O câncer de mama é o câncer mais comum entre as mulheres, e a detecção precoce é crucial para seu diagnóstico e tratamento. Atualmente, o método mais efetivo para a detecção precoce do câncer de mama é a mamografia, onde o sistema tela/filme é o padrão ouro. Entretanto, apesar do sistema tela/filme ter sido melhorado e otimizado ao longo dos anos, para imagens da mama, existem algumas limitações críticas, incluindo faixa de exposição, artefatos da imagem, problemas no processamento dos filmes, e inflexibilidade em processamento das imagens e gerenciamento dos filmes. Nos últimos anos, a mamografia digital tem sido introduzida nos programas de rastreamento do câncer, com o sistema tela/filme sendo gradualmente substituído. A radiografia computadorizada (computed radiography - CR), comumente conhecida também como photostimulable phosphor (PSP) ou storage phosphor, emprega placas de imagem reutilizáveis e computadores e programas associados para adquirir e mostrar as radiografias de projeção digital. Neste trabalho foi testado um modelo de protocolo para a realização do controle de qualidade de imagem e de avaliação de doses glandular em 19 instituições com sistemas de radiografia computadorizada em mamografia. O protocolo foi validado através de testes feitos no Laboratório de Radioproteção Aplicada à Mamografia (LARAM) do Centro de Desenvolvimento da Tecnologia Nuclear (CDTN). A avaliação visual da qualidade da imagem do phantom CDMAM mostrou que 53% dos serviços conseguiram produzir imagens de ótima qualidade. Já a avaliação automatizada da qualidade da imagem, através do software de análise cdcom.exe, mostrou que 57% das imagens eram de boa qualidade. O teste da linearidade do detector mostrou que a resposta do sistema CR é bastante linear, onde 95% dos serviços / Breast cancer is the most common cancer among women, and early detection is critical to its diagnosis and treatment. To date, the most effective method for early detection of breast cancer has been x-ray mammography for which the screen/film (SF) technique has been the gold standard. However, even though SF combinations have been improved and optimized over the years for breast imaging, there are some critical limitations, including a narrow exposure range, image artifacts, film processing problems, and inflexibility in image processing and film management. In recent years, digital mammography has been introduced in cancer screening programmes with the screen/film techniques gradually being phased out. Computed radiography (CR), also commonly known as photostimulable phosphor (PSP) imaging or storage phosphor, employs reusable imaging plates and associated hardware and software to acquire and to display digital projection radiographs. In this work, a protocol model was tested for performing image quality control and average glandular dose (AGD) evaluation in 19 institutions with computed radiography systems for mammography. The protocol was validated through tests at the Laboratório de Radioproteção Aplicada à Mamografia (LARAM) from the Centro de Desenvolvimento da Tecnologia Nuclear (CDTN). The image quality visual evaluation of CDMAM phantom showed that 53% of the facilities were able to produce images of excellent quality. Furthermore, the automated evaluation of image quality, using the analyze software cdcom.exe, showed that 57% of the images were considered to be of good quality. The detector linearity test showed that the CR response is very linear, where 95% of facilities evaluated were considered to be compliant. For the image noise was found that only 20% of facilities are in agreement with the parameters established for this test.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O processo de avaliação da qualidade de imagens radiográficas em geral, e de mamografia em especial, pode ser muito mais preciso, prático e rápido com o auxílio de ferramentas de análise computacional. A proposta deste trabalho é o desenvolvimento de uma metodologia computacional para automatizar o processo de avaliação da qualidade das imagens mamográficas por meio de técnicas de processamento digital de imagens (PDI), utilizando um ambiente de processamento de imagens já existente (ImageJ). Com a aplicação de técnicas de PDI foi possível determinar características geométricas e radiométricas das imagens avaliadas. Os parâmetros avaliados incluem resolução espacial, detalhes de alto contraste, limiar de baixo contraste, detalhes lineares de baixo contraste, massas tumorais, índice de contraste e densidade óptica de fundo. Os resultados obtidos por esta metodologia foram comparados com os resultados apresentados nas avaliações visuais realizadas pela Vigilância Sanitária de Minas Gerais. Por meio desta comparação foi possível demonstrar que esta metodologia automatizada apresenta-se como uma promissora alternativa para redução ou supressão da subjetividade existente na metodologia de avaliação visual, atualmente em uso. / The process of evaluating the quality of radiographic images in general, and mammography in particular, can be much more accurate, practical and fast with the help of computer analysis tools. The purpose of this study is to develop a computational methodology to automate the process of assessing the quality of mammography images through techniques of digital imaging processing (PDI), using an existing image processing environment (ImageJ). With the application of PDI techniques was possible to extract geometric and radiometric characteristics of the images evaluated. The evaluated parameters include spatial resolution, high-contrast detail, low contrast threshold, linear detail of low contrast, tumor masses, contrast ratio and background optical density. The results obtained by this method were compared with the results presented in the visual evaluations performed by the Health Surveillance of Minas Gerais. Through this comparison was possible to demonstrate that the automated methodology is presented as a promising alternative for the reduction or elimination of existing subjectivity in the visual assessment methodology currently in use.

