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Aplicação de técnicas de mineração de texto na recuperação de informação clínica em prontuário eletrônico do paciente / Application of text mining techniques in clinical information retrieval in the electronic patient record

Carvalho, Ricardo César de [UNESP] 08 May 2017 (has links)
Submitted by RICARDO CÉSAR DE CARVALHO (ricdon@gmail.com) on 2017-06-02T04:41:34Z No. of bitstreams: 1 Mestrado_Ricardo_Carvalho.pdf: 4464660 bytes, checksum: ba1819b77212278eb1a2808fd9658e4c (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-06-02T13:47:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carvalho_rc_me_mar.pdf: 4464660 bytes, checksum: ba1819b77212278eb1a2808fd9658e4c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T13:47:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carvalho_rc_me_mar.pdf: 4464660 bytes, checksum: ba1819b77212278eb1a2808fd9658e4c (MD5) Previous issue date: 2017-05-08 / Na área da saúde, as tecnologias digitais fornecem recursos para a geração, controle, manutenção e arquivamento dos dados vitais dos pacientes, pesquisas biomédicas, captura e disponibilização de imagens diagnósticas. Ao criar grandes bancos de dados sobre a saúde das pessoas, o processamento das informações contidas no prontuário do paciente permitirá uma nova visão a respeito do conhecimento atual do processo de diagnóstico médico. Existem diversos problemas nessa área, porque o acesso ao prontuário analógico é complicado, e em formato eletrônico não está disponível para todos, apesar do conhecido potencial desses documentos como fonte informacional. Uma das formas para a organização desse conhecimento é por meio da mineração de textos, que possibilita o processamento dos dados descritos em linguagem natural. Entretanto, é preciso levar em consideração o fato da redação médica não poder ser padronizada, embora exista a normativa do Conselho Federal de Medicina que orienta nessa direção. É neste contexto, que esta pesquisa se norteia com o objetivo básico de investigar a aplicabilidade da metodologia de mineração de textos para a extração de informações provenientes da anamnese de prontuários eletrônicos do paciente divulgados no ciberespaço visando a qualidade na recuperação de informações. Trata-se de uma pesquisa de cunho exploratório, tendo-se realizado a mineração de textos sobre um conjunto de 46 anamneses divulgadas no ciberespaço visando a recuperação de informação. Em seguida, fez-se um cotejamento com os dados recuperados de forma manual, efetuando-se a interpretação da linguagem de comunicação médico-paciente. Esses dois resultados foram registrados em um protótipo construído e simulando o ambiente de um consultório médico. Os resultados evidenciam que a utilização da mineração de texto como ferramenta de extração na busca e recuperação de informações em saúde encontrou diversas dificuldades decorrentes das inúmeras formas de se redigir uma anamnese, além dos erros ortográficos, erros gramaticais, remoção de sufixos e prefixos, sinônimos, abreviações, siglas, símbolos, pontuações, termos e jargões médicos. Esse fato evidencia que ao se planejar um sistema computacional ele deve ser capaz de interpretar informações descritas de inúmeras formas, não excluindo palavras importantes ou ignorando aqueles relevantes que poderiam colocar em risco as ações de cuidados do paciente. Ao aplicar os processos de tokenization, remoção de stopwords, normalização morfológica, stemming e cálculo da relevância, conjuntamente contribuíram para que os termos resultantes fossem muito diferentes daqueles extraídos manualmente, ou seja, há ainda muitos desafios em cada uma dessas etapas na busca da qualidade na recuperação de informações concernente à anamnese. Conclui-se que embora a mineração seja uma ferramenta útil ao se tratar de textos estruturados e de outros domínios, quando aplicada a anamnese que é um texto mais livre tal ferramenta deixa a desejar, posto que ao se tratar da área da saúde, a redução de termos compostos, bem como a utilização de siglas, símbolos, abreviaturas ou outra forma de redução linguística trará interferências danosas para a recuperação de informação. A construção do protótipo ilustra a criação de uma ferramenta leve e intuitiva aplicando os conceitos discutidos nessa dissertação, além de se tornar o pontapé inicial de trabalhos futuros. / In the health area, digital technologies provide resources for the generation, control, maintenance and vital patient data archiving biomedical research, diagnostic images capture and availability. By creating large databases on people´s health records, processing the information contained in the patient's medical record, will provide a new insight into current knowledge of the medical diagnostic process. There are several problems in this area, because the access to analogical records is very complex and electronic format is not available for all of them, despite the known potential of these documents as informational source. One of the ways to arrange this knowledge is by the text mining which enables the data processing in natural language. However, it is necessary to consider the fact that medical writing cannot be standardized, although there is a Federal Council of Medicine policy that directs to that path. This is the context which this research is guided by the basic goal of investigating the methodology applicability of text mining for extracting information from the anamnesis of patients' electronic medical records divulged in cyberspace and aiming at the quality