• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 538
  • 36
  • 5
  • 2
  • Tagged with
  • 584
  • 161
  • 129
  • 99
  • 99
  • 82
  • 80
  • 73
  • 71
  • 57
  • 57
  • 55
  • 51
  • 47
  • 45
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
221

AGrADC: uma arquitetura para implantação e configuração autônomas de aplicações em grades computacionais / AGrADC: an arquitecture for development and autonomic configuration of the aplications in grid computing

Franco, Sidnei Roberto Selzler 29 March 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-05T13:59:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 29 / Hewlett-Packard Brasil Ltda / A implantação e a configuração de aplicações em grades computacionais são tarefas exaustivas e sujeitas a erros, ainda representando elo fraco do ciclo de vida de aplicações desta natureza. Para lidar com o problema, este trabalho propõe AGrADC, uma arquitetura para instanciação sob demanda de aplicações em grades que incorpora características da Computação Autônoma.Esta arquitetura instrumenta o processo de desenvolvimento de aplicações para grades computacionais, oferecendo ferramentas para definir (a) um fluxo de implantação, respeitando pendências entre componentes que compõem a aplicação, (b) parâmentros de configuração e (c) ações a serem executadas diante de situações adversas tais como falhas. O resultado desse processo, materializado na forma de um conjunto de descrições, é repassado a um motor de instanciação, que passa utonomamente conduzir e gerenciar o processo de implantação e configuração / Deployment and configuration of grid computing applications are eshaustive and error-prone tasks, representing a weak link of the lifecycle of grid applications. To adress the problem, this work proposes AGrADC, an arquitecture to instantiate grid applications on demand, which incorporates features from the Autonomic Computing paradigm. This architecture improves the grid applications development process, providing tools to define (a) a deployment flow, respecting dependencies among components that comprise the application, (b) configuration paramenters and (c) actions to be executed when adverse situations like faults arise. The result of this process, materialized in the form of a set of descriptions, is delivered to an istantiation engine, which starts to autonomously conduct and manage the deployment and configuration process.
222

Reconhecimento de expressões de emoções na interação mediada por computador

Pasqualotti, Paulo Roberto 29 February 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-05T13:59:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No Processamento da Linguagem Natural (PLN) os avanços recentes na análise automática de texto conduziram ao surgimento de uma nova área que é o tratamento e reconhecimento dos aspectos subjetivos no texto, considerando fatores como opiniões, sentimentos, emoções e afetividade. Entre as aplicações dessa área podemos citar: medir o nível de satisfação de clientes, reconhecer a diferença entre emissão de opiniões e descrição de fatos, reconhecer perfil empreendedor e posturas interpessoais, identificar possibilidades de estados depressivos em pessoas, entre outras possibilidades, envolvendo a subjetividade. A pesquisa na área requer o desenvolvimento de métodos, recursos e técnicas, que, integrados, possibilitarão a sistemas computacionais serem capazes de manipular significado afetivo no discurso. Porém, por tratar-se de estudos recentes, os recursos ainda são bastante escassos para a língua portuguesa. Dessa forma, essa dissertação propõe o desenvolvimento de um léxico afetivo para a língua portuguesa, den / In the area of Natural Language Processing (NLP) the recent advances in text automatic analysis have led to the emergence of a new area which is the management and recognition subjective aspects in texts, considering factors such as opinion, sentiments, emotions and affection. Among the applications of this area we enumerate: to determine the client satisfaction level, to recognize the difference between opinion emission and description of facts, to recognize entrepreneur profile and interpersonal posture, to identify the possibility of depressive states in people, among other possibilities related to subjectivity. The research in this area requires the development of methods, resources and techniques, that, integrated, can make computational systems able to manage the affective meaning in discourse. However, since these studies are recent, the resources are scarce for the portuguese language. In this way, this dissertation proposes the development of an affective lexicon for the portuguese language, named W
223

