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Análise filogenética de Brachyplatytoma platynemum (Siluriformes: Pimelodidae)

Orrego, Luz Eneida Ochoa [UNESP] 23 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-23Bitstream added on 2014-06-13T19:12:56Z : No. of bitstreams: 1 orrego_leo_me_botib.pdf: 1487561 bytes, checksum: 90a7f6e8635b374d9485785d05ccddfa (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Brachyplatystoma platynemum é uma espécie de bagre amplamente distribuída no eixo Amazonas/Solimões e muitos de seus tributários e, apesar de ser considerado de baixo valor comercial, o declive do estoque de outras espécies de grandes bagres de interesse comercial tem levado ao incremento na captura desta espécie. Por outro lado, o estado atual da estrutura e variabilidade genética das populações desta espécie são desconhecidos. Neste sentido foi realizada uma análise filogeográfica através do sequenciamento de dois genes do DNA mitocondrial (região controle e o gene citocromo b) e de marcadores nucleares microssatélites, com o objetivo de determinar se a espécie esta composta de um único estoque geneticamente homogêneo ou se existe algum tipo de segregação genética associada com o espaço e o tempo, que possa ser relacionada com o comportamento de homing. Foi analisado um total de 216 indivíduos para a região controle, 140 para o gene citocromo b e 169 para seis locus microssatélites, em sete localidades. Os resultados indicam altos níveis de diversidade haplotípica e evidenciam estrutura genética dos indivíduos desta espécie em duas populações: rio Madeira e demais pontos de coleta, no entanto, a estrutura observada não constitui suficiente evidencia para ser associada ao comportamento de homing. Estimativas do tempo de divergência baseadas no mtDNA indicam que as populações divergiram entre 1,0 a 1,5 Ma, tempo durante o qual a influencia das mudanças climáticas podem ter contribuído para a estrutura atual das populações de B. platynemum. Embora o padrão filogeográfico concorde com as predições da hipótese dos refúgios do Pleistoceno, a influência de eventos paleogeográficos e hidrológicos não pode ser descartada. Nossos resultados mostram a interação das mudanças... / Brachyplatystoma platynemum is a catfish species widely distributed in the Amazonas / Solimões basin, despite being considered of little commercial interest, the decline of fish stock of other species has contributed to the increase in the catch of this species. However, the current state of the structure and genetic variability of populations of this species are unknown. In this sense a phylogeographic analysis was performed through sequencing of two mitochondrial molecular markers (control region and cytochrome b gene) and nuclear microsatellites. In order to determine whether the species is composed of a single genetic unit, or if there is any genetic segregation associated with space and time, which may be related to homing behavior. It was analyzed a total of 216 individuals in the control region, 140 for the gene cytochrome b and 169 individuals for six microsatellite loci in seven locations in the Amazon/Solimões basin. The results show high levels of haplotype diversity and evidence genetic structure in two populations (Amazon river channel and the Madeira River). However, the observed structure is not indicated of homing behavior. Divergence time estimates based on mtDNA indicated that the populations diverged between 1.5 to 1.0 Ma, during this time the influence of climate change may have contributed to the current structure of populations of B. platynemum. Although the phylogeographic patterns is consistent with the hypothesis of Pleistocene refuges, the influence of paleogeographic and hydrological events as a result of geological process in the Plio-Pleistocene, are important in the diversification of populations. Our results show the interaction of climate change as a result of hydrological and geological processes in the Plio-Pleistocene in the diversification of fish populations in the Amazon region. Finally... (Complete abstract click electronic access below)
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Análise filogenética de Brachyplatytoma platynemum (Siluriformes: Pimelodidae) /

Orrego, Luz Eneida Ochoa. January 2012 (has links)
Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Fernanda Simões de Almeida / Banca: Daniela Calcagnotto / Resumo: Brachyplatystoma platynemum é uma espécie de bagre amplamente distribuída no eixo Amazonas/Solimões e muitos de seus tributários e, apesar de ser considerado de baixo valor comercial, o declive do estoque de outras espécies de grandes bagres de interesse comercial tem levado ao incremento na captura desta espécie. Por outro lado, o estado atual da estrutura e variabilidade genética das populações desta espécie são desconhecidos. Neste sentido foi realizada uma análise filogeográfica através do sequenciamento de dois genes do DNA mitocondrial (região controle e o gene citocromo b) e de marcadores nucleares microssatélites, com o objetivo de determinar se a espécie esta composta de um único estoque geneticamente homogêneo ou se existe algum tipo de segregação genética associada com o espaço e o tempo, que possa ser relacionada com o comportamento de homing. Foi analisado um total de 216 indivíduos para a região controle, 140 para o gene citocromo b e 169 para seis locus microssatélites, em sete localidades. Os resultados indicam altos níveis de diversidade haplotípica e evidenciam estrutura genética dos indivíduos desta espécie em duas populações: rio Madeira e demais pontos de coleta, no entanto, a estrutura observada não constitui suficiente evidencia para ser associada ao comportamento de homing. Estimativas do tempo de divergência baseadas no mtDNA indicam que as populações divergiram entre 1,0 a 1,5 Ma, tempo durante o qual a influencia das mudanças climáticas podem ter contribuído para a estrutura atual das populações de B. platynemum. Embora o padrão filogeográfico concorde com as predições da hipótese dos refúgios do Pleistoceno, a influência de eventos paleogeográficos e hidrológicos não pode ser descartada. Nossos resultados mostram a interação das mudanças... