Submitted by Maria Creuza Silva (mariakreuza@yahoo.com.br) on 2017-03-10T13:16:13Z No. of bitstreams: 1 Tese THIAGO MAGALHÃES. 2016.pdf: 1427992 bytes, checksum: 34f7557c55899cd7c86016703d07af9d (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Creuza Silva (mariakreuza@yahoo.com.br) on 2017-03-10T13:39:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese THIAGO MAGALHÃES. 2016.pdf: 1427992 bytes, checksum: 34f7557c55899cd7c86016703d07af9d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-10T13:39:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese THIAGO MAGALHÃES. 2016.pdf: 1427992 bytes, checksum: 34f7557c55899cd7c86016703d07af9d (MD5) / A raça/cor é empregada como um eixo central na pesquisa biomédica e das iniquidades em saúde. Por outro lado, o aperfeiçoamento tecnológico tem permitido a estimativa cada vez mais acurada da ancestralidade biogeográfica individual. Visto que a raça/cor e a ancestralidade biogeográfica podem atuar como marcadores de exposições tanto a fatores genéticos quanto a determinantes não genéticos que afetam o status de saúde dos indivíduos, o conhecimento e a quantificação da relação existente entre raça/cor e ancestralidade, como também da relação entre essas variáveis e diferentes determinantes sociais da saúde, é de grande importância no campo da epidemiologia. Isso é especialmente destacado para desfechos cuja prevalência ou gravidade são desigualmente distribuídos entre grupos étnico-raciais distintos, a exemplo da asma e alergias. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo investigar as relações entre ancestralidade biogeográfica, raça/cor auto-relatada, determinantes sociais da saúde e asma e atopia. A tese foi estruturada em três capítulos, sendo que o primeiro foi desenvolvido a partir de um estudo caso-controle para dengue realizado nas cidades de Salvador e Fortaleza, enquanto que os dois últimos foram estudos transversais conduzidos na população integrante do Social Changes Asthma and Allergy in Latin America (SCAALA) - Salvador. No primeiro artigo, que avaliou a associação entre a ancestralidade biogeográfica e a raça/cor auto-relatada, verificou-se que a força dessa relação foi maior em Salvador do que em Fortaleza, embora significante nas duas cidades. Além disso, análises acerca da estruturação da diversidade genética revelaram uma maior estrutura genética presente em Salvador comparativamente a Fortaleza. No segundo artigo nós investigamos e comparamos a associação da ancestralidade biogeográfica e da raça/cor auto-relatada com diferentes variáveis sociodemográficas, ambientais e marcadores de infecções. Enquanto a ancestralidade biogeográfica e a raça/cor foram significativamente associadas com marcadores de infecções, apenas a ancestralidade biogeográfica foi um preditor para status socioeconômico e variáveis ambientais. O aumento da proporção de ancestralidade individual africana foi associado com condições socioeconômicas e ambientais mais precárias, com o contrário sendo observado para a ancestralidade europeia. Por fim, no terceiro artigo foi analisada a associação entre a proporção de ancestralidade individual africana e sintomas de asma, fenótipos de asma e atopia, considerando a influência de variáveis socioeconômicas, ambientais, infecções e fatores psicossociais. O aumento da proporção de ancestralidade africana foi negativamente associado com atopia, medida através do teste de reatividade cutânea (SPT), e positivamente associado com asma não atópica. Esses achados sugerem que eventuais fatores genéticos subjacentes à ancestralidade africana são mais prováveis de desempenhar algum papel na asma não atópica, o que precisará ser confirmado em estudos posteriores.

