Urbanization is one of the biggest threats to biodiversity. To address this problem, landscape planners have increasingly adopted landscape ecology as a theoretical basis for planning. They use spatial concepts that express principles of landscape ecology in diagrammatic form to create frameworks for planning. This dissertation presents a quantitative approach to evaluate the application of spatial concepts developed to create an armature of open space in areas subject to urbanization. It focuses on the predicted urban expansion of Damascus, Oregon, as a case study. An alternative futures study was used to test three open space spatial concepts for patches, corridors and networks in combination with compact and dispersed urban development patterns. The resulting eight scenarios of land use and land cover were then modeled for the year 2060 to evaluate their effects on habitat quantity, quality and configuration and to identify tradeoffs between urban development and conservation for three focal wildlife species: Red-legged frog, Western meadowlark, and Douglas squirrel. Open space spatial concepts strongly influenced habitat quantity and quality differences among future scenarios. Development patterns showed less influence on those variables. Scenarios with no landscape ecological spatial concept provided the most land for urban development but reduced habitat quantity and quality. Greenway scenarios showed habitat increases but failed to provide sufficient habitat for Western meadowlark. Park system scenarios showed habitat increases, but high-quality habitats for Western meadowlark and Red-legged frog decreased. Network scenarios presented the best overall amount of habitats and high-quality habitats for the three species but constrained urban development options. Next, I used an individual-based wildlife model, HexSim, to simulate the effects of habitat configuration and to compare and contrast resulting wildlife population sizes among the eight future scenarios with the ca. 2010 baseline landscape. Network scenarios supported the largest number of Red-legged frog breeders. Park scenarios performed best for meadowlarks, while greenway scenarios showed the largest populations of squirrels. Four of the eight scenarios sustained viable populations of Western meadowlarks. Compact development scenarios performed best for most indicators, but dispersed development scenarios performed better for Western meadowlarks. This dissertation includes both previously published and unpublished material.

Submitted by Maria Medeiros (maria.dilva1@ufcg.edu.br) on 2018-11-06T11:40:02Z No. of bitstreams: 1 LUCIANO FERNANDES MONTEIRO - TESE (PPGEP) 2012.pdf: 1345638 bytes, checksum: 56948a137db5ba5ecb07f475b625a828 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-06T11:40:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LUCIANO FERNANDES MONTEIRO - TESE (PPGEP) 2012.pdf: 1345638 bytes, checksum: 56948a137db5ba5ecb07f475b625a828 (MD5) Previous issue date: 2012-05-11 / Capes / As indústrias de processamento de frutas geram grandes quantidades de resíduos e em geral estes resíduos são descartados no ambiente, misturando os oriundos das diferentes frutas. Um aproveitamento racional e eficiente desses resíduos como substrato para a produção de proteínas microbianas poderá dar resultados satisfatórios na produção de suplementos para rações, contribuindo também para minimizar os problemas de deposição dos resíduos e agregar valor aos resíduos em forma de suplemento proteico. O presente trabalho foi realizado com o objetivo geral de viabilizar o processo de obtenção de enriquecidos proteicos para ração animal a partir de mistura dos resíduos agroindustriais do processamento de frutas, com estudos de casos com os resíduos do abacaxi, pedúnculo do caju e maracujá visando a produção de suplemento proteico animal, a logística de distribuição e a minimização dos custos do produto final através de análise econômica. Foi realizada a caracterização físicoquímica da mistura dos resíduos in natura e enriquecidos. O estudo do enriquecimento proteico foi realizado por fermentação semisólida (FSS) utilizando a levedura Saccharomyces cerevisiae como inóculo e mistura de resíduos de abacaxi, caju e maracujá como substrato. O enriquecimento foi realizado em estufa com circulação de ar e em câmara climática com umidade relativa do ar controlada. As condições de operação foram: percentagem de leveduras entre 3 e 8%, temperatura de 33 e 35 ºC e umidade relativa do ar de 60, 70 e 80%. Foi observado que a mistura de resíduos, mesmo em condições diversas das recomendadas, apresentou índice de enriquecimento proteico compatível com os relatados na literatura para os resíduos individuais, obtendo-se um produto com 20% de proteína bruta (b.s.). As melhores condições foram T = 35 ºC, inóculo de 3% de levedura e 80% de umidade relativa. Nestas condições o consumo de açúcares redutores foi de 3,422% e a umidade final dos resíduos enriquecidos de 78,24%. Foi realizado levantamento para identificação dos fornecedores de resíduos e de seus potenciais produtores na Região Nordeste, especificamente nos estados de Alagoas-AL, Ceará-CE, Paraíba-PB, Pernambuco-PE, Rio Grande do Norte-RN e Sergipe-SE. Mediante estudo de caso, através do método do centro de gravidade a localização recomendada para uma unidade produtora no estado de Sergipe foi o município de Estância. A análise preliminar de custos aponta para a viabilidade de produção, com preço final aproximado de R$ 0,47 por quilograma de suplemento proteico produzido, o que indica um valor muito competitivo em relação às alternativas tradicionais. / The fruit processing industries generate large quantities of wastes and the mixing of residuals from different fruits are usually disposed in the environment. A rational and efficient use of these wastes as a substrate for microbial protein enrichment may give satisfactory results in the production of supplements to diets obtaining products with value added. This use of residuals also contributes to minimize waste disposal problems. This work was carried out to optimize the overall process of obtaining enriched protein supplements for animal feed using the mixture of agro industrial wastes from processed fruits. Case studies with pineapple shell, cashew-apple bagasse and passion fruit shell and albedo aimed a better storage, distribution logistics and minimizing the costs of the final product through economic analysis. Fresh and enriched residuals mixture was characterized by their physicochemical properties. The study of protein enrichment was performed by solid state fermentation (SSF) using the yeast Saccharomyces cerevisiae as inoculum and a 1:1:1 mixture of pineapple shells, passion fruit shells and albedo and cashew apple bagasse as substrate. The enrichment was carried out in an oven with air circulation and in a climatic chamber with controlled relative humidity. The operating conditions were: yeast percentage between 3 and 8%, temperature 33ºC and 35 ° C and relative humidity between 60 and 80%. It was found that the mixture of wastes, even when processed out of the optimal conditions recommended for each one, presented protein enrichment index compatible with those reported in literature for the individual waste , obtaining a product with 20% crude protein (b.s). In the studied range it was found that the best conditions were T = 35 ° C, 3% of yeast inoculum and 80% relative humidity. Under these conditions the consumption of reducing sugars was 3.422% and the final moisture content of enriched waste 78.24%. Survey was conducted to identify the suppliers of waste and its potential producers in the Northeast of Brazil, specifically at the States: AL, CE, PB, PE, RN and SE. Through case study, by the method of center of gravity it was found that the neighbors of Estancia is the recommended location for a production unit in the State of Sergipe. A preliminary cost analysis indicates the feasibility of production, with the final price of approximately R$ 0.47 per kilogram of protein supplement produced, which indicates a very competitive value compared to traditional alternatives.

