Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2016-12-05T12:31:08Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_AnalisesPopulacionaisL.Purpureus.pdf: 2353749 bytes, checksum: 4e42a8beef4fdc3a4441691c75184517 (MD5) / Rejected by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br), reason: Corrigir as palavras-chaves, iniciar com letra maiusculas. Corrigir na citação após o (mestrado) inserir - e não ponto. Incluir ponto no final da citação. Renomear pdf para AnalisesPopulacionaisLutjanus Acrescentar a palavra Programa antes de Pós-Graduação no final da citação. on 2016-12-05T15:26:25Z (GMT) / Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-03T11:27:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnalisesPopulacionaisL.Purpureus.pdf: 2357106 bytes, checksum: 7f3ac8ad14a67fd29b0baca8fcc42b59 (MD5) / Rejected by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br), reason: Renomear pdf Verificar na citação a ausência da palavra Programa. on 2017-01-03T13:07:55Z (GMT) / Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-04T12:14:34Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnalisesPopulacionaisLutjanus.pdf: 2357106 bytes, checksum: 7f3ac8ad14a67fd29b0baca8fcc42b59 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-06T15:40:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnalisesPopulacionaisLutjanus.pdf: 2357106 bytes, checksum: 7f3ac8ad14a67fd29b0baca8fcc42b59 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-06T15:40:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnalisesPopulacionaisLutjanus.pdf: 2357106 bytes, checksum: 7f3ac8ad14a67fd29b0baca8fcc42b59 (MD5) Previous issue date: 2015-03-02 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Organismos marinhos com ampla distribuição são excelentes modelos para o entendimento de padrões de conectividade genética histórica. Lutjanus purpureus, ou pargo, como a espécie é popularmente conhecida, é um Teleósteo marinho pertencente à família Lutjanidae. A espécie distribui- se desde Cuba até o Nordeste do Brasil, sendo frequentemente encontrada sobre fundos rochosos e arenosos. Possui elevada importância econômica, no entanto poucos são os estudos disponíveis acerca da arquitetura genética da espécie. Dos principais objetivos do presente estudo, o primeiro trata do desenvolvimento e caracterização de iniciadores do tipo EPIC, para abordagens populacionais em L. purpureus, e outros teleósteos marinhos. A caracterização de regiões genômicas com polimorfismo suficiente para análises populacionais torna-se fundamental para estudos genéticos com múltiplas regiões não ligadas. Foram obtidos oito iniciadores, boa parte deles possuindo altos níveis de variação genética. Iniciadores EPIC possuem a vantagem de serem aplicáveis em um vasto nível taxonômico, assim estes iniciadores foram testados e amplificados em organismos de outros agrupamentos taxonômicos, portanto um indicativo de que podem ser usuais em abordagens intraespecíficas para vários grupos de peixes marinhos. O segundo objetivo principal foi avaliar questões sobre diversidade genética, demografia e conectividade genética histórica para L. purpureus, utilizando múltiplos loci (DNA mitocondrial e nuclear). Encontrou-se elevados índices de diversidade genética, provavelmente correlacionados a um elevado tamanho efetivo apresentado pela espécie. O pargo, aparentemente, demonstra elevados níveis de homogeneidade genética ao longo da região estudada, o que é coerente com traços biológicos da espécie tais como desova em mar aberto e desenvolvimento pelágico. Em relação a aspectos da demografia histórica, é apresentado um cenário de crescimento populacional, cujo início é datado de aproximadamente 170 mil anos, sendo esse período congruente com um período de máxima glacial para a região do Atlântico ocidental. / Marine organisms with wide distribution are excellent models for the understanding of historical genetic connectivity patterns. Lutjanus purpureus, or Caribbean snapper, as the species is popularly known, is a marine Teleost belonging to the Family Lutjanidae. The species distribution is from Cuba to the Northeast of Brazil, being often found on rocky and sandy bottoms. It has high economic importance, however there are few studies available on the genetic architecture of the species. Of major goals of this study, the first deals with the development and characterization of the EPIC primers, for population approaches in L. purpureus, and others marine teleosts. The characterization of genomic regions with sufficient polymorphism to population analysis is fundamental for genetic studies with multiple unlinked regions. Were