Thesis (Ph.D.)--University of Wollongong, 2006. / Typescript. Includes bibliographical references: leaf 148-160.

Thesis (Ph.D.)--University of Wollongong, 2006. / Typescript. Includes bibliographical references: leaf 173-216.

Thesis (Ph. D.)--University of Texas at Austin, 2008. / Vita. Includes bibliographical references.

Thesis (M.S.)--West Virginia University, 2000. / Title from document title page. Document formatted into pages; contains vii, 93 p. : ill. (some col.). Vita. Includes abstract. Includes bibliographical references (p. 75-83).

Thesis (Ph. D.)--University of Chicago, Dept. of Chemistry, December 2000. / Includes bibliographical references. Also available on the Internet.

Thesis (M.S.)--West Virginia University, 2005. / Title from document title page. Document formatted into pages; contains vii, 79 p. : ill. (some col.), col. map. Includes abstract. Includes bibliographical references (p. 68-75).

It has been shown previously in our lab that mutations in the pyrimidine pathway reduced the ability of Pseudomonas aeruginosa to produce virulence factors. Knockout mutations in pyrB, pyrC and pyrD genes of the pyrimidine pathway showed that virulence factor production was decreased. Pyoverdin, pyocyanin, hemolysin, iron chelation, motility, and adherence are all considered virulence factors. Here I further investigate the effects of mutations in the pyrimidine pathway by studying a pyrE mutant. I studied the effect of the pyrE mutation on the production of the above virulence factors. Just like the effect of pyrB, pyrC and pyrD mutations,the pyrE mutation also showed that the bacteria were deficient in producing virulence factors when compared to the wild type. The broader impact of this research would be the possibility of finding drugs that could treat patients infected with P. aeruginosa and possibly extend the lives of chronically infected patients with cystic fibrosis.

