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Caracterização do secretoma de Aspergillus niger crescido em bagaço de cana e purificação de xilanases de interesse biotecnológico

Martins, Pedro Alves 30 March 2012 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-09-24T12:59:02Z No. of bitstreams: 1 2012_PedroAlvesMartins.pdf: 2817452 bytes, checksum: e51e7a47a4726d306b0c4fcecf8ab2e2 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2012-10-02T12:06:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_PedroAlvesMartins.pdf: 2817452 bytes, checksum: e51e7a47a4726d306b0c4fcecf8ab2e2 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-02T12:06:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_PedroAlvesMartins.pdf: 2817452 bytes, checksum: e51e7a47a4726d306b0c4fcecf8ab2e2 (MD5) / Os fungos filamentosos quando submetidos ao crescimento em meios contendo material lignocelulósico, são capazes de produzir diferentes tipos de enzimas extracelulares responsáveis por catalisar a hidrólise de celulose, hemicelulose e outros polissacarídeos encontrados nas paredes celulares vegetais. Algumas dessas enzimas podem ser aplicadas comercialmente em processos industriais, como nas indústrias alimentícia, têxtil, papeleira e também na produção de bioetanol. O fungo filamentoso mesofílico e de distribuição cosmopolita Aspergillus niger é saprófita e apresenta potencial biotecnológico como produtor de enzimas hidrolíticas O presente trabalho tem como objetivo a purificação de xilanases de A. niger bem como a análise do seu secretoma (conjunto de proteínas secretadas) após seis dias de crescimento em meio sintético suplementado com 1% de bagaço de cana como única fonte de carbono. Uma fração xilanolítica (Xyl) previamente purificada por cromatografia de exclusão molecular revelou ser composta por polipeptídeos distintos apresentando diferentes pIs como demonstrado por eletroforese bidimensional (2-DE). A fim de aperfeiçoar a purificação de Xyl e separar possíveis isoformas, Xyl foi submetido às cromatografias de troca aniônica (CTA) em pH 8,5 e de troca catiônica (CTC) em pH 5,0. A CTA separou uma fração contendo apenas dois polipeptídeos como demonstrado por 2-DE. Um spot foi identificado como sendo uma endo-1,4-β-xilanase e o outro não pôde ser identificado. A xilanase presente na fração purificada exibiu um Km de 6.46 mg/ml e uma Vmax de 1.984 UI.mL-1 para xilana solúvel. A fim de ser submetido à análise proteômica,o secretoma foi primeiramente submetido à digestão tríptica tanto em solução quanto após separação eletroforética em gel de poliacrilamida. Os peptídeos resultantes foram analisados por LC-MS/MS-Orbitrap em modo Data Dependent Acquisition. A abordagem de digestão em gel propiciou a identificação de 55 proteínas comparada à identificação de apenas 14 proteínas utilizando a digestão em solução. A maioria das proteínas identificadas pertence à classe das hidrolases, sendo as xilanases as mais abundantes. Estes resultados correspondem aos ensaios enzimáticos realizados e à composição esperada do secretoma: um arsenal de enzimas capazes de promover a hidrólise do substrato e prover meios para o desenvolvimento e crescimento do fungo. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / When submitted to growth in media containing lignocellulosic materials, filamentous fungi are able to produce different kinds of extracellular enzymes, which are responsible to catalyze the hydrolysis of cellulose, hemicellulose and other polysaccharides found on plant cell wall. Some of these enzymes can be commercially applied to industrial processes, such as the ones used on food, paper and textile industry as well as on the production of bioethanol. Aspergillus niger, a mesophilic and saprophytic filamentous fungus, possesses biotechnological potential as a producer of hydrolytic enzymes. The present work aims at purifying xylanases from A. niger and analyzing its secretome (group of secreted proteins) after six days of growth on synthetic medium supplemented with 1% sugarcane bagasse as the only carbon source. A xylanolytic fraction (Xyl) previously purified by molecular exclusion chromatography was shown to be composed of different polypeptides bearing different pIs as demonstrated by two-dimensional electrophoresis (2-DE). In order to improve Xyl purification and to separate possible xylanase isoforms, Xyl was submitted to both Anion Exchange Chromatography (AEC) at pH 8.5 and Cation Exchange chromatography (CEC) at pH 5.0. The AEC approach could successfully isolate a fraction containing two different polypeptides as demonstrated by 2-DE. One spot was identified as an endo-1,4-β-xylanase and the other couldn’t be identified. This xylanase in the purified fraction exhibited a Km of 6.46 mg/ml and a Vmax of 1.984 IU.mL-1 for soluble xylan. For proteomic analysis, the secretome was firstly submitted to In-solution trypsin digestion or alternatively to SDS-PAGE followed by trypsin digestion of gel slices. Resulting peptides were then analyzed by LC-MS/MS-Orbitrap using Data Dependent Acquisition mode. Overall, the In-gel digested samples provided identification of 55 proteins comparing to only 14 identified proteins in In-solution digested samples. Most proteins identified in A. niger secretome belonged to the hydrolase class, being xylanases the most abundant ones. These findings correspond to experimental enzymatic assays and the expected secretome composition: an arsenal of enzymes capable of hydrolyzing the substrate and providing ways for the fungi growth and development.
