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Epidemiology and risk factors for candidaemia at Chris Hani Baragwanath hospital (2009-2010)

Seetharam, Sharona January 2017 (has links)
A research report submitted to the Faculty of Health Sciences, University of the Witwatersrand, in fulfillment for the requirements for the degree of Master of Medicine in Microbiology. Johannesburg, 2017 / Background Invasive Candida infections (ICI) have emerged as an important cause of increased morbidity and mortality in specific patient populations in recent years. Multiple risk factors coupled with changes in epidemiology have made clinical management of these patients challenging. A laboratory-based surveillance project, Tracking Resistance to Antifungal drugs for Candida species in South Africa (TRAC-SA) was conducted at Chris Hani Baragwanath Hospital (CHBH) from 2009 to 2010 and allowed for collection of laboratory information related to episodes of candidaemia, delineation of the situation at the hospital and distribution of information to relevant stakeholders to help make informed clinical decisions. Objective Determine the clinical epidemiology and risk factors for bloodstream Candida infection at CHBH over an 18-month period Methods A retrospective, cross-sectional analysis was carried out on cases of blood culture-confirmed candidaemia from inpatients from 1 February 2009 until 31 August 2010. These cases were identified from the TRAC-SA database, inpatient files were traced and clinical data recorded on a standard case report form. Additional laboratory data of selected tests done within 72 hours of the initial blood culture were obtained from the National Laboratory Health Service Corporate Data Warehouse (CDW). Results A total of 167 episodes of candidaemia were identified during the study period with an incidence of 2.09 per 1000 admissions. The distribution of episodes occurred among 55 children (33%), 41 adults (25%) and 71 neonates (43%). The overall species distribution was Candida species other than C. albicans (98/167, 58.7%) and C. albicans (69/167, 41.3%). Candida species other than C. albicans comprised mainly of C. parapsilosis (73/167, 43.7%), C. glabrata (10.2 %, 17/167) and other species combined including C. tropicalis and C. krusei (8/167, 4.7%). Factors associated with C. albicans (versus Candida species other than C. albicans) infection included older age, use of 2 or more antibiotics, use of broad spectrum antibiotics specifically meropenem, aminoglycosides, vancomycin, co-trimoxazole and mechanical ventilation (p < 0.001). The overall case-fatality was 59/163 (35.3%). The highest case fatality was noted among adults with C. albicans infection, i.e. 15/22 (68.18%). Significant risk factors associated with in-hospital mortality were use of central lines, urinary catheters, total parenteral nutrition, 2 or more antibiotics, beta lactam - beta lactamase inhibitors, proton pump inhibitors, aminoglycoside and abdominal surgery (p < 0.01). Of the C. parapsilosis isolates tested, 40 (57. 9%) tested non-susceptible to fluconazole. Risk factors associated with fluconazole resistance included neonatal age, involvement of the respiratory system, mechanical ventilation, chemotherapy, use of a prior antifungal agent and use of 2 or broader spectrum antibiotics (p<0.01). Of 71 neonates, 16 (22.5%) received empiric antifungals, in comparison to children (5/55, 9.0%) and adults (4/41, 9.7%) (p = 0.272). Conclusion CHBH had a high incidence of candidaemia with a predominance of Candida species other than C. albicans especially in the neonate age group. Risk stratification of in-patients is of paramount importance in choice of empiric antifungal drug due to the differing azole resistance patterns observed. / MT2017
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Impact of Pharmacists' Intervention on Antifungal Therapy Decisions for Candidemia (Part One)

Chu, Anita, Corrigan, Jennifer January 2010 (has links)
Class of 2012 Abstract / OBJECTIVES: The overall objective of this project is to conduct an evaluation of the impact of pharmacists’ early interventions on clinical outcomes in patients with candidemia infections using a new microbiology assay, peptide nucleic acid fluorescence in situ hybridization (PNA FISH). The primary purpose of part one of the project was to evaluate timing of antifungal therapy decisions for candidemia and patient outcomes prior to implementation of the PNA FISH assay. A second part of this project will evaluate patient outcomes and timing of antifungal therapy decisions after implementation of planned pharmacists' early intervention based on candida species determination by the PNA FISH assay. METHODS: In this part one IRB-­‐approved, retrospective study, all patients with a Candida species isolated from blood at a tertiary medical center during a one-­‐year period were reviewed. Subjects were excluded from analyses if discharged alive prior to the final blood culture report for the index Candida