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Aplicação de técnicas de engenharia de software no desenvolvimento de um sistema para análise de matrizes químicas por meio de imagem digital

Vieira, Anacília Maria Cavalcante De Almeida Palmeira 31 July 2015 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-12-01T20:29:53Z No. of bitstreams: 1 Dissertação -Anacília Maria Cavalcante de Almeida Palmeira Vieira.pdf: 2539964 bytes, checksum: bfdaceed13c905ce911fac663f53e29c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-12-02T15:45:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação -Anacília Maria Cavalcante de Almeida Palmeira Vieira.pdf: 2539964 bytes, checksum: bfdaceed13c905ce911fac663f53e29c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-12-02T15:48:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação -Anacília Maria Cavalcante de Almeida Palmeira Vieira.pdf: 2539964 bytes, checksum: bfdaceed13c905ce911fac663f53e29c (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-02T15:48:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação -Anacília Maria Cavalcante de Almeida Palmeira Vieira.pdf: 2539964 bytes, checksum: bfdaceed13c905ce911fac663f53e29c (MD5) Previous issue date: 2015-07-31 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The use of computer tools in business, science and engineering made it become essential nowadays and enabled the creation of new technologies in the field of administration, medicine, telecommunication and others. Each day new systems are implanted in order to improve more and more the users’ dealing with it. Nevertheless, most of them have a generalized operation system that not always meets the user’s specific needs. This way to have a computerized system and that can meet each user’s peculiarities, it is necessary to manufacture it based on software engineering guideline. Besides the application of software engineering technique, it was necessary to acquire specific knowledge about image processing and analytic chemistry. The conducted research outcome, contemplates a digital image system (SISAID) which entailed acquisition technique and image processing of chemical matrices, the acquisition of image was gotten by the use of webcam in the titulação process (chemical process) that interacts with the system and the system makes the image processing, based on color model RGB (Red, Green, Blue) the system also carries out the calculation of medium values of RGB and the NORMA of the vector RGB, those which make the image analysis possible through the titulação bend created by the system. Plus one can verify the obtained results through SISAD with results gotten, digital image analysis system used in the chemical laboratory of Instituto de Ciências Exatas e Tecnologia and it was noticed that the SISAID can bring about more efficiency regarding time. As the user got through the operation of the system in a shorter time, and was able to get satisfactory results concerning the titulação bend. / O uso de ferramentas computacionais nos negócios, ciência e engenharia passou a ser indispensável nos dias atuais e possibilitou a criação de novas tecnologias para as áreas de administração, medicina, telecomunicações, e em quase todas as áreas da ciência. A cada dia novos sistemas são implantados para facilitar ainda mais a vida dos usuários. No entanto, a maioria deles tem uma funcionalidade generalizada, de modo que nem sempre atendem às necessidades específicas dos usuários. Sendo assim, para que se tenha um sistema computadorizado e que atenda às particularidades dos usuários é necessário concebê-lo com base nas diretrizes da Engenharia de software. Além da aplicação de técnicas de engenharia de software, foi necessário também adquirir conhecimentos específicos sobre processamento de imagens e química analítica. O resultado da pesquisa desenvolvida contempla um sistema de análise de imagem digital (SISAID) que envolveu técnicas de engenharia de software na aquisição e processamento de imagem de matrizes químicas. A aquisição da imagem foi realizada utilizando uma webcam no processo de titulação (processo químico) que interage com o sistema, e este realiza o processamento das imagens com base no modelo de cores RGB (Red, Green, Blue). O sistema também efetua o cálculo dos valores médios de RGB e a NORMA do vetor RGB, os quais possibilitam a análise da imagem por meio da curva de titulação gerada pelo sistema. Além disso, verificaram-se os resultados obtidos pelo SISAID com resultados obtidos pelo sistema de análise de imagem digital utilizado no laboratório de química do Instituto de Ciências Exatas e Tecnologia de Itacoatiara e constatou-se que o SISAID oferece mais eficácia em relação ao tempo, visto que o usuário realizou as funcionalidades do sistema em um tempo muito inferior e alcançou resultados satisfatórios em relação à curva de titulação.
