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Região promotora do gene do receptor de androgenos : conservação ou divergencia ?

Cabral, Daniela Farias 31 July 2018 (has links)
Orientadores : Christine Hackel, Silvana Bordin / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-31T17:49:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cabral_DanielaFarias_D.pdf: 6803258 bytes, checksum: 5573dc43e42a10d1ed020bacb58e426b (MD5) Previous issue date: 2001 / Doutorado
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Estudo molecular de uma sequencia de DNA isolada do cromossono y humano

Sartorato, Edi Lúcia, 1962- 19 July 2018 (has links)
Orientador: Solange Bento Farah / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-19T23:03:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sartorato_EdiLucia_M.pdf: 4685693 bytes, checksum: fda73fd184d9bf0a8e374de113c67c42 (MD5) Previous issue date: 1994 / Mestrado / Genetica Humana / Mestre em Ciências Biológicas
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Indicadores de desempeño en empresas promotoras constructoras de vivienda. El caso de México

Luna Villarreal, Kevin 03 November 2017 (has links)
ABSTRACT Performance measurement in residential housing, at a company or project level, is usually assessed using financial indicators. There are other performance indicators that can be also applied to the construction industry. The literature review identifies papers and reports that propose a set of indicators that can be applied to different areas. However, there is no evidence of a system that comprises the key performance indicators at the design-bid-build-delivery stages of the life-cycle of developer and homebuilder companies. Therefore, the main goal of this research is to create a model of performance indicators (at the strategic, tactical and operative levels), based on the production chain of a developer and homebuilder company. Once the theoretical proposal is set, a Delphi study is developed; therefore, a panel of 11 experts assesses and summarizes the indicators that allow measuring the performance of Mexican developer and homebuilder companies. Once the model is simplified and adjusted, it is validated through multiple case studies of two Mexican developer and homebuilder companies; the model has to be implemented and monitored in two whole productive cycles of each one of these case studies. Finally, the basic indicators obtained are: time, production cost, administrative cost, housing internal delivery, housing technical report, housing external delivery, warrantees, quality, and customer service. These indicators are aligned with an intrinsic traceability among them. This research also proposes an indicator of global performance (IDGC). This way, developer and homebuilder companies achieve project success considering the proposed indicators, focused on three key areas of the value supply chain: construction, housing internal delivery, and housing delivery to the final customer. / RESUMEN La medición del desempeño en la edificación residencial, tanto a nivel empresarial como de proyecto, se ha evaluado normalmente mediante indicadores de tipo financiero. Existen otros indicadores de desempeño que también son aplicables al sector de la construcción. En la revisión de la literatura se identifican diversos artículos e informes que proponen una serie de indicadores aplicables a diferentes áreas. Sin embargo, no hay evidencia de un sistema específico que integre los indicadores clave de desempeño en las etapas de diseño-contratación-construcción-entrega del ciclo de vida de las empresas promotoras-constructoras de vivienda. Por lo tanto, el objetivo principal de esta investigación es cubrir esta laguna del conocimiento, generando un modelo de indicadores de desempeño (a nivel estratégico, táctico y operativo), basado en la cadena productiva de una empresa promotora-constructora de viviendas. Una vez realizada la propuesta de modelo teórico, se lleva a cabo un estudio Delphi con la finalidad de que un panel de 11 expertos valore y sintetice los indicadores que permitan medir el desempeño de las empresas promotoras constructoras de vivienda, en el contexto de la industria de la construcción mexicana. Una vez simplificado y adaptado, el modelo se somete a una validación práctica mediante estudios de caso múltiple de dos empresas promotoras-constructoras mexicanas; se requiere la implementación y seguimiento del modelo durante dos ciclos productivos completos en cada uno de los dos casos planteados. Finalmente, los indicadores básicos obtenidos son: tiempo, coste de producción, coste administrativo, entrega interna de vivienda, dictamen técnico de la vivienda, entrega externa de la vivienda, garantía, calidad y posventa. Estos indicadores se encuentran alineados con una trazabilidad intrínseca entre ellos. La presente investigación también propone un indicador de desempeño global (IDGC). De este modo, las empresas promotoras-constructoras de vivienda determinan el éxito de sus proyectos en base a los indicadores propuestos, centrados en tres áreas de fundamentales de la cadena de valor: construcción, entrega interna de vivienda, y entrega de vivienda al usuario final. / RESUM El mesurament del rendiment en l'edificació residencial, tant a nivell empresarial com de projecte, s'ha avaluat normalment per mitjà d'indicadors de tipo financer. Hi ha altres indicadors de rendiment que també són aplicables al sector de la construcció. En la revisió de la literatura s'identifiquen