species isolated. The time to proper antifungal therapy in relation to timing of blood culture, detection of candida growth, and determination of candida species were evaluated. The second part of this study is IRB-­‐approved and data collection is currently in progress for a second one-­‐year period after implementation of the PNA FISH assay for Candida species. During the second part of this study, designated pharmacists provided antifungal therapy recommendations based on PNA FISH results to each patient's healthcare team. RESULTS: n part one of this study, a total of 61 patients with candidemia were evaluated. The majority of candida infections were caused by either C. albicans (n=24) or C. glabrata (n=11). Prior to implementation of the PNA FISH assay, the mean time to final identification of C. albicans was 82.4 +/-­‐ 19.2 hours while the mean time for C. glabrata was 143 +/-­‐ 39.2 hours (p < 0.0001). The mean time to detection of candida growth, which is approximately the time PNA FISH assay performed in part two of project, was 31.2 +/-­‐ 19.8 hours. Planned data analysis will include comparison of time to appropriate antifungal therapy and clinical patient outcomes between part one and part two patient populations. CONCLUSIONS: The preliminary results of this part 1 of 2 studies provides the baseline data for comparison of antifungal therapy decisions for candidemia pre-­‐ and post-­‐ implementation of pharmacists' intervention based on PNA FISH results.
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Candidemias Nosocomiales: Patrones de cambio clínico-epidemiológicos, factores pronóstico e influencia del tratamiento antifúngico precoz en su evolución. Estudio 2002-2005

Espinosa Sierra, Cristina 16 July 2008 (has links)
Estudio descriptivo y comparativo de los cambios clínico-epidemiológicos de las Candidemias Nosocomiales en un hospital universitario, análisis de los factores pronóstico asociados a mayor mortalidad y la influencia del tratamiento precoz y adecuado junto con la retirada precoz del catéter en su evolución.Estudio transversal y observacional de pacientes adultos que desarrollaron CN durante su ingreso en el Hospital (enero-2002 a mayo- 2005). Se revisaron las historias clínicas de pacientes con hemocultivos positivos para Candida sp.El análisis comparativo se realizó con un grupo histórico (1993-8).Los resultados se derivan del estudio estadístico clínico-epidemiológico, patrones de cambio, factores pronóstico asociados a mortalidad y protectores de mortalidad.Conclusiones: La mortalidad (50%) no ha variado en los últimos años. C.no albicans predomina sobre C. albicans.Los principales factores pronóstico asociados a mayor mortalidad son: La situación de gravedad crítica inicial, el tratamiento antifúngico tardío y la no retirada precoz del catéter vascular. / Observational study of a group of adult patients with Nosocomial Candidemia (NC) admitted at a university hospital (january 2002 to may 2005). We analised epidemiological, clinical, microbiological and laboratory data and changes respesct to other historical group (1993-1998).Conclusions: Acute severity od illness at onset is associated to mortality in patients with NC whereas early and adequate treatment and early removing of central venous catheter are asociated to cur
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Estudo da incidência de candidemia e diversidade genética de Candida em pessoas internadas em Unidades Hospitalares de Manaus - Amazonas

Corrêa, Marcelo Augusto da Eira 28 February 2014 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-07-31T15:06:37Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-04T15:09:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-04T15:16:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-04T15:16:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Candidemia is a bloodstream infection caused by Candida. Its incidence varies between 1.27 and 3.9 cases per 1000 admissions in Brazil and from 0.29 to 1.95 cases per 1,000 admissions in the world. C. albicans is the main agent with an incidence ranging from 25.9 % to 59 %. This study aimed to determine the incidence of candidemia in 11 Hospital Units Manaus (public and private) and to determine the genetic diversity among isolates of Candida albicans and identify the existence of cryptic species Candida parapsilosis complex. The C. albicans isolates were subjected to molecular typing technique for multilocus sequencing (MLST) and identified as C. parapsilosis, were subjected to PCR/RFLP. Altogether 101 isolates were studied of the genus Candida. The overall incidence was found to be 2.31 cases per 1,000 admissions and 0.61 cases per 1000 patients/day. The genus Candida was the second cause of bloodstream infections in the studied hospitals, representing 8.6 % of all cases. The most prevalent species was Candida albicans representing 35.64 % of the cases followed by Candida tropicalis with 30.69 %. The male (68,24 %) was most affected by these infections than females (31,76 %). The overall mortality rate was 37.21 % and the species with the highest mortality rates Candida tropicalis was 53.85%. 