Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T14:07:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 681389 bytes, checksum: 13d59dc39cc9b534b7bc474992b0662b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T14:07:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 681389 bytes, checksum: 13d59dc39cc9b534b7bc474992b0662b (MD5) Previous issue date: 2003-05-06 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Com o objetivo de obter cromossomos morfologicamente adequados para serem caracterizados citogeneticamente e identificados para montagem do cariograma de C. canephora (2n=2x=22), C. arabica (2n=4x=44) e C. eugenioides (2n=2x=22), empregaram-se novas técnicas citogenéticas associadas às metodologias computacionais de análise de imagens. As metodologias utilizadas possibilitaram a obtenção do cariograma das três espécies com cromossomos definidos e resolução adequada para caracterização de cada par de homólogos, aparentemente semelhantes quando obtidos por meio de técnicas convencionais. A análise citogenética revelou que C. canephora possui um par de cromossomos metacêntricos (m) e 10 pares submetacêntricos (sm). Foi observada a presença de satélites no braço curto do cromossomo 6, e o comprimento absoluto de seus cromossomos variou de 1,58 a 3,30 μm. A citometria de fluxo foi usada para estimar a quantidade de DNA (valor 2C), na fase G0/G1, em Coffea. Foram analisadas amostras das espécies de C. canephora (2x), C. eugenioides (2x), C. racemosa (2x) e C. arabica (4x); do Híbrido de Timor, híbrido natural triplóide entre C. arabica e C. canephora (4x); dos supostos híbridos interespecíficos naturais entre C. racemosa e C. arabica, denominados UFV 557; e de plantas resultantes do retrocruzamento entre C. arabica e UFV 557. A diferença na quantidade do conteúdo de DNA entre espécies diplóides foi de até 0,50 pg = 45% (Coffea racemosa 1,11 pg; Coffea eugenioides 1,40 pg e Coffea canephora cv. ‘Robusta’ 1,61 pg). Considerando-se os valores intraespecíficos (Coffea canephora 1,43 a 1,61 pg e Coffea arabica 2,40 a 3,04 pg), estas diferenças foram de 0,18 pg (12,59%) e 0,64 pg (26,67%), respectivamente. A citometria de fluxo também revelou-se uma ferramenta importante no monitoramento e identificação de híbridos interespecíficos de Coffea. A citométria de imagem foi empregada para determinação do índice de densidade óptica de preparações de pontas de raízes esmagadas e coradas com reação de Feulgen. O método prófase/telófase (mensuramento de 10 núcleos em prófase e 10 em telófase por lâmina) foi empregado nesta pesquisa. Assim, valores 4C e 2C, referentes ao núcleos em prófase e telófase, foram estimados, e as razões entre os genomas de Coffea arabica cv. Catuaí Vermelho (2n=44) e Coffea canephora cv. Conillon (2n=22) e entre Coffea arabica cv. Mundo Novo e cv. Catuaí Vermelho puderam ser estabelecidas. As estimativas do índice entre as cultivares obtidas pelo método de citometria de imagem foram comparadas com valores obtidos previamente usando a citometria de fluxo e apresentaram diferenças inferiores a 2,27%. / New cytogenetic techniques together with methods of computer image analyses were utilized to set up the karyogram of C. canephora (2n=2x=22), C. arabica (2n=4x=44), and C. eugenioides (2n=2x=22). Thereby, morphologically appropriate chromosomes were obtained for cytogenetic characterization and identification. These methodologies brought forth a karyogram of the three species with defined chromosomes and a suitable resolution for the characterization of each homologous pair, which, when obtained by conventional techniques, are apparently similar. The cytogenetic analysis indicated that C. canephora owns one metacentric (m) and 10 submetacentric chromosome pairs (sm). Satellites were localized on the short arm of chromosome 6, while the absolute chromosomes length varied