Orientador: Sanae Kasahara / Banca: Cleusa Yoshiko Nagamachi / Banca: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Ana Paula Zampieri Silva / Banca: Luciana Bolsoni Lourenco / Resumo: Até recentemente, a família Leptodactylidae era considerada polifilética, mas nenhum dos trabalhos realizados antes de 2006 resolveu essa polifilia. Nesse ano, quase que simultaneamente, duas grandes revisões foram publicadas, com base principalmente em sequenciamento gênico e sem considerar dados citogenéticos, resultando em filogenias que mudaram radicalmente a taxonomia e a sistemática de muitos grupos de anuros. Leptodactylidae foi uma das famílias que passou por grandes transformações, sendo os gêneros reduzidos de 57 para apenas quatro. Na presente Tese, foram analisados os cariótipos de nove espécies do gênero Leptodactylus e 19 representantes de famílias relacionadas à Leptodactylidae, cujos dados são apresentados em três partes. No primeiro capítulo são apresentados cariótipos com 2n=20, nos exemplares de Vitreorana eurygnatha e V. uranoscopa (Centrolenidae); 2n=22, em Adelophryne baturitensis (Eleutherodactylidae), Brachycephalus ephippium, Ischnocnema guentheri, I. manezinho e I. parva (Brachycephalidae), Leptodactylus furnarius, L. fuscus, L. latrans, L. mystaceus, L. podicipinus e L. syphax (Leptodactylidae), Odontophrynus americanus (Cycloramphidae), Physalaemus barrioi, P. cuvieri e P. moreirae (Leiuperidae); e 2n=26 para Cycloramphus boraceiensis, C. brasiliensis, C. ryakonastes, Thoropa miliaris e Zachaenus parvulus (Cycloramphidae), Flectonotus sp. e Gastrotheca microdiscus (Hemiphractidae). São também descritos o padrão de Ag-RON e bandamento C para a grande maioria das espécies. Os dados cromossômicos aqui obtidos, juntamente com os disponíveis na literatura, foram avaliados à luz das árvores filogenéticas atuais, tendo sido observada grande concordância com as alterações propostas. O segundo capítulo trata dos cariótipos de três espécies de Leptodactylus que pertenciam ao gênero Adenomera, com 2n=24 em L. cf. marmoratus, 2n=23... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Until recently, the family Leptodactylidae was considered polyphyletic, but no paper published before 2006 clarify this question. In that year two extensive revisions were published, almost simultaneously, based mainly on gene sequencing with no contribution of cytogenetic data. These studies resulted in phylogenetic trees which have radically changed the taxonomy and systematic of several groups of frogs. Leptodactylidae was one of the families that suffered great modifications, and the number of genus was reduced from 57 to only 4. In this work, the karyotypes of 9 species of Leptodactylus and representatives of 19 families related to Leptodactylidae were analyzed, and the data are presented in three parts. The first chapter describes the karyotypes with 2n=20, in species of Vitreorana eurygnatha and V. uranoscopa (Centrolenidae); 2n=22 in Adelophryne baturitensis (Eleutherodactylidae), Brachycephalus ephippium, Ischnocnema guentheri, I. manezinho and I. parva (Brachycephalidae), Leptodactylus furnarius, L. fuscus, L. latrans, L. mystaceus, L. podicipinus and L. syphax (Leptodactylidae), Odontophrynus americanus (Cycloramphidae), Physalaemus barrioi, P. cuvieri and P. moreirae (Leiuperidae); and 2n=26 in Cycloramphus boraceiensis, C. brasiliensis, C. ryakonastes, Thoropa miliaris and Zachaenus parvulus (Cycloramphidae) Flectonotus sp. and Gastrotheca microdiscus (Hemiphractidae). The C band and Ag- RON patterns are described for the majority of the species. The chromosomal data obtained here, along with those available in the literature, were analyzed in the light of the current phylogenetic trees, and are in accordance to the proposed modifications. The second chapter reports the karyotypes of three Leptodactylus species belonging to the former genus Adenomera, with 2n=24 in L. cf. marmoratus, 2n=23 in Leptodactylus sp. (aff bokermanni), and 2n=26 in L. hylaedactylus, bearing different... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-22Bitstream added on 2014-06-13T20:00:07Z : No. of bitstreams: 1 maffei_f_me_botib.pdf: 4166647 bytes, checksum: 01728f1ad05a25bbd467cbc67d397b7d (MD5) / Duratex S/A / O Estado de São Paulo possui seus dois biomas, Cerrado e Mata Atlântica, ameaçados no mais alto grau em consequência da devastação que ocorreu em seu território nas últimas décadas. Mesmo com a maior parte da vegetação nativa toda fragmentada e perturbada, ainda possui uma rica biodiversidade com altos índices de endemismo. A anurofauna paulista é uma das mais ricas e bem estudadas do país, porém ainda existem lacunas de conhecimento em algumas regiões do Estado, principalmente no interior. O presente estudo foi realizado