Made available in DSpace on 2014-07-29T15:10:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lilian CARLA CARNEIRO Tese.pdf: 936824 bytes, checksum: e49c7ff122a0392ea9e5120fd05064ed (MD5) Previous issue date: 2010-05-31 / A small cryptic plasmid isolated from Salmonella enterica Enteritidis called pVCM04 was sequenced and characterizated. pVCM04 is a 3583 pb circle molecule that showed no homology with other plasmids deposited in the GenBank. 12 ORF with more than 50 aminoacids were predicted using the ORF finder program. ORF1 and ORF2 showed homology with replication proteins of different plasmids. ORF 3-5 showed homology with mobilization proteins present in several plasmids; the others seven ORF showed no homology with genes deposited in GenBank. The pVCM04 possess a region with more than 500 pb that is not associated with none of the predicted proteins. This region is organizated in a G+C rich, A+T rich and two repeat direct sequences. The second repeat direct sequence contains a region of DnaA box connection (TTTACAC). This region is probably associated to the replication origin theta type. The phylogenetic relationship among replicase and mobilization deduced protein showed highest similarity of replicase proteins than mobilization proteins. Conjugation experiments showed that the pVCM04/pUC18 fusion not have a good ability to transfer, the plasmid stability test showed that the cells lost 60% of pVCM04/pUC18 on the first day of cultivation. The characterization suggests that the pVCM04 probably would be a cryptic plasmid from fusion of different ancestral plasmid. / Um pequeno plasmídeo críptico isolado de Salmonella enterica Enteretidis denominado pVCM04 foi sequênciado e caracterizado. O pVCM04 é uma molécula circular com 3583 pb a qual não apresenta homologia com outros plasmídeos depositados no GenBank . 12 ORF ( Open Read Frame ) com mais de 50 aminoácidos foram preditas usando o programa ORFinder. A ORF1 e a ORF2 apresentaram homologia com proteínas de replicação de diferentes plasmídeos. As ORF 3, 4 e 5 apresentaram homologia com proteínas de mobilização presente em vários plasmídeos; as outras sete ORF não apresentaram homologia com genes depositados no GenBank . O pVCM04 possui uma região, com mais de 500 pb, que não está associada a nenhuma das proteínas preditas. Esta região está organizada em uma sequência rica em G+C, A+T e duas sequências repetidas diretas. A segunda sequência repetida direta contém uma sequência de ligação para a proteína DnaA (TTTACAC). Esta região está provavelmente associada com a origem de replicação do tipo theta. As relações filogenéticas para as proteínas deduzidas replicase e de mobilização mostraram maior similaridade para proteínas replicase do que para proteínas de mobilização. Experimentos de conjugação evidenciaram que a fusão pVCM04⁄pUC18 não possui uma boa capacidade de transferência; o teste de estabilidade plasmidial demonstrou que as células perdem 60% do pVCM04⁄pUC18 no primeiro dia de cultivo. A caracterização do pVCM04 sugere que este plasmídeo provavelmente seja um plasmídeo críptico oriundo de diferentes ancestrais.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:37:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_tanise_fortes.pdf: 3529801 bytes, checksum: 88734c926a2abf7729f24c5ee75649d1 (MD5) Previous issue date: 2013-07-25 / Brazil has one of the largest commercial heard of the world and it is a great beef exporter. Meanwhile, for the consolidation of Brazilian exportation of meat in natura and its derivatives it is necessary that the products have food safety. Among the microorganisms used as indicators of food security, Salmonella has a special attention because it causes severe diseases to animals and humans. This study was developed with the objective to isolate Salmonella during the cattle slaughter in a state inspection slaughterhouse located in the city of Pelotas, Rio Grande do Sul. A hundred and fifty samples were collected from three different points of slaughter: leather of the animal after bleeding (P1), the carcass after evisceration (P2) and cecum contents (P3). The isolates were tested for their antimicrobial susceptibility in vitro using amoxicillin, ampicillin and ciprofloxacin. As results, two (1,33%) strains were isolated from bovines and classified as Salmonella. No strain was isolated from buffalos. The two isolates were susceptible to amoxicillin and ciprofloxacin. Besides the investigation of the presence of Salmonella in the cattle flowchart, a review about Salmonella pathogenicity islands (SPI) was performed. According to the results, we conclude that there is the risk of incorporating the bacteria at the slaughter time by the ruminants, contaminating the carcasses. The implementation and maintenance of means to control the quality in the market facilities are important to prevent or reduce the health risk to employees and consumers. / O Brasil possui um dos maiores rebanhos de ruminantes do mundo e destaca-se como um grande exportador de carne. Entretanto, para que a exportação brasileira de carne in natura e seus derivados seja consolidada é importante que o produto tenha segurança alimentar. Entre os micro-organismos usados como indicadores de segurança alimentar, Salmonella se destaca por causar muitas doenças em animais e humanos. Este estudo foi realizado com o objetivo de isolar Salmonella durante o abate de ruminantes em um frigorífico sob inspeção estadual, localizado na cidade de Pelotas, Rio Grande do Sul, que utiliza medidas para o controle de qualidade. Cento e cinquenta amostras foram coletadas de três pontos diferentes do abate: couro do animal após a sangria (P1), carcaça após a evisceração (P2) e conteúdo cecal (P3). Os isolados foram testados quanto à suscetibilidade antimicrobiana in vitro usando amoxicilina, ampicilina e ciprofloxacina. Como resultados, duas (1,33%) cepas foram isoladas de bovinos e classificadas como Salmonella. Nenhuma cepa foi isolada de búfalos. Os dois isolados apresentaram suscetibilidade à amoxicilina e à ciprofloxacina. Além da investigação da presença de Salmonella no fluxograma de ruminantes, foi realizada uma revisão sobre ilhas de patogenicidade em Salmonella (SPI). De acordo com os resultados, conclui-se que existe o risco da bactéria ser incorporada na linha de abate pelos ruminantes e, dessa forma, provocar a contaminação das carcaças. A implementação e a manutenção de medidas para o controle de qualidade nos estabelecimentos são importantes para prevenir ou reduzir o risco à saúde dos funcionários e consumidores.