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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:30Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-06Bitstream added on 2014-06-13T20:37:26Z : No. of bitstreams: 1 lodo_bn_me_jabo.pdf: 200037 bytes, checksum: 3374cb8ac97e3177158a05ecc62ed985 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A expansão do período e a mecanização das etapas de plantio da cana-de-açúcar favorecem a ocorrência da podridão abacaxi causada por Thielaviopsis paradoxa, tornando-se necessária a busca por técnicas de manejo eficazes no controle da doença. Para tanto, foram realizados 4 ensaios. Inicialmente, foram testadas concentrações de 0, 102, 103, 104, 105, 106 e 107 conídios mL-1 de T. paradoxa inoculadas em 5 toletes de cana-de-açúcar com 1 gema cada por vaso. Foi avaliado o número de plântulas emergidas e calculado o índice de velocidade de emergência. Em um segundo ensaio, foi verificada a viabilidade do patógeno no solo dos vasos do ensaio anterior, sem irrigação por 4 meses, quando se realizou novamente o plantio, avaliando-se o número de plântulas emergidas. Para avaliar o controle da doença, em área de cana-planta, foram aplicados no solo ciproconazole + thiamethoxam (300 + 300 g do i.a. ha-1) e triadimenol + dissulfoton (600 + 3000 g do i.a. ha-1), com e sem incorporação em quatro épocas 6, 4, 2 e 1 mês antes do corte e plantio (ACP) das mudas. Os toletes foram retirados das áreas tratadas para a instalação de dois ensaios, um em vasos e outro em campo, sendo inoculandos com 107 conídios mL-1. Foram avaliados o número de plântulas emergidas e calculadas a porcentagem de germinação e a porcentagem de germinação em relação à testemunha. O delineamento foi em blocos casualizados em esquema fatorial 4 x 2 x 2 + 2 testemunhas com 4 repetições. Nos resultados dos ensaios observa-se que todas as concentrações do patógeno testadas foram eficientes para que ocorresse a doença. O patógeno permaneceu viável no solo por pelo menos 4 meses, provocando a doença, independente das concentrações testadas. A utilização de ciproconazole + thiamethoxam, independente do modo e da época de aplicação se mostrou eficaz no controle da doença, desde que o solo mantenha teor de umidade adequado após sua aplicação / The expansion of period and the steps mechanization of the cropping system of sugarcane favors the occurrence of pineapple disease caused by Thielaviopsis paradoxa, making necessary the search for effective management techniques to control the disease. To this end, four tests were done. Initially, concentrations were testing of 0, 102, 103, 104, 105, 106 and 107 conidia mL-1 of T. paradoxa inoculated in 5 sugarcane stems with a gem each per vase. The number of seedlings was evaluated and the index of germination speed was calculated. In a second experiment, the pathogen viability was verified in vases of the previous essay, without irrigation for 4 months, when it the planting again, the number of seedlings was evaluated. To evaluate the control of the disease, in area of first planting of sugarcane crop, in soil ciproconazole + thiamethoxam (300 + 300 g do i.a. ha-1) e triadimenol + dissulfoton (600 + 3000 g do i.a. ha-1) were applied, with and without incorporation in four time 6, 4, 2 and 1 month before cutting and planting (BCP) of stems. The stems were withdrew from of the treated areas for installation of two tests, one in vases and others in field, inoculating them with 107 conidia mL-1. The number of seedlings was evaluated and the germination percentage and germination percentage compared to check was calculated. The design was randomized block in a 4 x 2 x 2 + 2 checks with four replicates. The concentrations tested were effective to produce the disease. The pathogen remained viable in the soil for 4 months, causing the disease, regardless of concentration. The use of cyproconazole + thiamethoxam, regardless of the mode and time of application was effective in controlling the disease, since the soil has adequate moisture after application

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Resumo: A expansão do período e a mecanização das etapas de plantio da cana-de-açúcar favorecem a ocorrência da podridão abacaxi causada por Thielaviopsis paradoxa, tornando-se necessária a busca por técnicas de manejo eficazes no controle da doença. Para tanto, foram realizados 4 ensaios. Inicialmente, foram testadas concentrações de 0, 102, 103, 104, 105, 106 e 107 conídios mL-1 de T. paradoxa inoculadas em 5 toletes de cana-de-açúcar com 1 gema cada por vaso. Foi avaliado o número de plântulas emergidas e calculado o índice de velocidade de emergência. Em um segundo ensaio, foi verificada a viabilidade do patógeno no solo dos vasos do ensaio anterior, sem irrigação por 4 meses, quando se realizou novamente o plantio, avaliando-se o número de plântulas emergidas. Para