Submitted by Luiz Felipe Barbosa (luiz.fbabreu2@ufpe.br) on 2015-03-10T17:10:16Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Rafael Henrique da Silva Santos.pdf: 2107062 bytes, checksum: e753b1fdcb1bd51bc05ca43bd216612c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T17:34:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Rafael Henrique da Silva Santos.pdf: 2107062 bytes, checksum: e753b1fdcb1bd51bc05ca43bd216612c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-08 / O Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) vem causando a morte de milhões de vítimas todos os anos. Trata-se de um retrovírus capaz de alterar o material genético das células hospedeiras, utilizando-as para produzir cópias de si. Nesse processo de replicação, podem ocorrer falhas no pareamento das bases nitrogenadas, resultando em mutações do HIV. Essas mutações são as responsáveis pela resistência aos medicamentos antirretrovirais e fazem com que o sistema imunológico do hospedeiro não reconheça mais o vírus. Assim, identificar as mutações no HIV que levam à resistência do vírus a certos medicamentos e predizer se o paciente terá uma resposta satisfatória a terapia antes mesmo dela ser iniciada, é de fundamental importância para o sucesso do tratamento. Muitos métodos estatísticos e de aprendizagem de máquina têm sido aplicados para tentar solucionar esse problema. Nesse trabalho, dados de indivíduos com HIV foram utilizados para desenvolver modelos responsáveis por predizer a resposta dos pacientes ao tratamento antirretroviral. Informações clínicas (carga viral e quantidade de células T-CD4+) juntamente com sequências de RNA do vírus (transcriptase reversa e protease) foram empregadas no treinamento dos classificadores Perceptron Multicamadas, Função de Base Radial, e Máquinas de Vetor Suporte. O algoritmo SMOTE foi aplicado para lidar com a enorme diferença entre o número de amostras de casos e controles, o que foi crucial para a precisão dos modelos. Os resultados mostram que o modelo SVM é mais preciso do que os outros dois, com uma área de curva ROC de 0,9398. Dos 1000 pacientes, 646 foram preditos corretamente por todos os modelos, ao passo que 69 foram classificados incorretamente na mesma situação. Analisando esses dados mais atentamente, foram identificados códons e propriedades importantes na diferenciação desses dois grupos de pacientes. Entre os códons identificados, alguns tem respaldo na literatura e outros são novos. A análise empregada oferece várias informações que podem ser muito úteis na predição da resposta de pacientes ao tratamento antirretroviral.

Submitted by Daniel Vargas Pacherrez (vargasdanyster@gmail.com) on 2018-08-23T12:22:42Z No. of bitstreams: 1 Dissertação final 24072018.docx: 3541516 bytes, checksum: 0c2ef9b5d394a33c8b5df7ed77e52948 (MD5) / Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2018-08-27T13:35:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação final 24072018.docx: 3541516 bytes, checksum: 0c2ef9b5d394a33c8b5df7ed77e52948 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-27T13:35:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação final 24072018.docx: 3541516 bytes, checksum: 0c2ef9b5d394a33c8b5df7ed77e52948 (MD5) / sem financiamento / Objetivo: Revisar os estudos sobre prevalência de hipertensão arterial (HA) em portadores de HIV/AIDS e fatores associados a HA (artigo 1); avaliar a prevalência de HA em portadores de HIV em uso de tratamento antirretroviral (TARV) e fatores associados (artigo 2) e revisar os estudos sobre a doença hepática gordurosa não alcoólica (DHGNA) em pacientes com HIV/AIDS (artigo 3). Métodos: A dissertação é composta por dois artigos de revisão da literatura (artigo 1 e 3) e um artigo original (artigo 2) em portadores de HIV / AIDS com TARV. Resultados: A primeira revisão da literatura evidenciou que a prevalência de HA em portadores de HIV/AIDS é ligeiramente maior quando comparada com as pessoas que não têm infecção e está associada a fatores de risco clássicos para HA. Entretanto, os resultados são controversos, em relação a associação entre HA e fatores relacionados à infecção pelo HIV e TARV, merecendo destaque o papel da idade nessa relação. O artigo 2 mostrou uma alta a prevalência de HA em portadores de HIV em uso de TARV e demonstrou associação positiva com os fatores de risco clássicos para HA, que também são risco para população geral tais como idade maior, índice de massa corporal (IMC) alto e antecedente familiar positivo e um fator protetor são os que usam apenas um esquema de TARV, mas só nos indivíduos abaixo de 50 anos. O artigo três mostrou uma alta prevalência de DHGNA em pacientes infectados pelo HIV, associados a alterações metabólicas e resistência à insulina. Conclusão: A prevalência da HA é alta nos adultos infectados com HIV / AIDS. A hipertensão arterial nos pacientes HIV positivos está ligada a fatores conhecidos nos adultos não infectados e fatores relacionados à infecção HIV, duração da TARV e carga viral. A prevalência de DHGNA é elevada nos adultos infectados com HIV.

