Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-12-19Bitstream added on 2014-06-13T18:44:27Z : No. of bitstreams: 1 cicero_eas_dr_jabo.pdf: 499254 bytes, checksum: 2953fb8dcadff8a6c63acdb3bda489bc (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A bactéria B. thuringiensis caracteriza-se pela produção de proteínas tóxicas a representantes de diversas ordens de insetos, as quais são codificadas por genes cry. Este trabalho foi realizado com objetivo de selecionar isolados de B. thuringiensis por meio da caracterização morfológica e molecular identificando as diferentes subclasses dos genes cry3, cry7, cry8, cry9 e cry35 e determinar a patogenicidade contra Sphenophorus levis, que é uma das mais importantes pragas da cultura da cana-de-açúcar. Foram utilizados 1128 isolados de B. thuringiensis e com a observação em microscópio com contraste de fases foram confirmadas como pertencentes à espécie de B. thuringiensis e três linhagens padrões. O material genético foi extraído pela matriz de troca iônica “Instagene Matrix” e submetido a PCR com iniciadores gerais cry3, cry7, cry8, cry9 e cry35 identificando-se 45 isolados com produto de amplificação para coleópteros, os quais juntamente com as linhagens padrões de B. thuringiensis var. tenebrionis, var. morrissone e var. tolworthi e testemunhas foram utilizados para a realização do bioensaio. A análise discriminante alocou os isolados em três grupos quanto à toxicidade de B. thuringiensis e os grupos ficaram assim definidos: um grupo de BAIXA efetividade, com 19,60% do total dos isolados, nesse grupo ficaram as testemunhas e uma linhagem padrão B. thuringiensis var. morrissone e isolados do LGBBA; um grupo de MÉDIA efetividade, com 66,67% do total dos isolados, nesse grupo ficaram duas linhagens padrões B. thuringiensis var. tolworthi e var. morrissone e isolados do LGBBA e um grupo com ALTA efetividade com 13,72% do total dos isolados do LGBBA, os quais podem ser considerados promissores no controle biológico de S. levis. / Molecular characterization and selection of B. thuringiensis isolates exhibiting potential control on Sphenophorus levis larvae. Bacillus thuringiensis is characterized by the production of toxic proteins to insects from a number of different orders which are coded by the cry genes. This work was developed aiming to select B. thuringiensis isolates using morphological and molecular analysis so as to identify different cry genes subclass for cry3, cry7, cry8, cry9 and cry35 and also to determine the pathogenicity levels against Sphenophorus levis larvae, that is one of the most important sugar-cane pests. As much as 1128 bacterial isolates together with three control strains were used and for the phase contrast microscopy and molecular analysis. The genetic materials were obtained using the Instagene Matrix that is an ionic matrix and the PCR primers used were developed for cry3, cry7, cry8, cry9 and cry35 genes. A total of 45 isolates were selected showing possible amplicons for coleopterans. These isolates together with the standard strains B. thuringiensis var. tenebrionis, var. morrissone a var. tolworthi were used for bioassays. A discriminating analysis has allocated the bacterial isolates within three groups of B. thuringiensis toxicity and these groups were defined as one with LOW effectivity, comprising 19,6% of the isolates and the control strains together with one of the control strains B. thuringiensis var. morrissone. Another group has revealed a MEDIAN effectivity with a total of 66.7% of the isolates including two other control strains B. thuringiensis var. tolworthi e var. morrissone and a third group with HIGH effectivity with 13.7% of the isolates which were considered as promising B. thuringiensis isolates for the control of S. levis larvae.