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Brachyplatystoma platynemum is a catfish species widely distributed in the Amazonas / Solimões basin, despite being considered of little commercial interest, the decline of fish stock of other species has contributed to the increase in the catch of this species. However, the current state of the structure and genetic variability of populations of this species are unknown. In this sense a phylogeographic analysis was performed through sequencing of two mitochondrial molecular markers (control region and cytochrome b gene) and nuclear microsatellites. In order to determine whether the species is composed of a single genetic unit, or if there is any genetic segregation associated with space and time, which may be related to homing behavior. It was analyzed a total of 216 individuals in the control region, 140 for the gene cytochrome b and 169 individuals for six microsatellite loci in seven locations in the Amazon/Solimões basin. The results show high levels of haplotype diversity and evidence genetic structure in two populations (Amazon river channel and the Madeira River). However, the observed structure is not indicated of homing behavior. Divergence time estimates based on mtDNA indicated that the populations diverged between 1.5 to 1.0 Ma, during this time the influence of climate change may have contributed to the current structure of populations of B. platynemum. Although the phylogeographic patterns is consistent with the hypothesis of Pleistocene refuges, the influence of paleogeographic and hydrological events as a result of geological process in the Plio-Pleistocene, are important in the diversification of populations. Our results show the interaction of climate change as a result of hydrological and geological processes in the Plio-Pleistocene in the diversification of fish populations in the Amazon region. Finally... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Dinâmica populacional das raias-violas, Rhinobatos horkelli, Rhinobatidae percellens e Zapteryx brerostris (Chondrichthyes, Rhinobatidae) da plataforma continental de São Paulo /

Caltabellotta, Fabio Prior. January 2014 (has links)
Orientador: Otto Bismarck Fazzano Gadig / Coorientador: Debra Jean Murie / Resumo: As raias-viola (Elasmobranchii: Rhinobatiformes) são geralmente components da captura acessória da pesca multiespecífica de arrasto na região sudeste e sul do Brasil. Considerando a falta de estudos específicos sobre a estrutura etária e populacional dessas espécies há, portanto uma necessidade de pesquisas que possibilitem uma avaliação adequada da condição desses estoques. O presente avaliou a estrutura e a capacidade de crescimento populacional, dessas espécies na plataforma continental do Estado de São Paulo, utilizando para isso o estudo de idade e crescimento e a análise demográfica. Estavam disponíveis para o estudo 149 exemplares de Rhinobatos horkelli, 752 exemplares de Rhinobatos percellens e 952 exemplares de Zapteryx brevirostris. Desse total foi utilizada uma sub-amostra para realização do estudo de idade e crescimento. O melhor modelo que descreveu o crescimento das espécies foi a função do cresciemento de três parâmetros von Bertalanffy, sendo que os parâmetros estimados foram: L∞=121.71, k=0.21 e t0=-1.34 para Rhinobatos horkelli (sexo agrupado); L∞=106.99, k=0.17 e t0=-1.51 para Rhinobatos percellens (fêmea); L∞=90.69, k=0.24 e t0=-1.36 para Rhinobatos percellens (macho); L∞=60.73, k = 0.23 e t0 = -1.44 para Zapteryx brevirostris (fêmea) e L∞ = 57.88, k=0.26 e t0=-1.29 para Zapteryx brevirostris (macho). Através da análise de borda e do incremento marginal, sugere-se a formação de um par de banda (opaca e translúcida) por ano. A formação da banda translúcida deve ocorrrer entre o final do inverno até próximo do final da primavera. Cinco cenários foram avaliados para verificar a taxa intrínseca de crescimento populacional. De acordo com os resultados obtidos sob condições naturais e com a ausência da pesca a populacão de Rhinobatos horkelli pode aumentar cerca de 9% por ano, Rhinobatos percellens cerca de 10% ao ano e Zapteryx brevirostris 3.9% ao ano. Em um outro cenário com ... / Abstract: Guitarfishes (Elamobranchii, Rhinobatiformes) are usually components of the multispecific fishery as by-catch of double-rig, pair and single bottom trawls in the southeast and south of Brazil (Martins & Schwingel, 2003). Considering the lack of life history parameters on the age and population structure studies of these species there is therefore a need for research to enable a proper assessment of the