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Datsina Damro: um estudo do casamento entre os Xavante de Marãiwatsédé

Ramires, Marcos de MIranda 10 August 2015 (has links)
Submitted by Inês Marinho (bele_ballet@hotmail.com) on 2016-06-24T13:49:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcos Miranda Ramires.pdf: 4343319 bytes, checksum: 58911a457bd857500e25675b28d01258 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-05T15:55:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcos Miranda Ramires.pdf: 4343319 bytes, checksum: 58911a457bd857500e25675b28d01258 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-05T16:00:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcos Miranda Ramires.pdf: 4343319 bytes, checksum: 58911a457bd857500e25675b28d01258 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T16:00:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcos Miranda Ramires.pdf: 4343319 bytes, checksum: 58911a457bd857500e25675b28d01258 (MD5) Previous issue date: 2015-08-10 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This paper focuses its attention on the marriage alliance among the Xavante people living in Indigenous Land Marãiwatsédé, located in eastern Mato Grosso, far about 1,200 km from Cuiabá. This collective speaks a Jê language and inhabits a transition area between the Cerrado and Amazon biomes. I seek here to apply a method which, based on the assumptions of the Lévi-Strauss's kinship theory, articulated with the basic notions of graph theory, performs a thorough scan of empirical network alliance. This method also postulates which categories, rules and practices, analytical plans traditionally used in kinship studies, are taken as impact levels of tying kinship term, the exchange. / O presente trabalho centra sua atenção na aliança de casamento entre os Xavante residentes na Terra Indígena Marãiwatsédé, localizada no leste mato-grossense, distante cerca de 1.200 km de Cuiabá. Esse coletivo fala uma língua Jê e habita uma área de transição entre os biomas do Cerrado e Amazônia. Busco aqui aplicar um método que, partindo de pressupostos da teoria do parentesco de Lévi-Strauss, articulado a noções elementares da teoria dos grafos, realiza uma varredura exaustiva da rede empírica de aliança. O método também postula que categorias, normas e práticas, planos analíticos tradicionalmente usados nos estudos de parentesco, sejam tomados como níveis de repercussão do termo subordinante do parentesco, a troca.
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Sincronização fótica de um roedor subterrâneo: um estudo cronobiológico de campo e de laboratório do tuco-tuco (Ctenomys cf. knighti) / The photic synchronization of a subterranean rodent: a field/lab chronobiological study of the tuco-tuco (Ctenomys cf. knighti)

Danilo Eugênio de França Laurindo Flôres 07 November 2011 (has links)
As variáveis biológicas de muitos seres vivos apresentam ritmos diários, em paralelo ao dia e à noite do ambiente. A maioria desses ritmos não é uma mera reação aos estímulos cíclicos do ambiente: eles são ritmos circadianos gerados endogenamente por um temporizador interno - o oscilador circadiano - que sustenta uma ritmicidade com período diferente de 24 horas na ausência de pistas ambientais, mas se sincroniza para um período de 24 horas quando exposto ao ambiente cíclico. Em mamíferos, o oscilador circadiano se localiza no cérebro e pode ser sincronizado pelo ciclo diário de claridade e escuridão (ciclo CE) do dia e da noite transmitido através das retinas. Animais subterrâneos passam boa parte do tempo abaixo da terra, onde as condições ambientais variam menos que na superfície. Em razão disso, questiona-se até que ponto estes animais mantêm ritmos circadianos e se seus osciladores circadianos se baseiam no ciclo CE para se sincronizar com o ambiente. Procuramos responder essas questões nos roedores subterrâneos da espécie Ctenomys cf. knighti (tuco-tucos). Em campo, realizamos observações visuais diretas para registrar o padrão