Imagens multiespectrais são utilizadas em diferentes aplicações, que vão desde sensoriamento remoto a processos médicos. No caso de imagens multiespectrais oriundas de microscopia confocal de varredura à laser (Confocal Laser Scanning Microscopy-CLSM), a extração da informação se inicia pela conversão das assinaturas espectrais, em uma imagem RGB. Esta imagem é a referência para a seleção da região de interesse, da qual se obtém a assinatura espectral média, originada do arquivo multiespectral (LSM). Mesmo utilizando um padrão muito bem estabelecido de conversão, alguns pontos devem ser considerados: i) o processo de conversão reduz a informação, a uma ordem de 10-145%; ii) a cor é uma experiência sensorial, subjetiva e pessoal, interferindo na seleção da região de interesse e; iii) a assinatura é obtida pela média espectral, da região de interesse, selecionada manualmente.Assim, esta tese de doutorado propõem um método de mapeamento e visualização das informações de imagens multiespectrais, combinando um algoritmo de agrupamento não supervisionado(kmeans) e um algoritmo que define uma paleta de cores coerentes com a informação espectral das regiões mapeadas. Aplicou-se o método em três casos de estudos de tecidos vegetais: i) no pré-tratamento de paredes celulares da cana-de-açúcar; ii) na plasticidade foliar do Jacaranda caroba e; iii) no uso de assinaturas espectrais na classificação de plantas do Cerrado. Os resultados demonstraram que o método é bastante robusto, permitindo de forma inovadora a: visualização, análise e comparação de imagens multiespectrais qualitativa e quantitativamente, e que seu uso é viável em qualquer área de pesquisa que utilize imagens multiespectrais. / Multispectral images are used in different applications, ranging from remote sensing images to medical images. In the case of multispectral images derived from confocal laser scanning microscopy (CLSM), the extraction of information begins with the conversion of spectral signatures in an RGB image. This is the reference for selecting the region of interest, from which it gets the average spectral signature, originated from multispectral file (LSM). Even using a very well established pattern of conversion, some points should be considered: i) the conversion process reduces the information on the order of 10-145%; ii) the color is a sensory experience, subjective and personal, interfering in the selection of the interest region and; the signature is obtained by the spectral average, from interest region which is selected manually. Thus, this doctoral thesis proposes a method of mapping and visualization of multispectral imaging information, combining an unsupervised clustering algorithm (kmeans) and an algorithm that defines a consistent color palette with the spectral information of mapped regions. The proposed method was applied in three cases plant tissue studies: i) in the pre-treating the cell walls of sugarcane; ii) in the leaf plasticity of Jacaranda caroba; iii) in the use of spectral signatures in the Cerrado plant classification. The results showed that the proposed method is quite robust. It presents innovation to the visualization and analysis of multispectral images and makes possible a qualitative and quantitative comparison of a group of multispectral images. Besides that, its use is feasible in any area of research, which are using multispectral images.

Imagens multiespectrais são utilizadas em diferentes aplicações, que vão desde sensoriamento remoto a processos médicos. No caso de imagens multiespectrais oriundas de microscopia confocal de varredura à laser (Confocal Laser Scanning Microscopy-CLSM), a extração da informação se inicia pela conversão das assinaturas espectrais, em uma imagem RGB. Esta imagem é a referência para a seleção da região de interesse, da qual se obtém a assinatura espectral média, originada do arquivo multiespectral (LSM). Mesmo utilizando um padrão muito bem estabelecido de conversão, alguns pontos devem ser considerados: i) o processo de conversão reduz a informação, a uma ordem de 10-145%; ii) a cor é uma experiência sensorial, subjetiva e pessoal, interferindo na seleção da região de interesse e; iii) a assinatura é obtida pela média espectral, da região de interesse, selecionada manualmente.Assim, esta tese de doutorado propõem um método de mapeamento e visualização das informações de imagens multiespectrais, combinando um algoritmo de agrupamento não supervisionado(kmeans) e um algoritmo que define uma paleta de cores coerentes com a informação espectral das regiões mapeadas. Aplicou-se o método em três casos de estudos de tecidos vegetais: i) no pré-tratamento de paredes celulares da cana-de-açúcar; ii) na plasticidade foliar do Jacaranda caroba e; iii) no uso de assinaturas espectrais na classificação de plantas do Cerrado. Os resultados demonstraram que o método é bastante robusto, permitindo de forma inovadora a: visualização, análise e comparação de imagens multiespectrais qualitativa e quantitativamente, e que seu uso é viável em qualquer área de pesquisa que utilize imagens multiespectrais. / Multispectral images are used in different applications, ranging from remote sensing images to medical images. In the case of multispectral images derived from confocal laser scanning microscopy (CLSM), the extraction of information begins with the conversion of spectral signatures in an RGB image. This is the reference for selecting the region of interest, from which it gets the average spectral signature, originated from multispectral file (LSM). Even using a very well established pattern of