between 1,58 and 3,30 μm. Flux cytometry was used to estimate the quantity of the DNA (value 2C) in the G0/G1 phase, for Coffea. Samples of the following species were analyzed: C. canephora (2x), C. eugenioides (2x), C. racemosa (2x), and C. arabica (4x); the Timor Hybrid, natural triploid hybrid of C. arabica and C. canephora (4x); the suspected interspecific natural hybrids of C. racemosa and C. arabica, designated UFV 557; and the backcrosses of C. arabica and UFV 557. The difference in the content quantity of the DNA among the diploid species reached 0,50 pg = 45% (Coffea racemosa 1,11 pg, Coffea eugenioides 1,40 pg, and Coffea canephora cv. ‘Robusta’ 1,61 pg). These differences were 0,18 pg (12,59%) and 0,64 pg (26,67%), respectively, in the intra-species values (Coffea canephora 1,43 to 1,61pg and Coffea arabica 2,40 to 3,04 pg). Flux cytometry proved to be of great usefulness to monitor and identify the interspecific hybrids of Coffea. Picture cytometry was employed in the determination of the optical density index in slide preparations of root tips pressed and dyed by the Feulgen reaction. The prophase/telophase method (measurement of 10 nuclei in prophase and 10 in telophase per slide) was used in this study. The values 4C and 2C of the nuclei in prophase and telophase were estimated, and the genome ratios of Coffea arabica cv. Catuaí Vermelho (2n=44) and Coffea canephora cv. Conillon (2n=22), as well as of Coffea arabica cv. Mundo Novo and cv. Catuaí Vermelho could be established. In a comparison between the estimate indices of the cultivars obtained by the picture cytometry method and the values established previously by flux cytometry, the differences lay below 2,27%. / Tese importada do Alexandria

Made available in DSpace on 2018-08-01T23:26:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_7916_44 - Dissertacao - Danielly Dubberstein20150904-92351.pdf: 1526875 bytes, checksum: 97fd920c11547ee36e2432aa857f0cae (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Objetivou-se avaliar o crescimento vegetativo de ramos, a concentração e acúmulo de nutrientes em frutos e folhas de cafeeiro sob distintos manejos de adubação na Amazônia Sul Ocidental. O experimento foi realizado no município de Rolim de Moura, Rondônia, em lavoura propagada por estacas com 2,5 anos de idade. O delineamento experimental utilizado foi blocos casualizados em esquema de parcela subdividida no tempo, com três repetições. A parcela principal foi constituída por dois manejos de adubação (ausência e presença) e nas subparcelas as épocas de avaliação (mensuração dos ramos e coletas de frutos e folhas). O crescimento dos ramos diferiu em função do manejo da adubação, sendo que no período compreendido entre início de outubro ao início de dezembro ramos de plantas que foram adubadas expressaram taxas de crescimento maior do que ramos de plantas não adubadas. Houve variações sazonais de crescimento ao longo do ano, maiores taxas de crescimento ocorrem de meados de setembro ao início de abril, época caracterizada de estação chuvosa na região. A adubação mineral influi sobre a concentração no fruto, na folha e acúmulo nos frutos para nitrogênio, fósforo, potássio, cálcio, magnésio, manganês, ferro e zinco. A concentração para a maioria dos nutrientes nos frutos são maiores no início da formação. E, proporcionalmente menores a partir do desenvolvimento do fruto, excetuando-se o potássio que se comporta de forma distinta, mantendo-se elevado teor no fruto em todos os estádios de desenvolvimento. Já nas folhas, baixas concentrações ocorrem no início da formação do fruto e tende a aumentar posteriormente. Maior parte do acúmulo dos nutrientes nos frutos ocorre nos estádios de expansão, granação e maturação, sugerindo-se maior demanda nutricional neste período.

Thèse--Sci. nat.--Paris XI, 1984. / Notes bibliogr.

