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Agregação e viés em medidas de diversidade: uma abordagem computacional intensiva

Butturi-Gomes, Davi [UNESP] 25 February 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-25Bitstream added on 2014-06-13T20:29:43Z : No. of bitstreams: 1 butturigomes_d_me_botib.pdf: 420214 bytes, checksum: aac06b3aca61cdb7205ba4e36b9d3b5c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / É bastante comum no estudo de ecologia de comunidades o uso de índices de diversidade. Historicamente, os principais índices são os derivados por Shannon e por Simpson. Atualmente, existe uma família de índices, derivada da entropia de Tsallis, que inclui os índices supracitados. Igualmente importantes para descrever os padrões observados na natureza, são os modelos de distribuição de espécie/abundância. Sabe-se também que a amostragem em comunidades naturais geralmente é realizada por quadratins e que as populações das espécies na natureza exibem um padrão agregado de distribuição espacial, ao invés de uma distribuição aleatória. Esta dissertação tem como objetivo central avaliar os possíveis efeitos que a estrutura da comunidade imposta por meio de modelos clássicos, como as séries logarítmica e geométrica e a distribuição lognormal, que a agregação populacional e que o método de amostragem (por quadratins ou aleatória de indivíduos) podem ter sobre a estimação dos índices da família de Tsallis. Foram realizadas simulações baseadas no método modificado de Thomas (seguindo outros estudos na área), nas quais foram gerados diferentes cenários, representando comunidades naturais, com os três tratamentos: (i) distribuição de espécie/abundância, (ii) nível de agregação populacional e (iii) método de amostragem. Então foi verificado o desempenho dos métodos de estimação de máxima verossimilhança (EMV), jackknife e bootstrap . O desempenho desses métodos foi medido pelo viés percentual calculado em relação ao parâmetro populacional, pela amplitude do intervalo de confiança e também pela porcentagem de casos em que o intervalo de confiança cobriu o verdadeiro valor do parâmetro populacional. Foi observado que o EMV, em todos os cenários, produziu estimativas mais enviesadas do que os métodos intensivos de estimação... / Community ecology is often studied by the use of diversity indices. Historically, the most important indices are derived from Shannon and from Simpson’s formulas. Presently, there is a family of diversity indices, derived from Tsallis entropy, which include the above ones. The species/abundance models are also important to describe the observed patterns in nature. It is well known that, when sampling in natural communities, quadrats are used and that species populations usually exhibit an aggregated pattern of spatial distribution, instead of a random one. The main objective of this dissertation is to evaluate the possible effects that the community structure imposed by the classic species/abundance models, such as the logarithmic and geometric series and the lognormal distribution, the level of aggregation and the sampling method (by quadrats or individual sampling) would interfere with the estimation of the Tsallis diversity indices family. Simulations based on the modified Thomas method were performed (following other studies on the field), in which different scenarios were computationally created, representing the biological communities, with three treatments: (i) the species/abundance model, (ii) the aggregation level and, (iii) the sampling method. Then the performances of the maximum likelihood (MLE), jackknife and boostrap estimators were evaluated. The performances are measured by the relative bias around the population parameter, the length of the confidence intervals and also by the relative number of cases in which the confidence intervals covered the population parameter. It is observed that the MLE, in every scenario, generated more biased estimations than the two evaluated resampling methods. Also it is observed that the geometric series is the species/abundance distribution which caused less bias among the tested models, especially for species richness estimation... (Complete abstract click electronic access below)
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Metodologia para a correção e organização de bases cartográficas digitais

Iescheck, Andrea Lopes January 1996 (has links)
Orientador: Milton de Azevedo Campos / Co-orientador: Francisco Humberto Magro / Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal do Paraná / Inclui bibliografia / Inclui bibliografia / Resumo: O presente trabalho propõe uma metodologia para a correção e organização de bases cartográficas digitais. Após submetida às etapas do processo, a carta digital resultante apresenta seus elementos estruturados no formato padrão estabelecido para os arquivos gráficos, e armazenados em níveis e arquivos definidos de acordo com a natureza e características da informação. Com base nos tipos de problemas detectados, evidencia-se a necessidade de elaboração de um projeto de digitalização como garantia de obtenção de produtos que atendam às necessidades do usuário. É apresentado um modelo de projeto de digitalização, desenvolvido a partir das etapas constantes em projetos cartográficos. Os resultados apresentados comprovam a eficiência do método, possibilitando a utilização dos arquivos digitais em programas aplicativos e otimizando a recuperação e manipulação dos dados. / Abstract: This work proposes and discusses a methodology to correct and organize digital maps. Design files submitted to the procedures of the method present graphic elements structured in accordance with the standard file formats, and stored on levels and files which were previously defined according to the nature and attributes of the information. Based upon the problems detected on the digital maps, the need of a digitizing project to vouch for products that meet users necessities becomes evident. A digitizing project model developed on the basis of cartographic projects is also presented. The results attest the efficiency of the method, allowing digital maps to be used on aplicative programs and optimizing data retrievel and manipulation.
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Desenvolvimento de software e hardware para espectrometria de massas e cromatografia gasosa/espectrometria de massas