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2017-06-02T19:41:02Z No. of bitstreams: 1 2015 - Thuany Christine Lessa de Azevedo Vieira.pdf: 2529622 bytes, checksum: e7159cd09d3d218f61d6f6cee88a775e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T19:41:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015 - Thuany Christine Lessa de Azevedo Vieira.pdf: 2529622 bytes, checksum: e7159cd09d3d218f61d6f6cee88a775e (MD5) Previous issue date: 2015-04-15 / FAPERJ / During the last decade, the antiretroviral therapy (ART) contributed to the reduction of the mortality and morbidity among HIV-1 affected people. However, the therapeutic flaw related to the appearance of resistence to the retrovirals due to the mutations and/or the not adherence to the antiretroviral therapy, is a problem of public health. It becomes of extreme importance, the comprehension of the resistence patterns and the mechanism related to them, enabling the choice of a suited therapeutic treatment that considers the mutation frequency, the quantity of viral particles and CD4+ cells among subtypes B and C. Therefore, the goal of the paper is to develop a model based on computational intelligence to help make decisions and give a better support to the clinic practice and research for those who deal with the pati-ents. 923 samples were used for thus study, obtained together with the Laboratory of Molecu-lar Virology of the Federal University of Rio de Janeiro, that belongs to the genotyping net-work of the Health Ministry. Initially, it was done a study of the profile of the mutations of subtypes B and C. To do so, it was made a cut of the patients that entered from 1998 on, with mutation frequency in the protease equal or greater than 5% and submitted to only one HA-ART therapy with just one protease inhibitor, Nelfinavir (NFV), or without any kind of prote-ase inhibitor. Through these studies, it was possible to observe that the subtype C has a diffe-rent character from subtype B, not only when it comes to the CV and CD4+ level but also the numbers of mutations in the protease gene, this fact emphasizes the necessity of specific tre-atments, from health professionals, for each subtype Key-words: antiretroviral treatment, HIV, Artificial Neural Network. / Durante a ?ltima d?cada a terapia antirretroviral (TARV) contribuiu para a redu??o da taxa de mortalidade e morbidade entre as pessoas infectadas pelo HIV-1. Contudo, a falha terap?utica relacionada ao surgimento de resist?ncias aos retrovirais em fun??o das muta??es e/ou pela n?o ades?o ? terapia antirretroviral ? um problema de sa?de p?blica. Torna-se de fundamental import?ncia a compreens?o dos padr?es de resist?ncias e dos mecanismos a eles associados, possibilitando a escolha de um tratamento terap?utico apropriado que considere a frequ?ncia de muta??o, quantidade de part?culas virais (CV) e c?lulas CD4+ entre os subtipos B e C. Portanto, o objetivo desse trabalho ? desenvolver um modelo baseado em intelig?ncia computacional para auxiliar a tomada de decis?o e proporcionar melhor suporte a pr?tica cl?-nica e de pesquisa daqueles que lidam diretamente com pacientes. Foram utilizadas 923 amos-tras para esse estudo, obtidas juntos ao Laborat?rio de Virologia Molecular da Universidade Federal do Rio de Janeiro pertencente ? rede de genotipagem do Minist?rio da Sa?de. Inicial-mente foi realizado um estudo do perfil de muta??es dos subtipos B e C. Para tal foi feito um corte com pacientes com entrada no sistema a partir de 1998, com frequ?ncia de muta??es na protease maior ou igual a 5% e submetidos a uma ?nica terapia HAART com apenas um ini-bidor de protease, Nelfinavir (NFV), ou sem nenhum inibidor de protease. Foram realizadas 50 simula??es para cada um dos subtipos usando as posi??es da sequ?ncia da protease como dados entrada juntamente com as taxas de carga viral e CD4+. Atrav?s dos estudos foi poss?-vel observar que o subtipo C possui car?ter diferenciado do subtipo B tanto em n?vel de CV e CD4+ quanto ao n?mero de muta??es no gene da protease, fato esse que enfatiza a necessida-de de tratamentos espec?ficos para cada subtipo pelos profissionais da sa?de. Al?m disso, o modelo demonstrou um desempenho satisfat?rio, possuindo um bom ?ndice de acertos.

