Thesis--Wisconsin. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 65-67).

Th. doct.-ing.--Nancy, I.N.P.L., 1981.

Orientador: João Manuel Grisi Candeias / Banca: Adriana P. do Vale / Banca: Nancy Cristina J. Bellei / Não disponível / Not available / Mestre

Submitted by Mendes Eduardo (dasilva@ufba.br) on 2012-03-21T22:53:47Z No. of bitstreams: 1 CohindePinho_DISSERTAÇÃO.pdf: 323932 bytes, checksum: 963d9c845dbfff3273be48ebe3b2c251 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-03-21T22:53:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CohindePinho_DISSERTAÇÃO.pdf: 323932 bytes, checksum: 963d9c845dbfff3273be48ebe3b2c251 (MD5) / Capes, Millennium Inorganic Chemicals / The current study investigates the suitability of a tropical cladoceran species, Macrothrix elegans Sars (1901) for toxicity testing in ecotoxicological tests at 250C involving two reference substances, cadmium chloride (CdCl2) both in natural and artificial media, and potassium chloride (KCl) in natural medium. The work provides a comparison among other cladoceran species from tropical and temperate environments, and discusses the potential of M. elegans as a bioindicator of stress in tropical waters. An experiment on the animal’s life-span has been included to assess its reproductive potential. On average, at 250C, M. elegans lives 38.2 ± 4.4 days and each female produces 211.8±30.4 neonates. The criterion of toxicity adopted in the bioassays was mortality/immobility using neonates up to 24-h old. The CdCl2 48-h EC50 mean values and their confidence intervals were 0.035 mg.l-1 [0.020-0.050 mg.l-1] in natural medium, and 0.018 mg.l-1 [0.012-0.024 mg.l-1] in the artificial medium. The KCl 48-h EC50 mean value (natural medium only) was 749.08 mg.l-1 [625.32-872.76 mg.l-1]. The work demonstrates the great potential of M. elegans as a test organism in ecotoxicological tests involving these substances in tropical freshwater ecosystems. / Salvador, Bahia

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-25Bitstream added on 2014-06-13T19:02:42Z : No. of bitstreams: 1 gushi_lt_dr_botib.pdf: 860668 bytes, checksum: f4640ec40c34a33b45f1c604d7f189d2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Leishmaniose Visceral Americana (LVA) é uma doença tropical negligenciada em expansão no Brasil, ocorrendo em áreas onde antes não havia registro. Seu agente etiológico e a Leishmania chagasi um protozoário pertencente à classe Kinetoplastida caracterizada por uma organela denominada cinetoplasto a qual possui um DNA organizado em uma rede contendo maxicírculos, responsáveis pelas funções respiratórias e minicírculos, envolvidos na pordução de RNAs-guia, os quais possuem um papel importante na edição dos RNAs dos maxicírculos. Os minicírculos são divididos em uma região convervada de aproximadamente 120 p.b. e uma região variável de aproximadamente 600 p.b. O foco desse estudo está na análise das seqüências da região variável a fim de entender sua distribuição nos diferentes estágios de vida da L. chagasi. As amostras foram coletadas de cães e pacientes sintomáticos por aspiração dos linfonodos e, em alguns casos, foram obtidas culturas primárias. A extração do DNA foi realizada com o kit comercial Nucleo Spin Blood Kit (Macherey - Nagel) seguindo as instruções do protocolo. O kDNA foi amplificado por PCR, utilizando o par de oligonucleotídeos LIN R4 - forward (5’-GGT TGG TGT AAA ATA GGG-3) e LIN 19 - reverse (5’-GAA CGC CCC TAC CCG-3’), produzindo um fragmento de aproximadamente 720 p.b. Os produtos da PCR foram clonados no vetor pTZ57R/T de acordo com o protocolo do InsTAclone PCR cloning kit. As seqüências (aproximadamente 182) foram individualmente comparadas com as depositadas no GenBank, alinhadas com o software Clustal X2 e tiveram uma árvore filogenética construída utilizando o software MEGA 4.0 adotando o algoritmo UPGMA e escolhendo um bootstrap com 1000 replicatas. A distribuição entre os diferentes hospedeiros foi homogênea. A princípio, um lato polimorfismo