Submitted by SBI Biblioteca Digital (sbi.bibliotecadigital@puc-campinas.edu.br) on 2017-10-04T12:22:46Z No. of bitstreams: 1 GABRIELA MOREIRA RABELO.pdf: 1639157 bytes, checksum: fbcec3dd24c2ae9a8c08aad86d162a56 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-04T12:22:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GABRIELA MOREIRA RABELO.pdf: 1639157 bytes, checksum: fbcec3dd24c2ae9a8c08aad86d162a56 (MD5) Previous issue date: 2017-02-16 / This research aimed to analyze the contributions of the Book of Life as an instrument mediating the memory of children about their experiences in school. The specific objectives were (i) Identify the forms of production and use of the Book of Life in the daily life of a class of Early Childhood Education; (ii) Analyze the measure of students participation in the production of the Book of Life; (iii) Analyze what kind of content the handling of the Book of Life allows to children remember about their school experiences and (iv) To analyze if in these remembered contents there is prevalence of affective or cognitive aspects. The Book of Life is a pedagogical practice proposed by C?lestin Freinet that is a class book where the students record their impressions and discoveries about themselves and their school life, by their own initiative or by a directed way. The locus of the investigative work was a Kindergarten class. The production of empirical research was made from: (i) Observation the production of the Book of Life, focusing on the activities proposed in this paper; (ii) Interview with the teacher and (iii) Interviews with the children; The methodological procedures were videotaped. The material was analyzed from contributions of the Historical-cultural theory on mediated memory, its social constitution and its importance in the establishment of children's relations with school and with pedagogical practices. After analyzing, we conclude that the Book of Life in the hands of children, becomes an instrument that represent memory and teaching. The book becomes a document of memory and can act as a teaching tool, since it was built in a historical way (within a school year) and was contextualized through the activities that were elaborated within the social context of these children, thus enabling , The transformation of images into memories and feelings, transforming these external signs into internal processes, thus being memorized. / Esta pesquisa de Mestrado teve como objetivo analisar as contribui??es do Livro da Vida, como instrumento mediador da mem?ria das crian?as sobre suas viv?ncias no cotidiano escolar. Os objetivos espec?ficos foram (i) identificar os modos de produ??o e uso do Livro da Vida no cotidiano de uma turma de Educa??o Infantil; (ii) analisar o grau de participa??o dos alunos na produ??o do Livro da Vida; (iii) analisar que tipo de conte?do o manejo do Livro da Vida permite ?s crian?as recordarem-se sobre suas viv?ncias escolares e (iv) analisar se nestes conte?dos recordados h? preval?ncia de aspectos afetivos ou cognitivos. O Livro da Vida ? uma pr?tica pedag?gica proposta por C?lestin Freinet, a partir da qual, em um caderno da turma, os alunos registram suas impress?es e descobertas sobre si e sobre o seu cotidiano escolar, por iniciativa pr?pria e/ou de forma dirigida. O l?cus do trabalho investigativo foi uma turma de Educa??o Infantil. A produ??o da pesquisa emp?rica foi realizada atrav?s de: (i) observa??o da produ??o do Livro da Vida, focalizando-se as atividades propostas neste trabalho; (ii) entrevista com a professora e (iii) entrevistas com parte de seus alunos (cinco); a realiza??o dos procedimentos metodol?gicos foi v?deo filmada. O material foi analisado a partir dos aportes da teoria Hist?rico-cultural sobre a mem?ria mediada, sua constitui??o social e sua import?ncia no estabelecimento das rela??es das crian?as com a escola e com as pr?ticas pedag?gicas. Ap?s as an?lises chegamos ? conclus?o que o Livro da Vida nas m?os das crian?as, se transforma em instrumento de materializa??o, de representa??o, de mem?ria e de ensino. O Livro se transforma em um documento de mem?ria e pode agir como instrumento de ensino, pois foi constru?do de forma hist?rica (dentro de um ano letivo escolar) e foi sendo contextualizado atrav?s das atividades que foram elaboradas dentro do contexto social dessas crian?as, possibilitando assim, a transforma??o de imagens em lembran?as e sentimentos, transformando esses signos externos em processos internos, sendo assim memorizados.