58 different alleles were identified by the technique of MLST and one allele for the gene SYA1 has been set as a new allele. Their combinations represented 25 different genotypes, of which 15 were identified as new genotypes and sent to the curator for analysis. Of the 22 isolates originally described as C. parapsilosis, three were reidentified as C. orthopsilosis and C. metapsilosis. Of the 25 genotypes found for C. albicans was the main STD 90 and this data differ from the data found in Brazil and in the world , pointing DST 69 as the most common . Were identified for the first time in our region , blood stream infections by C. parapsilosis cryptic species complex with three cases of C. orthopsilosis and one case of C. metapsilosis. / Candidemia é a infecção de corrente sanguínea causada por leveduras do gênero Candida. Sua incidência varia entre 1,27 e 3,9 casos por 1000 internações no Brasil e 0,29 a 1,95 casos por 1000 internações no mundo. C. albicans é o principal agente etiológico com uma incidência que varia entre 25,9% a 59%. Este trabalho teve como objetivo verificar a incidência de candidemia em 11 Unidades Hospitalares de Manaus (públicas e privadas), bem como determinar a diversidade genética entre os isolados de Candida albicans e identificar a existência de espécies crípticas do complexo Candida parapsilosis. Os isolados de Candida albicans foram submetidos à técnica de tipagem molecular por sequenciamento de multilocus (MLST) e os identificados como C. parapsilosis, foram submetidos à PCR/RFLP. Ao todo foram estudados 101 isolados do gênero Candida. A incidência geral encontrada foi de 2,31 casos por 1000 internações e 0,61 casos por 1000 pacientes/dia. O gênero Candida foi o segundo causador das infecções de corrente sanguínea nas unidades hospitalares estudadas, representando 8,6% de todos os casos. A espécie mais prevalente foi Candida albicans representando 35,64% dos casos seguida por Candida tropicalis com 30,69%. O gênero masculino (68,24%) foi mais acometido por essas infecções do que o gênero feminino (31,76%). A taxa de mortalidade geral foi de 37,21% e a espécie que apresentou maiores taxas de mortalidade foi Candida tropicalis com 53,85%. Foram identificados 59 alelos diferentes pela técnica de MLST sendo que um alelo para o gene SYA1 foi configurado como novo alelo. Suas combinações representaram 25 genótipos diferentes, sendo que 15 foram identificados como novos genótipos. Dos 22 isolados inicialmente descritos como C. parapsilosis, três foram reidentificados como C. orthopsilosis e uma como C. metapsilosis. Dos 25 genótipos encontrados para C. albicans o principal foi o DST 90 e esse dado diverge dos dados encontrados no Brasil e no mundo, que apontam o DST 69 como o mais comum. Foram identificadas pela primeira vez em nossa região, infecções de corrente sanguíneas por espécies crípticas do complexo C. parapsilosis, com três casos de C. orthopsilosis e um caso de C. metapsilosis.
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Appropriateness of Antimicrobial Therapy for Bloodstream Infection based on Reporting Conditions with a Rapid Species Identification Assay

Huh, Youchin, Wang, Tina January 2012 (has links)
Class of 2012 / Specific Aims: The primary aim of this study was to determine the time to appropriate therapy for all patients with candidemia and/or bacteriemia (due to either Enterococcus or Streptococcus species) during a one year period in relation to time of blood culture, time of Gram-stain result, time of PNA FISH species result, and time of final species determination result. The secondary and third aims were to compare the time to appropriate therapy based on clinician group that was notified of Gram-stain result and PNA FISH result and compare the time to appropriate therapy based on PNA FISH assay results reported during the day and night microbiology laboratory shifts. Methods: This Institutional Review Board approved project is a retrospective, chart review evaluation of the 24 hour/ 7 days a week use of PNA FISH assays with therapeutic interventions by infectious diseases pharmacists and physicians on patient outcome measures and time to appropriate therapy. All patients admitted to an academic medical center during a one year period (April 2010-March 2011) with either Enterococcus, Streptococcus, or Candida species isolated from blood were included. Main Results: A total of 168 subjects were identified with Candida species isolated from 31 subjects and Enterococcus/Streptococcus species isolated from blood in 137 subjects. Conclusions: While reporting conditions can affect interpretation and intervention rates, rapid species identification assays such as PNA FISH can be used by pharmacists to provide antimicrobial therapy recommendations based on the species identification and to decrease the time to appropriate antimicrobial therapy.