Com os processos de preservação do sêmen, os espermatozoides sofrem danos devido à indução de alterações estruturais e funcionais na membrana e, aliada a estrutura anatômica do cérvix da ovelha, repercute na redução de fertilidade após a inseminação artificial. Muitos protocolos de congelação e de refrigeração aliados a inúmeros diluentes, vêm sendo estudados, a fim de diminuir os danos causados a essas células e aumentar sua capacidade fertilizante. Para otimizar os processos de congelação e de refrigeração, os objetivos deste estudo foram determinar (1) a influência do método de congelação na motilidade, viabilidade, potencial de membrana mitocondrial e nos defeitos acrossomais do semen ovino criopreservado e (2) a influência de três diluentes comerciais na motilidade, viabilidade, potencial de membrana mitocondrial e nos defeitos acrossomais do sêmen ovino refrigerado. Doze ejaculados foram coletados, diluídos e congelados utilizando (A) uma curva manual de congelação (em vapor de nitrogênio liquido) e (B) um congelador programável (CL-8800, Cryologic Freeze Control®). Na curva A, as amostras foram refrigeradas e congeladas à 30°C/min. Na curva B, houve uma redução de temperatura de 20°C até -50°C durante 37min. Imediatamente após as curvas de criopreservação, as amostras foram submersas em nitrogênio líquido (-196ºC). Para o descongelamento, as palhetas foram submetidas à 37°C por 20seg e analisadas. Para os protocolos de refrigeração, o sêmen diluído em Botubov®, Bovimix® e TYB® foi armazenado à 5°C e à 15°C, e avaliado em 0, 24, 48 e 72h pós coleta. As análises de viabilidade e potencial de membrana mitocondrial (MMP) foram realizadas por citometria de fluxo, e a motilidade e os defeitos acrossomais foram avaliados microscopicamente. Motilidade (29%), viabilidade (18%) e MMP (26%) dos espermatozoides criopreservados com o diluente Bovimix® e a curva B foram significativamente (P<0,05) superiores do que todos os outros tratamentos. As amostras refrigeradas e diluídas com o diluente Bovimix® apresentaram resultados superiores, tanto à 5°C quanto à 15°C, para MMP (44% e 51%, respectivamente) e viabilidade (60% e 53%, respectivamente) 72h pós coleta, quando comparado com as amostras diluídas com Botubov® e TYB®. Em conclusão, os protocolos de congelação/descongelação e de refrigeração utilizados nestes experimentos, reduziram a motilidade, viabilidade, MMP e aumentaram os defeitos acrossomais quando comparados com o sêmen fresco. Os protocolos de congelação/descongelação prejudicaram mais a função espermática quando comparado com os protocolos de refrigeração. Por fim, os resultados sugerem que as amostras espermáticas diluídas com o diluente Bovimix® causou menos danos às células espermáticas do que as amostras diluídas com os diluentes Botubov® e TYB®, tanto nos protocolos de congelação, quanto nos protocolos de refrigeração. / The process of sperm preservation damages spermatozoa due to induction of structural and functional changes in the membrane, and allied to the ewe cervix anatomy, reflects the reduction in fertility after artificial insemination. Many semen preservation protocols including freezing and cooling rates coupled with different extenders have been studied in order to reduce sperm cryo-damage, increase the fertilizing capacity and increase the time of storage. To improve freezing and cooling processes, the objectives of this study were to determine (1) the influence of freezing method on sperm motility, viability, mitochondrial membrane potential and defected acrosome of cryopreserved sperm and (2) the influence of three commercial extenders on the motility, viability, mitochondrial membrane potential and defected acrosome of liquid storaged and frozen-thawed sperm. Twelve semen samples were collected from two mature rams, pooled, and diluted in Botubov®, Bovimix® and TYB®, and frozen using (A) a manual freezing method (liquid nitrogen vapor) and (B) an automated programmable freezer (CL-8800, Cryologic Freeze Control®). For curve A, semen samples were maintained at 37°C and then cooled/frozen at 30°C/min. For curve B, the temperature reduced from 20°C to -50°C during 37min. Immediately, after cryopreservation curves, samples were plunged and stored into liquid nitrogen (-196ºC). Then, the straws were thawed at 37°C for 20sec, and analyzed. For cooling studies, pooled ram semen was diluted in Botubov®, Bovimix® and TYB®, stored at 5°C and at 15°C, and evaluated at 0, 24, 48 and 72 h post collection. For viability and mitochondrial membrane potential (MMP) assessments, semen samples were stained and analyzed by flow cytometry. Motility and defected acrosome assessments were analyzed microscopically. Motility (29%), viability (18%) and MMP (26%) of spermatozoa cryopreserved in Bovimix® coupled to curve B were significantly (P<0.05) higher than all other treated groups. Semen samples diluted with Bovimix® and stored at 5°C and at 15°C yielded better MMP (44% and 51%, respectively) than the samples diluted in Botubov® and in TYB®, and also showed higher viability characteristics at 5°C and at 15°C (60% and 53%, respectively) 72h post collection. In conclusion, freezing/thawing and cooling protocols used in these experiments reduced sperm motility, viability, MMP and increased the defects of acrosomes when compared to fresh semen. Freezing/thawing protocols harmed more spermatozoa function than cooling protocols. Furthermore, our results suggest that the semen samples diluted in the extender Bovimix® caused the least cellular injury than the samples diluted in Botubov® and in TYB® on freezing and on cooling protocols.

