Orientador: Aloísio Costa Sampaio / Banca: Sarita Leonel / Banca: Teresinha de Fatima Fumis / Resumo: O presente trabalho teve como objetivo avaliar os efeitos do prohexadione cálcio como fonte reguladora do crescimento vegetativo em macieiras e analisar possíveis incrementos na produção e na qualidade dos frutos em função dos principais problemas enfrentados na fruticultura moderna, que é o controle do vigor excessivo e a produção, tornando-se uma alternativa viável aos pomicultores. O experimento foi instalado na Fazenda Buriti Mirim (Angatuba/SP), no pomar comercial de macieira 'Eva' com plantas de dois anos de idade, na safra 2009/2010. O delineamento experimental utilizado foi em esquema fatorial 2 X 4, em parcelas subdivididas, formado por duas épocas de aplicação (fator principal) e quatro concentrações diferentes de prohexadione cálcio, produto comercial Viviful® (fator secundário), sendo os seguintes tratamentos: T1: 0 g p.c/ha, T2: 400 g p.c/ha, T3: 800 g p.c/ha, T4: 1200 g p.c/ha, T5: 0 g p.c/ha, T6: 400 + 400 g p.c/ha, T7: 800 + 800 g p.c/ha e T8: 1200 + 1200 g p.c/ha. O experimento ao todo foi composto por 256 plantas, distribuídas em quatro blocos casualizados, 8 plantas por tratamento, considerando como parcela útil apenas as 4 plantas centrais. A primeira aplicação do regulador foi realizada em todos os tratamentos aos 30 dias após a queda de pétalas, enquanto que a segunda aplicação foi realizada 27 dias após a primeira aplicação somente nos tratamentos T6, T7 e T8. Os resultados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey ao nível de 5% de probabilidade. Nas condições em que o experimento foi realizado, concluiu-se que prohexadione cálcio foi eficiente na redução do crescimento vegetativo dos ramos da macieira 'Eva', independente da concentração e do momento da aplicação, refletindo na redução do dossel da planta... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This study aimed to evaluate the effects of prohexadione calcium as a source of plant growth regulator on apples and possible increases in production and fruit quality in relation to the main problems faced in modern fruit, which is the control of excessive force and production, making it a viable alternative to apple growers. The experiment was conducted at Fazenda Buriti Mirim (Angatuba/SP), in a commercial orchard of apple 'Eva', with plants of two years of age, in 2009/2010. The experiment was a factorial 2 x 4 split plot, consisting of two application times (main factor) and four different concentrations of prohexadione calcium, commercial product Viviful® (secondary factor), and the following treatments: T1: 0 g pc/ha, T2: 400 g pc/ha, T3: 800 g pc/ha, T4: 1200 g pc/ha, T5: 0 g pc/ha, T6: 400 + 400 g pc/ha, T7: 800 + 800 g pc/ha, T8: 1200 + 1200 g pc/ha. The experiment consisted of a total of 256 plants, in four randomized blocks, eight plants per treatment, considering only the plot four central plants. The first application of the regulator was performed in all treatments at 30 days after the petals drop, while the second application was performed 27 days after the first application only in treatments T6, T7 and T8. The results were submitted to ANOVA and means compared by Tukey test at 5% probability. Under the conditions of the experiment was conducted, it was concluded that prohexadion calcium was effective in reducing vegetative growth of the branches of the apple 'Eva', independent of concentration and time of application, reflecting the reduction of the plant canopy, which favored... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Grapholita molesta é uma das principais pragas de Rosaceae, provocando danos significativos nas brotações e nos frutos. Nos meses de dormência das rosáceas, no sul do Brasil, a densidade populacional é reduzida. Nesse estudo, foi avaliada a influência dos fotoperíodos (10L:14E, 11L:13E, 12L:12E, 13L:11E, 14L:10E e 16L:8E) na temperatura de 25 ± 1 ºC e umidade relativa de 60 ± 10% na indução da diapausa nas fases de ovo, larva, pré-pupa e pupa de G. molesta. Observou-se também o efeito do fotoperíodo no tempo de desenvolvimento dos insetos que não manifestaram diapausa, bem como a fertilidade, a fecundidade e a duração das fases imaturas da segunda geração. A diapausa foi observada, no estágio de prépupa, apenas quando ovos e larvas com menos de 12 horas foram expostos às fotofases de 10, 11, 12, 13 e 14 horas. Entre os