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Ocorrência de C. tropicals no HUCAM Estudo de sua suscetibilidade a antifúngicos com proposta de métodos modificados para aprimoramento dos testes in vitro.

MALACARNE, B. 10 December 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:34:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_4463_.pdf: 2463617 bytes, checksum: 6f1b43fe12a243fee41aae39133a8316 (MD5) Previous issue date: 2010-12-10 / RESUMO: A frequência de candidemia tem aumentado nas últimas décadas, com crescente ocorrência de espécies não-albicans. Candida tropicalis representa, em geral, a espécie não-albicans mais freqüente no Brasil e pode apresentar crescimento tipo trailing nos testes de microdiluição em caldo, frente a drogas azólicas, o que dificulta e confunde a leitura dos valores de CIM. Os objetivos do presente trabalho foram avaliar a ocorrência de candidemia causada por C. tropicalis no HUCAM e seu perfil de suscetibilidade a fluconazol, itraconazol e anfotericina B, conforme metodologia de referência M27-A3 (CLSI, 2008), propor modificações deste teste, além de avaliar a influência de diferentes períodos de incubação e formas de leitura. Isolados de Candida tropicalis foram selecionados, através da realização de teste de suscetibilidade de acordo com M27-A3, e submetidos aos testes modificados, como a incubação na temperatura de 42°C, a adição de TSA ou a adição do composto colorimétrico resazurina. Os resultados obtidos nos testes modificados foram avaliados através da determinação das concordâncias categóricas e essenciais com o teste padrão. Os resultados mostraram que no período de 2006 a 2009, a frequência de candidemia no HUCAM variou de 1,21 a 1,65 casos/1.000 admissões hospitalares e de 0,16 a 0,25 casos/1.000 pacientes-dia. C. albicans representou 45% na etiologia dos episódios, seguida por C. tropicalis (26%), C. parapsilosis (14%), C. glabrata (10%) e outras (C. krusei, C. guilliermondii e C. lusitaniae). Os maiores percentuais de resistência a fluconazol e a itraconazol ocorreram com 48 horas de incubação, em relação ao período de 24 horas (26% versus 5% e 17% versus 1,2%, respectivamente). 28,05% dos isolados apresentaram crescimento tipo trailing para uma ou para as duas drogas testadas. As concordâncias categóricas e essenciais dos testes modificados, em relação à metodologia padrão, variaram de 70 a 87%, com 24 horas de incubação e para ambas a drogas. Com 48 horas de incubação, as modificações introduzidas (incubação a 42ºC e adição de TSA) propiciaram menores percentagens de concordâncias categóricas e essenciais que o método com adição de resazurina. A incubação a 42°C correlacionou com as melhores concordâncias entre as formas de leitura visual e espectrofotométrica, em comparação com o método padrão. Diferentes perfis de crescimento tipo trailing foram observados, sendo que os três métodos modificados foram eficazes em reduzir este fenômeno com 24 horas de incubação, mas apenas os métodos a 42ºC e com TSA foram capazes de reduzir o trailing com 48 horas de incubação. A análise de prontuários médicos permitiu verificar que isolado com crescimento tipo trailing apresentou resposta terapêutica satisfatória ao fluconazol e que isolado que permaneceu resistente nos testes modificados não respondeu a tratamento com fluconazol, in vivo. PALAVRAS CHAVES: Candida tropicalis, Candidemia; Teste de suscetibilidade
