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Uso da tomografia por coerência óptica para detecção de falhas após ensaio de extrusão de pinos estéticos

COSTA, Daene Patrícia Tenório Salvador da 31 January 2013 (has links)
Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-14T13:19:10Z No. of bitstreams: 2 Tese Daene da Costa.pdf: 1667535 bytes, checksum: fcc8264eb5582ea03bc9f87be2ed64a2 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-14T13:19:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Daene da Costa.pdf: 1667535 bytes, checksum: fcc8264eb5582ea03bc9f87be2ed64a2 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / CAPES / Objetivo: Validar a Tomografia por Coerência Óptica (OCT) como método de obtenção de imagens capaz de detectar e diferenciar falhas após ensaio de extrusão de pinos estéticos cimentados com sistemas resinosos. Métodos: Foram obtidas imagens de 50 secções radiculares de pré-molares, que foram submetidos ao teste push-out após cimentação de pinos, em Microscópio Óptico (MO) com aumento de 50x e em OCT 2D e 3D para obtenção de cortes axiais e imagens en-face (SR-OCT:OCP930SR e Callisto SD-OCT/Thorlabs). Cada grupo de imagens foi analisado por 3 examinadores calibrados, para detectar a presença das seguintes falhas: Adesivas dentina/cimento (ADC) ou pino/cimento (ACP); Coesivas dentária (CD), de cimento (CC) ou de pino (CP); e Presença de bolhas (PB). Resultados: O escore de Kappa interexaminadores obtido pelo MO variou de 0,156 a 0,588 para as falhas adesivas, enquanto que pelo OCT variou de 0,733 a 1,000. As falhas coesivas apresentaram concordâncias similares nos dois métodos, que variaram de moderadas a excelentes. O OCT demonstrou ser mais sensível e específico na detecção das falhas ADC e CD, apresentando, ainda, mais especificidade nas falhas ACP, CC e PB. Significância: A origem das falhas na cimentação de pinos intrarradiculares pode influenciar na decisão terapêutica, mas é de difícil detecção pela subjetividade presente nos métodos avaliativos usuais. O OCT demonstrou ser um método eficaz e de baixo custo na detecção dessas falhas.
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Classificação de bifurcações em imagens de tomografia de coerência óptica intravascular utilizando redes neurais e máquinas de vetores de suporte

Porto, Carmina Dessana Nascimento, 92-98277-4777 17 April 2017 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-24T14:13:46Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Carmina D. N. Porto.pdf: 4630675 bytes, checksum: 8e1212301a185a80f51001a833edce8d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-24T14:13:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Carmina D. N. Porto.pdf: 4630675 bytes, checksum: 8e1212301a185a80f51001a833edce8d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-24T14:13:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Carmina D. N. Porto.pdf: 4630675 bytes, checksum: 8e1212301a185a80f51001a833edce8d (MD5) Previous issue date: 2017-04-17 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Studies in intravascular optical coherence tomography (IV-OCT) have demonstrated the importance of coronary bifurcation regions in intravascular medical imaging analysis, as plaques are more likely to accumulate in this region leading to coronary disease. A typical IVOCT pullback acquires hundreds of frames, thus developing an automated tool to classify the OCT frames as bifurcation or non-bifurcation can be an important step to speed up OCT pullbacks analysis and assist automated methods for atherosclerotic plaque quantification. In this work, we evaluate the performance of two state-of-the-art classifiers, SVM and Neural Networks in the bifurcation classification task. The study included IV-OCT frames from 9 patients. In order to improve classification performance, we trained and tested the SVM with different parameters by means of a grid search and different stop criteria were applied to the Neural Network classifier: mean square error, early stop and regularization. Different sets of features were tested, using feature selection techniques: PCA, LDA and scalar feature selection with correlation. Training and test were performed in sets with a maximum of 1460 OCT frames. We quantified our results in terms of false positive rate, true positive rate, accuracy, specificity, precision, false alarm, f-measure and area under ROC curve. Neural networks obtained the best classification accuracy, 98.83%, overcoming the results found in literature. Our methods appear to offer a robust and reliable automated classification of OCT frames that might assist physicians indicating potential frames to analyze. Methods for improving neural networks generalization have increased the classification performance. / Estudos em tomografia de coerência óptica intravascular (IV-OCT) tem demonstrado a importância das regiões de bifurcação coronária na análise de imagens médicas intravasculares, uma vez que está região é mais propensa ao acúmulo de placas, o que pode levar a doença coronariana. Um exame IV-OCT comum adquire centenas de imagens, portanto, uma ferramenta automatizada para classificar as imagens como pertencentes ou não a região de bifurcações pode ser um passo importante para acelerar a análise de imagens IV-OCT e auxiliar métodos automatizados para a quantificação de placas ateroscleróticas. Neste trabalho, avaliamos o desempenho de dois classificadores, SVM e Redes Neurais, na tarefa de classificação de identificação de bifurcações em imagens IV-OCT. O estudo incluiu imagens IV-OCT de 9 pacientes. Para melhorar o desempenho da classificação, treinamos e testamos o SVM com diferentes parâmetros por meio de uma pesquisa de grade e diferentes critérios de parada foram aplicados ao classificador de Rede Neural: erro quadrático médio, parada precoce e regularização. Foram testados diferentes conjuntos de características, utilizando técnicas de seleção de características: PCA, LDA e seleção de características escalares com correlação. Treinamento e teste foram realizados em conjuntos com um máximo de 1460 imagens. Quantificamos nossos resultados em termos de taxa de falsos positivos, taxas de verdadeiro positivo, acurácia, especificidade, precisão, taxa de falsos alarmes, f-measure e área sob curva ROC. As redes neurais obtiveram a melhor precisão de classificação, 98,83%, superando os resultados encontrados na literatura. Nossos métodos parecem oferecer uma classificação robusta e confiável automatizada de imagens IV-OCT que podem ajudar médicos indicando potenciais imagens a serem analisadas. Métodos para melhorar a generalização das redes neurais aumentaram o desempenho da classificação.