CARVALHO NETO, F. H. Abelhas visitantes florais e potenciais polinizadoras do café (Coffea arabica L.) ecológico e sombreado no Maciço de Baturité - Ceará. 2010. 69 f. Dissertação (Mestrado em Zootecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2010. / Submitted by Daniel Eduardo Alencar da Silva (dealencar.silva@gmail.com) on 2014-12-10T21:03:10Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_fhcneto.pdf: 1405724 bytes, checksum: 78b3d45af638d20a1f7837e1f0a749e1 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2016-03-22T15:56:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_fhcneto.pdf: 1405724 bytes, checksum: 78b3d45af638d20a1f7837e1f0a749e1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-22T15:56:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_fhcneto.pdf: 1405724 bytes, checksum: 78b3d45af638d20a1f7837e1f0a749e1 (MD5) Previous issue date: 2010 / The survey was conducted on the farm São Sebastião, located in the city of Mulungu - CE. Data were collected and studied during the period November 2009 to June 2010 with the aim of studying the floral visitors and pollination of coffee (Coffea arabica L.) and green shade of Mundo Novo and Maragogipe. We studied the floral biology and pollination requirements of the cultivars, the grazing behavior and evaluation of fruit after 100 days of pollination. The results showed that Apis mellifera was the most frequent in the flowers (9 ± 0.42, n = 455) followed by Trigona fulviventris (4 ± 0.52, n = 206), Melipona rufiventris (4 ± 0.42, n = 151), Nannotrigona sp. (3 ± 0.48, n = 148), Trigona spinipes (3 ± 0.43, n = 157) and Xylocopa grisescens (2 ± 0.78, n = 38). After 100 days of pollination (open pollination, with narrow paper bag, with narrow organza bag, manual cross-pollination and geitonogamy) showed significant differences (Mundo Novo X2 = 44.9495, DF=4,p<0.005; Maragogipe: X2 = 59.8649, df = 4, p <0.005) between treatments with respect to viable fruits. The open pollinated differed significantly (P <0.05) of all treatments for Mundo Novo. In the cultivar Maragogipe, the free pollination, manual cross-pollination and geitonogamy presented the highest number of viable fruits and did not differ. However, these treatments differed significantly (P <0.05) than treatment with restricted pollination bag and this in turn also differed from the restricted pollination treatment with organza bag. The total weight of 100 days after the pollination treatments showed no significant differences between cultivars at a significance level of 5%. It is concluded that the Arabic coffee can produce fruits under any circumstances tested. Despite being selfcompatible, also supports the cross-pollination that leads to an increase in productivity. The wind and gravity did not favor an increase in fruit set fruit. Species Apis mellifera, Melipona rufiventris and Xylocopa grisescens recorded behavior of potential pollinators. / A pesquisa foi realizada na fazenda São Sebastião, localizada no município de Mulungu – CE. Os dados foram coletados e trabalhados no período de Novembro de 2009 a Junho de 2010, com o objetivo de estudar os visitantes florais e a polinização do café (Coffea arabica L.) ecológico e sombreado das cultivares Mundo Novo e Maragogipe. Foram estudados a biologia floral e os requerimentos de polinização das cultivares; o comportamento de pastejo e avaliação dos frutos após 100 dias dos tratamentos de polinização. Os resultados mostraram que Apis mellifera foi a espécie mais freqüente nas flores (9 ± 0,42, n = 455) seguida de Trigona fulviventris (4 ± 0,52, n = 206), Melipona rufiventris (4 ± 0,42, n = 151), Nannotrigona sp. (3 ± 0,48, n = 148), Trigona spinipes (3 ± 0,43, n = 157) e Xylocopa grisescens (2 ± 0,78, n= 38). Após 100 dias dos tratamentos de polinização (polinização livre, restrita com saco de papel, restrita com saco de organza, polinização cruzada manual e geitonogamia) verificamos diferenças significativas

Made available in DSpace on 2018-03-22T15:57:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10514_Luina Noia.pdf: 1963219 bytes, checksum: 9ba7c4e0872da5efab1b5880be237397 (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 / A composição química do café vem sendo estudada com o objetivo de caracterizar os compostos responsáveis pelos sabores e aromas presentes na bebida e identificar aqueles que causam sensações boas e ruins. No café conilon (Coffea canephora), este interesse surgiu recentemente, juntamente com o interesse por sua qualidade sensorial, que antes era pouco considerada. Dentre as análises que tem sido utilizadas para relacionar a composição com a qualidade do café estão as bromatológicas e cromatográficas. Neste trabalho, estas análises foram realizadas em 24 amostras de café conilon previamente classificadas sensorialmente, com o objetivo de relacionar caracteres físico-químicos com a qualidade do café conilon. As análises bromatológicas realizadas foram: umidade, cinza, lipídeos, acidez, pH, sólidos solúveis, açúcar total, açúcar redutor e não-redutor, compostos fenólicos, condutividade