Qu’est-ce que la vie privée? Bien qu’il puisse sembler s’agir d’une question simple, les façons de concevoir et de définir la vie privée sont diffuses et nombreuses dans les sciences sociales et plus largement dans la société. Ce concept, celui de la vie privée, est d’autant plus important et complexe dans l’ère du numérique car il est maintenant relié aux phénomènes de la production massive d’information (c.-à-d., mégadonnées) et de la multiplication des technologies informatiques. Ces phénomènes marquent la transition de nos sociétés vers un nouveau paradigme de la technologie et de l’information dans lequel ces éléments subissent des changements qualitatifs et quantitatifs sans précédent. Pour les sciences sociales et pour la criminologie, étudier des phénomènes sociaux comme la vie privée dans l’ère du numérique est un terrain relativement peu exploré qui présente certains défis permettant une réflexion théorique, épistémologique, ontologique et méthodologique. Le plus grand de ces défis est la place qu’on accorde aux non-humains et au contexte matériel à chacune des étapes de la démarche scientifique. L’impact et la présence des technologies dans toutes les sphères du quotidien fait en sorte qu’il est impossible de séparer le monde social du monde matériel. Cette perspective ne fait toutefois pas l’unanimité dans une communauté scientifique où la séparation entre nature et culture est encore canonique à bien des égards. Cela donne lieu à une autre tendance qu’ont les études de la vie privée, soit de tomber dans une instrumentalisation du monde matériel ou dans un discours qui positionne les objets comme étant une force déterminante du social. Par la suite, la vie privée n’est pas seulement polysémique, elle rassemble une grande variété d’enjeux qui traversent les frontières de l’ensemble des sciences sociales. Comme il existe plusieurs enjeux qui peuvent être considérés importants, cela fait en sorte qu’il est difficile de produire une définition universelle qui soit utile pour tous. Un troisième défi se rattache à la méthodologie qui est généralement utilisée pour étudier la vie privée. Indépendamment de la discipline, les études de la vie privée vont généralement se concentrer sur un nombre restreint d’enjeux (p. ex. la sécurité, la surveillance, l’information). Ceci fait en sorte que plusieurs portraits partiels de la vie privée sont produits et communiquent difficilement les uns avec les autres. Par exemple, la criminologie adopte généralement un discours dénonciateur des atteintes qui sont faites à la vie privée et accorde peu d’importance à des questions comme le transfert d’information ou la gestion de services pour la population d’une ville. Ces deux questions sont pourtant centrales à l’étude de la vie privée en communications et en sciences politiques. Cette tendance à fragmenter l’étude de phénomènes sociaux selon des sujets de plus en plus restreints a pour effet de produire des analyses qui évacuent une partie de la complexité associée à la multitude d’éléments sociotechniques, qui doivent être mobilisés dans l’articulation d’une vie privée. Afin de tenter de répondre à ces problèmes, la démarche que nous mobilisons cherche à articuler ensemble la criminologie, la technologie et la vie privée dans une approche pluridisciplinaire et plus particulièrement en fonction d’une ontologie relationnelle. En effectuant cette articulation, nous cherchons un positionnement dans un courant des sciences sociales qui vise à élargir le nombre d’objets de recherche au sein des disciplines, tout en renouant avec la complexité et la multidisciplinarité au sein de leurs démarches. Pour ce faire, deux principes structurent l’ensemble de notre approche. Tout d’abord, il est question d’adopter ce que certains ont nommé le tournant matériel en sciences sociales. C’est-à-dire, prendre en compte la matérialité, la place des objets et les dispositifs technologiques dans la production du social. Ensuite, le second principe structurant de notre approche est celui du pragmatisme. Une approche pragmatique nous permet de délaisser l’épistémologie surplombante d’un chercheur qui tente de définir la vie privée selon des critères préétablis. Cela se fait au profit d’une posture restitutive qui rend aux acteurs le pouvoir d’expliquer leur réalité. En combinant ces principes, nous nous positionnons dans une ontologie que nous qualifions comme étant relationnelle et symétrique. Pour réunir ces deux principes dans une démarche théorique et méthodologique cohérente, je mobilise des concepts de la théorie de l’acteur-réseau (en anglais, « Actor-Network Theory »; ANT) et de la sociologie de la traduction. L’ANT met en place un cadre théorique qui permet d’observer les humains et les non-humains de la même manière. La sociologie de la traduction prend la base conceptuelle de l’ANT et offre une méthode avec laquelle les acteurs humains et non-humains peuvent être observés lors du processus où ils s’assemblent, articulent et problématisent une réalité commune. Afin d’accomplir ces objectifs et de démontrer les mérites théoriques, méthodologiques et pratiques de ma démarche, nous proposons une analyse en trois volets qui prend la forme de ce que nous nommons : visites guidées du numérique. Ces trois visites illustrent comment le processus de traduction se déroule lorsque nos observations sont effectuées du point de vue d’un guide dont le rapport au contexte matériel est différent (c.