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Physiological studies on the isolated components of the lichen Peltigera aphthosaBednar, Thomas William, January 1963 (has links)
Thesis (Ph. D.)--University of Wisconsin--Madison, 1963. / Typescript. Vita. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references (leaves 146-156).
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An investigation of the sensitivity of cyanobacterial lichens to heavy metals and the induction of metal toleranceMahmood, Shafaat January 1997 (has links)
No description available.
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Identificación de cianolíquenes del género Peltigera en dos contextos ambientales de la Reserva Nacional Coyhaique y determinación de las fracciones de fósforo en sus sustratos.Veas Mattheos, Karla Nayarett January 2019 (has links)
Seminario de Título para optar al Título de Ingeniería en Biotecnología Molecular. / Tradicionalmente, los líquenes se definen como una asociación simbiótica mutualista
entre un hongo y uno o dos organismos fotosintéticos (alga y/o cianobacteria).
Investigaciones actuales han descrito una comunidad bacteriana asociada al talo liquénico
conformando una biopelícula altamente estructurada, la cual se ha sugerido compondría
un nuevo integrante simbiótico. Esta comunidad bacteriana estaría cumpliendo un rol
esencial en el éxito ecológico del individuo al cumplir funciones relacionadas a la
resistencia de estrés, fijación de nitrógeno, suministro de nutrientes, entre otros. Dentro de
estas funciones, el reciclaje de nutrientes y su rol en el ecosistema circundante ha
llamado la atención de diversas áreas de estudio, al participar como un proceso clave en
el ciclo biogeoquímico de distintos elementos.
El fósforo (P) es un nutriente esencial y limitante para el crecimiento y desarrollo de los
organismos. En el suelo puede encontrarse asociado a diferentes moléculas, a partir de lo
cual ha sido clasificado en diferentes fracciones de acuerdo a la naturaleza de las
moléculas, orgánica o inorgánica, o según su disponibilidad para el consumo por los
organismos, soluble, lábil o no lábil. Se ha visto que el P cumpliría un rol relevante como
macronutriente en el crecimiento de los líquenes, razón por la que diversos estudios se
han centrado en la descripción de la microbiota asociada a éste, y su rol en los procesos
de solubilización de P.
En el presente trabajo se estudiaron las distintas fracciones de fósforo biodisponible
(Psoluble, lábil y moderadamente lábil) en los sustratos asociados a líquenes del género
Peltigera en dos diferentes contextos ambientales, un bosque de Nothofagus (Bosque) y
una pradera altoandina sobre el límite arbóreo (Pradera) en la Reserva Nacional
Coyhaique, con el fin de comprender de mejor manera la dinámica del P y sus distintas
fracciones en los sustratos asociados a líquenes.
Los resultados revelaron un total de 5 OTUs de micobionte y 6 de cianobionte,
entre los cuales se seleccionaron para el fraccionamiento de P las parejas más
abundantes para cada sitio, Peltigera frigida en Bosque y Peltigera sp. en Pradera. Se
observó en sustratos de P. frigida creciendo en Bosque una mayor cantidad de P que en
sustratos de Peltigera sp. creciendo en Pradera. La fracción de P soluble correspondió a
la fracción más pequeña, mientras que el P moderadamente lábil resultó la más
abundante, completando sobre el 80% del P de la suma de fracciones en ambos sitios.
Por otro lado, se detectó una mayor cantidad de P inorgánico en Bosque que en Pradera,
mientras que las formas orgánicas de P no fueron significativamente diferentes entre los
sustratos de los dos sitios y predominó en las fracciones de P lábil y moderadamente lábil
en Pradera. Esto sugiere una acumulación de materia orgánica similar en los sustratos de
líquenes en los diferentes sitios, a pesar de las diferentes cantidades de P disponible, y un
enriquecimiento de P orgánico en sitios pobres en P. Estos resultados sugieren que los
líquenes estarían actuando como filtros ambientales al reclutar microorganismos
involucrados la solubilización de P en sitios en los que este nutriente está poco
biodisponible, y por tanto, cumplirían un importante rol en la dinámica del P en el suelo,
principalmente en sitios donde predomina la biota criptogámica, como son los sitios de
altura.