elétrica e lixiviação de potássio; e as análises cromatográficas foram: cafeína, trigonelina, ácido 5-cafeiolquínico (5-ACQ), ácido acético e ácido cítrico. A maioria das variáveisbromatológicas apresentaram correlação com a nota sensorial, sendo a condutividade elétrica e os açúcares as que mais se destacaram; a condutividade e o açúcar redutor apresentaram correlação negativa e o açúcar não-redutor apresentou correlação positiva. Foi possível formar grupos com separação das amostras de qualidade superior e inferior utilizando todas as amostras bromatológicas e também com, no mínimo, quatro ou cinco variáveis. Todas as variáveis cromatográficas tiveram correlação negativa com a nota sensorial, destacando-se o 5-ACQ com maior correlação, seguido pela cafeína. As variáveis condutividade, açúcar nãoredutor, 5-ACQ, ácido cítrico e ácido acético foram agrupadas com as características qualitativas das amostras: classe sensorial, local de produção, tipo, peneira e preparo póscolheita. Os menores valores de condutividade, 5-ACQ, ácido cítrico e ácido acético e os maiores valores de açúcar não-redutor se agruparam com cafés finos, tipo 3-4, peneira 15, preparo cereja descascado e local de produção Afonso Cláudio. Assim este trabalho aponta compostos que contribuem positiva e negativamente com a qualidade do café; indica um método de separação de amostras de diferentes qualidades através de análises bromatológicas de fácil realização; e demostra alguns fatores de produção que influenciam a obtenção de cafés de qualidade. Palavras-chave: análise sensorial; Coffea canephora; variáveis físico-químicas. AB

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-05-14T17:40:56Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1000395 bytes, checksum: a90460d786d7991c67d9a48413380eb8 (MD5) / Approved for entry into archive by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-05-14T17:41:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1000395 bytes, checksum: a90460d786d7991c67d9a48413380eb8 (MD5) / Approved for entry into archive by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-05-14T17:41:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1000395 bytes, checksum: a90460d786d7991c67d9a48413380eb8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-14T17:41:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1000395 bytes, checksum: a90460d786d7991c67d9a48413380eb8 (MD5) Previous issue date: 2006 / O café é considerado um dos produtos agrícolas de maior importância para o Brasil. Sua qualidade é de fundamental importância, devendo o produto apresentar propriedades físicas, químicas e sensoriais de acordo com as normas estabelecidas. Entre os vários fatores que influenciam a qualidade do café destaca-se a presença de grãos defeituosos (grãos pretos, verdes e ardidos), que são os mais indesejáveis. Assim, este trabalho objetivou uma diferenciação química entre os grãos sadios e os grãos pretos, verdes e ardidos (PVA), obtidos com diferentes graus de torrefação (torra fraca, média e forte), utilizando-se amostras proveniente do Cerrado Mineiro e para a torra média uma amostra do Sul de Minas. Os resultados mostraram que bebidas preparadas a partir de grãos PVA são mais ácidas devido aos processos fermentativos e mais adstringente decorrente de maiores teores de compostos fenólicos, proantocianidinas e ácidos clorogênicos. Além disso, a presença de defeitos reduz a concentração de óleo essencial, porém aumenta os teores de substâncias indesejáveis para o aroma, como aldeídos de baixa massa molar e sulfetos. Estes grãos são ricos em olefinas e cadeias saturadas. No entanto, o substrato dos grãos defeituosos e sadios são semelhantes, compondo-se basicamente por açúcares, fenóis ácidos carboxílicos e cafeína. / Coffee is considered one of Brazil’s most important commodities and, therefore, its quality is very important. This product must present physical, chemical and sensorial properties according to established standards to reach the quality degree for exportation. Among the several factors that influence the quality of coffee, the presence of defective beans (black, green and sour beans (BGS)) must be avoided. Thus, the aim of this dissertation was to obtain a chemical differentiation between good and defective roasted beans. To study that, samples from Minas Gerais’s cerrado and from the South of this state were used. They were roasted until three different degrees (mild, medium and strong roasting). The results showed that beverages prepared from BGS beans were more acid due to fermentative processes, and more astringent due to higher content of phenolic compounds, proanthocyanidins and chlorogenic acids. Moreover, the presence of defective beans reduces the essential oil concentration, but increases the content of undesirable substances for the aroma, as low molecular weight aldehydes and sulfides. These beans are rich in olefins and saturated chains. However, the matrixes of the defective and good beans are similar, being basically composed by sugars, phenols, carboxylic acids and caffeine.