é observado, mas... / American Visceral Leishmaniasis (AVL) is a neglected tropical disease in expansion in Brazil currently occurring in areas where there has never been reports. Its etiologic agent is Leishmania chagasi, a protozoan belonging to the order Kinetoplastida characterized by an organelle named kinetoplast wich has a DNA organized in a network containing maxicircles, responsible for respiratory functions and minicircles, involved in the production of guide RNAs, which play a role in the RNA editing of maxicircles. The minicircles are divided into an approximately 120 b.p. conserved region and an approximately 600 b.p. variable region. The focus of this study is on the sequence analysis of the minicircles variable region in order to understand its distribution on different life stages of L. chagasi. Samples were collected from dogs and symptomatic patients by lymphonod aspiration and, in some cases, primary cultures were obtained. DNA extraction was carried out with the commercial kit Nucleo Spin Blood Kit (Macherey - Nagel) following its protocol. kDNA was amplified by PCR, using a pair of oligonucleotides LIN R4 - forward (5’-GGT TGG TGT AAA ATA GGG-3) and LIN 19 - reverse (5’-GAA CGC CCC TAC CCG-3’), producing a fragment of 720 b.p. PCR products were cloned in pTZ57R/T vector according to the InsTAclone PCR cloning kit protocol. Sequences (182) were individually compared with the ones deposited at the GENBANK, aligned with Clustal X2 software and had a phylogenetic tree constructed utilizing MEGA 4.0 software adopting UPGMA algorithm and choosing bootstrap with 1000 replicates. Sequences distribution among different hosts was homogeneous. At first, high polymorphism is observed but, when analyzed in more detail, i.e. by branch, sequences proved to be conserved and minimal SNP (Single Nucleotide Polymorphism) was found... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-03-30Bitstream added on 2014-06-13T20:35:42Z : No. of bitstreams: 1 medeiros_jar_me_botfm.pdf: 769404 bytes, checksum: f2905508191b9ec700953a0b625dfb66 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Not available

Orientador: Wanderley Jose de Melo / Coorientador: José Marques Júnior / Banca: Antonio Sérgio Ferraudo / Banca: Cassio Hamilton Abreu Junior / Resumo: Os metais pesados podem ser encontrados naturalmente em solos, em baixas concentrações, podendo ter seus teores intensificados através de ações antrópicas, tornando-se um dos entraves no manejo de solos tropicais. Estes elementos químicos podem ser encontrados na constituição de adubos orgânicos e inorgânicos, inseticidas, fungicidas, rejeito de mineração e lixo urbano, podendo causar sérios danos ao ambiente e a saúde humana. Conhecer o comportamento dos metais pesados no solo é de suma importância. O objetivo do trabalho foi avaliar a influência dos atributos químicos, granulométricos e mineralógicos sobre adsorção do cádmio, avaliado pelo modelo de Langmuir e Freundlich, e sobre o potencial de disponibilidade de bário e cádmio, avaliado pela eficiência de extratores químicos, em Latossolos que sofreram ou não ação antrópica. As amostras de solo foram coletadas na camada superficial, 0-0,20 m, secas ao ar, peneiradas a malha de 2 milímetros e para caracterização foram realizadas análises químicas, granulométricas e mineralógicas. No estudo de adsorção, foram usadas as concentrações 0, 5, 25, 50, 100, 200, 300 e 400 μg L-1 de Cd, na forma de Cd(NO3)2. Para a construção das isotermas de adsorção, utilizaram-se os modelos de Langmuir e Freundlich. Para estimar o potencial de disponibilidade nos solos, foram utilizados os extratores Mehlich-1, Mehlich-3 e DTPA. Os dados foram analisados por meio das técnicas estatísticas multivariadas, Análises de Agrupamento e Análise de Componentes Principais. Os dados obtidos no experimento de adsorção ajustaram-se perfeitamente aos modelos de Langmuir e Freundlich. O extrator Mehlich-3 se destacou entre os demais extratores testados por extrair maiores