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Relación de la producción de metabolitos y la actividad fenoloxidasa de líquenes del género Peltigera con sus comunidades bacterianas asociadasLeiva Cáceres, Diego January 2015 (has links)
Tesis Magíster en Bioquímica en el área de especialización de Bioquímica Ambiental y Memoria para optar al Título de Bioquímico / Los líquenes son asociaciones simbióticas entre 2 o 3 organismos, entre los cuales hay siempre un hongo o micobionte y uno o dos fotobiontes. El fotobionte puede corresponder a un alga fotosintética o a una cianobacteria, y ambos están presentes en el caso de los líquenes tripartitos, donde el alga es el organismo fotosintético principal. En los cianolíquenes, la cianobacteria aporta los fotosintatos y además, con la fijación de nitrógeno atmosférico.
Recientemente se ha descrito que los ensambles microbianos que se desarrollan formando biopelículas sobre el talo del liquen pueden ser considerados un componente adicional en estas simbiosis. Sin embargo, aún no se han definido el o los factores que determinan la estructura de dicha microbiota asociada.
En general, los líquenes se caracterizan por poseer un metabolismo secundario muy activo, cuyos productos son principalmente compuestos fenólicos, obtenidos por diversas vías, como las del polimalonato, siquimato y mevalonato. Dada esta alta producción de metabolitos, se propone estudiar si la comunidad bacteriana asociada íntimamente al talo del cianoliquen Peltigera se relaciona con la diversidad de estos compuestos, aunque para este género de líquenes no se ha descrito una elevada producción de los mismos. Además, diversas actividades enzimáticas se han cuantificado en líquenes, y en el caso particular de Peltigera, las fenoloxidasas han sido las más estudiadas. Esta actividad podría estar relacionada con la estructuración de la comunidad bacteriana asociada al talo liquénico, ya que la generación de compuestos oxidantes se sugiere está asociada a defensa contra patógenos y propiedades antibióticas.
Las 50 muestras de líquenes del género Peltigera y el sustrato asociado, provienen de dos bosques de la Reserva Nacional Coyhaique. Con el fin de identificar y agrupar filogenéticamente a los simbiontes muestreados, se obtuvieron las secuencias de los genes rRNA 18S y 28S de hongos y del gen del rRNA 16S de cianobacterias, a partir de los cuales se encontraron 6 haplotipos de micobionte y 5 de cianobionte, con los que se definieron las OTUs y 11 muestras compuestas.
Por otra parte, los metabolitos de las muestras compuestas se analizaron usando técnicas de cromatografía en placa fina en dos dimensiones (TLC-2D), la actividad fenoloxidasa asociada a cada muestra liquénica compuesta se determinó espectrofotométricamente mediante el monitoreo de la oxidación del ácido 2'2-azino-bis-[3-etilbenzotiazol-6-sulfónico] (ABTS) a 436 nm. Finalmente, la estructura genética de la comunidad bacteriana relacionada a los líquenes y a los sustratos, se determinó mediante el uso de la técnica del polimorfismo en el largo de los fragmentos terminales de restricción (TRFLP), mientras que la estructura metabólica se determinó mediante los perfiles fisiológicos a nivel comunitario (CLPP) a través del uso de placas EcoPlate (BioLog®). Los perfiles genéticos y metabólicos fueron diferentes en su estructura dependiendo de la identidad de los simbiontes y el bosque del que provenían. Se encontraron correlaciones de la diversidad de metabolitos de los líquenes con la estructura genética de las comunidades asociadas a éstos y las presentes en el sustrato, y de la actividad fenoloxidasa de las muestras de líquenes con la estructura metabólica de la comunidad bacteriana obtenida desde el talo.