-à-d., un guide humain, un guide hybride et un guide non-humain). Dans la première visite guidée, nous observons l’acteur-réseau traduit par une firme d’experts-consultants (c.-à-d., des humains) dont la préoccupation est l’utilisation, la gestion et le transfert de l’information contenue dans les mégadonnées. Dans la deuxième visite guidée, nous suivons des sites web, et plus particulièrement les avis en matière de protection de la vie privée qui s’y trouvent. Cette deuxième visite nous transporte directement dans l’espace numérique, où les humains et les non-humains sont présents de façon proportionnelle. Finalement, notre troisième visite nous invite à suivre les associations qui se font à chacune des étapes du transfert d’un courriel, de l’envoi à la réception, et ce dans un espace où le rôle actif des humains est secondaire à celui des non-humains. Cette troisième visite a pour but d’illustrer comment un enjeu comme la vie privée, qui peut sembler être le résultat d’une construction humaine, est en fait aussi dépendant de l’assemblage et de la forme d’un contexte matériel. Ces visites permettent d’observer et de conclure qu’il n’existe pas une seule vie privée, mais bien plusieurs. Ces vies privées sont le produit d’assemblages résultant du travail collectif et continuel d’actants à la fois humains et non-humains. En adoptant simultanément le tournant matériel et une posture pragmatique, nous proposons que la criminologie se positionne de sorte à observer des éléments du social sur lesquels son regard ne se porte pas de façon générale, tout en renouant avec la complexité. Finalement, ce regard qui est possible grâce à l’ANT permet de mieux rendre compte des interactions qui se produisent dans une société où nous sommes entrés dans une nouvelle ère technologique.

L'environnement professionnel est une source multifactorielle d'expositions où des nuisances d'origine industrielle, chimique ou toxique interagissent pour produire des effets néfastes sur la santé. Le Réseau National de Vigilance et de Prévention des Pathologies Professionnelles (RNV3P) est une base de données où des médecins spécialistes enregistrent des Problèmes de Santé au Travail (PST) à la suite d'un interrogatoire professionnel avec le patient. Un PST est défini comme l'association entre une pathologie et des expositions professionnelles multiples (1 à 5 nuisances, un métier et un secteur d'activité). Les objectifs consistent à développer une approche prenant en compte la multi-exposition professionnelle pour surveiller et détecter les PST potentiellement émergents. Ce travail débute par l'investigation des méthodes et outils statistiques existants pour la surveillance et la détection des événements sanitaires émergents. Nous décrivons ensuite la base de données du RNV3P, son activité et les travaux de recherche déjà réalisés, puis définissons le concept d'émergence au sens des données du RNV3P. Dans un premier temps, nous avons développé une approche basée sur les réseaux relationnels, appelée "Exposomes", qui permet de caractériser et surveiller les expositions professionnelles simples ou multiples potentiellement en cause dans la survenue de la pathologie. A partir du processus d'enregistrement des PST, nous avons dans un deuxième temps développé des travaux de modélisation, appelés "Fonctions Expertes", et construit une stratégie pour détecter des Problèmes de Santé au Travail potentiellement émergents. / The occupational environment is a multifactorial source of exposures where industrial, chemical or toxic hazards interact to produce adverse effects on health. The French national occupational disease surveillance and prevention network (called RNV3P for Réseau National de Vigilance et de Prévention des Pathologies Professionnelles) is a database of Occupational Health Problems (OHPs) defined by physician scientists after a professionnal examination with the patient. An OHP is defined as an association between a disease and a set of occupational exposures (1 to 5 hazards, poste and activity sector). Objectives consist in developing an approach taking into account occupational multi-exposure for temporal surveillance of OHPs and identifying potentially emerging OHPs. This work begins with investigation of existent methods and statistical tools for surveillance and detection of emerging public health events. We then describe the RNV3P database, activity and researches already done, and then we define the concept of emergence in the sense of RNV3P data. First, we developed an approach based on relational networks, called "exposome" which is used to characterize and monitor single or multiple occupational exposures potentially involved in the onset of the disease. Second, from the OHP registration process, we develop a modeling work, called "Experts Functions", and built a strategy to detect potentially emerging OHPs.

