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Molecular and morphological characterization of Contracaecum pelagicum (Nematoda) parasitizing Spheniscus magellanicus (Chordata) from Brazilian waters

Borges, Juliana Novo, Santos, Helena Lúcia Carneiro, Brandão, Martha Lima, Santos, Everton Gustavo Nunes dos, Miranda, Daniele Ferreira de, Balthazar, Daniel de Almeida, Luque, José Luis, Santos, Cláudia Portes January 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T12:38:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1914 bytes, checksum: 7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81f (MD5) juliana_borgesetal_IOC_2014.pdf: 1206828 bytes, checksum: d5b077e672992a2e6600a607f62ab2ee (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Avaliação e Promoção da Saúde Ambiental. Curso de Pós-Graduação em Biodiversidade e Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Avaliação e Promoção da Saúde Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Curso de Pós-Graduação em Parasitologia Veterinária. Seropédica, RJ, Brasil. / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Avaliação e Promoção da Saúde Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Curso de Pós-Graduação em Parasitologia Veterinária. Seropédica, RJ, Brasil. / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Avaliação e Promoção da Saúde Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Fundação Jardim Zoológico da Cidade do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Departamento de Parasitologia Animal. Seropédica, RJ, Brasil. / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Avaliação e Promoção da Saúde Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Foram determinadas três novas sequências da região do Citocromo c-oxidase da subunidade II do DNA mitocondrial (cox-2 mtDNA) de Contracaecum pelagicum, parasito de Spheniscus magellanicus, pinguim Magalhães, de águas brasileiras. As sequências apresentaram 99 e 98% de similaridade com sequências de C. pelagicum da Argentina depositadas no GenBank da mesma região genética com forte suporte estatístico inferido pela arvore filogenética. Estudos morfológicos e ultraestruturais realizados confirmaram a identidade genética. / Three new sequences of Mitochondrial cytochrome c-oxidase subunit 2 (mtDNA cox-2) from C. pelagicum parasite of Spheniscus magellanicus, the Magelanicus penguin, were determined from Brazilian waters. The sequences presented 99 and 98% of similarity with C. pelagicum sequences from Argentina, deposited on GenBank for the same genetic region and with a strong statistical support inferred from the phylogenetic tree. The morphological and ultrastructural studies that were carried out confirmed the genetic analysis.
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Ecologia alimentar de spheniscidae na Ilha Elefante, Antártica

Valls, Fernanda Caminha Leal 27 February 2013 (has links)
Submitted by William Justo Figueiro (williamjf) on 2015-08-11T21:04:47Z No. of bitstreams: 1 13e.pdf: 3156102 bytes, checksum: da00a19d9782f6ac017289a5d272ac1f (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-11T21:04:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 13e.pdf: 3156102 bytes, checksum: da00a19d9782f6ac017289a5d272ac1f (MD5) Previous issue date: 2013 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPQ – Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / INCT-APA - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia Antártico de Pesquisas Ambientais / PROANTAR - Programa Antártico Brasileiro / SECIRM - Secretaria Interministerial para os Recursos do Mar / MMA - Ministério do meio Ambiente / INCT-APA - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia Antártico de Pesquisas Ambientais / UNISINOS - Universidade do Vale do Rio dos Sinos / O nicho realizado de duas espécies precisa ser diferente, para que estas espécies possam coexistir de maneira estável. Pygoscelis papua e P. antarcticus reproduzem simpatricamente na Ilha Elefante, Antártica. Foram coletadas amostras de conteúdo estomacal e realizado biometria das duas espécies para analisar a dieta e a sobreposição de nicho. Um total de 56 amostras de P. papua e 71 amostras de P. antarcticus foram coletadas durante dois períodos de reprodução austral, 2010/11 e 2011/12, na região de Stinker Point. A proporção de itens variou entre as espécies