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Clonalidad de cepas patógenas y comensales de Candida albicans de pacientes humanos con candidemia mediante técnicas moleculares

Castañón Santibáñez, Karen Carolina January 2007 (has links)
Memoria para optar al Titulo Profesional de Médico Veterinario / Candida albicans es una levadura comensal que forma parte de la microbiota de las mucosas en el hombre, sin embargo es también un patógeno oportunista, responsable de infecciones invasoras, principalmente nosocomiales endógenas, las que presentan una alta morbiletalidad. Debido a que el estado sexual no es conocido en C. albicans, se espera que su estructura poblacional sea primariamente clonal, por esta razón un individuo puede portar clones de una cepa colonizante, en distintos lugares anatómicos, los que bajo ciertas condiciones, principalmente del hospedero, pueden producir infección. En Chile no existen estudios que revelen la relación de origen entre cepas colonizantes e infectantes, por lo tanto, resulta relevante profundizar el conocimiento sobre la epidemiología de la infección por C. albicans. El objetivo de este trabajo fue analizar genéticamente cepas patógenas de C. albicans, aisladas de hemocultivo, y cepas comensales provenientes de sitios colonizados de un mismo paciente con diagnóstico comprobado de candidemia, con el fin de determinar la relación de origen de estas cepas. Para esto, se analizaron molecularmente 35 cepas, identificadas previo al estudio como C. albicans, provenientes de ocho pacientes internados en Unidades de Pacientes Críticos del Hospital Clínico de la Universidad de Chile. De estas 35 cepas, cuatro se identificaron posteriormente como C. dubliniensis y provenían de un mismo paciente. Las cepas de C. albicans y C. dubliniensis fueron genotipificadas inicialmente mediante el método de Amplificación Aleatoria del ADN Polimórfico (RAPD), utilizando cinco partidores con actividad discriminatoria intraespecie. Se determinó el grado de similitud entre cepas mediante Coeficiente de Dice y se construyó un dendrograma, mediante el método UPGMA (Unweighted Pair Group Method Whit Arithmetic Averages). Los resultados mostraron que casi en la totalidad de los pacientes, los aislados propios de cada uno fueron agrupados en “cluster” únicos con una alta similitud genética (SAB ≥ 0.9), demostrando el origen clonal de los aislados y, en algunos casos, la existencia de fenómenos microevolutivos y reemplazo de cepas. 2 Posteriormente se analizaron las cepas de C. albicans a través de la Electroforesis en Gel con Gradiente Desnaturante (DGGE), mediante la amplificación de la porción final del 18S, el ITS1, el 5.8S y parte del ITS2 del ADN ribosomal. Los resultados del DGGE mostraron que las bandas pertenecientes a cada uno de los aislados en estudio migraron a la misma altura, sin conseguir evidenciar las diferencias genéticas existentes entre aislados de un mismo paciente y entre pacientes. El análisis estadístico, mediante el Test de McNemar, permitió establecer que el método de RAPD presenta un mayor rendimiento que el DGGE para la genotipificación de cepas de Candida spp. Finalmente, al comparar ambos métodos de genotipificación, sólo el RAPD pudo determinar que las cepas patógenas y comensales de C. albicans, provenientes de un mismo paciente con candidemia, están en su gran mayoría, relacionadas clonalmente.