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-12-13Bitstream added on 2014-06-13T19:22:43Z : No. of bitstreams: 1 kishi_lt_dr_jabo_prot.pdf: 679937 bytes, checksum: fee4252e785e3aad08913f7c07f58933 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Bactérias simbiontes conhecidos como rizóbios interagem com raízes de leguminosas e induzem a formação de nódulos fixadores de nitrogênio. Em rizóbios, genes essenciais para simbiose são compartimentalizados em ilhas simbióticas ou em ilhas no cromossoma. Para o entendimento da estrutura e evolução dessas ilhas simbióticas, é necessário analisar seu contexto genético e sua organização. O genoma parcial de B. elkanii SEMIA 587 apresenta hoje um total de 5.821.111 pb seqüenciados contendo 62,6 % de GC em 3941 Contigs, onde foram identificados 5381 ORFs. Uma suposta ilha simbiótica foi localizada através da identificação de genes relacionados à fixação e nodulação em comparação à ilha simbiótica de B. japonicum, encontrando 267 ORFs em B. elkanii, onde 17 ORFs foram identificadas como transposases. Assim, através destes resultados parciais pode ser possível averiguar que B. elkanii provavelmente sofreu um rearranjo genético no cromossoma, já que ele apresenta um tamanho menor que B. japonicum em relação ao tamanho do genoma. / Symbiont bacteria, commonly known as rhizobia interact with root legume and induce the formation of Nitrogen-fixing nodules. Among rhizobia, essential genes for symbioses are compartmentalized either in symbiotic islands or in chromosomal islands. For better understanding of the structure and evolution of these symbiotic islands, it is necessary to analyze their genetic context and organization. The work had as objective to analyze genes related to the symbiotic island in the partial genoma of the B. elkanii strain 587 has 5.821.111 bp sequenced, containing 62,6 % of GC in 3941 Contigs, been identified 5381 ORFs. A purported symbiotic island was localized through of the identification of related genes of fixing nitrogen and nodulation in comparison with the symbiotic island of B. japonicum, founding 267 ORFs in B. elkanii, where 17 ORFs were identified as transposases. So through these partial results could be possible to infer that B. elkanii probably shows a symbiotic island with genetic rearrange into chromosome, because it showed lower genome size than B. japonicum.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-12Bitstream added on 2014-06-13T20:43:09Z : No. of bitstreams: 1 castellane_tcl_dr_jabo.pdf: 1115288 bytes, checksum: c46d10396d02bdc45c92887415f5fd8f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Rhizobium tropici e outras bactérias pertencentes à ordem Rhizobiales são produtores de polissacarídeos extracelulares (EPS), que possuem a função de molécula receptora do micro simbionte, fazendo uma interação célula/célula e desencadeando o processo de nodulação. A diversidade de estruturas e composição química apresentadas pelas moléculas de EPS é refletida pela diversidade de enzimas responsáveis pela sua síntese. Neste trabalho, buscou-se a inativação através da mutagênese insercional por transposição in vitro dos genes exoZ da estirpe selvagem Rhizobium tropici SEMIA 4080 envolvidas na síntese das subunidades repetitivas do EPS e no tanden phbAB, responsáveis pela síntese do PHB, com o intuito de obter microrganismos com aspecto altamente mucoso, produtor superior de EPS em relação a estirpe selvagem. Os mutantes obtidos apresentaram colônias mucosas quando cultivados nos meios de culturas PSYA, demonstrando que estirpes de rizóbio mutantes nos genes exoZ e phbAB são capazes de formar biofilme “in vitro” e, ao avaliar a eficiência relativa na produção de EPS, o mutante 4080 Z03 apresentou o melhor resultado. Para as três amostras de EPS foi possível observar um comportamento de fluxo de líquidos pseudoplástico e, também, a influência da concentração de EPS sobre a viscosidade aparente das soluções aquosas. A estirpe selvagem e todos os mutantes induziram a formação de nódulos em feijoeiro (fenótipo Fix+), sugerindo que os genes exoZ e phbAB não estão envolvidos nos processos de infecção e formação nodular mas, sendo necessários para a fixação biológica de nitrogênio / Rhizobium tropici and other bacteria belonging to the order Rhizobiales are extracellular polysaccharides (EPS) producers, which possess the function of the receptor molecule to function as micro-symbiont, making an interaction cell / cell and triggering the nodulation process. The diversity of structures and chemical composition of EPS presented by molecules is reflected by the diversity of enzymes responsible for its synthesis. In this study, we sought to inactivation by insertional