Lago, Claudimir Lucio do 13 July 2018 (has links)
Orientador : Concetta Kascheres / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-13T22:31:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lago_ClaudimirLuciodo_D.pdf: 7304422 bytes, checksum: 5699a74f9b745d96d6fc664189876d72 (MD5) Previous issue date: 1991 / Doutorado
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Titulador potenciométrico automatizado baseado em sistema de fluxo monossegmentado /

Ganzarolli, Edgard Moreira January 1997 (has links)
Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. / Made available in DSpace on 2012-10-17T01:09:49Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2016-01-08T22:37:22Z : No. of bitstreams: 1 138327.pdf: 2207144 bytes, checksum: d1839a6f2aaf97fc4fe19888ebe7d8ab (MD5)
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Exatidão cartográfica para as cartas digitais urbanas

Rocha, Ronaldo dos Santos da January 2002 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Produção. / Made available in DSpace on 2012-10-19T15:52:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2014-09-26T01:26:12Z : No. of bitstreams: 1 186396.pdf: 13331809 bytes, checksum: 2e523b28747c14c315c6d39d01272002 (MD5)
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Avaliação de modificações do cifrador caótico de Roskin

Misaghi, Mehran January 2001 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós -Graduação em Computação. / Made available in DSpace on 2012-10-18T07:35:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2014-09-25T22:30:54Z : No. of bitstreams: 1 182070.pdf: 2505459 bytes, checksum: e4ec598b0c16b30bbe2c7c66bbc3337a (MD5) / Este documento propõe uma metodologia para avaliação do criptossistema caótico de Roskin. Os princípios de criptografia e os princípios de caos relacionados com a criptografia foram estudados e também alguns criptossistemas caóticos foram caracterizados. Para a avaliação de criptossistemas caóticos, através da técnica de compressão de dados e o Critério da Avalanche Estrita, foram realizados diversos experimentos e os resultados obtidos foram analisados.Conforme os resultados dos experimentos obtidos com os criptossistemas citados neste documento, foram propostas melhorias. A intenção é que este documente se torne uma referência para avaliação de outros criptossistemas caóticos.
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Modelo simplificado do cifrador RC6

Mendes, Marco André Lopes January 2001 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós -Graduação em Computação. / Made available in DSpace on 2012-10-18T07:55:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2014-09-25T22:31:22Z : No. of bitstreams: 1 182075.pdf: 2234960 bytes, checksum: dce4c5a1d4867c567d731e0e6a6d161a (MD5) / Este trabalho consiste na proposta de um modelo simplificado para o cifrador de bloco simétrico RC6, a ser denominado S-RC6.Um modelo simplificado pode auxiliar no entendimento de um cifrador, pois ele mantém as operações primitivas, enquanto diminui os parâmetros, facilitando seu uso.
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Sistema multiagente para anotação manual em projetos de seqüenciamento de genomas

Lima, Richardson Silva 29 June 2007 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2007. / Submitted by Aline Jacob (alinesjacob@hotmail.com) on 2010-01-13T23:42:24Z No. of bitstreams: 1 2007_RichardsonSilvaLima.pdf: 1732822 bytes, checksum: f5a18335dd0187afe34cc7fd5204096d (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-01-14T21:40:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_RichardsonSilvaLima.pdf: 1732822 bytes, checksum: f5a18335dd0187afe34cc7fd5204096d (MD5) / Made available in DSpace on 2010-01-14T21:40:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_RichardsonSilvaLima.pdf: 1732822 bytes, checksum: f5a18335dd0187afe34cc7fd5204096d (MD5) Previous issue date: 2007-06-29 / Projetos de seqüenciamento de genomas obtêm as bases que compõem seqüências biológicas de um organismo, de tal forma que suas funções possam ser inferidas. As inferências de funções biológicas constituem uma das tarefas mais importantes destes projetos, as quais são realizadas na fase de anotação. Existem softwares} e bases de dados que podem auxiliar os biólogos a realizar esta tarefa com uma maior acurácia e eficiência. Esta etapa é chamada de anotação automática. Os biólogos decidem as funções biológicas ou classificações das seqüências, com base nos seus conhecimentos biológicos. Esta etapa é chamada de anotação manual. Sistemas Multiagente possuem uma arquitetura própria onde agentes inteligentes ou entidades autônomas interagem entre si de maneira cooperativa, compartilhando um objetivo comum ou agindo de acordo com seus objetivos individuais. Neste contexto, este trabalho propõe um sistema baseado na abordagem de Sistema Multiagente para apoiar o processo de anotação manual. A arquitetura do sistema provê a combinação de diferentes agentes, de tal forma que estes interajam entre si e com o ambiente, cooperando de forma a sugerir anotações manuais que deverão ser validadas pelos biólogos. Um protótipo, denominado BioAgents, foi desenvolvido sob uma arquitetura multiagente com abordagem blackboard a fim de validar a proposta. Como estudo de caso, aplicamos o BioAgents em dois projetos de seqüenciamento de genomas, cujo processamento foi realizado pelo Laboratório de Bioinformática do Instituto de Biologia da UnB, a saber: Projeto Genoma Funcional e Diferencial do Paracoccidioides brasilienses (Projeto Genoma Pb) e o Projeto Genoma Funcional e Genética Genômica de Paullinia cupana (Projeto Genoma Guaraná). ________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Genome sequencing projects provide the basis to form the biological sequences of an organism, in such a away that their functions can be inferred. The biological function inferences constitute one of the most important tasks of these projects, which is carried through the annotation phase. There are softwares and databases that can help the biologists through with improved accuracy and e±ciency. This task is called automatic annotation. The biologists decide the biological functions or the classi¯cation of the sequences based on their own biological knowledge. This task is called manual annotation. Multiagent Systems provide an architecture where intelligent agents or auto- nomous entities interact with each other in a cooperative way, where they can share a common goal or act according to their own interests. This work presents a system based on the Multiagent System approach to support the process of manual annotation. The architecture of the system provides the combination of di®erent agents, in such a way that these agents must interact among themselves and with the environment, suggesting annotations that will be later validated by the biologists. A prototype called BioAgents was developed under a multiagent architecture according to a blackboard approach in order to validate the proposal. Two study cases were developed applying the BioAgents in two genome sequen- cing projects of the Bioinformatics Laboratory of the Biology Institute of UnB - The Paracoccidioides brasilienses Functional and Di®erential Genome Project (Genome Pb Project) and The Paullinia cupana Functional and Genome Genetic Project (Genome Guaraná Project).
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Métodos iterativos para a soluçao de sistemas de equaçoes normais

