Ces travaux de thèse ont pour but de faire des avancées dans le domaine de la vision cognitive en proposant une plate-forme fonctionnelle et logicielle pour le problème complexe de l'interprétation sémantique d'images. Nous nous sommes focalisés sur la proposition de solutions génériques et indépendantes de toute application. Plus qu'une solution à un problème spécifique, la plate-forme proposée est une architecture minimale qui fournit des outils réutilisables pour la conception de systèmes d'interprétation sémantique d'images.<br />Le problème de l'interprétation sémantique d'images est un problème complexe qui peut se séparer en 3 sous-problèmes plus faciles à résoudre en tant que problèmes indépendants: (1) l'interprétation sémantique, (2) la gestion des données visuelles pour la mise en correspondance des représentations abstraites haut niveau de la scène avec les données image issues des capteurs et (3) le traitement d'images. Nous proposons une architecture distribuée qui se base sur la coopération de trois systèmes à base de connaissances (SBCs).<br />Chaque SBC est spécialisé pour un des sous problèmes de l'interprétation d'images. Pour chaque SBC nous avons proposé un modèle générique en formalisant la connaissance et des stratégies de raisonnement dédiées. De plus, nous proposons d'utiliser deux ontologies pour faciliter l'acquisition de la connaissance et permettre l'interopérabilité entre les trois différents SBCs.<br />Un travail d'implémentation de la plate forme de vision cognitive a été fait à l'aide de la plate-forme de développement de systèmes à base de connaissances LAMA conçue par l'équipe ORION.<br />Les solutions proposées ont été validées sur une application concrète et difficile: le diagnostic précoce des pathologies végétales et en particulier des pathologies du rosier de serre. Ce travail a été effectué en coopération avec l'INRA (Institut National de la Recherche Agronomique).

La créativité comme prévention du stress et de la souffrance au travail. De l'analyse des " pathologies de la communication " du cas des aides à domicile à celle de l'expérience de créativité collective chez les employés de DassaultComment comprendre et agir contre les malaises, ‒ du stress à la souffrance ‒, et les dysfonctionnements internes de l'entreprise moderne ?Nous montrons comment la créativité peut être une démarche communicationnelle préventive et omnipotente, une alternative capable de résorber une communication pathogène engendrée par le management, au profit d'une communication sociale moins instrumentale qu'institutionnelle et formelle.Notre démonstration se structure en 3 parties, chaque partie faisant émerger un paradoxe.Le premier est repéré à partir d'une lecture socio-historique réinterrogeant le travail d'antan. Il s'inscrit certes comme un lieu de souffrance, mais aussi de plaisir, présent dans la notion clé d'otium. Le second provient de l'univers pathogène de l'entreprise et apparait à la lecture de cet espace à partir du paradigme habermassien des " pathologies de la communication ". Le cas d'aides à domicile en situation de stress mais aussi de souffrance a été soumis à cette nouvelle "grille" de lecture. L'analyse est complétée d'une approche winnicotienne, permettant d'y voir les mécanismes inconscients générés par le néomanagement défaillant.Dans la troisième partie, au cœur des mouvements du processus créatif, via une approche socio-psychanalytique, nous partons des théories de Winnicott sur la créativité, pour la transposer et la dépasser, dans la vie interne de l'entreprise.Cette théorie est articulée et complétée par une étude empirique menée auprès d'employés Dassault qui ont fait cette insolite expérience de la création d'un " espace transitionnel hétérotopique ", permettant paradoxalement de s'affranchir du cadre du travail tout en y étant lié.

L'IRM de diffusion (IRMd) est une modalité d'imagerie médicale qui suscite un intérêt croissant dans la recherche en neuro-imagerie. Elle permet d'apporter in vivo des informations nouvelles sur les micro-structures locales des tissus. En chaque point d'une acquisition d'IRMd, la distribution des directions de diffusion des molécules d'eau est modélisée par un tenseur de diffusion. La nature multivariée de ces images requiert la conception de nouvelles méthodes de traitement adaptées. Le contexte de cette thèse est l'analyse automatique de changements longitudinaux intra-patient avec pour application le suivi de pathologies neuro-dégénératives. Notre recherche a ainsi porté sur le développement de nouveaux modèles et tests statistiques permettant la détection automatique de changements sur des séquences temporelles d'images de diffusion. Cette thèse a ainsi permis une meilleure prise en compte de la nature tensorielle des modèles d'ordre 2 (tests statistiques sur des matrices définies positives), une extension vers des modèles d'ordre supérieur et une gestion plus fine des voisinages sur lesquels les tests sont menés, avec en particulier la conception de tests statistiques sur des faisceaux de fibres.