Integramodel : um serviço de simulação de epidemias em grades computacionais

Gagliardi, Henrique Fabricio 15 June 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-02-04T21:45:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Henrique Fabricio Gagliardi.pdf: 10404769 bytes, checksum: 893188dca16784fd35a3b7cd133350b1 (MD5) Previous issue date: 2007-06-15 / O desenvolvimento de ferramentas para previsão e monitoramento do avanço de doenças infecto-contagiosas tornou-se atualmente uma necessidade por prover cenários e oferecer informações pertinentes à tomada de decisões por parte dos profissionais de saúde de maneira mais eficiente e eficaz. Diante disso, diversos modelos epidêmicos vêm sendo propostos, baseados em abordagens compartimentais (baseadas em equações diferenciais) ou baseadas no indivíduo (com uma rede local de contatos). Contudo, modelar a heterogeneidade das interações entre indivíduos ainda é um desafio para os epidemiologistas e, de fato, desenvolver modelos preditivos capazes de apresentar o comportamento de uma doença em particular baseado em dados reais ainda representa um desafio ainda maior. Além disso, um ambiente computacional robusto capaz de efetuar tais simulações também se torna uma necessidade nesse caso. Assim, a proposta deste trabalho é desenvolver um serviço de simulação para prever a dinâmica do espalhamento da dengue utilizando para tal uma plataforma de grades computacionais.
224

Um arcabouço cognitivamente inspirado para representação de conhecimento e raciocínio

Carbonera, Joel Luis January 2016 (has links)
Seres humanos são capazes de desenvolver complexas estruturas de conhecimento que podem ser utilizadas de modo flexível para lidar com o ambiente de maneira apropriada. Estas estruturas de conhecimento constituem um núcleo que suporta processos cognitivos, tais como a percepção, a categorização, o planejamento, etc. A Inteligência Artificial, enquanto área de investigação, ocupa-se de desenvolver meios que viabilizem a reprodução destas capacidades cognitivas em agentes artificiais. Por este motivo, a investigação de abordagens que permitam a representação de conhecimento de um modo flexível se revela altamente relevante. Com o objetivo de superar algumas das limitações típicas da teoria clássica, que é adotada por várias abordagens propostas na Inteligência Artificial, este trabalho propõe um arcabouço cognitivamente inspirado para representação de conhecimento e raciocínio que integra aspectos de três diferentes teorias cognitivas a respeito de como conceitos são representados na cognição humana: teoria clássica, teoria do protótipo e teoria do exemplar. O arcabouço resultante é capaz de suportar a composicionalidade, a tipicalidade, a representação de instâncias atípicas dos conceitos, e a representação da variabilidade de indivíduos classificados por cada conceito. Consequentemente, o arcabouço proposto também suporta raciocínio lógico e baseado em similaridade. As principais contribuições deste trabalho são a concepção teórica e a formalização de um arcabouço cognitivamente inspirado para representação de conhecimento e raciocínio. Uma outra contribuição deste trabalho é uma abordagem de raciocínio para classificação que utiliza a abordagem de representação de conhecimento proposta. Além disso, este trabalho também apresenta duas abordagens para seleção de exemplares representativos de cada conceito e uma abordagem para extração de protótipos de conceitos. Nesta tese também é apresentado um sistema para interpretação automática de processos deposicionais que adota o arcabouço proposto. Experimentos realizados em uma tarefa de classificação sugerem que o arcabouço proposto é capaz de oferecer classificações mais informativas que as oferecidas por uma abordagem puramente clássica. / Human beings can develop complex knowledge structures that can be used for dealing with the environment in suitable ways. These knowledge structures constitute a core that supports several cognitive processes, such as perception, categorization, planning, etc. The Artificial Intelligence, as a research field, aims at developing approaches for mimicking these cognitive capabilities in machines. Due to this, it is important to investigate approaches that allow representing the knowledge in flexible ways. In order to overcome some limitations of the classical theory of knowledge representation, which is adopted by several approaches proposed in the Artificial Intelligence field, this work proposes a cognitively-inspired framework for knowledge representation and reasoning which integrates aspects from three different cognitive theories about concept representation in the human cognition: classical theory, prototype theory and exemplar theory. The resulting framework can support compositionality, typicality, representation of atypical instances of concepts, and representation of the variability of the individuals classified by each concept. Consequently, the proposed framework also supports logical reasoning and similarity-based reasoning. The main contributions of this work are the formalization of a cognitively-inspired framework for knowledge representation and reasoning, two approaches for selecting representative exemplars of each concept and an approach of reasoning for classification that integrates logical reasoning and similarity-based reasoning and that is supported by definitions, prototypes and exemplars of concepts. This thesis also presents a system for automatic interpretation of depositional processes application that adopts the proposed framework. The experiments, which were performed on a classification task, suggest that the proposed framework provides classifications that are more informative than the ones provided by a classical approach.
225