temporal de exposição à luz. Em laboratório, construímos a Curva de Resposta de Fase (CRF), que consiste em medir indiretamente a resposta do oscilador circadiano a estímulos luminosos em diferentes momentos do dia. Por fim, recorremos a simulações computacionais de um modelo matemático de oscilador, para integrar os dados anteriores. Verificamos, em campo, que os tuco-tucos se expõem, diariamente, a pulsos de luz irregularmente distribuídos nas horas claras do dia levantando alguns questionamentos sobre sua capacidade como sincronizador dos ritmos em campo. Contudo, a CRF nos indicou que o sistema circadiano dos tuco-tucos responde a estímulos luminosos de forma semelhante aos animais não-subterrâneos. Nós verificamos 3 hipóteses: ou a informação da exposição à luz em campo é suficiente para sincronizar o oscilador circadiano, apesar da aparente irregularidade; ou a CRF do tuco-tuco possui alguma característica que facilita a sincronização pelo regime observado de exposição à luz; ou seu sistema circadiano se baseia em outra pista temporal do ambiente para se manter sincronizado. Nossas simulações computacionais indicaram que a primeira hipótese é a mais provável, visto que os padrões de exposição à luz simulados, como aqueles observados em campo, com o mínimo de informação temporal, ainda assim são suficientes para sincronizar os osciladores. Em conjunto, nossos dados indicam que o ciclo claro-escuro tem um papel importante na sincronização dos ritmos circadianos dos tuco-tucos na natureza. / Daily rhythms are found in the biological variables of many organisms, in parallel to the environmental day and night. Most of those rhythms are not mere reactions to the cyclic stimulus of the environment. They are actually circadian rhythms, endogenously generated by an internal timer, the circadian oscillator, which sustains a non-24-hour rhythm under constant conditions, but is synchronized to a 24-hour period when exposed do a cyclic environment. In mammals, this oscillator is located in the brain, and can be synchronized by the daily light-dark cycle (LD cycle) of day and night. Subterranean animals remain most of the time in an underground habitat, where environmental conditions vary less markedly than aboveground. Therefore, there are doubts whether these animals maintain circadian rhythms and whether their circadian oscillators rely on the LD cycle for environmental synchronization. We attempted to answer those questions in subterranean rodents of the species Ctenomys cf. knighti (tuco-tucos). In the field, we performed direct visual observations to assess their temporal pattern of light-exposure. In the lab, we build the Phase Response Curve (PRC), which consists in an indirect measurement of the circadian oscillator responses to light stimuli applied at different times of the day. Finally, computer simulations of an oscillator model were used to integrate these previous data. We verified that tuco-tucos expose themselves to light pulses that are irregularly distributed through day-light hours, raising some questions about its validity as an environmental synchronizer. However, the PRC results indicated that the tuco-tucos circadian system responds to light stimuli in a way similar to non-subterranean animals. We then verified three hypothesis: either the light-exposure temporal information was enough for the synchronization of the circadian system, despite its apparent irregularity; or the tuco-tuco\'s PRC present some feature that facilitates the synchronization by the observed light-exposure regimen; or the tuco-tuco\'s circadian system rely on another environmental temporal cue to maintain its synchronization. Our computer simulations support the first hypothesis, given that the simulated regimens, despite being little informative in the temporal sense, were still sufficient to synchronize the simulated oscillators. Together, our data indicate that the light-dark cycle plays an important role in the synchronization of the tuco-tucos\' circadian rhythms in nature.