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Avaliação pelo sistema de tomografia por coerência óptica do efeito do envelhecimento por ciclagem térmica na adaptação marginal das restaurações adesivas em cavidades classe II em dentina e esmalte dental / System for evaluation of tomography for coherent optical effect of aging for thermal cycling adaptation in marginal restoration of adhesive in class II cavities in enamel and dentin

Cristiaann Hincapie Ramirez 16 November 2016 (has links)
Este estudo teve como objetivo avaliar a adaptação marginal em restaurações classe II em dentina e esmalte dental utilizando um sistema adesivo universal de acordo com três técnicas diferentes de aplicação: Autocondicionante, condicionamento seletivo e condicionamento total, através do sistema de tomografia por coerência óptica (OCT), antes e após ao envelhecimento por termociclagem (TC). Preparos classe II foram confeccionados nas paredes mesial e distal, em 30 molares hígidos humanos, com término da cavidade em esmalte e em dentina. Todos os espécimenes foram restaurados (adesivo Single Bond Universal e resina composta Filtek Z350 XT) nas três técnicas de aplicação. Os dentes foram distribuídos aleatoriamente em três grupos (n=10), sendo um para cada técnica de aplicação adesiva: Grupo I: autocondicionante, Grupo II: condicionamento seletivo e Grupo III: condicionamento total; em seguida os grupos foram avaliados antes e depois a termociclagem pelo sistema de tomografia por coerência ótica. De posse dos corpos de prova devidamente restaurados, partimos para os procedimentos de termociclagem (1000 ciclos de 1 minuto com intervalo de 30 segundos) e a avaliação pelo sistema de Tomografia por Coerência Óptica. Em seguida, as amostras foram examinadas por meio de imagens geradas pelo OCT e os dados foram submetidos ao teste estatístico não-paramétricos de Kruskal-Wallis e Dunn (p<0.05). Foi observada diferença estatisticamente significante da adaptação marginal entre os grupos com término em esmalte (p= 0.0073); para os grupos com término em dentina, não foi observada diferença estatisticamente significante na adaptação marginal (p=0.2063). Conclui-se que o OCT foi, então, capaz de diagnosticar a microinfiltração marginal nas restaurações em cavidades classe II. Existe deterioração das margens e alteração de padrão de infiltração marginal com as diferentes técnicas adesivas dos preparos classe II restauradas com resina em esmalte. Atribui-se à termociclagem a falha de vedamento marginal observada nos espécimes após em esmalte. / This study aimed to evaluate the marginal adaptation of Class II restorations in enamel and dentin using a universal adhesive according to three different application techniques: self-etching, selective packaging and selective conditioning through the system optical coherence tomography (OCT) before and after aging thermocycling (TC). Class II preparations were made in the mesial and distal surfaces in 30 healthy human molars, with completion in enamel and dentin. All samples were restored ( composite Filtek Z350 XT resin Universal Single Bond) in three application techniques. The teeth were randomized into three groups (n = 10), one for each adhesive application technique: Group I: etching, Group II: engraved selective and Group III: Engraving the total; then the groups were assessed before and after thermal cycling through the system optical coherence tomography (OCT). With properly restored specimens, we went to the procedures of thermal cycles (1000 cycles of one minute at intervals of 30 seconds) and evaluation system through optical coherence tomography. Then the samples were examined by OCT-generated images and data were subjected to a non-parametric statistical test Kruskal-Wallis and Dunn (p <0.05). Was observed found statistically significant difference in marginal adaptation between the groups ended in tooth enamel (p = 0.0073); for groups with completion in dental dentin, there was no statistically significant difference in marginal adaptation (p = 0.2063). It is concluded that the OCT was then able to diagnose the microleakage in restorations in class II cavities. There are margins deterioration and changes in microleakage standard with different adhesive techniques of class II preparations restored with resin enamel. Assigns to the thermal cycling the marginal sealing failure observed in specimens in enamel.