avaliar o controle da doença, em área de cana-planta, foram aplicados no solo ciproconazole + thiamethoxam (300 + 300 g do i.a. ha-1) e triadimenol + dissulfoton (600 + 3000 g do i.a. ha-1), com e sem incorporação em quatro épocas 6, 4, 2 e 1 mês antes do corte e plantio (ACP) das mudas. Os toletes foram retirados das áreas tratadas para a instalação de dois ensaios, um em vasos e outro em campo, sendo inoculandos com 107 conídios mL-1. Foram avaliados o número de plântulas emergidas e calculadas a porcentagem de germinação e a porcentagem de germinação em relação à testemunha. O delineamento foi em blocos casualizados em esquema fatorial 4 x 2 x 2 + 2 testemunhas com 4 repetições. Nos resultados dos ensaios observa-se que todas as concentrações do patógeno testadas foram eficientes para que ocorresse a doença. O patógeno permaneceu viável no solo por pelo menos 4 meses, provocando a doença, independente das concentrações testadas. A utilização de ciproconazole + thiamethoxam, independente do modo e da época de aplicação se mostrou eficaz no controle da doença, desde que o solo mantenha teor de umidade adequado após sua aplicação / Abstract: The expansion of period and the steps mechanization of the cropping system of sugarcane favors the occurrence of pineapple disease caused by Thielaviopsis paradoxa, making necessary the search for effective management techniques to control the disease. To this end, four tests were done. Initially, concentrations were testing of 0, 102, 103, 104, 105, 106 and 107 conidia mL-1 of T. paradoxa inoculated in 5 sugarcane stems with a gem each per vase. The number of seedlings was evaluated and the index of germination speed was calculated. In a second experiment, the pathogen viability was verified in vases of the previous essay, without irrigation for 4 months, when it the planting again, the number of seedlings was evaluated. To evaluate the control of the disease, in area of first planting of sugarcane crop, in soil ciproconazole + thiamethoxam (300 + 300 g do i.a. ha-1) e triadimenol + dissulfoton (600 + 3000 g do i.a. ha-1) were applied, with and without incorporation in four time 6, 4, 2 and 1 month before cutting and planting (BCP) of stems. The stems were withdrew from of the treated areas for installation of two tests, one in vases and others in field, inoculating them with 107 conidia mL-1. The number of seedlings was evaluated and the germination percentage and germination percentage compared to check was calculated. The design was randomized block in a 4 x 2 x 2 + 2 checks with four replicates. The concentrations tested were effective to produce the disease. The pathogen remained viable in the soil for 4 months, causing the disease, regardless of concentration. The use of cyproconazole + thiamethoxam, regardless of the mode and time of application was effective in controlling the disease, since the soil has adequate moisture after application / Orientador: Modesto Barreto / Coorientador: Marcelo da Costa Ferreira / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Érika Auxiliadora Guicheto Scaloppi / Mestre

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The coconut palm (Cocos nucifera L.) is the most palmae cultivated throughout the world. The stem bleeding, caused by the fungus Ceratocystis paradoxa (De Seynes) Moreau, has caused significant losses in production in several states of Brazil, including Sergipe. Etiology and transmission mechanisms are largely unknown and epidemiological studies have not yet been realized. This study aimed to analyze the spatial arrangement of disease in the field, in order to characterize the spread of stem bleeding, besides the use of the technique for analyzing the structure of foci for characterization. The spatial pattern of disease was investigated in three planting areas, each containing 1500 plants / area, divided into quadrats of 15 plants, using the mapping analysis, ordinary runs, a slight adjustment to the distribution of frequency and spatial autocorrrelation. In all areas it was evident the presence of aggregation of diseased plants, indicating a predominant pattern of spatial arrangement of disease in the field. In analyzing the structure of foci, it was found a total of 13 foci, with an average of 27.5 plants / focus and tendency (higher number of symptomatic plants) to grow in the direction of the lines of plantation, with provision so elliptical. From the data analysis, there were indications that possibly the stem bleeding route of transmission has the natural dispersal of inoculum and cultural practices. Are required to carry out additional studies on the dispersal of inoculum for a better understanding of disease dynamics and the establishment of appropriate control measures. / O coqueiro (Cocos nucifera L.) é a palmácea mais cultivada em todo o mundo. A resinose do estipe, causada pelo fungo