em uma área de Cerrado e Floresta Estacional Semidecidual no município de Lençóis Paulista, região centro-oeste do Estado de São Paulo, com os objetivos de caracterizar a fauna de anfíbios anuros do local, verificar o uso do habitat pelas espécies, analisar a distribuição espacial e temporal das espécies e determinar a diversidade da comunidade de anuros presente na área. As visitas foram realizadas mensalmente entre novembro de 2007 e dezembro de 2009 com amostragens em 24 pontos de coleta de dados. Os métodos utilizados para o registro das espécies foram levantamento por encontro visual, procura auditiva e armadilhas de interceptação e queda. Foram registradas 40 espécies de anuros de sete famílias: Bufonidae (2 spp.), Cycloramphidae (2 spp.), Centrolenidae (uma espécie), Hylidae (21 spp.), Leiuperidae (4 spp.), Leptodactylidae (8 spp.) e Microhylidae (2 spp.). A atividade dos anuros esteve associada ao período quente e chuvoso (setembro a março), sendo a chuva o principal componente na variação sazonal dos anuros. Os ambientes de área aberta foram utilizados por 29 espécies e apenas quatro tiveram a mata como ambiente. A borda de área aberta foi utilizada por 14 espécies e oito foram registradas em borda de mata. A diversidade da comunidade foi de 1,76 (H’) e a equitabilidade de 0,69 (J). A anurofauna se mostrou diferente em... / The São Paulo state of has its two biomes, Cerrado and Atlantic Forest, both highly threatened as a consequence of the devastation that occurred in recent decades. Even with most of the native vegetation fragmented and disturbed, this region still has a rich biodiversity with high levels of endemism. The anuran fauna of the São Paulo state is one of the richest and most studied of Brazil, but there are still important knowledge gaps in some regions, especially in the interior. This study was conducted in an area of Cerrado and Semideciduous Seasonal Forest in the municipality of Lençóis Paulista, Center-West of the São Paulo state. The objectives were to characterize the anuran fauna of the site, investigate the habitat use of these species, analyze their spatial and temporal distribution and determine the diversity of the anuran community in the area. Field visits were carried out monthly from November 2007 to December 2009, sampling 24 points of data collection. Visual encounter surveys, audio strip transects and pitfall traps were used to record the species. We recorded 40 species of anurans from seven families: Bufonidae (2 spp.), Cycloramphidae (2 spp.), Centrolenidae (one species), Hylidae (21 spp.), Leiuperidae (4 spp.), Leptodactylidae (8 spp.) and Microhylidae (2 spp.). Anurans were associated with the warm and rainy season (September to March), and rain was the main component underlying the seasonal variation in anurans. Open area environments were used by 29 species, whilst only four species used the forest. The edges of open areas were used by 14 species, and eight species were recorded in forest edges. The diversity of the community was 1.76 (H') and equitability was 0.69 (J). The anuran fauna had a different composition in areas under the influence of the vegetal formation, both in Cerrado and Seasonal Semideciduous Forest. Some important records were: Vitreorana ... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-28Bitstream added on 2014-06-13T19:39:33Z : No. of bitstreams: 1 costa_wp_me_botib.pdf: 1719005 bytes, checksum: 6eca3d6beacef4c55b025b4eb2c25475 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Variações populacionais são fatos relativamente frequentes em populações naturais que permitem inferir considerações sobre o caminho evolutivo e a estreita relação dos táxons com o ambiente. Dentre as espécies brasileiras, Proceratophrys moratoi (Anura, Cycloramphidae) é considerada endêmica do Estado de São Paulo e, nas últimas décadas, novas populações foram registradas, verificando-se sutis variações. Diante das novas populações e considerando o grau de importância que as mesmas apresentam para a compreensão da espécie, realizou-se neste trabalho um estudo da variação populacional da espécie com base em caracteres morfométricos, morfológicos e citogenéticos. Para tanto foram examinados 52 indivíduos componentes de cinco populações conhecidas de P. moratoi. Na comparação entre as populações foram utilizados 81 caracteres morfológicos e 15 morfométricos, somando 96 caracteres distintos. Os dados citogenéticos foram obtidos com o uso de técnicas de citogenética básica pela coloração com Giemsa, localização das regiões organizadoras de nucléolo (RONs) e localização da heterocromatina constitutiva. Os valores obtidos pela análise dos 15 caracteres morfométricos foram submetidos à Análise de Componentes Principais, resultando em dois componentes (PC1 e