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Avaliação do processo de desenvolvimento de desmineralização em esmalte dental humano utilizando a técnica de tomografia por coerência óptica / Human dental enamel demineralization process assessment using the optical coherence tomography technique

Ana Claudia Ballet de Cara 20 August 2012 (has links)
A detecção de lesões cariosas nos estágios iniciais possibilita a escolha de tratamentos baseados na preservação da estrutura dental. Dessa forma, a utilização de exames capazes de diagnosticar precocemente essas lesões, como a Tomografia por Coerência Óptica (OCT Optical Coherence Tomography) é adequada. Assim, o objetivo do trabalho foi avaliar a capacidade da OCT em quantificar os estágios de desmineralização do esmalte durante o desenvolvimento de lesões simuladas de cárie, tendo como padrão de referência o teste de microdureza seccional. Foram utilizados 53 dentes terceiros molares hígidos, os quais tiveram as coroas seccionadas para obtenção de 210 amostras. Para avaliar as possíveis alterações sofridas por cada amostra, essas foram examinadas através da técnica de OCT no início do experimento e novamente examinadas após o término do período de ciclagem estabelecido para cada grupo, utilizando os coeficientes de atenuação óptica total e o cálculo de área em gráficos de intensidade de sinal de OCT, como parâmetros de análise. Posteriormente, as amostras foram submetidas a testes de microdureza seccional. A diferença entre os coeficientes de atenuação óptica obtidos antes e depois da ciclagem de pH apresentou elevado grau de correlação com os resultados de microdureza seccional. Por meio da análise das áreas provenientes de gráficos de intensidade de sinal de OCT e microdureza Knoop, ambos em função da profundidade, foi observada relação de linearidade entre os resultados e elevada correlação entre as técnicas avaliadas (&rho; = 0,99). De acordo com os resultados, a técnica de OCT foi capaz de detectar diferentes graus de desmineralização do esmalte dental humano em lesões simuladas de cárie. / The detection of carious lesions in early stages enables treatment choose based on dental structure preservation. This way, the utilization of exams capable of early diagnosis of these lesions, like OCT (Optical Coherence Tomography), is appropriate. Therefore, the objective of this work was to assess the capability of OCT in quantifying the enamel demineralization stages during the development of simulated caries lesions, having as reference standard the sectional microhardness test. There were used 53 sound third molars, which had their crowns sectioned to obtain 210 samples. To assess possible changes in each sample, these were examined by the OCT technique in the beginning of the experiment and again in the end of the cycling period established to each group, using the total optical attenuation coefficient and the area calculations using OCT signal intensity as analysis parameters. After that, the samples were submitted to sectional microhardness test. The difference between optical attenuation coefficients taken before and after the pH cycling, showed a high level of correlation with the microhardness results. Through areas analysis of OCT signal intensity and Knoop microhardness against depth, it was observed linearity relation between results and high correlation among assessed techniques (&rho;=0,99). According to the results, the OCT technique was capable of detecting different degrees of demineralization of the human enamel in carious simulated lesions.
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Abordagens para segmentação de imagens de tomografia intravascular por coerência ótica. / Approaches to segmentation of intravascular optical coherence tomography.

Veronica Meyer Gaiarsa 06 May 2016 (has links)
Devido à sua alta taxa de mortalidade as doenças cardiovasculares vem sendo foco de pesquisas nos últimos anos. Estima-se que neste grupo, 42% das mortes foram consequência de doença coronariana (CHD) em 2012. Para auxiliar o acompanhamento de pacientes com CHD, este estudo teve como objetivo investigar um método simples e robusto que segmenta de maneira semi-automática a área da neoíntima em Tomografias Intravasculares por Coerência Óptica no Domínio da Frequência (FD-IOCT), a mais recente técnica de imagear vasos internamente. O método foi dividido em duas etapas. A primeira segmenta a área contida pelo lúmen através de operações morfológicas com valores de intensidade e aplicação da limiarização Otsu. Na segunda, o foco foi segmentar a área contida por partes de stent onde duas estratégias foram desenvolvidas e comparadas. Ambas as etapas (segmentação de área de lúmen e de stent) obtiveram resultados acurados com aproximadamente 98% de Verdadeiro Positivo, enquanto o Falso Positivo foi próximo de 3% para o lúmen e 5% para stent, onde uma das estratégias (para delimitar a área contida por stent) apresentou um tempo de execução 50 vezes maior que a outra. O método foi utilizado em 443 imagens com diferentes características e os resultados são encorajadores. / Due to its high mortality rate cardiovascular diseases have been the focus of research in recent years. It is estimated that among these, 42% of deaths were due to coronary heart disease (CHD) in 2012. To monitor patients with CHD, the goal of this study was to investigate a simple and robust method that segments semi-automatically the neointimal area on Frequency Domain Intravascular Optical Coherence Tomography (FD-IOCT), the latest technology to view vessels internally. The method was divided into two steps. The first one segments the area contained by the lumen through morphological operations on intensity values and the Otsu threshold. In the second one, the focus was to segment the area contained by stent struts where two strategies were developed and compared. Both steps (lumen and stent strut area segmentation) obtained accurate results with true positives approximately 98%, while the false positives were close to 3% for the lumen and 5% for the stent, where one strategy (to delimit the area contained by stent struts) showed run time of 50 times the other. The method was executed on 443 images with different characteristics and the results are encouraging.