Ceratocystis paradoxa (De Seynes) Moreau, tem causado perdas significativas na produção em diversos estados do Brasil, entre eles Sergipe. Sua etiologia e mecanismos de transmissão são pouco conhecidos e, estudos epidemiológicos, ainda não foram realizados. Objetivou-se analisar o arranjo espacial da doença no campo, com o intuito de caracterizar a disseminação da resinose, além do emprego da técnica de análise da estrutura de focos para caracterização da doença. O arranjo espacial da doença foi investigado em 3 parcelas de plantio, cada um contendo 1.500 plantas/área utilizou-se análises de mapeamento e ordinary runs , posteriormente as parcelas foram subdivididas em quadriláteros de 15 plantas para o cálculo de ajuste à distribuição discreta de freqüência e autocorrrelação espacial. Em todos os setores ficou evidenciada a presença de agregação de plantas doentes, indicando haver um padrão predominante de arranjo espacial agregado da doença no campo. Na análise da estrutura de focos, constatou-se um total de 13 focos, com média de 27,5 plantas/focos e com tendência (maior número de plantas sintomáticas) de crescerem na direção das linhas de plantios, tendo disposição de forma elíptica. A partir da análise dos dados, houve indicações que possivelmente a resinose tem como via de transmissão a dispersão natural do inóculo e práticas culturais. São necessários a realização de estudos adicionais sobre a dispersão do inóculo para o melhor entendimento da dinâmica da doença e o estabelecimento de medidas de controle adequadas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-13T14:20:21Z No. of bitstreams: 1 Iwanne Lima Coelho.pdf: 1395783 bytes, checksum: bfb69bfcc0a83cb3f0e7ff59aade864a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-13T14:20:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Iwanne Lima Coelho.pdf: 1395783 bytes, checksum: bfb69bfcc0a83cb3f0e7ff59aade864a (MD5) Previous issue date: 2013-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The occurrence of stem bleeding, caused by Ceratocystis paradoxa (Anamorphic: Thielaviopsis paradoxa), compromises the productivity of green dwarf coconut and poses a threat to the entire production chain of green coconut. There are no fungicides registered in the Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento (MAPA) for the management of this disease, the indiscriminate use of the fungicide thiophanate methyl may result in the emergence of resistant pathogenic strains, environmental contamination and to human health. Biological control using yeast, promising biocontrol agents, may represent an efficient and applicable solution when aggregated to crop management. Work on yeasts not recovered in control of the causal agent of this disease, as well as studies related to its field control. The study aimed to select yeasts from fruits of the green dwarf coconut, with potential for biocontrol of stem bleeding coconut on the seedlings of green dwarf coconuts. Thirty-seven yeasts, isolated from immature coconuts, were evaluated in vivo for their potential to reduce the symptoms of stem bleeding in seedlings of green dwarf coconuts, packed in a greenhouse under 40 ± 2 ° C and 60 % RH, for two methods of application: spray (10 mL de 1x107 cells mL-1) and injection (1 mL de 1x107 cells mL-1); and in vitro (28 ± 2 °C, 12 h photoperiod), as for inhibition of mycelial growth, volatile metabolic action, parasitism, antibiosis and "killer" activity. Fifteen yeast strains in vivo reduced the percentage of the area damaged by C. paradoxa isolated Moju - PA. In vitro, the isolates identified as Pichia guilliermondii (LEV 25) and Candida dosseyi (LEV47), stood out as potentially promising antagonists, because of the diameter of the inhibited mycelial growth , competing for space and nutrients, and reduced production of conidia by the action of volatile metabolites on pathogenic isolates of Moju - PA, Neópolis- SE and Sousa –PB. This is the first report of reduction of the symptoms of stem bleeding in seedlings of green dwarf coconuts by the antagonistic action of yeast on C. paradoxa. The isolates of P. guilliermondii and C. dosseyi have potential as a component of integrated management of coconut stem bleeding / A ocorrência da resinose, causada por Ceratocystis paradoxa (Anamorfo: Thielaviopsis paradoxa), compromete a produtividade do coqueiro-anão-verde e representa ameaça para toda a cadeia produtiva do coco-verde. Não há registros no Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento (MAPA) de fungicidas para o manejo dessa doença, o uso indiscriminado do fungicida tiofanato metílico pode resultar no surgimento de linhagens patogênicas resistentes, contaminação ambiental e à saúde humana. O controle biológico utilizando-se leveduras, promissores agentes de biocontrole, pode representar uma solução eficiente e aplicável quando agregada ao manejo