Made available in DSpace on 2018-08-01T22:33:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11088_Leonardo Leoni Belan.PDF: 52 bytes, checksum: 355322626f3c01c634e47dc81d68dc51 (MD5) Previous issue date: 2018-02-20 / As principais medidas de manejo da ferrugem (Hemileia vastatrix Berk. et Br.) em lavouras de cafeeiro conilon (C. canephora Pierre ex. Froehn) são a aplicação de fungicidas, e/ou plantio de cultivares/clones resistentes. Porém, plantas em situação de desequilíbrio nutricional, ficam predispostas à ocorrência de doenças. Desta forma, monitorar e conhecer a distribuição espacial da doença e dos nutrientes nas áreas de plantio é fundamental para o auxílio na tomada de decisão. Considerando a interação entre ambiente, patógeno e hospedeiro; a distribuição espacial e a quantificação da ferrugem do cafeeiro, objetivou-se: (i) avaliar o efeito da nutrição mineral na favorabilidade da doença; e (ii) elaborar e validar uma escala diagramática com fotografias coloridas originais. (i) Para avaliar o efeito da nutrição mineral na ocorrência da ferrugem, foi selecionada uma lavoura da variedade Robusta Tropical na região sul do Estado do Espírito Santo. Nessa lavoura foram demarcados e georreferenciados 51 pontos amostrais compostos por cinco plantas cada. Durante o ano agrícola 2016/17 avaliou-se mensalmente a incidência e a severidade da ferrugem nas plantas marcadas, bem como a nutrição mineral das plantas nos pontos amostrais, em seguida plotou-se a curva de progresso da doença e calculou-se o valor de área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Estas variáveis foram correlacionadas com os nutrientes presentes no tecido foliar das plantas. Os nutrientes foliares que apresentaram correlação significativa (p < 0,05) com a variável AACPD foram selecionados para análise geoestatística, plotagem de mapas por krigagem e análise de correlação espacial. Houve correlação entre as variáveis AACPD e teores foliares de N, K, Ca, Mn, Cu e B. A fim de desenvolver uma escala diagramática para auxiliar na quantificação da severidade da ferrugem nas folhas de C. canephora, folhas de cafeeiro conilon com diferentes níveis da doença foram coletadas a campo, fotografadas e analisadas em um software para determinar a severidade real da doença. Com base na distribuição de frequência dos valores de severidade, e de acordo com a lei de Weber-Fechner, os limites máximo e mínimo e os níveis intermediários da escala foram definidos. A validação foi realizada por 13 avaliadores que estimaram a severidade em 50 folhas com diferentes intensidades de sintomas com e sem o uso da escala. Foi realizada uma avaliação sem o auxílio da escala diagramática e duas avaliações com a utilização da escala, em intervalos de sete dias. Este procedimento foi realizado inicialmente com uma escala com imagens geradas por computador e já publicada, e posteriormente com a escala com fotografias coloridas originais proposta neste trabalho. Para validação, avaliou-se a acurácia, a precisão, a repetibilidade e a reprodutibilidade das estimativas, e realizada a comparação entre eficiência das duas escalas. A escala desenvolvida apresenta 8 níveis: 0 (0%), 1 (0,1-0,99%), 2 (1-2%), 3 (2,01- 4%), 4 (4,01-8%), 5 (8,01-16%), 6 (16,01-20%), 7 (25,01-50,1%). Utilizando a escala com fotografias coloridas originais proposta, os avaliadores apresentaram melhores níveis de acurácia, precisão, reprodutibilidade e repetibilidade nas estimativas, quando comparados aos avaliadores que não utilizaram a escala diagramática, ou utilizaram a escala com imagens geradas por computador. A escala diagramática proposta foi adequada para auxiliar na estimativa visual da severidade da ferrugem em folhas de cafeeiro conilon.

