleção precoce em programas de melhoramento com espécie. Os ensaios foram instalados em três experimentos em cada um dos dois locais, Angatuba-SP e Lençóis Paulista-SP, em fevereiro de 1988. O delineamento experimental utilizado foi o blocos casualizados, com 10 repetições, 6 plantas por parcela, ao espaçamento de 3 x 2 metros e totalizando 75 progênies. Os caracteres avaliados foram o diâmetro a altura do peito (DAP); altura de planta e volume de madeira. As avaliações foram feitas em quatro anos consecutivos (02, 03, 04 e 05 anos) em Lençóis Paulista (local 2), sendo que em Angatuba (local 1) foram realizadas avaliações anuais do segundo ao sexto ano. Os resultados mostraram haver variabilidade genética suficiente para avançar as gerações de melhoramento com a espécie... / The species Eucalyptus grandis Hill ex Maiden is the most commonly cultivated in commercial stands in Brazil and throughout the world. The species is planted as a cultivar, by seed, e also by clonal plantings of its interspecific hybrids. The research is a study of genetic variability in open pollinated progenies of Eucalyptus grandis of phenotipically selected trees in Seedling Seed Orchard of Coff’s Harbour – Australia provenance. The orchard is of Duratex S.A. company located in Morro D’Ouro Experimental Station, in Botucatu city, S.P., Brazil. The study also have as objective to analyze the correlations between different traits in different ages and to study the correlations between juvenile and final of culture rotation, aiming to get support for procedures of early selection in forest tree breeding programs of Eucalyptus grandis. The experiments were set up by three trails in each one of two localities, Angatuba and Lençois Paulista, both in São Paulo State, Brazil, in February of 1988. The experimental design was the randomized blocks, with 10 replications, 06 plants per plot, 3 x 2 spacing, and totalizing 75 progenies. The diameter of breast height (dbh), plant height, and wood volume were the studied traits. The evaluations were made through the consecutive years (02, 03, 04, and 05 years old) in Lençois Paulista (Locality 2), and in Angatuba (Locality 1) were made annual evaluations from de second to the sixth years old. The results have shown sufficient genetic variability to advance breeding generations of species... (Complete abstract click electronic access below)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A study based in DNA and isozyme markers was carried out to evaluate the diversity and genetic structures of natural populations of Erythrina velutina Willd., aiming monitored prospection of the genetic variability for two populations from the Atlantic Forest (Santana do São Francisco-SE) and Caatinga (Pinhão-SE) Biomes. Young leaves of twenty individuals per population were sampled from each population. Primers of ten arbitrary bases sequence and fifteen enzymatic systems were used. In RAPD analysis, the population from Atlantic Forest Biome originated 100 polymorphic loci and population from Caatinga Biome, 112 loci. It was observed that the genetic structure for population from Caatinga present higher number of observed and effectives alleles, which implicate in a higher heterozigozity. The observed average heterozygozity was higher than the expected heterozigozity by Hardy- Weinberg, which indicate a excess of heterozygotes, and this value might be confirmed by negative value of the Wright´s fixation index (-0.5098). In relation to genetic diversity between populations (Fst and Gst) the values were similar for both markers. The results suggest the use of M1, M7, M11 and M14 individuals from Atlantic Forest Biome; and the M5, M6, M18 and M19 individuals from Caatinga Biome as most divergent for future chemical, biochemical and pharmacological studies. / Um estudo baseado em marcadores de DNA e isoenzimáticos foi realizado para avaliar a diversidade e estrutura genética de populações naturais de Erythrina velutina Willd., visando à prospecção monitorada da variabilidade genética, para fins de seleção das matrizes mais divergentes, em duas populações naturais do estado de Sergipe. Foram amostradas folhas jovens de vinte indivíduos em cada população. Um total de vinte oligonucleotídeos decâmeros de sequência arbitrária e 15 sistemas enzimáticos foram testados. Na análise de RAPD, a população do Baixo São Francisco Sergipano originou 134 locos, sendo 100 polimórficos e a população do município de Pinhão, 143 locos, sendo 112 polimórficos. Observou-se para a estrutura genética da população do município de Pinhão maior número de alelos observados e efetivos, o que implica numa maior heterozigosidade. A heterozigosidade média observada foi maior que a esperada pelo equilíbrio de Hardy- Weinberg, o que indica um excesso de heterozigotos e pode ser confirmado pelo valor negativo do índice de fixação de Wright (-0,2304). Em relação à diversidade genética entre populações (Fst e Gst) os valores foram similares para os dois marcadores. Sugere-se o uso dos indivíduos M1, M7, M11 e M14 do Baixo São Francisco Sergipano; e dos indivíduos M5, M6, M12 e M19 do município de Pinhão como os mais divergentes para futuros estudos químicos, bioquímicos e farmacológicos.