of information retrieval. This is an exploratory research, with texts mining on a set of 46 anamnesis published in cyberspace aimed at information retrieval. Then, a comparison was made with the data retrieved manually, to the interpretation of the medical-patient communication language. Those two results were recorded in a prototype built and simulating the environment of a doctor's office. The results show that the use of text mining as an extraction tool in the search and retrieval of health information has found several difficulties due to the numerous ways of writing an anamnesis, besides spelling errors, grammatical errors, deletion of suffixes and prefixes, synonyms, abbreviations, acronyms, symbols, punctuations, medical terms and jargon. It shows that when planning a computer system, it should be able to interpret information described in different ways, not excluding important words or ignoring relevant ones that could jeopardize patient care actions. By applying the processes of tokenization, stopwords, morphological normalization, stemming and calculus of relevance, altogether contributed to showing that the resulting terms were very different from those extracted manually. There are still many challenges in each of those steps concerning quality in the anamnesis information retrieval. Concluding that although mining is a useful tool when dealing with structured texts and other domains, when applied to anamnesis, which is a freer text, such tool lacks efficiency, since in health area the compound terms reduction, as well as the use of acronyms, symbols, abbreviations or other forms of linguistic reduction will bring harmful interference to the retrieval of information. The prototype is a light and intuitive tool applied to the concepts discussed on this dissertation, which way become the kickoff of a future project.
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Integração de modelos de processos de negócio com modelos de requisitos de software : um caso na área de saúde

Silva, Fernanda Gomes 23 August 2016 (has links)
The first steps in the software development life cycle are crucial for a successful software product. In this scenario, modeling activities play an important role in the requirements specification and other activities throughout the Project. Although the modeling activities of business processes and activities related to Requirements Engineering are recognized as important individually, some approaches have considered the integration of these activities. In this context, this master thesis proposes an approach and corresponding guidelines for integration of modeling software requirements with SysML and modeling of business processes and workflows with the support of BPMN. This relationship is represented with both graphical models and tabular format. Therefore, software developers can track business processes and software requirements already during the initial activities of the software development process. The proposed approach has been presented to a group of systems analysts, university professors and master students. These participants answered to a questionnaire based on TAM theory mostly agreeing that integrating BPMN and SysML will contribute positively for documentation , validation and tracking requirements. Despite their interest in learning more about the two languages, they declared di culty in performing integration and the cost to use this proposal in projects in industry. This work has also presented a report of the experience in HU / UFS and a guide to integration of BPMN and SysML to assist the development of a patient’s Electronic Health Record in a public hospital. / Os primeiros passos no ciclo de vida de desenvolvimento de software são cruciais para um produto de software bem sucedido. Neste cenário, as atividades de modelagem desempenham um papel importante na especificação de requisitos e demais atividades em todo o projeto. Embora as atividades de modelagem de processos de negócio e as atividades relacionadas com a Engenharia de Requisitos sejam reconhecidas como importantes individualmente, algumas abordagens têm considerado a integração destas atividades. Neste contexto, este trabalho propõe uma abordagem e orientações correspondentes à integração dos modelos de processos de negócio elaborados com BPMN e modelos de requisitos de software com SysML. Essa relação é representada tanto com modelos gráficos como em formato tabular. Portanto, os desenvolvedores de software podem rastrear os processos de negócio e requisitos de software já durante as atividades iniciais do processo de desenvolvimento de software. A abordagem proposta foi apresentada a um grupo de analistas de sistemas, professores universitários que lecionam a disciplina Engenharia de Software e estudantes de mestrado do curso de Ciência da Computação da Universidade Federal de Sergipe, e respondendo a um questionário baseado na teoria TAM afirmaram que a integração BPMN e SysML irá contribuir positivamente nas atividades de documentação, validação e rastreamento de requisitos. Apesar do interesse em aprender mais sobre as duas linguagens, os participantes na pesquisa declararam a dificuldade em realizar a integração e o custo em utilizar esta proposta em projetos reais. Neste trabalho foi ainda apresentado um relato da experiência no Hospital Universitário da Universidade Federal de Sergipe (HU/UFS) e um guia para integração de modelos elaborados com BPMN e SysML, para auxiliar o desenvolvimento de um prontuário eletrônico do paciente em um hospital público.