L'évolution des plantes à fleurs est remarquable par la vitesse et l'étendue de la diversification qui l'accompagne. La variabilité génétique qui découle de cette diversification pourrait provenir de nombreux processus. Parmi ceux-ci, les éléments transposables (ET) ont été considérés comme l'un des agents les plus importants. Les ET peuvent constituer de grandes proportions des génomes de plantes (>80%) et joueraient un rôle important dans l'établissement de la diversité génétique. Notre travail contribue à la compréhension du rôle des ET dans l'évolution des génomes d'espèces du genre Coffea, genre qui appartient à la famille des Rubiacées. Plus précisément, l'objectif de l'étude était d'étudier l'impact d'ET actifs sur le génome de certaines espèces du genre Coffea. Les données obtenues ont été divisées en deux parties qui composent les deux chapitres de la thèse. Dans le premier chapitre, dix rétrotransposons (LTR-RTs) ont été identifiés et annotés dans le génome de C. canephora. Le profil de leur polymorphisme d'insertion a été analysé à l'aide des approches IRAP et REMAP chez plusieurs génotypes des espèces C. canephora (18) et C. eugenioides ( 5), qui sont les espèces parentales de l'allotétraploïde, C. arabica (21). Les résultats soulignent la dynamique évolutive de ces éléments dans ces espèces, ainsi que leur transmission. Nos résultats montrent également des modifications de la structure du génome de l'hybride. Dans la seconde partie est constitué par une analyse complète de la répartition et de l'évolution d'un rétrotransposon particulier : Copia25. Ces analyses, menées in silico et in vitro, ont montré que ce LTR-RT est largement distribué au sein de la famille des Rubiacées et qu'il est également présent chez d'autres espèces proches ou bien plus éloignées phylogénétiquement (Asterides, Rosides ou Monocotylédones). Une situation particulière est constituée par la relation étroite qui existe entre les séquences de Copia25 identifiées dans le genre Musa, monocotylédone, et dans le genre Ixora, dicotylédones de la famille des Rubiacées. Nos résultats révèlent la complexité de la dynamique évolutive de Copia25 chez les angiospermes qui implique plusieurs processus incluant un mécanisme de conservation de la séquence, un « turnover » rapide, des pertes stochastiques et le transfert horizontal.L'article présenté dans le dernier chapitre a été accepté avec modifications par la revue « Plant Molecular Biology ». il est actuellement en cours de révision pour être renvoyé prochainement en vue de son acceptation définitive. / The evolutionary history of the flowering plants is remarkable for its rapid and extensive diversification. The background of the genetic variability for this diversification is originated by numerous processes, among them the transposable elements (TEs) have been considered as one of the most important agents. TEs may compose large amounts of plant genomes and might play important roles in the promotion of genetic diversity. Our study contributes for the understanding of TEs impact on the genome of Coffea species. Coffea is a genus that belongs to the Rubiaceae family. The goal of the study was to investigate the occurrence and diversity of active TEs in Coffea species and the data obtained were divided in two parts that compose the two chapters of the thesis. In the first chapter, ten retrotransposons with LTRs (LTR-RTs) were annotated in the C. canephora genome and had their insertion polymorphism profile analyzed, using the IRAP (inter-retrotransposon-amplified polymorphism) and REMAP (Retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism) methods, in genotypes the progenitor species, C. canephora (18) and C. eugenioides (5), and the allotetraploid hybrid, C. arabica. The results outline the evolutionary dynamics of these elements in the species, as well as their inheritance. Our results also suggest the occurrence of genomic structural changes mediated by the LTR-RTs in the hybrid. And, the