condition of these stocks. We evaluated the structure and the capacity of population growth in the State of São Paulo continental shelf, using the estimated growth and demographic parameters. Were available for this study, 149 samples of Rhinobatos horkelli, 752 samples of Rhinobatos percellens and 952 samples of Zapteryx brevirostris.A sub-sample were used for the age and growth study. The best model that describes the growth of the species was the three parameters von Bertalanffy growth function. Estimated parameters were : L∞=121.71 , k =0.21, and t0 = -1.34 for Rhinobatos horkelli (grouped sex), L∞ = 106.99 , k = 0.17 and t0 = -1.51 for Rhinobatos percellens (female) , L∞ = 90.69 , k = 0:24 and t0 = -1.36 for Rhinobatos percellens (male), L∞ = 60.73 , k = 0.23 and t0 = - 1.44 to Zapteryx brevirostris (female) and L∞ = 57.88 , k = 0.26 and t0 = -1.29 for Zapteryx brevirostris (male). Centrum edge analysis and marginal increment suggests the formation of one band-pair (opaque and translucent) per year. The formation of the translucent band should occour from late winter to the end of the spring. Five scenarios were evaluated for estimated the intrinsic rate of population growth. According to the results obtained under natural mortality conditions and in the absence of fishing, population trends of Rhinobatos horkelli showed a increase about 9% per year, Rhinobatos percellens about 10% per year and Zapteryx brevirostris 3.9% per year. When were considered scenarios with the presence of fishing, all species ... / Doutor
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Redescrição, osteologia craniana e limites de distribuição geográfica de Characidium timbuiense Travassos, 1946 (Characiformes: Crenuchidae), com descrição de três espécies novas

Lopes, Maridiesse Morais 25 February 2015 (has links)
Submitted by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2015-08-19T19:32:29Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Redescrição, osteologia craniana e limites de distribuição geográfica de Characidium timbuiense Travassos, 1946 (Characiformes Crenuchidae), com descrição de três e.pdf: 9134164 bytes, checksum: 61bc79f622c154746242143ed779547a (MD5) / Approved for entry into archive by Morgana Andrade (morgana.andrade@ufes.br) on 2016-01-11T11:30:01Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Redescrição, osteologia craniana e limites de distribuição geográfica de Characidium timbuiense Travassos, 1946 (Characiformes Crenuchidae), com descrição de três e.pdf: 9134164 bytes, checksum: 61bc79f622c154746242143ed779547a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-11T11:30:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Redescrição, osteologia craniana e limites de distribuição geográfica de Characidium timbuiense Travassos, 1946 (Characiformes Crenuchidae), com descrição de três e.pdf: 9134164 bytes, checksum: 61bc79f622c154746242143ed779547a (MD5) Previous issue date: 2015 / CAPES / Apresenta-se a redescrição de Characidium timbuiense Travassos, 1946 incluindo a osteologia craniana. Characidium timbuiense difere das demais congêneres, exceto C. grajahuense, C. pterostictum e C. vidali, pela presença de manchas com formato de poliedros, que ocorrem na porção média e inferior das laterais do corpo. A espécie, que era conhecida apenas para as cabeceiras do rio Timbuí, teve sua distribuição ampliada. Seus limites geográficos foram conhecidos, sendo ao norte a bacia do rio Piraquê-Açu, ao leste o Oceano Atlântico, ao sul a bacia do rio Itapemirim e ao oeste o divisor de águas que separa o vale do rio Doce das drenagens litorâneas circunvizinhas. Characidium timbuiense é comparada com espécies nominais e formas potencialmente novas, geograficamente próximas. Três espécies vizinhas potencialmente novas são descritas. Sendo, Characidium sp. ―caparaó‖, ocorrente na região dos contrafortes da Serra do Caparaó; Characidium sp. ―cricaré‖, ocorrente da bacia do rio Jucuruçu até a bacia do rio Itapemirim e Characidium sp. ―doce‖, aparentemente endêmica da bacia do rio Doce. Finalmente, é disponibilizada uma chave de identificação taxonômica para as espécies de Characidium das drenagens da Mata Atlântica Nordeste, entre as bacias do rio Jucuruçu ao Itabapoana. / A redescription of Characidium timbuiense Travassos 1946 is provided, including the cranial osteology. Characidium timbuiense is distinctive from the species within the genus, with the exception of C. grajahuense, C. pterostictum and C. vidali, by the presence of polyedric shaped spots distributed over the middle and low portions of lateral sides of body. The species, known only for headwaters of rio Timbuí, has its distribution expanded. Its geographical limits were stablished, corresponding to rio Piraquê-Açu basin on North, Atlantic Ocean on east, rio Itapemirim basin on south and watershed divide between the rio Doce and neighbor drainages on west. Characidium timbuiense is compared with nominal species and potentially new forms, geographically close. Three potentially new species are described. Characidium sp. "caparaó", from montane region of Caparaó; Characidium sp. "cricaré", ranging from Rio Jucuruçu to the Rio Itapemirim and Characidium sp. ―doce‖, apparently endemic to the Rio Doce basin. Finally, an identification key is available for recognition of Characidium species on Northeastern Mata Atlântica between the rivers Jucuruçu to Itabapoana.