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Novos arranjos territoriais : a expansão da cultura da cana-de açúcar na região do Triângulo Mineiro – MG

Michelotto, Bruno Del Grossi 03 1900 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Centro de Desenvolvimento Sustentável, 2009. / Submitted by Raquel Viana (tempestade_b@hotmail.com) on 2009-11-09T17:49:01Z No. of bitstreams: 1 2008_BrunoDelGrossiMichelotto.pdf: 3210621 bytes, checksum: cbf3eeb328e60e4f9122e49615a09f45 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2009-11-10T14:39:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_BrunoDelGrossiMichelotto.pdf: 3210621 bytes, checksum: cbf3eeb328e60e4f9122e49615a09f45 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-11-10T14:39:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_BrunoDelGrossiMichelotto.pdf: 3210621 bytes, checksum: cbf3eeb328e60e4f9122e49615a09f45 (MD5) Previous issue date: 2008-03 / A expansão das lavouras de cana-de-açúcar na região do Triângulo Mineiro é reflexo do processo de modernização da agricultura que afeta as áreas de cerrado do Brasil central. Caracteriza-se pela incorporação de novos objetos produtivos e de lógicas operacionais que passam a definir as novas formas de apropriação da natureza e da produção do espaço geográfico associado à essa cadeia produtiva. Defini-se também pelas interações escalares que projetam a região às escalas mais amplas da globalização, transformando o papel das localidades na racionalidade da rede urbana do período atual. O objetivo principal desta pesquisa é identificar e compreender as mudanças que a expansão da cultura da cana-deaçúcar produz no território. Pretende dessa forma, identificar e compreender as transformações provocadas pela expansão desta atividade produtiva nos subsistemas que compõem o arranjo territorial do Triângulo Mineiro, particularmente os subsistemas políticoinstitucional, econômico, social e ambiental. Partindo desses objetivos, levantamos a hipótese de que esta expansão estaria provocando alterações consideráveis no arranjo territorial regional, justamente nestes subsistemas citados acima. Para o reconhecimento destas transformações foram analisadas as políticas públicas setoriais, nas escalas federal, estadual e municipal; evolução do Produto Interno Bruto e a distribuição do Valor Adicionado Corrente para cada setor da economia municipal; a evolução do Índice de Desenvolvimento Humano Municipal e os possíveis impactos ambientais positivos e negativos derivados desta atividade produtiva. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The expansion of the sugar cane crops in the Triangulo Mineiro region is result of the process of modernization of the agriculture that affects the areas of cerrado located at the central portion of Brazil. It is characterized for the incorporation of new productive objects and operational logics that start to define the new forms of nature appropriation and the production of the geographic space associate to this productive chain. It is also defined for the scale interactions that project the region to the amplest scales of globalization, transforming the role of the localities into the rationality of the urban net of the current period. The main objective of this research is to identify and to understand the changes that the expansion of the sugar cane culture produces in the territory. It intends therefore, to identify and to understand the transformations provoked by the expansion of this productive activity in the subsystems that compose the territorial arrangement of the Triangulo Mineiro, particularly the politicianinstitucional, economic, social and environmental subsystems.Throughout this objetives, the hypothesis raised is that this expansion would be provoking considerable alterations in the regional territorial arrangement, mainly in these subsystems listed above. For the recognition of these transformations the sectorial public politics had been analyzed, in the federal, state and municipal scales; evolution of the Gross Domestic Product and the distribution of the Added Value Index for each sector of the municipal economy; the evolution of the Human Development Index and the possible positive and negative environmental impacts derived from this productive activity.