diversos articles i informes que proposen una sèrie d'indicadors aplicables a diferents àrees. No obstant això, no hi ha evidència d'un sistema específic que integre els indicadors clau de rendiment en les etapes de disseny-contractació-construcció-entrega del cicle de vida de les empreses promotores- constructores de vivenda. Per tant, l'objectiu principal d'esta investigació és cobrir esta llacuna del coneixement, generant un model d'indicadors de rendiment (a nivell estratègic, tàctic i operatiu), basat en la cadena productiva d'una empresa promotora-constructora de vivendes. Una vegada realitzada la proposta de model teòric, es du a terme un estudi Delphi amb la finalitat que un panell de 11 experts valore i sintetitze els indicadors que permeten mesurar el rendiment de les empreses promotores constructores de vivenda, en el context de la indústria de la construcció mexicana. Una vegada simplificat i adaptat, el model és sotmés a una validació pràctica per mitjà d'estudis de cas múltiple de dos empreses promotores-constructores mexicanes; es requerix la implementació i seguiment del model durant dos cicles productius complets en cada un dels dos casos plantejats. Finalment, els indicadors bàsics obtinguts són: temps, cost de producció, cost administratiu, entrega interna de vivenda, dictamen tècnic de la vivenda, entrega externa de la vivenda, garantia, qualitat i postvenda. Estos indicadors es troben alineats amb una traçabilitat intrínseca entre ells. La present investigació també proposa un indicador de rendiment global (IDGC). D'esta manera, les empreses promotores-constructores de vivenda determinen l'èxit dels seus projectes basant-se en els indicadors proposats, centrats en tres àrees fonamentals de la cadena de valor: construcció, entrega interna de vivenda, i entrega de vivenda a l'usuari final. / Luna Villarreal, K. (2017). Indicadores de desempeño en empresas promotoras constructoras de vivienda. El caso de México [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/90447 / TESIS
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Mulheres que (des)aprendem a ser mulheres na tradição católica desconstruindo modelos de opressão através da formação das promotoras legais e populares

Cornaglia, Graciela Patrícia 11 September 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-04T20:03:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 11 / Nenhuma / O Projeto Acesso Popular a Justiça (APJ) promove o Curso de Formação de Promotoras Legais Populares (PLPs). As PLPs são mulheres que, depois de fazerem o curso de capacitação na área de legislação e direitos humanos, com ênfase nos direitos das mulheres, procuram ser agentes multiplicadoras de informações nas suas comunidades. O CECA (Centro Ecumênico de Evangelização, Capacitação e Assessoria) foi a ONG que inaugurou essa formação no âmbito do município de São Leopoldo e, há trinta e quatro anos, desenvolve vários projetos em uma perspectiva ecumênica e de educação popular. As PLPs, apoiadas por essa instituição, desenvolvem ações de escuta, apoio, denúncia, prevenção à violência, defesa da cidadania e encaminhamentos das mulheres em situação de violência aos órgãos competentes. Por meio dessas ações, da organização e articulação das mulheres, um desafio que se apresenta e que elas aceitam é a luta por direitos e pela implantação de políticas públicas de gênero. A maioria das PLPs formadas pelo CECA é ori
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Uso de bactérias diazotróficas na produção de mudas de cana-de-açúcar em diferentes substratos / Use of diazotrophic bacteria in the production of sugarcane seedlings on different substrates

Matoso, Ester Schiavon Matoso 23 March 2017 (has links)
Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-07-05T14:00:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação de Mestrado - Ester Schiavon Matoso.pdf: 3410407 bytes, checksum: 162df96e3e5a35b23543fd851dc17f78 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-07-11T20:54:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação de Mestrado - Ester Schiavon Matoso.pdf: 3410407 bytes, checksum: 162df96e3e5a35b23543fd851dc17f78 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T20:54:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação de Mestrado - Ester Schiavon Matoso.pdf: 3410407 bytes, checksum: 162df96e3e5a35b23543fd851dc17f78 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-23 / A cana-de-açúcar é uma cultura de grande importância no Brasil, o país é o primeiro do mundo na produção de cana e açúcar, segundo em etanol e conquista, cada vez mais, o mercado externo com o uso do biocombustível como alternativa energética. Um dos problemas desta cultura é o plantio convencional, pois nele ocorre o gasto excessivo de colmos que poderiam ser destinados à indústria, além de aumentar o risco de difusão de pragas e doenças. Além disso, a cana-de-açúcar é extremamente dependente da adubação nitrogenada, pois entre os nutrientes responsáveis pela sua nutrição, o nitrogênio é o elemento absorvido em maior quantidade. Neste sentido, o objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da inoculação de bactérias diazotróficas na produção de mudas originadas de minitoletes e de cultura de tecidos de cana-de-açúcar em substratos alternativos. Utilizaram-se as variedades de cana RB867515, RB92579, RB966928 e RB975932, e substratos produzidos a partir da mistura de casca de arroz carbonizada e composto orgânico, além de um de marca comercial. E foram