PC2) que permitiram contemplar 73% da variabilidade. A Análise dos Fatores Discriminantes foi significativa e permitiu a formação de três agrupamentos, sendo a população de Botucatu aquela que apresentou melhor estruturação e também a que apresentou valores das médias morfométricas menores em relação às amostras das demais localidades. Os caracteres morfológicos foram analisados através de uma matriz comparativa que permitiu identificar caracteres invariáveis, variáveis intra e inter-populacionalmente e... / Population variations are frequent facts in natural populations that permit to infer considerations about evolution trends and the close relationship between the species and the environment. Among Brazilian´s species, Proceratophrys moratoi (Anuran, Cycloramphidae) is considered endemic in Sao Paulo State and in the last decades new populations have being registered showing such slightly variations. Face the new populations and considering the importance degree they represent for species understanding in this work a study of population variations was performed based on morphometric, morphological and cytogenetic characters. For it 52 individuals were examinaed and distributed into five populations of P. moratoi. In the comparison 81 morphological and 15 morphometric characters were used summing 96 distinct characters. The cytogenetic data were gotten using basic cytogenetics ( Giemsa coloration, NORs and Heterochromatin regions localization ( C-banding).The obtained values through the 15 morphometric characters were submitted under the Principal Components Analysis (PCA) and resulted in two components (PC1 e PC2) that permitted contemplating 73% of variability. The discriminating factors analysis was significant and permitted the three groups formation in which Botucatu´s population was the best structured one and also the one that showed smaller morphometic averages related to other locations.The morphological characters were analyzed through comparative matrix that permitted to identify invariable characters, into and inter-populations variations, and punctual phenotypes. From the 81 morphological characters analyzed, 22 were invariable, 9 were punctual and 50 variable inter and intopopulations. From the 50 variations, 14 were regional ones ocurring only in one population and... (Complete abstract click electronic access below)

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Programa de Pós Graduação em Biologia Animal, 2014. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2014-06-11T14:58:05Z No. of bitstreams: 1 2014_LuisaMayumiArakeTacca.pdf: 3171230 bytes, checksum: f2a279d3f6739aba7da24618336db559 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-07-09T11:45:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_LuisaMayumiArakeTacca.pdf: 3171230 bytes, checksum: f2a279d3f6739aba7da24618336db559 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-09T11:45:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_LuisaMayumiArakeTacca.pdf: 3171230 bytes, checksum: f2a279d3f6739aba7da24618336db559 (MD5) / Os anfíbios anuros são animais que vêm sendo estudados e utilizados como modelos para descoberta de novas moléculas há algum tempo. Sua pele secreta uma mistura de substâncias ativas em grande parte já isoladas e estruturalmente caracterizadas. Dentre tais compostos, podemos citar peptídeos antimicrobianos, hipotensores e opióides, aminas biogênicas, alcaloides e esteróis. O trabalho em questão analisou um peptídeo oriundo da secreção cutânea do anfíbio Hypsiboas punctatus. Tal peptídeo apresenta uma sequência de 15 resíduos de aminoácidos e um motivo ativo composto pelo tripeptídeo KGD característico das proteínas da família das desintegrinas, até o momento inédito em anfíbios. O peptídeo em questão foi modificado em mais cinco análogos e sintetizado por meio de síntese química sólida. As moléculas foram purificadas, caracterizadas e testadas e, ao final do processo, tiveram os modelos das suas estruturas tridimensionais determinados por meio de Ressonância Magnética Nuclear. A sequência peptídica original foi modificada para gerar cinco análogos sintéticos obtidos por meio de síntese química em fase sólida. Todos os análogos foram submetidos à oxidação do par de resíduos de cisteína para formação das respectivas pontes dissulfeto, purificados, caracterizados e testados. Ao final deste processo, tiveram suas respectivas estruturas tridimensionais determinadas por meio de Ressonância Magnética Nuclear. O peptídeo natural não apresentou qualquer atividade anti- plaquetária in vitro quando testado por meio da metodologia de impedância elétrica, no entanto é possível atribuir-se a esta molécula discreta atividade relativa de inibição de agregação em ensaios de espalhamento plaquetário. Contudo, quando avaliados comparativamente sob mesma metodologia, os análogos sintéticos demonstram atividade anti-plaquetária significativamente superior ao peptídeo natural, utilizado neste trabalho como um arquétipo estrutural de desintegrina. Tais evidências, isto é, a comprovação experimental do surgimento de uma nova atividade biológica em análogos sintéticos, originalmente inexistente na molécula arquetípica, corrobora nossa hipótese sobre a importância da redistribuição das cargas (positiva e negativa) ao longo do eixo maior da estrutura 3D de cada análogo e da necessidade de um reposicionamento “Taylor-Made” dos motivos (Arg-Gly-Asp; Lys-Gly-Asp; His-Gly-Asp) para que as novas moléculas fossem ativas. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Anurans are animals that have been much explored as models. Their skin is part of their immune system and it has special glands which secrete a rich mixture of substances related to their innate defense against predators and microorganisms. Among this molecules are active peptides which have been isolated and tested for many pathogens and are a growing field within pharmacology. The present work analyzed a specific peptide from the skin secretion of the amphibian Hypsiboas punctatus. It is formed by a 15 amino acid sequence with a KGD disintegrin-like motif in the center of a loop constricted by a disulfide bridge. This motif has never been registered for amphibians before. The natural peptide was modified into five analogues which were synthesized through solid phase tButyl/FMOC strategy. They were purified (Reverse-Phase High Performance Liquid Chromatography), characterized (Mass Spectrometry), had their biological activity tested and their 3D structures calculated with the use of Nuclear Magnetic Resonance. The natural peptide did not show any anti-platelet inhibition activity when tested through electric impedance methodology; however it did show relative biological activity when tested through platelet spreading assay methodology. The modified analogues showed a higher activity rate. The results indicate the verification of the hypothesis of the importance of an improved positioning of the positive and negative charges along the molecule structure and also of the need for the ligand section of the peptide to be centered in the active loop.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2009. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-04-16T14:57:14Z No. of bitstreams: 1 2009_FernandaAparecidaSCassemiro.pdf: 5957794 bytes, checksum: 0c07f9101a4d80fc577d0d3260a080db (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-04-16T14:57:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_FernandaAparecidaSCassemiro.pdf: 5957794 bytes, checksum: 0c07f9101a4d80fc577d0d3260a080db (MD5) / Made available in DSpace on 2011-04-16T14:57:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_FernandaAparecidaSCassemiro.pdf: 5957794 bytes, checksum: 0c07f9101a4d80fc577d0d3260a080db (MD5) / A Teoria Metabólica da Ecologia (MTE) tenta explicar os gradientes latitudinais de biodiversidade. Baseada na cinética bioquímica do metabolismo, a MTE basicamente apresenta uma precisa predição quantitativa de como a riqueza de espécies deveria variar com a temperatura ambiental, expressa como 1/kT: linearmente com uma inclinação da reta (b) de aproximadamente -0,65. Utilizando dados de 3019 espécies de anfíbios do Novo Mundo avaliou-se qual é o melhor teste estatístico para se testar as predições da MTE, bem como qual região do espaço geográfico essas predições melhor se aplicam. Além disso, foi avaliado se as taxas evolutivas são função da temperatura e se a magnitude dos desvios de b predito pela MTE para a relação entre riqueza e temperatura é função de violações dos pressupostos da teoria. As análises mostraram que a MTE possui algumas falhas metodológicas e conceituais, como a falta de incorporação da estrutura espacial dos dados e o ajuste da teoria em apenas uma limitada área geográfica do mapa. A correlação entre temperatura e taxas evolutivas mostrouse fraca. Adicionalmente, cerca de 60% dos desvios de b predito foram devido à violações nos pressupostos. A hipótese que os padrões de riqueza são uma função da temperatura ambiental é simplificada e não considera outros processos ecológicos e ambientais. Contudo, seria possível obter derivações múltiplas da equação principal da MTE considerando as idiossincrasias dos fatores espaciais, biológicos e ecológicos que são essenciais ao entendimento dos padrões de biodiversidade. _____________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Metabolic Theory of Ecology (MTE) tries to explain the latitudinal gradients in biodiversity. Based on the biochemical kinetics of metabolism, MTE basically gives a precise