indivíduos que não manifestaram dormência, a redução da fotofase tendeu a aumentar o tempo de desenvolvimento dos insetos. A fecundidade e a fertilidade, de modo geral, não foram afetadas pelo fotoperíodo. O tempo de desenvolvimento dos indivíduos da segunda geração tendeu a ser mais longo nas fotofases entre 14 e 10 horas. / Grapholita molesta is a major pests of Rosaceae, causing significant damage to buds and fruits. In Southern Brazil, its population density is reduced during Rosaceae dormancy months. In this study, we evaluated the influence of photoperiod (10L:14D, 11L:13D, 12L:12D, 13L:11D, 14L:10D and 16L:8D) on diapause induction of egg, larval, prepupal and pupal phases in G. molesta, at 25 ± 1 ºC of temperature and 60 ± 10% of relative humidity. We also observed the photoperiod effect on the duration of development of non-diapausing insects, on fertility and fecundity, and the duration of the immature stages of the second generation. The prepupal diapause was observed only when eggs and larvae were submitted to photophases of 10, 11, 12, 13 and 14 hours. Among the individuals that did not manifest dormancy, the photophase reduction tended to increase the length of development. In general, fecundity and fertility were not affected by the photoperiod. The development of the second generation individuals tended to be longer in the photophases between 10 and 14 hours.

Este trabalho objetivou registrar os pentatomídeos e seus inimigos naturais em lavouras de arroz irrigado, avaliar a flutuação populacional de Tibraca limbativentris Stål, 1860 (Hemiptera, Pentatomidae) e as causas de mortalidade em adultos hibernantes. Em julho/2010 adultos do percevejo-do-colmo foram coletados na resteva, em Eldorado do Sul (30◦02’S; 51◦23’O), e mantidos em laboratório (25 ± 1 ◦C; 60 ± 10% U.R.; fotofase 16 horas). No período de dezembro/2010 a março/2011 foram realizadas amostragens em duas lavouras localizadas nos municípios de Charqueadas (29◦59’S; 51◦31’O) (2.400 m², cultivar Puita) e de Eldorado do Sul (2.500 m², cultivar Epagri 109), RS. Semanalmente, em 12 pontos de 1 m², as plantas foram examinadas e todos os percevejos coletados. Em laboratório, os insetos eram mantidos em gaiolas com alimento, em sala climatizada por até 30 dias. Os pentatomídeos observados nas lavouras foram: Edessa meditabunda (Fabricius, 1794), Glyphepomis adroguensis Berg 1891, T. limbativentris, Oebalus poecilus Dallas 1851 e Oebalus ypsilongriseus (De Geer, 1773). Este foi o primeiro registro de G. adroguensis em arroz irrigado no RS. O número total de pentatomídeos/m² (Charqueadas = 2,1 ± 0,58; Eldorado do Sul = 1,2 ± 0,47) não diferiu entre as áreas amostradas (P = 0,1003). A quantidade média de ovos foi maior em Eldorado do Sul (2.231) do que em Charqueadas (1.908) (U = 8; P = 0,035). T. limbativentris, em ambas as áreas, foi a espécie mais frequente e abundante. Além da geração colonizante, duas outras foram registradas. Nos indivíduos de T. limbativentris oriundos da resteva observou-se 35% de mortalidade causada pelos taquinídeos Cylindromyia brasiliana (Townsend, 1927) (Cylindromyiini) e Phasia (Paraphorantha) sp. (Phasiini), 27,3% associada ao entomopatógeno Beauveria bassiana (Balsamo) Vuillemin, 1912 e 37,7% decorrente de outros fatores. Os mesmos taquinídeos foram observados em T. limbativentris oriundos da lavoura, sendo este o primeiro hospedeiro registrado para C. brasiliana. Constataram-se os entomopatógenos B. bassiana e Metarhizium anisopliae (Metsch.) em adultos do percevejo-do-colmo. Apenas Telenomus podisi Ashmead 1893 (Hym., Platygastridae) foi encontrado em ovos do percevejo-do-colmo, com índice de parasitismo de 89% em Eldorado do Sul e 73,5%, em Charqueadas. / This study aimed to survey pentatomids and their natural enemies in irrigated rice fields, to assess population fluctuations in Tibraca limbativentris Stål, 1860 (Hemiptera, Pentatomidae) and to determine causes of mortality in hibernating adults. In July 2010 adults of the rice stalk stink bug were collected from rice stubble in Eldorado do Sul (30◦ 02'S, 51 ◦ 23'W) and maintained under laboratory conditions (25 ± 1 ° C, 60 ± 10% RH, 16 : 8h L : D). Between December 2010 and March 2011 two active rice fields in Charqueadas (29 ◦ 59'S, 51 ◦ 31'W) (2,400 m², Puita variety) and Eldorado do Sul (2,500 m², Epagri 109 variety), Rio Grande do Sul, Brazil, were sampled. Plants were examined and all bugs collected