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:50:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Giacomo.pdf: 2099220 bytes, checksum: d6927d7d0c872e71a61326b4e0e42e48 (MD5) Previous issue date: 2010-12-10 / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / This work presents a proposal for a Cloud computing environment, for the deployment and execution of distributed applications. Cloud Computing may be defined as a provisioning model of on-demand, virtualized computing resources as a service. Here, I make a description of Cloud Computing as a type of distributed computing, comparing it with Grid Computing. Some intrinsic characteristics of Cloud environments are presented, along with proposals for their classification and general architecture. Additionally, I propose an implementation of a specific Cloud environment, oriented to scientific applications. I describe the proposed architecture and beha- vior of the implementation, indicating the considerations made while choosing and configuring its components. This work presents the evaluation of the proposed Cloud using a distributed application as a case study. The deployment in the virtualized environment is studied in detail. Finally, I present results of experiments conducted in order to evaluate the environment impact on the performance of processing and communication, and I discuss future work. / Neste trabalho é apresentado um ambiente de Cloud ou Nuvem, para a disponibilização e execução de aplicações distribuídas. A computação em Cloud pode ser definida como um modelo de aprovisionamento de recursos computacionais, virtualizados e sob demanda, oferecidos como um serviço. A computação em Cloud é descrita neste trabalho como um tipo de computação distribuída, a qual é comparada com a computação em Grade. São descritas caraterísticas próprias de um ambiente de Cloud, com uma proposta para a classificação e arquitetura geral desses ambientes. Adicionalmente, é proposta a implementação de um ambiente específico de Cloud, orientado a aplicações científicas. São descritos o funcionamento e arquitetura propostos para a implementação, indicando as considerações realizadas para a escolha e configuração dos componentes. O ambiente proposto é avaliado utilizando uma aplicação distribuída como estudo de caso e a disponibilização da aplicação no ambiente virtualizado avaliada em detalhe. Por fim, são realizados experimentos para avaliar o impacto do ambiente no desempenho da capacidade de processamento e comunicação, e discutidos trabalhos futuros.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:50:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 capitulo00.pdf: 149755 bytes, checksum: a2f94dd5a3a96753bd5a54659a575c98 (MD5) Previous issue date: 2006-04-07 / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / Main memory limitations can lower the performance of segmentation applications for large images or even make it undoable. In this work we integrate the T-Surfaces model and Out-of-Core isosurface generation methods in a general framework for segmentation of large image volumes. T-Surfaces is a parametric deformable model based on a triangulation of the image domain, a discrete surface model and an image threshold. Isosurface generation techniques have been implemented through an Out-of-Core method that uses a kd-tree structure, called Meta-Cell technique. By using the Meta-Cell framework, we present an Out-of-Core version of a segmentation method based on T-Surfaces and isosurface extraction. The