Foi realizado um estudo para verificar a ocorrência de leveduras do gênero Rhodotorula, em hemocultura por um período de 8 anos. Os pacientes identificados foram descritos clinicamente segundo variáveis de interesse incluindo dados sobre terapêutica e desfecho. Determinou-se também as concentrações inibitórias mínimas de 20 cepas frente a diferentes antifúngicos de acordo com NCCLS e EUCAST. Realizou-se tipagem molecular através da cariotipagem eletroforética em campo pulsátil / A study was conducted to verify the frequency of occurrence of Rhodotorula spp. from blood cultures over an 8-year period, clinically and microbiologically characterizing patients affected, including data regarding antifungal treatment and outcome. The minimal inhibitory concentrations of antifungal agents were determined against 20 isolates. Molecular typing of the strains were performed using pulsed field gel electrophoresis method

As espécies do Complexo Acinetobacter calcoaceticus-A. baumannii (ACB) são importantes causadoras de Infecções Relacionadas à Assistência à Saúde em todo o mundo. Detêm maior relevância os isolados com resistência aos antimicrobianos, os quais impactam negativamente no prognóstico, na mortalidade e custos associados ao cuidado com o paciente. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade genética e o perfil de susceptibilidade antimicrobiana de 134 isolados multirresistentes de A. baumannii presentes no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu, entre 2007 e 2014. A identificação de A. baumannii deu-se pela pesquisa dos genes blaOXA-51-like e gltA, detectados em 85% (n=114) dos isolados Os isolados de Acinetobacter não-baumannii foram identificados por sequenciamento gênico como A. nosocomialis (n=4; 3,1%), A. pittii, A. bereziniae (n=2; 1,7%, cada), A. ursingii, A. variabilis, A. gyllenbergii (n=1; 0,9% cada) e Acinetobacter spp (n=2; 1,7%). Os isolados de A. baumannii foram submetidos às técnicas de PCR multiplex para detecção de outras oxacilinases, pesquisa de ISAba1, teste de susceptibilidade antimicrobiana, tipagem molecular por eletroforese em campo pulsado (PFGE), por sequência trilocus (3LST) e por sequência multilocus (MLST). Detectou-se o gene blaOXA-23-like em 105 isolados (92,1%), estando 100% associados a ISAba1; blaOXA-72 em um isolado (0,9%) e blaOXA-231 em dois isolados (1,7%). A maior parte (n=66; 57,9%) dos isolados foi classificada como extensivamente resistentes (XDR). O PFGE agrupou os isolados em 11 clusters (A-K) e o MLST identificou os isolados pertencentes majoritariamente aos clones CC79 (42,4%), CC1 (16,6%), CC15 (12,1%) e ao ST317 (18,2%). Os resultados do MLST e 3LST concordaram em 95,6%. Foi verificada a ocorrência de diferentes perfis de PFGE em A. baumannii MDR e XDR, predominando cepas carreadoras de ISAba1/OXA-23-like e pertencentes aos CC1, CC15, CC79, ST317. Predominaram o ST317 nos anos iniciais e o CC79 (ST730) de 2011 a 2014. Estes resultados fornecem subsídios que ressaltam a necessidade de monitoramento e controle de patógenos multirresistentes / Species of Acinetobacter calcoaceticus-A. baumannii Complex (ACB) are important causes of Healthcare Associated Infections worldwide. More relevant are isolates with antimicrobial resistance, which have a negative impact on the outcome, mortality and costs associated with patient care. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity and the antimicrobial susceptibility profile of 134 multiresistant ACB spcies strains present at Botucatu Medical School Teaching Hospital between 2007 and 2014. Identification of A. baumannii species was by detection of blaOXA-51-like and gltA genes, detected in 85% (n=114) of the isolates. Non-baumannii Acinetobacter species were identified by gene sequencing as A. nosocomialis (n=4, 3.1%), A. ursingii, A. variabilis, A. gyllenbergii (n=1, 0.9% each) and Acinetobacter spp (n=2; 1.7%). A. baumannii isolates were submitted to multiplex PCR for other oxacillinases and ISAba1 detection, antimicrobial susceptibility testing, molecular typing by pulsed field gel electrophoresis (PFGE), trilocus sequence typing (3LST) and multilocus sequence typing (MLST). blaOXA-23-like gene was detected in 105 isolates (92.1%), of which 100% were associated with