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-05-14T13:16:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Daiana_Wolter.pdf: 1178826 bytes, checksum: 7f33e23ee952c737fbce99b8d3bd0b06 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-05-16T20:15:10Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação_Daiana_Wolter.pdf: 1178826 bytes, checksum: 7f33e23ee952c737fbce99b8d3bd0b06 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-16T20:15:10Z (GMT). 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Diante disso, foram desenvolvidos dois estudos. O primeiro teve como objetivo caracterizar genótipos de batata quanto à resistência a isolados de P. infestans de diferentes complexidades, utilizando três métodos. Foram avaliados 19 genótipos, em experimentos a campo e in vitro, quanto à severidade de diferentes isolados de P. infestans. Os 19 genótipos de batata apresentaram diferentes níveis de resistência nos experimentos de campo e in vitro, existindo genótipos com resistência qualitativa e quantitativa. Os genótipos classificaram-se como: ’EPAGRI Catucha’, resistente a P. infestans; ‘IAC Ibituaçu’ e o clone F50-08-01, moderadamente resistentes; ‘BRS F63’ (Camila), F63-10-07, ‘BRS Pérola’, F63-10-13, F183-08-01 e F37-08-01, moderadamente suscetíveis; F131-08-01, F21-07-09, ‘BRS Clara’, ‘Innovator’, ‘BRS Ana’, ‘Asterix’, ‘Ludmilla’ e CL 308, altamente suscetíveis. Dentre os métodos in vitro testados, o de folíolos destacados ofereceu melhores resultados. O segundo estudo teve como objetivo comparar dois genitores de batata com resistência a P. infestans, ‘BRS Eliza’ e ‘BRS Clara’, quanto à capacidade de geração de populações hibridas. Duas populações híbridas de 120 indivíduos (genótipos) cada, foram obtidas dos cruzamentos de ‘BRS Eliza’ e ‘BRS Clara’ com C1883-22-97 (suscetível). As estimativas de herdabilidade da área abaixo da curva de progresso da requeima (AACPD) das duas populações foram de magnitude moderada e suas respostas esperadas de seleção não diferiram entre si. No entanto, a média de AACPD dos indivíduos da população de ‘BRS Eliza’ x C1883-22-97 foi menor (isto é, mais resistentes), indicando superioridade da cultivar ‘BRS Eliza’ em comparação com a cultivar BRS Clara. / Potato (Solanum tuberosum L.) is extremely important for the food security of mankind. Its production is limited to many factors, especially diseases that affect the crop, among them the late blight, caused by the oomycete Phytophthora infestans (Mont.) De Bary, which is considered one of the most destructive and with great economic impact. The use of resistant cultivars is the most economical way to control this disease, however in Brazil the cultivars widely used are susceptible to the pathogen. For the development of highly resistant genotypes, it is necessary that potato breeding programs to know the inheritance of resistance of the genitors. Faced with this situation, two studies were carried out. The objective of the first study was to characterize potato genotypes for resistance to isolates of P. infestans of different complexities, using different methods. Nineteen potato genotypes were evaluated in field and in vitro experiments for the severity of different isolates. The 19 potato genotypes presented different levels of resistance to P. infestans in the field and in vitro experiments, with genotypes having qualitative and quantitative types of resistance. The genotypes were classified as: 'EPAGRI Catucha', resistant to P. infestans; 'IAC Ibituaçu' and clone F50-08-01, moderately resistant; 'BRS F63' (Camila), F63-10-07, 'BRS Pérola', F63-10-13, F183-08-01 and F37-08-01, moderately susceptible; F131-08-01, F21-07-09, 'BRS Clara', 'Innovator', 'BRS Ana', 'Asterix', 'Ludmilla' and CL 308, highly susceptible. Of the two in vitro methods tested, the detached leaflet offered better results. The second study had as objective to compare two potato resistance genitors, ‘BRS Eliza’ and ‘BRS Clara’, regarding the capacity of generating a hybrid population. Two hybrid populations of 120 individuals (genotypes) each were obtained from crossing 'BRS Eliza' and 'BRS Clara' with C1883-22-97 (susceptible). Heritability estimates of the area under disease progress curve (AUDPC) of the two populations were of moderate magnitude, and expected selection response did not differ from each other. However, the mean AUDPC of individuals from the 'BRS Eliza' x C1883-22-97 cross was lower (i.e., more resistant), indicating the superiority of 'BRS Eliza' compared to ‘BRS Clara’.