desenvolvidos diversos experiementos, onde foram avaliados: a sobrevivência das espécies de bactérias diazotróficas nos substratos; parâmetros relacionados à brotação, desenvolvimento de parte aérea e de raízes, além do acúmulo de nitrogênio de mudas; a resposta dessas à inoculação quanto ao perfilhamento, teor de clorofila, área foliar, acúmulo de biomassa, incremento de massa seca, teor de nitrogênio e fixação biológica; e no cultivo in vitro foi aviada a multiplicação das brotações e o crescimento de plântulas em frascos contendo meio semissólido e em biorreator de imersão temporária, a resposta destas plantas à inoculação quanto ao enraizamento e a aclimatação nos diferentes substratos. Os resultados obtidos indicam a interação entre as variedades, substratos e inoculação para todos os parâmetros avaliados que envolveram estes fatores. Os substratos contendo casca de arroz carbonizada e composto orgânico apresentam melhores resultados na sobrevivência de bactérias diazotróficas e podem ser utilizados desde a aclimatação até o desenvolvimento de mudas. Todas as variedades apresentam excelente desenvolvimento de mudas a partir de micropropagação e também de minitoletes, e de alguma forma respondem à inoculação de bactérias diazotróficas, mas apesar disso, apenas na RB92579 e na RB975932 ocorreu a fixação biológica de nitrogênio / Sugarcane is a very important culture in Brazil, the country is the world's first in the production of cane and sugar, second of ethanol and increasingly conquers the foreign market with the use of biofuel as an alternative energy. One of the problems of this crop is conventional planting, because in it occurs the excessive spending of stalks that could be destined to the industry, besides increasing the risk of diffusion of plagues and diseases. Moreover, sugarcane is extremely dependent on nitrogen fertilization, because among the nutrients responsible for its nutrition, nitrogen is the element absorbed in greater quantity. In this sense, the objective of this work was to evaluate the effects of the inoculation of diazotrophic bacteria in the promotion of growth, rooting and biological nitrogen fixation of pre-sprouted and micropropagated sugarcane seedlings produced in alternative substrates. Were used the sugarcane varieties RB867515, RB92579, RB966928 and RB975932, and substrates produced from the mixture of carbonized rice rusk and organic compound, in addition to a trademark. And several experiments were developed, where they were evaluated: the survival of the diazotrophic bacteria species in the substrates; parameters related to sprouting, aerial part and root development, and nitrogen accumulation of seedlings; the response of these seedlings to inoculation for tillering, chlorophyll content, leaf area, biomass accumulation, dry mass increase, nitrogen content and biological fixation; And in the in vitro cultivation the multiplication of the shoots and the growth of seedlings in glass jars containing semi-solid medium and in temporary immersion bioreactor, the response of these plants to the inoculation in rooting and the acclimatization in the different substrates. The results indicate the interaction between the varieties, inoculation and substrates for all evaluated parameters that involved these factors. The substrates containing carbonized rice rusk and organic compost present better results in the survival of diazotrophic bacteria and can be used from acclimatization to the development of seedlings. All varieties show excellent development of seedlings from micropropagation and also minitoletes, and somehow respond to the inoculation of diazotrophic bacteria, but nevertheless, only in RB92579 and in RB975932 the biological fixation of nitrogen.
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Diversidade de bactérias epífitas e endofíticas da cultura do milho /

Milani, Rafael de Mello January 2017 (has links)
Orientador: Everlon Cid Rigobelo / Resumo: Bactérias que habitam os tecidos externos e internos de plantas sem lhes causarem prejuízos são conhecidas como epífitas e endofíticas, atuando como promotoras de crescimento em plantas ou agindo como agentes de controle biológico. Dentre os benefícios proporcionados por essas bactérias, destacam-se a solubilização do fósforo, a fixação do nitrogênio e a produção de ácido indol acético (fitohormônio), mas também a resistência a patógenos e a adaptação a situações de estresse. Os desafios da agricultura moderna e a importância da cultura do milho exigem inovações como o uso de microrganismos promotores de crescimento. Nesse sentido, o objetivo do presente estudo foi de isolar e caracterizar bactérias epífitas e endofíticas obtidas da cultura do milho com capacidade solubilizar fósforo, fixar nitrogênio e produzir ácido indol acético. O isolamento resultou em 320 isolados retirados das folhas, caules e raízes, sendo 57% epífitas e 43% endofíticas. Foram selecionados 10 isolados, todas solubilizadoras de fósforo e fixadoras de nitrogênio, além de produtoras de ácido indol acético, que também foi quantificado e comparadas ao controle positivo. Os microrganismos selecionados foram submetidos à reação em cadeia da polimerase (PCR) e análise da porção 16S do rDNA, sendo que a identificação resultou em três espécies bacterianas diferentes, 8 Bacillus subtilis, 1 Bacillus velezensis e 1 Lactococcus lactis, encontradas nos diferentes órgãos vegetais. / Mestre
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Diversidade de bactérias epífitas e endofíticas da cultura do milho / Diversity of epiphytic and endophytic bacteria from corn