Os cálculos de custo de produção apontam para a viabilidade econômica da soja apenas em médias e grandes propriedades, entretanto os agricultores familiares persistem nesta atividade produtiva há gerações. Diante disso, o objetivo geral deste trabalho é compreender as racionalidades, motivações e estratégias dos agricultores familiares que culminam em sua manutenção na produção de soja em uma região representativa de ambos. Para tanto, foram utilizados dados secundários dos Censos Demográficos e do Censo Agropecuário e pesquisa de campo no município de Capanema na mesorregião do Sudoeste Paranaense. Observou-se a existência de dois conjuntos de motivações e/ou estratégias na sojicultura familiar do Sudoeste. O primeiro conjunto refere-se às motivações exógenas que impulsionam a soja entre os agricultores familiares que são as políticas públicas, tanto creditícias quanto de seguro consideradas fundamentais para o custeio da produção; o mercado que oferece os insumos, define os preços e adquire a produção; as tecnologias direcionadas como as sementes transgênicas e o maquinário agrícola, responsáveis pelo aumento da produtividade e diminuição da penosidade do trabalho em um ambiente de pouca mão de obra e de população, cada vez mais envelhecida. O segundo conjunto é formado pelos fatores endógenos verificados no trabalho de campo. Ele refere-se à cultura da população rural do Sudoeste, à detenção de um saber fazer sobre a sojicultura, à tradição, às possibilidades que a terra e o clima local oferecem e à renda adquirida pelas famílias. As diferentes combinações destes fatores explicam as razões e o modo como os sojicultores familiares constroem suas racionalidades para se viabilizarem na produção e permanecerem como agricultores, mesmo em meio às dificuldades da atividade. / Estimation of production costs estimation suggests that soya crop would be economically viable only in medium and large lands; however, family farmers have kept this activity for many generations. Taking it into account, the main goal of this thesis is to understand the rationality, strategies and motivations which support the soya farmers’ activities in a representative region of both. In order to answer these questions, secondary dataset from diverse sources were employed such as demographics and agricultural Surveys as well as field research in Capanema Municipality, in the Mesoregion of Southwest Parana. According to the field survey, we observe that there are two samples of motivations and strategies. The first sample refers to exogenous motivations, which support soya activities; public policies such as credits and insurance-both being essential for the production costs- and also, the market that offers the inputs, sets the prices and get the production, technologies which have developed transgenic seeds and farm machines - both being essential for the increase in the productivity and reduction of hardship in an environment with low workforce and elderly population. The second sample is the result of endogenous factors such as culture, knowledge transmitted by previous generations, possibilities to explore land considering local climate and their income. The different combinations of these factors explain why and how soya farmers develop diverse rationality to have economically viable production and consequently, remain as farmers, despite all the existing difficulties.

Micronutrientes, vitaminas e minerais, são indispensáveis para as vias de metabolismo do DNA e, além disso, são tão importantes para a manutenção da vida quanto os macronutrientes. Na ausência dos nutrientes adequados, a instabilidade genômica compromete a homeostase, ocasionando doenças crônicas e certos tipos de câncer. Meios de cultura celular tem por finalidade mimetizar o ambiente in vivo, proporcionando aos modelos in vitro condições adequadas para que se avalie a resposta celular aos diferentes estímulos. O artigo de revisão sumariza e discute os micronutrientes usados na suplementação das culturas celulares e sua influência na a viabilidade celular e a estabilidade genômica, focando nos estudos in vitro previamente realizados. Nestes estudos, os meios de cultura celular incluem certas vitaminas e minerais em concentrações distintas das fisiológicas in vivo. Em muitos meios de cultura comumente usados, a única fonte de micronutrientes é o Soro Fetal Bovino (SFB), o qual contribui com 5-10% da composição final do meio. Atenção insuficiente tem sido direcionada à composição de SFB, micronutrientes e culturas celulares como um todo, ou à influência de micronutrientes na viabilidade e genética de culturas celulares. Estudos adicionais avaliando melhor o papel de micronutrientes no nível molecular e a sua influência na estabilidade genômica de células ainda se fazem necessários. O micronutriente foco dessa tese é o Ferro (Fe), que por sua vez é um micronutriente essencial, sendo requerido para o crescimento, desenvolvimento e condições normais de funcionamento das células. Tanto seu excesso quanto a sua deficiência podem causar estresse oxidativo e dano ao DNA. Uma vez que os meios de cultura usualmente utilizados para culturas celulares têm níveis de Fe abaixo das concentrações encontradas no soro fisiológico humano, os objetivos deste estudo foram a avaliação do papel da suplementação com Fe na viabilidade celular, na produção de espécies reativas de oxigênio (ERO), na atividade da catalase, na integridade genômica, na expressão de proteínas de reparo de DNA que contém clusters Fe/S em sua estrutura (TFIIH e MutyH) e na expressão de receptores de absorção de Fe (CD71 e Nramp2). Duas linhagens celulares – MRC5 (fibroblasto pulmanar humano) e HepG2 (hepatocarcinoma) - e dois tipos de suplementação com