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Agroindústria canavieira : uma análise sobre o uso da água na produção sucroalcooleira

Pereira, Bruno Alves January 2009 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Centro de Desenvolvimento Sustentável, 2009. / Submitted by Allan Wanick Motta (allan_wanick@hotmail.com) on 2010-03-02T16:55:43Z No. of bitstreams: 1 2009_BrunoAlvesPereira.pdf: 2281299 bytes, checksum: 3931b4676cb9596551e5f92c1c99f660 (MD5) / Rejected by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br), reason: Falta abstract. on 2010-04-13T20:53:42Z (GMT) / Submitted by Allan Wanick Motta (allan_wanick@hotmail.com) on 2010-04-22T12:39:48Z No. of bitstreams: 1 2009_BrunoAlvesPereira.pdf: 2281299 bytes, checksum: 3931b4676cb9596551e5f92c1c99f660 (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-05-11T00:47:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_BrunoAlvesPereira.pdf: 2281299 bytes, checksum: 3931b4676cb9596551e5f92c1c99f660 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-11T00:47:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_BrunoAlvesPereira.pdf: 2281299 bytes, checksum: 3931b4676cb9596551e5f92c1c99f660 (MD5) Previous issue date: 2009 / A relação entre água e cana-de-açúcar é um assunto bastante comentado, mas sobre o qual existem poucos ensaios teóricos. Para tentar contribuir com a reduzida literatura existente, este trabalho apresenta uma série de quatro estudos em forma de artigos. O primeiro é uma pesquisa sobre o início da atividade canavieira no Brasil e sua dependência em relação aos recursos hídricos, pois, sem água, a planta não poderia viver, nem as engrenagens dos engenhos reais, primeiras unidades de fabricação de açúcar no País, movidas à força hidráulica, poderiam funcionar. O segundo relata os efeitos das mudanças no sistema de produção industrial de derivados da cana-de-açúcar às margens dos rios onde foram instaladas as primeiras usinas, que acompanharam as tendências da Revolução Industrial. O terceiro analisa as transformações técnicas ocorridas na parte agrícola da agroindústria canavieira, em decorrência do processo de industrialização da agricultura, e seus impactos sobre os corpos de água. O quarto discute os problemas relacionados à disponibilidade hídrica e ao uso da água pela agroindústria canavieira em São Paulo, atualmente o maior Estado produtor de cana-de-açúcar e derivados do País. O objetivo do trabalho é estudar a maneira como os recursos hídricos vêm sendo usados pela agroindústria canavieira ao longo dos anos e avaliar a qualidade da relação entre a água e a cana-de-açúcar. A conclusão do estudo indica que a água vem sendo utilizada de maneira descuidada pelo setor, sendo consumida em excesso nas etapas dos processos industriais e contaminada por fontes pontuais de lançamento de efluentes e não pontuais de insumos agrícolas. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The relation between water and sugarcane is a topic that has been greatly discussed, but on which there are few theoretical writings. To try to help with the small existing literature, this work presents a series of four studies. The first study researches the beginnings of the activity of sugarcane in Brazil and its dependence on water resources, for, without water, the plant could not live, neither the wheels of the royal mills, the first units of sugar production in the country, moved byhydraulic power, could work. The second study describes the effects of changes in the industrial production system of sugarcane by-products on the banks of the rivers where the first plants were installed, which followed the trends of the Industrial Revolution. The third study examines the technical changes that took place in the agricultural techniques of the sugarcane agribusiness as a result of the industrialization of agriculture, and its impacts on the bodies of water. The fourth study discusses the problems related to water availability and water use by the sugarcane agribusiness in São Paulo, currently the largest State producer of sugarcane and its by-products in Brazil. The objective of the work is to study the way in which water resources are being used by the sugarcane agribusiness over the years and to evaluate the quality of the relationship between water and sugarcane. The conclusion of the study indicates that water is being used carelesly by the sector, being consumed excessively in the stages of industrial processes and contaminated by effluents and agricultural waste.