Milani, Rafael de Mello [UNESP] 30 June 2017 (has links)
Submitted by RAFAEL DE MELLO MILANI null (milanirafael@hotmail.com) on 2017-07-27T00:31:10Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - versão final para repositório.pdf: 1289343 bytes, checksum: 95c979cc483886175553e5416bd9626a (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-07-31T16:20:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 milani_rm_me_jabo.pdf: 1289343 bytes, checksum: 95c979cc483886175553e5416bd9626a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-31T16:20:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 milani_rm_me_jabo.pdf: 1289343 bytes, checksum: 95c979cc483886175553e5416bd9626a (MD5) Previous issue date: 2017-06-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Bactérias que habitam os tecidos externos e internos de plantas sem lhes causarem prejuízos são conhecidas como epífitas e endofíticas, atuando como promotoras de crescimento em plantas ou agindo como agentes de controle biológico. Dentre os benefícios proporcionados por essas bactérias, destacam-se a solubilização do fósforo, a fixação do nitrogênio e a produção de ácido indol acético (fitohormônio), mas também a resistência a patógenos e a adaptação a situações de estresse. Os desafios da agricultura moderna e a importância da cultura do milho exigem inovações como o uso de microrganismos promotores de crescimento. Nesse sentido, o objetivo do presente estudo foi de isolar e caracterizar bactérias epífitas e endofíticas obtidas da cultura do milho com capacidade solubilizar fósforo, fixar nitrogênio e produzir ácido indol acético. O isolamento resultou em 320 isolados retirados das folhas, caules e raízes, sendo 57% epífitas e 43% endofíticas. Foram selecionados 10 isolados, todas solubilizadoras de fósforo e fixadoras de nitrogênio, além de produtoras de ácido indol acético, que também foi quantificado e comparadas ao controle positivo. Os microrganismos selecionados foram submetidos à reação em cadeia da polimerase (PCR) e análise da porção 16S do rDNA, sendo que a identificação resultou em três espécies bacterianas diferentes, 8 Bacillus subtilis, 1 Bacillus velezensis e 1 Lactococcus lactis, encontradas nos diferentes órgãos vegetais. / Bacteria that inhabit the external and internal tissues of plants without damaging them are known as epiphytes and endophytes, acting as growth promoters in plants or acting as biological control agents. Among the benefits provided by these bacteria, phosphorus solubilization, nitrogen fixation and the production of indole acetic acid (phytohormone), as well as resistance to pathogens and adaptation to stress situations are noteworthy. The challenges of modern agriculture and the importance of maize culture require innovations as the use of plant growth microorganisms, in this way the present study had as aim to isolate and characterize the epiphytic and endophytic bacteria obtained from maize culture with the ability to solubilize phosphorus, fix nitrogen and produce indole acetic acid. Isolation resulted in 320 isolates from leaves, stems, and roots, being 57% epiphytic and 43% endophytic. Ten isolates, all phosphorus solubilizers, and nitrogen fixers were selected, as well as indole acetic acid producers, which were also quantified and compared to the positive control. The selected microorganisms were submitted to polymerase chain reaction (PCR) and analysis of the 16S portion of rDNA, and the identification resulted in three different bacterial species, 8 Bacillus subtilis, 1 Bacillus velezensis and 1 Lactococcus lactis, found in the different plant organs.
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Identificação e caracterização funcional dos elementos cis-regulatorios da miostatina / Identification and functional characterization of the cis-regulatory elements of myostatin

Grade, Carla Vermeulen Carvalho, 1983- 13 August 2018 (has links)
Orientador: Lucia Elvira Alvares / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-13T02:44:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Grade_CarlaVermeulenCarvalho_M.pdf: 54304678 bytes, checksum: 869f67d6a836e256bbd7ee9e15980659 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: A proteina Miostatina (tambem conhecida como GDF8) e um membro da superfamilia de crescimento e diferenciacao ß (TGF- ß) e e expressa quase que exclusivamente em musculatura esqueletica, tanto no embriao em desenvolvimento quanto no individuo adulto, onde circula livre pela corrente sanguinea. A Miostatina foi inicialmente identificada em 1997 por MCPHERRON et al. e, desde entao, muitos estudos tem demonstrado seu papel essencial na regulacao do desenvolvimento de musculatura esqueletica de aves e mamiferos. O nocaute genico da Miostatina causa hiperplasia e hipertrofia das fibras musculares, resultando em musculos individuais ate duas vezes maiores do que em animais selvagens. Isso demonstra que a Miostatina e um regulador negativo da deposicao de musculatura esqueletica. A estrutura e a funcao desta proteina sao conservadas em diversas especies, incluindo humanos, onde os niveis de Miostatina circulante no sangue se encontram aumentados durante condicoes de distrofia e na caquexia que acompanha alguns tipos de cancer e a AIDS. Um melhor entendimento dos mecanismos que regem a expressao da Miostatina e essencial para o desenvolvimento de estrategias que possam regular sua atividade durante tais