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Dinâmica populacional das raias-violas, Rhinobatos horkelli, Rhinobatidae percellens e Zapteryx brerostris (Chondrichthyes, Rhinobatidae) da plataforma continental de São Paulo / Age, growth and demographic of the Guitarfishes, Rhinobatos horkelli, Rhinobatos percellens and Zapteryx brerostris in the continental shelf of São Paulo

Caltabellotta, Fabio Prior [UNESP] 27 February 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-27Bitstream added on 2015-03-03T12:06:37Z : No. of bitstreams: 1 000807200.pdf: 6054070 bytes, checksum: 68ae25e2766edfe283abb5444fe0d2dc (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As raias-viola (Elasmobranchii: Rhinobatiformes) são geralmente components da captura acessória da pesca multiespecífica de arrasto na região sudeste e sul do Brasil. Considerando a falta de estudos específicos sobre a estrutura etária e populacional dessas espécies há, portanto uma necessidade de pesquisas que possibilitem uma avaliação adequada da condição desses estoques. O presente avaliou a estrutura e a capacidade de crescimento populacional, dessas espécies na plataforma continental do Estado de São Paulo, utilizando para isso o estudo de idade e crescimento e a análise demográfica. Estavam disponíveis para o estudo 149 exemplares de Rhinobatos horkelli, 752 exemplares de Rhinobatos percellens e 952 exemplares de Zapteryx brevirostris. Desse total foi utilizada uma sub-amostra para realização do estudo de idade e crescimento. O melhor modelo que descreveu o crescimento das espécies foi a função do cresciemento de três parâmetros von Bertalanffy, sendo que os parâmetros estimados foram: L?=121.71, k=0.21 e t0=-1.34 para Rhinobatos horkelli (sexo agrupado); L?=106.99, k=0.17 e t0=-1.51 para Rhinobatos percellens (fêmea); L?=90.69, k=0.24 e t0=-1.36 para Rhinobatos percellens (macho); L?=60.73, k = 0.23 e t0 = -1.44 para Zapteryx brevirostris (fêmea) e L? = 57.88, k=0.26 e t0=-1.29 para Zapteryx brevirostris (macho). Através da análise de borda e do incremento marginal, sugere-se a formação de um par de banda (opaca e translúcida) por ano. A formação da banda translúcida deve ocorrrer entre o final do inverno até próximo do final da primavera. Cinco cenários foram avaliados para verificar a taxa intrínseca de crescimento populacional. De acordo com os resultados obtidos sob condições naturais e com a ausência da pesca a populacão de Rhinobatos horkelli pode aumentar cerca de 9% por ano, Rhinobatos percellens cerca de 10% ao ano e Zapteryx brevirostris 3.9% ao ano. Em um outro cenário com ... / Guitarfishes (Elamobranchii, Rhinobatiformes) are usually components of the multispecific fishery as by-catch of double-rig, pair and single bottom trawls in the southeast and south of Brazil (Martins & Schwingel, 2003). Considering the lack of life history parameters on the age and population structure studies of these species there is therefore a need for research to enable a proper assessment of the condition of these stocks. We evaluated the structure and the capacity of population growth in the State of São Paulo continental shelf, using the estimated growth and demographic parameters. Were available for this study, 149 samples of Rhinobatos horkelli, 752 samples of Rhinobatos percellens and 952 samples of Zapteryx brevirostris.A sub-sample were used for the age and growth study. The best model that describes the growth of the species was the three parameters von Bertalanffy growth function. Estimated parameters were : L?=121.71 , k =0.21, and t0 = -1.34 for Rhinobatos horkelli (grouped sex), L? = 106.99 , k = 0.17 and t0 = -1.51 for Rhinobatos percellens (female) , L? = 90.69 , k = 0:24 and t0 = -1.36 for Rhinobatos percellens (male), L? = 60.73 , k = 0.23 and t0 = - 1.44 to Zapteryx brevirostris (female) and L? = 57.88 , k = 0.26 and t0 = -1.29 for Zapteryx brevirostris (male). Centrum edge analysis and marginal increment suggests the formation of one band-pair (opaque and translucent) per year. The formation of the translucent band should occour from late winter to the end of the spring. Five scenarios were evaluated for estimated the intrinsic rate of population growth. According to the results obtained under natural mortality conditions and in the absence of fishing, population trends of Rhinobatos horkelli showed a increase about 9% per year, Rhinobatos percellens about 10% per year and Zapteryx brevirostris 3.9% per year. When were considered scenarios with the presence of fishing, all species ...
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Composição e distribuição da ictiofauna de tributários do Rio Mogi Guaçu e do Rio Corumbataí, Estado de São Paulo.