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Impacto de sistemas de cultivo orgânico e convencional da cana-de-açucar nos atributos do solo / Iimpact of organic and conventional sugar cane cultivation system on soil attributes

Barbosa, Lurdineide de Araújo 26 February 2010 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2010. / Submitted by Washington da Silva Chagas (washington@bce.unb.br) on 2011-03-28T20:26:18Z No. of bitstreams: 1 2010_LurdineidedeAraujoBarbosa.pdf: 8843448 bytes, checksum: ff47f8ab1be29e15610e84aa3e82a2e8 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2011-04-01T15:51:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_LurdineidedeAraujoBarbosa.pdf: 8843448 bytes, checksum: ff47f8ab1be29e15610e84aa3e82a2e8 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-04-01T15:51:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_LurdineidedeAraujoBarbosa.pdf: 8843448 bytes, checksum: ff47f8ab1be29e15610e84aa3e82a2e8 (MD5) / O objetivo deste trabalho foi estudar os efeitos dos sistemas de cultivo orgânico e convencional da cana-de-açúcar, com e sem queima, em alguns atributos do solo. Foram avaliados os atributos físicos, químicos e bioquímicos do solo: carbono orgânico e nitrogênio total (CO e NT, respectivamente); estoque de carbono orgânico e N total; densidade do solo; porosidade total; carbono e nitrogênio da biomassa microbiana do solo (CBMS e NBMS, respectivamente) e a respiração basal, como medida da atividade microbiana. Utilizaram-se cinco sistemas de uso do solo: três áreas cultivadas com cana-de-açúcar e, duas que serviram como referência: uma área sob Cerrado nativo e outra sob pastagem. Os sistemas estudados foram: sistema de cultivo orgânico da cana-de-açúcar (CO); sistema de cultivo convencional sem queima da palhada antes da colheita (CC); sistema de cultivo convencional com queima da palhada antes da colheita (CQ); sistema pastagem (PT) e sistema Cerrado nativo (CE). Foi feito um estudo observacional, onde as variáveis bioquímicas foram coletadas em dois tempos (época seca e chuvosa) e duas camadas de solo (0-10 e 10-20 cm). As variáveis físicas e químicas foram feitas em agosto de 2008 e agosto de 2009, nas camadas do solo de 0-10; 10-20; 20-30; 30-40; 40-50 e 50-60 cm. As amostras de solo foram coletadas após o 4º e 5º corte do canavial. Houve alterações nos atributos do solo no sistema de cultivo orgânico em relação aos sistemas de cultivo convencional. Nos atributos físicos e químicos, em geral, os maiores estoques de C orgânico e N total, assim como as menores densidades do solo e porosidade total foram observadas no sistema de cultivo orgânico, em relação aos sistemas de cultivo convencional. Nos atributos bioquímicos o CBMS e o NBMS foram maiores no sistema de cultivo orgânico da cana-de-açúcar do que no sistema de cultivo convencional. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The aim of this work was to study the effects of organic and conventional sugar cane cultivation system, with and without burn, on some soil attributes. Physical, chemical and biochemical soil attributes were evaluated, such as: total organic carbon and nitrogen (TOC and TN, respectively), carbon and nitrogen storage, bulk density, total porosity, carbon and nitrogen microbial biomass carbon and nitrogen (MBC and MBN. respectively) and basal respiration, for measuring microbial activity. Five soil use systems were utilized: three areas cultivated with sugar cane and two were utilized as reference areas: one with native Cerrado area and the other with pasture. The studied systems were: sugar cane organic system; sugar cane conventional system without burnt; sugar cane conventional system with burnt; pasture and native Cerrado area. An observational study were made, where biochemical variables were collected at two periods (dry and rain season) and two soil layers (0-10 and 10-20 cm). Physical and chemical variables were collected at August/2008 and August/2009) at the following soil layers: 0-10, 10-20, 20-30, 30-40, 40-50 e 50-60. Soil samples The samples were collected after 4º and 5º sugar cane harvest. There were soil attributes alterations on organic sugar cane system compared to conventional sugar cane cultivation systems. On physical and chemical attributes, in general, higher values of carbon and nitrogen storage and lower bulk soil and total porosity were observed on organic sugar cane systems in relation to conventional systems. The biochemical attributes MBC and MBN showed higher values compared to conventional sugar cane cultivation systems.