Gradient Vector Flow (GVF) is an approach based on Partial Differential Equations. This method has been applied together with snake models for image segmentation through boundary extraction. The key idea is to use a diffusion-reaction PDE in order to generate a new external force field that makes snake models less sensitivity to initialization as well as improves the snake s ability to move into boundary concavities. In this work, we firstly review basic results about global optimization conditions of the GVF and numerical considerations of usual GVF schemes. Besides, we present an analytical analysis of the GVF and a frequency domain analysis, which gives elements to discuss the dependency from the parameter values. Also, we discuss the numerical solution of the GVF based in a SOR method. We observe that the model can be used for Multiply Connected Domains and applied an image processing approach in order to increase the GVF efficiency. / Limitações de memória principal podem diminuir a performance de aplicativos de segmentação de imagens para grandes volumes ou mesmo impedir seu funcionamento. Nesse trabalho nós integramos o modelo das T-Superfícies com um método de extração de iso-superfícies Out-of-Core formando um esquema de segmentação para imagens de grande volume. A T-Superficie é um modelo deformável paramétrico baseado em uma triangulação do domínio da imagem, um modelo discreto de superfície e um threshold da imagem. Técnicas de extração de isso-superfícies foram implementadas usando o método Out-of-Core que usa estruturas kd-tree, chamadas técnicas de Meta-Células. Usando essas técnicas, apresentamos uma versão Out-of-Core de um método de segmentação baseado nas T-Superfícies e em iso-superfícies. O fluxo do Vetor Gradiente (GVF) é um campo vetorial baseado em equações diferenciais parciais. Esse método é aplicado em conjunto com o modelo das Snakes para segmentação de imagens através de extração de contorno. A idéia principal é usar uma equação de difusão-reação para gerar um novo campo de força externa que deixa o modelo menos sensível a inicialização e melhora a habilidade das Snakes para extrair bordas com concavidades acentuadas. Nesse trabalho, primeiramente serão revistos resultados sobre condições de otimização global do GVF e feitas algumas considerações numéricas. Além disso, serão apresentadas uma análise analítica do GVF e uma análise no domínio da frequência, as quais oferecem elementos para discutir a dependência dos parâmetros do modelo. Ainda, será discutida a solução numérica do GVF baseada no método de SOR. Observamos também que o modelo pode ser estendido para Domínios Multiplamente Conexos e aplicamos uma metodologia de pré-processamento que pode tornar mais eficiente o método.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:57:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bulant.pdf: 14030619 bytes, checksum: 7bdeb54a02eeadbb90a53496f04a524c (MD5) Previous issue date: 2013-02-26 / This work focuses on tomographic reconstruction and three-dimensional arterial structures segmentation problems, understanding both as fundamentals modules of patient specific-based cardiovascular modeling. Is in this context where the possibility of improving information quality contained in medical images, by means of more accurate reconstruction methods, is of interest because of its impact on segmentation algorithm precision, allowing the construction of more realistic vessel geometrical models. Specifically, in this work, we study the reconstruction from projection inverse problem based on the classic simplified model for x-ray interaction, using the Radon transform, in two and three dimensions with different acquisition geometries. Then, we present the standard methods, which are based on analytic inversion of the Radon transform in the form of back-projection. An iterative reconstruction method based on sensitivity analysis, was studied and adapted to work in a parallel and matrix-free form. In addition, a novel reconstruction