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Variability of peripapillary retinal nerve fiber layer measurements with spectral domain OCT = Variabilidade de medidas de espessura da camada de fibras nervosas peripapilar utilizando spectral domain OCT / Variabilidade de medidas de espessura da camada de fibras nervosas peripapilar utilizando spectral domain OCT

Cremasco, Fernanda, 1979- 23 August 2018 (has links)
Orientador: Vital Paulino Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-23T06:08:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cremasco_Fernanda_D.pdf: 5564009 bytes, checksum: bb04dfbdd0809568c204a7076f6df39f (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Esta pesquisa teve por finalidade avaliar a variabilidade intrasessão, intersessão e interexaminador das medidas de espessura da camada de fibras nervosas da retina peripapilar (CFNRP) com a Tomografia de Coerência Óptica de Domínio Espectral (TCO-DE). Foi incluído no estudo apenas um olho de 32 indivíduos saudáveis e de 34 pacientes com glaucoma. As medidas da CFNRP foram obtidas com o Cirrus HD-OCT 4000 (Carl Zeiss Meditec, Dublin, Califórnia, EUA) cinco vezes no mesmo dia, por um único examinador, para avaliação da variabilidade intrasessão. O mesmo examinador realizou medidas de espessura da CFNRP nos mesmos sujeitos em cinco dias diferentes, para avaliação da variabilidade intersessão. Um segundo examinador realizou medidas da espessura da CFNRP nos mesmos pacientes para avaliação da variabilidade interexaminador. O coeficiente de variação (CDV) e o coeficiente de correlação intraclasse (CCI) foram obtidos para os seguintes parâmetros: espessura média, espessura nos quadrantes e espessuras setoriais. Em relação à variabilidade intrasessão, em pacientes com glaucoma, os CDVs variaram de 4,51% a 11,84% e os CCIs variaram de 0,74 a 0,99; em indivíduos saudáveis, os CDVs variaram de 2,92% a 6,99% e os CCIs variaram de 0,89 a 0,98. Na análise da variabilidade intersessão observou-se que, em pacientes com glaucoma, os CDVs variaram de 3,68% a 10,50% e os CCIs variaram de 0,82 a 0,99; em indivíduos saudáveis, os CDVs variaram de 3,13% a 6,92% e os CCIs variaram de 0,87 a 0,99. Em relação à variabilidade interexaminador, em pacientes com glaucoma, os CDVs variaram de 2,62% a 14,94% e os CCIs variaram de 0,55 a 0,98; em indivíduos saudáveis, os CDVs variaram de 2,04% a 7,31% e os CCIs variaram de 0,86 a 0,98. Estes resultados indicam que as medidas de espessura da CFNRP com a TCO-DE apresentam reprodutibilidade excelente, com baixa variabilidade intrasessão, intersessão e interexaminador / Abstract: The purpose of this study was to evaluate the intrasession, intersession and interexaminer variabilities of peripapillary retinal nerve fiber layer (PRNFL) thickness measurements with Spectral Domain Optical Coherence Tomography. One eye of 32 healthy individuals and 34 patients with glaucoma were included in the study. The PRNFL measurements were obtained with the Cirrus HD-OCT Model 4000 (Carl Zeiss Meditec, Dublin, Califórnia, USA) five times during the same sitting by one examiner to assess intrasession variability. The same examiner performed PRNFL measurements in the same patients in five different days to assess intersession variability. A second examiner performed PRNFL measurements in the same patients to assess interexaminer variability. The coefficient of variation (COV) and the intraclass correlation coefficient (ICC) were obtained for the following parameters: average thickness, quadrant thickness and clock-hour thickness measurements. The analysis of the intrasession variability, in glaucoma patients, showed that COVs ranged from 4.51% to 11.84% and ICCs varied from 0.74 to 0.99, whereas in healthy individuals, COVs ranged from 2.92% to 6.99% and ICCs varied from 0.89 to 0.98. Regarding the intersession variability, in glaucoma patients COVs ranged from 3.68% to 10.50% and ICCs varied from 0.82 to 0.99; whereas in healthy individuals, COVs ranged from 3.13% to 6.92% and ICCs varied from 0.87 to 0.99. In interexaminer variability, between glaucoma patients, COVs ranged from 2.62% to 14.94% and ICCs varied from 0.55 to 0.98, whereas in healthy individuals, COVs ranged from 2.04% to 7.31% and ICCs varied from 0.86 to 0.98. These findings indicate that PRNFL measurements with Spectral Domain Optical Coherence Tomography display excellent reproducibility, with low intrasession, intersession and interexaminer variabilities / Doutorado / Oftalmologia / Doutor em Ciências Médicas
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Diagnóstico de glaucoma baseado em classificadores de aprendizagem de máquina utilizando dados do Spectral Domain-OCT e perimetria automatizada acromática / Machine learning classifiers for glaucoma diagnosis using Spectral Domain-OCT and standard automated perimetry

Silva, Fabrício Reis, 1979- 23 August 2018 (has links)