mutagenesis by “in vitro” transposition of genes from wild type exoZ Rhizobium tropici SEMIA 4080 involved in the synthesis of the EPS repeating subunits and phbAB tanden, responsible for synthesis of PHB, in order to obtain microrganisms with high mucosal aspect producer of EPS compared to wild type. The mutants showed mucous colonies when grown in culture media PsyA, demonstrating that mutant strains in genes exoZ and phbAB from rhizobia are able to form biofilm “in vitro”, and to evaluate the relative efficiency in the production of EPS, the mutant 4080 Z03 showed the best result. For the three samples of EPS was possible to observe a flow behavior of pseudoplastic fluids, and also the influence of EPS concentration on the apparent viscosity of aqueous solutions. The wild type and mutants induced the formation of nodules in common bean (Fix+ phenotype), suggesting that genes exoZ and phbAB are not involved in the processes of infection and nodule formation, but are necessary for nitrogen fixation

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-03-07T15:15:55Z No. of bitstreams: 1 PGCS15MA156.pdf: 2654919 bytes, checksum: 53e7b0ccf7729ee5d0e5bb39ed4bd14b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-07T15:15:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCS15MA156.pdf: 2654919 bytes, checksum: 53e7b0ccf7729ee5d0e5bb39ed4bd14b (MD5) Previous issue date: 2015-12-21 / Biological nitrogen fixation involves a series of processes beginning with the adaptation of the bacteria to the plant and terminate in fixation of atmospheric N2, being mediated by a portion of prokaryotes that, though relatively small, exhibits high morphological diversity, physiological, genetic and Phylogenetic. The study aimed to Morphophysiological and genetic characterization of nitrogen fixing bacteria nodulation seven forest legume trees. In all, 79 isolates obtained in winter and summer period, the studied species. Based on the morphological and physiological properties, the isolates were classified into eight groups. For DNA analysis of isolated after amplification with OPA-4 RAPD, there has been a high degree of genetic diversity, obtaining 19 different groups, and for the amplification ERIC gave 18 groups, both with 90% similarity. The populations of rhizobia differ even by PCR-RFLP of the 16S ribosomal gene with the digestion by HinfI restriction endonuclease and were obtained 54 groups with 90% similarity, which could indicate the occurrence of different species within the genus Burkholderia the which prevailed in the study. Although there was a predominance genus Burkholderia, the results indicate that this predominance was due to nutritional and adaptive versatility of its kind, characterizing the high degree of polymorphism and dominance in the study / A fixação biológica do nitrogênio (FBN) envolve uma sucessão de processos que começam com a adaptação da bactéria à planta e culminam na fixação do nitrogênio atmosférico, sendo mediada por uma parcela dos procariotos que, apesar de relativamente pequena, apresenta alta diversidade morfológica, fisiológica, genética e filogenética. O estudo teve por objetivo a caracterização morfofisiológica e genética de bactérias fixadoras de nitrogênio nodulantes de sete leguminosas arbóreas florestais. Ao todo, foram obtidos 79 isolados no período do inverno e verão, nas espécies estudadas. Com base nas propriedades morfofisiológicas, os isolados foram classificados em oito grupos. Pela análise do DNA dos isolados após a amplificação com OPA-4 em RAPD, foi possível constatar um grau elevado de diversidade genética, com a obtenção de 19 grupos distintos e, pela amplificação por ERIC obteve-se 18 grupos, ambas com 90% de similaridade. As populações de rizóbios diferiram ainda pela técnica de PCR-RFLP do gene ribossomal 16S, com a digestão pela endonuclease de restrição HinfI, e foram obtidos 54 grupos com 90% de similaridade, que poderiam indicar a ocorrência de espécies distintas dentro do gênero Burkholderia a qual prevaleceu no estudo. Os resultados indicam que a predominância do gênero Burkholderia ocorreu devido a versatilidade nutricional e adaptativa do gênero, caracterizando assim o elevado grau de polimorfismo e dominância no estudo