Ce travail étudie les corrélats cérébraux de l'adaptation de la parole et de la motricité oro-faciale après l'exérèse chirurgicale d'une tumeur intra-orale. Une attention particulière est portée à la recherche de corrélats révélant une redéfinition des buts de la tâche, une réorganisation de la coordination motrice, et une modification des représentations internes du système moteur.Trois tâches ont été étudiées : production de mouvements oro-faciaux silencieux ; production de voyelles ; production de syllabes. Les activités cérébrales ont été mesurées par IRM fonctionnelle au cours de 4 sessions, en pré-opératoire, puis 1 mois, 3 mois et 9 mois après la chirurgie. Onze patients et onze sujets sains ont été enregistrés. Pour les patients, trois types de données informant sur leur récupération motrice ont été acquis aux mêmes périodes : données praxiques ; signal acoustique de parole ; auto-évaluation de la qualité de parole. Trois analyses statistiques ont été menées sur les données cérébrales : (1) une analyse " cerveau entier " sur les amplitudes des activations ; (2) une analyse de la localisation de l'activation principale dans le cortex moteur primaire ; (3) une analyse en régions d'intérêt dans le réseau cérébral de la parole, via un modèle linéaire général dans lequel le facteur Groupe (Patients/Sains) a été remplacé par une covariable continue, l'" Indice d'Adaptation Motrice " ou " IAM ", mesurant le niveau de dégradation de la parole, puis son amélioration dans les mois suivants l'opération. Les effets et les interactions des facteurs Groupe (ou IAM), Session et Tâche sur la variable dépendante ont ainsi été mesurés. Toutes tâches et toutes sessions confondues, les patients se distinguent des sujets sains par une activité cérébrale plus faible dans les zones sensori-motrices oro-faciales. Des effets de la session sont observés pour toutes les tâches, pour les patients et les sujets sains. Seules les tâches de motricité silencieuse et de production des voyelles révèlent des effets de la session sur l'activité cérébrale significativement différents pour les patients et les sujets sains. Ainsi, pour la motricité silencieuse, 1 mois après l'opération, les patients montrent, pour la tâche linguale, une forte activité dans le Lobule Pariétal Supérieur (LPS) et dans le Cortex Pré-Frontal Dorso-Latéral (CPFDL). Pour les voyelles, 3 mois après la chirurgie, l'activité cérébrale des patients décroît dans le cervelet et croît fortement dans le Lobule Pariétal Inférieur ; de 3 à 9 mois après la chirurgie, l'activité croît dans les zones motrices (Cortex Moteur Primaire et Aire Motrice Supplémentaire) et elle décroît dans le Gyrus Temporal Supérieur. Les patients montrent aussi 1 mois après l'opération, tous articulateurs confondus, une localisation plus dorsale de l'activité dans le Cortex Moteur Primaire. Pour des tâches motrices silencieuses, nos observations suggèrent que, immédiatement après l'opération, les patients pourraient réactualiser leur modèle interne du système moteur (activité dans le LPS), devenu imprécis, tout en ré-élaborant leurs stratégies de coordination (activité dans le CPFDL). Pour la production des voyelles, tâche plus complexe et plus précise, nos résultats suggèrent que 3 mois après l'opération, les patients utiliseraient moins les modèles internes devenus trop imprécis. Le retour à une activation forte dans les zones motrices 9 mois après l'intervention suggère que l'adaptation de la production des voyelles est quasiment achevée, et la baisse concomitante de l'activation dans le cortex auditif est cohérente avec l'hypothèse qu'il existerait de nouveau une adéquation entre la copie d'efférence auditive et le feedback auditif externe. Pour la production de syllabes, les résultats sont les moins pertinents parmi les 3 tâches. Une réorganisation plus tardive, au-delà de 9 mois, due à la plus grande complexité de la tâche, pourrait en être une explication potentielle.