condicoes. No presente trabalho, nos identificamos, com o uso de ferramentas de Bioinformatica, elementos cisregulatorios putativos (promotor e enhancers) que possivelmente regulam a transcricao do gene da Miostatina. Inicialmente foi realizada uma comparacao dos loci do GDF8, incluindo as regioes intergenicas adjacentes, provenientes dos genomas de Humano, Camundongo e Galinha. Essa analise revelou a presenca de diferentes regioes evolutivamente conservadas (RECs) adjacentes a sequencia codificadora desta proteina, sete downstream e uma upstream ao gene. Por terem sido mantidas relativamente conservadas ao longo da evolucao, essas regioes supostamente possuem um papel funcional, possivelmente como elementos cis-regulatorios do gene da Miostatina. Em seguida, com o intuito de entender as funcoes que cada uma dessas regioes possa estar exercendo sobre a regulacao da atividade transcricional do gene da Miostatina, foi realizada uma busca por sitios de ligacao para fatores transcricionais que tenham sido conservados evolutivamente nessas RECs. Muitos sitios conservados foram observados nas sete RECs downstream ao gene da Miostatina, entre eles estao sitios para fatores relacionados ao desenvolvimento de musculatura esqueletica (MyoD, Myogenin, E47, EN1), membros (Pax3, Tbx5) e coracao (Nkx2.5, Pitx2). Juntos, esses dados sugerem uma regulacao modular do gene da Miostatina durante a embriogenese dos vertebrados. A unica REC localizada upstream ao GDF8 representa o promotor minimo putativo deste gene. Essa hipotese e reforcada pela presenca de um sitio de ligacao conservado para a Proteina de Ligacao ao sitio TATA. Com o intuito de validar as hipoteses formuladas com base nas analises de Bioinformatica, no presente trabalho buscamos caracterizar funcionalmente o promotor minimo do gene da Miostatina. Para tanto, a regiao do promotor minimo foi inicialmente clonada em um vetor que nao contem promotor e possui como gene reporter o GFP. Essa construcao de expressao foi entao testada atraves de experimentos de eletroporacao em embrioes de galinha in ovo. A analise dos embrioes eletroporados revelou que a regiao de DNA elegida para as analises funcionais e capaz de dirigir a transcricao do gene reporter, indicando que ela corresponde ao promotor minimo do gene da Miostatina. Alem do sitio TATA, ha, na regiao do promotor, diversos sitios conservados para a ligacao de proteinas envolvidas na via de sinalizacao mediada por cAMP (CREB, ATF, NFY). Esse achado esta de acordo com estudos recentes que demonstram o envolvimento do cAMP na regulacao dos fatores miogenicos Myf5 e MyoD, bem como de Pax3, sugerindo que a atividade do gene da Miostatina tambem possa estar sendo regulada por essa via de sinalizacao. Outras regioes do genoma humano que possuem arquitetura semelhante a observada no promotor da Miostatina foram identificadas, demonstrando que outros genes podem estar sob influencia da mesma via de sinalizacao que regula a atividade do promotor da Miostatina, dentre eles genes envolvidos na miogenese e neurogenese. / Abstract: The Myostatin protein (also known as GDF8) is a member of the transforming growth factor-ß (TGF-ß) superfamily and is expressed almost exclusively in skeletal muscle, both in the embryo and in the adult, where the protein circulates in the blood flow. It was initially identified in 1997 by MCPHERRON et al., and since then many studies have been demonstrating its essential role in the regulation of the development of skeletal muscle from birds and mammals. The knockout of the Myostatin gene causes both hyperplasia and hypertrophy of the skeletal muscle fibers, resulting in muscles twice as big as the wildtype ones, thus showing that Myostatin is a negative regulator of skeletal muscle deposition. The GDF8 structure and function is conserved in many species, including humans where the Myostatin levels are increased during dystrophy conditions and in the cachexia that accompanies some types of cancer and AIDS. A better understanding of the mechanisms that rule the Myostatin expression is essential for the development of strategies that might regulate its activity during such conditions. In this research, we have identified, with the use of bioinformatic tools, the cis-regulatory elements (promoter and enhancers) that regulate the Myostatin gene transcription. We compared the GDF8 loci from human, chicken and mouse and found different evolutionary conserved regions (ECRs), adjacent to the GDF8 coding sequence. Because these intergenic sequences remained relatively conserved throughout evolution, they supposedly have a functional role, possibly as cis-regulatory elements for the Myostatin gene. Our analyses revealed the presence of seven possible enhancers downstream of the GDF8 gene and one conserved region upstream of it. In order to understand the role these regions might have in the regulation of Myostatin's transcription activity, we searched for binding sites that were also evolutionary conserved. Many conserved binding sites were observed in the RECs downstream to the Myostatin gene, and among them are sites for factors related to the development of the skeletal muscle (MyoD, Myogenin, E47, EN1), limbs (Pax3, Tbx5) and heart (Nkx2.5, AREB6, Pitx2). Together, these data suggest a modular regulation of the Myostatin gene during vertebrates' embryogenesis. The only REC observed upstream of the Myostatin locus represents the putative basal gene promoter. This hypothesis is strengthened by the presence of a binding site for the Tata