every week in 12 1-m² plots. In the laboratory, insects were kept in cages with food under laboratory conditions for up to 30 days. The following pentatomids were recorded: Edessa meditabunda (Fabricius, 1794), Glyphepomis adroguensis Berg 1891, T. limbativentris, Oebalus poecilus Dallas 1851, and Oebalus ypsilongriseus (De Geer, 1773). This is the first record of G. adroguensis in rice fields of Rio Grande do Sul. The total numbers of pentatomids/m² (Charqueadas = 2.1 ± 0.58; Eldorado do Sul = 1.2 ± 0.47) did not differ between the studied areas (P = 0.1003). The mean number of eggs was larger in Eldorado do Sul (2231) than in Charqueadas (1908) (U = 8; P = 0,035). At both sites T. limbativentris was the most frequent and abundant species. In addition to the colonizing generation, two others were recorded. Individuals of T. limbativentris collected from rice stubble suffered 35% mortality caused by the tachinid flies Cylindromyia brasiliana (Townsend, 1927) (Cylindromyiini) and Phasia (Paraphorantha) sp. (Phasiini), 27.3% associated with the entomopathogen Beauveria bassiana (Balsamo) Vuillemin, 1912, and 37.7% due to other factors. The same tachinids were observed in T. limbativentris collected in active rice fields, this being the first host record for C. brasiliana. The entomopathogens B. bassiana and Metarhizium anisopliae (Metsch.) were found in adults of the rice stalk stink bug. Only Telenomus podisi Ashmead 1893 (Hymenoptera, Platygastridae) was found in eggs of the rice stalk stink bug, with a parasitism rate of 89% in Eldorado do Sul and 73.5% in Charqueadas.

A presença dos predadores em ecossistemas é fundamental na regulação das populações de insetos fitófagos. Em agrossistemas, entretanto, a simplificação do ambiente pode levar a desequilíbrios e, consequente, aparecimento de espécies pragas das culturas. O sistema orizícola caracteriza-se pelo cultivo em áreas circundadas por hábitats aquáticos e terrestres, compreendendo um mosaico de ambientes em transformação, tanto implantados quanto naturais. O conhecimento das espécies associadas a este sistema é importante para o entendimento da dinâmica do mesmo e para auxiliar no manejo de espécies que possam tornar-se pragas. Neste sentido, o estudo teve como objetivo conhecer e comparar, através de índices faunísticos, a diversidade de insetos predadores entre um agroecossistema de produção orgânica de arroz irrigado (AO) e uma área preservada, Refúgio de Vida Silvestre Banhado dos Pachecos (RBP), ambas localizadas no município de Viamão, RS. Realizaram-se coletas mensais de maio/2011 a abril/2012. Foram utilizadas armadilhas tipo Malaise, Pitfall e Moericke, permanecendo armadas por um período de 24 horas. No total foram coletados 355 indivíduos de hábito predador na AO, sendo identificados 26 morfotipos distribuídos em quatro ordens e 11 famílias. No RBP coletou-se 653 indivíduos de 50 morfotipos, pertencentes a seis ordens e 13 famílias. Os estimadores de riqueza, Chao 1, Chao 2 e Bootstrap, apontaram uma riqueza de 29 a 35 espécies na AO e de 59 a 71 na RBP. A comparação entre os índices de diversidade apontou maior diversidade para a área RBP (p= 0,001). A variação sazonal foi responsável por diferenças, tanto na riqueza como na abundância de espécies, em ambas as áreas, sendo o período de janeiro o que apresentou maior número de indivíduos nas duas. Considerando a composição das espécies, 18 morfotipos foram compartilhados entre os dois ambientes apesar da pouca complexidade estrutural disponibilizada na área do arroz, indicando que a RBP pode estar atuando como reservatório de espécies predadoras. / Predator’s appearance in ecosystems is fundamental to regulate phytophagous insect population. In agroecosytems, the ambient simplification can traslate to a lack of equilibrium and, for that reason, enables pests occurrence in farming. Rice field system is characterized by a cultivation surrounded by aquatics and terrestrial habitats which include different ambient transformation from natural to implanted kind. Knowledge about associated species in every system is very important to understand the dynamic events and to help the management of possible pests. Predator diversity of an irrigated organic rice production agroecosystem (AO) and a preserved area, Refúgio de Vida Silvestre Banhado dos Pachecos (RBP), both located in Viamão city, RS, was studied and compared by the use of faunistic indexes