Resumo: Rhizobium tropici e outras bactérias pertencentes à ordem Rhizobiales são produtores de polissacarídeos extracelulares (EPS), que possuem a função de molécula receptora do micro simbionte, fazendo uma interação célula/célula e desencadeando o processo de nodulação. A diversidade de estruturas e composição química apresentadas pelas moléculas de EPS é refletida pela diversidade de enzimas responsáveis pela sua síntese. Neste trabalho, buscou-se a inativação através da mutagênese insercional por transposição in vitro dos genes exoZ da estirpe selvagem Rhizobium tropici SEMIA 4080 envolvidas na síntese das subunidades repetitivas do EPS e no tanden phbAB, responsáveis pela síntese do PHB, com o intuito de obter microrganismos com aspecto altamente mucoso, produtor superior de EPS em relação a estirpe selvagem. Os mutantes obtidos apresentaram colônias mucosas quando cultivados nos meios de culturas PSYA, demonstrando que estirpes de rizóbio mutantes nos genes exoZ e phbAB são capazes de formar biofilme "in vitro" e, ao avaliar a eficiência relativa na produção de EPS, o mutante 4080 Z03 apresentou o melhor resultado. Para as três amostras de EPS foi possível observar um comportamento de fluxo de líquidos pseudoplástico e, também, a influência da concentração de EPS sobre a viscosidade aparente das soluções aquosas. A estirpe selvagem e todos os mutantes induziram a formação de nódulos em feijoeiro (fenótipo Fix+), sugerindo que os genes exoZ e phbAB não estão envolvidos nos processos de infecção e formação nodular mas, sendo necessários para a fixação biológica de nitrogênio / Abstract: Rhizobium tropici and other bacteria belonging to the order Rhizobiales are extracellular polysaccharides (EPS) producers, which possess the function of the receptor molecule to function as micro-symbiont, making an interaction cell / cell and triggering the nodulation process. The diversity of structures and chemical composition of EPS presented by molecules is reflected by the diversity of enzymes responsible for its synthesis. In this study, we sought to inactivation by insertional mutagenesis by "in vitro" transposition of genes from wild type exoZ Rhizobium tropici SEMIA 4080 involved in the synthesis of the EPS repeating subunits and phbAB tanden, responsible for synthesis of PHB, in order to obtain microrganisms with high mucosal aspect producer of EPS compared to wild type. The mutants showed mucous colonies when grown in culture media PsyA, demonstrating that mutant strains in genes exoZ and phbAB from rhizobia are able to form biofilm "in vitro", and to evaluate the relative efficiency in the production of EPS, the mutant 4080 Z03 showed the best result. For the three samples of EPS was possible to observe a flow behavior of pseudoplastic fluids, and also the influence of EPS concentration on the apparent viscosity of aqueous solutions. The wild type and mutants induced the formation of nodules in common bean (Fix+ phenotype), suggesting that genes exoZ and phbAB are not involved in the processes of infection and nodule formation, but are necessary for nitrogen fixation / Orientador: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos / Coorientador: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Regiane de Fátima Travensolo Sacomano / Banca: Simone Cristina Picchi / Banca: Jackson Antônio Marcondes de Souza / Banca: Eliamar Aparecida Nascimbem Pedrinho / Doutor

Orientador: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Ricardo Antonio Polanczyk / Banca: Sabrina Moutinho Chabregas / Banca: Janete Apparecida Desidério Sena / Banca: Antonio Sérgio Ferraudo / Resumo: A bactéria B. thuringiensis caracteriza-se pela produção de proteínas tóxicas a representantes de diversas ordens de insetos, as quais são codificadas por genes cry. Este trabalho foi realizado com objetivo de selecionar isolados de B. thuringiensis por meio da caracterização morfológica e molecular identificando as diferentes subclasses dos genes cry3, cry7, cry8, cry9 e cry35 e determinar a patogenicidade contra Sphenophorus levis, que é uma das mais importantes pragas da cultura da cana-de-açúcar. Foram utilizados 1128 isolados de B. thuringiensis e com a observação em microscópio com contraste de fases foram confirmadas como pertencentes