obtained eight primers, and the majority has high levels of genetic variation. EPIC primers have the advantage of being applicable on a wide taxonomic level, thereby these primers were tested and amplified in other taxonomic groups of organisms, so that an indication can be useful in various approaches to intraspecific groups of marine fish. The second main objective was to evaluate issues of genetic diversity, demographics and historical genetic connectivity for L. purpureus using multiple loci (mitochondrial and nuclear DNA). It was found high levels of genetic diversity, probably related to a high effective size presented by species. The Caribbean snapper apparently shows high levels of genetic homogeneity along of the study area, which is consistent with biological traits of species such as spawning in offshore and larval pelagic development. In relation to aspects of historical demography, a population growth scenario is presented, whose beginning is dated about 170,000 years, this period being congruent with a period of glacial maximum to the region of the western Atlantic.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2016-12-05T12:21:58Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AutenticacaoMolecularFiles.pdf: 2978408 bytes, checksum: e3bc932536affe01151bcfa9f69bbf50 (MD5) / Rejected by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br), reason: Corrigir as palavras-chaves, iniciar com letra maiusculas. Corrigir na citação após o (mestrado) inserir - e não ponto. Incluir ponto no final da citação. on 2016-12-05T15:19:20Z (GMT) / Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2016-12-28T12:43:13Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 9 bytes, checksum: 42dd12a06de379d3ffa39b67dc9c7aff (MD5) Dissertacao_AutenticacaoMolecularFiles.pdf: 2983515 bytes, checksum: 1521ddfb898b98943edfec455f0ba063 (MD5) / Rejected by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br), reason: Licença Creative Commons com erro on 2017-01-03T13:02:29Z (GMT) / Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-04T14:29:17Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AutenticacaoMolecularFiles.pdf: 2983515 bytes, checksum: 1521ddfb898b98943edfec455f0ba063 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-06T16:36:25Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AutenticacaoMolecularFiles.pdf: 2983515 bytes, checksum: 1521ddfb898b98943edfec455f0ba063 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-06T16:36:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AutenticacaoMolecularFiles.pdf: 2983515 bytes, checksum: 1521ddfb898b98943edfec455f0ba063 (MD5) Previous issue date: 2015-03-02 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A demanda por frutos do mar tem aumentado notavelmente, e devido a isso, segmentos industriais tem diversificado a forma de apresentação do pescado, oferecendo produtos processados como filés, por exemplo. Tal tendência por um lado estimula o consumo, mas por outro diminui sua confiabilidade, uma vez que pescados processados apresentam altas taxas de substituição. O processamento remove partes do corpo utilizadas no reconhecimento das espécies, e então a identificação fica comprometida, especialmente em um grupo de peixes com grandes semelhanças morfológicas, como é o caso dos pargos ou vermelhos da Família Lutjanidae. Tais peixes tem grande interesse econômico mundialmente, e no Brasil a espécie mais procurada é o Pargo – Lutjanus purpureus. Existem vários outros fatores que propiciam a substituição dessa espécie: captura conjunta a outros lutjanídeos, registro estatístico impreciso, nomenclatura popular despadronizada e rotulagem inadequada do produto filetado. Portanto, o presente trabalho investigou se os filés comercializados em supermercados de Bragança-PA, sob o rótulo de “Pargo”, pertenciam de fato a espécie L. purpureus. Através da metodologia de DNA barcode, foi possível detectar que 22% dos filés amostrados correspondiam à espécie Rhomboplites aurorubens, lutjanídeo de baixo valor comercial na região. Os resultados apontam para a necessidade de prevenir práticas dessa natureza, e fornecem subsídio para auxiliar no combate a substituições, junto a órgãos competentes, indústrias e supermercados. Apesar da eficácia da técnica de DNA barcode para identificação, há metodologias mais práticas e baratas que vêm sendo sugeridas para a elaboração de protocolos de autenticação de produtos pesqueiros, como aqueles baseados em PCR multiplex. Tendo em vista os inúmeros relatos de fraudes em produtos derivados de lutjanídeos, foi desenvolvido um protocolo de identificação forense por padrão de bandeamento, para