La franchise se définit comme « un système de commercialisation de produits et/ou de services » (Code de Déontologie). Trois éléments essentiels la caractérisent avec la fourniture d’une enseigne et de signes de ralliements de la clientèle, la transmission de savoir-faire et une assistance continue tout au long du contrat. Le franchiseur concède au franchisé le droit d’exploiter un concept avec l’obligation pour ce dernier de respecter l’ensemble des règles et procédures mises au point part le franchiseur. Cette relation inter organisationnelle présente un intérêt particulier pour la problématique du contrôle du fait de deux caractéristiques importantes l’indépendance juridique et financière des parties et l’interdépendance économique. Notre thèse porte sur l’étude du contrôle et son évolution tout au long de la relation de franchise. Une étude exploratoire nous a permis de proposer un modèle global et dynamique du contrôle reposant sur un séquençage de la relation en quatre phases et sur la mise en œuvre d’un contrôle pluriel. Dans une optique confirmatoire, nous avons réalisé une double enquête quantitative auprès de franchiseurs et franchisés de réseaux de franchise de service. Les résultats montrent l’existence d’une dynamique du contrôle tout au long de la relation avec un contrôle de conformité des opérations qui décroit au fur et à mesure de l’acquisition et la maitrise des savoir-faire, un contrôle d’efficacité de l’exploitation qui s’oriente vers une recherche d’efficience par la fourniture d’outils de gestion et un contrôle social qui se développe par une intégration progressive des franchisés dans la vie du réseau / A franchise is defined as “a system of marketing products and/or services”, (Code of Ethics). It is characterized by three essential elements : the provision of the franchisor’s distinctive signs and trade-marks, in-house training, and supervisory services throughout the length of the contract. The franchisor grants the franchisee the right to operate a concept with the requirement that he comply with all the rules and procedures developed by the franchisor. This inter-organizational relation raises a particular interest with regard to the question of control because of two important aspects : the legal and financial independence of both parties as well as their economic interdependence. Our thesis focuses on the study of control and how it evolves throughout the franchise relationship. An exploratory study allowed us to propose a dynamic and global model of control based on the sequencing of the relationship in four phases as well as the implementation of multiple controls. To corroborate our findings, we carried out a double quantitative study of franchisors and franchisees involved in networks that market services. The results point to the existence of a dynamic approach to control throughout the relationship: with compliance verifications of operations that decrease gradually as the acquisition and mastery of know-how increases; with performance controls of the business oriented towards gaining efficiency through the provision of management tools; and with a social control that develops through the gradual integration of franchisees in the life of the network

L'avènement du web 2.0, centré utilisateur, a fait émerger une quantité importante d'informations (personnelles, collectives, partagées, "aimées", etc.). Ces informations peuvent constituer une aide pour les utilisateurs en les guidant vers l'information recherchée. Cependant, cette quantité rend l'accès à l'information partagée de plus en plus difficile, vu la diversité des contenus qui peuvent intéresser l'utilisateur. La désorientation de l'utilisateur est donc l'un des principaux problèmes liés aux médias sociaux. Pour surmonter ce problème, l'adaptation constitue une solution classique qui peut être appliquée dans un contexte social. Avec l'évolution des réseaux sociaux, de nouvelles notions apparaissent comme la navigation sociale, qui est une manière de naviguer en étant influencé par les autres utilisateurs du réseau. Une autre notion importante est celle de "tag". Ce terme définit les annotations sociales créées par les utilisateurs et associées à des ressources. La navigation peut être dès lors effectuée aussi bien par les liens qu'à travers les tags. Adapter la navigation sociale, signifie la rendre plus ciblée pour chaque utilisateur selon ses intérêts. Concrètement, cela peut se faire en recommandant à chaque utilisateur des tags, qu'il pourra suivre ou non. Pour cela, il faut garantir une détection adéquate des intérêts de l'utilisateur ainsi que la prise en compte de leur évolution. Cependant, nous sommes confrontés à des limites liées à : i) la détection des intérêts, puisque ces derniers peuvent être déduits de plusieurs ressources sociales (des amis, des ressources, des tags, etc.). Leur pertinence est primordiale afin de garantir un résultat d'adaptation adéquat. ii) la mise à jour du profil utilisateur. En effet, l'utilisateur social, est caractérisé par sa grande activité sociale, et par conséquent ses intérêts doivent refléter ses "vrais" intérêts à chaque période de temps afin d'aboutir à une adaptation fiable. Afin de résoudre les problèmes affectant la qualité d'adaptation de la navigation sociale cités ci-dessus, nous avons proposé en premier lieu, une approche de