Les oomycètes représentent un groupe d’organismes très diversifiés responsables de diverses maladies d’animaux et de plantes. En agriculture le mildiou de la pomme de terre, causé par un oomycète phytopathogène, occasionne à lui seul des pertes économiques mondiales annuelles de 3 à 5 milliards de dollars américains. La lutte contre le mildiou de la pomme de terre et de la laitue, causés respectivement par, Phytophthora infestans et Bremia lactucae, repose en grande partie sur l’utilisation de fongicides. Cependant, l’apparition de nouvelles souches résistantes au métalaxyl a réduit de manière substantielle l’efficacité des fongicides de synthèse. De plus, les fongicides doivent être appliqués au moment opportun pour être efficaces contre le mildiou. L’approche par modélisation constitue donc une option intéressante pour améliorer la lutte contre les mildious en offrant la possibilité de prédire les périodes à risque et d’améliorer la régie d’application des fongicides. Toutefois, l’évaluation de ces modèles a montré qu’ils manquent de précision et que leur efficacité varie d’une année à l’autre. Ce manque de précision peut s’expliquer en partie par l’absence de considération de la présence ou de l’abondance de l’inoculum aérien. P. infestans et B. lactucae produisent un inoculum adapté à la dispersion aérienne. Cependant, il existe un manque de connaissance notable dans la littérature sur l’aérobiologie de ces deux oomycètes phytopathogènes. Un modèle de simulation dynamique qui intègrerait l’information sur l’aérobiologie de l’agent pathogène permettrait de prédire plus efficacement les périodes de risque d’infection par le mildiou. Ainsi, l’objectif général de ce projet de doctorat était d’améliorer la connaissance sur l’aérobiologie de deux oomycètes (P. infestans et B. lactucae) dans l’optique de mieux comprendre et prédire les périodes d’infection du mildiou de la pomme de terre et de la laitue. Dans un premier temps, la distribution spatiotemporelle des spores à l’échelle d’une région de production de monoculture de pommes de terre a été déterminée. Les résultats ont montré que la distribution des spores est hétérogène et l’efficacité des mesures prophylactiques peut être évaluée à l’aide de l’aire sous la courbe de progression de l’inoculum aérien. De plus, l’information dérivée de l’implantation d’un réseau de capteur permet de pondérer le risque d’infection estimé par les modèles prévisionnels. Dans un deuxième temps, la relation entre la concentration aérienne de spores et l’intensité du mildiou a été établie. Cette relation a permis de définir des seuils d’intervention basés sur la concentration aérienne de spores. Dans le pathosystème de la pomme de terre, le seuil d’intervention varie en fonction des lignées clonales de P. infestans alors que dans celui de la laitue, ce seuil ne tient pas compte des lignées clonales de B. lactucae. Un outil moléculaire pour le comptage des spores a été développé pour pallier aux inconvénients liés à la quantification des spores au microscope. Les résultats de cette étude ont montré, entre autres, que sous conditions climatiques au Canada deux heures de mouillure sont suffisantes pour l’établissement d’une infection par B. lactucae, contrairement aux trois à quatre heures de mouillure proposées dans la littérature. Dans un troisième temps, un modèle de simulation de la concentration aérienne des spores a été développé. La relation entre le nombre de spores observées à l’heure et le nombre de spores prédit à l’heure est linéaire. Dans plus de 94% des cas, les coefficients de détermination de la régression entre le nombre de spores observées et celui prédit sont supérieurs à 0,7. Même si ce modèle est une première dans la littérature publiée et représente une avancée significative dans l’aérobiologie des oomycètes, il est à améliorer notamment dans l’optique de pouvoir développer un modèle générique comme outil de recherche pour l’étude de l’aérobiologie des oomycètes phytopathogènes. En effet, l’étape à venir sera d’incorporer ce modèle comme module dans un système de support décisionnel pour prédire efficacement l’apparition des symptômes de mildiou. Les auteurs espèrent que ce modèle constituera la base pour le développement d’un modèle générique pour tous les oomycètes phytopathogènes à dispersion aérienne.

Pour traiter des défis écologiques et créer de nouveaux avantages concurrentiels, les entreprises ont besoin de considérer et d’intégrer les aspects environnementaux dans tous les processus de l'entreprise. De nombreuses méthodes environnementales existent, ainsi que des solutions visant leur intégration dans les processus de l’entreprise. Mais la revue de la littérature montre qu’une approche systémique combinant besoins stratégiques et pratiques de l’éco-conception pourrait favoriser cette intégration.Cette thèse, qui s’intègre dans le module « tactique » du projet national ANR-Convergence,vise à fournir un nouveau cadre d’analyse, s’appuyant sur un ensemble de méthodes environnementales. Ce cadre doit permettre d'identifier et de planifier une séquence d’actions appropriée pour une meilleure intégration de l’environnement en entreprise. Ainsi, une analyse claire, visant l’identification de l’ensemble des méthodes et solutions existantes et l’identification de leurs interrelations a été menée.Notre travail a ainsi consisté à identifier les corrélations opérationnelles entre les méthodes via une cartographie, puis a mettre en évidence des relations entre ces méthodes et les besoins dynamiques des entreprises. Ceci nous a permis de proposer au final une approche systémique pour la création de feuilles de route environnementales en entreprise. Ces feuilles de route vont s’adresser aussi bien aux niveaux stratégiques, tactiques qu’opérationnels des entreprises.Les résultats de trois expérimentations menées montrent que les propositions ci-dessus conduisent bien à la création de feuilles de routes appropriées aux besoins réels et souvent dynamiques des entreprises.Ces feuilles de routes tracent ainsi les actions à mener et indiquent les potentiels outils à leur associer,afin d’identifier le processus opérationnel réel et d'organiser le flux de travail entre les différentes fonctions de l'entreprise. / To answer environmental challenge and create new competitive advantages, the companies needto consider and integrate environmental considerations into all its processes. Numerous environmentalmethods exist as well as solutions to integrate them into companies. But, the literature review realisedindicates that a systemic approach combining strategic and practical needs from eco-design couldfacilitate this integration.This thesis, which represents the "tactic" module of the national research project ANR- Convergence,aims to provide a new framework to identify a suitable operational trajectory for a better integration ofenvironmental consideration in companies. Thus, a clear analysis about the identification of theseexisting methods and their interrelationships was realised. Our work was to identify the operativecorrelation between methods via a cartography, then the relationship between those methods and thedynamic needs/contexts of companies to finally propose ” environmental roadmaps. So, we finallypropose a systematic approach to define environmental roadmaps in companies.Those roadmapsconcern the strategis, tactic and operational levels in companies.The results of three academic/industrial experiments demonstrate that all proposals of this thesis couldensure effectively the identification of a suitable systemic trajectories’ group based on actual corporateneeds and its dynamic context. The pre-defined chain of action and the list of available tools providedsupport the company to identify the working process and to organize the workflow between differentcorporate functions.