Orientador: Vital Paulino Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-23T16:05:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_FabricioReis_M.pdf: 2953091 bytes, checksum: 5a1660d55c27fcad4aeb1be8cceeb33f (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Objetivo: Avaliar a sensibilidade e especificidade dos classificadores de aprendizagem de máquina no diagnóstico de glaucoma usando dados do Spectral Domain OCT (SD-OCT) e perimetria automatizada acromática (PAA). Desenho do estudo: Estudo transversal observacional. Método: Sessenta e dois pacientes com glaucoma e 48 indivíduos normais foram incluídos. Todos os pacientes foram submetidos a exame oftalmológico completo, PAA (24-2 SITA; Humphrey Field Analyzer II, Carl Zeiss Meditec, Inc., Dublin, CA) e exame de imagem da camada de fibras nervosas utilizando SD-OCT (Cirrus HD-OCT; Carl Zeiss Meditec Inc., Dublin, California). Curvas ROC (Receiver Operating Characteristic) foram obtidas para todos os parâmetros do SD-OCT e índices globais da perimetria acromática (MD, PSD, GHT). Subsequentemente, os seguintes classificadores de aprendizagem de máquina (CAMs) foram testados usando parâmetros do OCT e PAA: Bagging (BAG), Naive-Bayes (NB), Multilayer Perceptron (MLP), Radial Basis Function (RBF), Random Forest (RAN), Ensemble Selection (ENS), Classification Tree (CTREE), Ada Boost M1(ADA), Support Vector Machine Linear (SVML) e Support Vector Machine Gaussian (SVMG). Áreas abaixo da curva ROC (aROC) obtidas com os parâmetros isolados do campo visual (CV) e OCT foram comparados com os CAMs usando dados combinados do OCT e CV. Resultados: A média de idade foi de 57,0 ± 9,2 anos para os indivíduos normais e 59,9 ± 9,0 anos para os pacientes glaucomatosos (p=0,103). As médias dos valores do Mean Deviation (MD) foram -4,1 ± 2,4 dB para glaucomatosos e -1,5 ± 1,6 dB para indivíduos normais (p<0,001). Os parâmetros do SD-OCT com maiores aROCs foram: quadrante inferior (aROC=0,813) e espessura média (aROC=0,807). O melhor parâmetro do CV foi PSD (aROC=0,915). Combinando os dados do OCT e do CV, aROCs dos CAMs variaram entre 0,777 (CTREE) e 0,946 (RAN). A maior aROC dos CAMs OCT+CV, obtida com RAN (0,946) foi significativamente maior que o melhor parâmetro do OCT (p=0,003), mas não houve diferença estatisticamente significante com o melhor parâmetro do CV (p=0,37). Conclusão: Os classificadores de aprendizagem de máquina treinados com dados do OCT e CV podem discriminar entre olhos normais e glaucomatosos com sucesso. A combinação das medidas do OCT e CV melhoraram a acurácia diagnóstica comparados aos parâmetros do OCT / Abstract: Purpose: To evaluate the sensitivity and specificity of machine learning classifiers (MLCs) for glaucoma diagnosis using Spectral Domain OCT (SD-OCT) and standard automated perimetry (SAP). Design: Observational cross-sectional study. Population: Sixty two glaucoma patients and 48 healthy individuals were included. Methods: All patients underwent a complete ophthalmologic examination, SAP and retinal nerve fiber layer (RNFL) imaging with SD-OCT (Cirrus HD-OCT; Carl Zeiss Meditec Inc., Dublin, California). Receiver operating characteristic (ROC) curves were obtained for all SD-OCT parameters and some SAP parameters (MD, PSD, GHT). Subsequently, the following MLCs were tested using parameters from SD-OCT and SAP: Bagging (BAG), Naive-Bayes (NB), Multilayer Perceptron (MLP), Radial Basis Function (RBF), Random Forest (RAN), Ensemble Selection (ENS), Classification Tree (CTREE), Ada Boost M1 (ADA), Support Vector Machine Linear (SVML) and Support Vector Machine Gaussian (SVMG). Areas under the ROC (aROC) obtained with SAP and OCT parameters were compared with those obtained with MLCs using combined OCT+SAP data. Results: The mean age was 57.0 ± 9.2 years for healthy individuals and 59.9 ± 9.0 years for glaucoma patients (p=0.103). Mean Deviation (MD) values were -4.1 ± 2.4 dB for glaucoma patients and -1.5 ± 1.6 dB for healthy individuals (p<0.001). SD-OCT parameters with the greater aROCs were inferior quadrant (0.813) and average thickness (0.807). The best SAP parameter was PSD (aROC=0.915). Combining OCT and SAP data, MLCs'aROCs varied from 0.777(CTREE) to 0.946 (RAN). The best combined OCT+SAP aROC, obtained with RAN (0.946), was significantly larger than the best single OCT parameter (p=0.003), but was not significantly different from the aROC obtained with the best single SAP parameter (p=0.37). Conclusion: Machine learning classifiers trained with OCT and SAP data can successfully discriminate between healthy and glaucomatous eyes. The combination of OCT and SAP measurements improved the diagnostic accuracy compared with OCT data alone / Mestrado / Oftalmologia / Mestre em Ciências Médicas
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Avaliação de um novo índice prognóstico para a cirurgia do buraco macular idiopático / Evaluation of a new prognostic index for the idiopatic macular hole surgery

Alan Diego Negretto 28 March 2008 (has links)
Objetivo: A partir das medidas anatômicas isoladas (altura, diâmetro externo e interno) do BMI construir um novo índice prognóstico para a cirurgia de correção do Buraco Macular Idiopático (IPBM). Tipo de estudo: intervencional, série de casos. Pacientes e Métodos: Estudo realizado no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo e no Instituto Suel Abujamra, São Paulo-SP, entre outubro de 2005 e outubro de 2007. Foram incluídos 36 olhos de 36 pacientes com BMI, que foram avaliados segundo as medidas apresentadas ao exame de TCO (Stratus - Zeiss, versão 4.01) antes da cirurgia do BMI. Utilizando o compasso do TCO, obteve-se a medida dos maiores diâmetros externo e interno e da altura dos BMI. Por meio dessas medidas, foi criado o IPBM. Após vitrectomia posterior com retirada de Membrana Limitante Interna (MLI), sem utilização de corantes, os pacientes foram