Los resultados de esta tesis sugieren que tanto la producción de metabolitos como la actividad fenoloxidasa, ambos factores atribuibles al liquen, cumplirían un papel en determinar la diversidad genética y metabólica de la comunidad bacteriana asociada al talo de líquenes del género Peltigera y al sustrato donde ellos crecen / Lichens are symbiotic associations between 2 or 3 organisms, including a fungus and one or two photobionts. A photosynthetic algae or a cyanobacterium can be the photobiont in these associations, and both are present in tripartite lichens, where the algae is the main photosynthetic organism. In cyanolichens, the cyanobacterium provides with photosynthates and with atmospheric nitrogen fixation.
Recently, it has been described that microbial assembles, that develop forming biofilms upon the lichen thallus, can be considered an additional component in these symbioses. However, the factors determining the structure of this associated microbiota have not yet been defined.
In general, lichens are characterized by their very active secondary metabolism, whose products are mainly phenolic compounds obtained by different metabolic pathways, such as the polymalonate, shikimic acid and mevalonate ones. Given this high production of metabolites, it is propose to study if the bacterial community intimately associated to Peltigera cyanolichens thallus is related to the diversity of these compounds, even though this particular lichen genera has not been associated with a high production of these compounds. Moreover, different enzymatic activities have been quantified in lichens, and in the Peltigera particular case, phenoloxidases have been the more studied enzymes. This activity could be related with the structuration of lichen thallus associated bacterial community, because the production of oxidant compounds has been related to defense against pathogens and to antibiotic activities.
The 50 lichen samples of the genus Peltigera and their corresponding associated substrates derived from two forests of the Coyhaique National Reserve. With the aim of identifying and phylogenetically grouping the sampled symbionts, sequences of fungal 18S and 28S rRNA and cyanobacterial 16S rRNA genes were obtained, from which 6 mycobiont and 5 cyanobiont haplotypes were found, defining the corresponding OTUs and 11 composite samples.
On the other hand, metabolites of composite samples were analyzed using bi-dimensional thin layer chromatography (TLC-2D), whilst phenoloxidase activity of each lichen composite sample was spectrophotometrically determined by monitoring the oxidation of 2,2'-azino-bis-[3-ethylbenzothiazoline-6-sulphonic acid] (ABTS) at 436 nm. Finally, genetic structures of the bacterial communities, related to lichens and substrates, were determined by terminal restriction fragment length polymorphism (TRFLP), while metabolic structures were determined by community-level physiological profiling, using EcoPlates (Biolog®). Genetic and metabolic profiles were different in structure, depending on the symbiont identity and the forest from where they derived. Correlations were founded between diversity of lichen metabolites and genetic structures of bacterial communities associated to both lichen and substrate, and between lichen
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Étude de l'homéostasie des micronutriments de la fixation d'azote au sein de la symbiose lichénique en forêt boréaleDarnajoux, Romain Nicolas Xavier January 2015 (has links)
L’azote est un des éléments les plus importants dans la nature. Sa disponibilité limite la productivité d’un grand nombre d’écosystèmes naturels, et influencera sans doute de manière importante leurs réponses aux changements climatiques globaux. La première source d’azote dans les écosystèmes non anthropisés est la fixation biologique de l’azote. Ce processus repose sur un groupe de métallo-enzymes spécifiques, les nitrogénases, dont le cofacteur métallique contient soit du fer et un atome de molybdène, soit du fer et un atome de vanadium, soit uniquement du fer. A ce jour, seule la nitrogénase au molybdène est prise en considération dans la dynamique de l’azote dans les écosystèmes, et ce malgré de nombreux indices indiquant que la nitrogénase au vanadium pourrait avoir un rôle important. Est-ce que la nitrogénase au vanadium est utilisée dans les écosystèmes naturels et quelles sont les conditions favorisant son utilisation ?