Montly catches were taked from May/2011 to April/2012, with Malaise, Pitfall e Moericke traps, for 24 hours every time. A total of 355 predators were colected in AO, identificated in 26 morfotypes and distributes in four orders and 11 families. The RBP group found 653 individuals were 50 morfotypes, belonged to six orders and 13 families. The richness estimators, Chao 1, Chao 2 e Bootstrap, indicated from 29 to 35 species richness in the AO and 59 to 71 in the RBP group. RBP presented more diversity than AO according the diversity index (p=0,01). Seasonal variation had influence in differences, for richness and abundance of species, in both areas. January was the month with higher number of observed individuals in both areas. Considering the composition of the species, 18 morfotypes were shared in both ambient, even with the lower structural complexity of the rice field, which may indicates that RBP may serve as a reservoir of predators species.

Grapholita molesta é um tortricídeo de origem asiática, que tem como principais hospedeiros, espécies de rosáceas. Neste estudo foram avaliadas as alterações morfológicas nos órgãos reprodutivos de machos e fêmeas de G. molesta de um e oito dias de idade, virgens e acasalados. As implicações da idade, do número de acasalamentos e do comportamento poligâmico na performance reprodutiva de G. molesta também foram estudadas. No sistema reprodutivo das fêmeas a bolsa copuladora, ovidutos, receptáculo seminal e ovários foram as estruturas que sofreram significativas modificações em função da idade e/ou status de cópula. Nos machos, tais fatores levaram a alterações nos testículos, vasos deferentes, vesícula seminal, glândula dos dutos e dutos ejaculatórios. O comportamento poliândrico não elevou as médias de fecundidade, fertilidade e longevidade das fêmeas, assim como o poligínico foi desvantajoso ao macho, apenas por este não conseguir copular com todas as fêmeas oferecidas. Os machos mantiveram o mesmo sucesso reprodutivo após quatro cópulas consecutivas, apesar de na primeira transferirem um espermatóforo maior. Fêmeas copuladas por machos já acasalados foram mais receptivas em novos pareamentos, do que as fertilizadas por machos virgens, sem alterar a duração do período refratário. A fecundidade, fertilidade e longevidade das fêmeas não se alteraram quando estas copularam uma ou várias vezes ao longo da vida. O avanço da idade do casal foi um fator que contribuiu para a queda nas taxas das variáveis reprodutivas avaliadas. Os resultados apontam que a capacidade de reprodução de G. molesta alterou-se minimamente diante dos fatores analisados, ressaltando assim, o elevado potencial biótico da espécie. / Grapholita molesta is an Asian totricidean that has rosacean species as one of its main hosts. In the present study morphological modifications in reproductive organs of males and females of G. molesta were evaluated in individuals of one and eight days of age, virgin and non-virgin. The implications of age, number of copulas, and polygamic behavior in the reproductive performance of G. molesta were also studied. In the reproductive system of the females the copulatory pouch, oviducts, sperm receptacle, and ovaries presented significant modifications according to the age and/or copula status. While in males, these factors led to alterations of the testicles, deferent ducts, seminal vesicles, ejaculatory ducts and its glands. The polyandric behavior did not increased mean fecundity, fertility, and longevity of the females, and the polyginic behavior presented disadvantages for the males, since they could not copulate with all available females. Males kept the same reproductive success after four consecutive copulas, but in the first they transferred a larger spermatophore. Females copulated by males that have had a copula before were more receptive when paired with other males, in comparison with females fertilized by virgin males. No alteration in length of the refractory period was observed. Fecundity, fertility, and longevity of the females were not altered when they copulated one or several times during the life cycle. The rates of the reproductive variables evaluated decreased with an increase in the age of the couple. The results demonstrate that the reproductive capacity in G. molesta presented minimum alteration in relation to the factors analyzed here, highlighting the elevated biotic potential of the species.