second part constitutes a wide analysis of the distribution and evolution of a particular LTR-RT, Copia25. In silico and in vitro analyses showed that Copia25 is widely distributed among the Rubiaceae family and that it is also present in other distantly related species belonging to asterids, rosids and monocots. A particular situation is the closer relationship between the Copia25 sequences of Musa, a monocot, and Ixora, a dicot species (Rubiaceae). Our results disclose the complexity of the evolutionary dynamics of Copia25 in angiosperm involving several processes including sequence conservation, rapid turnover, stochastic losses and horizontal transfer. The article presented in the last chapter was accepted for publication after modifications in “Plant Molecular Biology”, it is at the present under correction to be soon sent back for final approval.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-20T12:14:39Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 27685777 bytes, checksum: 9849a516323681437d5c135d801a0b14 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-20T12:14:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 27685777 bytes, checksum: 9849a516323681437d5c135d801a0b14 (MD5) Previous issue date: 1999-07-12 / Com o objetivo de avaliar as áreas aptas, restritas e inaptas para o cultivo do café conilon (Coffea canephora L.) e arábica (Coffea arabica L.), utilizou-se o soltware ldrisi (versão 2.0 para Windows) para o zoneamento agroclimatológico e a análise da influência dos elementos climáticos sobre a produtividade para as duas espécies de café cultivadas na Bacia do Rio Itapemirim, situada no sul do Estado do Espírito Santo. Os resultados mostraram que o café conilon pode ser cultivado em 38,78% da área, podendo apresentar alguma restrição por temperatura, deficiência hídrica e classe de solo; que 7,32% da área total é considerada totalmente apta; e que 53,9% desta área é considerada inapta para o cultivo do café conilon. Os resultados obtidos para o café arábica mostraram que ele pode ser cultivado em 25,02% da área, podendo apresentar alguma restrição por temperatura, deficiência hídrica e classe de solo; que 53,56% da área total e' considerada totalmente apta; e que 21,42% desta área é considerada inapta para o cultivo do café arábica. Os municípios produtores de café conilon que apresentaram maior produtividade estão localizados na região central da bacia, exatamente nas áreas totalmente aptas ou aptas com alguma restrição, e os que apresentaram menor produtividade estão localizados nas áreas mais próximas do litoral, consideradas inaptas por deficiência hídrica ou classe de solo. Da mesma forma, os municípios produtores de café arábica que apresentaram maior produtividade estão localizados nas direções oeste e noroeste da bacia, em áreas aptas ou aptas com alguma restrição; já os municípios que apresentaram menor produtividade estão localizados em áreas de maior elevação, inaptas por temperatura, e nas áreas próximas do litoral, que são inaptas por deficiência hídrica e classe de solo. A diferença ocorrida entre as áreas propícias para o cultivo do café conilon e arábica pode ser explicada pelo fato de a região apresentar o relevo bastante montanhoso, com altitudes elevadas e, consequentemente, temperaturas mais favoráveis para o cultivo do café arábica. / A climatological zoning was established to determine the suitable, restricted and unsuitable areas for Conilon (Coffea canephora L.) and Arabic coffee (Coffea Arabíca L.) tree plantation. A raster geographical information system software was used in order to get the homogeneous climatic areas, and to analyse the influence of the climatic elements on the yield response for two coffee tree species planted at Itapemirim river basin area, in the Southern part of the State of Espirito Santo, Brazil. The results showed that the Conilon coffee can be planted in 38.78% of the basin, but with some restriction due to temperature, soil