détection des intérêts de l'utilisateur. Cette approche analyse les tags des utilisateurs selon le contenu de leurs ressources respectives. La plupart des recherches ne considèrent pas l'exactitude des tags vis-à-vis du contenu des ressources : cette exactitude reflète si l'utilisateur peut vraiment être intéressé par le contenu ou pas. Les tags précis sont ceux qui reflètent fidèlement le contenu des ressources. Ceci est effectué grâce à l'interrogation du réseau de l'utilisateur et de l'analyse de son comportement d'annotation. Notre approche repose sur l'hypothèse qu'un utilisateur qui annote la ressource par des tags reflétant le contenu de ladite ressource, reflète mieux ses "vrais" intérêts. Nous avons proposé en deuxième lieu, une approche de mise à jour des intérêts des utilisateurs. Nous nous sommes intéressés aux techniques d'enrichissement du profil utilisateur est effectué par l'ajout des intérêts jugés pertinents à un moment donné. L'enrichissement dans un contexte social est effectué selon l'information sociale comme les personnes proches qui partagent avec l'utilisateur des comportements en communs, selon le comportement d'annotation des utilisateurs, et selon les métadonnées des ressources annotées. Le choix de ces informations est effectué selon l'étude de leur influence sur l'évolution des intérêts de l'utilisateur. L'approche d'enrichissement nous a servi à proposer des recommandations (de tags) selon les nouveaux tags ajoutés au profil utilisateur.Ces deux contributions ont été testées sur la base sociale Delicious. Elles ont montré un taux de précision assez important. Elles ont aussi prouvé leur efficacité par rapport à des méthodes classiques. De plus, le taux d'ambigüité associé aux tags a été fortement réduit, grâce au filtrage implicite des tags non pertinents par rapport au contenu des ressources. / The advent of Web 2.0, user-centered, has given rise to a significant amount of information (personal, collective, shared, "loved", etc.). This information is a way to help users and guide them to the information sought. However, this quantity makes access to shared information more and more difficult, given the diversity of content that may interest the user. Disorientation of the user is one of the main problems related to social media. To overcome such problem, adaptation is a standard solution that can be applied in a social context. With the evolution of these social networks, new concepts appear such as social navigation, which is a way to navigate while being influenced by other users in the network: Another important concept is that of "tag". This term is defined as social annotations created by users and associated to resources. Navigation can be therefore carried out by both links and tags. Adapting social navigation means making it more targeted for each user according to their interests. In practice, this can be done by recommending tags to each user, so he can follow or not. To adapt the social navigation, we must ensure proper detection of the user's interests and taking into account their evolution. However, we are faced with some problems: i) the detection of interest, since they can be derived from several social resources (friends, resources, tags, etc.). Their relevance is primordial to ensure adequate adaptation result. ii) updating the user profile. Indeed, the social user, is characterized by its great social activity, and therefore its interests should reflect its "real" interest each time period in order to achieve a reliable adaptation. To solve the problems affecting the quality of adaptation of social navigation quoted above, we first proposed a method for detecting the user's interests. This proposal aims to overcome the detection of irrelevant interests issues. This approach analyzes the user tags depending on the content of their respective resources. Unlike most research, who do not consider the accuracy of tags with the contents of resource, the accuracy reflects whether the user is really interested with the content or not. This is done by querying the user's network and analysis of the user annotation behavior. The approach is based on the assumption that a user annotates the resource by tags reflecting the content of this resource better reflects its "true" interests. Following the proposal of the interests of detection approach, we conducted second, the treatment of the problem of updating these interests. We were interested to the user profile enrichment techniques, performed by adding interests deemed relevant at a given time. The enrichment in a social context is performed according to social information such as neighbours who share the user behaviors in common, according to the user annotation behavior, and according to the metadata annotated resources. The choice of such information shall follow the study of their influence on the changing interests of the user. The approach we used enrichment propose recommendations (tags) according to the new tags added to the user profile. Both contributions were tested on the social database Delicious. They showed a sizeable accuracy rate. They have also proven their efficiency compared to conventional methods. In addition, the rate of ambiguity associated with the tags has been greatly reduced, thanks to the implicit filtering of irrelevant tags relative to resource content.