ISAba1; blaOXA-72 was present in one isolate (0.9%) and blaOXA-231, in two isolates (1.7%). The majority (n=66; 57.9%) of isolates were classified as extensively resistant (XDR). The PFGE grouped the isolates into 11 clusters (A-K) and MLST identified the isolates belonging mainly to CC79 (42.4%), CC1 (16.6%), CC15 (12.1%) and ST317 (18.2%). MLST and 3LST results were 95.6% concordant. We verified the occurrence of different PFGE profiles in multidrug-resistant (MDR) and extensively drug-resistant (XDR) A. baumannii, predominantly presenting ISAba1/OXA-23-like genes and belonging to CC1, CC15, CC79 and ST317. There was a prevalence of ST317 in the early years and CC79 (ST730) from 2011 to 2014. Our results highlight the importance of surveillance and control of multiresistant pathogens

CNPQ; Fundação Araucária / Os enterococos são cocos Gram-positivos que pertencem ao grupo das bactérias ácido láticas (BAL). Podem ser isolados de plantas, solo, água, alimentos e do trato digestório de humanos e outros mamíferos. Alguns isolados são potencialmente patogênicos e resistentes a antimicrobianos, principalmente à vancomicina e demais antimicrobianos clinicamente importantes. Devido a este cenário, alimentos estão sendo sugeridos como reservatórios de enterococos resistentes a antimicrobianos. Contudo, são escassos os estudos que analisam a presença deste microrganismo em vegetais. Portanto, este trabalho teve como objetivo isolar e identificar Enterococcus spp. a partir de amostras de vegetais folhosos, legumes e raízes, e verificar sua suscetibilidade a antimicrobianos e formação de biofilme. Os isolados foram identificados ao nível de gênero/espécie pela reação da polimerase em cadeia (PCR), utilizando os oligonucleotídeos iniciadores das principais espécies. A sensibilidade a antimicrobianos foi determinada pelo método de disco-difusão e a presença dos genes ermB, aac-(6'), tetL, tetM, vanA e vanB pela PCR. A capacidade de formação de biofilme foi determinada, in vitro, por biomassa total. Foram obtidos 85 isolados de Enterococcus distribuídos em 62% das amostras analisadas. As espécies identificadas foram: Enterococcus casseliflavus/flavescens, Enterococcus columbae, Enterococcus faecium, Enterococcus mundtii e Enterococcus avium. Dos isolados 64% apresentaram resistência fenotípica a todos os antimicrobianos testados, principalmente à vancomicina, eritromicina, teicoplanina, ampicilina e penicilina. A maioria das espécies apresentou pelo menos um isolado resistente à vancomicina. Dos isolados resistentes 61% apresentaram multirresistência. Os genes detectados foram: tetM (15%), tetL (8%), vanA (5%), vanB (4%) e aac-(6') (2%). Todos os isolados foram capazes de formar biofilme, onde 27% foram classificados como produtor de biofilme fraco, 60% moderado e 13% forte. Os isolados produtores de biofilme moderado foram os que mais apresentaram resistência à vancomicina, teicoplanina, eritromicina e penilicina. De acordo com estes resultados, os vegetais podem atuar como reservatório de enterococos resistentes a diversos antimicrobianos de importância clínica, principalmente à vancomicina. Isso representa um risco para a saúde pública uma vez que a vancomicina é o último recurso terapêutico para o tratamento de infecções enterocócicas graves. / The e enterococci are Gram-positive cocci that belong to the group of lactic acid bacteria (LAB). They can be isolated from plants, soil, water, food and the digestive tract of humans and other mammals. Some strains are potentially pathogenic and resistant to antibiotics, especially vancomycin and other clinically important antibiotics. Due to this scenario, foods are being suggested as reservoirs enterococci resistant to antimicrobials. However, there are few studies that analyze the presence of this organism in food vegetable. Therefore, this study aimed to isolate and identifyenterococci from samples of leafy vegetables, legumen and roots, and verify their susceptibility to antimicrobial and biofilm formation. Isolates were identified to genus / species by polymerase chain reaction (PCR) using the primers of the main species.The antimicrobial susceptibility was determined by disk diffusion method and thepresence of ermB genes, aac (6 '), tetL, tetM, vanA and vanB by PCR. Biofilm formation ability was determined in vitro by the total biomass. 