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A tecnologia da informação como instrumento para gestão estratégica hospitalar: um estudo de caso sobre a contribuição do Prontuário Eletrônico do Paciente - PEP - para a gestão hospitalar do hospital beneficente Maria Vitória - PE

Méllo, Antônio Charles Lucena de Oliveira 18 February 2013 (has links)
Submitted by Antonio Charles Lucena de Oliveira Mello (charleslucena@gmail.com) on 2013-11-03T04:59:56Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO MESTRADO ANTONIO CHARLES LUCENA DE OLIVEIRA MELLO VERSAO FINAL COM FOLHA DE ASSINATURA E FICHA CARTOGRAFICA.pdf: 691540 bytes, checksum: 6e28ea04b5b21c4a646f2f1060eb082e (MD5) / Approved for entry into archive by ÁUREA CORRÊA DA FONSECA CORRÊA DA FONSECA (aurea.fonseca@fgv.br) on 2013-11-18T19:03:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO MESTRADO ANTONIO CHARLES LUCENA DE OLIVEIRA MELLO VERSAO FINAL COM FOLHA DE ASSINATURA E FICHA CARTOGRAFICA.pdf: 691540 bytes, checksum: 6e28ea04b5b21c4a646f2f1060eb082e (MD5) / Approved for entry into archive by Marcia Bacha (marcia.bacha@fgv.br) on 2013-11-25T11:06:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO MESTRADO ANTONIO CHARLES LUCENA DE OLIVEIRA MELLO VERSAO FINAL COM FOLHA DE ASSINATURA E FICHA CARTOGRAFICA.pdf: 691540 bytes, checksum: 6e28ea04b5b21c4a646f2f1060eb082e (MD5) / Made available in DSpace on 2013-11-25T11:07:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO MESTRADO ANTONIO CHARLES LUCENA DE OLIVEIRA MELLO VERSAO FINAL COM FOLHA DE ASSINATURA E FICHA CARTOGRAFICA.pdf: 691540 bytes, checksum: 6e28ea04b5b21c4a646f2f1060eb082e (MD5) Previous issue date: 2013-02-18 / This study aims to identify the perception that managers Maria Victoria Hospital Society located in the state of Pernambuco has about the contribution of the Electronic Patient Record - PEP - for the strategic management of the Hospital. This work is focused on three major pillars, namely: Hospital Administration and its main features, Information Technology - IT as a strategic tool for the management and use of the Electronic Patient Record and its peculiarities. With regard to the methodology used, is a case study of the kind of research used as the means were bibliographic, documental and field. The findings raised will be used to contribute to the advancement in the field of public administration, more specifically, the managers' perception of the potential contribution of PEP as a strategic tool in the management of Maria Victoria Hospital. / O presente estudo teve objetivo identificar qual a percepção e expectativas que os Gestores da Sociedade Hospitalar Maria Vitória localizada no Estado de Pernambuco tem acerca da contribuição do Prontuário Eletrônico do Paciente – PEP – para a gestão estratégica do Hospital. Este trabalho está focado em três importantes pilares, a saber: Administração Hospitalar e suas principais características, a Tecnologia da Informação – TI como ferramenta estratégica para a gestão e a utilização do Prontuário Eletrônico do Paciente e suas peculiaridades. No que se refere à metodologia aplicada trata-se de um estudo de caso, o tipo de pesquisa utilizado, quanto aos meios, foram bibliográfica, documental e de campo. As conclusões suscitadas servirão no sentido de contribuir para o avanço em matéria de administração pública, mais especificamente, a percepção dos gestores da potencial contribuição do PEP como ferramenta estratégica na gestão do Hospital Maria Vitória.