à espécie de B. thuringiensis e três linhagens padrões. O material genético foi extraído pela matriz de troca iônica "Instagene Matrix" e submetido a PCR com iniciadores gerais cry3, cry7, cry8, cry9 e cry35 identificando-se 45 isolados com produto de amplificação para coleópteros, os quais juntamente com as linhagens padrões de B. thuringiensis var. tenebrionis, var. morrissone e var. tolworthi e testemunhas foram utilizados para a realização do bioensaio. A análise discriminante alocou os isolados em três grupos quanto à toxicidade de B. thuringiensis e os grupos ficaram assim definidos: um grupo de BAIXA efetividade, com 19,60% do total dos isolados, nesse grupo ficaram as testemunhas e uma linhagem padrão B. thuringiensis var. morrissone e isolados do LGBBA; um grupo de MÉDIA efetividade, com 66,67% do total dos isolados, nesse grupo ficaram duas linhagens padrões B. thuringiensis var. tolworthi e var. morrissone e isolados do LGBBA e um grupo com ALTA efetividade com 13,72% do total dos isolados do LGBBA, os quais podem ser considerados promissores no controle biológico de S. levis. / Abstract: Molecular characterization and selection of B. thuringiensis isolates exhibiting potential control on Sphenophorus levis larvae. Bacillus thuringiensis is characterized by the production of toxic proteins to insects from a number of different orders which are coded by the cry genes. This work was developed aiming to select B. thuringiensis isolates using morphological and molecular analysis so as to identify different cry genes subclass for cry3, cry7, cry8, cry9 and cry35 and also to determine the pathogenicity levels against Sphenophorus levis larvae, that is one of the most important sugar-cane pests. As much as 1128 bacterial isolates together with three control strains were used and for the phase contrast microscopy and molecular analysis. The genetic materials were obtained using the Instagene Matrix that is an ionic matrix and the PCR primers used were developed for cry3, cry7, cry8, cry9 and cry35 genes. A total of 45 isolates were selected showing possible amplicons for coleopterans. These isolates together with the standard strains B. thuringiensis var. tenebrionis, var. morrissone a var. tolworthi were used for bioassays. A discriminating analysis has allocated the bacterial isolates within three groups of B. thuringiensis toxicity and these groups were defined as one with LOW effectivity, comprising 19,6% of the isolates and the control strains together with one of the control strains B. thuringiensis var. morrissone. Another group has revealed a MEDIAN effectivity with a total of 66.7% of the isolates including two other control strains B. thuringiensis var. tolworthi e var. morrissone and a third group with HIGH effectivity with 13.7% of the isolates which were considered as promising B. thuringiensis isolates for the control of S. levis larvae. / Doutor

Orientadora: Eliana Gertrudes Macedo Lemos / Banca: Maria José Valarini / Banca: Haroldo Alves Pereira Junior / Banca: Lúcia Maria Carareto Alves / Banca: Maria Inês Tiraboschi Ferro / Resumo: Bactérias simbiontes conhecidos como rizóbios interagem com raízes de leguminosas e induzem a formação de nódulos fixadores de nitrogênio. Em rizóbios, genes essenciais para simbiose são compartimentalizados em ilhas simbióticas ou em ilhas no cromossoma. Para o entendimento da estrutura e evolução dessas ilhas simbióticas, é necessário analisar seu contexto genético e sua organização. O genoma parcial de B. elkanii SEMIA 587 apresenta hoje um total de 5.821.111 pb seqüenciados contendo 62,6 % de GC em 3941 Contigs, onde foram identificados 5381 ORFs. Uma suposta ilha simbiótica foi localizada através da identificação de genes relacionados à fixação e nodulação em comparação à ilha simbiótica de B. japonicum, encontrando 267 ORFs em B. elkanii, onde 17 ORFs foram identificadas como transposases. Assim, através destes resultados parciais pode ser possível averiguar que B. elkanii provavelmente sofreu um rearranjo genético no cromossoma, já que ele apresenta um tamanho menor que B. japonicum em relação ao tamanho do genoma. / Abstract: Symbiont bacteria, commonly known as rhizobia interact with root legume and induce the formation of