85 were obtainedEnterococcus distributed in 62% of samples. The species identified were:Enterococcus casseliflavus/flavescens, Enterococcus columbae, Enterococcus faecium, Enterococcus mundtii and Enterococcus avium. From the isolates showed 64% phenotypic resistance to all tested antibiotics, especially vancomycin, erythromycin, teicoplanin, ampicillin and penicillin. Most species had at least one isolate resistant to vancomycin. 61% of resistant isolates showed multidrug resistance. The genes were detected: tet M (15%), tetL (8%), vanA (5%), vanB (4%)and aac-(6 ') (2%). All isolates were able to form biofilm, where 27 % were classifiedas weak biofilm producer, 60 % moderate and 13 % stronger. Isolated producers of moderate biofilm were the ones who were resistant to vancomycin, teicoplanin, erythromycin and penillicin. According to these results, the vegetables can act as a reservoir of enterococci resistant to several antibiotics of clinical importance, especially vancomycin. This represents a risk to public health since vancomycin is the last therapeutic option for the treatment of severe enterococcal infections.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:04:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao marleneandrade.pdf: 776220 bytes, checksum: 89f7e969fbef687591092b3ded9dd40a (MD5) Previous issue date: 2008-04-30 / Assessing patients with chronic wounds poses a challenge to professionals and doubts still persist concerning characterization of the wound infection status. We believe that the Basic Health Units are in places of reference for the public to submit chronic wounds and should have full attendance and resolution were objectives of this study: characterizing patients with chronic wounds attended as spontaneous demand in the bandage room; characterizing patients chronic wounds regarding the presence of classical signs and additional infection criteria; isolating and identifying aerobic bacteria and fungi in the samples of chronic wounds clinically signaling to infection; verifying strains susceptibility when isolated before antimicrobial agents often used in praxis as well as new antibiotics and analyzing the relationship of local factors with infection status. This is a cross-sectional study, carried out in ambulatory bandage rooms in basic health units with emergency service in the municipality of Goiânia. Data was collected from June to July, in 2007. Data was obtained through the use of structured interviews containing questions about characterization of patients and a check list for the assessment of chronic wounds through the signs and clinical symptoms indicating infection and analysis of wound samples by using swabs in accordance with Levine s technique. After consent and approval of the ethics committee, 46 patients were evaluated and 60 wound samples were assessed. Data bank was organized in Excel table and statistics analysis in SPSS- 15.0. The average age was 55 years, 37 (80.4%) male, 20 (43.5%) belonging to E social class, 23 (50%) retired people having basic sanitation items. 28 (61%) presented venous ulcerated lower limbs, 31 (67.4%) performed the bandage both in the BHU and at home. 45 (75%) out of 60 wounds were infected and 15 (25%) noninfected. Through bivariate analysis we verified an association of the infection status with the following characteristics: width depth of tissular damage, necrotic tissue and exudate amount. Among signs and symptoms, classical ones occurred in a frequency higher than 65% both in the infected and noninfected group. Regarding the additional ones, we verified variance in occurrence in both wound groups. Staphylococcus aureus was predominat in 65% of cases and was sensitive to most antibiotics tested. Among Gram-negative bacteria the most frequent were: Pseudomonas aeruginosa (23%), resistant to amoxylin +clavulanic acid, cefalexin and cefotaxim; Proteus mirabilis (16.6%) and Proteus vulgaris (15.0%), all sensitive to gentamicin, aztreonam, ciprofloxacin, and amicacin. These results indicate the need to structure an integrated net to treat patients with chronic wounds and evidence additional criteria to be employed in the elaboration