Fe foram utilizados, holo-Transferrina (h-Tf) e FeSO4. Ambas suplementações foram capazes de aumentar os níveis intracelulares de Fe e a viabilidade genômica. A suplementação com Fe também aumentou a formação de ERO, sem alterar a atividade da catalase. No entanto, este aumento de ERO não foi acompanhado por genotoxicidade. No que se refere à expressão de proteínas de reparo ao DNA, os resultados sugerem que o pré-tratamento com h-Tf ou FeSO4 não exercem influência direta na expressão de TFIIH ou MutyH. Entretanto, na expressão de receptores de Fe, os resultados preliminares indicam que CD71 é uma via prioritária de absorção de Fe, estando relacionada com a homeostase de Fe, enquanto Nramp2 parece ter um papel secundário. Devido à importância fisiológica da h-Tf na homeostase do Fe e o acúmulo de ERO menos pronunciado, sugere-se que h-Tf seja uma melhor forma para a suplementação de Fe nas culturas in vitro. Estudos adicionais se fazem necessários para a melhor elucidação do papel do Fe na viabilidade celular e estabilidade genômica. / Micronutrients, including minerals and vitamins, are indispensable to DNA metabolic pathways and thus are as important for life as macronutrients. Without the proper nutrients, genomic instability compromises homeostasis, leading to chronic diseases and certain types of cancer. Cell-culture media try to mimic the in vivo environment, providing in vitro models used to infer cells’ responses to different stimuli. The review summarizes and discusses studies of cellculture supplementation with micronutrients that can increase cell viability and genomic stability, with a particular focus on previous in vitro experiments. In these studies, the cell-culture media include certain vitamins and minerals at concentrations not equal to the physiological levels. In many common culture media, the sole source of micronutrients is fetal bovine serum (FBS), which contributes to only 5-10% of the media composition. Minimal attention has been dedicated to FBS composition, micronutrients in cell cultures as a whole, or the influence of micronutrients on the viability and genetics of culture cells. Further studies better evaluating micronutrients’ roles at a molecular level and its influence on the genomic stability of cells is still required. The micronutrient focus on this thesis is Iron (Fe), which is an essential micronutrient and is required for growth, development, and normal cellular functioning. Either excess or deficiency of iron can cause oxidative stress and DNA damage Since the cell media commonly used for cell culture has a lower iron concentration than the human serum, this study aimed to evaluate the role of iron supplementation on viability, reactive oxygen species (ROS) production, catalase activity, genome integrity and the expression of iron-bearing DNA repair proteins (TFIIH and MutyH) and proteins associated with iron absorption (CD71 and Nramp2). Two human cell lines – MRC5 (normal lung fibroblast) and HepG2 (hepatocellular carcinoma) and 2 sources of iron - holo-Transferrin (h-Tf) or FeSO4 were used. Both iron supplements were able to increase intracellular iron levels and cell viability. Iron supplementation increased the formation of ROS, but did not alter catalase activity. However, this increase was not accompanied by genotoxicity. Regarding the DNA repair protein expressions, the results suggest that 24h pre-treatment with h-Tf or FeSO4 has no role in the TFIIH or MutyH expressions. Although, in iron receptor proteins expression, the preliminary data could indicate that CD71 is priority related with Fe homeostasis while Nramp2 seems to have a secondary role. Due to h-Tf physiological role in the iron homeostasis and the less pronounced ROS accumulation, h-Tf could be a better iron supplier in vitro. Additional studies are still required to better elucidate the role of Fe in cell viability and genomic stability.

A inseminação artificial é utilizada como uma importante ferramenta para o melhoramento reprodutivo, tanto com sêmen resfriado ou congelado. O primeiro experimento teve como objetivo identificar um tampão de pH para resfriamento de sêmen de pôneis por 48 horas a 5°C e 15°C. O efeito de cinco tampões (TES (ácido N-tris (hidroximetil) metil-2-aminoetanosulfônico), PIPES (ácido piperaxín-N,N'-bis(2-etanosulfônico)), BES (ácido N,N-Bis(2-18hidroxietil)-2-aminoetanosulfônico), MES (ácido 4-morfolinoetanosulfônico) e HEPES (ácido N-2-hidroxietilpiperazina-N’-2-etanosulfônico)) foi avaliado em um diluente composto de leite em pó desnatado e glicose. Os testes do diluente com os tampões BES, MES e TES foram conduzidos com o sêmen fresco de oito pôneis e no sêmen resfriado por 48 h a 15°C. Uma amostra de cada grupo foi utilizada para análise da motilidade, pH, osmolaridade, teste hiposmótico, atividade mitocondrial (MTT) e integridade de membrana através das sondas fluorescentes. O pH e a osmolaridade dos diluentes sem o sêmen também foram avaliados. Os dados foram analisados por análise de variância e pelo teste de Tukey, quando P < 0.05 foi significante. A osmolaridade do sêmen diluído não variou entre diluentes e foi para o BES 350.91 ± 11.24 mOsm, MES 350.41 ± 11.76 mOsm e TES 350 ± 12.96 mOsm. O pH do sêmen após diluição nos respectivos diluentes variou entre as horas avaliadas (P < 0.05) e não variou com o passar do tempo o que evidencia o efeito tamponante dos diluentes. A osmolaridade dos diluentes foi similar entre os tampões BES (366 ± 5.47 mOsm), MES (370 ± 6.12 mOsm) ou TES (371 ± 5.47 mOsm) a fresco e sem adição de sêmen. Já o pH variou (P < 0.05) de acordo com o tampão. No experimento a 5°C ocorreu decréscimo na porcentagem de motilidade total, progressiva e local do sêmen resfriado após 24 h e 48 