Tema : Audinių prieinkstinių liaukų histopatologinis tyrimas. Tyrimo objektas: X ūkio 6 mėnesių amžiaus audinių prieinkstinių liaukų histologiniai preparatai. Atlikimo vieta: Lietuvos Sveikatos Mokslų Universiteto Veterinarijos Akademijos Patologijos centras. Darbo apimtis: 41 puslapis, naudoti 43 literatūros šaltiniai, 31 paveikslas. Tyrimo tikslas: Įvertinti audinių prieinkstinių liaukų histomorfologinius pokyčius. Tyrimo uždaviniai: 1. Atlikti histologinį ir histocheminį mėginių tyrimus. 2. Įvertinti audinių prieinkstinių liaukų histopatologijas. Tyrimo metodai: Rutininio skrodimo metu buvo paimta 40 audinių prieinkstinių liaukų pataloginė medžiaga (n=40), fiksuota 10 proc. neutraliu formalino tirpalu, atliktas mėginių dažymas hematoksilinu eozinu ir Kongo raudonuoju. Histologinio tyrimo metu įvertintos prieinkstinių liaukų patologijos. Tyrimo duomenų statistinis įvertinimas atliktas, naudojant Microsoft Exel (2010) programą. Paskaičiuotas įvairių patologijų pasireiškimo dažnumas, jų pasiskirstymas žievėje ir šerdyje (proc.). Taip pat įvertinta, kaip pasiskirstė patologijos žievės zonose, jų pasireiškimo dažnumas procentais. Išvados: 1. Atlikus histologinį tyrimą pakitusių audinių antinksčių rasta 92 proc. 2. Atlikus histocheminį prieinkstinių liaukų tyrimą, baltymo amiloido sankaupų prieinkstinėse liaukose nerasta. 3. Didžiausią dalį patologinių pokyčių sudaro plazmocitų infiltracija (70 proc.) ir hemosiderozė (17 proc.). 4. Mažiausią dalį patologinių pokyčių... [toliau žr. visą tekstą] / Theme: Histopathological research of mink adrenal glands Study object: adrenal gland histological samples (preparations) of 6-month-old minks from farm X. Venue of performance: in Pathology Center of the Veterinary Academy of the Lithuanian University of Health Sciences Volume of the paper: the total volume of the work comprises 41,i.e. 31 picture. The aim of the research: to evaluate histomorphologic changes of mink adrenal glands. Tasks of the work: 1. to make histological and histochemical analysis of samples. 2. to evaluate histopathologies of mink adrenal glands. Research methods: during the routine autopsy was taken pathological material of adrenal glands (n = 40) of 40 minks, which was fixed 10 per cent with neutral formalin solution, and samples dyeing with hematoxylin eosin and Congo red were carried out. Statistical evaluation of the survey data carried out using Microsoft Excel (2010) program. Calculated the frequency of the appearance of various pathologies, their distribution in the cortex and core (in percent). Also, has been assessed the distribution of pathology in cortex areas and their frequency of occurrence percentage (in percent). The most important conclusions : 1. An analysis of 40 male minks adrenal glands histological results showed that 92 per cent. analyzed samples demonstrate a change. 2. The largest part of the pathological changes consist of infiltration by plasmocytes (70 percent.) and hemosiderosis (17 percent.). 3. The smallest part of the... [to full text]

The present work aims at analyzing the development f conjuntos habitacionais of social interest built in the city of São Gabriel, R/S, through the methodology of post occupation assessment, APO , including the elaboration and the application of both: a questionnaire and the detailed visiting of several inhabitance unities. The researched area consisted of 2 conjuntos habitacionais of shared unities from a total of 314 houses with an area from 27,00 to 36, 24 sq meters, built between 1996 and 2002. From the total above mentioned, 175 unities were visited (55,7%) and 24 were surveyed (7,6%). The unities are built with a ceramic block with an external covering, but without an internal one. The main problems noticed are related to the deficiency of ground solidification and high warping of the floor. We also identified cracking on the walls and the low quality of the materials, especially the doorknobs. An expressive number of houses show an increasing of the area and the inhabitants, generally speaking, seem to be satisfied with their houses, certainly due to previous living conditions (places susceptible to floods, etc) / O presente trabalho pretende avaliar o desempenho de conjuntos habitacionais de interesse social, construídos no município de São Gabriel RS, através de metodologia de avaliação pós-ocupação APO compreendendo a elaboração e aplicação de um questionário e de vistorias detalhadas de diversas unidades habitacionais. O universo pesquisado compreende 2 conjuntos habitacionais de unidades térreas unifamiliares, num total de 314 casas com áreas de 27,00 a 36,24 m2, construídas entre 1996 a 2002. Desse total, 175 unidades foram visitadas (55,7%) e 24 vistoriadas (7,6%). As unidades são construídas em bloco cerâmico, com revestimento externo de chapisco e sem revestimento interno. Os principais problemas identificados estão relacionados à deficiência de compactação do solo e conseqüentes deformações excessivas de piso e fissuras/rachaduras nas paredes e à baixa qualidade dos materiais, principalmente, das aberturas. Um número expressivo de moradias apresenta aumento de área e os moradores, de um modo geral, estão satisfeitos com sua casa, devido, certamente, às condições anteriores de moradia (lugares alagadiços, sub-moradias).