quantitative prediction of how species richness should vary with ambient temperature, expressed as 1/kT: linearly with a slope of (b) of approximately -0.65. Using data from 3019 species of amphibians in the New World were evaluated what is the best statistical test to test the predictions of the MTE, and geographic region of space where these predictions apply best. In addition, we assessed whether evolutionary rates are a function of temperature and the magnitude of the deviations of b predicted by MTE for the relationship between richness and temperature is due to violations of assumptions of the theory. The analysis showed that LAT has some methodological and conceptual flaws, the lack of incorporation of the spatial structure of data and the fit of theory in only a limited geographic area of the map. The correlation between temperature and evolutionary rates has proved to be weak. Additionally, about 60% of the predicted deviations of b were due to violations in assumptions. The hypothesis that patterns of richness are a function of ambient temperature is simplified and does not consider other environmental and ecological processes. However, it would be possible to obtain multiple derivations of the main equation of the MTE considering the idiosyncrasies of spatial factors, biological and ecological processes that are essential to understanding patterns of biodiversity.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, 2013 / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2013-11-27T14:43:43Z No. of bitstreams: 1 2013_CarlosEduardoRibeiroCandido.pdf: 3573441 bytes, checksum: 21d4abbcabbb170086d202609670b6f9 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-12-10T10:45:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_CarlosEduardoRibeiroCandido.pdf: 3573441 bytes, checksum: 21d4abbcabbb170086d202609670b6f9 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-12-10T10:45:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_CarlosEduardoRibeiroCandido.pdf: 3573441 bytes, checksum: 21d4abbcabbb170086d202609670b6f9 (MD5) / Phyllomedusa oreades ocorre em localidades de Goiás e Minas Gerais, além do Distrito Federal, sempre associada a regiões de altitude (acima de 900m), onde se reproduz em riachos temporários. Pouco se conhece sobre sua biologia básica, incluindo sua biologia reprodutiva. O estudo foi conduzido em um riacho de altitude localizado em uma área de campo limpo (47°56'46,30"O; 15°58'35,11"S, altitude 1100m) da fazenda Água Limpa (FAL) que pertence à Universidade de Brasília (UnB), situada no Distrito Federal. As coletas de dados foram realizadas em duas estações chuvosas, entre os meses de outubro de 2011 e janeiro de 2012 e entre setembro e dezembro de 2012. O esforço amostral foi de 83 noites, somando 800 horas, foram feitos 472 registros em 2011/12 e 81 registros durante a estação chuvosa de 2012/13. O período de atividade de P. oreades começa nas primeiras chuvas e perdura por aproximadamente três meses. A precipitação exerce bastante influência na atividade de vocalização, assim como no período reprodutivo. Apresenta hábito noturno, com pico de atividade de vocalização entre 20 e 21h. O período reprodutivo dura cerca de três meses, o que caracteriza como tipo prolongado. Os ninhos são construídos em folhas de arbusto pendentes sobre a lâmina d’água, onde são depositados em média 30 ovos e a incubação dura cerca de 13 dias. Em média nascem 25 girinos por desova. Os machos são territorialistas, permanecendo nos mesmos sítios por mais de 60 dias, defendendo-os por meio de vocalizações e eventuais combates físicos. Os machos utilizam três modos distintos para demarcar e defender seu território e apresentam o comportamento de macho-satélite. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Phyllomedusa oreades occurs in localities of Goiás, Minas Gerais and the Federal District of Brazil, always associated with temporary streams above 900m o. s. l., where it breeds. Little is known about its biology, including reproductive biology. The study was conducted in a high altitude stream located in a grassland area (47°56'46,30"W; 15° 58'35,11"S, 1100-m high) of the Água Limpa Farm (FAL) which belongs to the University of Brasilia (UnB), located in Brasília, Federal District. Data were gathered during two rainy seasonsbetween October 2011 and January 2012, and between September and December 2012. Sampling effort accounted for 83 nights, totaling 800 hours. 472 individuals were recorded in the first rainy season and 81 in the second rainy season. The activity of P. oreades began with the first rains and lasted for about three months. Rainfall exerts considerable influence on the vocalization activity, as well as in the eproductive period. The species is nocturnal, with a peak in calling activity between 8:00 pm and 9:00 pm. The breeding season lasted for about three months, which characterize it as prolonged. Nests, containing about 30 eggs, were built in leaves of bushes, hanging over stream pools. Twenty five tadpoles hatched from each nest after about 30 days. Males are territorial, staying at the same site for more than 60 days, and defending it through aggressive vocalizations and agonistic encounters. Males used three different ways to demarcate and defend their territory and some males behaved as satellite-males.