method, with foundations given by the theoretical framework of variational formulations, is developed. In view of the characteristics of the methodology, the computational implementation is carried out following a distributed computing paradigm on top of a matrix-free form version of the method. We perform parameter sensitivity analysis for each method, and a quantitative comparative analysis among them, using the well known Shepp-Logan head phantom, is also presented. Some preliminary reconstruction studies with real data are presented. In the context of medical image segmentation, we explore two alternatives for arterial structures segmentation from three dimension images acquired on three-Dimensional Rotational Angiography and Computed Tomography Angiography clinical studies. The first methodology is based on a simple seeded region growing algorithm, combined with thresholding and anisotropic diffusion techniques. The second pipeline uses a Level Set approach, initialized with the colliding fronts algorithm. Now days, Level Set methods variants are gaining popularity for vessel segmentation problems. In this work, we present a qualitative comparison by segmenting a numerical phantom, as well as segmenting arterial structures on different anatomical regions of the head and neck. At last, we present some recommendations for method and parameter choosing, as a function of the anatomical region. / Este trabalho foca-se nos problemas da reconstrução tomográfica e da segmentação de estruturas arteriais em três dimensões, entendendo ambos como blocos fundamentais na modelagem do sistema cardiovascular humano orientada a pacientes específicos. Dentro deste contexto, a possibilidade de melhorar a qualidade das informações contidas nas imagens médicas realizadas em estudos clínicos via métodos de reconstrução mais precisos torna-se atraente porque impacta diretamente na acurácia das técnicas de segmentação, e permite a construção de modelos geométricos mais próximos à realidade. Especificamente, neste trabalho, o problema inverso de reconstrução a partir de projeções é estudado empregando o modelo simplificado clássico, via a transformada de Radon, para duas e três dimensões com diferentes geometrias de amostragem. Logo, os métodos de resolução padrão baseados na inversão analítica desta transformada em forma de back-projection foram estudados. Um método iterativo baseado em análise de sensibilidade, denominado aqui como método baseado no gradiente topológico, foi estudado e adaptado para funcionar com um esquema matrix-free em paralelo. Em seguida, um novo método com fundamentos na teoria de formulações variacionais é desenvolvido. Devido às características do método, o mesmo é implementado computacionalmente empregando paralelismo e um formato matrix-free. Um estudo quantitativo sobre os parâmetros de cada método é fornecido, assim como também um estudo comparativo entre todos eles usando o amplamente difundido fantasma de Shepp-Logan. Por fim, estudos preliminares com projeções de estudos de angiografias rotacionais tridimensionais são apresentados. No contexto da segmentação de imagens médicas, duas alternativas são apresentadas para segmentar estruturas arteriais a partir de imagens tridimensionais provenientes de estudos de angiografia rotacional e tomográfica. A primeira metodologia baseia-se num enfoque simples de crescimento de região, combinado com thresholding e suavizado anisotrópico. A segunda metodologia utiliza um enfoque de Level Set, inicializado por uma técnica denominada colliding fronts. Na atualidade diversas variantes do método de Level Set têm ganhado popularidade na segmentação de estruturas arteriais. Neste trabalho comparam-se qualitativamente ambas alternativas com um fantasma numérico, e na segmentação de estruturas arteriais presentes em imagens médicas localizadas em diversas regiões anatômicas. Por fim, recomendações sobre o método mais conveniente a ser utilizado em cada região junto com valores para os parâmetros são fornecidos.