Made available in DSpace on 2015-09-25T12:22:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Estevam Cipriano Araujo de Lima.pdf: 1780691 bytes, checksum: 6d96c61393940933aac44c66940be196 (MD5) Previous issue date: 2014-02-20 / The terrestrial fauna on oceanic islands is highly vulnerability and diversity particular due to the geographical limited and unique space. Conservation Strategies of island must be strict to ensure the maintenance of diversity. The recognition of distribution patterns of diversity is important to determine the appropriate spatial scales for the development of conservation strategies biogeographic. This work, by partitioning the diversity of Collembola in Oceanic Islands of the Archipelago Fernando de Noronha, we present the distribution pattern the diversity of arthropods and also described a new species of Collembola endemic to this island environment. This work was structured in three chapters. In the first we present the state of the art, the objectives (general and specific), hypothesis, inquiry and characterization of the study area. The remaining chapters were developed in article format, respecting the proposed by the respective magazines format. The second chapter presents a study on the spatial distribution of Collembola, which determine the appropriate scale for the conservation of the Archipelago Fernando de Noronha and will be submitted for Diversity and Distributions ( IF 6.122 ) magazine and third present the first species of collembola endemic and restricted the sandy strand of the Archipelago Fernando de Noronha published in The Florida Entomologist (IF 1.163 ) in December 2013 (volume 96 , pages 1579-1587) titled " A New Species of Isotogastrura (Collembola : Isotogastruridae) from Northeastern Brazil " (PALACIOS - VARGAS et al., 2013) . / A fauna terrestre em ilhas oceânicas apresenta alta vulnerabilidade e diversidade particular, devido ao espaço geográfico restrito e único. As estratégias de conservação dos ambientes insulares devem ser rigorosas para garantir a manutenção da diversidade. O reconhecimento dos padrões de distribuição da diversidade é importante para determinar as escalas espaciais apropriadas para o desenvolvimento de estratégias de conservação biogeográfica. No presente trabalho, através do particionamento da diversidade de Collembola em Ilhas Oceânicas do Arquipélago Fernando de Noronha, apresentamos o padrão de distribuição da diversidade destes artrópodes e também descrevemos uma nova espécie de Collembola endêmica deste ambiente insular. Este trabalho foi estruturado em três capítulos. No primeiro apresentamos o estado da arte, os objetivos (gerais e específicos), hipótese, pergunta e a caracterização da área de estudo. Os demais capítulos foram desenvolvidos em formato de artigo, respeitando o formato proposto pelas respectivas revistas. O segundo capítulo traz um estudo sobre a distribuição espacial de Collembola, onde determinamos a escala apropriada para a conservação do Arquipélago Fernando de Noronha e será submetido à revista Diversity and Distributions (IF 6.122) e no terceiro apresentamos a primeira espécie de collembola endêmica e restrita ao cordão arenoso do Arquipélago Fernando de Noronha publicado na revista The Florida Entomologist (IF 1.163) em dezembro de 2013 (volume 96, páginas 1579-1587) intitulado A New Species Of Isotogastrura (Collembola: Isotogastruridae) From Northeastern Brazil (PALACIOSVARGAS et al., 2013).

Estudo da termitofauna (Insecta, Isoptera) da região do alto Rio Madeira, Rondônia. Na região conhecida como alto Rio Madeira, no município de Porto Velho, Rondônia, estão sendo criadas as Usinas Hidrelétricas (UHEs) de Santo Antônio e Jirau. As construções das represas das UHEs estão inundando grandes porções de floresta ao longo das duas margens do rio Madeira. Desta forma o conhecimento da biota local, especialmente de sua distribuição no espaço, é extremamente importante, ainda mais porque o alinhamento dos rios Amazonas-Madeira-Mamoré separa a região Neotropical em duas áreas de endemismo para diversos grupos de animais. Essa tese tem por objetivo apresentar os resultados gerais obtidos ao longo de três anos de monitoramento de cupins nas áreas de influência da UHE de Jirau e dois anos nas áreas de influência da UHE de Santo Antônio, assim como desenvolver um estudo de comunidades e análise da distribuição espacial dos cupins presentes nas áreas de influência da UHE de Jirau (Capítulo 1). Outro objetivo é o estudo da estrutura genética das populações de Heterotermes tenuis (Rhinotermitidae) ao longo das áreas de influência das duas UHEs, visando investigar a existência de fluxo gênico entre as populações de cada margem do Rio Madeira (Capítulo 2). Foram amostrados doze módulos, sete na margem esquerda do rio e cinco na margem direita. Cada um era compostos por transectos de 3 ou 4 km e parcelas perpendiculares a cada 1km, e as amostragens foram realizadas em subparcelas de 5x2m dentro das parcelas. Durante um total de 20 campanhas foram investigadas 1121 subparcelas, totalizando 7875 amostras de cupins e pelo menos 169 espécies. Esse é provavelmente o trabalho com maior esforço amostral já empregado e também o que registrou o maior número de espécies de cupins até hoje. Para o estudo de comunidades, foram aleatorizadas 20 subparcelas nos seis módulos da UHE de Jirau, sendo cinco subparcelas dentro das parcelas marcadas nas seguintes distâncias em relação à margem do rio: P1 - 50 m, P2 - 1 km, P3 - 2 km e P4 - 3 km. A composição de cupins não está relacionada com o lado do rio. O estimador que mais se aproximou do provável número real de espécies foi o Jackknife 2. Como resultado das análises de diversidade beta utilizando a composição de espécies de cupins houve um agrupamento dos módulos com o mesmo tipo de solo, sugerindo que algumas espécies de cupins estejam distribuídas de acordo com esta variável. Em relação à distância para o rio, a parcela mais próxima do rio foi a mais singular, tanto em relação à composição de espécies quanto à riqueza e abundância, sendo que existem espécies restritas à P1 e outras praticamente ausentes nessas parcelas. Das dez variáveis ambientais analisadas, a riqueza de cupins se mostrou correlacionada com a altitude, concentração de argila e silte no solo e estratificação vegetal entre 1 e 5 m. Para o estudo da estrutura genética das populações de H. tenuis foram utilizadas 84 sequências dessa espécie dos 12 módulos de monitoramento, seis de colônias do Cerrado e três do GenBank (de Manaus, Guiana Francesa, e Equador), além de uma de H. longiceps como grupo externo. Nas análises iniciais, foi encontrada uma forte estruturação genética entre as sequências: todas as análises filogenéticas (máxima parcimônia, máxima verossimilhança e inferência bayesiana), assim como a rede de haplótipos, formaram dois grupos consistentes, mas sem qualquer relação espacial. A partir disso, passou-se a trabalhar com a hipótese de que há duas espécies crípticas (chamadas Ht. A e Ht. B). Desta forma, todas as análises para testar se o Rio Madeira funcionava como barreira biogeográfica foram testadas separadamente para cada uma das supostas duas espécies crípticas, entretanto, não foi constatada qualquer influência do rio como barreira ao fluxo gênico entre as populações de cada margem. / The Santo Antônio and Jirau hydroelectrics plants (HP) are being built in the Madeira River region, in Porto Velho, RO, Brazil. The HPs will flood large portions of native forest, and thus knowledge of the local biota and its distribution in space is extremely important for the formulation of management plans for creation of protected areas. This region in particular is unique, since the alignment of Amazonas-Madeira-Mamoré Rivers divides the Neotropical region into two areas of endemism for a diversity of taxa. The main objective of this thesis was to monitor termites for three years in areas near the Jirau HP and two years in areas near the Santo Antônio HP. As well as conduct a community level study and analyze the spatial distributions of termites from the areas influenced by Jirau HP (Chapter 1); and investigate the population genetic structure of Heterotermes tenuis (Rhinotermitidae), for the two areas influenced by the HPs, to test whether there is genetic flow between the populations on either bank of the Madeira River (Chapter 2). Twelve modules were marked, seven on the left bank of the river and five on the right bank. Each module was composed of 3 or 4 km transects and perpendicular parcels every 1 km. The sampling was conducted in sub parcels of 5 x 2 m inside each main parcels. During 20 expeditions, 1121 subparcels were investigated and a total of 7875 samples were collected and identified to 169 species. This study incorporates greater sampling effort than already employed by other published studies to date and also registered the highest number