of service protocols pursuing improvement of quality of assistance given in basic health units. / A avaliação de pacientes com feridas crônicas representa um desafio para os profissionais, e dúvidas, ainda persistem em torno da caracterização do status de infecção, nessas lesões. As Unidades Básicas de Saúde constituem-se locais de referência para a população portadora de feridas crônicas, onde deveriam ter atendimento integral e resolutividade. Objetivos deste estudo: caracterizar os pacientes com feridas crônicas, atendidos como demanda espontânea, na sala de curativos; caracterizar as feridas crônicas dos pacientes atendidos em relação à presença de sinais clássicos e critérios adicionais de infecção; isolar e identificar bactérias aeróbias e fungos das amostras de feridas crônicas, com indícios clínicos de infecção; verificar a susceptibilidade das cepas isoladas, frente aos antimicrobianos freqüentemente utilizados na prática e novos antibióticos, e analisar a relação de fatores locais, com o status de infecção. Trata-se de estudo transversal, realizado em Salas de Curativos Ambulatoriais de Unidades Básicas de Saúde (UBS), com atendimento de urgência do Município de Goiânia. Os dados foram coletados no período de junho a julho de 2007 e obtidos por meio de entrevista com roteiro estruturado, contendo questões de caracterização dos pacientes e de um check-list, para a avaliação das feridas crônicas, por meio dos sinais e sintomas clínicos indicativos de infecção, e análise de amostras de feridas utilizando o swab, mediante técnica de Levine. Após aprovação pelo Comitê de Ética e Consentimento, foram avaliados 46 pacientes, e analisadas amostras de 60 feridas. Os programas computacionais utilizados para organizar e analisar estatisticamente os dados foram: o Excel e o SPSS (versão 15.0), respectivamente. A média de idade foi de 55 anos, 37 (80,4%) eram do sexo masculino, 20 (43.5%) pertenciam à classe social E, 23 (50%) eram aposentados e possuíam itens de saneamento básico, 28 (61%) apresentaram úlceras venosas, localizadas nos membros inferiores, 31 (67,4%) realizavam o curativo nas UBS ou em domicílios. Das 60 lesões, 45 (75%) estavam infectadas e 15 (25%) não infectadas. Mediante análise bivariada, verificaram-se associação com o status de infecção as seguintes características: profundidade da extensão do dano tissular, quantidade de tecido necrótico e exsudato. Dentre os sinais e sintomas, os clássicos ocorreram numa freqüência superior a 65%, tanto no grupo de infectadas quanto não infectadas, e nos adicionais verificou-se variação na ocorrência, em ambos os grupos de feridas. Houve predominância do Staphylococcus aureus em 65% dos casos e a maioria sensível aos antibióticos testados. Entre as bactérias Gram-negativas, as mais freqüentes foram: Pseudomonas aeruginosa (23,3%), resistentes à amoxicilina+ácido clavulânico, cefalexina e cefotaxima; Proteus mirabilis (16,6%) e Proteus vulgaris (15,0%) sensíveis a gentamicina, aztreonam, ciprofloxacino e amicacina. Estes resultados indicam a necessidade de se estruturar uma rede integrada, para o atendimento dos pacientes com feridas crônicas. Também evidenciam critérios adicionais que podem ser empregados na elaboração do protocolo de atendimento, buscando a melhoria da qualidade da assistência prestada nas unidades básicas de saúde.

Foi realizado um estudo para verificar a ocorrência de leveduras do gênero Rhodotorula, em hemocultura por um período de 8 anos. Os pacientes identificados foram descritos clinicamente segundo variáveis de interesse incluindo dados sobre terapêutica e desfecho. Determinou-se também as concentrações inibitórias mínimas de 20 cepas frente a diferentes antifúngicos de acordo com NCCLS e EUCAST. Realizou-se tipagem molecular através da cariotipagem eletroforética em campo pulsátil / A study was conducted to verify the frequency of occurrence of Rhodotorula spp. from blood cultures over an 8-year period, clinically and microbiologically characterizing patients affected, including data regarding antifungal treatment and outcome. The minimal inhibitory concentrations of antifungal agents were determined against 20 isolates. Molecular typing of the strains were performed using pulsed field gel electrophoresis method