conversion, some points should be considered: i) the conversion process reduces the information on the order of 10-145%; ii) the color is a sensory experience, subjective and personal, interfering in the selection of the interest region and; the signature is obtained by the spectral average, from interest region which is selected manually. Thus, this doctoral thesis proposes a method of mapping and visualization of multispectral imaging information, combining an unsupervised clustering algorithm (kmeans) and an algorithm that defines a consistent color palette with the spectral information of mapped regions. The proposed method was applied in three cases plant tissue studies: i) in the pre-treating the cell walls of sugarcane; ii) in the leaf plasticity of Jacaranda caroba; iii) in the use of spectral signatures in the Cerrado plant classification. The results showed that the proposed method is quite robust. It presents innovation to the visualization and analysis of multispectral images and makes possible a qualitative and quantitative comparison of a group of multispectral images. Besides that, its use is feasible in any area of research, which are using multispectral images.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-29T15:35:21Z No. of bitstreams: 1 Nise de Fatima Coutinho Souto.pdf: 727551 bytes, checksum: 95ee1193333767288a6ff7225ee4caf5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-29T15:35:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nise de Fatima Coutinho Souto.pdf: 727551 bytes, checksum: 95ee1193333767288a6ff7225ee4caf5 (MD5) Previous issue date: 2008-08-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The in vitro culture is a tool of great importance in the production of seedlings of the fitossanitary quality. The Tapeinochilos ananassae (Hassk) K. Schum is a tropical species that has a great acceptance in the world of floriculture market and presents, in the Brazilian Northeast, fitossanitary problems in which the Rhabdovirus is highlighted. In the present work, aiming to assess the establishment and development of various explants in the in vitro culture of T. ananassae, including the study of biochemical and anatomical variables. For this, lateral buds and mature zygotic embryos were inoculated in MS medium, full or reduced to its half ionic strength, using three sources of antioxidants: ascorbic acid, activated charcoal and PVP, in the concentrations 0,25g.L-1; 3,0g.L-1 and 0,5g. L-1. The ½MS culture medium supplemented with 3,0g. L-1 activated charcoal promoted a higher rate of success in the establishment of zygotic embryos. The plants formed from the culture of embryos were propagated by nodal segments in different concentrations of BAP and GA3: ½MS; ½MS + 0,5mg.L-1 GA3; ½MS + 1,0mg.L-1 GA3; ½MS + 0,5mg.L-1 BAP; ½MS + 0,5mg.L-1 BAP + 0,5mg.L-1 GA3; ½MS + 0,5mg.L-1 BAP + 1,0mg.L-1 GA3; and showed better development when cultivated in ½MS medium free from growth regulators. The lateral buds had not shown morfogenetic development under the conditions of study, besides a large phenolic oxidation had been seen, regardless of the culture medium that had been used, and a high level of microbial contamination, especially bacterial, when buds that had come from basal branches are used. In the enzymatic analysis of lateral buds that were cultivated in vitro in a process of oxidation, had been realized that the activity of peroxidase had declined through the time, suggesting the loss of organogenetic potential, but the activity of polyphenoloxidase had tended to increase during the oxidation process of explants. / O cultivo in vitro é uma ferramenta de grande importância na produção de mudas com qualidade fitossanitária. O Tapeinochilos ananassae (Hassk) K. Schum é uma espécie tropical com grande aceitação no mercado floricultor mundial. No Nordeste brasileiro, vem enfrentando sérios problemas fitossanitários causados principalmente pelo Rhabdovirus. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o estabelecimento e desenvolvimento de diferentes explantes no cultivo in vitro de T. ananassae, incluindo o estudo de variáveis bioquímicas e anatômicas. Para isso, gemas laterais e embriões zigóticos maduros foram inoculados em meio MS completo ou reduzido à metade da força iônica, utilizando três fontes de antioxidantes: ácido ascórbico, carvão ativado e PVP, nas concentrações 0,25g L-1; 3,0g L-1 e 0,5g L-1. O meio de cultivo ½MS suplementado com 3,0g. L-1 de carvão ativado promoveu um maior índice de sucesso no estabelecimento de embriões zigóticos. As plantas formadas a partir da cultura de embriões foram propagadas por segmentos nodais em diferentes concentrações de BAP e GA3: ½MS; ½MS+0,5mg.L-1 GA3; ½MS+1,0mg. L-1 GA3; ½MS+0,5mg.L-1 BAP; ½MS+0,5mg.L-1 BAP+0,5mg.L-1 GA3; ½MS+0,5mg.L-1 BAP+1,0mg.L-1 GA3. O meio de cultivo constituído de ½ dos sais MS e isento de reguladores de crescimento mostrou-se mais adequado para o cultivo de segmentos nodais de T. ananassae. As gemas laterais não apresentaram desenvolvimento morfogênico nas condições de estudo deste trabalho. Além disso, foi observado grande oxidação fenólica, independentemente do meio de cultivo utilizado, e elevado índice de contaminação microbiana, sobretudo bacteriana, quando do uso de gemas advindas de ramos basais. Nas análises enzimáticas das gemas laterais cultivadas in vitro em processo de oxidação, percebeu-se que a atividade da peroxidase decaiu ao longo do tempo, sugerindo a perda do potencial organogenético; já a atividade da polifenoloxidase tendeu a aumentar ao longo do processo de oxidação dos explantes.