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Estudo da fração aquosa proveniente da pirólise da palha de cana de açúcar

Maciel, Gabriela Pereira da Silva January 2011 (has links)
A palha de cana resultante da colheita da cana-de-açúcar, usada na produção de etanol no Brasil, pode ser utilizada como fonte de biomassa. Uma das maneiras de utilização deste e de outros resíduos agro-industriais é a sua transformação por pirólise. Durante este processo, gera-se uma fração aquosa que é oriunda da umidade inicial da matéria prima e de reações que ocorrem durante a pirólise, e contém na sua composição uma variedade de compostos oxigenados de alto valor. O desenvolvimento de métodos de extração do material orgânico presente nesta fração aquosa assume um importante papel na caracterização e aproveitamento deste material. No presente trabalho foram aplicadas a extração em fase sólida (SPE) com cartucho comercial C18 e a extração líquido-líquido (LLE), para o isolamento dos analitos presentes na fração aquosa da pirólise da palha de cana, usando três solventes de diferentes polaridades (hexano, diclorometano e clorofórmio). A caracterização dos extratos orgânicos obtidos foi realizada por GC/qMS e GC×GC/TOFMS. Os dois métodos de extração mostraram-se satisfatórios e os solventes usados foram complementares. Os extratos apresentaram em sua composição compostos oxigenados tais como fenóis, ácidos, cetonas, aldeídos e éteres, com sensível predomínio dos fenóis. A técnica de GC×GC/TOFMS apresentou maior sensibilidade e permitiu a identificação de um maior número de compostos. / The sugar cane straw, resulting from the harvesting of sugar cane, used in ethanol production in Brazil, can be used as a source of biomass. Pyrolysis is one of the way to transform and aggregate value to this and other agro-industrial wastes. During this process, it is generated an aqueous fraction originated from the initial moisture of raw material, which contains a variety of oxygenated compounds of high industrial importance. The application of techniques for extraction of organic material from this aqueous fraction plays an important role in the characterization and use of this material. In the present study solid phase extraction (SPE), using C18 commercial cartridges, and liquid-liquid extraction (LLE) was applied the for the isolation of the analytes present in the aqueous fraction of pyrolysis of sugarcane straw, using three solvents of different polarities (hexane, dichloromethane and chloroform). Characterization of organic extracts was performed by GC/qMS and GC×GC/TOFMS. Both extraction methods were satisfactory and the solvents used were complementary. The extracts showed several oxygenated compounds in their composition, such as phenols, acids, ketones, aldehydes and ethers, with significant predominance of phenols. The technique of GC×GC/TOFMS showed higher sensitivity and allowed the identification of a greater number of compounds.
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Estudo comparativo da reação inflamatória e da deposição de fibras colágenas induzidas por biopolímero da cana-de-açucar e polipropileno

Silveira, Arlon Breno Figueiredo Nunes da 28 February 2014 (has links)
Submitted by Ramon Santana (ramon.souza@ufpe.br) on 2015-03-11T17:35:58Z No. of bitstreams: 2 TESE Arlon Breno Figueiredo Neves da Silveira.pdf: 1511288 bytes, checksum: 8a7a1a4aad8da5a7513f9f8f64fa685d (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T17:35:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE Arlon Breno Figueiredo Neves da Silveira.pdf: 1511288 bytes, checksum: 8a7a1a4aad8da5a7513f9f8f64fa685d (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / Introdução: O Sling é considerado padrão ouro para o tratamento da Incontinência Urinária de Esforço. Essa técnica cirúrgica utiliza um material sintético no espaço suburetral para prover um arcabouço de fibrose e corrigir a perda urinária. A partir do melaço da cana-de-açúcar, por síntese da bactéria Zoogloea sp., obtivemos o biopolímero da cana-de-açúcar que pode ser processado em forma de membrana. Nosso objetivo é avaliar a ação do biopolímero da cana-de-açúcar comparando-o com o polipropileno, no tocante, a reação inflamatória e indução da formação de fibras colágenas. Material e Métodos: Trata-se de um estudo experimental, prospectivo, controlado, tipo ensaio clínico. Utilizamos 30 ratos Wistar, divididos em dois grupos de 15 animais, que tiveram uma tela de polipropileno e outra membrana de biopolímero da cana-de-açúcar implantadas no subcutâneo da parede abdominal. Os animais sacrificados após sete e 120 dias do procedimento. Analisamos e comparamos a reação inflamatória e a deposição de fibras colágenas induzidas pelos materiais utilizados. Todas as conclusões foram tomadas ao nível de significância de 5%. Resultados: A reação inflamatória aguda e linfoplasmocitária foram maiores, nos primeiros sete dias, induzidas pelo biopolímero. Sendo essas respostas semelhantes entre os materiais após 120 dias. A deposição de fibras colágenas foi significativamente maior quando induzida pelo biopolímero, tanto após sete dias, quanto após 120 dias. Não foi demonstrada rejeição, infecção, necrose em nenhum dos animais do estudo. Conclusão: O biopolímero no subcutâneo dos ratos, em nosso experimento, estimulou uma resposta inflamatória e um acúmulo de fibras colágenas maiores que o polipropileno.