Análise de sensibilidade do modelo de fluxos de detritos : Kanako-2D / Sensitivity analysis of debris flow model : Kanako-2D

Paixão, Maurício Andrades January 2017 (has links)
Por se tratar de um fenômeno complexo, a modelagem computacional tem sido utilizada na tentativa de simular o comportamento de fluxos de detritos. Um dos modelos computacionais é o Kanako-2D. O presente trabalho realizou análise de sensibilidade desse modelo em relação a alcance, área de erosão, área de deposição, área total atingida e largura do fluxo. Os valores dos parâmetros de entrada do Kanako-2D, cujas faixas de variação foram estabelecidas a partir de revisão bibliográfica, foram alterados individualmente enquanto os demais eram mantidos nos valores padrão do modelo. Os parâmetros analisados foram: diâmetro dos sedimentos, coeficiente de rugosidade de Manning, coeficiente de taxa de deposição, coeficiente de taxa de erosão, massa específica da fase fluida, massa específica do leito, concentração de sedimentos e ângulo de atrito interno. Foi utilizada uma vertente real com histórico de ocorrência de fluxos de detritos (bacia hidrográfica do arroio Böni, em Alto Feliz e São Vendelino/RS) e uma vertente hipotética com as mesmas características da vertente real para avaliar o efeito da topografia na propagação do fluxo. Também foram simuladas diferentes condições de terreno na propagação do fluxo de detritos. A sensibilidade do modelo foi quantificada a partir de três métodos: (a) análise por rastreamento, que indicou massa específica do leito, ângulo de atrito interno e concentração de sedimentos como os parâmetros que causam maior sensibilidade do modelo; (b) análise regional, indicando que os parâmetros massa específica do leito, ângulo de atrito interno e massa específica da fase fluida apresentaram maior sensibilidade do modelo; e (c) análise das variâncias, em que os parâmetros que mais causaram sensibilidade ao modelo foram coeficiente de taxa de erosão, diâmetro dos sedimentos e massa específica do leito. Os resultados apontaram que, de maneira geral, os parâmetros que geram maior sensibilidade no modelo são massa específica do leito, ângulo de atrito interno e concentração de sedimentos. As maiores variações relativas, no entanto, foram observadas nos parâmetros massa específica do leito, ângulo de atrito interno e massa específica da fase fluida. As maiores sensibilidades foram verificadas, em ordem decrescente, para área de erosão, área total, área de erosão, área de deposição, alcance e largura na vertente real e, para área total, alcance e largura na vertente hipotética. A condição de terreno que gerou maior alcance e área atingida foi de 45° de inclinação na encosta e 17° de inclinação na planície aluvial. / Due to a complex phenomenon, computational modeling has been used in an attempt to simulate the behavior of debris flows. One of the computational models is Kanako-2D. The present work carried out sensitivity analysis of this model in relation to length, erosion area, deposition area, total reached area and flow width. The values of the Kanako-2D input parameters, which ranges were established from literature review, were individually changed while the others were kept at the standard values of the model. The analyzed parameters were: sediment diameter, Manning roughness coefficient, coefficient of deposition rate, coefficient of erosion rate, mass density of the fluid phase, mass density of bed material, sediment concentration and internal friction angle. It was used a real slope-site with a history of occurrences of debris flow (Böni river basin in Alto Feliz and São Vendelino/RS) and a hypothetical slope-site with the same characteristics of the real one to evaluate the effect of the topography in the propagation of the flow. Different hillslope and alluvial fan conditions were also simulated in order to evaluate the length and reached area in the propagation of the flow. The sensitivity was quantified from three methods: (a) screening analysis, which indicated mass density of bed material, internal friction angle and sediment concentration as the parameters that cause bigger sensitivity in the model; (b) regionalized analysis, indicate that the parameters mass density of bed material, internal friction angle and mass density of the fluid phase showed higher sensitivity in the model; and (c) variances analysis, indicated that coefficient of erosion rate, sediment diameter and mass density of bed material showed higher sensitivity in the model. The results showed that, in general, the parameters that generate the higher sensitivity in the model are mass density of bed material, internal friction angle and concentration. The largest relative variation, however, in the response of the model were observed in mass density of bed material, internal friction angle and mass density of fluid phase. In descending order, the highest sensitivities were verified for erosion area, total area, deposition area, length and width for the real slope-site and total area, length and width for the hypothetical slope-site. The terrain condition that generated the largest length and reached area was 45° on the hillslope and 17º on the alluvial fan.
226