Shigella provoque la dysenterie bacillaire en envahissant les muqueuses du colon. Cette maladie diarrhéique est responsable d’un million de décès par an essentiellement dans les pays en voie développement. Les gènes nécessaires àl’entrée dans les cellules hôtes sont regroupés sur un fragment d’ADN plasmidique de 30-kb. Celui-ci contient deux types de gènes, les gènes ipa(B, C et D) et ipgcodant pour des protéines responsables de l’entrée de la bactérie dans les cellules, et les gènes mxi/spacodant pour un système de sécrétion appelétype III (SST3) nécessaire àla sécrétion des facteurs de virulence. Les gènes mxi/spaetipa/ipgsont exprimés à37°C et les protéines Ipa/Ipgrestent dans le cytoplasme jusqu’àce que le SST3 soit activéau contact de la cellule hôte. Ce contact induit l’internalisation de la bactérie par macropinocytose, suivie de sa dissémination intra-et intercellulaire. Des observations en microscopie électronique (ME) montrent que le SST3 est composéde trois parties: i) une aiguille dont la longueur est régulée à50 nm par la protéine Spa32, ii) un corps basal qui traverse les membranes interneet externe ainsi que le peptidoglycane, et iii) un bulbe cytoplasmique. Le SST3 est le dispositif principal de virulence et permet l’injection de facteurs de virulences du cytoplasme bactérien vers celui de la cellule cible. Shigelladoit sécréter ces protéines de manière ordonnée. Très peu de travaux ont abordécette question. L’objectif principal de ce travail de thèse a étéd’étudier les mécanismes moléculaires impliqués dans la hiérarchie de sécrétion.Nous avons principalement investiguéle rôle de 3 protéines: Spa32, Spa40 et MxiC dans la sécrétion. Nous avons montré, par des études génétiques, que contrairement aux études publiées sur les protéines homologues, Spa32 n’agit pas comme un «molecularruler»pour réguler la taille de l’aiguille. Nous avons montréque cette régulation nécessite l’interaction de Spa32 via ses résidus 206-246 au domaine C-terminal de Spa40 (Spa40C) (Botteaux et al. 2008a). Ayant identifiécette interaction avec Spa40, l’étape suivante de notre travail a portésur la caractérisation de la fonction du gène spa40par des méthodes génétique, biochimique et structurale (ME). Nos résultats montrent que Spa40 joue un rôle important dans l’assemblage du SST3. Des plus, nous avons mis en évidence de nouvelles interactions impliquant Spa40C et des composants du SST3 (Botteaux et al. in preparation).Parallèlement àces travaux, nous avons montréque l’inactivation du gène mxiCaboutit àune dérégulation spécifique de la sécrétion des effecteurs sans altérer celle des translocateurs IpaB et IpaC. Cette augmentation de sécrétion est due àune augmentation de transcription des gènes tardifs, conséquence de la sécrétion précoce de l’anti-activateur transcriptionnel, OspD1 (Botteaux et al. 2008b). De plus, nous avons montréque MxiC est un substrat de l’appareil de sécrétion et que cette sécrétion est associée àsa fonction. Finalement, la mise en évidence d’une interaction entre MxiC et Spa47, l’ATPase du SST3 nous permet de proposer un modèle régulant la hiérarchie de sécrétion des effecteurs.Dans une autre partie de notre travail, nous avons identifié, par des expériences de ME et d’immunomarquage, que l’invasineIpaD est localisée au sommet de l’aiguille du SST3 oùelle lui sert de bouchon. Enfin, de manière très intéressante, nous avons montréque des anticorps anti-IpaD neutralisent l’entrée de Shigelladans les cellules (Sani, Botteaux et al. 2007, dépôt de brevet). IpaD, étant conservée dans les isolats invasifs de Shigella, représente donc un réel candidat vaccinal pouvant pallier la diversitédes sérotypesbactériens.En conclusion, nos travaux représentent une contribution importante àla compréhension des mécanismes de virulence bactériens et dépassent le cadre de Shigellapuisque les systèmes de sécrétion sont hautement conservés parmi plusieurs pathogènes. L’identification de drogues pouvant interférer avec ces systèmes de sécrétion représente une voie d’avenir pour le développement de nouveaux agents anti-infectieux. / Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Wong, Sze Ki. / Thesis (M.Phil.)