Wandresen, Romualdo, 1949-, Gemael, Camil 31 October 2013 (has links)
Resumo: Este trabalho consiste em desenvolver e aplicar alguns métodos iterativos â solução de sistemas de equações normais, oriundas da aplicação do método dos mínimos quadrados; estudar os princípios para o estabelecimento de métodos iterativos; estabelecer condições de convergência dos métodos iterativos para sistemas de equações lineares; e estudar, ainda, por um processo iterativo, o calculo da inversa de ma trizes simétricas e definidas positivas. Ele contêm testes computacionais compara tivos entre os métodos iterativos de Jacobi, Gauss- Seidel, S.O.R.(Successive Over Relaxation) e Gradientes Conjugados para um mesmo sistema de equações normais .
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Análise, desenvolvimento e implantação de software para monitorização, controle e gerenciamento dos processos na condução de estudos clínicos em cancerologia

Lago, Adriano Rocha [UNESP] 30 March 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-03-30Bitstream added on 2014-06-13T18:09:08Z : No. of bitstreams: 1 lago_ar_me_botfm.pdf: 686937 bytes, checksum: bf3207ac9af78684b885e65c7b4ac7c6 (MD5) / Fundação Pio Xii - Barretos / A gestão administrativa e de informação são ferramentas indispensáveis nas empresas e contribuem decisivamente para um melhor desempenho e otimização de recursos, podendo melhorar a estratégia e visão de futuro, possibilitando projetar cenários diferenciados e privilegiados para tomadas de decisão. Presente no país há duas décadas aproximadamente, a Pesquisa Clínica em oncologia pouco utiliza estas ferramentas. É indiscutível a importância e necessidade de definição da unidade de pesquisa clínica como ponto estratégico de uma entidade médico/hospitalar. Em 2006, após reestruturação de área física e profissional da unidade de Pesquisa Clínica do Hospital de Câncer de Barretos foi implementado um modelo de gestão profissionalizado, sendo designado a gerência geral e tomada de decisão para um profissional atuante em administração médico/hospitalar. Foi necessária a criação de um sistema informatizado capaz de monitorar, controlar e gerenciar todos os processos na condução de estudos clínicos oncológicos. Este software foi desenvolvido pelo departamento de tecnologia da informação da instituição e contou com a participação de um analista de sistemas, um programador e um analista de negócios, utilizando banco de dados e ferramentas de desenvolvimento Oracle®. O programa computacional demonstrou atender as necessidades mínimas do departamento, além de se revelar como perfeitamente aplicável em estrutura e recursos de uma instituição médico/hospitalar em oncologia / The management of business and information are indispensable tools in companies and contribute decisively for a better performance and optimization of resources, which can improve the performance and vision of future, allowing to project differential and privileged sceneries for decision-making. Oncology Clinical Research is present in our country for about two decades and makes very little use of those tools. The importance and necessity of definition of Clinical Research Unit as a strategic item of a medical/hospital entity is unquestionable. In 2006, after area and professional re-structuration of the Clinical Research Unit of Hospital de Cancer de Barretos, a professional pattern of administration, general management and decision-making was designated to a professional who was used to act on medical/hospital administration. It was necessary the creation of a computerized system, able to monitoring, controlling and managing all the process on the conduction of oncology clinical trials. This software was developed by the information technology department of the institution, with participation of a systems analyst, a programmer and a business analyst, using database and Oracle® development tools. It was observed that the computational program attended the minimal necessities of the department. Besides, it was considered perfectly applied on structure and resources of an oncology medical/hospital institution

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