acompanhados por seis meses. Após a cirurgia, os pacientes foram avaliados no primeiro e sétimo dias, duas semanas, um, três e seis meses. Ao final do seguimento, o IBPM e outras variáveis (sexo, idade, raça, estádio do BMI pela classificação biomicroscópica de Gass, tempo decorrido desde a piora da acuidade visual informada pelo paciente e a acuidade visual pré-operatória), foram correlacionadas com o resultado anatômico e a acuidade visual pós-operatória. Resultados: Vinte e nove (80,6%) dos 36 olhos com BMI obtiveram fechamento anatômico ao final de seis meses de acompanhamento (8,86 ± 4,23 meses). Dezenove (52,7%) dos BMI eram do estádio IV de Gass, com tempo de duração maior que um ano em 21 pacientes (58,3%). A AV LogMAR corrigida pré-operatória média foi de 1,10 (0,60 a 1,62) e a pós-operatória média foi de 0,69 (0,0 a 1,60). A média de melhora da AV foi de 3,94 linhas. Em relação ao fechamento anatômico, não houve significância em relação ao tempo de história da doença entre os grupos aberto (grupo 1) e fechado (grupo 2) (Teste t-Student, p=0,072). O diâmetro da base interna foi maior no grupo 1 em relação ao grupo 2 (Teste t-Student, p=0,007). Na análise do índice IPBM, houve diferença significativa entre o grupo 1 (média 0,49) e o grupo 2 (média 0,91). (Teste t-Student, p< 0,001) A análise de regressão logística apontou que BMIs com IPBM maior que 0,53 apresentam chance de fechamento anatômico 9,6 vezes maior (Odds Ratio= 9,6, p = 0,018). Pacientes com IPBM > 0,53 apresentaram AV pós-operatória ao final do sexto mês significativamente melhor do que pacientes com IPBM < 0,53 (Mann-Whitney, p=0,005). O ganho percentual da AV foi de 41,93% nos pacientes com IBPM>0,53, quando comparado com os 7,14% do grupo com IPBM <0,53 (p=0,002). No que diz respeito à AV final LogMAR, todas as variáveis estudadas anteriormente foram submetidas ao teste de correlação de Pearson. Observou-se que o IPBM tem uma correlação negativa significante com a AV, e foi selecionado juntamente com a AV pré-operatória através de regressão linear como os melhores preditores de AV final (p<0,001 e p=0,005, respectivamente). O modelo aponta que 58,4% da AV pós-operatória está sendo explicada pelo IPBM e AV pré-operatória. Conclusões: Foi construído um novo índice Prognóstico do Buraco Macular Idiopático (IPBM) representado pela razão altura / diâmetro interno do BMI. Verificou-se que o IPBM pode ser utilizado como fator prognóstico de fechamento anatômico do BMI. O IPBM e a AV pré-operatória foram os fatores prognósticos com melhor relação para a AV no sexto mês após o tratamento cirúrgico do BMI. / Purpose: To create a new prognostic index for IMH surgery based on anatomical values of IMH height, external and internal diameters (MHPI). Type of Study: Prospective, interventional, case of series. Patients and Methods: 36 eyes with IMH of 36 patients followed at Hospital das Clinicas, University of São Paulo Medical School (HC-FMUSP) and Suel Abujamra Institute (ISA), São Paulo-SP, between October 2006 and October 2007, were included. IMH OCT measurements were obtained before surgery (Stratus - Zeiss version 4.01) Values of the larger external and internal diameters, and the IMH height were obtained using the OCT compass. The prognostic index of IMH (MHPI) was defined as the index height / internal base. MHPI was defined by using those OCT measurements. Patients underwent pars plana vitrectomy with ILM peeling without dye and were followed by 6 months. Patients were seen at days 1, 7, 14, and months 1, 2, 3, and 6 after surgery. At the end of the follow-up period, MHPI and, other variables (sex, age, ethnic group, stage of IMH following the biomicroscopic classification of Gass, the time of visual loss reported by the patient, and pre surgical visual acuity) were correlated with anatomical results and post-surgical visual acuity. Results: Twenty nine eyes (80.6%) of thirty six patients with IMH had anatomical closure at the end of the six-month follow-up (8.86 ± 4.23 months). Nineteen (52.7%) IMH were stage IV of Gass with more than one year duration in twenty one patients. Pre-surgical medium LogMAR VA was 1.10 (0.60 to 1.62) and post-surgical was 0.69 (0.0 to 1.60). Medium VA improvement was 3.94 lines. The internal base diameter (BINT) was larger in group 1 than in group 2 (t-Student Test, p=0.373). MHPI analisys showed significant difference between group 1 (average 0.49) and group 2 (average 0.91) (t-Student Test, p> 0.001). Logistical regression showed that IMH with MHPI higher than 0.53 present 9.6 times more risk of failure than those with MHPI lower than 0.53 (Mann-Whitney, p=0.005). The percentage gain of VA was 41.93% in patients with MHPI > 0.53, and 7.14% in patients with MHPI lower than 0.53 (p=0.002). In regards to the final LogMAR VA, all studied variables above submitted to Pearson correlation test. MHPI is inversely correlated with VA by linear regression with gradient procedure as best predictor of final VA (p< 0.001 and p= 0.005 respectively). The sample shows that 58.4% of post-surgery VA is being explained by the MHPI and pre-surgery VA. Conclusions: A new prognostic index for IMH surgery was defined as IMH height/internal diameter. We concluded that MHPI may be used as a prognostic factor for IMH anatomical closure after surgical treatment. MHPI and preoperatory VA were the best correlated prognostic factors for 6-month VA.