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Produção de astaxatina por Mucor circinelloides utilizando melaço de cana-de-açúcar como substrato alternativo sob a influência de luz azul

ANJOS, Mayara Nunes Vitor 28 February 2013 (has links)
Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-03-17T11:58:46Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Mayara Nunes Anjos.pdf: 706530 bytes, checksum: fd790fb778cff175e2c741fe323d8c38 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-17T11:58:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Mayara Nunes Anjos.pdf: 706530 bytes, checksum: fd790fb778cff175e2c741fe323d8c38 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 / CNPq / Os carotenóides são substâncias naturais que podem ser sintetizados por plantas e microorganismos. Recentemente houve um aumento do interesse da produção de corantes naturais por processos biotecnológicos de fontes biológicas devido à preocupação com o uso de aditivos químicos nos alimentos. A astaxantina é um dos principais carotenóides amplamente utilizado na indústria e na aquicultura, além disso, possui um importante papel na diminuição do risco de várias doenças degenerativas devido ao seu alto poder antioxidante. Neste trabalho foi estudada a produção de astaxantina por Mucor circinelloides utilizando o meio definido Hesseltine e Anderson e o resíduo agroindustrial melaço de cana-de-açúcar, nas concentrações de 4%, 7% e 10% na presença e ausência de LED´s azul. O inóculo foi obtido a partir do M. circinelloides após 5 dias de crescimento no meio BDA (Batata-Dextrose-Ágar), a 28ºC, 96 horas, 120 rpm. Após a seleção da melhor concentração os frascos contendo melaço de cana-de-açúcar foram incubados em shaker orbital sob diferentes temperaturas (25, 30 e 35ºC), pH (6,0, 7,0 e 8,0) e agitação (120, 135 e 150 rpm) por 96h sob iluminação com LED´S de cor azul e no escuro, segundo um planejamento fatorial 23 com quatro repetições no ponto central. Após o processo fermentativo, a astaxantina foi extraída da biomassa, utilizando uma solução de dimetilsulfóxido/acetona. Em seguida foi pré-purificada em éter de petróleo e analisada por espectrofotometria UV-visível (474 nm). A partir do ponto maximizado do planejamento fatorial foi realizada a determinação do peso seco, pH, proteínas totais, assim como teste de toxicidade e de atividade antioxidante da astaxantina obtida. A produção de astaxantina utilizando o meio Hesseltine e Anderson apresentou rendimento de 142,0 μg/g sem influência de LED´s azul e 340,1 μg/g quando se utilizou LED´s azul, com um aumento da produção de aproximadamente 42%. A melhor condição para a produção de astaxantina com melaço de cana-de-açúcar deu-se na concentração de 4% na ausência (32,7 μg/g) e presença de LED´s azul (134,4 μg/g) durante 96h, 120 rpm a 25°C. De acordo com o planejamento fatorial 23 o ponto máximo de produção foi obtido a 30°C, pH 7,5 e 100 rpm com cerca de 469,0 μg/g na ausência de LED´s azul e 667,6 μg/g na presença de LED´s azul, aumentando em aproximadamente 89% a produção. A astaxantina obtida por M. circinelloides apresentou baixa toxicidade frente à Artemia salina na concentração de 25% e potencial de inibição dos radicais livres de cerca de 92% nos índices testados. O resíduo agroindustrial melaço de cana-de-açúcar possui potencial para a produção de astaxantina por M. circinelloides principalmente na concentração de 4%. Os resultados apresentados demonstram que a utilização de LED´S azul pode aumentar significativamente o teor de astaxantina produzida pelo M. circinelloides.