Oliveira, Alexandre Kennebley de 08 November 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseAKO.pdf: 3295538 bytes, checksum: b50c85aba2935d04db1e60faccbaaa06 (MD5) Previous issue date: 2006-11-08 / Financiadora de Estudos e Projetos / The composition and distribution of fish fauna from streams and creeks of Mogi Guaçu and Corumbataí river basins, at São Paulo State, were studied and compared. A watershed in the boundary of the geomorphological provinces Cuestas Basálticas and Depressão Periférica isolates the drainage systems of Mogi Guaçu and Tietê rivers, from which Corumbataí belongs. The works were focused in collection and identification of fish species from the streams Cabaceiras, Araras, Quilombo and Pântano (tributaries of the Mogi Guaçu River) and from creeks affluent of Corumbataí River, aiming to the realization of an inventory of the ichthyofauna in the region and to verify the similarity and distribution of species, associating them to geological and geographic events that occurred in these river drainages. The species lists of the two drainage systems were compared and particularities of each one were identified. The distribution of these species restricted to one or other drainage is analysed relative to relief. The drainages isolation is considered important factor acting in the occurrence of fish composition particularities in these small rivers. For inventory of species fish were collected in sites distributed in both mountainsides. A total of 16455 fish specimens belonging to 92 species were collected. Other fish species that occur in the study area were added to this preliminary list by the examination of lots deposited in LISDEBE (Laboratório de Ictiologia Sistemática da UFSCar) and from the studies in the Corumbataí River, summing 104 fish species. Eighty-one of these species were registered in affluent of the Mogi Guaçu River basin and 88 in the Corumbataí River. The 104 species are distributed in six orders: Characiformes (52 species), Siluriformes (40 species), Gymnotiformes (3 species), Cyprinodontiformes (2 species), Perciformes (6 species) and Synbranchiformes (1 species). Twenty-one species were restricted to one or another drainage, being 16 of these restricted to the Corumbataí, and five to the tributaries of Mogi Guaçu River. Some of the species that showed restriction in our study area to the Corumbataí River, or in the Tietê basin, are also encountered in the Paranapanema River, as Bryconamericus sp., Astyanax sp., Schizodon intermedius and Loricaria prolixa, and in the Paranaíba River, as Bryconamericus turiuba. Others are restricted to the Tietê River, as Corumbataia cuestae, Corydoras flaveolus, Planaltina glandipedis, Cyphocharax vanderi, Hypoptopomatinae gen. sp., Harttia sp. and Trichomycterus sp. About the species that showed to be restricted to the tributaries of Mogi Guaçu River basin (in our study area), Bunocephalus sp. only occurs in this basin and Corydoras difluviatilis also occurs in the headwaters of the rivers: Grande, São Francisco and Paranaíba, evidencing a shared biogeographical history among these drainages. The recognition of the upper Paraná River basin as a great area of endemism may be reevaluated not only on the strength of the results obtained, which indicate species of restrict distribution to one or another basin of affluent of the upper Paraná River, but chiefly in function of several work actually being developed, which have been demonstrated the existence of smaller areas in this great basin that presents species of restricted distribution. The lower stretches of Corumbataí River and tributaries of Mogi Guaçu River show several common species, including species of small body size and medium to great body size, widely distributed in the upper Paraná River basin, such as Acestrorhynchus lacustris, Piabina argentea, Salminus hilarii, those of the subfamily Cheirodontinae, the species of genus Leporinus, Schizodon nasutus, Prochilodus lineatus, Pimelodus maculatus, the species of genus Hypostomus, among others. Of the inventoried species, Astyanax sp., Bryconamericus sp., Odontostilbe sp., Bunocephalus sp., Hypoptopomatinae gen. sp., Harttia sp., Trichomycterus sp. e Laetacara sp. are probably new to science. / A composição e a distribuição da fauna de peixes de ribeirões e riachos das bacias dos rios Mogi Guaçu e Corumbataí, no Estado de São Paulo, são estudadas e comparadas. As vertentes das bacias do rio Mogi Guaçu e do rio Tietê, da qual o rio Corumbataí faz parte, são separadas por um divisor de águas na área limítrofe das províncias geomorfológicas Depressão Periférica e Cuestas Basálticas. Os trabalhos se concentraram na coleta e identificação das espécies de peixes dos ribeirões Cabaceiras, Araras, Quilombo e Pântano (tributários do rio Mogi Guaçu) e de riachos afluentes do rio Corumbataí, objetivando realizar o inventário da ictiofauna na região do divisor de águas entre as bacias, e verificar a similaridade e a distribuição das espécies, associando-as aos eventos geográficos e geológicos que desenharam as drenagens. O isolamento das drenagens é considerado um importante fator para a ocorrência de particularidades na composição de espécies desses rios de menor porte. Foram realizadas coletas em pontos distribuídos nas duas vertentes; examinado material ictiológico de coleções e compilados dados de literatura para realização do inventário. As coletas de peixes realizadas totalizaram 16455 exemplares e permitiram o inventário preliminar de 92 espécies. Espécies de peixes ocorrentes na área de estudo foram acrescidas a esta lista preliminar