O percevejo-do-colmo (Tibraca limbativentris Stal) é um dos insetos mais prejudiciais à cultura do arroz no Brasil, principalmente em cultivos irrigados. A estratégia de defesa da planta contra estes percevejos pode estar relacionada à emissão de compostos químicos, liberados após o ataque, prejudicando direta ou indiretamente o desempenho da praga. Desta forma, o trabalho objetivou identificar substâncias presentes nos extratos de plantas de arroz que sofreram ou não ataque do percevejo-do-colmo, bem como, as respostas comportamentais de adultos de T. limbativentris e dos parasitóides de ovos Telenomus podisi (Ashmead) e Trissolcus basalis (Wollaston) (Hymenoptera, Platygastridae) a estes odores. Foram coletados voláteis de plantas da cultivar IRGA 417 sem dano e com dano de cinco adultos, machos e fêmeas do percevejo, por até 120 h. Os extratos foram analisados em cromatografia gasosa acoplada a detector de ionização de chamas (CG-DIC) e cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas (CG-EM). As respostas de machos e fêmeas de Ti. limbativentris e fêmeas dos parasitóides, foram avaliadas em olfatômetro “Y”. Houve indução na liberação de compostos secundários, tais como alcoóis, aldeídos e terpenóides, após a herbivoria. Fêmeas de Ti. limbativentris foram significativamente atraídas por voláteis das plantas sem dano. Não houve diferença significativa entre os tratamentos em relação à preferência de machos aos odores. Quanto aos parasitoides, fêmeas de Te. podisi foram significativamente atraídas aos extratos de plantas danificadas por fêmeas do percevejo, enquanto que as de Tr. basalis responderam de forma indiferenciada aos voláteis de plantas danificadas por ambos os sexos. Supõe-se, desta forma, que as plantas de arroz liberam compostos de defesa, os quais induziram a antixenose em fêmeas de Ti. limbativentris atuando também na defesa indireta atraindo inimigos naturais. / The rice stem bug (Tibraca limbativentris Stal) is one of the most important pests of rice plantations in Brazil, especially in irrigated fields. The plant‟s defensive strategy against these bugs may involve the emission of chemical compounds following herbivore attacks which directly or indirectly harm the pest‟s performance. The objective of this study was to identify the substances present in extracts of rice plants that had suffered herbivory by rice stem bugs and in unattacked plants, as well as the behavioral responses of Ti. limbativentris adults and the egg parasitoids Trissolcus basalis and Telenomus podisi towards these odors. Plant volatiles were collected from the undamaged rice cultivar IRGA 417 and from the same cultivar exposed to five males and five females of Ti. limbativentris for up to 120 hours. The extracts were analyzed by GC-FID and GC-MS. The responses of male and female Ti. limbativentris and female egg parasitoids were evaluated in a "Y" olfactometer. Herbivory on rice plants by both sexes of Ti. limbativentris induced the release of secondary compounds such as alcohols, aldehydes and terpenoids. Female Ti. limbativentris were significantly more attracted to volatiles from undamaged plants, but males showed no preference. Female Te. podisi were significantly more attracted to the extracts of plants damaged by female rice stem bugs, while female Tr. basalis responded indistinguishably to the volatiles from plants damaged by both sexes. It is hypothesized, therefore, that rice plants may be emitting defensive compounds, which induce the antixenosis in Ti. limbativentris females and may also provide indirect defense by attracting natural enemies.