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Detecção da diversidade molecular de Candida spp. isoladas de UTI neonatal

Arraes, Ana Carolina Palmeira 10 June 2013 (has links)
Submitted by Hiolanda Rêgo (hiolandar@gmail.com) on 2013-06-10T20:55:35Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Ana Carolina Arraes.pdf: 1876812 bytes, checksum: c4740a70b3675be50d2ebafeb0ba8fe3 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-10T20:55:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Ana Carolina Arraes.pdf: 1876812 bytes, checksum: c4740a70b3675be50d2ebafeb0ba8fe3 (MD5) / CAPES / A incidência de candidemia tem aumentado nos últimos anos e o espectro das espécies de Candida tem mudado com a emergência das espécies não-albicans e com o aumento da resistência antifúngica. A técnica de PCR associada à análise dos polimorfismos de fragmentos de restrição (PCR-RFLP) e AP-PCR são exemplos de técnicas moleculares utilizadas para a detecção da variabilidade genética desses micro-organismos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente Candida spp. clinicamente importantes. Foram estudadas 82 leveduras do gênero Candida, 73 isolados clínicos e nove cepas padrão de referência da “American Type Culture Collection” (ATCC). O DNA genômico foi extraído através de lise mecânica/química e fenol-clorofórmio. Após amplificação com iniciadores ITS1 e ITS4, os produtos da PCR foram digeridos com as enzimas DdeI, HaeIII, BfaI e MspI. Outra amplificação foi realizada com o iniciador arbitrário AP-4. A identificação fenotípica revelou a frequência de 38% de C. parapsilosis, 33% de C. albicans, 27,5% de C. tropicalis e 1,5% de C. guilliermondii. Após amplificação, foi possível identificar e diferenciar as espécies C. lusitaniae, C. guilliermondii, C. famata e C. glabrata. A diferenciação entre C. albicans, C. dubliniensis C. tropicalis, C. krusei e C. parapsilosis não foi bem evidenciada com as enzimas DdeI e HaeIII. Porém, MspI conseguiu diferenciar C. tropicalis, C. krusei, C. parapsilosis, C. glabrata, C. guilliermondii, C. lusitaniae e C. famata, juntamente com BfaI que separou C. albicans de C. dubliniensis. Já a técnica de AP-PCR com o iniciador AP-4, possibilitou a distinção das nove espécies cepas padrão ATCC de Candida, pois todas apresentaram perfis de amplificação com número, intensidade e tamanho de banda específico, onde cada espécie foi alocada em grupo distinto e a relação de similaridade variou de 38-69%, ratificando o poder de diferenciação das espécies. As técnicas moleculares foram reprodutíveis e relativamente rápidas, de fácil interpretação e podem ser aplicadas na identificação de espécies clinicamente importantes de Candida para auxílio no diagnóstico mais rápido e tratamento mais eficiente. / Salvador
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Perfil de sensibilidade e genotipagem de leveduras isoladas de pacientes com candidemia em dois hospitais de referência terciária de Fortaleza-Ceará / Sensitivety profile to antifulgal and evaluate the genotypical profile of the yeast isolated from candidemic patients tertiary care hospital from Northeast Brazil

Medrano, Délia Jéssica Astete January 2004 (has links)
MEDRANO, Delia Jessica Astete. Perfil de sensibilidade e genotipagem de leveduras isoladas de pacientes com candidemia em dois hospitais de referência terciária de Fortaleza - Ceará. 2004. 146 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Médica) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2004. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-01-04T15:52:19Z No. of bitstreams: 1 2004_dis_djamedrano.pdf: 1543027 bytes, checksum: bf8abffaae3f0d8ea1a8c267957fc295 (MD5) / Approved for entry into archive by Eliene Nascimento(elienegvn@hotmail.com) on 2012-02-02T16:19:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2004_dis_djamedrano.pdf: 1543027 bytes, checksum: bf8abffaae3f0d8ea1a8c267957fc295 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-02-02T16:19:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2004_dis_djamedrano.pdf: 1543027 bytes, checksum: bf8abffaae3f0d8ea1a8c267957fc295 (MD5) Previous issue date: 2004 / The systemic infections caused by yeasts of the genus Candida are considered opportunist mycoses of high risk in hospital environments. These infections represent important therapeutical challenge, by reason of arising of species resistent to some antifungals, associated with high rate of mortality. Therefore, this work sought: To verify the frequency of fungemias at Dr. César Cals Hospital and Albert Sabin Children Hospital; identify the etiological agents implicated; determine the sensitivety profile to antifulgal and evaluate the genotypical profile of the species isolated from patients with recurrency. For this, were recuperated from 4627 hemcultures, 55 yeast-positive hemocultures at HGCC and from 5316 hemocultures 87 yeast-positive hemocultures at HIAS. From them, 23 patients at HGCC and from 43 at HIAS that had clinical histories with complet data entered this study. The mycological diagnosis was performed through biochemical and morphological characteristics of the etiological isolated. The test of sensitivety to antifungal- amphotericin B, fluconazole, itraconazole and cetoconazole- utilized the microdilution method in broth, reported in the document M27-A2 