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-20T10:44:52Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 542026 bytes, checksum: 2ca363eb8fda9e4793dc1753fbf56056 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-20T10:44:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 542026 bytes, checksum: 2ca363eb8fda9e4793dc1753fbf56056 (MD5) Previous issue date: 2015-05-15 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Objetivou-se, com o presente trabalho estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para pesos obtidos por modelos de regressão aleatória (MRA) via polinômios ortogonais de Legendre e compará-los a modelos multicaracterísticos; e comparar o MRA de melhor ajuste (via polinômio ortogonal de Legendre), com funções ajustadas por modelos B- spline com segmentos lineares, quadráticos ou cúbicos. Foram avaliados registros de peso dos 60o o 499o dias de idade de bovinos da raça Nelore nascidos entre 2005 e 2012. Os dados para as análises multicaracterísticas foram compostos por pesos ajustados aos 120 (P 120 ), 210 (P 210 ), 365 (P 365 ) e 450 (P 450 ) dias de idade, já para os MRA continha os mesmo dados porem não ajustados. A estimação dos componentes de (co)variância e parâmetros genéticos foram realizadas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML). Foram testados 12 diferentes MRA, utilizando-se de polinômios ortogonais de Legendre, de ordens dois (linear), três (quadrático) ou quatro (cúbico). Da mesma forma, para as funções B-spline, polinômios lineares (L), quadráticos (Q) e cúbicos (C), foram testados, porém variando o número de nós. Os critérios de informação de Akaike (AIC), informação bayesiano de Schwarz (BIC), valores do logaritmo da função de verossimilhança (Log e L) e teste da razão de verossimilhança (LRT) foram utilizados para a escolha do melhor modelo. O modelo (6) - Leg34444 com ordem 3 para o efeito fixo e 4 para os efeitos aleatórios (aditiva direta, materna e ambiente permanente direto e materno) ajustado pelo polinômios de legendre apresentou um menor número de parâmetros, maior valor de Log e L e menor de AIC e BIC. As estimativas de variância genética aditiva direta 2 do animal (σ gad ), variância genética aditiva materna (σ gam ), variância de ambiente permanente 2 ), variância de ambiente permanente direto (σ pd ), variância fenotípica (σ f 2 ) e materno (σ pm variância residual composta (σ rc ) obtidas pelos modelos multicaracterístico e MRA (modelo 6-ajustado por polinômios de Legendre), apresentaram tendências semelhantes para o peso ao longo da curva de crescimento. No entanto, as estimativas mais acuradas foram obtidas via MRA. Em relação as estimativas de herdabilidades direta (h2 d ), de maneira geral, foram semelhantes e variaram de 0,09 a 0,28 e 0,15 a 0,39 para os modelos multicaracterístico e o MRA. De mesmo modo, as herdabilidades materna (h2 m ) foram similares, porém de baixa magnitude, com estimativas que variaram de 0,01 a 0,03 e 0,08 a 0,11 para os modelos vi multicaracterístico e o MRA. A função B-spline do modelo A1- BSL33322 (CL4) sendo linear, ordem 3 para os coeficientes de regressão fixos, aleatórios genético aditivo e materno e ordem 2 para os coeficiente de regressão aleatória de ambiente permanente direto e materno, com quatro classes de variância residual (CL 4 ) e 27 parâmetros, propiciou melhor ajuste em relação ao polinômio de Legendre de modelo 6 - Leg34444 (CL4), que continha com 43 parâmetros. As estimativas de (co)variância e parâmetros genéticos estimadas tanto para MRA (ajustada por polinômios de Legendre) quanto para os modelos multicacteristico foram biologicamente semelhantes. No entanto, o modelo com função polinomial de Legendre de ordem três para os efeitos fixos e quatro para os efeitos aleatórios foi o que apresentou as melhores acurácias para os parâmetros avaliados. O uso de uma função B-Spline linear com coeficientes de regressão de ordem três para os (efeitos fixos, aleatórios genético aditivo e materno) com três nós e ordem dois para os (efeitos aleatórios de ambiente permanente direto e materno) com dois nós no extremo da curva, proporcionaram um melhor ajuste no modelo em comparação com o modelo ajustado com polinômios ortogonais de Legendre. / The objective of the present study was to estimate (co)variance components and genetic parameters for weight records (WR) using an orthogonal Legendre polynomials random regression model (MRA) and to compare with multi-trait models adjusted for weight records at 120 (P 120 ), 210 (P 210 ) 365 (P 365 ) and 450 (P 450 ) days old, and to compare the MRA best-fitting model with B-spline models fitted by different orders of segment (linear, quadratic or cubic). We provided weight records from 60 to 499 days old from Nellore cattle born between 2005 and 2012. WR for multi-trait analyses were adjusted at 120 (P 120 ), 210 (P 210 ), 365 (P 365 ) and 450 (P 450 ) days old, whereas the original WR was used in the MRA. The estimation of (co)variance and genetic parameters were performed by the REML. Twelve (12) different MRA using orthogonal Legendre polynomials were fitted (linear, quadratic or cubic) as well as via B-spline function, linear (L), quadratic (Q), and cubic (C) polynomials were fitted differing from the number of nodes assumed in each model. Akaike information criterion (AIC), Bayesian information criterion of Schwarz (BIC), logarithm values of the likelihood function (Log e L) and the likelihood ratio test (LRT) were used for model choice. The model (6) - Leg34444 with order 3 for the fixed effect and 4 for the random effects (direct