h comparado a avaliação a fresco em todos os grupos. No entanto, a porcentagem de espermatozoides móveis a fresco, 24 h e 48 h a 5°C entre tratamentos foi similar. A porcentagem de espermatozoides reativos ao teste hiposmótico, e com atividade mitocondrial não diferiu entre tratamentos. No experimento a 15°C o vigor e motilidade total, progressiva e local foram similares entre os tampões BES, MES e TES em cada período avaliado. A osmolaridade do sêmen diluído não variou entre diluentes e foi para o BES 360.93 ± 10.52 mOsm, MES 361.47 ± 6.79 mOsm e TES 361.56 ± 7.68 mOsm. Devido as características individuais de cada tampão o pH do sêmen diluído variou entre os diluentes com os tampões utilizados. A porcentagem de espermatozoides reativos ao teste hiposmótico, com atividade mitocondrial e membrana intacta observada com CFDA e PI não diferiu entre tratamentos. Evidenciou-se que tanto BES, MES ou TES podem ser utilizados no armazenamento e transporte do sêmen de pôneis durante 48 h a 5°C ou 15°C. O segundo experimento teve como objetivo foi avaliar a influência da suplementação de ácidos graxos poli-insaturados sobre a qualidade de sêmen de pôneis da raça Brasileira a fresco e após congelamento. Oito pôneis receberam sua dieta convencional não suplementada (grupo controle) ou dieta convencional e 70 g de farinha de alga Schizochytrium sp rica em DHA (grupo PUFA). O efeito da Vitamina E (1 mM, DL-α-tocoferol), adicionada ao diluente de congelamento para sêmen também foi avaliado sobre a qualidade seminal, antes e após o congelamento do sêmen. O sêmen foi coletado a cada 15 dias durante 60 dias. Os garanhões tratados passaram a controle e vice-versa após um intervalo de sessenta dias. O sêmen foi avaliado a fresco e após o congelamento. Motilidade e vigor foram avaliados a fresco. Após o descongelamento motilidade, funcionalidade de membrana, integridade de membrana e análise computadorizada da motilidade foram avaliados. Os valores médios para os parâmetros avaliados a fresco no grupo PUFA e controle foram similares. Os valores médios da motilidade total, progressiva e local, hiposmótico, CFDA/PI e análise computadorizada de sêmen suplementados com DHA e o grupo controle pós-descongelamento não diferiram. A associação da suplementação de DHA e Vitamina E adicionada ao diluente não potencializou a capacidade antioxidante do diluente durante o congelamento. A associação da suplementação de DHA e Vitamina E adicionada ao diluente resultou em diminuição da motilidade total e progressiva comparada ao grupo não suplementado (controle). A suplementação de 70 g de farinha de alga Schizochytrium sp rica em DHA e ou a inclusão de 1 mM de vitamina E ao diluente de congelamento de sêmen em pôneis da raça Brasileira não foi eficiente para promover melhoria na viabilidade seminal após a coleta ou mesmo após o congelamento. / Artificial insemination with cooled and frozen semen is an important tool for breeding industry. The first experiment aimed to identify a pH buffer for cooling semen of ponies for 48 h at 5°C and 15°C. The effect of five buffers (TES (N-tris (hydroxymethyl) methyl-2-aminoethanesulfonic acid), PIPES (piperaxin-N, N'-bis (2-ethanesulfonic acid)), BES (N, N-Bis (N-2-hydroxyethylpiperazine-N'-2-ethanesulfonic acid)) was evaluated in a extender composed of skimm milk powder and glucose. Analysis with the BES, MES and TES buffers were performed in fresh semen of eight ponies and in cooled semen for 48 h at 15°C. A sample from each group was used for analysis of motility, pH, osmolarity, hyposmotic test, mitochondrial activity (MTT) and membrane integrity through fluorescent probes. The pH and osmolarity of the extenders without semen were also evaluated. Data were assessed by analysis of variance and Tukey's test, when P <0.05 was considered significant. Osmolarity of the diluted semen did not differ between extenders and was for BES 350.91 ± 11.24 mOsm, MES 350.41 ± 11.76 mOsm and TES 350 ± 12.96 mOsm. The pH of the semen after dilution in the respective extenders varied between the hours (P <0.05) and did not change over time as evidenced by the buffering effect of the extenders. Extender osmolarity was similar between BES (366 ± 5.47 mOsm), MES (370 ± 6.12 mOsm) or TES (371 ± 5.47 mOsm) buffers after dilution and without addition of semen. The pH varied (P <0.05) according to the buffer. In the experiment at 5°C all treatments showed a decrease in the percentage of total, progressive and local motility of the cooled semen after 24 h and 48 h compared to the fresh. However, in the percentage of motile sperm to fresh, 24 h and 48 h at 5°C between treatments was similar. Percentage of spermatozoa reactive to the hyposmotic test, and with mitochondrial activity did not differ between treatments. In the experiment at 15°C total, progressive and local vigor and motility were similar between BES, MES and TES buffers in each period. Osmolarity of the diluted semen did not differ between extenders and was for BES 360.93 ± 10.52 mOsm, MES 361.47 ± 6.79 mOsm and TES 361.56 ± 7.68 mOsm. Due to the individual characteristics of each buffer, diluted semen pH varied between the extenders with the buffers used. Percentage of spermatozoa reactive to the hyposmotic test, with mitochondrial activity and intact membrane observed with CFDA and PI did not differ between treatments. We concluded that BES, MES or TES can be used in the storage and transport of ponies semen for 48 h at 5°C or 15°C. The second experiment aimed to evaluate the influence of polyunsaturated fatty acid supplementation in the fresh and after freezing semen of Brazilian ponies. Eight ponies received their conventional diet (control group) or conventional diet and 70 g of DHA-rich Schizochytrium