Xenia: um sistema de segurança para grades computacionais baseado em cadeias de confiança / Xenia: a security system for grid computing based on trust chains

Pinheiro Junior, José de Ribamar Braga 18 April 2008 (has links)
Os Sistemas de Grades Computacionais são intrinsecamente mais vulneráveis às ameaças de segurança que os Sistemas tradicionais, uma vez que abrangem um grande número de usuários e os recursos e as aplicações são geridas por diferentes domínios administrativos. A autenticação e a autorização são fatores imperativos para os Sistemas de Grade Computacional. Da mesma forma, a escalabilidade e a distribuição de dados vêm também sendo objeto de estudo de vários pesquisadores da área. Os serviços providos pelas Grades Computacionais devem evitar implementações centralizadas pela dificuldade do gerenciamento global. Outro importante requisito das Grades Computacionais é prover mecanismos para a delegação de direitos de acesso aos recursos. O proprietário do recurso deve ser capaz de delegar permissões para outro usuário, talvez por um tempo limitado, com base na confiança que possui neste. No entanto, a delegação deve ser usada com cuidado, pois uma longa cadeia de delegações poderia conduzir a uma utilização abusiva dos recursos pelos usuários maliciosos. Para tratar os principais requisitos de segurança das Grades Computacionais, desenvolvemos uma Arquitetura de Segurança denominada Xenia. Esta arquitetura é baseada em SPKI/SDSI, um modelo de segurança flexível, extensível e descentralizado que fornece autenticação, confidencialidade e controle de acesso. Propusemos uma extensão ao modelo SPKI/SDSI baseada em lógica subjetiva para representar relações de confiança entre indivíduos. / Grid Computing Systems are inherently more vulnerable to security threats than traditional systems, since they potentially encompass a large number of users, resources, and applications managed by different administrative domains. Authentication and authorization are imperative for grid systems. Since scalability and distribution are major concerns on grid environments, those services implementations should avoid centralized solutions. Another relevant requirement to consider is the provision of mechanisms for delegating access rights, since they minimize the overhead of grid administrators on providing access rights to grid resources. The owner of an access right should be able to delegate permissions to another user, maybe for a limited time, based on his trust on that user. However, delegation must be used with care. A long chain of delegations could lead to improper use of resources by malicious users. Confidentiality and integrity are also important security requirements for many grid applications. To address these problems, we designed a Security Architecture for Grid Systems named Xenia. This architecture is based on SPKI/SDSI, a flexible and extensible decentralized security model that provides authentication, confidentiality, and access control. We proposed an extension to the SPKI/SDSI model to represent trust relations between subjects based on subjective logic.
227

Programas computacionais como ferramentas socioculturais na formação inicial de professores de química: da aprendizagem de conceitos químicos à prática pedagógica / Computer programs as sociocultural tools in the beginning teachers\' education of chemistry: from learning of chemistry concept to educational practice