of termites species of any similar study. For the community study, 20 subparcels were randomized in the six modules of the Jirau HP, with five subparcels marked in relation to distance from the river margin (P1 - 50 m, P2 - 1 km, P3 - 2 km, and P4 - 3 km). The termite species composition was not related to side of the river bank. The richness estimator Jackknife 2 was the best estimator of the real number of species diversity. The beta diversity analysis with termite species composition clustered for modules with the same soil type, suggesting that some termite species may be distributed according to the soil type. Parcels closest to the river were the most unique, both in terms of termite species composition and abundance patterns, with some species restricted to the P1 and others absent. Of the ten environmental variables measured, termite species richness was correlated with altitude, clay and silt concentration in the soil, and vegetation stratification between 1 and 5 m, among. For the study of the genetic structure of Heterotermes tenuis, 84 sequences of this species were used from the 12 monitoring modules, six from colonies from the Cerrado (Brazilian Savanna), three from GeneBank (from Manaus, French Guiana and Ecuador), and one of H. longiceps as outgroup. In the initial analysis, relatively strong genetic structure within the samples was found: all phylogenetic analysis (maximum parsimony and likelihood, and Bayesian inference), and haplotype networks, consistently clustered two groups of haplotypes, but without any spatial relationships. Thus was assumed that there were two cryptic species (here called Ht. A and Ht. B), and all the analysis to test whether the Madeira River was a biogeographic barrier were conducted separately for each putative species. However, it was not possible to detect any influence of the river to genetic flow between the populations from either side of the river.

The diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes 1832 in the Rio Doce basin is investigated using conventional and modern morphology and DNA analyses. The work is presented in two Chapters. Chapter One, entitled Diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes, 1832 (Siluriforms, Trichomycteridae) in the Rio Doce basin: a systematic study integrating phenotypes, DNA and classical taxonomy integratively analyzes specimens of the genus from the entire Rio Doce drainage and adjacent basins, both from available world-wide collections and from active sampling efforts. A combination of phenotypic and DNA (COI barcoding analysis) provides evidence for the existence of 14 species in the basin, 10 of which are new: T. alternatus Eigenmann, 1917; T. argos Lezama et al., 2012; T. astromycterus sp. nov.; T. barrocus sp. nov.; T. brucutu sp. nov.; T. brunoi Barbosa & Costa, 2010; T. immaculatus (Eigenmann & Eigenmann, 1889)] T. illuvies sp. nov.; T. melanopygius sp. nov.; T. ipatinguensis sp. nov.; T. pussilipygius sp. nov.; T. sordislutum sp. nov.; T. vinnulus sp. nov; and T. tantalus sp. nov. . In addition, a lectotype is designated for T. immaculatus and the species is considered as a senior synonym of Trichomycterus pradensis Sarmento-Soares et al., 2005. Although remarkable, such increase in species number of Trichomycterus in a single drainage matches similar recent increments in some other Southeastern Brazilian basins, such as the Paraíba do Sul and Iguaçu. The kind of differentiation among species herein recognized varies, with some of them being well-differentiated in morphology but not in barcoding data, and others showing the opposite phenomenon. The geographical distribution of each of the 14 species is plotted in the Rio Doce basin. The wide geographical distribution of some species (T. alternatus and T. immaculatus) is explained against data from geomorphological processes and comparative information on their biology. Chapter two, The type specimens of Trichomycterus alternatus (Eigenmann, 1917) and T. zonatus (Eigenmann, 1918), with elements for future revisionary work (Teleostei, Siluriformes, Trichomycteridae) focuses on the complex taxonomy, nomenclature and type material status of T. alternatus and T. zonatus. The type series of the two species are analyzed in detail, both in morphology and locality data. Osteological information was obtained with conventional and a new technique of radiographic stereo-triplets. Our new data elucidates their species