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Elaboração de atividades de ensino de funções utilizando recursos computacionais no Ensino Médio / Developing teaching activities of functions using technological resources in high school

Daniela de Morais Siqueira 17 April 2013 (has links)
Este projeto de pesquisa tem como foco as atividades para o ensino de funções no Ensino Médio com a utilização dos recursos tecnológicos do software Geogebra. O objetivo é compreender as manifestações dos alunos ao realizarem atividades de funções com o uso de recursos computacionais. Foram elaboradas atividades de ensino sobre o conceito e características das funções constante, linear, afim, quadrática, exponencial e logarítmica, para os primeiros anos do Ensino Médio de uma escola da rede estadual de São Paulo. A metodologia utilizada é a da pesquisa qualitativa; os dados coletados foram o registro escrito dos alunos e as observações do diário de bordo da pesquisadora. Os resultados observados indicam que, embora os alunos apresentem dificuldades no conceito de função e suas peculiaridades, o uso do software proporciona uma melhor compreensão na análise e interpretação dos gráficos. O trabalho em grupo colaborou nas relações interpessoais alunoaluno e o uso de recursos computacionais trouxe novo estímulo ao processo ensinoaprendizagem. A pesquisa indicou que o professor, ao propor novas mediações e atividades de ensino, tem necessidade de refletir e reorganizar sua prática / This research project focuses on activities for teaching functions at High School with the use of technological resources software Geogebra. The goal is to understand the response of the students in performing activities function with the use of technological resources. This research covers learning activities about the concept and characteristics of functions constant, linear, affine, quadratic, exponential and logarithmic, for the first years of secondary education at High School of the state of São Paulo. The methodology used is qualitative research the data collected is the written record of the students and the observations of the researcher\'s logbook. The results indicate that while students have difficulties in the concept of function and its peculiarities the use of the software provides a superior understanding in the analysis and interpretation of graphs. The working group collaborated in interpersonal relationships and student-student use of technological resources brought new stimulus and understanding to the teaching-learning process. In addition, the survey indicated that the teacher, when proposing this new mediations and teaching activities needs to reflect and reorganize his instruction procedures
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Computational modeling to describe the dynamics of fall armyworm Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) in Bt crop areas / Modelagem computacional para descrever a dinâmica populacional de Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) em áreas com cultivos Bt

Adriano Gomes Garcia 27 October 2017 (has links)
Spodoptera frugiperda is one of the main insect pests of the New World, and causes extensive damage to economically important crops such as cotton and corn. One of the most common control strategies is the use of Bt plants; however, their intense and indiscriminate use has led to the evolution of resistance in some populations. The establishment of a refuge can be a viable option to delay this process. Refuges consist of areas where non-Bt crops are planted, in order to provide susceptible insects to the population. In this study, I initially developed a model to describe the evolution of resistance of fall armyworm populations in different refuge configurations (seed mixture, blocks, and strips) and sizes (20% - 50%), considering the larval movement. I demonstrated that with a seed mixture, in most cases, the higher the rate of larval movement, the higher the proportion of resistant insects in the population, regardless of the type of resistance tested; meanwhile, strip configurations showed the opposite trend. In the second part of this study, I obtained data to validate the proposed model. The development of the fall armyworm on corn leaves was determined at five constant temperatures ranging from 14°C to 30°C. These data were also used to estimate the number of generations of fall armyworms at 42 locations in the state of Florida, from 2006 to 2016, which were interpolated and represented on maps, using GIS (Geographic Information System). I observed that counties farther south had the highest numbers of generations, and that fall armyworms should be able to overwinter as far north as ~29°N. Using the data obtained in the experiment, a new model was proposed, covering a wider range of conditions and allowing the user to define the crop area, the thermal requirements of the population studied, the viability and oviposition functions, the migration rate, the rate of larval movement and the frequency of alleles for resistance. The model was verified with monitoring data collected in a crop area in Florida from 2012 - 2015, only 