Pinheiro, Dulce Raquel Pereira Oliveira 27 January 2017 (has links)
Este trabalho foi desenvolvido na Universidade Federal do Amazonas (UFAM), tendo como sujeitos de pesquisa alunos do curso de Licenciatura em Química. O objetivo foi investigar de que forma uma estratégia didática com o uso de programas computacionais pode contribuir para o aprendizado de conceitos relacionados a equilíbrio ácido-base e para a prática pedagógica de professores em formação inicial. Os programas computacionais e os conceitos químicos foram compreendidos como ferramentas socioculturais. A pesquisa foi desenvolvida em três etapas: 1) acompanhamento o projeto de Ensino de Química, 2) desenvolvimento e aplicação de um curso para os licenciandos e 3) proposta da inserção de um dos programas computacionais no Projeto de Ensino de Química pelos licenciandos. Os instrumentos de coleta de dados utilizados foram entrevistas semiestruturadas, pesquisa documental, fichas de atividade e videogravação. O Projeto Pedagógico do curso e os Planos de Ensino das disciplinas foram os documentos analisados na pesquisa. Os documentos e as transcrições das entrevistas e videogravações foram analisadas por meio da Análise Textual Discursiva à luz da Teoria da Ação Mediada. Observou-se que uma metodologia que emprega recursos tecnológicos no processo de ensino e aprendizagem de química desperta o interesse do licenciando e proporciona diferentes interações dialógicas, contribuindo para a significação de conceitos químicos e para a reflexão sobre a prática pedagógica da qual ele fará uso. Contudo, os dados apontam ainda que o Curso de Licenciatura em Química da UFAM tem contribuído pouco para proporcionar uma interação entre os programas computacionais e os licenciandos a ponto de estimulá-los a se apropriar dessas ferramentas culturais e a inseri-las em suas práticas de ensino. / This thesis was developed in the Federal University of Amazonas (UFAM) and it had students of the Licentiate Degree in Chemistry as investigation subjects. The goal was to investigate how educational strategy using programs could contribute for learning concepts related to acid-base balance and for educational practice of early-career teachers. Programs and chemistry concepts were understood as sociocultural tools. The research was developed in three steps: 1) the follow-up of the Chemistry Education Plan, 2) the development and application of a course to licentiates and 3) the proposal to include one of the programs in the Chemistry Learning Project. Semi structured interviews, documental research, activity files and videorecordings were used as data collect tools. The Pedagogic Project and Subject\'s Education Plans were the analyzed documents in this thesis. The documents, the interview\'s transcriptions and the videorecordings were analyzed by the Discursive Textual Analysis according to the Mediated Action . It was observed that the employment of a methodology that uses technological resources in the chemistry teaching and learning process increases licentiates\' interest and provides different dialogic interactions, contributing to reframe concepts and reflections about the educational practice that they will use. Data also show that the Licentiate Degree in Chemistry of UFAM has contributed little to provide an interaction between computer programs and licentiates so as to stimulate them to appropriate these cultural tools and to insert them into their teaching practices.
228

Simulação de partículas carregadas em fluídos ionizados

Paiva Filho, Manoel da Rosa January 2010 (has links)
Neste trabalho abordam-se alguns aspectos numéricos relacionados ao movimento de uma partícula carregada em um fluido ionizado, constituindo assim o fenômeno de eletroforese. A equação de Navier-Stokes governa a hidrodinâmica do sistema, sendo atribuída a esta um termo forçante relacionado a equação de Poisson-Boltzmann que descreve a interação com o campo elétrico. A simulação foi realizada utilizando a linguagem Fortran 90 e as discretizações foram feitas pelo método de diferenças finitas junto as equações governantes. Para descrever a posição da partícula foi usada a técnica de fronteira virtual, onde são criados pontos lagrangeanos sobre,o contorno da partícula formando uma espécie de segunda malha. Foram feitos testes com objetivo de validar as equações governantes e identificar a influencia das condições de contorno direção da partícula. / In this work we study some of the numerical aspects related to the motion of a charged particle in an ionized fluid, known as the phenomenon of electrophoresis. The Navier-Stokes equations models the ,hydrodynamics of the system, with the addition of a forcing term, related to the Poisson-Boltzmann equation, which describes the interaction of the electric field. The simulation was performed using Fortran 90 and discretizations were made by the method of finite differences applied to the governing equations. To describe the position of the particle the technique of virtual boundary is used, where Lagrangean points are created around the circumference of the particle forming a sort of second mesh. Tests were made with the objective of validating the governing equations and to identify the influence of boundary conditions in the direction of the particle.
229