--Chinese University of Hong Kong, 2011. / Includes bibliographical references (leaves 87-106). / Abstracts in English and Chinese. / Acknowledgements --- p.i / Abstract --- p.ii / Abstract in Chinese --- p.iv / Table of contents --- p.V / List of figures --- p.ix / List of abbreviations --- p.X / Chapter Chapter 1. --- General introduction --- p.1 / Chapter Chapter 2. --- Literature review --- p.6 / Chapter 2.1. --- Pathogenic mechanisms of Vibrio species in fish --- p.7 / Chapter 2.1.1. --- Introduction --- p.7 / Chapter 2.1.2. --- Adhesion --- p.7 / Chapter 2.1.3. --- Invasion --- p.8 / Chapter 2.1.4. --- Proliferation --- p.9 / Chapter 2.2. --- Vibrio virulence factors --- p.12 / Chapter 2.2.1. --- Introduction --- p.12 / Chapter 2.2.2. --- Hemolysin --- p.12 / Chapter 2.2.3. --- Protease --- p.14 / Chapter 2.2.4. --- Siderophore --- p.15 / Chapter 2.2.5. --- Lipopolysaccharide --- p.15 / Chapter 2.3. --- General apoptotic pathways --- p.17 / Chapter 2.3.1. --- Introduction --- p.17 / Chapter 2.3.2. --- Extrinsic apoptotic pathway --- p.17 / Chapter 2.3.2.1. --- Death receptor signaling apoptosis --- p.17 / Chapter 2.3.2.1.1. --- Fas signaling pathway --- p.18 / Chapter 2.3.2.1.2. --- TNF-R1 signaling pathway --- p.19 / Chapter 2.3.2.1.3. --- TRAIL receptors signaling pathway --- p.20 / Chapter 2.3.2.2. --- Growth factor receptor signaling apoptosis --- p.21 / Chapter 2.3.3. --- Intrinsic apoptotic pathway --- p.21 / Chapter 2.3.3.1. --- Mitochondrial apoptotic pathway --- p.21 / Chapter 2.3.3.1.1. --- Cyto c --- p.22 / Chapter 2.3.3.1.2. --- Smac/DIABLO --- p.22 / Chapter 2.3.3.1.3. --- Omi/HtrA2 --- p.22 / Chapter 2.3.3.1.4. --- AIF and endo G --- p.23 / Chapter 2.3.3.1.5. --- Bcl-2 family --- p.23 / Chapter 2.3.3.1.6. --- Mitochondrial membrane permeabilization (MMP) --- p.23 / Chapter 2.3.3.2. --- p53-regulated apoptotic pathway --- p.24 / Chapter 2.3.3.3. --- Endoplasmic reticulum (ER) stress-induced apoptotic pathway --- p.25 / Chapter 2.4. --- Membrane vesiculation in erythrocytes --- p.26 / Chapter 2.4.1. --- Introduction --- p.26 / Chapter 2.4.2. --- Induction of vesiculation --- p.26 / Chapter 2.4.3. --- Contents of vesicles --- p.28 / Chapter 2.4.4. --- Mechanisms involved during vesiculation --- p.29 / Chapter 2.4.5. --- Correlation between apoptosis and membrane vesiculation in erythrocytes --- p.31 / Chapter 2.4.6. --- Reasons for vesiculation --- p.31 / Chapter Chapter 3. --- "Induction of apoptosis by Vibrio alginolyticus thermolabile hemolysin (TLH) in blood cells of silver sea bream, Sparus sarba" --- p.33 / Chapter 3.1. --- Abstract --- p.34 / Chapter 3.2. --- Introduction --- p.34 / Chapter 3.3. --- Materials and methods --- p.36 / Chapter 3.3.1. --- Experimental fish --- p.36 / Chapter 3.3.2. --- Whole blood preparation --- p.37 / Chapter 3.3.3. --- Preparation of V. alginolyticus TLH --- p.37 / Chapter 3.3.4. --- "Caspase-3, -8, -9/6 fluorescent assay" --- p.38 / Chapter 3.3.5. --- TUNEL assay --- p.39 / Chapter 3.3.6. --- Apoptotic DNA ladder assay --- p.40 / Chapter 3.3.7. --- Statistical analysis --- p.41 / Chapter 3.4. --- Results --- p.42 / Chapter 3.4.1. --- "Increase of caspase-3, -8, -9/6 activities" --- p.42 / Chapter 3.4.2. --- Detection of DNA fragmentation by TUNEL assay --- p.44 / Chapter 3.4.3. --- Detection of DNA fragmentation by apoptotic DNA ladder assay --- p.44 / Chapter 3.5. --- Discussion --- p.46 / Chapter Chapter 4. --- "Occurrence of membrane vesiculation, apoptosis and post-apoptotic necrosis after exposure to Vibrio alginolyticus thermolabile hemolysin (TLH) in erythrocytes of silver sea bream, Sparus sarba" --- p.51 / Chapter 4.1. --- Abstract --- p.52 / Chapter 4.2. --- Introduction --- p.52 / Chapter 4.3. --- Materials and methods --- p.54 / Chapter 4.3.1. --- Experimental fish --- p.54 / Chapter 4.3.2. --- Whole blood preparation --- p.54 / Chapter 4.3.3. --- Preparation of V. alginolyticus TLH --- p.55 / Chapter 4.3.4. --- Light microscopy --- p.55 / Chapter 4.3.5. --- Transmission electron microscopy (TEM) --- p.56 / Chapter 4.3.6. --- Measurement of membrane vesiculation - acetylcholinesterase (AChE) assay --- p.56 / Chapter 4.3.7. --- Measurement of necrosis - hemoglobin colorimetric assay --- p.57 / Chapter 4.3.8. --- Apoptotic DNA ladder assay --- p.58 / Chapter 4.3.9. --- Flow cytometry --- p.59 / Chapter 4.3.10. --- Statistical analysis --- p.59 / Chapter 4.4. --- Results --- p.60 / Chapter 4.4.1. --- Ultrastructural changes in red blood cells after exposure to TLH --- p.60 / Chapter 4.4.2. --- Changes of cell population in size and granularity after exposure of TLH --- p.67 / Chapter 4.4.3. --- Effect of TLH dosage on necrosis and DNA fragmentation --- p.72 / Chapter 4.4.4. --- "Occurrence of membrane vesiculation, necrosis and DNA fragmentation in cells exposed to TLH" --- p.72 / Chapter 4.5. --- Discussion --- p.76 / Chapter Chapter 5. --- General conclusions --- p.82 / References --- p.87

Abstract not available