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Avaliação de técnicas diagnósticas de lesão de cárie proximal: raio X, transiluminação com radiação infravermelho próximo e tomografia por coerência óptica

Marly Araújo Maia, Ana 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T22:58:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4060_1.pdf: 2278213 bytes, checksum: afea7a63daa6738b26d0bc8828b118f1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Esta dissertação foi organizada em forma de artigos científicos para serem enviados a revistas internacionais, especializadas na área de interface entre a Física Biomédica e Odontologia, precedido por uma introdução ao tema e revisão bibliográfica. A revisão de literatura em bancos de dados eletrônicos internacionais pesquisou a complexidade dos avançados métodos de diagnóstico de cárie precoce, elucidando técnicas que avaliam propriedades ópticas da interação laser-tecido, como a Transiluminação (TI, sigla em inglês) com infravermelho próximo (NIR, sigla em inglês), e Tomografia por coerência óptica (TCO). De acordo com os objetivos de avaliar as técnicas de forma integral, esta dissertação resultou em três artigos que apresentam inicialmente a montagem do sistema ótico e avaliação da resolução ótica, bem como a sensibilidade e especificidade no diagnóstico da cárie precoce. O primeiro artigo, intitulado de Evaluation of Near-Infrared Transillumination System for Early Caries Detection , a ser encaminhado ao Journal of Biomedical Optics, consiste em uma análise da resolução espacial do sistema de Transiluminação com Infravermelho Próximo tornando possível afirmar as possibilidades e limitações da técnica, quanto à menor visualização de uma lesão de cárie, elucidando interferências quanto a propagação da luz no tecido em diferentes espessuras de esmalte. Este teste inicial foi essencial para definir a metodologia utilizada. Os resultados obtidos mostraram uma visualização da cárie quantitativamente e provaram que a resolução do sistema não é um fator limitante. O segundo artigo intitulado, Evaluation of sensibility and specificity of NIR TI and X Ray images of noncavitated caries lesions , que será encaminhado a Photomedicine and Laser Surgery, proporcionou continuidade à avaliação da técnica. Um total de 28 imagens, referente a dentes sadios e com manchas brancas iniciais nas superfícies proximais, foram realizadas pela técnica de transiluminação com infravermelho próximo e pelo raio x convencional digitalizado. As imagens foram avaliadas por especialistas em Radiologia Odontológica, quanto à sensibilidade e especificidade, cujo resultado comprovou a eficácia da Transiluminação quando comparada ao raio x, comumente utilizado na prática clínica diária. Como resultado, ficou demonstrado que a sensibilidade da transiluminação é duas vezes melhor que o raio x enquanto que a especificidade foi semelhante nos dois casos. O terceiro artigo, intitulado Characterization of enamel in decíduos teeth by Optical Coherence Tomography: in vitro comparison between 850nm and 1280nm , que será enviado para publicação na International Journal of Paediatric Dentistry, avaliou a aplicação da Tomografia por Coerência Óptica em dentes decíduos comparada a cortes histológicos e microscopia óptica como padrão ouro. Os resultados demonstraram a eficácia da TCO em visualizar com qualidade as alterações ópticas ocorridas no tecido num processo de desmineralização. Também comprovou que o sistema com comprimento de onda em 1280nm apresenta maior profundidade de penetração em esmalte quando comparado ao de 850nm, devido às diferenças do coeficiente de espalhamento e de absorção. Em geral, conclui-se que a Transiluminação no infravermelho próximo e a TCO apresentam grande potencial de serem utilizadas na prática clínica proporcionando diagnóstico precoce, e conseqüentemente, o estabelecimento de métodos profiláticos e preventivos, para reversão ou controle do processo carioso
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Sensitivity and specificity of machine learning classifiers and spectral domain OCT for the diagnosis of glaucoma = Sensibilidade e especificidade de sistemas de aprendizagem de máquina e da tomografia de coerência óptica de domínio espectral para o diagnóstico de glaucoma / Sensibilidade e especificidade de sistemas de aprendizagem de máquina e da tomografia de coerência óptica de domínio espectral para o diagnóstico de glaucoma