Binding Protein conserved for the studied species. In this research, we aimed at functionally characterizing the Myostatin gene basal promoter. For that purpose, we cloned the studied region in a promoterless vector, which contains GFP as a reporter gene. This expression construct was then tested through in ovo electroporation assays. The analysis of the electroporated embryos revealed that the cloned DNA region is capable of driving the transcription of the reporter gene, which indicates that it truly corresponds to the basal promoter of the Myostatin gene. Moreover, there are conserved binding sites for the CREB and ATF1 transcription factors in the basal promoter, which are activated by the cAMP signaling path. This finding is in agreement with recent studies that demonstrate the involvement of cAMP in the regulation of the myogenic factors Myf5 and MyoD, as well as Pax3, thus suggesting that the activity of the Myostatin gene might be under the influence of this signaling path. Other regions of the human genome that have a similar architecture to the one observed in the Myostatin promoter were identified. This demonstrates that other genes are possibly under the influence of the same signaling path regulating the activity of the Myostatin promoter, among them genes involved in myogenesis and neurogenesis. / Mestrado / Histologia / Mestre em Biologia Celular e Estrutural
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Identificação de genes e uso de promotores modulados por etanol em cana-de-açucar / Identification of genes and use of promoters regulated by ethanol in sugarcane

Camargo, Sandra Rodrigues de 23 August 2007 (has links)
Orientadores: Marcelo Menossi Teixeira, Eugenio Cesar Ulian / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-09T08:36:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Camargo_SandraRodriguesde_D.pdf: 3039020 bytes, checksum: 14d2f6b74500161c7e839b7d6776dd47 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A cana-de-açúcar é uma cultura de grande importância social e econômica para o Brasil. Além da produção de açúcar, que coloca o país como o maior produtor mundial, a cana-de-açúcar tem alcançado grande destaque na produção de energia renovável e pouco poluente, o etanol. Devido ao rápido crescimento das áreas cultivadas e do aumento no número de indústrias processadoras da cana-de-açúcar, milhares de novos empregos têm sido gerados no Brasil. Por se tratar de uma cultura tão importante para a sociedade e economia brasileira, a cana-de-açúcar vem ganhando cada vez mais destaque e atenção das instituições de pesquisa públicas e privadas. Grande parte da pesquisa e experimentação desenvolvida atualmente para esta cultura visa o desenvolvimento de variedades mais adaptadas às condições edafoclimáticas do Brasil e mais resistentes e tolerantes contra pragas e doenças. Outro importante campo de estudo que tem sido bastante focado no momento é a compreensão dos mecanismos bioquímicos da síntese de sacarose com a finalidade de aumentar a produção deste açúcar e conseqüentemente de etanol. O desenvolvimento de um sistema genético capaz de modificar o metabolismo da planta, através de um estímulo artificial, pode ser muito útil no aumento da produtividade e qualidade ou na redução dos custos envolvidos com a produção de cana-de-açúcar. Esta tecnologia poderá contribuir significativamente para um avanço ainda maior da cana-de açúcar no país. A partir desta premissa, o presente estudo buscou identificar e caracterizar um sistema de indução de expressão gênica disparado pela aplicação externa de etanol em folhas de cana-de-açúcar. Para isso, fazendo uso da técnica de macroarranjos de cDNA, analisamos a expressão gênica de 3.575 ESTs, isolados de folhas de cana-de-açúcar, em resposta a aplicação de etanol. Setenta ESTs apresentaram padrão de expressão alterado pelo etanol. Dentre estes, foram identificados ESTs que codificavam para proteínas relacionadas ao processo de transcrição e tradução e estresse abiótico. Muitos genes cuja função ainda permanece desconhecida também foram identificados nesta análise. Dos 70 ESTs identificados, 48 tiveram expressão induzida pela aplicação de etanol. A partir dos ESTs selecionados como induzidos pelo tratamento com etanol, foi possível selecionar o gene ERD (early responsive dehydration) como candidato para identificação e caracterização da sua seqüência promotora. O EST do gene ERD apresentou um perfil de expressão interessante, com expressão basal baixa durante os tratamentos controle e indução da expressão após a primeira hora de tratamento com etanol. Estudos realizados com várias espécies de plantas demonstram que o sistema alc é um sistema eficiente de expressão gênica baseado na indução por etanol. A partir desta informação, desenvolvemos um vetor de expressão contendo o promotor alcA regulando a expressão do gene repórter da ß-glucuronidase e em seqüência, o promotor constitutivo Ubi-1 de milho controlando a expressão do gene alcR, um fator de transcrição indispensável para a ativação do sistema. Posteriormente, esta construção foi utilizada para transformação genética de plantas de cana-de-açúcar que no momento estão sendo selecionadas e analisadas quanto a introgressão estável do cassete gênico. Outra etapa do presente estudo foi realizada com o gene SsNAC23, já descrito como induzido por estresse de frio, estresse hídrico e herbivoria. Neste trabalho foi demonstrado que SsNAC23 também é induzido pela aplicação de etanol nas folhas de cana-de- açúcar