sp algae meal (PUFA group). The effect of Vitamin E (1 mM, DL-α-tocopherol) added to the freezing diluent for semen was also evaluated on seminal quality, before and after freezing. Semen was collected every 15 days during 60 days. Stallions were reversed in treatments after an interval of sixty days. Semen was evaluated fresh and after freezing. Motility and vigor were estimated in the fresh semen. After thawing motility, membrane functionality, membrane integrity and computed motility analysis were evaluated. Mean values for fresh parameters evaluated in the PUFA and control groups were similar. Mean values of total, progressive and local motility, hyposmotic, CFDA/PI and computerized analysis of semen supplemented with DHA and post-thaw control group did not differ. The combination of DHA and Vitamin E supplementation added to the diluent did not potentiate the antioxidant capacity of the diluent during freezing and resulted in decreased total and progressive motility compared to the non-supplemented group. Supplementation of 70 g of DHA-rich microalgae Schizochytrium sp and the addition of 1 mM vitamin E to the semen freezing diluent in Brazilian ponies was not efficient to promote improvement in seminal viability after collection or even after freezing.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:34:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_4971_Dissertação_Nahun Thiagor.pdf: 1844062 bytes, checksum: 8e3e54f1750887fb5387ffffb0103629 (MD5) Previous issue date: 2011-08-16 / No presente estudo é estabelecida uma correlação entre alguns tensoativos, um derivado de ciclodextrina, oligossacarídeo cíclicos originado da ação da ciclodextrina glicosiltransferase, a β-ciclodextrina metilada e as linhagens de câncer de ovário A 2780 e OVCAR 3, tentando abrir a possibilidade de utilização da ciclodextrina associada a medicamentos quimioterápicos padronizados à terapia contra o câncer de ovário, que é apontado como uma das principais causas de óbito entre as malignidades ginecológicas. O câncer de ovário apresenta alta taxa de mortalida, além de possuir vários subtipos histo-clínicos, a cada ano aumenta cada vez mais o número de pacientes diagnosticadas, assim, é indispensável à continuidade das pesquisas científicas relacionadas a este tipo de câncer, visto que os conhecimentos até então elaborados são de extrema significância, porém insuficientes para que seja estabelecida uma cura. Através da viabilidade celular pelo método do MTT, onde se utiliza o sal de tetrazol para expressar de forma quantitativa a proliferação e sobrevivência das células e o método de BRADFORD, para normalização de dados, tenta-se estabelecer a influência de alguns tensoativos e do derivado de ciclodextrina sobre e entre as linhagens de câncer de ovário. A metil-β-ciclodextrina e os tensoativos SDS, TX100 E TW20 induziram uma redução da atividade mitocondrial dose-dependente em cultura de células de câncer de ovário da linhagem A 2780 e OVCAR 3. O derivado de ciclodextrina demonstrou indução gradativa da redução da atividade mitocondrial para duas das oito concentrações testadas (0,2% e 0,4%) com viabilidade celular próxima a 60% na linhagem A 2780. Na linhagem OVCAR 3 a metil-β-ciclodextrina apresenta potencial citotóxico capaz de inviabilizar 25% do crescimento celular em concentrações superiores a 0,003125%, a viabilidade celular perante as mesmas condições de tratamento é menor nesta linhagem quando comparada a linhagem A 2780. Devido às propriedades da ciclodextrinas os resultados das análises comparativas de viabilidade celular, nas linhagens de câncer de ovário, estes resultados apontam para possibilidades maiores em futuros estudos, podendo a pesquisa aqui apresentada ser tomada como referência. / This study sets up a correlation between some surfactants, a derivate of cyclodextrin, cyclic oligosaccharide originated from the action of the glycosyltransferase cyclodextrin, a methyllated β-cyclodextrin and the lines of ovarian cancer A 2780 and OVCAR 3, trying to offering the possibility of using cyclodextrin associated with standard chemotherapy drugs in therapy against ovarian cancer, which is pointed as one of the main causes of death among gynecological ills. Ovarian cancer is connected with high mortality rate and has several histo-clinical subtypes, raising the number of patient diagnosed each year, therefore there are the needy of continuing the scientific research which this kind of cancer is related, once the knowledge developed so far are extremely significant, yet it still is insufficient to generate a cure. Through the cellular viability by MTT method, which uses salt of tetrazol to express quantitatively the proliferation and survival of cells, and Bradford method for standardization data, it attempts to establish the influence of surfactants and some of the derivate of cyclodextrin on and between the lines of ovarian cancer. The methyl-β-cyclodextrin and the surfactant SDS, TX100 and TW20 induced a reduction in dose-dependent mitochondrial activity in cell cultures of ovarian cancer line A 2780 and OVCAR 3. The cyclodextrin derivate has demonstrated induction of gradual reduction of the mitochondrial activity of two from eight concentrations tested (0,2% and 0,4%) with cell viability of approximately 60% in strain A 2780. In the line OVCAR 3 the methyl-β-cyclodextrin shows potential cytotoxic able to tamper 25% of cell growth in conditions of treatment is reduced in this strain when compared with strain A 2780. Due to the properties of cyclodextrins, results of comparative analyzes of cell viability, in the strains of ovarian cancer, indicates to greater possibilities in future studies, enabling the research presented here as a reference.