Orientadores: Luis Felipe de Toledo Ramos Pereira, Renato Neves Feio / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T16:33:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nunes-de-Almeida_CarlosHenriqueLuz_M.pdf: 2724728 bytes, checksum: 32daa352df879ffab82840075e1dc3f6 (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: Os anfíbios da família Cycloramphidae são endêmicos da porção oriental do Brasil e alguns estão ameaçados ou em perigo de extinção. Apesar de ser uma família com poucos grupos taxonômicos, apenas três gêneros (Cycloramphus, Thoropa e Zachaenus), até o momento não há uma proposta filogenética para o gênero Thoropa que abranja todas as espécies. Então, propomos a reconstrução filogenética de Thoropa usando como grupo esterno, uma espécie do gênero Hylodes (Hylodidae), duas do gênero Cycloramphus e uma espécie do gênero Zachaenus. Definimos 86 caracteres baseados em osteologia, ecologia e morfologia externa de adultos e larvas. Neste contexto realizamos a descrição da forma larval de Cycloramphus rhyakonastes, a qual foi utilizada como grupo esterno. A filogenia proposta é baseada em critérios de máxima parcimônia. Como duas das árvores resultantes indicam parafilia, propomos aqui um novo gênero para as espécies de menor porte, separando-as das espécies maiores / Abstract: The phylogenetic resolution of Neotropical amphibians increased considerably in recent decades, providing great understanding of the relationships of higher taxa, such as the relationships between families and genera. After such improvement, amphibian systemticians are now focusing their efforts on lower taxa, such as the relationships within congeneric species. Under such context we did a phylogenetic reconstruction of the genus Thoropa, for which no comprehensive phylogeny is available. We examined all species of the genus including two species with extinct populations and possible new species. We adopted the criteria of maximum parsimony to analyze 86 characters based on osteology, external morphology, behavior, bioacoustics, and tadpole external morphology of at least one specimen per species. As the resulting topology of Thoropa tree indicates a possible case of paraphyly, we propose a new genus, assuring the monophyly of Thoropa in all possible scenarios / Mestrado / Biodiversidade Animal / Mestre em Biologia Animal

Orientador: Cinthia Aguirre Brasileiro / Coorientador: Mariana Lúcio Lyra / Banca: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Banca: Maria Tereza Chiarioni Thomé / Resumo: A Mata Atlântica, uma formação florestal com alta diversidade e ameaçada por ação antrópica, é foco de interesse de vários estudos sobre diversificação de espécies. Este estudo teve como objetivo principal entender a história evolutiva das espécies de Thoropa grupo miliaris (Anura: Cycloramphidae), que inclui T. miliaris, T. taophora, T. saxatilis e T. megatympanum. Utilizei sequências de DNA mitocondrial dos fragmentos 16S, ND2 e COI de indivíduos das quatro espécies (N = 487), distribuídos em um total de 98 localidades. Realizei análises de agrupamento para os três fragmentos separados, e posteriormente realizei análises filogenéticas sob Inferência Bayesiana, Máxima Verossimilhança e Máxima Parcimônia com os fragmentos concatenados. Além disso, fiz redes de haplótipos com as sequências de 16S, e calculei diversidades genéticas, além das divergências genéticas intra e interclados. Por fim, estimei tempos de divergência por meio de análises coalescentes (t MRCA) e das divergências genéticas (dA ). Encontrei a diversidade genética distribuída em oito clados distintos. Thoropa saxatilis e T. megatympanum são grupos monofiléticos bem estruturados. A primeira localiza-se no nordeste do Rio Grande do Sul e sudeste de Santa Catarina, e a segunda ocorre na Serra do Espinhaço. Thoropa miliaris inclui cinco grupos parafiléticos em relação à T. taophora, e ocorrem desde o sudeste da Bahia até o sudeste do Rio de Janeiro, e sobrepõem-se no centro-sul do Espírito Santo e centro-norte do Rio de Janeiro. Thoropa taophora inclui populações do extremo sudeste do estado do Rio de Janeiro e do litoral do estado de São Paulo. Alguns clados de Thoropa miliaris são bem estruturados, e os outros formam, juntamente com T. taophora, um agrupamento... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Atlantic Forest, a forest formation with high diversity and threatened by human action, is the subject of interest of many studies on species diversification. This study is based on the evolutionary history of the Thoropa miliaris group (Anura: Cycloramphidae), which includes T. miliaris, T. taophora¸ T. saxatilis and T. megatympanum. I used sequences of mitochondrial DNA fragments of 16S, ND2 and COI from individuals of the four species (N = 487), distributed in 98 localities. I performed cluster analysis for the three separated fragments, and after that, phylogenetic analyzes with Bayesian Inference, Maximum Likelihood and Maximum Parsimony with the concatenated fragments. In addition, I made haplotype networks using the 16S fragment, and also calculated genetic diversity and genetic divergences within and between clades. Finally, I estimated times of divergence using coalescent analysis (t MRCA) and genetic divergence (dA ). I found the genetic diversity distributed in eight distinct clades. Thoropa saxatilis and T. megatympanum are monophyletic and structured groups. The first located in northeastern Rio Grande do Sul and southeast Santa Catarina and the second occurs at Serra do Espinhaço. Thoropa miliaris includes five paraphyletic groups that occur from southern Bahia to southern Rio de Janeiro, and these clades overlap in the center- south of the Espírito Santo and north-central Rio de Janeiro. Thoropa taophora includes populations from the extreme southeastern of the state of Rio de Janeiro, and the coast of the São Paulo state. Some clades of Thoropa miliaris are structured, and the others form, along with T. taophora, a group with low genetic diversity. Thoropa miliaris group possibly began its diversification in the Miocene (tempo de divergência: 8.5 to 3.7 My) and most recent common ancestors are from... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Denise de Cerqueira Rossa-Feres / Coorientador: Carlos Eduardo Conte / Banca: Paulo de Marco Jr / Banca: Mauricio Osvaldo Moura / Banca: Vitor Hugo Mendonça do Prado / Banca: Fernando Rodrigues Silva / Resumo: Com intuito de compreender os processos que determinam a composição e distribuição da diversidade de anfíbios em paisagens subtropicais, nós (1) inventariamos a composição dos anfíbios em áreas de campos naturais entremeados a formações florestais da Mata Atlântica, (2) avaliamos como características da paisagem (i.e., cobertura e uso do solo) e dos habitats (i.e., área, hidroperíodo, cobertura de dossel dos corpos d'água) influenciam os padrões de distribuição da diversidade taxonômica e filogenética e (3) avaliamos quais e como gradientes ambientais e espaciais influenciam a estrutura filogenética da metacomunidade regional. Empregamos três métodos de amostragem (transecção, amostragem em sítio de reprodução e busca ativa) em 12 unidades de conservação e entorno, distribuídas nos Estados do Paraná e de Santa Catarina. As amostragens foram realizadas em diferentes períodos entre 2004 e 2014. Nós registramos 63 espécies de 11 famílias de anfíbios, das quais 20 espécies foram associadas aos campos, 19 às áreas florestais e ecótonos e 21 espécies foram generalistas. Espécies com um único indivíduo registrado não foram avaliadas quanto ao uso de habitat. Para avaliar a influência das características estruturais do habitat e da paisagem sobre os padrões de distribuição dos anfíbios, nós selecionamos oito das unidades de conservação e amostramos mensalmente, ao longo de um ano, entre oito e 14 corpos d'água em cada unidade, totalizando 81 corpos d'água (poças temporárias, lagoas... / Abstract: In order to understand wich processes determine the composition and distribution of amphibian diversity in subtropical landscapes, the goals of this work was (1) inventorying the composition of amphibians in areas of natural grasslands associated with Atlantic Forest, (2) assess how land coverage (i.e., land cover and use) and breeding habitats features (i.e., area, depth) influence the distribution patterns of taxonomic and phylogenetic diversity, (3) evaluate how environmental and spatial gradients influence the phylogenetic structure regional metacommunity. We employ three sampling methods (transect sampling, survey at breeding site and active search) in 12 conservation units, distributed in the states of Paraná and Santa Catarina. Samples were taken at different periods between 2004 and 2014. We recorded 63 species of amphibians distributed in 11 families. In relation to use of habitat by amphibians, 20 species were preferably associated with grasslands, 19 were preferably forest and forest edge, 21 generalist (recorded on forest, edge and