de pinguins e entre os táxons representados. E. superba foi a presa de maior abundância comparado com outros itens alimentares, com aproximadamente 69% FO para P. papua e 98% FO para P. antarcticus. Foram encontradas nove espécies de peixe, seis espécies de crustáceos e uma espécie de cefalópode, identificados a nível específico. Existe uma diferença significativa entre os fatores, espécie de pinguim, tamanho da carapaça e sexo de krill antártico, quando comparados entre si. Além disso, a biometria indica que o comprimento do bico e peso de P. papua são maiores que em P. antarcticus, da mesma forma que o bico é mais alto e mais largo em P. antarcticus. Tais diferenças morfológicas podem explicar as diferenças no forrageio. Foi observada uma sobreposição de nicho trófico entre as espécies, pela utilização dos mesmos recursos, uma vez que estas espécies ocorrem simpatricamente na mesma região. Este estudo demonstra que a variação específica do nicho trófico ocupado pelas espécies pode ser definida pelo comportamento de forrageio e pela seleção dos recursos alimentares de cada espécie. É importante a recomendação destas espécies como indicadores de qualidade ambiental, adicionando questões como a variabilidade local, pois o nicho trófico pode alterar ao longo do tempo. / The two species realized niche needs to be different, since these species can coexist stably. Pygoscelis papua and P. antarcticus breed simpatricaly on Elephant Island, Antarctica. Stomach content samples were collected and biometrics of both species was measured in order to analyze the diet and the niche overlap. A total of 56 P. papua samples and 71 P. antarcticuss samples were collected, during the two austral breeding seasons, 2010/11 and 2011/12, on the Stinker Point region. The proportion of items ranged from the penguin species and among the taxa represented. E. superba was the most abundant prey compared with other food items, with approximately 69% FO for P. papua, and 98% FO for P. antarcticus. We found nine species of fish, six species of crustaceans and one species of cephalopod, identified by the specific level. There is a significant difference between the factors, species of penguin, carapace length and sex of antarctic krill, when compared with each other. In addition, the biometrics indicates that length of P. papua’s beak and weight are larger than P. antarcticus, but P. antarcticus has the highest and widest beak measures. Such morphological differences may explain differences in foraging. We observed a niche overlap of species, by the use of the same food resources, once these species occurs simpatricaly in the same region. This study also demonstrated that the specific variation of trophic niches occupied by the species may be defined by the foraging behavior and by the selection of the food resources. It is important the recommendation of these species as indicators of environmental quality, adding issues such as local variability since the trophic niche may change over the time.
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Estudo do bumblefoot (pododermatite) em pinguinsde- magalhães (Spheniscus magellanicus) em centro de recuperação / Bumblefoot s (pododermatitis) study in Magellanic Penguins in rehabilitation center

Osório, Luiza da Gama 24 February 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T14:37:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_luiza_osorio.pdf: 19002428 bytes, checksum: 248f2bc7bb85ec8caca8336bb8f6ed0d (MD5) Previous issue date: 2010-02-24 / Penguins are seabirds that spends about 75% of their life on the sea, and when they are found weak, this birds are sent to rehabilitation centers. Although, their extensive adaptations to sealife can become limiting issues to their life in captive, occurring, often, bumblefoot, or pododermatitis, cases: a foot disease that can evolve to septicemia and death. The Centro de Recuperação de Animais Marinhos (CRAM Marine Animals Recovery Center) is the place that, in Brazil, recieve more penguins to rahabilitation. Given the CRAM s importance in the national matter in penguin rehabilitation, the research objective was to evaluate the bumlefoot epidemiology in the birds kept captive in CRAM, trying to minimize the injuries that accompany the syndrome during rehabilitation period. Were observed 129 penguins in CRAM, where the