três das principais espécies de vermelhos comercializadas no Brasil: L. purpureus, L. synagris e Ocyurus chrysurus. Esse protocolo representa uma alternativa a ser aplicada tanto pela fiscalização, na busca por substituição, como na proteção dos direitos do consumidor; quanto na rotina de setores comerciais e industriais, no sentido de controlar a qualidade e garantir a autenticidade dos produtos. / The demand for seafood has increased remarkably, and because of this, industries have diversified the presentation of fish, offering products processed as fillets, for example. This tendency on the one hand stimulates consumption, but on the other reduces its reliability since processed fish have high replacement rates. The process removes parts of the body used to recognize the species, and then the identification is compromised, especially in a large group of fish with morphological similarities, as is the case of the red snappers of Lutjanidae family. These fish have large worldwide economic interest, and in Brazil the most popular species is the Pargo - Lutjanus purpureus. There are several other factors that favor the replacement of this species: Joint capture the other snappers, inaccurate statistical record, popular nomenclature standard out and mislabelling of product. Therefore, this study investigated whether the fillets sold in supermarkets in Bragança-PA, under the label of "Pargo", to belong to species L. purpureus. Through DNA barcode method was able to detect 22% of the sampled fillets corresponded to the species Rhomboplites aurorubens, low commercial value snapper in the region. The results point to the need to prevent such practices, and provide grant to help fight the replacements, with the competent bodies, industry and supermarkets. Despite the effectiveness of barcode DNA technique for identification, there are more practical and inexpensive methods that have been suggested for the development of authentication protocols fishery products, such as those based on multiplex PCR. In view of the numerous reports of fraud in derivative products snappers, we developed a protocol for forensic identification banding pattern, for three of the main species of red marketed in Brazil: L. purpureus, L. synagris and Ocyurus chrysurus. This protocol is an alternative to be applied both for the supervision, in the search for replacement and so on protection of consumer rights; as in routine commercial and industrial sectors, in order to control quality and ensure the authenticity of products.

Made available in DSpace on 2011-03-23T21:19:49Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Growth, mortality, biometry and reproduction of the red snapper, Lutjanus purpureus was researched from samples obtained from landings of commercial catches in the northern Brazilian coast with auspicious of REVIZEE program and Biology and Fishing of the red snapper in the northern Brazilian Project of the CEPNOR/IBAMA . Total and zoological length data obtained from approximately 500 individuals were collected monthly in the cities of Belém, Vigia and Bragança, from January 1999 to December 2000. Sub-samples of 150 fishes were obtained monthly from April 1998 to January 2000 to study reproduction and biometry. In the CEPNOR/IBAMA laboratory were carried out biometry, identification of sexy type and gonadal maturation stages. The total of 16. 733 specimens, presents percentile superiors at 50% of young individuals. The amplitude of total class varied from 13 to 112 cm of length and the length averages were 45,72 cm and 51,91 cm, respectively for the year of 1999 and 2000. The morphometric and weight/length relationships show positive allometry. The weight/length relation of male and female differ significantly from Student statistic method. The reproduction was researched determining the sexual proportion under chisquare statistics, the size of first maturation and spawning period, that was analyzed temporal variation of frequency of the gonadal stages and gonadal-somatic relation. The whole research period was observed a female predominance in the month analysis only in April 1998, May and June 1999 do not present significant differences between male and female. In sexual proportion, by class length the predominance of female was highly significant from 28 to 45 cm. The total length class of first maturation was estimated between 43 a 46 cm from females by graphic extrapolation method and the 43,67 cm by adjust of Galton ogive. The reproductive period was defined in two points, one more intense in the second quarter of the year, with a larger amplitude in may/1998 and another one