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Desafios da gestão de uma base de dados de identificação unívoca de indivíduos: a experiência do Projeto Cartão Nacional de Saúde no SUS / Challenges of managing a database of unique identification of individuals: the experience of the National Health Card Project in SUS

Magalhães, Marcelo de Araujo January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2011-05-04T12:36:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010 / A Base de Dados de Identificação Unívoca de Indivíduos voltada para o SUS constitui uma base de informações relacionada ao processo de identificação unívoca dos indivíduos formando, juntamente com as bases de informações de Profissionais de Saúde e Estabelecimentos de Saúde o que podemos chamar de bases de dados estruturantes para os Sistemas de Atenção à Saúde. Estas bases de dados estruturantes contribuíram para aconstrução de um alicerce de informações para o SUS, tornando-se referência para os Sistemas de Atenção à Saúde no Brasil. Sua construção se deu para que fosse possível o desenvolvimento e implantação de uma solução informatizada contratada pelo Ministério da Saúde. O presente trabalho inicia-se com o estudo da história de desenvolvimento desta solução informatizada, denominada de Projeto do Cartão Nacional de Saúde, e seu contexto histórico de construção iniciado em 1999. Por meio de revisões bibliográficas, análise de documentos institucionais produzidos pelo Ministério da Saúde, e as principais escolas formadoras e produtoras de estudos sobre o tema, além da experiência profissional do autor, são discutidas as soluções encontradas para o projeto procurando dar ênfase aos aspectos de desenvolvimento e tecnologias empregadas, dentro do contexto político institucional e organizacional do seu processo histórico de criação. Realiza-se ainda exposição do panorama da situação atual (2008) do projeto e suas bases estruturantes, com destaque para a gestão da Base de Identificação Unívoca de Indivíduos do SUS. Por fim,procura-se contribuir com discussões e conclusões que permitam sua consolidação como uma base de dados de identificação unívoca de indivíduos para o SUS e, desta forma, ser capaz de atender às demandas dos Sistemas de Atenção à Saúde. / The Brazilian HealthCare System (SUS in portuguese) Database of Unique identification of Individuals is a database of information related to the process of unique identification of individuals, together with the Healthcare Individual Provider and Healthcare Provider Information Databases, form what we call the structuring databases for the health care information systems. These databases contributed to building a foundation of information for the SUS, becoming a reference for the Health Care Systems in Brazil. Its construction was done to make possible the development and implementation of a computerized solution contracted by the Ministry of Health. This work begins with the study of the history of development of this computerized solution, called Projeto do Cartão Nacional de Saúde (National Healthcare Card), which began in 1999, and its historical context. Through literature review, analysis of institutional documents produced by the Health Ministry and by the main schools on the subject, beyond the professional experience of the author, this study presents the solutions to the project, seeking to emphasize the development process and the technologies employed, taking into account the institutional and political context of its evolution. It also shows the current situation (2008) of the project and is structuring databases, with emphasis on the management of Database of Unique Identification of Individuals. Finally, we seek to contribute with discussions and conclusions that allow the consolidation of a database of unique identification of individuals for SUS and thus be able to meet the demands of the Brazilian health care information systems.

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