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Análise in silico da Expressão Diferencial de Transcritos SuperSAGE de Proteínas Quinases em Cana-de-Açúcar em Resposta ao Déficit Hídrico

Correia, Carolina Neves 31 January 2013 (has links)
Submitted by Andre Moraes Queiroz (andre.moraesqueiroz@ufpe.br) on 2015-04-14T14:30:37Z No. of bitstreams: 2 Dissertaçao Carolina Neves Correia.pdf: 5310409 bytes, checksum: 06fd884bd1cc5beab0d792b693d0b03f (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-14T14:30:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertaçao Carolina Neves Correia.pdf: 5310409 bytes, checksum: 06fd884bd1cc5beab0d792b693d0b03f (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / FINEP / Estudos de expressão gênica diferencial associados a perfis metabólicos de plantas submetidas a um estresse alvo são abordagens valiosas na compreensão da tolerância vegetal. Por sua vez, proteínas quinases são importantes componentes da sinalização celular, catalisando a transferência do grupo fosfato de uma molécula de ATP para um substrato, em processo chamado fosforilação, com participação ativa na aclimatação às mudanças ambientais. O presente trabalho teve como objetivo comparar in silico perfis de transcrição, de unitags SuperSAGE diferencialmente expressas e anotadas como prováveis quinases, de genótipos de cana-de-açúcar tolerantes e sensíveis ao déficit hídrico (24 h de supressão de rega). Para tanto, sequências expressas (EST) de gramíneas, de diversos bancos de dados públicos, similares às unitags (análises BLASTn), foram caracterizadas em termos de Ontologia Gênica, que conjuntamente com as anotações das EST permitiram identificar e classificar as quinases em famílias. Através dos respectivos números de Classificação Enzimática (EC), mapas metabólicos foram gerados, permitindo comparar os grupos de genótipos contrastantes (tolerantes e sensíveis ao estresse). Foram observadas 539 prováveis quinases, que distribuídas em 41 famílias e em 18 vias metabólicas, quando associadas às unitags, permitiram discuti-las com base em oito classes hierárquicas funcionais. Importantes diferenças na expressão desses transcritos mapeados como quinases, entre os grupos de genótipos tolerantes e sensíveis, após 24 h de supressão de rega, foram observadas neste trabalho, contribuindo para um melhor entendimento da percepção do estresse aplicado, podendo ser útil ao melhoramento genético da cana-de-açúcar.
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Análise in Silico de Subfamílias de Aquaporinas em Cana-de-açúcar (Saccharum spp.) sob Condições de Déficit Hídrico via Tecnologia SuperSAGE

Silva, Manassés Daniel da 31 January 2013 (has links)
Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-04-15T13:19:44Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao Manasses_vFinal_posBanca.pdf: 1881133 bytes, checksum: af2bbe291155bec9db92c52ab52f2f43 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-15T13:19:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao Manasses_vFinal_posBanca.pdf: 1881133 bytes, checksum: af2bbe291155bec9db92c52ab52f2f43 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / CNPq; FINEP; CAPES / O presente trabalho, pioneiro em abordar especificamente o tema aquaporinas em transcriptomas de cana-de-açúcar, permitiu detectar representantes das quatro subfamílias de aquaporinas descritas em vegetais superiores (PIP, TIP, SIP e NIP), apresentando 43 isoformas distintas, oriundas de quatro bibliotecas SuperSAGE de raízes de genótipos tolerantes e sensíveis à seca. As subfamílias de aquaporinas com maiores níveis de transcritos em cana-de-açúcar foram PIP e TIP. Já as subfamílias SIP e NIP, além de menos abundantes, foram também menos responsivas ao estresse de supressão de rega (24 h). Ao menos 10 potenciais alvos distintos de isoformas de aquaporinas e suas respectivas unitags foram considerados promissores para estudos futuros, com potencial para desenvolvimento de marcadores moleculares para uso no melhoramento genético. Desses, quatro mostraram respostas exclusivas e diferencialmente significativas e divergentes entre os bulks de genótipos tolerantes e sensíveis quando comparado nas condições de estresse e controle. Tomando por base a expressão dessas isoformas nos genótipos tolerantes, a maioria foi reprimida sob estresse (SoPIP2-4, SoPIP2-6, OsPIP2-4), com exceção da SsPIP1-1 (induzida). Foi também proposto um protocolo para validar a expressão das unitags via RTqPCR, bem como pares de primers (5) funcionais como genes de referência, além de dois outros propostos para aquaporinas, tendo-se validado os dados de SuperSAGE para os alvos SsPIP1-1 e SoPIP1-3/PIP1-4, com genótipos pertencentes aos bulks tolerante ou sensível ao estresse.
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Avaliação e disponibilidade de enxofre em solos cultivados com cana-de-açúcar em Pernambuco. / Sulfur evaluation and availability in soils cultivated with sugarcane in Pernambuco.