logo após uma hora de exposição ao agente indutor. Concluindo, os resultados obtidos neste trabalho contribuem para elucidar questões importantes do processo de regulação da expressão gênica induzida por etanol, além da validação de um processo útil para aplicação na agricultura. A partir dos dados gerados nas análises de macroarranjos de cDNA foi possível ainda, validar um novo método de quantificação do erro estatístico resultante das análises realizadas no programa SOM (Self Organizing Maps) / Abstract: The sugarcane is a very important crop in Brazil, the biggest producer of the World. Besides sugar, the sugarcane is also used to produce ethanol, a very important renewable source of energy in Brazil. Nowadays this crop is responsible for generation of thousands of job positions directly and indirectly linked to the sugar and ethanol industry and market. Since the sugarcane is getting an important role in the Brazil economy, Brazilians researchers are focusing a lot of work in this crop to breed new varieties with improved traits and better adaptation to stressing environmental, such as cold, poor and acid soils, and attack of pests and diseases. Other important field of study is the improvement of sucrose content to increase the efficiency of ethanol production. The development of a genetic system triggered by an external stimulus and able to modify the plant metabolism may be very useful to improve productivity and quality, besides the cost reduction of sugarcane production. This technology might permit Brazil to increase the expansion of this crop without degrading the environmental. Therefore, the aim of this work was the identification of an efficient system of gene expression induced by ethanol. The technique of cDNA array was used to check the expression of 3,575 ESTs isolated from sugarcane leaves previously treated with ethanol. Seventy ESTs showed expression profile altered by ethanol. Among these ESTs with altered expression we have identified sequences encoding proteins involved with transcription and translation and genes previously reported as responsive to abiotic and biotic stresses. Forty eight of the 70 ESTs with altered expression were up-regulated by ethanol. The SsNAC23, a gene induced by cold, dry and insect attack, was also responsive to ethanol in this study. The expression of SsNAC23 in sugarcane leaves was increased after one hour of exposition to ethanol. The expression analysis of genes induced by ethanol in arrays filters allowed us select a candidate gene whose promoter region will be identified and studied. The gene chosen was the ERD, Early Responsive to Dehydration, whose expression profile was the absence of expression under control treatment and high induction after one hour of ethanol application. Previous works have showed that the genetic system based in ethanol induction, also known as alc system, can be very useful in crops. This system was tested in several plant species and the results were very promising. Therefore, one of the goals of this work was the production of genetic altered sugarcane plants with the alc system. For that, we have developed an expression cassette using the alcA promoter regulating the expression of the ß -glucuronidase, used as a reporter gene, and the constitutive promoter Ubi-1 from maize controlling the expression of the gene alcR, a transcriptor factor essential to ctivation of the alc system. The transformed sugarcanes are being analysed and selected to construct introgression. The results obtained in this work will contribute to understanding of gene expression regulation using an external and chemical inductor as well as provide new insights to the development of new approaches of gene expression control in sugarcane. Besides that, the array data was also used to validate a new statistical method of error estimation by using the SOM software / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular
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Trocas gasosas e morfometria de plantas de milho inoculadas com Azospirillum brasilense e fungos micorrízicos arbusculares sob adubação fosfatada

Inagaki, Adriano Mitio 22 February 2017 (has links)
Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2017-11-22T19:30:42Z No. of bitstreams: 2 Dout_2017_Adriano_Mitio_Inagaki.pdf: 1950982 bytes, checksum: 0c974aadf10da4670cea7331baf30f39 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-22T19:30:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dout_2017_Adriano_Mitio_Inagaki.pdf: 1950982 bytes, checksum: 0c974aadf10da4670cea7331baf30f39 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The objective of this work was to analyze the development and gas exchange of maize plants under fertilization and inoculation of Azospirillum brasilense in Arbuscular Microrrimal Fungi (AMF), as well as the residual effects of A. brasilense and for the production of phosphorus in corn. Response to nitrogen fertilization. In the greenhouse, no first experiment had two corn crops. For the first cultivation use the block design with four replications, in a 2x4 factorial scheme. Inoculation of A. brasilense and control and four doses of phosphate fertilization (0; 150; 300 and 450 mg dm-3) were tested, without nitrogen fertilization. In the second harvest, a residual effect of the inoculation and P doses was obtained, obtaining the same factorial scheme (2x4) composed of the same treatments, under successive maize cultivation, with nitrogen fertilization. In the second