A utilização de inoculantes em culturas de leguminosas é uma prática conhecida e empregada há longo tempo e o substrato mais utilizado até o momento tem sido a turfa. Diversos tipos de formulações inoculantes que existem no mercado visam oferecer uma alternativa ao emprego da turfa, porém muitas apresentam baixa capacidade para manter a sobrevivência e eficiência dos rizóbios. Este trabalho avaliou a utilização de catorze misturas diferentes de polímeros naturais e/ou sintéticos como suportes para inoculantes, visando a produção de inoculantes comerciais para soja, e a capacidade de manter a sobrevivência e preservar as características de infectividade e de efetividade das estirpes SEMIA 587 de Bradyrhizobium elkanii e SEMIA 5079 de Bradyrhizobium japonicum. Avaliou-se a sobrevivência dos rizóbios nas formulações armazenadas, a capacidade de aderência das formulações em sementes, a sobrevivência dos rizóbios em sementes a 40 ºC e a eficiência dos inoculantes em plantas de soja, cultivadas em vasos com solo, submetidas a estresse hídrico e térmico. Observou-se que as misturas contendo goma xantana, jataí e guar, tanto nas formulações em gel como líquidas, podem ser usadas como veículo para inoculantes proporcionando maior proteção aos rizóbios contra as condições de dessecação e temperatura. Todos os inoculantes mantiveram a sobrevivência da população de rizóbios durante um ano de armazenamento. Os rizóbios das formulações G5, L1 e L7, que continham goma arábica, foram afetados pelo estresse hídrico e pelas temperaturas elevadas, reduzindo o número de nódulos formados. Dentre as formulações líquidas, as que continham xantana e glicerol (L2) e com adição de polivinilpirrolidona (L5) e a formulação que continha xantana, carboximetilcelulose e polivinilpirrolidona (L6), foram as mais promissoras para a formulação de inoculantes para soja.

O presente trabalho teve como principal objetivo avaliar a produção de enzimas proteolíticas por Bacillus cereus. As fermentações foram conduzidas em Biorreator Biodesign, com aeração de 1vvm, temperatura de 37°C e agitação de 400 r.p.m. como parâmetros fixos. Dois meios diferentes foram utilizados, Meio Referência (MR) e Meio de Proteína de Soja PS60® (MPS1), em experimentos realizados com 24 horas. Para avaliação da produção de complexos enzimáticos, retirou-se amostras a intervalos de 3 horas para análise de valores de pH, densidade ótica e massa seca. A atividade proteolítica, concentração de proteína solúvel e açúcares redutores, contagem de células viáveis totais e esporos também foram investigadas. Os resultados demonstraram que ambos os meios propiciaram condições para o ótimo desenvolvimento do B. cereus. Os resultados também indicam que, embora os dois meios tenham apresentado um crescimento celular semelhante, o meio composto por proteína de soja propiciou a obtenção de um extrato bruto com atividade proteolítica mais elevada. Nas condições de fermentação empregadas, o meio MPS1 apresentou em 15 horas uma atividade enzimática de 18,7UmL-1.h-1.enquanto que o meio MR apresentou uma atividade proteolítica de 11,8 UmL-1.h-1.

Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-08-23T11:41:13Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1357280 bytes, checksum: d84ea26fc09b10e0e096ba1387bdb81e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-23T11:41:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1357280 bytes, checksum: d84ea26fc09b10e0e096ba1387bdb81e (MD5) Previous issue date: 2017-06-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O ecossistema ruminal é composto por uma alta diversidade de microrganismos que desepenham papel fundamental na nutrição e saúde do hospedeiro. Estudos recentes tem sugerido que o rúmen representa uma fonte promissora de novos peptídeos antimicrobianos e resultados anteriores demonstraram que os peptídeos produzidos por algumas linhagens de Streptococcus possuem características úteis para o controle de patógenos. Neste trabalho, o objetivo foi isolar, caracterizar e sequenciar o genoma de bactérias produtoras de peptídeos antimicrobianos obtidas do rúmen de bovinos Nelore alimentados com forrageiras tropicais. Cinco isolados foram selecionados e identificados como Streptococcus lutetiensis. Após a anotação dos genomas foram utilizadas ferramentas computacionais para mineração de clusters de biossíntese de bacteriocinas para identificação e comparação de sequências de peptídeos antimicrobianos. Além disso, foi realizada uma análise comparativa com genomas de Streptococcus isolados de humanos, para avaliar diferenças quanto aos requerimentos nutricionais e potencial patogênico dessas espécies. Nas análises usando bancos de dados de acesso livre, os cinco genomas de Streptococcus apresentaram clusters putativos