reduced in the fourth quarter same year. Growth parameters were estimated by ELEFAN I system, Bhattacharya, Gulland & Holt and Appeldoorn methods in FiSAT program. The Appeldoorn method presents the better adjust to red snapper with value of L= 115 cm, K= 0,091 year-1, and determine von Bertalanffy equation Lt = 115 (1-e 0,091t-to). The natural mortality was estimated in 0,25 year-1 e 0,31 year-1 by Pauly and Rikhter & Efanov equations, respectively. The total mortality estimated by converted length in curve of linearized catch and Beverton & Holt method reached values of 0,59; 0,664 respectively. Mortality by fishing and exploitation rate were also calculated and obtained values F = 0,34 year1 e E = 0,57. The longevity estimated by Taylor equation was 33 years. The red snapper presents slow growth and longevity life with periodic spawn. The fishing in the northern Brazilian coast happen high percentile of young fishes. That can contribute to overfishing growth , compromising the sustentability of the species and the fishing activity in the northern Brazilian coast. It is indispensable to adopt regulation measures to red snapper fishing, at least about minimum size capture. / O crescimento, a mortalidade, biometria e a reprodução do pargo Lutjanus purpureus foram estudadas a partir de amostras obtidas nos desembarques da frota comercial capturadas com pargueira na costa norte do Brasil no âmbito do programa REVIZEE e do Projeto biologia e pesca do pargo no norte do Brasil do CEPNOR/IBAMA. Dados de comprimentos total e zoológico de aproximadamente 500 indivíduos foram coletados aleatoriamente e mensalmente nos desembarques dos municípios de Belém, Vigia e Bragança, no período de janeiro de 1999 a dezembro de 2000. E para realizar estudos de reprodução e biometria foram obtidas subamostras mensais de 150 indivíduos em abril de 1998 a janeiro de 2000. No laboratório do CEPNOR/IBAMA foram realizadas as biometrias, sexagem e identificados os estágios de maturação gonadal. As amostras totalizaram 16.733 indivíduos com percentuais superiores a 50% de indivíduos jovens. A amplitude de classe total variou de 13 a 112 cm de comprimento e as médias de comprimentos foram de 45,72 cm e 51,91 cm, respectivamente para o ano de 1999 e 2000. As relações morfométricas e as relações peso/comprimento apresentaram alometria positiva. E a relação peso/comprimento para macho e fêmea diferem significativamente entre si, pelo teste de Student, bilateral, com alfa = 0,05. A reprodução foi estudada determinando a proporção sexual através do teste quiquadrado, o tamanho de primeira maturação e o período de desova, que foi analisado pela variação temporal das freqüências dos estágios gonadais e relação gonadossomática. Para todo o período estudado foi verificada a predominância de fêmeas e nas análises mensais apenas nos meses de abril de 1998, maio e junho de 1999 não apresentaram diferenças significativas entre os sexos. Na proporção sexual por classe de comprimento a predominância de fêmeas foi altamente significativa de 28 a 45 cm. A classe de comprimento total do tamanho de primeira maturação foi estimado 43 a 46 cm para fêmeas pelo método da extrapolação gráfica e de 43,67 cm pelo ajuste da ogiva de Galton. E o período reprodutivo foi observado em dois picos, sendo um intenso no segundo trimestre, com maior amplitude no mês de maio/1998 e um mais reduzido no quarto trimestre. Os parâmetros de crescimento foram estimados pelo sistema ELEFAN I, método de Bhattacharya, Gulland & Holt e Appeldoorn no programa Fisat. O método de Appeldoorn apresentou o melhor ajuste para a espécie com o valor de L= 115 cm K= 0,091ano-1 , que determinou a equação do crescimento de von Bertalanffy Lt = 115 (1-e 0,091tto). A mortalidade natural foi estimada em 0,25 ano-1 e 0,31 ano-1 pelas equações de Pauly e Rikhter & Efanov respectivamente. A mortalidade total estimada pelos métodos do comprimento convertido em curva de captura linearizada e Berverton & Holt atingiu valores de 0,59; 0,664 respectivamente. A mortalidade por pesca e a taxa de explotação também foram calculados. Os resultados foram F = 0,34 ano 1 e E = 0,57. A longevidade estimada pela fórmula de Taylor foi de 33 anos. O pargo apresenta crescimento lento e vida longa com desova contínua e periódica. A pesca na costa norte do Brasil incide em percentuais elevados de jovens o que pode contribuir para um estado de sobrepesca de crescimento, comprometendo assim a sustentabilidade da espécie e da atividade pesqueira na região norte. É imprescindível adotar medidas de ordenamento para a pesca do pargo, principalmente no que diz respeito ao tamanho mínimo de captura.