experiment, a randomized block design was used in a 2x5 factorial scheme and four replications. The first factor was the presence and absence of phosphate fertilization and the second factor was the combination of inoculation with A. brasilense and FMA species, resulting in the following treatments: control; Inoculation of A. brasilense; A. brasilense + Acaulospora scrobiculata; A. brasilense + Claroideoglomus etunicatum; E A. brasilense + Gigaspora margarita. Similar shapes of the following variables: stem diameter, leaf number, plant length, root volume, leaf dry matter mass, stem + hem, root, leaf area and SPAD index. Also evaluated were foliar content of N and P, populations of endophytic diazotrophic bacteria in the roots and number of AMF spores in the substrate. Net assimilation rate of CO2 (A), leaf transpiration (E), stomatal conductance (gs) and internal CO2 concentration (Ci). With the results of the first experiment, the inoculation of A. brasilense on corn seeds associated with phosphate fertilization, without addition of nitrogen, resulted in a higher development of the plants at 36 days after emergence (AED). At a dose of 300 mg dm-3 of P, maize plants with nitrogen fertilizer coverage and the remaining population of A. brasilense had a positive effect in relation to the development of the crop. As a consequence of the higher content of P and leaf chlorophyll, the plants showed higher A, E, gs and Ci resulting in higher water efficiency (A/E). In the second experiment, the treatments of A. brasilense + A. scrobiculata and A. brasilense + C. etunicatum resulted in a greater accumulation of leaf N in the absence of phosphate fertilization in relation to treatment without inoculation. The inoculation with increased insulation or foliar content of P when compared to the control treatment. The use of phosphate fertilization resulted in an increase in the gas exchange and, consequently, a greater development of plants. Roots of maize plants submitted to phosphate fertilization had a higher population of diazotrophic bacteria. In the present study, the mycorrhizal spores of A. scrobiculata, C. etunicatum and G. margarita were not observed on the substrate at 30 DAE. / O objetivo do trabalho foi analisar o desenvolvimento e trocas gasosas de plantas de milho conduzidas sob adubação fosfatada e inoculação de Azospirillum brasilense em associação aos fungos micorrízicos arbusculares (FMA), bem como os efeitos residuais do A. brasilense e do fósforo sob segundo cultivo de milho em resposta a adubação nitrogenada de cobertura. Em casa de vegetação, no primeiro experimento houve dois cultivos de milho. Para o primeiro cultivo utilizou-se o delineamento em blocos ao acaso com quatro repetições, em esquema fatorial 2x4. Testou-se a inoculação de A. brasilense e tratamento sem inoculação, e quatro doses de adubação fosfatada (0; 150; 300 e 450 mg dm-3), desprovido da adubação nitrogenada. No segundo cultivo foi avaliado o efeito residual da inoculação e doses de P, obtendo o mesmo esquema fatorial (2x4) composto pelos mesmos tratamentos, sob cultivo sucessivo de milho, com adubação nitrogenada de cobertura. No segundo experimento utilizou-se delineamento em blocos ao acaso em esquema fatorial de 2x5 e quatro repetições. O primeiro fator foi composto pela presença e ausência de adubação fosfatada e o segundo pela combinação da inoculação com A. brasilense e espécies de FMA resultando nos seguintes tratamentos: sem inoculação; inoculação de A. brasilense; A. brasilense+Acaulospora scrobiculata; A. brasilense+Claroideoglomus etunicatum; e A. brasilense+Gigaspora margarita. Foram realizadas análises das seguintes variáveis: diâmetro de colmo, número de folhas, comprimento de plantas, volume de raiz, massa de matéria seca de folhas, colmo+bainha, raiz, área foliar e índice SPAD. Também se avaliou o teor foliar de N e P, população de bactérias diazotróficas endofíticas nas raízes e número de esporos de FMA no substrato. Avaliou-se ainda índices de trocas gasosas: taxa de assimilação líquida de CO2 (A), transpiração foliar (E), condutância estomática (gs) e concentração interna de CO2 (Ci). Com os resultados do primeiro experimento constatou-se que a inoculação de A. brasilense em sementes de milho associada à adubação fosfatada, sem adição de nitrogênio, proporcionou maior desenvolvimento de plantas aos 36 dias após emergência (DAE). Sob dose de 300 mg dm-3 de P, plantas de milho conduzidas com adubação nitrogenada de cobertura e população remanescente de A. brasilense, demonstraram efeito positivo em relação ao desenvolvimento da cultura. Em consequência do maior teor de P e clorofila foliar, as plantas apresentaram maior A, E, gs e Ci resultando em maior eficiência no uso da água (A/E). No segundo experimento, os tratamentos de A. brasilense+A. scrobiculata e A. brasilense+C. etunicatum resultaram maior acúmulo no teor foliar de N na ausência da adubação fosfatada, comparado ao tratamento sem inoculação. A inoculação com A. brasilense de forma isolada aumentou o teor foliar de P quando comparado ao tratamento sem inoculação. A utilização da adubação fosfatada resultou em aumento nas trocas gasosas e em consequência, maior desenvolvimento de plantas. Raízes de plantas de milho submetido à adubação fosfatada apresentaram maior população de bactérias diazotróficas. No presente estudo, não foi observado esporos micorrízicos de A. scrobiculata, C. etunicatum e G. margarita, no substrato aos 30 DAE.

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