Nitrogen-fixing nodules. Among rhizobia, essential genes for symbioses are compartmentalized either in symbiotic islands or in chromosomal islands. For better understanding of the structure and evolution of these symbiotic islands, it is necessary to analyze their genetic context and organization. The work had as objective to analyze genes related to the symbiotic island in the partial genoma of the B. elkanii strain 587 has 5.821.111 bp sequenced, containing 62,6 % of GC in 3941 Contigs, been identified 5381 ORFs. A purported symbiotic island was localized through of the identification of related genes of fixing nitrogen and nodulation in comparison with the symbiotic island of B. japonicum, founding 267 ORFs in B. elkanii, where 17 ORFs were identified as transposases. So through these partial results could be possible to infer that B. elkanii probably shows a symbiotic island with genetic rearrange into chromosome, because it showed lower genome size than B. japonicum. / Doutor

FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico / A degradaÃÃo do solo resultante de prÃticas nÃo conservacionistas pode acarretar prejuÃzos irreparÃveis Ãs propriedades quÃmicas e biolÃgicas do solo de regiÃes semiÃridas do nordeste brasileiro. O objetivo do trabalho foi avaliar alguns atributos quÃmicos do solo, a densidade populacional de rizÃbios nativos, isolar e testar estirpes eficientes na fixaÃÃo simbiÃtica do nitrogÃnio atmosfÃrico no feijÃo-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.), alÃm de avaliar a densidade de fungos micorrizicos arbusculares e a respiraÃÃo basal do solo em quatro Ãreas de exclusÃo (preservadas desde o ano de 2000) e de superpastejo (pecuÃria extensiva) localizadas no municÃpio de IrauÃuba-CE. Foram utilizadas quatro Ãreas de exclusÃo de animais e de superpastejo (adjacentes Ãs Ãreas de exclusÃo), sendo coletadas amostras de solos na profundidade de 0 a 20 cm para analisar alguns atributos quÃmicos (pH, CE, C, N, MO, e P assimilÃvel) e biolÃgicos do solo (densidade de esporos de fungos micorrizico arbusculares e rizÃbios nativos, respiraÃÃo basal do solo), alÃm do isolamento e teste de eficiÃncia das estirpes nativas em relaÃÃo a fixaÃÃo biolÃgica do nitrogÃnio atmosfÃrico. Os experimentos foram conduzidos em casa de vegetaÃÃo e no LaboratÃrio de Microbiologia do Solo pertencente ao Departamento de CiÃncias do Solo da Universidade Federal do CearÃ. Para os testes de eficiÃncia da fixaÃÃo simbiÃtica de nitrogÃnio atmosfÃrico das estirpes nativas isoladas das quatro Ãreas foi adotado um delineamento experimental inteiramente casualizado, com 4 repetiÃÃes. Na Ãrea 1 foram adotados nove tratamentos e quatro repetiÃÃes, sendo um controle com adiÃÃo de nitrogÃnio mineral (+N-R) e um com omissÃo de nitrogÃnio mineral e ausÃncia de inoculaÃÃo C(-N-R); na Ãrea 3 foram adotados oito tratamentos e quatro repetiÃÃes, sendo um controle com adiÃÃo de nitrogÃnio mineral (+N-R) e um com omissÃo de nitrogÃnio mineral e ausÃncia de inoculaÃÃo C(-N-R); na Ãrea 4 o teste foi composto de seis tratamentos e quatro repetiÃÃes, sendo um controle com adiÃÃo de nitrogÃnio mineral (+N-R) e um com omissÃo de nitrogÃnio mineral e ausÃncia de inoculaÃÃo C(-N-R); na Ãrea 5 o teste foi constituindo de quatro tratamentos e quatro repetiÃÃes, sendo um controle com adiÃÃo de nitrogÃnio mineral (+N-R) e um com omissÃo de nitrogÃnio mineral e ausÃncia de inoculaÃÃo C(-N-R). Os tratamentos diferenciados das quatro Ãreas foram estabelecidos de acordo com o total de estirpes isoladas e autenticadas de cada Ãrea de estudo. As atuais prÃticas de manejo do solo empregadas nas Ãreas de exclusÃo de animais (pousio) favoreceram a presenÃa de propÃgulos de fungos micorrÃzicos arbusculares no solo em decorrÃncia da preservaÃÃo da vegetaÃÃo e da conservaÃÃo da camada superficial do solo. As estirpes de rizÃbios nativas isoladas e testadas das Ãreas 1 e 5 estabeleceram simbiose com o feijÃo-caupi, demonstrado uma eficiÃncia fixadora do N 2 razoÃvel, podendo ser em futuros ensaios de competiÃÃo. Evidencia-se a necessidade de que mais estudos em relaÃÃo as propriedades quÃmicas e biolÃgicas dos solos de IrauÃuba-CE sejam realizadas, para que se possa buscar alternativas para a reduÃÃo dos efeitos negativos do