of the NCCLS. The genotyping techniques were performed through PFGE (Pulsed Field Gel Electrophresis), RAPD (Randomly amplified polymorphic DNA analysis). Within the period from june of 2000, to june of 2002 at HGCC, were analysed 4627 hemocultures, being positives 1051, of which 55 (5,2%) were positive for yeast of the genus Candida. On the other hand, in the period from june of 2001 to july of 2002 at HIAS, were analysed 5316 hemocultures, of which 87 (5,72%) were yeast-positive of the genus Candida and Rhodotorula.The main specie involved in the genus Candida, was C. parapsilosis with 36% and 42% of the cases at HGCC and HIAS respectively. The main risk factors associated with candidemia, were: the previous antibiotic therapy, central venous catheter, parenteral nutrition, gastric probe, mechanical ventilation, surgery and prematurity. About the resistance to antifungals drugs was observed that amphotericin B showed a resistance level of 4%, fluconazole-56%, itraconazole-52% and cetoconazole- 86%. The PFGE technique caracterized a cromossomic profile of 6 bands for C. parapsilosis and 4 for C. tropicalis. This technique permited the diferentiation of one cepa with changed pattern of bands for the last episode of the patient 4. The technique of RAPD chacacterized a distribution pattern of predominant bands for C. parapsilosis and was capable of characterize 4 genetical profiles, denoting reinfection in 3 patients and 2 genomic profiles were found for C. tropicalis. This assay shows the emergency of the non- albicans Candida, specially the C. parapsilosis, as main responsible for the cases of candidemia in the two hospitals of tertiary indication of Fortaleza, associated with a high resistance in vitro to antifungals. The genetical variability found in C. parapsilosis and C. tropicalis through the PFGE and RAPD techniques, revealed reinfection pictures, which rises the possibility that these be due to a contamination among patients or indirectly through the healthy workers. / As infecções fúngicas sistêmicas causadas por leveduras do gênero Candida são consideradas micoses oportunistas de alto risco em ambientes hospitalares. Essas infecções representam importante desafio terapêutico, em razão do surgimento de espécies resistentes a antifúngicos, associados a altos índices de mortalidade. Por esta razão, este trabalho objetivou: Verificar a freqüência de fungemias no Hospital Geral Dr. César Cals (HGCC) e Hospital Infantil Albert Sabin (HIAS); identificar os agentes etiológicos implicados; determinar o perfil de sensibilidade aos antifúngicos e avaliar o perfil genotípico das espécies isoladas de pacientes com quadros de recorrência. Para isso foram recuperadas, de 4 627 hemoculturas, 55 hemoculturas positivas para leveduras do HGCC, e, de 5 316 hemoculturas, 87 positivas para leveduras do HIAS. Destas, 23 do HGCC e 43 pacientes do HIAS que possuíam histórias clínicas com dados completos entraram neste estudo. O diagnóstico micológico foi realizado por meio das características bioquímicas e morfológicas dos agentes etiológicos isolados. O teste de sensibilidade aos antifúngicos - anfotericina B, fluconazol, itraconazol e cetoconazol - utilizou o método de microdiluição em caldo, descrito no documento M27-A2 do NCCLS. As técnicas de genotipagem foram realizadas por eletroforese em campo pulsátil (PFGE) e amplificação aleatória do DNA (RAPD). Entre o período do junho do 2000 a junho do 2002, no HGCC, foram analisadas 4 627 hemoculturas, sendo positivas 1051, das quais 55 (5,2%) foram positivas para leveduras do gênero Candida. Em contrapartida, no período de junho do 2001 a junho do 2002, no HIAS, foram analisadas 5316 hemoculturas, sendo positivas 1520 amostras, das quais 87 (5,72%) foram positivas para leveduras dos gêneros Candida e Rhodotorula. A principal espécie envolvida, dentro do gênero Candida, foi a C. parapsilosis com 36% e 42% no HGCC e HIAS, respectivamente. Os principais fatores de risco foram: a antibioticoterapia prévia (n=19; 90%), cateter venoso central, nutrição parenteral, sondagem gástrica , ventilação mecânica, cirurgia e prematuridade. Quanto à resistência a drogas antifúngicas, foi observado que anfotericina B apresentou um índice de resistência de 4%, fluconazol- 52%, itraconazol- 50% e cetoconazol- 86%. A técnica do PFGE caracterizou um perfil cromossômico de 6 bandas para C. parapsilosis e 4 para C. tropicalis. Esta técnica permitiu a diferenciação de uma cepa com padrão de bandas alterado para o último episódio do paciente 4. A técnica de RAPD caracterizou um padrão de distribuição de bandas predominante para C. parapsilosis e foi capaz de caracterizar 4 perfis genômicos, indicando re-infecção em 3 pacientes e 2 perfis genômicos foram encontrados para C. tropicalis . Este ensaio demonstra a emergência das Candida não-albicans, especialmente a C. parapsilosis, como principal responsável pelos casos de candidemias em dois hospitais de indicação terciária de Fortaleza, associado a uma alta resistência in vitro aos antifúngicos. A variabilidade genética encontrada nas C. parapsilosis e C. tropicalis, mediante as técnicas do PFGE e RAPD, revelaram quadros de re-infecção, os quais erguem a possibilidade de que estas sejam decorrentes de uma contaminação entre pacientes ou indiretamente, por intermédio de trabalhadores da saúde.