Ce travail étudie les corrélats cérébraux de l’adaptation de la parole et de la motricité oro-faciale après l’exérèse chirurgicale d’une tumeur intra-orale. Une attention particulière est portée à la recherche de corrélats révélant une redéfinition des buts de la tâche, une réorganisation de la coordination motrice, et une modification des représentations internes du système moteur.Trois tâches ont été étudiées : production de mouvements oro-faciaux silencieux ; production de voyelles ; production de syllabes. Les activités cérébrales ont été mesurées par IRM fonctionnelle au cours de 4 sessions, en pré-opératoire, puis 1 mois, 3 mois et 9 mois après la chirurgie. Onze patients et onze sujets sains ont été enregistrés. Pour les patients, trois types de données informant sur leur récupération motrice ont été acquis aux mêmes périodes : données praxiques ; signal acoustique de parole ; auto-évaluation de la qualité de parole. Trois analyses statistiques ont été menées sur les données cérébrales : (1) une analyse « cerveau entier » sur les amplitudes des activations ; (2) une analyse de la localisation de l’activation principale dans le cortex moteur primaire ; (3) une analyse en régions d’intérêt dans le réseau cérébral de la parole, via un modèle linéaire général dans lequel le facteur Groupe (Patients/Sains) a été remplacé par une covariable continue, l’« Indice d’Adaptation Motrice » ou « IAM », mesurant le niveau de dégradation de la parole, puis son amélioration dans les mois suivants l’opération. Les effets et les interactions des facteurs Groupe (ou IAM), Session et Tâche sur la variable dépendante ont ainsi été mesurés. Toutes tâches et toutes sessions confondues, les patients se distinguent des sujets sains par une activité cérébrale plus faible dans les zones sensori-motrices oro-faciales. Des effets de la session sont observés pour toutes les tâches, pour les patients et les sujets sains. Seules les tâches de motricité silencieuse et de production des voyelles révèlent des effets de la session sur l’activité cérébrale significativement différents pour les patients et les sujets sains. Ainsi, pour la motricité silencieuse, 1 mois après l’opération, les patients montrent, pour la tâche linguale, une forte activité dans le Lobule Pariétal Supérieur (LPS) et dans le Cortex Pré-Frontal Dorso-Latéral (CPFDL). Pour les voyelles, 3 mois après la chirurgie, l’activité cérébrale des patients décroît dans le cervelet et croît fortement dans le Lobule Pariétal Inférieur ; de 3 à 9 mois après la chirurgie, l’activité croît dans les zones motrices (Cortex Moteur Primaire et Aire Motrice Supplémentaire) et elle décroît dans le Gyrus Temporal Supérieur. Les patients montrent aussi 1 mois après l’opération, tous articulateurs confondus, une localisation plus dorsale de l’activité dans le Cortex Moteur Primaire. Pour des tâches motrices silencieuses, nos observations suggèrent que, immédiatement après l’opération, les patients pourraient réactualiser leur modèle interne du système moteur (activité dans le LPS), devenu imprécis, tout en ré-élaborant leurs stratégies de coordination (activité dans le CPFDL). Pour la production des voyelles, tâche plus complexe et plus précise, nos résultats suggèrent que 3 mois après l’opération, les patients utiliseraient moins les modèles internes devenus trop imprécis. Le retour à une activation forte dans les zones motrices 9 mois après l’intervention suggère que l’adaptation de la production des voyelles est quasiment achevée, et la baisse concomitante de l’activation dans le cortex auditif est cohérente avec l’hypothèse qu’il existerait de nouveau une adéquation entre la copie d’efférence auditive et le feedback auditif externe. Pour la production de syllabes, les résultats sont les moins pertinents parmi les 3 tâches. Une réorganisation plus tardive, au-delà de 9 