water deficit and soil type; 7.32% of the total area are considered totally suitable; and 53.9% of the area are unsuitable for Conilon coffee tree plantation. The results obtained for Arabic coffee showed that it can be planted in 25.02% of the area, but with some restriction due to temperature conditions, soil water deficit and soil type; 53.56% of the total area are totally suitable; and 21.42% of the area are unsuitable. The municipal districts that presented larger productivity of Conilon coffee are located in the central region of the Itapemirim river basin, which correspond to areas that are climatically suitable or suitable with some restriction. The areas that presented smaller productivity are located near the coast, which is unsuitable due to soil water deficit and soil type. Moreover, the municipal districts that are producers of Arabic coffee presented larger productivity when located in the west and northwest side of the basin, which are suitable or suitable with some restriction. The districts that presented smaller productivity are located in areas of higher elevation, and they are unsuitable because of low temperature conditions, and in the areas close to the coast, which are unsuitable due to soil water deficit and soil type. The topographic conditions of high altitude showed to be more adequate for Arabic coffee plantation mainly due to more favorable temperature conditions for that coffee.

Made available in DSpace on 2018-08-01T21:58:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_9982_Dissertação_Radigya (1).pdf: 1760976 bytes, checksum: 51ceba8c31d07e4fd2e5e4d40c305358 (MD5) Previous issue date: 2016-03-04 / O Brasil é o maior produtor e segundo consumidor mundial de café, sendo o Espírito Santo um dos maiores pólos de produção nacional deste produto. O café é uma fruta de grande importância para o PIB do país e a presença de adulterantes infringe o direito do consumidor, causando-lhe prejuízos e possíveis danos à saúde. Desta maneira, desenvolver um método analítico para determinar possíveis adulterações, agregaria valor de commodity, fortalecendo o crescimento econômico do país. Amostras de café torrados Conilon e Arábica foram analisadas através da técnica de Espectrometria de Massas por Ressonância Ciclotrônica de Íons com Transformada de Fourier (ESI(-)FT-ICR MS) e Espectroscopia na região do infravermelho médio com refletância total atenuada (ATR-FTIR) com o objetivo de desenvolver um método de quantificação de café Conilon em blendas de café Arábica, utilizando modelos de análise de dados uni e multivariados. Para construção do modelo de calibração univariada por ESI(-)FT-ICR MS, foram usadas 10 amostras de café Arábica (Coffea Arábica) adulteradas com diferentes proporções de café Conilon (Coffea Canephora), e 2 amostras puras (0% e 100 wt% de café Conilon) dopadas com um padrão interno de ácido esteárico de concentração 5.10-3 mol.L-1 (m/z 283 e 567). Para a análise de ATR-FTIR foram usadas uma maior variabilidade de adulterações, totalizando 21 amostras de blendas e 2 amostras puras (0% e 100 wt% de café Conilon), a partir dos resultados foi proposto um modelo de regressão por mínimos quadrados parciais (PLS). A partir dos resultados de ESI(-)FT-ICR foi possível identificar as principais espécies químicas presentes nas amostras de cafés, tais como: ácido quínico (m/z 191), ácido cafeoilquínico (m/z 353) e ácido feruloilquínico (m/z 367). O modelo de calibração univariada desenvolvido apresentou boa linearidade (R2 de 0,976) e limites de detecção e de quantificação de 0.2 e 0.3 wt%, respectivamente. O modelo PLS construído com dados ATR-FTIR resultou em um RMSECV de 5.7 wt% e RMSEP de 9.2 wt%, com coeficientes de determinação para validação cruzada e previsão de 0.9635 e 0.9295, respectivamente. Foram encontrados valores de repetibilidade e precisão intermediária de 4 wt% e 5 wt% para ESI(-)FT-ICR MS respectivamente, e 1,7 wt% para ambas as figuras de mérito nas análises de ATR-FTIR.