teores de bário e cádmio. Os atributos do solo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Heavy metals can be found naturally in soils at low concentrations, can have their contents enhanced by human activities, becoming a major problem in the management of tropical soils. These chemicals can be found in the constitution of organic and inorganic fertilizers, insecticides, fungicides, mining tailings and urban waste, may cause serious damage to the environment and human health. Knowing the behavior of heavy metals in soil is of paramount importance. The objective of this study was to evaluate the influence of the chemical, mineralogical and granulometric on adsorption of cadmium, measured by Langmuir and Freundlich model, and the potential availability of barium and cadmium, evaluated the efficiency of chemical extractors, who have Oxisols or not human activity. Soil samples were collected on the surface of 0-0.20 m, air dried, sieved to 2 mm mesh and analyzes were performed to characterize chemical, textural and mineralogical properties. In the study of adsorption, the concentrations used were 0, 5, 25, 50, 100, 200, 300 and 400 mg L-1 Cd, as Cd (NO 3) 2. For the construction of adsorption isotherms, we used the Langmuir and Freundlich models. To estimate the potential availability in the soil were used Mehlich-1, Mehlich-3 and DTPA. Data were analyzed by means of multivariate statistical techniques, cluster analyzes and principal component analysis. The data obtained in the experiment of adsorption fit perfectly to the Langmuir and Freundlich models. The Mehlich-3 stood out among the other extractants tested by extracting higher levels of barium and cadmium. Soil attributes decisively influenced the adsorption process of cadmium and the potential availability of barium and cadmium. The cluster analyzes and principal components processed with the attributes of soil, availability and... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Paulo Eduardo Martins Ribolla / Banca: Hiro Goto / Banca: Jayme Augusto de Souza Neto / Banca: Cassiano Victória / Banca: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Resumo: Leishmaniose Visceral Americana (LVA) é uma doença tropical negligenciada em expansão no Brasil, ocorrendo em áreas onde antes não havia registro. Seu agente etiológico e a Leishmania chagasi um protozoário pertencente à classe Kinetoplastida caracterizada por uma organela denominada cinetoplasto a qual possui um DNA organizado em uma rede contendo maxicírculos, responsáveis pelas funções respiratórias e minicírculos, envolvidos na pordução de RNAs-guia, os quais possuem um papel importante na edição dos RNAs dos maxicírculos. Os minicírculos são divididos em uma região convervada de aproximadamente 120 p.b. e uma região variável de aproximadamente 600 p.b. O foco desse estudo está na análise das seqüências da região variável a fim de entender sua distribuição nos diferentes estágios de vida da L. chagasi. As amostras foram coletadas de cães e pacientes sintomáticos por aspiração dos linfonodos e, em alguns casos, foram obtidas culturas primárias. A extração do DNA foi realizada com o kit comercial Nucleo Spin Blood Kit (Macherey - Nagel) seguindo as instruções do protocolo. O kDNA foi amplificado por PCR, utilizando o par de oligonucleotídeos LIN R4 - forward (5'-GGT TGG TGT AAA ATA GGG-3) e LIN 19 - reverse (5'-GAA CGC CCC TAC CCG-3'), produzindo um fragmento de aproximadamente 720 p.b. Os produtos da PCR foram clonados no vetor pTZ57R/T de acordo com o protocolo do InsTAclone PCR cloning kit. As seqüências (aproximadamente 182) foram individualmente comparadas com as depositadas no GenBank, alinhadas com o software Clustal X2 e tiveram uma árvore filogenética construída utilizando o software MEGA 4.0 adotando o algoritmo UPGMA e escolhendo um bootstrap com 1000 replicatas. A distribuição entre os diferentes hospedeiros foi homogênea. A princípio, um lato polimorfismo é observado, mas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: American Visceral Leishmaniasis (AVL) is a neglected tropical disease in expansion in Brazil currently occurring in areas where there has never been reports. Its etiologic agent is Leishmania chagasi, a protozoan belonging to the order Kinetoplastida characterized by an organelle named kinetoplast wich has a DNA organized in a network containing maxicircles, responsible for respiratory functions and minicircles, involved in the production of guide RNAs, which play a role in the RNA editing of maxicircles. The minicircles are divided into an approximately 120 b.p. conserved region and an approximately 600 b.p. variable region. The focus of this study is on the sequence analysis of the minicircles variable region in order to understand its distribution on different life stages of L. chagasi. Samples were collected from dogs and symptomatic patients by lymphonod aspiration and, in some cases, primary cultures were obtained. DNA extraction was carried out with the commercial kit Nucleo Spin Blood Kit (Macherey - Nagel) following its protocol. kDNA was amplified by PCR, using a pair of oligonucleotides LIN R4 - forward (5'-GGT TGG TGT AAA ATA GGG-3) and LIN 19 - reverse (5'-GAA CGC CCC TAC CCG-3'), producing a fragment of 720 b.p. PCR products were cloned in pTZ57R/T vector according to the InsTAclone PCR cloning kit protocol. Sequences (182) were individually compared with the ones deposited at the GENBANK, aligned with Clustal X2 software and had a phylogenetic tree constructed utilizing MEGA 4.0 software adopting UPGMA algorithm and choosing bootstrap with 1000 replicates. Sequences distribution among different hosts was homogeneous. At first, high polymorphism is observed but, when analyzed in more detail, i.e. by branch, sequences proved to be conserved and minimal SNP (Single Nucleotide Polymorphism) was found... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Eduarda Figueiredo (eduarda.ffigueiredo@ufpe.br) on 2015-03-12T15:03:27Z No. of bitstreams: 2 Falcao Elisabeth - Tese DOCEAN.pdf: 3017166 bytes, checksum: 501efc5a810247c179abd49b82ac1fc2 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-12T15:03:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Falcao Elisabeth - Tese DOCEAN.pdf: 3017166 bytes, checksum: 501efc5a810247c179abd49b82ac1fc2 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / CNPq / Na costa brasileira, apesar da crescente preocupação em se estabelecer um manejo integrado dos ambientes costeiros, muitas das características ecológicas, como a conectividade entre estes ecossistemas através da movimentação dos peixes, ainda são pouco estudadas. No complexo estuarino do Rio Formoso, litoral sul de Pernambuco – Brasil existe uma variedade de habitats costeiros próximos a sua desembocadura que apresentam relativa proximidade um do outro. Entre eles destacam-se os manguezais, os prados de fanerógamas e os recifes de arenito. Recentemente, foram realizados alguns estudos a respeito da ictiofauna da região, contudo pouco se sabe sobre os padrões de abundância, diversidade e mudanças ontogenéticas de habitats dos peixes que utilizam estes ecossistemas em suas fases iniciais do ciclo de vida, especialmente durante a fase larval. O presente estudo objetivou analisar variações temporais e espaciais de densidade de larvas de peixes coletadas em diferentes habitats no estuário inferior do rio Formoso, buscando evidenciar padrões que indiquem o movimento das larvas ao longo de sua fase larval. Durante o período de abril de 2009 a março de 2011, foram coletadas 432 amostras mensais de ovos e larvas de peixes nos períodos diurno e noturno. Foram realizados arrastos horizontais com rede de plâncton (55 m) durante um intervalo de 10 minutos, em canal de mangue, praia estuarina com manchas de prados e paralelamente à linha de recifes situados na foz do estuário. As variáveis analisadas foram densidade de larvas, de ovos e de estágios larvais, comprimento da larva, diversidade (Shannon-Wiener), equitabilidade (Pielou), salinidade e temperatura. Durante dois ciclos sazonais e em diferentes habitats, o presente estudo determinou padrões sazonais e espaciais da comunidade íctia em fase larval e determinou tendências na preferência por habitat na fase de préassentamento. Isto permitiu gerar dados que indiquem a existência de conectividade entre os habitats. Verificou-se que a comunidade é dominada, em densidade, por espécies residentes do estuário, principalmente Achirus spp., Engraulidae e Atherinela brasiliensis. Sazonalmente não ocorreram alterações na composição das espécies, contudo, a densidade larval em geral foi mais elevada durante a estação de estiagem, indicando ser um período de maior atividade reprodutiva na área. Não foi observada influencia das variáveis ambientais temperatura, salinidade e pluviosidade na estruturação da comunidade, no entanto, a análise de correlação sugeriu que as respostas às variações destes parâmetros foi espécie específica. Os diferentes estágios larvais de algumas espécies apresentaram segregação de habitat, a exemplo de Lile piquitinga, Achirus spp. e Bairdiella ronchus, indicando uma movimentação de larvas e conseqüente conectividade biológica entre habitats. Este estudo evidenciou a conectividade ecológica entre recifes, prados e manguezal através da movimentação de larvas de peixes entre habitats na zona estuarina do rio Formoso. Os resultados obtidos demonstram a importância da manutenção da integridade dos ecossistemas para conservação e manejo dos recursos pesqueiros em ecossistemas marinhos tropicais.

Made available in DSpace on 2014-06-12T22:59:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1459_1.pdf: 3148348 bytes, checksum: 8c11b7f3640e135e0defb40be0c31e38 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O rio Sirinhaém nasce na Serra do Alho no município de Camocim de São Félix e deságua no litoral do município de Sirinhaém, situado na região fisiográfica da Mata meridional de Pernambuco, a 76 km do Recife. O presente trabalho foi realizado na zona costeira do litoral sul de Pernambuco, entre a desembocadura do rio Sirinhaém e a Ilha de Santo Aleixo. Trata-se de uma área importante por sustentar intensa atividade pesqueira e turística, exercendo relevante papel socioeconômico para a população local. O trabalho foi desenvolvido tendo como objetivo determinar as condições hidrológicas e avaliar sua relação com a comunidade e a biomassa fitoplanctônica, bem como a influência do hidrodinamismo provocado pelas variações das marés. As coletas foram realizadas em três estações fixas, durante o período de estiagem (outubro, novembro e dezembro/2007) e chuvoso (maio, junho e julho/2008), em dois regimes de maré (preamar e baixamar). A profundidade nas estações de coleta variou de 2,6 a 8,5m; a transparência da água entre 0,2 e 6,0m; a temperatura apresentou valores oscilando entre 25ºC e 30,5ºC, não sendo verificada estratificação térmica na coluna d água; a salinidade apresentou um gradiente crescente à medida que se afasta da costa, com valores variando entre 2,44 e 37,18 (oscilando entre os regimes oligoalino a eurialino); o pH manteve-se sempre alcalino; o oxigênio dissolvido de 2,33 até 5,68 ml.L-1, as taxas de saturação do oxigênio variaram de 45,53% à 127,64%, estando dentro da classificação de área semipoluída a saturada; material em suspensão de 0,6 à 120,6mg.L-1; a biomassa fitoplanctônica total 0,5 à 7,92mg.m-3, e a biomassa fracionada 0,13 a 7,71mg.m-3. As concentrações de sais nutrientes (nitrito, nitrato, amônia, fosfato e silicato) mantiveram-se abaixo dos níveis considerados normais para cada nutriente analisado. Foram identificados 115 táxons, distribuídos em seis divisões, sendo Bacillariophyta o grupo dominante, destacando-se as espécies Paralia sulcata e Asterionellopsis glacialis, em termos de frequência e abundância, respectivamente. Os resultados dos parâmetros hidrológicos mostram características de uma área mesotrófica, dando sustentabilidade à produtividade primária