Nous avons cherché à répondre à ces questions à l’aide d’un modèle symbiotique tripartite, un lichen, association entre une algue, un champignon et une cyanobactérie fixatrice d’azote. Nous avons tout d’abord développé une méthode d’étude des contenus en métaux des différents symbiontes, puis nous avons étudié la répartition et la régulation du vanadium au sein des différents symbiontes dans différentes conditions environnementales. Nous avons pu démontrer que dans ce modèle, le vanadium possède toutes les caractéristiques d’un micronutriment essentiel à la fixation d’azote. Nous avons également démontré que la disponibilité du molybdène ainsi que les températures, telles que rencontrées en milieux boréaux, seraient deux facteurs importants contrôlant l’utilisation de la V-Nase.
Les résultats présentés dans cette étude apportent une meilleure compréhension de la gestion des métaux cofacteurs de la nitrogénase au sein de la symbiose lichénique. Mais ils permettent surtout de remettre en question le paradigme de l’hégémonie du molybdène sur la fixation biologique de l’azote. Ainsi, la fixation d’azote en milieu continental repose sur un ensemble hétérogène d’enzymes, ce qui autorise aux organismes fixateurs d’azote une grande flexibilité vis-à-vis des paramètres environnementaux comme les basses températures. Cela leurs permet également une meilleure adaptation au stress métallique résultant de carences en micronutriments, notamment celle en molybdène. Ces résultats invitent également à réévaluer les modèles biogéochimiques liant les cycles des micronutriments aux cycles des macronutriments, particulièrement celui de l’azote.
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Secondary Metabolites from a Northern Manitoban FungusAnyanwu, Chukwudi 12 February 2014 (has links)
Over the years, secondary metabolites have proven to be significant in the discovery of novel antibiotics and/or lead compounds. Various secondary metabolites have been reported to be produced by fungus of the genus, Alternaria. Here we report the isolation of secondary metabolites by the bioassay-guided fractionation of the ethyl acetate extract of fermentation cultures of the fungus, Alternaria tenuissima. This fungal strain was isolated from the soil underlying the lichen, Peltigera didactyla; and the lichen was collected from Wapusk National Park, a location in Northern Manitoba. The compounds isolated from the fungus include deoxyphomalone, dimethyl 4-methyl-2,6-pyridinedicarboxylate, stemphyperylenol and N-Methyl pyrrolidinone. Their structures were determined by comprehensive analysis of their spectroscopic data including FT-IR, mass spectrometry, 1D and 2D NMR; and their bioactivities were tested against E. coli cells. Some of the compounds demonstrated some bioactivity. The taxonomic identity of the fungus was confirmed by ITS sequencing of its ribosomal DNA.
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Secondary Metabolites from a Northern Manitoban FungusAnyanwu, Chukwudi 12 February 2014 (has links)
Over the years, secondary metabolites have proven to be significant in the discovery of novel antibiotics and/or lead compounds. Various secondary metabolites have been reported to be produced by fungus of the genus, Alternaria. Here we report the isolation of secondary metabolites by the bioassay-guided fractionation of the ethyl acetate extract of fermentation cultures of the fungus, Alternaria tenuissima. This fungal strain was isolated from the soil underlying the lichen, Peltigera didactyla; and the lichen was collected from Wapusk National Park, a location in Northern Manitoba. The compounds isolated from the fungus include deoxyphomalone, dimethyl 4-methyl-2,6-pyridinedicarboxylate, stemphyperylenol and N-Methyl pyrrolidinone. Their structures were determined by comprehensive analysis of their spectroscopic data including FT-IR, mass spectrometry, 1D and 2D NMR; and their bioactivities were tested against E. coli cells. Some of the compounds demonstrated some bioactivity. The taxonomic identity of the fungus was confirmed by ITS sequencing of its ribosomal DNA.
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