70 km from the area that provided the population for the experiment. I also used the model to estimate the number of adults for 2016 and for two hypothetical situations that considered possible scenarios involving global warming (mean temperatures in 2016 + 1°C and + 2°C). The model succeeded in fitting the monitoring data, and indicated that the simulated increases in mean temperature could produce outbreaks nearly twice as large as the levels of fall armyworm estimated for 2016. The model can be used to estimate the population dynamics of S. frugiperda in a particular area, according to the crop composition and disposal, to investigate the effects of temperature changes on the levels of fall armyworm populations, to define appropriate refuge areas in order to manage the evolution of insect resistance, and to define the best periods for plantation and harvesting during the year to reduce pest populations, among others. / Spodoptera frugiperda é um dos principais insetos-praga do hemisfério ocidental, causando diversos danos a cultivos de interesse econômico, como milho e algodão. Uma das estratégias mais comuns de controle é o uso de plantas Bt, contudo sua aplicação intensa e indiscriminada levou à evolução de resistência em algumas populações. O estabelecimento de refúgio pode representar uma opção viável para atrasar esse processo. Refúgios são áreas nas quais cultivos não-Bt são plantados de forma a fornecerem insetos suscetíveis para a população. Neste estudo, eu desenvolvi inicialmente um modelo para descrever a evolução de resistência de populações de S. frugiperda em diferentes configurações de refúgio (mistura de sementes, blocos e faixas) e tamanhos (20 - 50%), considerando o movimento larval. Eu demonstrei que para a mistura de sementes, na maioria dos casos, maiores taxas de movimentação larval implicavam em maiores proporções de insetos resistentes na população, independente do tipo de resistência testada, enquanto áreas com configurações em faixas apresentaram tendência oposta. Na segunda parte deste trabalho, eu obtive dados para validar o modelo proposto. O desenvolvimento de S. frugiperda em folhas de milho foram determinadas em 5 temperaturas constantes variando de 14°C a 30°C. Estes dados também foram utilizados para estimar o número de gerações do inseto em 42 localizações no estado da Flórida de 2006 a 2016, que foram interpolados e representados em mapas, utilizando SIG (Sistema de Informações Geográficas). Eu observei que condados mais ao sul apresentaram maior número de gerações e que S. frugiperda é capaz de passar o inverno abaixo de latitudes ~29°N. Utilizando os dados obtidos no experimento, um novo modelo foi proposto, considerando um intervalo maior de condições e permitindo ao usuário definir a área de cultivo, as exigências térmicas da população estudada, as funções de oviposição e viabilidade, a taxa de migração, a taxa de movimentação larval e a frequência do alelo de resistência. O modelo foi verificado com dados de monitoramento de 2012 a 2015, coletados em uma área de cultivo localizada na Flórida, distante apenas 70 km da área que forneceu a população para o experimento laboratorial. Eu também utilizei o modelo para estimar o número de adultos para 2016 e para duas situações hipotéticas que consideraram possíveis cenários envolvendo o aquecimento global (médias de temperaturas de 2016 + 1°C e + 2°C). O modelo se ajustou aos dados de monitoramento com sucesso e indicou que os aumentos simulados na temperatura média poderiam produzir surtos quase duas vezes maiores que os níveis de S. frugiperda estimados para 2016. O modelo pode ser usado para estimar a dinâmica populacional de S. frugiperda em uma determinada área de acordo com a composição e disposição dos cultivos, investigar os efeitos das mudanças de temperatura nos níveis populacionais, definir áreas de refúgio apropriadas para o manejo da evolução de resistência, definir os melhores períodos para plantação e colheita durante o ano de forma a reduzir a população da praga, entre outros.
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A rede Meh: em busca de estruturas de troca e parentesco Kraho / The meh network: in search of Kraho exchange and kinship structures

Carlos Melo de Oliveira Paulino 20 September 2016 (has links)
Esta dissertação constitui um experimento na aplicação de ferramentas computacionais para análise de uma rede empírica de parentesco do povo indígena Kraho. A rede é formada por relações de filiação, casamento, onomástica e amizade formal. O experimento se baseia amplamente em dados etnográficos sobre os Kraho e os discute no contexto de teorias antropológicas do campo de estudos do parentesco, em especial da Teoria da Aliança. / This dissertation is an experiment in the application of computational tools for the analysis of a empiric kinship network of the Kraho indigenous people. The network is formed by relations of filiation, marriage, name-giving and formal friendship. The experiment is largely based in ethnographic data about the Kraho and discusses them in light of anthropological theories of the kinship studies field, especially the Alliance Theory.