processo de degradaÃÃo observados nas Ãreas em estudo. / The soil degradation resulting from non-conservative practices can cause irreparable damage to chemical and biological properties of the soil of semiarid regions in northeastern Brazil. The objective of this research was to evaluate the soil chemical attributes, the population density of rhizobia and its symbiotic fixing efficiency of the atmospheric nitrogen in cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.) in addition to density of arbuscular mycorrhizal fungi and the basal soil respiration in four areas of exclusion and overgrazing located in the municipality of IrauÃuba-CE. Four areas of animal exclusion and overgrazing (adjacent to the exclusion areas) were chosen, with soil samples being collected in the 0 to 20 cm to analyze the chemical attributes pH, Electric Conductivity (EC), Carbon (C),Nitrogen (N), Organic Matter (OM), and assimilable Phosphorus (P) and biological attributes (arbuscular mycorrhizal fungi spores density, rhizobia density and effectiveness and basal soil respiration. The experiments were conducted under greenhouse conditions and, for the atmospheric symbiotic nitrogen fixation performance tests, native strains were isolated from the four areas and a completely randomized design, with four replications, was adopted. In area 1 were used nine treatments and four replications, with a control with the addition of mineral nitrogen (+N-R) and another with mineral nitrogen omission and no inoculation C(-N-R); in area 3 were used eight treatments and four replications, with a control with the addition of mineral nitrogen (+N-R) and with mineral nitrogen omission and no inoculation C(-N-R); in area 4 the test consisted of six treatments and four replications, with a control with the addition of mineral nitrogen (+N-R) and with mineral nitrogen omission and no inoculation C(-N-R); in area 5 the test were used four treatments and four replications and a control with the addition of mineral nitrogen (+N-R) and another with mineral nitrogen omission and no inoculation C(-N-R). The different treatment numbers of the four areas were established according to the total number of isolated and authenticated strains of each study area. The current soil management practices employed in the areas of exclusion of animals (fallow) favored the presence of propagules of arbuscular mycorrhizal fungi in the soil due to the preservation of vegetation and conservation of topsoil. Native rhizobia strains isolated and tested from Areas 1 and 5 established symbiosis with the cowpea and demonstrated a fixing efficiency of N 2 reasonable and can be used in future field trials. More studies on the chemical and biological properties of soils IrauÃuba-CE should be performed so that we can find alternatives for reducing the negative effects of the degradation process observed in the areas under study.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-12-20T18:58:02Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leniany Patrícia Moreira - 2015.pdf: 1645373 bytes, checksum: 6b0d185814dfdfc0f4ba2612f6b87c40 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-12-26T14:13:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leniany Patrícia Moreira - 2015.pdf: 1645373 bytes, checksum: 6b0d185814dfdfc0f4ba2612f6b87c40 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-26T14:13:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leniany Patrícia Moreira - 2015.pdf: 1645373 bytes, checksum: 6b0d185814dfdfc0f4ba2612f6b87c40 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-02-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is a leguminous plant of great importance for the Brazilian population, especially for the poorer population by representing the main source of protein. Common bean can establish symbiosis with nitrogen-fixing bacteria to obtain N from the atmosphere through Biological Nitrogen Fixation (BNF) process. This work aimed to evaluate the agronomic efficiency of rhizobia isolates under field conditions in two sites: Guapó and Santo Antônio de Goiás, by comparison of their results with the commercial strains SEMIA 4077, 4080 and SEMIA SEMIA 4088 of Rhizobium tropici. We evaluated the number of nodules (NN), nodules