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OCORRÊNCIA DE INFECÇÃO NOSOCOMIAL POR Candida spp. NO HOSPITAL UNIVERSITÁRIO CASSIANO ANTONIO DE MORAES (HUCAM) E AVALIAÇÃO DAS DROGAS ANFOTERICINA B E VORICONAZOL NA INIBIÇÃO DE FORMAÇÃO DE BIOFILME PELAS ESPÉCIES ISOLADAS.

RIBEIRO, A. D. 09 August 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:34:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_6739_DISSERTAÇÃO Aline Dias Ribeiro.pdf: 1995821 bytes, checksum: 257ebf9537bf0f4881b2a7d2bf130050 (MD5) Previous issue date: 2013-08-09 / INTRODUÇÃO: Infecções de corrente sanguínea por fungos têm se destacado principalmente pelo crescente número de casos de candidemia (infecções por Candida spp neste sítio). Atualmente, este fungo figura como um dos sete patógenos mais comuns em infecções nosocomiais, apresentando taxas de mortalidade bruta entre 40 e 70% e atribuída, de 50%. Formação de biofilme é frequentemente associada a persistente infecção por Candida spp. e dificulta o tratamento devido à elevada resistencia que as células fúngicas adquirem a drogas antifungicas, nestas circunstâncias. OBJETIVOS: Determinar a incidência de candidemias no Hospital Universitário Cassiano Antônio de Moraes (HUCAM), entre 1º de março de 2011 a 30 de dezembro de 2012; determinar as taxas de prevalência das espécies de Candida spp.e testar a potencial atividade das drogas anfotericina B e voriconazol na inibição de formação de biofilme pelas espécies isoladas. MATERIAIS e MÉTODOS: Informações sobre o número total de admissões e de pacientes-dia, na UTI e UTIN do HUCAM foram fornecidos pelo setor de estatística e as 32 cepas de Candida spp., obtidos de sangue, urina e ponta de cateter foram isoladas no laboratório de Análises Clínicas deste hospital. Para as análises de inibição de formação de biofilme foram utilizados os testes estatísticos de Wilcoxon, de Sinais e de Mann-Whitney. RESULTADOS: O setor do HUCAM com maior incidência de candidemia foi a UTIN (8,6/10.000 pacientes-dia e 14,2/1.000 internações). Candida spp foi 5º microrganismo mais isolado das ICS, com predomínio de espécies não-albicans (81%), sendo C. parapsilosis a espécie mais frequente. Na UTIN, a frequência de candidemia por C. albicans foi de 67% e a única espécie não-albicans isolada foi Candida parapsilosis. Na avaliação da inibição de formação de biofilme foi constatado que as concentrações de anfotericina B estatisticamente significantes foram: 128 µg/mL para as epécies C. albicans, C parapsilosis e C tropicalis e 64 µg/mL para as espécies agrupadas em outros. Voriconazol foi capaz de inibir formação de biofilme apenas para isolados da espécie C. albicans e na maior concentração testada (16 µg/mL). CONCLUSÕES: A maior incidência de candidemia no HUCAM foi encontrada para recém-nascidos internados na UTIN. A distribuição das espécies de Candida variou de acordo com setores do hospital, mas sofreu pouca alteração em relação ao período estudado. No geral, anfotericina B foi mais eficaz que voriconazol na inibição de formação de biofilme por espécies de Candida.

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