a partir do exame de lotes depositados no LISDEBE e a partir dos estudos do rio Corumbataí consultados, totalizando 104 espécies de peixes. Dessas, 81 espécies foram registradas nos afluentes do rio Mogi Guaçu e 88 no rio Corumbataí. As 104 espécies estão distribuídas em seis ordens: Characiformes (52 espécies), Siluriformes (40 espécies), Gymnotiformes (3 espécies), Cyprinodontiformes (2 espécies), Perciformes (6 espécies) e Synbranchiformes (1 espécie). Foram registradas 21 espécies restritas a uma ou outra vertente, sendo 16 dessas espécies restritas ao rio Corumbataí, e apenas cinco aos afluentes do rio Mogi Guaçu. Algumas das espécies que se mostraram restritas ao Corumbataí, ou à bacia do Tietê, em nossa área de estudo, também ocorrem no rio Paranapanema, como Bryconamericus sp., Astyanax sp., Schizodon intermedius e Loricaria prolixa, e no rio Paranaíba, como Bryconamericus turiuba. Outras são restritas ao rio Tietê, como Corumbataia cuestae, Corydoras flaveolus, Planaltina glandipedis, Cyphocharax vanderi, Hypoptopomatinae gen. sp., Harttia sp. e Trichomycterus sp. Das espécies que se mostraram restritas aos afluentes do rio Mogi Guaçu, Bunocephalus sp. ocorre somente nesta bacia e Corydoras difluviatilis também ocorre em cabeceiras dos rios: Grande, São Francisco e Paranaíba, evidenciando uma história biogeográfica compartilhada entre essas drenagens. A consideração da bacia do alto rio Paraná como uma grande área de endemismo pode ser reavaliada em virtude não só dos resultados obtidos, que indicam espécies de distribuição restrita a uma ou outra bacia de afluentes do alto rio Paraná mas, principalmente, em função dos diversos trabalhos realizados atualmente que têm demonstrado haver áreas menores na bacia que apresentam espécies de distribuição restrita. Os trechos inferiores do rio Corumbataí e dos afluentes do rio Mogi Guaçu apresentam muitas espécies em comum, incluindo espécies de pequeno porte e de médio a grande porte, amplamente distribuídas na bacia do alto rio Paraná, como Acestrorhynchus lacustris, Piabina argentea, Salminus hilarii, as da subfamília Cheirodontinae, as espécies do gênero Leporinus, Schizodon nasutus, Prochilodus lineatus, Pimelodus maculatus, as espécies de Hypostomus, entre outras que foram registradas neste estudo. Das espécies inventariadas, Astyanax sp., Bryconamericus sp., Odontostilbe sp., Bunocephalus sp., Hypoptopomatinae gen. sp., Harttia sp., Trichomycterus sp. e Laetacara sp. são possivelmente novas para a ciência.
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Comportamento e distribuição de bagres subterrâneos e epígeos, subfamília Copionodontinae Pinna, 1992 (Siluriformes, Trichomycteridae)

Rantin, Bianca 06 June 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3698.pdf: 4947783 bytes, checksum: 69de2c1623f8af90b728e842d2888657 (MD5) Previous issue date: 2011-06-06 / Universidade Federal de Minas Gerais / Dentre as 25 espécies de peixes subterrâneos brasileiros, duas coexistem em cavernas areníticas/quartizíticas da Chapada Diamantina, Bahia central: Glaphyropoma spinosum e uma nova espécie de Copionodon (Trichomycteridae: Copionodontinae). Trata-se do primeiro registro de bagres troglóbios neste tipo de feição, além de ser o segundo registro no Brasil de coexistência de peixes subterrâneos, configurando uma ótima oportunidade para estudos ecológico/evolutivos. Aqui são apresentados os estudos da distribuição e de vários aspectos do comportamento destes bagres, visando verificar se há diferenças relacionadas ao isolamento no meio subterrâneo. Os resultados foram comparados com seu parente epígeo Copionodon orthiocarinatus, sintópico (bacia do Paraguaçu). Para o estudo da distribuição geográfica foram realizadas coletas e inspeção visual do hábitat em rios epígeos e subterrâneos. Até o momento, os copionodontíneos subterrâneos foram registrados em sete cavernas/sistemas. Estima-se que novas localidades de ocorrência de bagres copionodontíneos ainda sejam descobertas, aumentando sua amplitude geográfica, que é relativamente restrita (24,75 km2). Estas espécies não estão efetivamente protegidas de impactos ambientais: somente uma rígida fiscalização ou planejamento das atividades desenvolvidas no Parque Nacional da Chapada Diamantina protegeriam de forma eficaz sua fauna subterrânea. O comportamento fototático foi analisado por meio do método de câmaras de escolha. Os copionodontíneos subterrâneos são mais fotonegativos que a espécie epígea; é possível que estes tenham se originado de um ancestral de atividade noturna. G. spinosum é fortemente fotonegativa, provavelmente percebendo estímulos luminosos pela pele. Copionodon sp. n. também apresentou fotofobia acentuada, porém com uma variabilidade intrapopulacional maior. Já a espécie epígea C. orthiocarinatus é levemente fotofóbica, e sua variabilidade intrapopulacional pode ser uma resposta ecológica à recente pressão de predação noturna, hipótese a ser testada. Para analisar o comportamento agonístico, indivíduos provenientes de diferentes aquários foram pareados de acordo com seu status hierárquico exibido anteriormente aos testes. Foram registradas e descritas 26 unidades comportamentais, das quais nove são inéditas na literatura. Ao contrário dos epígeos C. orthiocarinatus, os copionodontíneos subterrâneos apresentam comportamento agonístico mais complexo e agressivo, territorialidade e alta intolerância a coespecíficos. É possível que o comportamento agonístico destas espécies seja resultado da manutenção de um comportamento presente em seus ancestrais ou grupos-irmãos basais, ou mesmo de novas