de biossíntesse de bacteriocinas da classe II e apenas o S. lutetienses 59 apresentou um cluster associado com a biossíntese de lantibióticos (classe I). Em análises complementares usando a ferramenta protótipo AMPLY, foi observado um padrão de sequências homólogas a pre-peptídeos mais diverso do que o observado para peptídeos maduros, modificados pós traducionalmente. Nas análises comparativas dos cinco genomas ruminais com os genomas de Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC 43143, Streptococcus pyogenes M1 GAS e Streptococcus pasteurianus ATCC 43144, foi observado que os genomas dos Streptococcus isolados de humanos apresentavam vias metabólicas mais completas para a utilização de carboidratos, o que não ocorreu para as vias de biossíntese de vitaminas e metabolismo de nitrogênio, nos quais os isolados do rúmen apresentaram mais genes associados com essas vias do anabolismo. Fatores de virulência foram identificados em todas as espécies analisadas, porém as espécies clínicas apresentaram maior quantidade e diversidade de genes relacionados com o fenótipo de patogenicidade, com destaque para S. pyogenes. Os resultados demonstraram que todos os isolados de Streptococcus do rúmen são potenciais produtores de AMPs e indicaram que linhagens do complexo Streptococcus bovis/equinus representam uma fonte promissora de bacteriocinas das classes I e II. / The ruminal ecosystem is composed of a high diversity of microorganisms that play a fundamental role in the nutrition and health of the host. Recent studies have suggested that the rumen also represents a promising source of new antimicrobial peptides and preliminary work demonstrated that the peptides produced by some strains of Streptococcus have useful characteristics for the control of pathogens. In this work, the objective was to isolate, characterise and sequence the genome of antimicrobial peptide- producing bacteria obtained from the rumen of Nelore cattle fed with tropical forages. Five isolates were selected and identified as S. lutetiensis. After the annotation of the genomes, computational tools were used to mine gene clusters probably associated with the biosynthesis of bacteriocins aiming to identify and compare new sequences of antimicrobial peptides. In addition, a comparative genomic analysis was carried out to evaluate the nutritional requirements and pathogenic potential of other Streptococcus isolated from humans. The five genomes of Streptococcus presented clusters involved in the biosynthesis of class II bacteriocins and only S. lutetienses 59 presented a cluster involved in the biosynthesis of lantibiotics (class I). Complementary analyses using the AMPLY prototype tool, allowed the identification of sequences that were homologous to prepeptides showing greater diversity than that observed for mature, posttranslationally modified peptides. In the comparative analyses of the five ruminal genomes with Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC 43143, Streptococcus pyogenes M1 GAS and Streptococcus pasteurianus ATCC 43144, it was observed that the genomes from human isolates presented more complete metabolic pathways for carbohydrate metabolism, which was not observed for the pathways of vitamin biosynthesis and nitrogen metabolism, in which the rumen isolates presented more complete pathways. Virulence factors were identified in all species analysed, but the clinical species presented a greater quantity and diversity of genes related to the phenotype of pathogenicity, especially S. pyogenes. The results demonstrated that ruminal Streptococcus are potential producers of AMPs and indicated that strains of the Streptococcus bovis/equinus complex represent a promising source of class I and II bacteriocins.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-10-22T16:46:47Z No. of bitstreams: 1 Jose Francisco da Cruz Neto.pdf: 3421545 bytes, checksum: 0b1cff767b7c81ca00ba462135a36410 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-22T16:46:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Francisco da Cruz Neto.pdf: 3421545 bytes, checksum: 0b1cff767b7c81ca00ba462135a36410 (MD5) Previous issue date: 2016-07-25 / The semi-arid northeast Brazil specifically in the states of Pernambuco and Paraíba are the Mountain forests. In these locations, the exploitation of natural resources occurs gradually every years, because of the milder climate and greater water availability for the agricultural and livestock sectors. Studies related to the microclimatic conditions of mountain forests are fundamental for social and agricultural development, considering the climate as the most important factor for the emergence or disappearance of different plant or animal species, as well as the way of life of its population. The