Dans cette thèse nous abordons le problème de la conception de passerelle IPsec très haut débit pour la sécurisation des communications entre réseaux locaux. Pour cela, nous proposons deux architectures : une passerelle purement logicielle sur un unique serveur, dite intégrée, et une passerelle utilisant plusieurs serveurs et un module matériel cryptographique, dite en rupture. La première partie de nos travaux étudie l'aspect performance des deux architectures proposées. Nous commençons par montrer qu'un serveur sur étagère est limité par sa puissance de calcul pour atteindre l'objectif de chiffrement et communication à 10 Gb/s. De plus, les nouvelles cartes graphiques, bien que prometteuses en terme de puissance, ne sont pas adaptées au problème du chiffrement de paquets réseau (à cause de leur faible taille). Nous mettons alors en place une pile réseau répartie sur plusieurs machines et procédons à sa parallélisation dans le cadre de l'architecture en rupture. Dans un second temps, nous analysons l'intégration d'une passerelle dans un réseau, notamment l'interaction du protocole de contrôle ICMP avec IPsec. ICMP est particulièrement important pour atteindre de haut débit par son implication dans le mécanisme d'optimisation de la taille des paquets. Pour cela, nous avons développé IBTrack, un logiciel d'étude du comportement des routeurs, par rapport à ICMP, le long d'un chemin. Nous montrons ensuite qu'ICMP est un vecteur d'attaque contre IPsec en exploitant un défaut fondamental des normes IP et IPsec : le surcoût des paquets IP créé par le mode tunnel entre en conflit avec le minimum de la taille maximale prévue par IP. / In this thesis, we explore the design of a high-bandwidth IPsec gateway to secure communications between local networks. We consider two gateway architectures: the first one, called "integrated gateway", is a purely software approach that uses a single server; the second one, called "split architecture", relies on a hardware security module and two servers. The first contribution of this thesis consists in an evaluation of both architectures on the performance side. We show that an off-the-shell server lacks processing capacities to sustain 10 Gb/s networking and ciphering. Moreover, although new graphic card architectures seem promising, they are not appropriate to cipher network packets. Therefore we have designed and evaluated a prototype for the split architecture. Particularly, we show that the 10 Gb/s goal is hard to reach when using only the standards sizes and no software aggregation method, which creates jitter. The second contribution of this thesis concerns the gateway integration inside a network, mainly on the ICMP/IPsec interaction level. Given the importance of ICMP in the Path Maximum Transmission Unit discovery (PMTUd), we developed IBTrack, a software which aims at characterizing router's behavior, with regards to their ICMP handling, along a path. Afterwards, we show that ICMP can be used as an attack channel on IPsec gateways by exploiting a fundamental flaw in the IP and IPsec standards: the IPsec tunnel mode overhead conflicts with the minimum maximal size of IP packets.

Durant cette thèse nous nous sommes intéressés aux réseaux métaboliques et notamment leur modélisation sous forme d'un graphe bipartite dirigé pondéré. Ce dernier permet d'étudier la production d'éléments cibles métaboliques regroupés dans une biomasse à partir de composants provenant du milieu de croissance de l'organisme. Nous nous sommes plus particulièrement penchés sur le rôle des métabolites internes au réseau et la notion d'essentialité de ces derniers pour la production d'une biomasse dont nous avons raffiné la définition dans le cas d'une étude de flux (métabolite essentiel du point de vue de la productibilité du réseau et métabolite essentiel du point de vue de l'efficacité du réseau) puis étendu cette dernière dans le cas d'une étude topologique (métabolite essentiel du point du vue de la persistance du réseau). Nous nous sommes pour cela reposés sur le formalisme d'un part de Flux Balance Analysis et ses dérivés, et d'autre part d'expansion de réseau, afin de définir un métabolite essentiel (ou carrefour), nous permettant de mettre au point un package python (Conquests) cherchant les carrefours dans un réseau métabolite. Nous avons appliqué ce dernier à six réseaux métaboliques dont quatre provenant d'espèces modèles (iJO1360, iAF1260et iJR904 d'E. coli et Synecchocystis) et les deux autres d'espèces plus spécifiques (A. ferrooxidans et T. lutea). Nous avons aussi défini le concept de cluster de métabolites essentiels du point du vue de la persistance du réseau lié aux composants de la biomasse auxquels ils sont nécessaires et que nous avons appliqué sur les six réseaux métaboliques précédents et sur 3600 réseaux dégradés du réseau iJR904de E. coli puis reconstruits selon trois méthodes de gapfilling (Gapfill, Fastgapfill et Meneco) afin de comparer ces dernières. Ces études nous ont permis de mette en avant l'importance de métabolites internes dans la production de composés cibles. / In this thesis we are interested in metabolic networks and, in particular, their modelling with a weighted directed bipartite graph. This representation makes it possible to study the production of target metabolic elements, constituting a biomass, from components coming from the growth medium of the organism. We focused on the role of metabolites inside the network and the notion of essentiality for this elements for the production of a biomass whose definition we have refined in the case of a flow study (metabolite essential for biomass producibility and metabolite essential for biomass efficiency) and extended this notion in the case of a topological study (metabolite essential for biomass sustainability). We rely on the formalism of Flux Balance Analysis and its derivatives, and of network expansion, in order to define an essential metabolite (ME or crossroad), allowing us to develop a python package (Conquests) looking for crossroads in a metabolic network. We applied our concept to six metabolic networks, four of which came from model species (iJO1360, iAF1260 and iJR904 of E. coli and Synecchocystis) and the other two from more specific species (A. ferrooxidans and T. lutea). We have also defined the concept of cluster of ME-sustainability, related to the biomass components to which they are required and which we have applied over the six previous metabolic networks and over 3600 degraded networks of iJR904 of E. coli and reconstructed according to three methods of gapfilling (Gapfill, Fastgapfill and Meneco) to compare the results. These studies have allowed us to highlight the importance of internal metabolites in the production of target compounds.