aquisições evolutivas. Já a alta tolerância a coespecíficos exibida por C. orthiocarinatus pode ser explicada pela abundância de alimento em seu ambiente ou mesmo a ausência de restrição espacial, freqüente em populações subterrâneas. Para estudar o comportamento espontâneo utilizou-se os métodos ad libitum (ambiente natural) e animal focal (em laboratório). Em laboratório cronometrou-se os seguintes componentes comportamentais: entocado, estacionário fora da toca, natação no fundo, coluna d água, superfície e na parede do aquário. G. spinosum é fortemente criptobiótica, esta resposta pode ser reflexo do seu territorialismo acentuado. Copionodon sp. n. e a espécie epígea C. orthiocarinatus são bentônicas, com preferência por nadar no substrato (fundo + parede). As diferenças na ocupação do espaço exibidas por ambas as espécies troglóbias, aliadas ao fato de quase não exibirem comportamento agonístico entre elas, indica que estas espécies não ocupam o mesmo nicho. O comportamento alimentar foi estudado individualmente, cronometrando-se os tempos de alerta, procura, captura e ingestão do alimento que lhes era oferecido. Os epígeos se mostraram mais eficientes na procura do alimento em relação às espécies troglóbias, cuja baixa eficiência alimentar pode estar sendo influenciada pela abundância de alimento presente nas cavernas de Igatu, diferentemente do observado para cavernas em geral. Por fim, a reação a 2 estímulos mecânicos foi testada por meio de estímulos bruscos na superfície d água, aplicados com uma haste vibratória. Todas as espécies apresentaram reações fóbicas acentuadas, como surtos natatórios ou tentativas de pular do aquário, que podem ser relacionadas com as fortes enchentes/enxurradas presentes tanto no ambiente cavernícola quanto superficial. Concluindo, G. spinosum é provavelmente uma espécie troglóbia antiga, devido à baixa variabilidade intrapopulacional morfológica e comportamental. Já Copionodon sp. n. apresentou maior variabilidade nestes quesitos. Duas hipóteses são propostas aqui no entendimento desta variabilidade: 1. Trata-se de uma população troglóbia recente, ou 2. Ainda há fluxo gênico (hibridização) entre a população que vive na caverna com a epígea, de modo que ainda não há isolamento genético entre estas populações. Por se tratar de um grupo basal, os estudos comportamentais e de distribuição dos copionodontíneos fornecem informações valiosas para uma melhor compreensão da história evolutiva dos copionodontíneos e suas relações de parentesco com outros clados de Trichomycteridae. Os dados também contribuirão para enriquecer descrição da nova espécie de Copionodon e para a efetiva proteção destas populações na região da Chapada Diamantina, a qual ainda sofre ameaças de garimpo clandestino e turismo descontrolado.
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Análise da composição e distribuição geográfica dos atuns da costa brasileira (Perciformes: Scombridae: Thunnini)

Ramirez, Zoila Raquel Siccha [UNESP] 25 February 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-06-07T17:12:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-25. Added 1 bitstream(s) on 2016-06-07T17:16:41Z : No. of bitstreams: 1 000859133_20170225.pdf: 410628 bytes, checksum: f81a73f11d88719a3c6335c8a9339361 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-03-03T11:01:35Z: 000859133_20170225.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-03-03T11:02:43Z : No. of bitstreams: 1 000859133.pdf: 2180235 bytes, checksum: f0bce47e04dacf3bf05a4c88d59fb720 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os atuns, bonitos e cavalas são peixes marinhos pelágicos distribuidos em todos os oceanos tropicais e subtropicais do mundo. São frequentemente capturados e comercializados ao longo de toda sua área de distribuição sendo as oito espécies do gênero Thunnus as de maior valor comercial. A correta identificação das espécies, assim como a delimitação de suas populações são de muita importância na pesca, permitindo a tomada de melhores decisões sobre políticas pesqueiras e conservação. Os resultados são discutidos em dois capítulos, o primeiro baseado na identificação das espécies dentro da família Scombridae e o segundo testando análises populacionais em duas espécies de atuns Thunnus obesus e Katsuwonus pelamis, frequentemente capturados no Brasil e Peru. Para isto testamos a eficiência da metodologia do DNA barcode e a amplificação da região controle na identificação das espécies pertencentes à familia Scombride, com ênfase no gênero Thunnus, e a identificação e separação das populações dos dois atuns. Vinte espécies foram analisadas com o COI (648 espécimes) e dezoito com o D-loop (313 espécimes). Para a primeira parte do estudo, o gene COI discriminou 66% das espécies analisadas, mas as pertencentes ao gênero Thunnus não puderam ser separadas, diferente dos resultados encontrados no D-loop onde todas as espécies foram adequadamente separadas, sendo uma ferramenta eficiente para a identificação das espécies da família Scombridae, incluindo o gênero Thunnus. Nas análises populacionais (segundo capítulo) com o uso do D-loop foi possível identificar duas populações de T. obesus (Pacífico e Atlântico), com um valor alto de Fst, fortemente estruturado e estatisticamente significativo e também de duas populações de Katsuwomus pelamis (clado I e clado II) mas nesse segundo caso não foi verificada um isolamento geogrático das populações / Tunas, bonitos and mackerels are marine pelagic fishes distributed in the tropical and subtropical oceans of the world. They are highly captured and traded throughout