da cultura. Não foram recuperados trabalhos sobre leveduras no controle do agente causal dessa enfermidade, assim como estudos referentes ao seu controle em campo. O trabalho teve por objetivo selecionar leveduras, obtidas de frutos do coqueiro-anão-verde, com potencial para o biocontrole da resinose do coqueiro, em mudas de coqueiro-anão-verde. Trinta e sete leveduras, isoladas de cocos imaturos, foram avaliadas in vivo quanto ao potencial de redução dos sintomas de resinose em mudas de coqueiro-anão-verde, acondicionadas em telado sob 40±2 °C e 60% UR, por dois métodos de aplicação: aspersão (10 mL de 1x107 células mL-1) e injeção (1 mL de 1x107 células mL-1); e in vitro (28±2 °C, 12 h fotoperíodo), quanto inibição de crescimento micelial, ação de metabólitos voláteis, parasitismo, antibiose e atividade “killer”. Quinze cepas de leveduras, reduziram in vivo o percentual de área lesionada por C. paradoxa isolado de Moju-PA. In vitro, os isolados identificados como Pichia guilliermondii (LEV 25) e Candida dosseyi (LEV 47), destacaram-se como os antagonistas potencialmente promissores, pois inibiram o diâmetro de crescimento micelial, competindo por espaço e nutrientes, e reduziram a produção de conídios, pela ação de metabólitos voláteis sobre os isolados patogênicos de Moju-PA, Neópolis-SE e da Sousa-PB. Este é o primeiro relato da redução dos sintomas de resinose em mudas de coqueiro-anão-verde pela ação antagônica de leveduras sobre C. paradoxa. Os isolados de P. guilliermondii e C. dosseyi apresentam potencialidade como componente do manejo integrado da resinose do coqueiro.

Les patrons de variation au sein des espèces d'arbres résultent d'évolutions complexes dont certaines sont particulièrement liées à la condition d'arbre. Si les facteurs expliquant cette variabilité ont été abordés pour les espèces des zones tempérées, ils restent encore peu connus pour des espèces fruitières des zones tropicales sèches offrant des particularités sur le plan adaptatif et relevant d'un processus de domestication ancien. Pour répondre à cet enjeu, l'objectif scientifique de cette thèse est de mieux comprendre l'impact des facteurs évolutifs sur la variabilité au sein d'une espèce d'arbre en zone soudano-sahélienne. Nous nous sommes intéressés à Vitellaria paradoxa (karité), une espèce jouant un rôle économique majeur par la production de beurre à partir des graines, dont l'aire de distribution s'étend du Sénégal à l'Ouganda sous la forme de peuplements naturels et agroforestiers. Dans une approche phylogéographique basée sur l'analyse du polymorphisme de marqueurs moléculaires supposés neutres (microsatellites chloroplastiques et nucléaires, et régions intergéniques du chloroplaste) et sur la modélisation des niches écologiques du Karité à différentes périodes du Quaternaire, nous mettons en évidence l'impact des perturbations liées aux dernières glaciations (il y a 20000 ans) sur la diversité génétique de l'espèce. Dans une seconde approche méthodologique, nous étudions l'impact des déterminants environnementaux sur la variabilité des constituants chimiques des graines de Karité, permettant d'énoncer de nouvelles hypothèses. Enfin, nous nous intéressons à l'expression du polymorphisme de gènes candidats, codant les enzymes stéaroyl-ACP-désaturase (SAD) et homogentisate phytyltransférase (HPT), en relation avec la variabilité de la composition chimique en acides gras et en tocophérols des graines. Les résultats obtenus permettent notamment de discuter de l'impact de la sélection naturelle, de la domestication et de la dérive génétique, et d'apporter des hypothèses évolutives et fonctionnelles potentielles expliquant la variabilité observée. / Patterns of variation within tree species are the result of complex evolutionary changes, some of which are particularly related to the condition of trees. If the factors explaining this variability were discussed for species in temperate zones, they remain little known for fruit tree species of dry tropics, which show special adaptive features and result from an old domestication process. To meet this challenge, the scientific purpose of this thesis is to improve our understanding of evolutionary factors affecting the variability within a tree species in the Sudano-Sahelian zone. We got interested in Vitellaria paradoxa (Shea tree), a species which plays a major economic role for the production of butter from seeds and whose distribution range extends from Senegal to Uganda. In a phylogeographic approach based on the analysis of polymorphism supposedly neutral molecular markers (chloroplast and nuclear microsatellites and chloroplast intergenic regions) and based on ecological niche modelling of Shea tree at different periods of the Quaternary, we shape the role of last glacial maximum (20.000 YBP) on the genetic diversity of the species. In a second methodological approach, we study the impact of environmental determinants on the variability of Shea nuts chemical constituents, stating novel hypotheses. Finally, we investigate the polymorphism of candidate genes, encoding enzymes stearoyl-ACP-desaturase (SAD) and homogentisate phytyltransférase (HPT), in connection with the variability of relative fatty acids compositions and tocopherols contents in seeds. Through the results obtained, we discuss the impact of natural selection, domestication and genetic drift, and provide evolutionary and functional hypotheses that potentially explain the varia bility observed.