Depuis sa démocratisation dans les années 1990, Internet est devenu un milieu technologique et symbolique d’échanges à échelle mondiale dans lequel les individus d’une grande partie de la planète se retrouvent. En effet, permettant à tout un chacun d’y accéder non seulement comme récepteur, mais également comme émetteur et producteur, ce milieu se présente depuis ses origines comme un milieu ouvert à la participation de chacun des utilisateurs. Cette propriété apparaît prometteuse pour des artistes qui depuis les années 1960 sont à la recherche de nouvelles formes à travers lesquelles provoquer la participation d’un public de plus en plus anesthésié par les médias de masse et le rapport de consommation qui lui est associé. À travers cette recherche, nous proposons d’aborder la question de la participation dans les dispositifs d’art sonore en réseau télématique dits participatifs. Terme employé pour qualifier un grand nombre d’activités, la notion de « participation » nous apparaît problématique à une époque où l’hypercontrôle est au coeur d’une société de plus en plus informatisée. Tenter de comprendre les enjeux en termes de participation de ces nouvelles formes apparues avec les réseaux télématiques nécessite de les inscrire auparavant dans un processus plus large qui est celui des transformations organologiques supportant et engendrant le processus d’individuation psychosociale à partir duquel est construite toute sensibilité. Pour cela, le concept de transindividuation proposé par Bernard Stiegler à partir de Gilbert Simondon, mais aussi d’André Leroi-Gourhan, nous paraît fondamental,car il permet d’inscrire la participation au sein d’un circuit qui dépasse les seules actions.Nous proposons ainsi d’étudier ces nouvelles formes d’art sonore en réseau au regard d’une histoire du circuit de la sensibilité musicale à partir de la notion de dispositif. Il s’agit de rediriger l’attention vers une organologie élargie, en étudiant les formes d’organisations spatiales,temporelles et relationnelles des différentes périodes historiques, dans l’objectif de dégager leur fonctionnement en termes de circuit de participation. L’étude de l’organologie propre aux dispositifs d’art sonore en réseau requiert d’un plus grand élargissement qui dépasse largement le cadre de la musicologie, ce qui nous conduit à importer des outils d’étude issus d’autres disciplines scientifiques. C’est en adoptant cette approche généalogique et organologique que les enjeux en termes de participation de ces nouvelles « formes dispositifs » peuvent être ainsi étudiés dans leur complexité. / Since its democratization in the 1990s, the Internet has become a technological and symbolic medium for global exchanges in which individuals from a large part of the world find themselves. Indeed, enabling everyone to access not only as receiver, but also as transmitter and producer, this environment presents itself from its origins as an environment open to the participation of each user. This property appears promising for artists who since the 1960s are looking for new forms through which to provoke the participation of a public increasingly anesthetized by the mass media and the relationship of consumption associated with it. Through this research, we propose to address the issue of participation in sound art devices in telematic networks known as participatory. A term used to describe a large number of activities, the notion of "participation" seems problematical to us at a time when hypercontrol is at the heart of an increasingly computerized society. To try to understand the stakes in terms of the participation of these new forms appeared with the telematic networks requires to include them before in a broader process which is that of the organological transformations supporting and generating the process of psychosocial individuation from which all sensitivity is constructed . To do this, the concept of transindividuation proposed by Bernard Stiegler from Gilbert Simondon, but also from André Leroi-Gourhan, seems fundamental to us, because it allows participation in a circuit that goes beyond actions alone. We propose to study these new forms of networked sound art in the light of a history of the circuit of musical sensitivity from the notion of device. It is a question of redirecting attention to an enlarged organology by studying the spatial, temporal and relational forms of the various historical periods, with the aim of identifying their functioning in terms of participation patterns. The study of the organology specific to the devices of sound art in network requires a greater enlargement that goes far beyond the framework of musicology, which leads us to import tools of study coming from other scientific disciplines. It is by adopting this genealogical and organic approach that the stakes in terms of the participation of these new "device forms" can thus be studied in their complexity.