syndrome incidence were 75%, presenting, the abrasive surface as main predisposing factor for development. The research presented the bumblefoot usually as a bilateral disease and with a progressive course. Every foot pads where qualified according the injury level to clinic evaluation, showing, by creating a method of biometric measurement of edema between each lesion score. The fungal microorganisms were related to the penguin s foot pad s transitory microbiota, being more isolated the C. albicans e Rhodotorula spp.The bacteria were related as transitory and permanent s microbiotas compounds, as well the pododermatitis epidemiology, being the more isolated genres the Staphylocossus and Corybacterium. The antibiotic that inhibited most the bacterial development against all strain tested was cefalosporina, followed by enrofloxacina, estreptomicina and penicillin. Was possible through this study highlight the syndrome s importance about penguin rehabilitation, and understand its epidemiology, enabling the implementation of precise forms of management, prophylaxis and treatment. / Pinguins são aves que dispensam cerca de 75% das vidas no mar, e quando encontrados debilitados são encaminhados a centros de. Porém, suas amplas adaptações à vida marinha atuam como fatores limitantes em cativeiro, sendo freqüentes os casos de bumblefoot, ou pododermatite, afecção podal que pode evoluir para septicemia e óbito. O Centro de Recuperação de Animais Marinhos (CRAM) é o local no Brasil que mais recebe mais pinguins para reabilitação. Em vista da importância do CRAM no cenário Nacional no que tange a reabilitação de pinguins, o estudo objetivou avaliar a epidemiologia do bumlefoot nessas aves mantidas em cativeiro no Centro, a fim de minimizar os prejuízos que acompanham a síndrome durante o período de recuperação. Foram acompanhados 129 pinguins no CRAM, onde a incidência da síndrome foi de 75%, apresentando-se, o piso abrasivo como o principal fator predisponente ao seu desenvolvimento. O estudo demonstrou o bumblefoot como doença geralmente bilateral e de curso progressivo. Todos os coxins plantares foram classificados de acordo com o grau da lesão à avaliação clínica, demonstrando-se através da criação de método de biometria a mensuração de edema entre cada escore de lesão. Os microorganismos fúngicos foram relacionados à microbiota transitória do coxim plantar de pinguins, sendo mais isolados a C. albicans e Rhodotorula spp., As bactérias foram relacionadas como componentes das microbiotas transitória e permanente, bem como com a epidemiologia da pododermatite, sendo os gêneros mais isolados o Staphylococcus e o Corynebacterium. O antibiótico que melhor inibiu o crescimento bacteriano frente a todas as cepas testadas foi a cefalosporina, seguida de enrofloxacina, estreptomicina e penicilina. Foi possível através deste estudo salientar a importância da síndrome no que tange a reabilitação de pinguins, e entender sua epidemiologia, o que permite aplicar formas precisas de manejo, profilaxia e tratamento.
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Variação morfométrica entre os sexos, variabilidade genética e inferência de expansão histórica de Pygoscelis antarcticus, nas ilhas Shetland do Sul, Antártica

Brummelhaus, Jaqueline 21 November 2013 (has links)
Submitted by Silvana Teresinha Dornelles Studzinski (sstudzinski) on 2015-11-30T11:09:24Z No. of bitstreams: 1 Jaqueline Brummelhaus_.pdf: 909672 bytes, checksum: a67cf8e4fb697cea521fe93f204b4187 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-30T11:09:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jaqueline Brummelhaus_.pdf: 909672 bytes, checksum: a67cf8e4fb697cea521fe93f204b4187 (MD5) Previous issue date: 2013-11-21 / UNISINOS - Universidade do Vale do Rio dos Sinos / O pinguim-antártico (Pygoscelis antarcticus) tem suas populações distribuídas principalmente nas Ilhas Sandwich do Sul, Georgia do Sul e Shetlands do Sul e na região da Península Antártica. Algumas de suas características são o baixo dimorfismo sexual, a monogamia e o comportamento filopátrico. Esta tese tem como objetivos: 1) quantificar o dimorfismo sexual através de medidas morfológicas, testar uma função discriminante e avaliar o dimorfismo sexual entre duas áreas de reprodução distantes (Ilhas Rei George e Elefante, Shetlands do Sul); 2) caracterizar a distribuição