mois, due à la plus grande complexité de la tâche, pourrait en être une explication potentielle. / This thesis investigates the cerebral correlates of the adaptation of speech production and orofacial motor skills after the exeresis of a tumor in the intraoral cavity. A special focus has been given to searching for correlates associated with a redefinition of the task’s goals, a reorganization of motor coordination, or a change in the internal representations of the peripheral motor system. Three tasks were investigated: non-audible oro-facial movements, vowel production, and syllable production. Brain activity was measured using fMRI longitudinally across 4 sessions: before surgery, and at 1, 3 and 9 months after surgery. Eleven patients and eleven healthy subjects were recorded. For the patients only, 3 additional kinds of data were collected in parallel to the fMRI, in order to assess, at each stage of the clinical process, the improvement of oro-facial motor skills: scores assessing orofacial praxis, acoustic speech signal, and a self-evaluation of speech production quality. Three statistical analyses were run on the fMRI data: (1) a “whole brain” analysis, which is based on brain activity amplitudes; (2) an analysis of the localization of the strongest activity in the primary motor cortex; (3) an analysis of Regions of Interest located in the speech production/perception cerebral network, using a General Linear Model. In this third analysis, the independent “Group” factor has been replaced by a continuous covariable, called “Motor Adaptation Index” (MAI), that quantitatively measures the degradation of speech production 1 month after surgery, and then its improvement in the subsequent months. The main effects of the “Group” (or MAI), “Session” and “Task” factors have been estimated, together with their interactions.All the tasks and all the sessions taken together, patients show significantly lower activity than healthy subjects in the orofacial sensorimotor regions. Significant main effects of the “Session” factor are also observed for all the tasks, for the patients as well as for the healthy subjects. Only non-audible motor tasks and vowel production tasks show for the “Session” factor effects that are significantly different for the patients and the healthy subjects. For non-audible lingual movements, 1 month after surgery, the patients show a high level of activity in the Superior Parietal Lobule (SPL) and DorsoLateral PreFrontal Cortex (DLPFC). For patients’ vowel production, 3 months after surgery activity decreases in the cerebellum and strongly increases in the Inferior Parietal Lobule (IPL), while from 3 to 9 months after surgery, the activity increases in the motor regions (Primary Motor Cortex, Supplementary Motor Area), and decreases in the Superior Temporal Gyrus (STG). In addition, 1 month after the surgery, patients show, for all tasks, Primary Motor Cortex activity located more dorsally than in the other sessions.For non-audible oro-facial motor tasks, our results suggest that immediately after surgery patients might have to re-tune their internal model of the peripheral motor system (SPL activity), which is no longer accurate, while redefining their coordination strategies (DLPFC activity). For vowel production, a more skilled and demanding task, stronger modifications of the patients’ internal model could be necessary 3 months after surgery. Nine months after surgery, the simultaneous increase of activity in the motor regions and decrease of activity in the STG suggest for vowel production that the adaptation has almost been achieved, with regained consistency between the efferent copy and auditory feedback. Syllable production tasks show no significant patient specific changes across sessions, possibly due to the greater complexity of the task as compared to the other two.