Cette recherche traite du phénomène immersif dans les mondes virtuels accessibles « grâce à » internet. Second Life sert de terrain d'analyse car il permet de discuter trois régimes immersifs : le perceptif, le narratif et le lien social. Au traversd'une approche formelle (Simmel) et de la théorie de l'acteur-réseau (ANT, Latour), nous analysons diverses médiations conditionnant ces régimes : les villes modélisées dans Second Life sont étudiées de façon approfondie comme le lieu duvivre ensemble et de l'hétérogénéité des publics et des usages.Notre thèse qui s'appuie sur la sociologie a également recours aux sciences de l'information et de la communication, à la philosophie, à la géographie de l'espace social et aux digital humanities. Il s'agit d'une approche transdisciplinaire sollicitant des matériaux variés : observations participantes, entretiens, questionnaires. Nous développons une techniqueautomatisée de « tracking » pour générer des « Big Data » permettant l'analyse des pratiques spatiales des avatars dans l'univers digital.Nous montrons que l'immersion dépend des choix de l'utilisateur (point de vue visuel, choix des activités, etc.) et des qualités et possibles de Second Life (architecture technique, carte du monde, forme du cadre bâti, etc.). Des phénomènes d'appropriation et d'attachement entre des acteurs et des lieux sont décrits et permettent de constater la formalisation d'un« chez-soi ». Les diverses étapes de ce travail contribuent à une théorie de l'habiter dans les mondes virtuels / This research deals with the phenomenon of immersion in virtual worlds which are accessible "thanks to" the internet. Second Life is used as fieldwork because it allows to discuss three immersion regimes: perceptive, narrative andsocial ones. Through a formal approach (Simmel) and actor-network theory (ANT, Latour), we analyze various mediations which condition these immersion regimes: cities modeled in Second Life are studied in depth as the place to live togetherand as heterogeneous audiences and uses.Our thesis which is based on sociology also uses information and communication sciences, philosophy, geography of social space, and digital humanities. It is a transdisciplinary approach using various methods: participant observations,interviews, questionnaires. We develop an automated tracker to generate "Big Data" for the analysis of spatial practices of avatars in the digital world.We show that the immersion depends on the choice of the user (visual point of view, choice of activities, etc.) and on qualities and potentialities of Second Life (technical architecture, world map, shape of the built environment, etc.).Appropriation and attachment phenomena between actors and locations are described and allow us to observe the formalization of a "home". The various steps of this work contribute to a theory of habitat in virtual worlds

L’accumulation récente de données de séquences génomiques a montré que l’évolution des gènes n’est pas strictement arborescente. De nombreux processus évolutifs, comme l’exon shuffling, la fusion de gènes ou la recombinaison illégitime remodèlent les gènes, créant des structures composites, formées de parties dont les histoires évolutives sont différentes. Le développement de réseaux de similarité de séquences fournit un cadre analytique permettant d’étudier l’impact de ces processus sur l’évolution moléculaire, en structurant les relations de ressemblance entre séquences et en formalisant en termes de graphes la détection de gènes (triplets intransitifs) et de familles de gènes (cliques minimales séparatrices) composites. La taille des jeux de données actuels, de l’ordre de plusieurs millions de séquences, a également requis le développement de nouveaux outils et méthodes : parallélisation des comparaisons de séquences, visualisation de très grands réseaux par simplification en communautés de Louvain et identification de grands cycles. Appliquées à des jeux de données de génomes eucaryotes et viraux, ces méthodes ont démontré la présence de gènes composites dans tout le vivant et les éléments génétiques mobiles. En proportion, les gènes composites sont plus nombreux dans les génomes eucaryotes ; en nombre absolu, ils sont plus nombreux à être portés par des virus. Chez ces derniers, la distribution fonctionnelle des gènes composites est biaisée (enrichissement dans les familles essentielles pour la perpétuation du cycle viral), et les éléments des gènes composites trouvent même parfois leurs origines dans le matériel génétique de classes virales différentes. Plus généralement, l’étendue des processus combinatoires, en révélant des liens évolutionnaires autres que les liens d’homologie au sens fort, justifie une étude pluraliste des relations de similarité entre séquences. / The recent accumulation of genomic sequence data has shown that gene evolution is not strictly tree-Like. Many evolutionary processes, like exon shuffling, gene fusion or nonhomologous recombination remodel genes by creating composite structures that are made from parts with different evolutionary histories. The development of sequence similarity networks provides an analytical framework to study the impact of these processes on molecular evolution, by structuring the resemblance relationships between sequences and by formalizing, in terms of graph theory, the detection of composite genes (intransitive triplets) and gene families (clique minimal separators). The size of current data sets, typically several million sequences, has also required the development of new tools and methods: sequence comparison parallelization, large networks visualization with Louvain communities and large cycles identification. When applied to eukaryotic and viral genome data sets, these methods have shown that composite genes are found throughout cellular organisms and mobile genetic elements. Proportionally, composite genes are more numerous in eukaryotic genomes; in absolute number, they are more numerous in viruses. In the latter, composite genes functional distribution is biased (enrichment of genes families that are essential for the perpetuation of the viral cycle), and the various parts of composite genes sometimes even originate from the genetic material of different viral classes. More generally, the extent of combinatorial processes, by unravelling other evolutionary bonds than homology bonds in the strictest sense, legitimates a pluralistic study of similarity relationships between sequences.