their distribution area being the eight species of the genus Thunnus those with higher commercial value. Correct species identification in fisheries is needed to take better conservation measures and efficient fisheries management. The results are discussed in two chapters, the first based on the identification of the species within the family Scombridae and the second testing population analysis in two species of tuna Katsuwonus pelamis and Thunnus obesus, offen captured in Brazil and Peru. For this, test the efficiency of the DNA barcode methology and amplification of the control region of species of the Scombridae family, with emphasis in the genus Thunnus, and the identification and separation of the populations of two tuna. Twenty species were analyzed with the COI (648 specimens) and eighteen with the D-loop (313 specimens). For the first part of the study, the COI gene discriminated 66% of the analyzed species, but those belonging to the genus Thunnus could not be separated, unlike the results found in the D-loop in which all species were properly separated and powerful tool for species identification of the Scombridae family, including genus Thunnus. In the population analysis (second chapter) using the D-loop was possible to identify two populations of T. obesus (Pacific and Atlantic), with a high value of Fst, highly structured and statistically significant and also of two populations of K.pelamis (clade I and clade II), but in this second case has not been verified a geographical isolation of populations / FAPESP: 2011/00881-1
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Análise da composição e distribuição geográfica dos atuns da costa brasileira (Perciformes: Scombridae: Thunnini) /

Ramirez, Zoila Raquel Siccha. January 2015 (has links)
Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Anderson Luis Alves / Banca: Luis Henrique Garcia Pereira / Banca: Cristiane Kioko Shimabukuru Diaz / Banca: Alexandre Hisdorlf / Resumo: Os atuns, bonitos e cavalas são peixes marinhos pelágicos distribuidos em todos os oceanos tropicais e subtropicais do mundo. São frequentemente capturados e comercializados ao longo de toda sua área de distribuição sendo as oito espécies do gênero Thunnus as de maior valor comercial. A correta identificação das espécies, assim como a delimitação de suas populações são de muita importância na pesca, permitindo a tomada de melhores decisões sobre políticas pesqueiras e conservação. Os resultados são discutidos em dois capítulos, o primeiro baseado na identificação das espécies dentro da família Scombridae e o segundo testando análises populacionais em duas espécies de atuns Thunnus obesus e Katsuwonus pelamis, frequentemente capturados no Brasil e Peru. Para isto testamos a eficiência da metodologia do DNA barcode e a amplificação da região controle na identificação das espécies pertencentes à familia Scombride, com ênfase no gênero Thunnus, e a identificação e separação das populações dos dois atuns. Vinte espécies foram analisadas com o COI (648 espécimes) e dezoito com o D-loop (313 espécimes). Para a primeira parte do estudo, o gene COI discriminou 66% das espécies analisadas, mas as pertencentes ao gênero Thunnus não puderam ser separadas, diferente dos resultados encontrados no D-loop onde todas as espécies foram adequadamente separadas, sendo uma ferramenta eficiente para a identificação das espécies da família Scombridae, incluindo o gênero Thunnus. Nas análises populacionais (segundo capítulo) com o uso do D-loop foi possível identificar duas populações de T. obesus (Pacífico e Atlântico), com um valor alto de Fst, fortemente estruturado e estatisticamente significativo e também de duas populações de Katsuwomus pelamis (clado I e clado II) mas nesse segundo caso não foi verificada um isolamento geogrático das populações / Abstract: Tunas, bonitos and mackerels are marine pelagic fishes distributed in the tropical and subtropical oceans of the world. They are highly captured and traded throughout their distribution area being the eight species of the genus Thunnus those with higher commercial value. Correct species identification in fisheries is needed to take better conservation measures and efficient fisheries management. The results are discussed in two chapters, the first based on the identification of the species within the family Scombridae and the second testing population analysis in two species of tuna Katsuwonus pelamis and Thunnus obesus, offen captured in Brazil and Peru. For this, test the efficiency of the DNA barcode methology and amplification of the control region of species of the Scombridae family, with emphasis in the genus Thunnus, and the identification and separation of the populations of two tuna. Twenty species were analyzed with the COI (648 specimens) and eighteen with the D-loop (313 specimens). For the first part of the study, the COI gene discriminated 66% of the analyzed species, but those belonging to the genus Thunnus could not be separated, unlike the results found in the D-loop in which all species were properly separated and powerful tool for species identification of the Scombridae family, including genus Thunnus. In the population analysis (second chapter) using the D-loop was possible to identify two populations of T. obesus (Pacific and Atlantic), with a high value of Fst, highly structured and statistically significant and also of two populations of K.pelamis (clade I and clade II), but in this second case has not been verified a geographical isolation of populations / Doutor

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