Submitted by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2017-03-15T12:16:53Z No. of bitstreams: 1 thesis-sicilia.pdf: 22807419 bytes, checksum: 2e869968cd7288e2f82a07fe6ec9911f (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2017-03-15T12:17:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 thesis-sicilia.pdf: 22807419 bytes, checksum: 2e869968cd7288e2f82a07fe6ec9911f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-15T12:17:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 thesis-sicilia.pdf: 22807419 bytes, checksum: 2e869968cd7288e2f82a07fe6ec9911f (MD5) Previous issue date: 2017-11-07 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / This work presents a methodology involving two-dimensional fluids initialization through sketching techniques (free draw on tablets, for example) along with diffusion-reaction equations and fluid simulation using Lattice Boltzmann Method (LBM). In the initial stage, the framework converts the drawings made by the users into streamlines. From these lines it is generated a partial velocity field, which is widespread throughout the fluid domain through diffusion-reaction techniques. The velocity field obtained at the end of the process is used to initialize the fluid simulation via the LBM method. We tested two diffusion-reaction techniques, one based on differential equations (Gradient Vector Flow) and another in LBM models. We discussed aspects of vector fields topology and fluid dynamics involved in the sketching conversion into streamlines, as well as the preservation of singularities by the diffusion-reaction methods analyzed. The aim of our application is in the areas of visual effects and computer graphics. In this sense, we presented visual results involving the theoretical concepts which demonstrate the potential of the methodology presented for computational fluid animation . / Neste trabalho apresentamos uma metodologia envolvendo inicialização de fluidos bidimensionais usando técnicas de sketching (desenho livre em tablets, por exemplo) juntamente com equações do tipo difusão-reação e simulação do fluido usando método Lattice Boltzmann (LBM). Na etapa inicial, o framework converte os desenhos feitos pelo usuário em linhas de corrente. A partir destas linhas é gerado um campo de velocidades parcial, que é difundido por todo o domı́nio do fluido via técnicas de difusão-reação. O campo de velocidades obtido no final deste processo é usado para inicializar a simulação do fluido via método LBM. Foram testadas duas técnicas de difusão-reação, uma baseada em equações diferenciais (Gradient Vector Flow ) e outra em modelos do tipo LBM. São discutidos aspectos de topologia de campos vetoriais e dinâmica de fluidos envolvidos na conversão do sketching em linhas de corrente, bem como na preservação de singularidades pelos métodos de difusão-reação analisados. Nosso foco de aplicação está nas áreas de efeitos visuais e computação gráfica. Neste sentido, são apresentados resultados visuais envolvendo os conceitos teóricos os quais demonstram a potencialidade da metodologia apresentada para animação computacional de fluidos.

Submitted by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2018-08-07T14:56:30Z No. of bitstreams: 1 dissertacao_LNCC_Pedro_C_Siracusa.pdf: 6667553 bytes, checksum: 8e4bc4cbfb017c3310acba5656150294 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2018-08-07T14:56:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dissertacao_LNCC_Pedro_C_Siracusa.pdf: 6667553 bytes, checksum: 8e4bc4cbfb017c3310acba5656150294 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-07T14:56:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_LNCC_Pedro_C_Siracusa.pdf: 6667553 bytes, checksum: 8e4bc4cbfb017c3310acba5656150294 (MD5) Previous issue date: 2018-06-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coleções biológicas são consideradas fundamentais fontes de informação científica sobre biodiversidade, tendo historicamente suportado uma ampla gama de iniciativas para conservação de recursos naturais. Por serem tipicamente compostas de registros pontuais de espécies (muitos dos quais derivam de amostragem não aleatória e oportunística), dados de coleções biológicas são comumente associados a uma variedade de vieses, que precisam ser caracterizados e mitigados antes que dados possam ser consumidos. Nesta dissertação temos como principal motivação os vieses taxonômico e de coletor, que podem ser compreendidos como o efeito de preferências pessoais de coletores-chave na composição taxonômica das coleções com as quais eles contribuem. Neste contexto, propomos dois modelos de redes como um primeiro passo para um modelo conceitual, com o objetivo de compreender a formação de coleções biológicas como resultado da composição dos interesses e atividades de seus coletores. Os modelos estendem o campo bem estabelecido da análise de redes sociais, beneficiando-se de uma variedade de métricas e algoritmos para a caracterização de aspectos topológicos. Redes Espécie-Coletor (SCNs) modelam os interesses dos coletores em espécies, e se estruturam por meio de enlaces entre coletores e espécies que eles registram. De forma complementar, SCNs permitem tanto a investigação de coletores compartilhando interesses comuns em conjuntos de espécies; quanto de espécies normalmente coletadas por conjuntos similares de coletores. Redes Colaborativas de Coletores (CWNs) são um tipo especial de redes de colaboração, estruturadas a partir de enlaces colaborativos que se formam entre coletores que registram espécies em conjunto em campo. Tais relações de colaboração são criadas entre pares de coletores caso ambos tenham sido incluídos como coletores responsáveis pelo mesmo registro. Com base nos modelos definidos, nós também apresentamos um estudo de caso em que exploramos a comunidade de coletores e a composição taxonômica dos herbário da Universidade de Brasília. Descrevemos aspectos topológicos gerais das redes e indicamos alguns dos coletores mais relevantes na coleção, bem como grupos taxonômicos de seus respectivos interesses. Nós também investigamos o comportamento colaborativo de coletores durante a coleta de espécimes. Ao final, discutimos perspectivas futuras para a incorporação das dimensões temporal e geográfica nos modelos. Também indicamos algumas possíveis direções de investigação que poderiam se beneficiar de nossa abordagem para a modelagem e análise de coleções biológicas. / Biological collections have been historically regarded as fundamental sources of scientific information on biodiversity, supporting a wide range of scientific and management initiatives in the scope of natural resources conservation. As they are typically composed of discrete records of specimens (most of which derived from non-random and opportunistic sampling), biological collection datasets are commonly associated with a variety of biases, which must be characterized and mitigated before data can be consumed. In this dissertation, we are particularly motivated by taxonomic and collector biases, which can be understood as the effect of particular recording preferences of key collectors on shaping the overall taxonomic composition of biological collections they contribute to. In this context, we propose two network models as the first steps towards a network-based conceptual framework for understanding the formation of biological collections as a result of the composition of collectors’ interests and activities. Both models extend the well-established framework of social network analytics, benefiting from a whole set of metrics and algorithms for characterizing network topological features. Species-Collector Networks (SCNs) model the interests of collectors towards particular species, and are structured by linking collectors to each species they have recorded in biological collection datasets. From complementary perspectives, SCNs allow one to investigate which collectors share common interest for sets of species; and conversely, which species are usually recorded by similar sets of collectors. Collector CoWorking Networks (CWNs) are a special type of collaboration networks, structured from collaboration ties that are formed between collectors who record specimens together in field. Such collaborative ties are created between pairs of collectors whenever they are both included as collectors in the same record. Building upon the defined network models, we also present a case study in which we use our models to explore the community of collectors and the taxonomic composition of the University of Brasília herbarium. We describe general topological features of the networks and point out some of the most relevant collectors in the biological collection as well as their taxonomic groups of interest. We also investigate the collaborative behavior of collectors while recording specimens. Finally, we discuss future perspectives for incorporating temporal and geographical dimensions to the models. Moreover, we indicate some possible investigation directions that could possibly benefit from our approach based on social network analytics to model and analyze biological collections.

Submitted by Ricardo Camacho (rscamacho@ufpa.br) on 2018-04-10T20:23:08Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ModelosRepresentacaoCartografica.pdf: 6130329 bytes, checksum: 3a6f0a9a4528255e906e070d7096daf1 (MD5) / Approved for entry into archive by Ricardo Camacho (rscamacho@ufpa.br) on 2018-04-10T20:23:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ModelosRepresentacaoCartografica.pdf: 6130329 bytes, checksum: 3a6f0a9a4528255e906e070d7096daf1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-10T20:23:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ModelosRepresentacaoCartografica.pdf: 6130329 bytes, checksum: 3a6f0a9a4528255e906e070d7096daf1 (MD5) Previous issue date: 2010-11-26 / Este trabalho trata sobre modelos de representação cartográfica de dinâmicas espaciais, tendo como base metodológica as técnicas apresentadas pelo Professor da Universidade