Le réseau de distribution électrique français, construit dans une optique de desserte d'électricité depuis les centrales de production en amont, vers les consommateurs en aval, est aujourd'hui le lieu de transits d'énergie multi-sens et dont la charge instantanée dépend à la fois des consommations et des productions locales. Il faut donc moderniser les modèles d'exploitation des réseaux actuellement utilisés.C'est dans ce contexte que le gestionnaire du réseau de distribution de la Vienne SRD, et les différentes équipes du laboratoire LIAS, ont cherché à mettre en place un outil d'optimisation des schémas d'exploitation des réseaux de distribution d'électricité de la VIENNE.Dans cette thèse, le trnvt1il s'est porté principalement sur la modélisation du problème et non sur les méthodes de résolution. En effet, le contexte industriel du développement de l'outil d'optimisation du réseau a permis de se rapprocher au mieux de la réalité des informations disponibles concernant le réseau électrique. Et il est apparu plus pertinent d'utiliser des méthodes de résolution exactes tout en recherchant à simplifier le modèle complexe de représentation du réseau électrique. Ainsi,un modèle simple d'optimisation basé sur le problème de Bot à coût minimum a été mis en place et une étude comparative a été réalisée avec les modèles complexes présents dans la littérature.Ce premier modèle a été reformulé et rendu convexe et quadratique, et permet ainsi d'obtenir des performances supérieures en terme de temps de résolution à solution égale. Le problème d'optimisation simplifié a aussi été élaboré pour permettre de prendre en compte un horizon de temps dans l'optimisation du réseau électrique', afin de prendre en compte des profils de consommation et de production au cours du temps. En effet, ceci permet ainsi de prendre en compte des variations liées au comportement des consommateurs et des producteurs reliés au réseau.Et pour finir. ces modèles d'optimisation ayant pour objectif d'être inséré dans un outil d'aide à la décision pour une utilisation dans un contexte industriel. différentes contraintes liées à l'exploitation des réseaux électriques ont été insérées au modèle.Différents cas d'études issus de la littérature sont présentés pour valider la pertinence du modèle au regard des méthodes existantes. Nous avons pu expérimenter en simulation notre optimisation de réseau sur données de réseaux réels, ce qui a démontré l'applicabilité de la démarche à des problèmes de tailles importantes correspondant à la réalité du réseau électrique de SRD. / The French electrical distribution network was originally built to bring electricity from very large producers to consumers, but it has now become a place of multi-directional energy flows that rely on local production and consumption. Because of this new situation, the way of operating electrical networks needs to be renewed. In light of this, the local Distribution System Operator (SRO) of the French department Vienne and the different teams of the LIAS laboratory have worked together on the development of a distribution network configuration optimization tool. In this thesis the majority of the work was focused on the modeling part of the problem rather than on the development of new optimization methods. The industrial root of this project gave the opportunity to be very close to the reality of the available network data. Based on those observations,it was more consistent to use exact and precise optimization methods to solved simplified versions of the complex electrical network models.Thus a simple optimization model based on the minimum cost flow problem was developed, and a comparative study between the developed model and state of the art more complex one was led. This simple model was reformulated to become convex and quadratic and to reach better resolution time performances with the same solutions. This optimization problem was developed to take into account a time horizon factor into the optimization of the operation planning of the distribution network. The time horizon factor aim to represent the production and consumption variation over a selected period. Finally. because this model has to be integrated into a decision making helping tool that will be used by the DSO SRD several operational constraints were added into the optimization model. Several state of the art case studies arc presented to validate the model accuracy regarding existing methods. Simulation experiments were done on real networks data to show the applicability of the proposed optimization model over large scale case studies which correspond to the DSO SRO reality.