grasslands environments). Species with a single individual recorded were not evaluated for their habitat use. In order to assess how land coverage and breeding habitats features influence the distribution patterns of taxonomic and phylogenetic diversity, we selected eight conservation units and sampled monthly, over a year, a minimum of 8 and a maximum of 14 water bodies in each unit, totaling 81 water bodies (i.e., pools, permanent ... / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-06-13T20:49:32Z : No. of bitstreams: 1 sabbag_af_me_sjrp_parcial.pdf: 281729 bytes, checksum: e0a57c9718410973d302e0afd7b6dd4d (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-25T13:01:06Z: sabbag_af_me_sjrp_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-25T13:03:25Z : No. of bitstreams: 1 000713955_20160228.pdf: 262208 bytes, checksum: 2e947072f90441db7014c4cdf6133fde (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-29T12:16:26Z: 000713955_20160228.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-29T12:17:25Z : No. of bitstreams: 1 000713955.pdf: 1305705 bytes, checksum: 3e29a2bd15ec794b73a281cd78030871 (MD5) / A Mata Atlântica, uma formação florestal com alta diversidade e ameaçada por ação antrópica, é foco de interesse de vários estudos sobre diversificação de espécies. Este estudo teve como objetivo principal entender a história evolutiva das espécies de Thoropa grupo miliaris (Anura: Cycloramphidae), que inclui T. miliaris, T. taophora, T. saxatilis e T. megatympanum. Utilizei sequências de DNA mitocondrial dos fragmentos 16S, ND2 e COI de indivíduos das quatro espécies (N = 487), distribuídos em um total de 98 localidades. Realizei análises de agrupamento para os três fragmentos separados, e posteriormente realizei análises filogenéticas sob Inferência Bayesiana, Máxima Verossimilhança e Máxima Parcimônia com os fragmentos concatenados. Além disso, fiz redes de haplótipos com as sequências de 16S, e calculei diversidades genéticas, além das divergências genéticas intra e interclados. Por fim, estimei tempos de divergência por meio de análises coalescentes (t MRCA) e das divergências genéticas (dA ). Encontrei a diversidade genética distribuída em oito clados distintos. Thoropa saxatilis e T. megatympanum são grupos monofiléticos bem estruturados. A primeira localiza-se no nordeste do Rio Grande do Sul e sudeste de Santa Catarina, e a segunda ocorre na Serra do Espinhaço. Thoropa miliaris inclui cinco grupos parafiléticos em relação à T. taophora, e ocorrem desde o sudeste da Bahia até o sudeste do Rio de Janeiro, e sobrepõem-se no centro-sul do Espírito Santo e centro-norte do Rio de Janeiro. Thoropa taophora inclui populações do extremo sudeste do estado do Rio de Janeiro e do litoral do estado de São Paulo. Alguns clados de Thoropa miliaris são bem estruturados, e os outros formam, juntamente com T. taophora, um agrupamento... / The Atlantic Forest, a forest formation with high diversity and threatened by human action, is the subject of interest of many studies on species diversification. This study is based on the evolutionary history of the Thoropa miliaris group (Anura: Cycloramphidae), which includes T. miliaris, T. taophora¸ T. saxatilis and T. megatympanum. I used sequences of mitochondrial DNA fragments of 16S, ND2 and COI from individuals of the four species (N = 487), distributed in 98 localities. I performed cluster analysis for the three separated fragments, and after that, phylogenetic analyzes with Bayesian Inference, Maximum Likelihood and Maximum Parsimony with the concatenated fragments. In addition, I made haplotype networks using the 16S fragment, and also calculated genetic diversity and genetic divergences within and between clades. Finally, I estimated times of divergence using coalescent analysis (t MRCA) and genetic divergence (dA ). I found the genetic diversity distributed in eight distinct clades. Thoropa saxatilis and T. megatympanum are monophyletic and structured groups. The first located in northeastern Rio Grande do Sul and southeast Santa Catarina and the second occurs at Serra do Espinhaço. Thoropa miliaris includes five paraphyletic groups that occur from southern Bahia to southern Rio de Janeiro, and these clades overlap in the center- south of the Espírito Santo and north-central Rio de Janeiro. Thoropa taophora includes populations from the extreme southeastern of the state of Rio de Janeiro, and the coast of the São Paulo state. Some clades of Thoropa miliaris are structured, and the others form, along with T. taophora, a group with low genetic diversity. Thoropa miliaris group possibly began its diversification in the Miocene (tempo de divergência: 8.5 to 3.7 My) and most recent common ancestors are from... (Complete abstract click electronic access below)