additive, maternal and direct permanent environmental and maternal) adjusted by the Legendre polynomials had a small number of parameters, higher value Log e L and lower AIC and BIC values. Estimates ), maternal direct additive genetic of direct additive genetic variance of the animal (σ gad 2 variance (σ gam ), maternal permanent environmental variance (σ pm ), direct permanent 2 environmental variance (σ pd ), phenotypic variance (σ f 2 ) and composed residual variance (σ rc ) obtained by multi-trait models and MRA (model-6 adjusted for Legendre polynomials) were similar along the growth curve. However, MRA presented higher accuracy compared to multi- trait models. The estimates of direct heritability (h2 d ) were, in general, similar for both models (range 0.09-0.28 and 0.15-0.39) for multi-trait and MRA, respectively. The maternal heritability (h2 m ) were low magnitude and showed the same trend, with estimates ranging from (0.01 to 0.03) and (0.08 to 0.11) for multi-trait and MRA. The B-spline model function A1-BSL33322 (CL 4 ) being linear, order 3 for fixed regression coefficients, random genetic and maternal and order 2 for the random regression coefficient of direct and maternal permanent environment, with four classes of residual variance (CL 4 ) and 27 parameters, provided better fit compared to viii the Legendre polynomial model 6-Leg34444 (CL 4 ), which contained 43 parameters. Covariance and genetic parameters estimates for MRA (adjusted for Legendre polynomials) and multi-trait models presented the same behavior along the growth curve. However, the model assuming Legendre polynomials of order three for the fixed and four for random effects showed higher accuracies. The use of a B-Spline Linear function of order three for fixed effects, random genetic animal and maternal with three nodes and order two for direct and maternal permanent environmental effects with two nodes best fit in comparison with Legendre polynomials orthogonal models.

Esta pesquisa teve como objetivo avaliar as diferenças nos padrões de desenvolvimento ponderal, composição de carcaça e qualidade de carne entre linhagens e touros representativos da raça Nelore, com aplicação de tecnologias modernas para coleta de dados e estimação de parâmetros genéticos e fenotípicos das características em estudo. Foram utilizados dados de desenvolvimento ponderal, características de carcaça e qualidade de carne de machos da raça Nelore, terminados a pasto e confinamento e pertencentes a programas de avaliação genética. Desses animais, foram coletadas informações individuais de características de carcaça avaliadas por ultrassonografia e medidas corporais para estimação do frame de cada animal. Ao abate, foram avaliadas características de carcaça e carne, diretamente na carcaça e também através de imagens digitais do músculo Longissimus para determinação de atributos relacionados à qualidade, como maciez, perdas por cozimento, gordura intramuscular e pH. Avaliações por infravermelho com comprimentos de onda na faixa do visível próximo (VIS-NIRS) foram tomadas para associação com valores de pH, força de cisalhamento e lipídios no músculo Longissimus. Foram estimados parâmetros genéticos para todas as características avaliadas neste trabalho. As características de ganho ponderal, frame, medidas de ultrassonografia e qualidade de carne foram utilizadas para comparação entre genearcas e novos genearcas da raça Nelore. Estas informações em conjunto com a validação ferramentas auxiliares para coleta de fenótipos poderão ajudar na condução de programas de melhoramento genético de características de desempenho e qualidade de nos rebanhos dessa raça, bem como a obtenção de importantes informações sobre a variabilidade e valor genético de genearcas e touros representativos da raça Nelore. / The objective of this study was to evaluate the differences of growth, carcass composition and beef quality traits among lineages and representative Nellore sires, using new technologies to collect data and estimate genetic and phenotypic parameters. Data on growth, carcass and meat quality traits of Nellore bulls, raised in pastures and included in genetic evaluation programs were analyzed. Individual information on live ultrasound carcass measurements and frame were, also, collected. After slaughter, carcass, beef quality traits and video image analysis (VIA) of muscle Longissimus were obtained for estimation of beef quality attributes like tenderness, cooking losses, intramuscular fat and pH. Evaluations with Near Infrared Spectroscopy (VIS-NIRS) were made to quantify tenderness and lipid in Longissimus muscle. Genetic parameters were estimated for all traits analyzed in this study. Traits like performance, frame, ultrasound carcass evaluation and meat quality were used to compare lineages and representative Nellore sires. This research provide precious information to development of auxiliary tools for genetic improvement of growth, carcass and meat quality traits in Nellore herds, and provide important information about variability and genetic value of founders and representative sires of this breed.