distinctiveness, diagnostic characteristics, type localities and show that T. zonatus does not occur in the Rio Doce basin. / A diversidade do gênero Trichomycterus Valenciennes 1832 na bacia do Rio Doce é investigada utilizando métodos convencionais e modernos em análises morfológicas e moleculares. Os resultados desta dissertação são apresentados em dois capítulos. Capítulo um, intitulado Diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes, 1832 (Siluriforms, Trichomycteridae) in the Rio Doce basin: a systematic study integrating phenotypes, DNA and classical taxonomy examinou espécimes pertencentes a este gênero encontrados no Rio Doce e em bacias adjacentes disponíveis em coleções nacionais e internacionais e coletados durante esta dissertação. O conjunto de dados obtidos através de análises morfológicas e moleculares (COI, DNA barcoding) revelou a existência de 14 espécies na bacia do Rio Doce, das quais 10 novas: T. alternatus Eigenmann, 1917; T. argos Lezama et al., 2012; T. astromycterus sp. nov.; T. barrocus sp. nov.; T. brucutu sp. nov.; T. brunoi Barbosa & Costa, 2010; T. immaculatus (Eigenmann & Eigenmann, 1889)] T. illuvies sp. nov.; T. melanopygius sp. nov.; T. ipatinguensis sp. nov.; T. pussilipygius sp. nov.; T. sordislutum sp. nov.; T. vinnulus sp. nov; and T. tantalus sp. nov. Além disso, é designado um lectótipo para T. immaculatus, espécie aqui proposta como sinônimo sênior de Trichomycterus pradensis Sarmento-Soares et al., 2005. O acentuado incremento em número de espécies de Trichomycterus para uma única bacia segue um padrão de crescimento em biodiversidade conhecida do gênero para outras drenagens do sudeste brasileiro a exemplo do rio Paraíba do Sul e Iguaçu. Os tipos de diferenciação detectada entre as espécies aqui tratadas variam, com algumas bem corroboradas morfologicamente, porém muito similares ou indiferenciáveis em análise de DNA barcoding, e outras apresentando o fenômeno oposto. As distribuições geográficas de cada uma das 14 espécies são mapeadas com base em todo o material examinado. A ampla distribuição geográfica de algumas espécies (T. alternatus and T. immaculatus) é explicada através de processos geomorfológicos e informações comparativas sobre suas biologias. O capítulo dois, The type specimens of Trichomycterus alternatus (Eigenmann, 1917) and T. zonatus (Eigenmann, 1918), with elements for future revisionary work (Teleostei, Siluriformes, Trichomycteridae) se concentra em esclarecer a complexa taxonomia, nomenclatura e o status do material tipo de T. alternatus e T. zonatus. As séries tipos das duas espécies foram minuciosamente analisadas tanto para morfologia como para suas respectivas localidades de proveniência. Informações osteológicas foram obtidas através de técnicas de radiografia convencionais e uma nova metodologia chamada stereo triplets. Os dados obtidos corroboram as respectivas espécies como distintas, e permitem uma avaliação precisa de seus respectivos caracteres diagnósticos e localidades tipo. Também se chegou à conclusão que T. zonatus não ocorre na bacia do Rio Doce.

Estudo da termitofauna (Insecta, Isoptera) da região do alto Rio Madeira, Rondônia. Na região conhecida como alto Rio Madeira, no município de Porto Velho, Rondônia, estão sendo criadas as Usinas Hidrelétricas (UHEs) de Santo Antônio e Jirau. As construções das represas das UHEs estão inundando grandes porções de floresta ao longo das duas margens do rio Madeira. Desta forma o conhecimento da biota local, especialmente de sua distribuição no espaço, é extremamente importante, ainda mais porque o alinhamento dos rios Amazonas-Madeira-Mamoré separa a região Neotropical em duas áreas de endemismo para diversos grupos de animais. Essa tese tem por objetivo apresentar os resultados gerais obtidos ao longo de três anos de monitoramento de cupins nas áreas de influência da UHE de Jirau e dois anos nas áreas de influência da UHE de Santo Antônio, assim como desenvolver um estudo de comunidades e análise da distribuição espacial dos cupins presentes nas áreas de influência da UHE de Jirau (Capítulo 1). Outro objetivo é o estudo da estrutura genética das populações de Heterotermes tenuis (Rhinotermitidae) ao longo das áreas de influência das duas UHEs, visando investigar a existência de fluxo gênico entre as populações de cada margem do Rio Madeira (Capítulo 2). Foram amostrados doze módulos, sete na margem esquerda do rio e cinco na margem direita. Cada um era