espacial da variabilidade genética populacional entre colônias de reprodução nas Ilhas Rei George e Elefante, através de marcador mitocondrial. Na avaliação do dimorfismo sexual de tamanho, através de caracteres morfológicos, foi encontrado que machos são 6 a 9,4% maiores que as fêmeas e a equação discriminante formulada classifica corretamente 80,6% das aves. Não foi encontrada diferença no dimorfismo sexual entre as colônias de reprodução das Ilhas Rei George e Elefante. Mesmo sendo uma alternativa na determinação sexual, as equações discriminantes devem ser usadas com cautela em locais diferentes do que foram produzidas por causa dos erros de classificação. Quando equações discriminantes das Ilhas Deception e Rei George foram testadas para os dados da Ilha Elefante, obteve-se apenas 67,7% e 71% de acerto. Desta forma, a abordagem molecular é uma opção eficiente na resolução de dúvidas relacionadas à sexagem. Quanto à variabilidade genética com uso de marcador mitocondrial, foram encontrados 38 haplótipos para 61 indivíduos analisados, sendo apenas dois compartilhados nas colônias e todos os demais são exclusivos. Os valores de FST e da AMOVA revelam que a divergência entre as populações é baixa e que a maioria da variação genética (98,3%) ocorreu dentro das populações. Isso poderia ser justificado por um alto fluxo gênico entre as populações, mas não corrobora com o comportamento filopátrico da espécie. Os testes de neutralidade e de expansão demográfica apontam para uma evolução neutra e possibilidade de expansão, que ocorreu há mais de dois milhões de anos atrás e no último um milhão de anos o tamanho efetivo populacional manteve-se constante. Os resultados ressaltam a ocorrência de uma expansão populacional a partir de uma população geneticamente homogênea e a manutenção do tamanho efetivo em longa escala de tempo pode ter amplamente contribuído para a falta de estruturação genética entre as colônias recentes de pinguim-antártico. / Chinstrap penguin (Pygoscelis antarcticus) has their populations distributed mainly in South Sandwich, South Georgia and South Shetlands Islands, and the Antarctic Peninsula. This specie presents low sexual dimorphism, monogamy and philopatric behavior. This thesis aims to: 1) to evaluate sexual dimorphism among males and females and among two breeding areas (King George and Elephant Islands) using morphological characters and to obtain a discriminant function based on the characters that best identify the sex of Chinstrap penguins; 2) to determine the spatial structuring of population genetic variation among breeding colonies at King George and Elephant Islands, using mitochondrial control region. In the assessment of sexual dimorphism using morphological characters, were found that males were 6 to 9.4% larger than females and discriminant equation formulated correctly classifies 80.6% of the birds. There was no difference in sexual dimorphism between the breeding colonies of King George and Elephant Islands. However, the discriminant function should be used with caution in different locations than are produced because penguins may be misclassified. When discriminant equations from Deception and King George Islands were tested for Elephant Island data, we obtained only 67.7% and 71% accuracy. Where there is doubt in the field, it would be interesting to apply molecular sexing technique. For genetic variability using mitochondrial control region, were found 38 haplotypes for 61 individuals analyzed, only two were shared in the colonies and all others are exclusive. FST and AMOVA values revealed that the divergence between populations is low and that most of genetic variation (98.3%) occurred within populations. This could be explained by a high gene flow among populations, but does not corroborate with the philopatric behavior of this specie. The neutrality tests and Mismatch distribution point to a neutral evolution and possibility of expansion, which occurred more 2 Mya and the last 1 Mya, the effective population size remained constant. The results show the occurrence of a population expansion from a genetically homogeneous population and maintenance of effective size in long time scale can have widely contributed to the lack of genetic structuring among the current colonies of Chinstrap penguin.

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