Orientadora: Prof. Dra. Marcella Pecora Milazzotto. / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biotecnociência, 2015. / A morfologia e as taxas de clivagem e de blastocistos têm sido critérios utilizados para avaliação da competência embrionária. Entretanto, com o advento de novas biotecnologias tem-se tornado claro que a competência embrionária pode ser severamente comprometida sem alterações morfológicas perceptíveis. Estudos em embriões humanos propuseram avaliações morfológicas adicionais relacionadas ao momento das primeiras divisões celulares embrionárias (rápida e lenta) que parecem estar relacionadas com a viabilidade do embrião. No entanto, ainda não existem muitos dados dessa análise morfocinética em bovinos. A viabilidade embrionária também pode ser severamente comprometida pelo acúmulo de lipídeos nos embriões PIV, podendo inclusive prejudicar aplicações comerciais como a criopreservação. Com isso, o objetivo desse estudo foi caracterizar em embriões bovinos de cinéticas diferentes de desenvolvimento (rápido e lento) o padrão de metabolismo lipídico. Para tal, embriões produzidos in vitro foram analisados quanto a quantidade de lipídeos totais e caracterização de lipídeos de membrana nos estádios iniciais de clivagem (22hpi e 96hpi) e blastocisto. Para o estádio de blastocisto também foi incluído um grupo de embriões in vivo. Foi possível evidenciar menor quantidade de lipídeos totais pela coloração SUDAN BLACK B nos grupos lentos. As análises de MALDI-MS evidenciaram lipídeos de membrana com padrões distintos nos grupos rápidos e lentos nos estádios de clivagem e mórula. Já nos estádios de blastocistos os dados nos permitem inferir que o grupo de blastocisto lento parece estar mais próximo do grupo in vivo, pela semelhança na abundância/intensidade relativa no maior número de íons revelados pelas análises multivariadas. No entanto, o grupo lento ainda mostra alguma semelhança com o grupo rápido devido a exposição ao mesmo ambiente in vitro. / Embryo viability and competence have been evaluated by criteria such as morphology and cleavage and blastocyst rates. However, the advent and application of new biotechnologies have demonstrated that embryonic competence can be severely compromised without noticeable morphological changes. Human embryo studies proposed the use of additional morphological evaluations related to the moment of the first embryonic cell divisions and its kinetic (fast and slow), which appear to be relevant to the embryo viability. Nevertheless, there are still not enough data available related to the morphokinetic analysis of embryos in bovine cattle. Embryo viability can also be severely compromised by lipid accumulation in IVP (in vitro produced) embryos and can even harm commercial applications such as cryopreservation. Therefore, the aim of this study was to evaluate and characterize the pattern of lipid metabolism on bovine embryos with different developmental kinetics (fast and slow). For this goal, IVP embryos were analyzed considering the lipids total amount and membrane lipids characterization during the cleavage early stages (22hpi and 96hpi) and blastocyst stage. The study also included a group of in vivo embryos at the blastocyst stage. The results, using SUDAN BLACK B staining technique, showed a smaller amount of total lipids in the slow groups. The MALDI-MS analysis results showed different patterns of membrane lipids in the fast and slow groups in the cleavage and morulae stages. The data obtained at the blastocyst stage allow us to infer that the slow group is more similar to the in vivo group, since the results showed similarity in relative quantity/intensity in a greater number of ions revealed by multivariate analysis. However, the slow group still shows some similarity with the fast group due to the exposure to the same in vitro environment.

Submitted by LEANDRO AUGUSTO FELIX TAVARES null (leandropekiki@hotmail.com) on 2016-01-21T02:09:43Z No. of bitstreams: 1 TESE LEANDRO FINAL.pdf: 1924418 bytes, checksum: 00b22b6beafcf0567713349857b8b0e4 (MD5) / Approved for entry into archive by Sandra Manzano de Almeida (smanzano@marilia.unesp.br) on 2016-01-21T13:42:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 tavares_laf_dr_bot.pdf: 1924418 bytes, checksum: 00b22b6beafcf0567713349857b8b0e4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-21T13:42:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tavares_laf_dr_bot.pdf: 1924418 bytes, checksum: 00b22b6beafcf0567713349857b8b0e4 (MD5) Previous issue date: 2015-12-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Na busca pelo maior retorno financeiro para os produtores rurais, pesquisadores têm estudado diferentes métodos de produção, dentre os quais está a redução do espaçamento entre fileiras no momento da semeadura. Contudo é necessário a realização de balanço econômico para saber se é viável para os produtores a inclusão dessas novas técnicas de semeadura. Diante do exposto, o objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito de diferentes sistemas de semeadura na cultura da soja semeada com semeadora-adubadora de precisão e de fluxo contínuo, bem como o seu balanço econômico. O experimento foi conduzido na área experimental das Fazendas de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE) da Faculdade de Ciências Agronômicas, da Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” – UNESP, Campus de Botucatu. O delineamento experimental foi em blocos casualizados em esquema de arranjo fatorial 4x2, sendo 4 sistemas de semeadura [sistema de semeadura convencional (testemunha), sistema de semeadura cruzada, sistema de semeadura adensado e sistema de semeadura em fileira dupla] e 2 tipos de semeadora [Semeadora-adubadora de precisão e de fluxo contínuo], com quatro repetições. As características agronômicas avaliadas foram: altura de plantas e inserção de vagens, determinação da população final de plantas, determinação do teor de água dos grãos, determinação da massa de 1.000 grãos e determinação da produtividade. Foi avaliado também o dano mecânico em sementes por meio das análises de teste de verde rápido e teste de germinação. O balanço econômico foi realizado utilizando a metodologia de custo operacional das máquinas agrícolas descritas por MIALHE (1974) e ASABE (2006). Depois de realizada a análise se variância foi verificada diferença estatística para as todas as características agronômicas avaliadas no experimento. Verifica-se que houve diferença estatística em todas as características agronômicas avaliadas no experimento, constata-se também principal dos tipos de semeadora para as características produtividade e dano mecânico da cultura de soja, dessa forma observou-se que a semeadora de fluxo contínuo causou maior dano mecânico a semente do que a semeadora de precisão, logo também houve diferença estatística na produtividade da cultura da soja, em que quando a semeadura foi realizada com a semeadora de precisão a produtividade foi mais elevada. Avaliando os espaçamentos utilizados no estudo foi