\"Ver o corpo humano por dentro\" sem a necessidade de intervenção cirurgica é objetivo que motivou a criação de diversos instrumentos como eletrocardiogramas, eletroencefalogramas, equipamentos de ressonância magnética e raio-X. Através daavaliação de imagens ou resultados numéricos, pode-se detectar patologias nos primeiros estágios, permitindo uma ação decisiva de especialistas médicos na cura destas. Especialistas da fala normalmente empregam instrumentos comovideolaringoscopia e videoestroboscopia para avaliar qualitativamente o comportamento da laringe e pregas vocais. Comprendendo que a voz transmite informações sobre alterações orgânicas ou funcionais nas estruturas de vocalização, este trabalhoapresenta um conjunto de medidas acústicas neste sinal que evidenciam alterações na periodicidade do movimento das cordas vocais e quantidade de ruído turbulento que atravessa a glote. A partir de avaliação estatística da capacidadedescriminatória destes índices acústicos e empregando-se redes neurais artificiais, define-se um método automático para identificação probabilística das patologias que afetam as estruturas da laringe. / \"To see the inside of the human body\" without the necessity of surgical intervention is the objective that motivates the conception of several instruments like electrocardiogram, electroencephalongram, magnetic resonance and X-ray equipments. Through the image analysis or numerical results, it is possible to identify pathologies, allowing a decisive action of physician specialists in cure of these. Voice specialists, normally, use instruments as videolaryngoscopy and videostroboscopy to assess the vocal folds and larynx comportment, qualitatively. Understanding that the voice transmits information upon functional or organic alterations in vocalization structures, this work presents a set of acoustic measurements, based on this signal, that evidences alterations on vocal folds movement periodicity and quantify of turbulent noise throught the glottis. From the statistic evaluation of discriminatory capacity of these acoustic indexes and using artificial neural networks, it defines an automatic method for the probabilistic identification of pathologies that affect the laryngeal structures.

La Néolithisation au Proche-Orient est une période phare de l’histoire de l’humanité : c’est en effet à ce moment qu’interviennent de grands changements dans l’économie de subsistance, apportés par l’invention de l’agriculture et de l’élevage. D’autres changements dans le mode de vie sont également engendrés par la sédentarisation et, en dernier lieu, par l’invention de la céramique en tant que récipient. Ces bouleversements que connaissent les populations néolithiques s’observent aussi bien dans l’état sanitaire que dans les pratiques funéraires. Le travail entrepris a donc consisté à étudier les sépultures et les restes humains provenant de sept sites syriens répartis sur toute la période de la Néolithisation. Les pratiques funéraires se complexifient tout au long de la période, bien que les sépultures primaires et individuelles, avec un dépôt des corps en position fléchie sur le côté, soient longtemps restées la norme. Dès le PPNA, des sépultures sont directement associées à certains bâtiments, avant que des lieux d’inhumations spécifiques apparaissent à la fin du PPNB. L’étude anthropologique s’est concentrée sur les pathologies infectieuses osseuses et dentaires ainsi que sur les indicateurs de stress, selectionnés parmi les marqueurs les plus pertinents. Ainsi la tuberculose, la périostite, les caries, les abcès, la perte de dents ante-mortem, la maladie parodontale, les hypoplasies de l’émail dentaire, la Cribra orbitalia et l’hyperostose poreuse ont été systématiquement recherchés sur les squelettes. Après une étude des changements dans l’état de santé des populations site par site, les individus ont été regroupés par périodes afin de mettre en évidence l’impact de la Néolithisation dans une étude diachronique. L’avènement de l’agriculture semble avoir entrainé une augmentation des pathologies dentaires et des indicateurs de stress à la période du PPNB ancien, tandis qu’un pic de stress, enregistré au PPNB moyen, pourrait être relié à l’introduction de l’élevage, qui a pu entrainer des carences alimentaires et peut-être l’apparition de nouvelles maladies infectieuses. De même, la plupart des indicateurs laissent entrevoir une certaine dégradation de l’état sanitaire lors de la dernière période étudiée, le Néolithique céramique. Ce travail a permis de mettre en évidence que les changements intervenus dans l’état de santé sont loin d’être linéaires ; des fluctuations se produisent entre les périodes selon les différents indicateurs, et c’est au PPNB qu’apparaissent les bouleversements les plus importants. Il semblerait en outre que le degré de gravité des pathologies évolue de façon non linéaire tout au long de la Néolithisation. / The Neolithisation of the Near-East is a key period in the history of humanity, when huge changes occur in subsistence economy, triggered by agriculture and animal husbandry. Other changes in lifestyle