compostos por transectos de 3 ou 4 km e parcelas perpendiculares a cada 1km, e as amostragens foram realizadas em subparcelas de 5x2m dentro das parcelas. Durante um total de 20 campanhas foram investigadas 1121 subparcelas, totalizando 7875 amostras de cupins e pelo menos 169 espécies. Esse é provavelmente o trabalho com maior esforço amostral já empregado e também o que registrou o maior número de espécies de cupins até hoje. Para o estudo de comunidades, foram aleatorizadas 20 subparcelas nos seis módulos da UHE de Jirau, sendo cinco subparcelas dentro das parcelas marcadas nas seguintes distâncias em relação à margem do rio: P1 - 50 m, P2 - 1 km, P3 - 2 km e P4 - 3 km. A composição de cupins não está relacionada com o lado do rio. O estimador que mais se aproximou do provável número real de espécies foi o Jackknife 2. Como resultado das análises de diversidade beta utilizando a composição de espécies de cupins houve um agrupamento dos módulos com o mesmo tipo de solo, sugerindo que algumas espécies de cupins estejam distribuídas de acordo com esta variável. Em relação à distância para o rio, a parcela mais próxima do rio foi a mais singular, tanto em relação à composição de espécies quanto à riqueza e abundância, sendo que existem espécies restritas à P1 e outras praticamente ausentes nessas parcelas. Das dez variáveis ambientais analisadas, a riqueza de cupins se mostrou correlacionada com a altitude, concentração de argila e silte no solo e estratificação vegetal entre 1 e 5 m. Para o estudo da estrutura genética das populações de H. tenuis foram utilizadas 84 sequências dessa espécie dos 12 módulos de monitoramento, seis de colônias do Cerrado e três do GenBank (de Manaus, Guiana Francesa, e Equador), além de uma de H. longiceps como grupo externo. Nas análises iniciais, foi encontrada uma forte estruturação genética entre as sequências: todas as análises filogenéticas (máxima parcimônia, máxima verossimilhança e inferência bayesiana), assim como a rede de haplótipos, formaram dois grupos consistentes, mas sem qualquer relação espacial. A partir disso, passou-se a trabalhar com a hipótese de que há duas espécies crípticas (chamadas Ht. A e Ht. B). Desta forma, todas as análises para testar se o Rio Madeira funcionava como barreira biogeográfica foram testadas separadamente para cada uma das supostas duas espécies crípticas, entretanto, não foi constatada qualquer influência do rio como barreira ao fluxo gênico entre as populações de cada margem. / The Santo Antônio and Jirau hydroelectrics plants (HP) are being built in the Madeira River region, in Porto Velho, RO, Brazil. The HPs will flood large portions of native forest, and thus knowledge of the local biota and its distribution in space is extremely important for the formulation of management plans for creation of protected areas. This region in particular is unique, since the alignment of Amazonas-Madeira-Mamoré Rivers divides the Neotropical region into two areas of endemism for a diversity of taxa. The main objective of this thesis was to monitor termites for three years in areas near the Jirau HP and two years in areas near the Santo Antônio HP. As well as conduct a community level study and analyze the spatial distributions of termites from the areas influenced by Jirau HP (Chapter 1); and investigate the population genetic structure of Heterotermes tenuis (Rhinotermitidae), for the two areas influenced by the HPs, to test whether there is genetic flow between the populations on either bank of the Madeira River (Chapter 2). Twelve modules were marked, seven on the left bank of the river and five on the right bank. Each module was composed of 3 or 4 km transects and perpendicular parcels every 1 km. The sampling was conducted in sub parcels of 5 x 2 m inside each main parcels. During 20 expeditions, 1121 subparcels were investigated and a total of 7875 samples were collected and identified to 169 species. This study incorporates greater sampling effort than already employed by other published studies to date and also registered the highest number of termites species of any similar study. For the community study, 20 subparcels were randomized in the six modules of the Jirau HP, with five subparcels marked in relation to distance from the river margin (P1 - 50 m, P2 - 1 km, P3 - 2 km, and P4 - 3 km). The termite species composition was not related to side of the river bank. The richness estimator Jackknife 2 was the best