MTCLIM model was used in this research to estimate the global solar radiation, the air temperature (mean, minimum and maximum) and the vapor pressure deficit, with the objective to identify and analyze the spatialtemporal dynamics of meteorological elements as well as biophysical parameters to detect environmental changes through remote sensing techniques on satellite images for the Arapuá mountain, city of Carnaubeira da Penha-PE. Using sixteen days images MODIS: index of vegetation NDVI and superfice albedo available in 2006 and 2012. The NDVI were used in estimation Leaf Area Index (IAF) and Fraction of soil covered by vegetation (FC). It was used too surface data: average, minimum and maximum air temperatures (°C), precipitation (mm), the global solar radiation (W m-2) obtained in three automatic weather stations located in next study area belonging to the INMET and CPTEC. The thematic maps of meteorological elements: Tmax, Tmed, Tmin and Rg were processed by Demo Surfer 10.0 software while albedo, NDVI, FC and IAF were processed from SPRING software, version 5.1. It was accomplished the MTCLIM model calibration process to the automatic meteorological stations of the cities of Cabrobó and Triunfo. The estimated data were correlated with the observed Tmax, Tmed, Tmin, Rg and DPV using the regression analysis, considering Mean Error (EM), Mean Absolute Error (EMA) and WILLMOTT Correlation Index. The validation from MTCLIM model showed good results for the cities of Cabrobó and Triunfo with high values of correlation (r ) and determination index (d) for Tmed, Tmin, Tmax e Rg except for the vapor pressure deficit. The topography effect is very important for the modeling of Tmed, Tmin, Tmax and Rg in all scenarios, showing that the Arapuá mountain has a great influence on the spatial distribution of these meteorological elements. It follows that the main condition for the variation of vegetation conditions in this region was precipitation, which presented its highest values in the year of 2006. / O semiárido nordestino especificamente nos estados de Pernambuco e Paraíba são encontrados os Brejos de altitudes ou Matas Serranas. Nesses locais, a exploração dos recursos naturais ocorre gradativamente todos os anos porque apresenta clima mais ameno e maior disponibilidade hídrica para os setores da agropecuária. Os estudos relacionados às condições microclimáticas de florestas serranas são fundamentais para o desenvolvimento social e agrícola, tendo em vista o clima como fator mais importante para o surgimento ou desaparecimento de diferentes espécies vegetais ou animais, bem como o modo de vida de sua população. Utilizou-se nesta pesquisa o modelo MTCLIM para estimar radiação solar global, temperatura do ar (média, mínima e máxima) e déficit de pressão de vapor, objetivando-se identificar e analisar a dinâmica espaço-temporal dos elementos meteorológicos, e também parâmetros biofísicos usados na detecção de alterações ambientais obtidos por técnicas de sensoriamento remoto para a Serra do Arapuá, município de Carnaubeira da Penha - PE. Utilizou-se imagens de dezesseis dias do sensor MODIS: índice de vegetação NDVI e albedo da superfície disponíveis em 2006 e 2012. Imagens de NDVI foram utilizadas para estimar índice de área foliar e fração de solo coberto por vegetação. Utilizou-se também dados meteorológicos de superfície: temperaturas média, mínima e máxima do ar (Tmed,, Tmin, Tmax, ºC), precipitação (P, mm), radiação solar global (Rg, W m-2), obtidos em três estações meteorológicas automáticas situadas próximas da área de estudo pertencente ao INMET e ao CPTEC. As cartas temáticas mensais dos elementos meteorológicos: Tmax, Tmed, Tmin e Rg foram processadas pelo software Demo Surfer 10, enquanto que o albedo, índices de vegetação (NDVI), FC e IAF foram processadas a partir do software SPRING. Realizou-se os processos de calibração do modelo MTCLIM para as estações meteorológicas automáticas de Cabrobó e Triunfo. Os dados estimados foram correlacionados com os medidos de Tmax, Tmed, Tmin, Rg e DPV usando a análise de regressão, considerando o Erro médio (EM), Erro médio absoluto (EMA) e Índice de correlação de WILLMOTT. A validação do modelo MTCLIM mostrou bons resultados para ambos os município de Cabrobó quanto para Triunfo, foram verificados também valores elevados de correlação (r) e de índice de determinação (d). O efeito da topografia é muito importante para a modelagem da Tmed, Tmin, Tmax e Rg em todos os cenários, mostrando que a serra do Arapuá tem grande influência na distribuição espacial destes elementos meteorológicos. Conclui-se que o principal condicionante para a variação das condições de vegetação nessa região foi à precipitação, que apresentou seus maiores valores no ano de 2006.