Submitted by Emanuel Varela Cardoso (emanuel.varela@ufcg.edu.br) on 2018-10-15T21:11:01Z No. of bitstreams: 1 THYAGO DE ALMEIDA SILVEIRA - TESE (PPGRN) 2017.pdf: 7826699 bytes, checksum: 411f7475b113a4b1f39d4c7ddf148553 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-15T21:11:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 THYAGO DE ALMEIDA SILVEIRA - TESE (PPGRN) 2017.pdf: 7826699 bytes, checksum: 411f7475b113a4b1f39d4c7ddf148553 (MD5) Previous issue date: 2017-08-31 / No Semiárido Brasileiro (SAB), onde predomina o Bioma Caatinga, o processo de desertificaçao tem-se intensificado devido às ações antrópicas, sendo atingida severamente e alterada por corte de lenha, agricultura, queimadas, caça e ação contínua de rebanhos bovinos e caprinos, restando apenas uma pequena parcela preservada e protegida. No município de Picuí, no Seridó Oriental Paraibano, durante as últimas quatro décadas, as fazendas de subexistências, localizadas na zona rural, receberam o plantio de monocultivos que fez com as terras fossem completamente devastadas, tornando-se improdutivas. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi identificar alterações ambientais na decomposição da serrapilheira de Marmeleiro e Catingueira, e na fauna edáfica em áreas degradadas do bioma Caatinga que estão passando por diferentes processos de sucessão ambiental na Paraíba. Para tanto, foi realizada a caracterização histórica da degradação ambiental utilizando imagens de satélite e índices de vegetação, em seguida, foi montado um experimento na Fazenda Agroecológica Gavião e Izidro, em três áreas, sendo elas Degradada, Restaurada e Preservada, cuja metodologia abrangeu estudos de decomposição da serrapilheira, análises físicas e químicas do solo, da macrofauna decompositora e da respiração do solo (Efulxo de CO2). Os resultados da caracterização mostraram como o processo de degradação aconteceu nas últimas décadas, e que a vegetação se recompôs. A decomposição da serrapilheira identificou que duas espécies são importantes provedoras de nutrientes para o solo, sendo que o Marmaleiro se decompõe mais rápido, e Catingueira deposita mais nutrientes no solo. As análises dos solos, revelaram que apesar de serem pedregosos e muito arenosos, eles possuem uma fertilidade muito boa, e que é o processo da ciclagem de nutrientes da serrapilheira, advinda das vegetação presente nas áreas, que contribui significativamente para tal. A macrofauna decompositora foi identificada em maior quantidade na serrapilheira depositada nos litterbags na superfície, do que a presente no solo. Já o Efluxos de CO2 foram muito baixos, e ressalta-se a importância da identificação do fenômeno do Influxo de CO2, que foi medido em condições semelhantes a de uma região desértica, evidenciando que se não houver intervenções nas áreas degradas com condições semelhantes, esses processos tendem a se expandir para outras áreas. Todos os resultados indicaram que a Área Preservada se comportou melhor, exaltando a necessidade da proteção e manuntenção de áreas semelhantes, pois os processos de ciclagem de nutrientes ocorre mais facilmente em ambientes semelhantes. / In the Brazilian semi-arid, where the Caatinga Biome predominates, the process of environmental degradation has intensified due to the anthropic actions, being severely affected and altered by firewood cutting, agriculture, burned, hunting and continuous action of cattle and goats, leaving only a small preserved and protected portion. In Picuí municipality, in Seridó Oriental Paraibano, during the last four decades, the subexistences farms, located in the rural area, were planted with monocultures caused the completely land devastated by degradation of its soils, becoming quite unproductive. In this sense, the work objective was to identify environmental changes in the litter decomposition and in the edaphic fauna in degraded areas of the Caatinga biome that are undergoing different environmental succession processes in Paraíba. For this purpose, the historical characterization of the environmental degradation using satellite images and vegetation indexes was realized, then, an experiment was made at the Agroecological Farm Gavião and Izidro, in three areas, a Degraded, Restored and Preserved Areas, whose developed procedures associated litterbags decomposiotion, physical and chemical soil analyzes, decomposing macrofauna and soil respiration measurements (Efflux de CO2). The characterization results showed how the degradation process occurred in the last decades, and that the vegetation was recovered. For the litter decomposition it was identified that the two species are important nutrients suppliers to the soil, and the Marmaleiro decomposes faster, and Catingueira deposits more nutrients in the soil. Soil analyzes, revealed that, although they are rocky and very sandy, they have a very good fertility, which is the cycling nutrients process from the litter, from the vegetation present in the areas, contributes significantly to this. The decomposing macrofauna was identified in greater quantity in the litterbags deposited in the surface than in the soil. The CO2 fluxes measured were very low, and it is important to identify the CO2 Influx phenomenon, which was measured in conditions similar a desert region, evidencing that if there aren’t interventions in the degraded areas with similar conditions, they process trend to expand to another areas. All results indicated that the Preserved Area behaved better, exalting the need for protection and maintenance of similar areas, because the processes of nutrient cycling occur more easily in similar environments.