estimator of the real number of species diversity. The beta diversity analysis with termite species composition clustered for modules with the same soil type, suggesting that some termite species may be distributed according to the soil type. Parcels closest to the river were the most unique, both in terms of termite species composition and abundance patterns, with some species restricted to the P1 and others absent. Of the ten environmental variables measured, termite species richness was correlated with altitude, clay and silt concentration in the soil, and vegetation stratification between 1 and 5 m, among. For the study of the genetic structure of Heterotermes tenuis, 84 sequences of this species were used from the 12 monitoring modules, six from colonies from the Cerrado (Brazilian Savanna), three from GeneBank (from Manaus, French Guiana and Ecuador), and one of H. longiceps as outgroup. In the initial analysis, relatively strong genetic structure within the samples was found: all phylogenetic analysis (maximum parsimony and likelihood, and Bayesian inference), and haplotype networks, consistently clustered two groups of haplotypes, but without any spatial relationships. Thus was assumed that there were two cryptic species (here called Ht. A and Ht. B), and all the analysis to test whether the Madeira River was a biogeographic barrier were conducted separately for each putative species. However, it was not possible to detect any influence of the river to genetic flow between the populations from either side of the river.

Submitted by Marta Toyoda (1144061@mackenzie.br) on 2018-02-07T20:34:11Z No. of bitstreams: 2 ALEXANDRE ALBERTO POLITI.pdf: 6517536 bytes, checksum: fb9ba1ab203e8cab6c749798155d3bea (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Paola Damato (repositorio@mackenzie.br) on 2018-04-28T15:26:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 ALEXANDRE ALBERTO POLITI.pdf: 6517536 bytes, checksum: fb9ba1ab203e8cab6c749798155d3bea (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-28T15:26:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 ALEXANDRE ALBERTO POLITI.pdf: 6517536 bytes, checksum: fb9ba1ab203e8cab6c749798155d3bea (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This dissertation makes use of Biogeography and Biogeographic Computation concepts for the proposal of an adaptive radiation model on adaptive surfaces. The proposed model is based on a computational definition of biological isolation to detect the emergence of a new species and, thus, to promote emergent processes of sympatric speciation and extinction of species from a single ancestral species. Ecosystem patterns were investigated in static and time-varying habitats based on the model. Adaptive surfaces represent ecological habitats and opportunities and, therefore, the temporal variation of habitats is linked to the variation of the surface. In this context we have investigated how adaptive radiation patterns emerge and are favorable to the continued adaptation of species, even in cases where severe environmental changes occur. Adaptive surfaces may also be linked to optimization problems, so the results allow a discussion of how ecosystem patterns can be conducive to optimization in dynamic environments where decision surfaces vary in time. / Essa dissertação faz uso de conceitos da Biogeografia e Computação Biogeográfica para a proposta de um modelo de radiação adaptativa em superfícies de adaptação. O modelo pro-posto valeu-se de uma definição computacional de isolamento biológico para detecção do surgimento de uma nova espécie e, dessa forma, promover processos emergentes de especiação simpátrica e extinção de espécies a partir de uma única espécie ancestral. Por meio do modelo foram investigados padrões de ecossistemas em habitats estáticos e variantes no tempo. Superfícies de adaptação representam habitats e oportunidades ecológicas e, portanto, a variação temporal de habitats está vinculada à variação da superfície. Neste contexto foram investigados como padrões de radiação adaptativa emergem e são favoráveis à adaptação continuada de espécies, mesmo em casos em que ocorrem mudanças ambientais severas. Superfícies de adaptação também podem estar vinculadas a problemas de otimização, sendo assim os resultados permitem uma discussão de como padrões de ecossistemas podem ser favoráveis à otimização em ambientes dinâmicos onde superfícies de decisão são variantes no tempo.