Métodos para estimar prevalências ajustadas

Barbieri, Natália Bordin January 2016 (has links)
Objetivo: Apresentar e discutir métodos para estimar prevalências ajustadas em pesquisas clínicas e epidemiológicas, bem como desenvolver rotinas computacionais em SAS e R. Métodos: No contexto de estudo transversal, foi simulada uma amostra de 2.000 observações independentes, considerando o desfecho dicotômico diabetes, sexo como a variável de exposição e idade como variável de ajuste. As estimativas de prevalências ajustadas (IC 95%) foram estimadas pelos métodos de predição condicional e marginal, utilizando as rotinas desenvolvidas em SAS e R. O método Delta foi usado para construir os intervalos de confiança. Os resultados foram comparados com aqueles do SUDAAN (SAS-Callable), Stata e a macro %ADJ_PROP (SAS). Resultados: No exemplo simulado, 68,2% são do sexo feminino e a idade média (DP) foi 57,6 (5,0) anos, sendo 54,2 (3,9) anos em homens e 59,2 (4,6) anos em mulheres. A estimativa da prevalência global do desfecho foi de 25,3% (IC 95%:23,4-27,3); sendo 13,8% (IC 95%:11,7-16,7) e 30,7% (IC 95%:28,3-33,2), respectivamente para homens e mulheres. As estimativas de prevalências ajustadas por idade, por meio do método de predição condicional, foram de 19,6% (IC 95%:16,2-23,6) para homens, e 23,6% (IC 95%:21,2-26,1) para mulheres. Pelo método de predição marginal, as estimativas foram de 22,4% (IC 95%:18,7-26,5) para homens, e 26,3% (IC 95%:24,1-28,6) para mulheres. Conclusão: A discrepância entre as estimativas não ajustadas é devida ao confundimento pela idade. Estimativas livres de confundimento podem ser obtidas por meio das prevalências ajustadas pela idade. No entanto, a estimativa pelo método de predição condicional não engloba a prevalência global. Em virtude disso, o método de predição marginal é, geralmente, mais adequado. A rotina desenvolvida na versão para R é uma alternativa aos softwares comerciais. / Objective: To present and discuss methods to estimate adjusted prevalences for clinical and epidemiological research, and develop computational routines in SAS and R. Methods: In the context of cross-sectional study, it was simulated a sample of 2,000 independent observations, considering the dichotomous outcome diabetes, sex as the exposure variable and age as an adjustment variable. Adjusted prevalences were estimated by the conditional and marginal methods, using routines developed in SAS and R. Confidence intervals were constructed using the Delta method. The results were compared with those of the SUDAAN (SAS-callable), Stata and macro %ADJ_PROP (SAS). Results: In simulated example, 68.2% are female and the mean (SD) age was 57.6 (5.00) years old, being that 54.2 (3.94) years for men and 59.2 (4.60) years in women. The estimated global prevalence of outcome was 25.3% (CI 95%: 23.4-27.3) and 13.8% (CI 95%: 11.7-16.7) and 30.7% (CI 95%: 28.3-33.2), respectively for men and women. Estimates of adjusted prevalence for age, through the conditional method, were 19.6% (CI 95%: 16.2-23.6) for men, and 23.6% (CI 95%: 21,2-26.1) for women. For marginal method, the estimates were 22.4% (CI 95%: 18.7-26.5) for men and 26.3% (CI 95%: 24.1-28.6) for women. Conclusion: The observed discrepancy in estimates by sex, unadjusted, can be attributed to confounding due to difference in age distribution between sexes. Comparable estimates (without confounding) of the prevalences can be obtained through prevalence adjusted for age. However, the estimate for the conditional method does not comprise the global prevalence. As a result, the marginal method is in general more suitable. The developed routines can be useful for estimating adjusted prevalences, particularly the R version (an alternative to commercial software).
230