Este estudo consiste em uma análise crítica sobre uma intervenção focada na melhoria da adesão de pessoas vivendo com aids ao tratamento antirretroviral, construída com base nas proposições da psicologia social construcionista, do referencial do Cuidado e do quadro da vulnerabilidade e dos direitos humanos. Essa intervenção foi testada pela primeira vez em um serviço de referência em DST/AIDS do estado de São Paulo, tendo sido conduzida por três profissionais de saúde previamente capacitadas, junto a pacientes em tratamento na instituição. Com o objetivo de descrever essa experiência e de compreender a viabilidade da condução da intervenção no contexto do SUS, por profissionais de diferentes especialidades, as três profissionais que integraram o estudo foram entrevistadas em profundidade, individualmente e em grupo. As entrevistas abordaram as reflexões das participantes sobre o processo de capacitação e a experiência prática na intervenção, incluindo seus relatos sobre os encontros que realizaram com os pacientes como parte da intervenção. Na discussão, enfocamos as principais facilidades e dificuldades encontradas pelas participantes ao longo do processo; as repercussões percebidas para sua atuação profissional e para o tratamento dos pacientes; e os desafios e sugestões levantados para uma futura implantação da intervenção em outros serviços. A proposta de intervenção mostrou-se factível do ponto de vista das profissionais que a conduziram e trouxe importantes reflexões para as práticas na área da assistência às pessoas vivendo com aids, contribuindo para o debate sobre as concepções teóricas e metodológicas que fundamentam as ações voltadas para a melhoria da adesão ao tratamento antirretroviral / This study presents a critical analysis of an intervention that sought to improve adherence of people living with aids to antiretroviral treatment based on the propositions of the social constructionist psychology, the Care reference and the vulnerability and human rights framework. This intervention was tested for the first time in an STD/AIDS reference service in the state of Sao Paulo. It was conducted by three previously trained health workers, along with patients undergoing treatment at the institution. Aiming to describe this experience and to understand the feasibility of the interventions conduction within SUS by workers from different areas, the three health workers who were part of the study were invited to answer to individual and group in-depth interviews. The interviews approached participants considerations regarding interventions training process and practical experience, including their reports about the meetings they held with patients as part of the intervention. In the discussion, we focused on the positive aspects and the main difficulties faced by participants throughout the process; the perceived results concerning their work practice and the patients treatment; and the challenges and suggestions proposed for a future implementation of the intervention in other services. The intervention was considered feasible from the health workers point of view and it brought important considerations about the practice developed to assist people living with aids, contributing to the debate concerning the theoretical and methodological conceptions that underlie the actions directed to improve the adherence to antiretroviral therapy

Este estudo consiste em uma análise crítica sobre uma intervenção focada na melhoria da adesão de pessoas vivendo com aids ao tratamento antirretroviral, construída com base nas proposições da psicologia social construcionista, do referencial do Cuidado e do quadro da vulnerabilidade e dos direitos humanos. Essa intervenção foi testada pela primeira vez em um serviço de referência em DST/AIDS do estado de São Paulo, tendo sido conduzida por três profissionais de saúde previamente capacitadas, junto a pacientes em tratamento na instituição. Com o objetivo de descrever essa experiência e de compreender a viabilidade da condução da intervenção no contexto do SUS, por profissionais de diferentes especialidades, as três profissionais que integraram o estudo foram entrevistadas em profundidade, individualmente e em grupo. As entrevistas abordaram as reflexões das participantes sobre o processo de capacitação e a experiência prática na intervenção, incluindo seus relatos sobre os encontros que realizaram com os pacientes como parte da intervenção. Na discussão, enfocamos as principais facilidades e dificuldades encontradas pelas participantes ao longo do processo; as repercussões percebidas para sua atuação profissional e para o tratamento dos pacientes; e os desafios e sugestões levantados para uma futura implantação da intervenção em outros serviços. A proposta de intervenção mostrou-se factível do ponto de vista das profissionais que a conduziram e trouxe importantes reflexões para as práticas na área da assistência às pessoas vivendo com aids, contribuindo para o debate sobre as concepções teóricas e metodológicas que fundamentam as ações voltadas para a melhoria da adesão ao tratamento antirretroviral / This study presents a critical analysis of an intervention that sought to improve adherence of people living with aids to antiretroviral treatment based on the propositions of the social constructionist psychology, the Care reference and the vulnerability and human rights framework. This intervention was tested for the first time in an STD/AIDS reference service in the state of Sao Paulo. It was conducted by three previously trained health workers, along with patients undergoing treatment at the institution. Aiming to describe this experience and to understand the feasibility of the interventions conduction within SUS by workers from different areas, the three health workers who were part of the study were invited to answer to individual and group in-depth interviews. The interviews approached participants considerations regarding interventions training process and practical experience, including their reports about the meetings they held with patients as part of the intervention. In the discussion, we focused on the positive aspects and the main difficulties faced by participants throughout the process; the perceived results concerning their work practice and the patients treatment; and the challenges and suggestions proposed for a future implementation of the intervention in other services. The intervention was considered feasible from the health workers point of view and it brought important considerations about the practice developed to assist people living with aids, contributing to the debate concerning the theoretical and methodological conceptions that underlie the actions directed to improve the adherence to antiretroviral therapy