Vidotti Pimenta, Vanessa Gonçalves, 1980- 24 August 2018 (has links)
Orientador: Vital Paulino Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Aplicadas / Made available in DSpace on 2018-08-24T05:07:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VidottiPimenta_VanessaGoncalves_D.pdf: 6967367 bytes, checksum: 6f865b9b0ad4158ca43a18b2ff974544 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: O presente estudo teve como objetivo investigar a sensibilidade e especificidade dos classificadores de aprendizagem de máquina (MLC) e da tomografia de coerência óptica de domínio espectral (SD-OCT) para o diagnóstico de glaucoma. Sessenta e dois pacientes com glaucoma e defeito de campo visual inicial a moderado, e 48 indivíduos saudáveis foram incluídos. Todos os participantes foram submetidos a um exame oftalmológico completo, perimetria automatizada acromática e medida da espessura da camada de fibras nervosas da retina com SD-OCT (Cirrus HD-OCT; Carl Zeiss Meditec, Inc., Dublin, Califórnia, EUA). Uma curva ROC (receiver operating curve) foi obtida para cada parâmetro do SD-OCT: espessura média, espessura nos quatro quadrantes (temporal, superior, nasal e inferior) e a espessura a cada hora de relógio. Posteriormente, foram testados os seguintes MLCs construídos a partir dos dados do OCT: Árvore de Decisão (CTREE), Random Forest (RAN), Bagging (BAG), Adaptative Boosting (ADA), Ensemble Selection (ENS), Multilayer Perceptrons (MLP), Rede de Funções de Base Radial (RBF), Naive-Bayes (NB), Support Vector Machine - Linear (SVMl) e Support Vector Machine - Gaussian (SVMg). Áreas sob as curvas ROC (aROCs) foram obtidas para cada parâmetro do SD-OCT e para cada MLC. A média de idade foi de 57,0 ± 9,2 anos para os indivíduos saudáveis e de 59,9 ± 9,0 anos para os pacientes com diagnóstico de glaucoma (p=0,103). Valores do &quot;mean deviation¿ (MD) foram de -4,1 ± 2,4 dB para pacientes com glaucoma e -1,5 ± 1,6 dB para indivíduos normais (p<0,001). Os parâmetros do SD-OCT com as maiores aROCs foram: quadrante inferior (0,813), espessura média global (0,807), 7 horas (0,765) e 6 horas de relógio (0,754). As aROCs dos classificadores variaram de 0,785 (ADA) a 0,818 (BAG). A aROC obtida com o BAG não foi significativamente diferente da aROC obtida com o melhor parâmetro isolado do SD-OCT (p=0,932). O SD-OCT mostrou boa acurácia diagnóstica em um grupo de pacientes com glaucoma inicial a moderado. Os MLCs não melhoraram a sensibilidade e a especificidade do SD-OCT para o diagnóstico do glaucoma / Abstract: This study aimed to investigate the sensitivity and specificity of machine learning classifiers (MLC) and spectral domain optical coherence tomography (SD-OCT) for the diagnosis of glaucoma. Sixty-two patients with early to moderate glaucomatous visual field damage and 48 healthy individuals were included. All subjects underwent a complete ophthalmologic examination, achromatic standard automated perimetry, and RNFL imaging with SD-OCT (Cirrus HD-OCT; Carl Zeiss Meditec, Inc., Dublin, California, USA). Receiver operating characteristic (ROC) curves were obtained for all SD-OCT parameters: average thickness, four quadrants (temporal, superior, nasal and inferior) and 12 clock hour measurements. Subsequently, the following MLCs were tested: Classification Tree (CTREE), Random Forest (RAN), Bagging (BAG), AdaBoost M1 (ADA), Ensemble Selection (ENS), Multilayer Perceptron (MLP), Radial Basis Function (RBF), Naive-Bayes (NB), and Support Vector Machine (SVM). Areas under the ROC curves (aROCs) were obtained for each parameter and each MLC. The mean age was 57.0 ± 9.2 years for healthy individuals and 59.9 ± 9.0 years for glaucoma patients (p=0.103). Mean deviation values were ¿4.1 ± 2.4 dB for glaucoma patients and ¿1.5 ± 1.6 dB for healthy individuals (p<0.001). The SD-OCT parameters with the greater aROCs were inferior quadrant (0.813), average thickness (0.807), 7 o¿clock position (0.765), and 6 o¿clock position (0.754). The aROCs obtained with classifiers varied from 0.785 (ADA) to 0.818 (BAG). The aROC obtained with BAG was not significantly different from the aROC obtained with the best single SD-OCT parameter (p=0.932). SD-OCT showed good diagnostic accuracy in a group of patients with early to moderate glaucoma. In this series, MLCs did not improve the sensitivity and specificity of SD-OCT for the diagnosis of glaucoma / Doutorado / Oftalmologia / Doutora em Ciências Médicas

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