constatado que o espaçamento em fileira dupla obteve maior produção, diferindo estatisticamente dos demais arranjos de semeadura. Em relação ao custo total de produção observou-se que os arranjos de semeadura mais onerosos são os que é necessário realizar duas passadas na mesma área, são estes, sistema de plantio cruzado com as semeadoras de precisão e fluxo contínuo, sistema semeadura adensado com a semeadora de precisão. Na relação benefício/custo dos sistemas ficou constatado que o melhor arranjo de semeadura é o fileira dupla quando a operação foi realizada com a semeadora de precisão. / In an attempt to increase the financial return to farmers, researchers have studied diferente production methods such as the reduction of the spacing between rows during the sowing. However, a study of the economic balance is needed to know whether the use of this method at sowing is feasible for farmers. Therefore, the objective of this work was to evaluate the soybean crop as to the effect of different sowing systems using a precision and continuous flow seeder and as well as to evaluate the feasibility of these systems. The experiment was conducted in an experimental area from Fazendas de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE) at Faculdade de Ciências Agronômicas from Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (UNESP), Botucatu campus. A randomized complete block design in a 4 [conventional seeding system (control), cross-seeding system, dense seeding system and seeding system in double row] x 2 (kind of seeder and fertilizer drill: precise and continuous flow) factorial arrangement with four repetitions in each treatment was used. The agricultural characteristics evaluated were plant height, string bean insertion, total plants counting, determination of water content in grains, determination of mass in 1,000 grains, and determination of productivity. The mechanical damage was also evaluated in seeds by the analyses of fast green test and germination test. Economic balance was found using the operating cost methodology of agricultural machines described by MIALHE (1974) and ASABE (2006). After conducted analysis of variance was verified statistical difference for all agronomic traits in the experiment. It is found that there were statistically significant differences in all agronomic traits in the experiment also is observed main types of seeder for the characteristics productivity and mechanical damage of soybean thus noted that the streaming seeder caused higher mechanical damage the seed of the sower of precision, so also was no statistical difference in the soybean yield, in that when the seeding was done with the precision seeder productivity was higher. Evaluating the spacing used in the study it was found that the spacing in double row obtained the highest production, differing from the other seeding arrangements. In relation to the total cost of production it was observed that the most costly seeding arrangements are that you must perform two passes in the same area, are these, crossed planting system with precision sowing machines, continuous flow, dense planting system with precision seeder. The benefit / cost of the systems it was found that the best seeding arrangement is the double row when the operation was carried out with a precision seeder.

Made available in DSpace on 2016-04-01T17:54:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-07-15. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-01T18:00:18Z : No. of bitstreams: 1 000577402.pdf: 782786 bytes, checksum: aeee0a8ffec3f3ca18b09361308fb3bd (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Esta dissertação tem como finalidade, apresentar e comparar dados quantitativos relativos à estação de tratamento de esgotos situada no interior de São Paulo, mais especificamente na cidade de Lençóis Paulista. A proposta do presente trabalho é apresentação de dados financeiros, particularmente retorno e risco do projeto. Dados esses que demonstram também o montante investido, e ainda, as receitas e despesas inerentes ao funcionamento do mesmo. Serão utilizados métodos de análise investimentos tradicionalmente conhecidos como valor presente líquido, taxa interna de retorno e prazo médio de retorno. Para o cálculo da probabilidade de risco do projeto, a distribuição normal será a ferramenta utilizada. É senso comum que um dos maiores fatores de degradação da qualidade da água é justamente a poluição resultante do lançamento dos esgotos sanitários coletados em corpos d'água, o que justifica a necessidade do tratamento desses esgotos, de modo a reduzir a carga poluidora antes de sua disposição final. Segundo dados do Governo Federal apenas 20,2% do esgoto sanitário coletado nos domicílios brasileiros recebem tratamento e só uma pequena parcela tem destinação final sanitariamente adequada no meio (IBGE, 2003). Desta forma, o presente estudo deste problema contemporâneo, demonstrou quantitativamente que a implantação de uma ETE é viável financeiramente, como demonstra os cálculos do valor presente líquido (VPL), taxa interna de retorno (TIR) e o prazo médio de retorno do investimento (payback). Esses métodos de avaliação de investimento foram sensibilizados com uma série que envolve a probabilidade de crescimento populacional, o que possibilitou calcular o risco do projeto, cujo percentual confirma a viabilidade do projeto, em razão do risco calculado ser muito baixo. / This dissertation has the purpose to present and compare quantitative data about waste treatment station, placed in Lençóis Paulista city, in the state of Sao Paulo. At first, this work had the intent to present financial and environmental data, however, the project not in operation, it showed only financial data. These data demonstrate the amount of money invested, as also, the revenues and expenses inherent of operation. This work used the traditional investment analysis method, like net present value, interested rate return and payback. To calculate the project risk probability, it was used normal distribution. The waste water collected is fundamental to guarantee the population's life quality. However, one of the major reason to quality's water degradation is the pollution resulted of throwing waste waters in creeks, rivers and others flow waters which justify the need to treat them, reducing the amount of pollution before their final disposal. According to Brazilian's Government statistics, only 20,2% of waste water from brazilian's homes receives proper treatment, and just a small quantity is returned in sanitary way to the environment. (IBGE, 2003). In such a way, this study esposes a contemporary problem, demonstrating quantitatively, that the implementation of ETE is financially viable, like demonstrated calculation of the net present value (NPV), internal interested rate (IRR), and payback. That investments methods evaluation was sensibility through an probability series about population growth, that make possible calculated the project risk, wich result confirm the viability of the project.