dry weight (NDW), root dry weight (RDW), shoot dry weight (SDW), stand (S), leaf area (LA), number of pods (NP), number of grains (NG), 100 grains dry weight (100GDW), grain yield (GY) and levels of macro and micronutrients in the shoots of common bean plants. The results revealed significant differences for NN, SDW, NP, NG and GY among the treatments evaluated in Guapó. In the experiment carried out in Santo Antônio de Goiás significant differences were observed among treatments for NDW, RDW, LA, SDW, NP, NG and GY. The content of micro and micronutrients varied significantly among all of the isolates while in Santo Antônio de Goiás no significant differences were found for Fe and Mn. About 70% of the isolates evaluated in Guapó showed relative efficiency of grain yield similar to the strains SEMIA 4077, SEMIA 4080 and SEMIA 4088. In Santo Antônio de Goiás all of the evaluated isolates showed the same efficiency of those strains. The inoculation with the isolates contributed on a significant way for the grain yield increasing with results similar to the N treatment and commercial strains. These results indicate that is possible to find isolates more efficient than the commercial strains on the BNF process. / O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L) é uma leguminosa de grande importância para a população brasileira, principalmente as mais carentes por representar a principal fonte de proteínas. O feijoeiro tem capacidade de se beneficiar da Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN), através da simbiose com bactérias fixadoras pertencentes ao grupo dos rizóbios. No presente trabalho avaliou-se a eficiência agronômica de isolados de rizóbio em condição de campo, comparados às três estirpes comerciais de Rhizobium tropici SEMIA 4077, SEMIA 4080 e SEMIA 4088. Foi avaliado o número de nódulos (NN), massa seca de nódulos (MSN), massa seca de raiz (MSR), massa seca da parte aérea (MSPA), estande (E), área foliar (AF), número de vagens (NV), número de grãos (NG), massa seca de 100 grãos (MS100G), produção de grãos (PG) e teores para macro e micronutrientes na parte aérea de plantas de feijoeiro-comum. Os resultados revelaram que houve diferenças significativas para os tratamentos testados em Guapó para os parâmetros de NN, MSPA, NV, NG e PG. Em Santo Antônio de Goiás houve diferenças significativas para MSN, MSR, AF, MSPA, NV, NG e PG. Foi verificado, na avaliação de macro e micronutrientes no experimento em Guapó, diferenças significativas para todos os nutrientes avaliados. Em Santo Antônio de Goiás não foram verificadas diferenças significativas apenas para Fe e Mn. Cerca de 70% dos isolados testados em Guapó apresentaram eficiência relativa de produção de grãos iguais às estirpes SEMIA 4077, SEMIA 4080 e SEMIA 4088, enquanto em Santo Antônio de Goiás todos os isolados apresentaram a mesma eficiência verificada para as estirpes padrão. A inoculação com isolados de rizóbio contribuiu de forma significativa para o aumento de rendimento de grãos no feijoeiro-comum, com resultados semelhantes ao tratamento TN e às estirpes SEMIA 4077, SEMIA 4080 e SEMIA 4088, sendo um indicativo de que é possível encontrar isolados mais eficientes no processo da FBN que as estirpes comerciais utilizadas atualmente.

Vicibactin is a small, high-affinity iron chelator produced by Rhizobium leguminosarum ATCC 14479. Previous work has shown that vicibactin is produced and secreted from the cell to sequester ferric iron from the environment during iron-deplete conditions. This ferric iron is then transported into the cell to be converted into ferrous iron. This study uses UV-Vis spectroscopy as well as ion trap-time of flight mass spectroscopy to determine that vicibactin does form a complex with copper(II) ions, however, at a much lower affinity than for iron(III). Stability tests have shown that the copper(II)-vicibactin complex is stable over time. The results of this study show that vicibactin could be used in order to remove copper(II) ions from the soil or other media if they are present in toxic amounts. It also suggests that vicibactin’s purpose for the rhizobia could be expanded to include both copper sequestering and to reduce extracellular copper concentrations to prevent toxicity.