are generated by sedentarization and eventually by the invention of pottery as container. The disruptions known by the Neolithic populations are to be found both in their health status and funerary practices. The sepultures and human remains from seven Syrian archaeological sites are studied in this work over the entire period of Neolithisation. The funerary practices become more complex over time, although the primary individual sepultures, with the corpse laid in a flexed position on one side, remain the standard for a long time. From the PPNA, some sepultures are directly associated with particular buildings, until specific burial areas appear towards the end of the PPNB. The bioanthropological study focuses on infectious diseases affecting bones and teeth and on stress indicators, with a selection of the most relevant features. The skeletons were thus systematically examined for signs of tuberculosis, periostitis, dental caries and abcesses, ante-mortem tooth loss, periodontal disease, dental hypoplasia, Cribra orbitalia and porotic hyperostosis. A site by site study of health status changes was carried out first, then the individuals were gathered by period in order to bring to light the impact of the Neolithisation processes in a diachronic study. The advent of agriculture seems to have entailed an increase in dental pathologies and stress indicators in the early PPNB, and a peak of stress registered in the middle PPNB could be related to the introduction of animal husbandry, creating dietary deficiency and new infectious diseases. Most of the markers indicate a deterioration in health status during the last studied period, the Pottery Neolithic. This work establishes that changes in health status were far from linear; the different indicators pointing to fluctuations between the periods, with the most important changes featuring in the PPNB. Furthermore, it suggests that the severity of the pathologies evolved in a non linear way throughout the Neolithisation.

Les pathologies du motoneurone sont caractérisées par une atteinte progressive des motoneurones au niveau de la corne antérieur de la moelle épinière. Au delà de cette susceptibilité anatomique commune, qui est responsable d’une atteinte motrice progressive et diffuse dans ces pathologies, d’autres systèmes neurologiques sont touchés. La dégénérescence du faisceau corticospinal est une caractéristique classique dans la sclérose latérale amyotrophique, qui est la maladie du motoneurone la plus commune chez l’adulte. Cependant, il est de plus en plus reconnu que la SLA est une maladie multisystémique. En particulier, une atteinte précoce du système sensoriel a été démontrée dans la modèle animal de la SLA ainsi que dans l’amyotrophie spinal liée à la mutation du gène SMN1 (survival motor neuron 1 en anglais). Chez les patients, l’imagerie par résonance magnétique (IRM) a émergé comme l’approche la plus performant à l’étage cérébral, permettant d’extraire des indices quantitatifs sur la perte neuronale, la dégénérescence axonale et la démyélinisation dans les pathologies neurodégénératives. Cependant, l’investigation de l’étage médullaire dans ces pathologies est difficile à mener à cause des nombreux défis techniques et méthodologiques que représente l’IRM de la moelle épinière.L’objectif de ce projet de thèse a été d’utiliser l’approche IRM multiparamétrique au niveau de la moelle épinière pour analyser les structures de la matière grise et blanche qui sont atteintes dans deux des pathologies du motoneurone les plus répondues, c’est-à-dire la SLA et la SMA, leurs altérations au cours du temps et leurs corrélations fonctionnelles avec les données cliniques et électrophysiologiques. / Degenerative motor neuron diseases (MND) are characterized by a progressive dysfunction and loss of ventral horn motor neurons of the spinal grey matter. Beyond this common anatomical susceptibility, which is responsible for a progressive and diffuse weakness, other neurological systems are also impaired. The corticospinal tract (CST) degeneration is a classical feature of amyotrophic lateral sclerosis (ALS), which is the most common adult onset motor neuron disease, but a more widespread multisystem involvement is now well recognized. In particular, early sensory system involvement has been demonstrated in animal models of ALS and also of survival motor neuron 1 gene linked spinal muscular atrophy (SMN1-linked SMA). In human patients, magnetic resonance imaging (MRI) has emerged as the most powerful approach at the brain level to extract quantitative data on neuronal loss, axonal degeneration and demyelination in degenerative conditions. Studies at the spinal cord levels are scarce mainly because of technical and methodological difficulties. The objective of the present thesis project was to use a multi-parametric MRI approach at the spinal cord level to analyze grey and white matter structures that are impaired in two most common MND, i.e. ALS and SMN1-linked SMA, their temporal alterations during the disease course and the functional correlates, as assessed by clinical and electrophysiological examinations.