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-26T13:59:31Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnaliseMorfologicaMolecular.pdf: 1631378 bytes, checksum: 5757c5c8705000ab31e5fe11f2a6a2d0 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-27T13:33:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnaliseMorfologicaMolecular.pdf: 1631378 bytes, checksum: 5757c5c8705000ab31e5fe11f2a6a2d0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-27T13:33:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnaliseMorfologicaMolecular.pdf: 1631378 bytes, checksum: 5757c5c8705000ab31e5fe11f2a6a2d0 (MD5) Previous issue date: 2015-12-18 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A espécie Lepidosiren paradoxa pertence à ordem Dipnoi, juntamente com mais dois gêneros, sendo considerados os peixes pulmonados verdadeiros. Os machos adultos de L. paradoxa diferenciam-se das fêmeas através da presença de filamentos nas nadadeiras pélvicas. Estes filamentos assemelham-se àqueles encontrados em brânquias de peixes e de salamandras neotênicas. Estes filamentos desenvolvem-se e tornam-se vascularizados durante o período de reprodução. Neste trabalho, propomos testar a hipótese de que os filamentos pélvicos de L. paradoxa compartilham características morfológicas e moleculares com filamentos brânquiais. Para tanto, realizamos análise morfológica e molecular dos filamentos das nadadeiras pélvicas entre as estações de estiagem e chuvosa. A análise morfológica ocorreu através de coloração de hematoxilina e eosina (HE) e microscopia eletrônica de varredura (MEV). Por fim, foi feita a quantificação de expressão gênica de marcadores enriquecidos em brânquias de peixes, através de PCR em Tempo Real (RT-PCR), utilizando a nadadeira peitoral como referência. O comprimento dos filamentos da estação chuvosa e de estiagem apresentaram os valores de média e desvio padrão de, 4,31 mm±0,186 e 1,63 mm±0,104, respectivamente. Nas imagens de MEV foram observadas algumas células com microvilosidades e/ou microciliadas e algumas células menores. Nas análises de HE os filamentos apresentaram uniformidade no seu epitélio formada com 4 camadas de células, sendo preenchido por tecido conjuntivo e por fim tornam-se mais vascularizados na estação chuvosa. Na analise molecular de RT-PCR os marcadores selecionados não apresentaram variação quando comparados com a nadadeira peitoral e entre as estações. Em conclusão, apesar de existirem semelhanças morfológicas entre filamentos pélvicos de L. paradoxa e filamentos brânquiais de peixes e anfíbios, os dados moleculares aqui obtidos não suportam a hipótese de que estes filamentos realizem trocas gasosas. / The Lepidosiren paradoxa species belongs to Dipnoi order, along with two genre and are considered true lungfishes. Adult males of L. paradoxa differ from females by the presence of filaments in the pelvic fin. These filaments resemble those found in gills of fish and neotenic salamanders. These filaments are grow and become vascularized during the reproduction period. In this work we tested the hypothesis that the pelvic filament of L. paradoxa share morphological and molecular characteristics with gill filaments. Thus, we performed morphological and molecular analyses of the filaments of the pelvic fins between the dry and rainy seasons. Morphological analysis was perfomed through hematoxylin and eosin (HE) and scanning electron microscopy (SEM). Finally, we quantified gene expression of gill markers by RT-PCR using pectoral fin as reference. The mean length and standard deviation of the filaments during rainy and dry season were 4,31mm of ± 0.186 and 1,63mm ± 0.104, respectively. In the SEM images, we observed with a few cell microvilli and/or microplicae and some smaller cells. In the HE analyzes we found that the filaments have uniform epithelium formed with four layers of cells being filled by connective tissue and finally become more vascularized the rainy season. Molecular analysis through RT-PCR did not show any change when compared to the pectoral fin and between the stations. In conclusion, despite morphological and molecular similarities between gill filaments and pelvic fin filaments, our findings do not support a role for L. paradoxa pelvic filaments in gas exchange.