Aplicação de algoritmos de mineração de dados para classificação molecular de Leptospira spp / Application of data mining algorithms for molecular classification of Leptospira spp

Labonde, Julia 19 February 2016 (has links)
Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2017-08-30T14:07:13Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_julia_labonde.pdf: 678599 bytes, checksum: d233ff13ddb416df716b9ee25c98978d (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-09-01T19:13:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 dissertacao_julia_labonde.pdf: 678599 bytes, checksum: d233ff13ddb416df716b9ee25c98978d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-09-01T19:14:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 dissertacao_julia_labonde.pdf: 678599 bytes, checksum: d233ff13ddb416df716b9ee25c98978d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-01T19:14:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 dissertacao_julia_labonde.pdf: 678599 bytes, checksum: d233ff13ddb416df716b9ee25c98978d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / A leptospirose é uma doença infecciosa de importância mundial, que afeta humanos e animais, causada por espiroquetas patogênicas pertencentes ao gênero Leptospira. Para a área epidemiológica e clínica é fundamental que os laboratórios tenham a capacidade de identificar e classificar com precisão as espécies de Leptospira que causam doença, para que sejam tomadas decisões coerentes com relação à saúde pública. Neste estudo, nós relatamos pela primeira vez a utilização de ferramentas de mineração de dados para fins de classificação de cepas do gênero Leptospira. Vinte e cinco loci referentes a 15 genes foram selecionadas e analisados em 600 genomas rascunho de Leptospira, com o propósito de buscar polimorfismos que pudessem ser utilizados na classificação de cada espécie. Para isso, foram utilizados os algoritmos baseados em mineração de dados C4.5, Naive Bayes e Support Vector Machine. Todos os algoritmos computacionais de mineração de dados utilizados neste trabalho apresentaram valores de acurácia acima de 93% para classificação de Leptospira a nível de espécie, no entanto, o algoritmo C4.5, além de atingir a melhor acurácia de classificação (95.6%), também apresentou os genes que contribuíram para o resultado final da análise. O mesmo banco de dados genômicos utilizado pelos algoritmos computacionais foi submetido a testes com a metodologia MLST – técnica mais utilizada para classificação molecular de espécies deste gênero – no entanto, nenhum dos testes apresentou acurácia superior a 80%. Visto o algoritmo de mineração de dados C4.5 atingir uma acurácia superior aos outros algoritmos, pode-se concluir que C4.5 é uma ferramenta de mineração de dados bastante promissora para classificar espécies de Leptospira. / Leptospirosis is an infectious disease of global importance that affects humans and animals caused by pathogenic spirochetes belonging to the genus Leptospira. For epidemiological and clinical areas, it is essential that laboratories have the ability to identify and classify accurately species of Leptospira that cause disease, to take decisions consistent with respect to public health. In this study, we report for the first time the use of data mining tools for the purposes of strain classification of the genus Leptospira. Twenty-five loci related to 15 genes were selected and analyzed in 600 Leptospira draft genomes in order to search polymorphisms that could be used for the classification of each species. For this, data mining-based algorithms - C4.5, Naive Bayes and SVM - were used. All data mining computational algorithms used in this study showed accuracy levels above 93% for Leptospira classification species, however, the C4.5 algorithm achieve the best accuracy rating (95.6%) and presented the genes that contributed to the final result of the analysis. The same genomic database used by computer algorithms has been tested with the MLST methodology – most used technique for molecular classification of species of this genus - however, none of the tests show accuracy higher to 80%. Because data mining algorithm C4.5 achieve better accuracy than other algorithms, it can be concluded that C4.5 is a very promising data mining tool to classify species of Leptospira.

Page generated in 0.0801 seconds