FERNANDES, Michelangelo Bezerra 15 June 2007 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-11T12:05:56Z No. of bitstreams: 1 Michelangelo Bezerra Fernandes.pdf: 293138 bytes, checksum: 593ab060571c263ba78d5d64c9a4ad85 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-11T12:05:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Michelangelo Bezerra Fernandes.pdf: 293138 bytes, checksum: 593ab060571c263ba78d5d64c9a4ad85 (MD5) Previous issue date: 2007-06-15 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Burning sugarcane for harvesting causes expressive volatization of the sulfur in the plant material, worsening possible nutrient deficiencies over the short and medium time-scales. This research aimed to generate data for using mineral gypsum from Araripe-PE region as a sulfur source for sugarcane. Five field experiments were installed in soils of different textural classes. In all experiments, the experimental design employed was randomized blocks. In each experiment the treatments were formed by combining five mineral gypsum levels and three chemical extractors, with three replicates. The treatments were evaluated at two soil sampling times, and two different depths. Sulfur doses were defined by liming requirement, calculated by the exchangeable aluminum neutralization and or calcium exchangeable content method, for the 0.4-0.6 soil depth layer. Soil sulfur contents were determined by three extractors. Ammonium acetate in acetic acid extracted the most sulfur in clayey soils, with low P-rem values and higher organic matter contents, while calcium chloride presented the lowest sulfur extraction power, under the same conditions. Calcium phosphate, with phosphorus and in the presence of acetic acid, extracted sulfur efficiently, independently of soil chemical and physical characteristics. The values ofthe critical levels varied among soils. In the soil S1 ST varied from 9,64 to 122,98 mg dm-3, in the soil S2 CC varied from 12,71 to 153,43 mg dm-3, in the soil S3 PE varied from 1,47 to 41,03 mg dm-3, in the soil S4 TR varied from 6,70 to 190,8 mg dm-3 and in the soil S5 SA varied from 28,46 to 162,46 mg dm-3; and were higher in clayey soils, with low P-rem values and higher organic matter contents. Trapiche´s critical sulfur leaf content was 0.29 dag.kg-1. Sulfur extracted by the chemical extractors correlated with leaf sulfur content and accumulation, with the highestcorrelation coefficient being for calcium chloride, in surface and subsurface. / A queima da cana-de-açúcar por ocasião da colheita causa uma expressiva volatilização do enxofre contido no material vegetal, agravando possíveis deficiências deste nutriente a curto e médio prazo. O objetivo desta pesquisa foi gerar informações com o gesso mineral da região do Araripe-PE como fonte de enxofre para a cana-de-açúcar. Foram instalados cinco ensaios de campo em solos de diferentes classes texturais. Em todos os ensaios o delineamento experimental empregado foi o de blocos ao acaso. Os tratamentos em cada ensaio constituíramse da combinação de cinco doses de gesso mineral e três extratores químicos, com três repetições. Avaliaram-se os tratamentos em dois tempos de coleta de solo e duas profundidades de amostragem. As doses de enxofre foram definidas pela necessidade de calagem, calculada pelo método da neutralização do alumínio trocável e ou elevação dos teores trocáveis de cálcio para a camada 0,4-0,6 m deprofundidade. Os teores de enxofre no solo foram determinados usando três extratores. Com os resultados de produção da cana-de-açúcar, teores de enxofre na planta e no solo, foram determinados os níveis críticos de enxofre no solo e nas plantas. O extrator acetato de amônio em ácido acético extraiu mais enxofre em solos argilosos, de baixos valores de P-rem e com maiores teores de matéria orgânica, enquanto o extrator cloreto de cálcio apresentou menor poder de extração de enxofre, nas mesmas condições. Já o fosfato de cálcio, contendo fósforo e na presença de ácido acético, extraiu enxofre eficientemente, independente de características físicas e químicas dos solos. Os valores dos níveis críticos variaram entre os solos, no solo S1 ST variaram de 9,64 a 122,98 mg dm-3, no solo S2 CC variaram de 12,71 a 153,43 mg dm-3, no solo S3 PE variaram de 1,47 a 41,03 mg dm-3, no solo S4 TR variaram de 6,70 a 190,8 mg dm-3 e no solo S5 SA variaram de 28,46 a 162,46 mg dm-3; e foram crescentes em solos argilosos, de baixos valores de P-rem e com maiores teores de matéria orgânica. O nível crítico foliar de enxofreem Trapiche foi de 0,29 dag kg-1. As quantidades extraídas de enxofre pelos extratores se correlacionaram com o enxofre absorvido e acumulado nas folhas de cana-de-açúcar, no entanto, o cloreto de cálcio foi quem apresentou melhor coeficiente de correlação, tanto em superfície como em subsuperfície.

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