de São Paulo (USP), o Dr. Marcello Martinelli, na obra “Cartografia Dinâmica: Tempo e Espaço nos Mapas”. Aqui é discutida a contribuição dessas técnicas como ferramenta para o processo de construção do planejamento territorial. A fim de fomentar essa análise, foi realizada uma aplicação destas, para o recém criado município de Mojuí dos Campos, Estado do Pará. Esse estudo de caso teve caráter demonstrativo, sendo considerado apenas o aspecto da dinâmica de uso da terra nesse território. Como subsídios foram utilizados dados secundários oficiais, oriundos de instituições públicas, e os dados de uso e cobertura da terra, publicados em 2008, produzidos no âmbito do Projeto de Modelagem da Amazônia (Rede GEOMA), do qual a autora foi integrante. Dessa forma, mais do que servi como um produto ao planejamento territorial da área de estudo escolhida, esta dissertação tem por objetivo refletir sobre o potencial das representações cartográficas de dinâmicas espaciais para o processo de planejamento territorial. / This paper deals with models of cartographic representation of spatial dynamics, based on methodological techniques presented by Professor of the University of São Paulo (USP), Dr. Marcello Martinelli, in "Dynamic Mapping: Maps in Time and Space." Here is discussed the contribution of these techniques as a tool for construction process planning. In order to further this analysis, we performed an application of these to the newly created municipality of Moju dos Campos, State of Pará This case study was demonstrative character, considered only the dynamic aspect of land use in that territory. Subsidies were used as official secondary data, from public institutions, and data use and land cover, published in 2008, produced under the Modeling Project Amazon (GEOMA Network), which the author was a member. Thus, more than one product to serve as territorial planning of the study area chosen, this work aims to reflect on the potential of cartographic representations of spatial dynamics to the process of planning.

Submitted by Ricardo Camacho (rscamacho@ufpa.br) on 2018-05-15T19:44:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AbastecimentoAguaCidade.pdf: 8126918 bytes, checksum: b4a89aa66300091cfdf01559978135e5 (MD5) / Approved for entry into archive by Ricardo Camacho (rscamacho@ufpa.br) on 2018-05-15T19:45:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AbastecimentoAguaCidade.pdf: 8126918 bytes, checksum: b4a89aa66300091cfdf01559978135e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-15T19:45:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AbastecimentoAguaCidade.pdf: 8126918 bytes, checksum: b4a89aa66300091cfdf01559978135e5 (MD5) Previous issue date: 2009-12-17 / Análise da formação, expansão e a gestão do abastecimento de água na cidade de Marabá. Esta cidade, locus de toda uma problemática relacionada à grande explosão demográfica provocada a partir da década de 70, pelo intenso processo migratório estimulado por diversas ações públicas ligadas à política nacional de integração nacional que perpassa por obras de infraestrutura como estradas, hidrelétricas, projetos de colonização oficial, implantação de grandes projetos como ferro-carajás, agropecuários e de exploração de madeira. Essa explosão demográfica quadruplicou a área urbana da cidade impactando profundamente a oferta de serviços públicos, entre os quais o abastecimento de água. Este estudo visa contribuir para com o debate relacionado à gestão de abastecimento de água, procuramos analisar como se deu o abastecimento de água na cidade ao longo do tempo, como ele se apresenta, quais as áreas atendidas pela Companhia de Saneamento do Pará e os tipos de abastecimento alternativos nas áreas que não tem abastecimento. / This work analyzes the formation, expansion and management of the water supply system of the city of Marabá, in the State of Pará. In the mid-‘70s, the city became the locus of a strong demographic growth, exacerbated by an intensive migration process, resulting from several public initiatives connected with a policy of national integration This policy comprised the development of infrastructure such as roads, hydroelectric plants, official colonization plans, implementation of big projects, as the mining complex of Carajas, incentives to agriculture and cattle-raising and timber exploration. This demographic boom increased by four times the city’s urban population creating a big impact in the supply of public services, overburdening, inclusive, the water supply system. Aiming to contribute to the debate on the question of water supply in the aforementioned city, we concentrated our efforts to analyze how the city’s water supply is being made throughout these years. Its present supply structure, which areas are covered by the services provided by the Company of Water Supply of the State of Pará and which are not and which alternatives of water supply are being adopted to secure water supply services in areas not covered by the official water supply system.