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Estudo comparativo de ferramentas computacionais para modelagem geométrica e cubagem de maciços rochosos

CARMO, Ítalo Marcolino do 29 October 2013 (has links)
Submitted by Israel Vieira Neto (israel.vieiraneto@ufpe.br) on 2015-03-03T18:20:06Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Ítalo final.pdf: 5327201 bytes, checksum: 88970597f61fdd4e128178674c2d9ed7 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-03T18:20:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Ítalo final.pdf: 5327201 bytes, checksum: 88970597f61fdd4e128178674c2d9ed7 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-10-29 / A mineração normalmente tem fase inicial onde se desenvolve uma análise prévia da quantidade e qualidade do minério passível de ser extraído de um modo rentável. Neste contexto, é fundamental a elaboração de um modelo geomorfológico representativo do corpo mineral, que reflita de forma conveniente as suas características geológicas e geométricas. Nessa fase inicial a precisão dos resultados, em função da carência de dados de campo e necessidade de custos reduzidos, não é normalmente o fator decisivo na seleção dos alvos de pesquisa geológica de detalhe, admitindo-se variações de até 30% nos valores determinados. Consequentemente as incertezas são grandes e refletem a carência de informações associadas ao baixo investimento que se realiza nessa etapa. O desenvolvimento contínuo das ferramentas computacionais, em especial as ferramentas de computação gráfica, permite que modelos geométricos das ocorrências minerais possam ser elaborados de uma maneira rápida e precisa com baixo custo operacional. O objetivo desta dissertação é desenvolver uma metodologia para modelagem geométrica de maciços rochosos a partir do uso de softwares de baixo custo e ilustrar na prática a aplicação da mesma para determinação do volume de maciços rochosos. Como caso de estudo, foi feita a modelagem de um maciço rochoso localizado no distrito de Jussaral, a sudoeste do município do Cabo de Santo Agostinho. Tal modelagem foi construída mediante a elaboração de um modelo de blocos do maciço rochoso a partir de 3 modelos digitais de terreno (DTM) elaborados com 3 metodologias distintas e comparação dos volumes do maciço rochoso em uma área pré-determinada (área base) e cubagem de reservas em uma cava hipotética (cava experimental) Os resultados foram comparados em termos de diferença percentual em relação ao dado mais confiável obtido em ortofotocartas confeccionadas pela Fundação de Desenvolvimento da Região Metropolitana do Recife – FIDEM.
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[en] A GRAPHIC PROCESSOR FOR THE CYGNUS SYSTEM / [pt] UM PROCESSADOR GRÁFICO PARA O SISTEMA CYGNUS

PAULO VALVERDE DE LACERDA PARAISO ROCHA 18 April 2007 (has links)
[pt] O uso de recursos gráficos se torna cada vez mais comum e necessário a sistemas computacionais de qualquer porte. Este trabalho apresenta um processador gráfico que pode ser utilizado de maneira independente ou subordinado ao sistema CYGNUS - um supermicro desenvolvido nos laboratórios da PUC/RJ. O Projeto baseia-se em circuitos VLSI e no microprocessador Motorola MC68010, de modo a obter um circuito eficiente, versátil e compacto. / [en] Graphics resources are becoming more common and necessary on computer systems of any size. This work describes a graphic processor developed for stand-alone use or integrated to the CYGNUS system, a DEE, PUC/RJ, project of a supermicro. The hadware is based on VLSI circuits and on Motorola´s MC68010 microprocessor. The objective is an efficient, varsatile and compact module.
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Avaliação de novos compostos sobre a atividade de colinesterases em modelos in silico e in vitro / Evaluation of new compounds on cholinesterases activity in models in silico and in vitro

Lugokenski, Thiago Henrique 04 June 2012 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The enzyme acetylcholinesterase (EC 3.1.1.7, AChE) is responsible to terminate acetylcholine activity in the terminal nervous junctions with its effector organs or post-synaptic sites. The activity of this enzyme could be inhibited by organophosphorus (OP) compounds, and this inactivation leads to an accumulation of acetylcholine in the cholinergic receptors, leading to a cholinergic crisis that may result in death. In this way, the OP compound methamidophos has been related to its broad use in various agriculture cultures in Brazil, with high intoxication rate. Actually, the only compounds able to revert the AChE inhibition by OP, are the oxime, such compounds may reactive the enzyme activity due its high nuclephilic power, attacking the phosphoryl group of the inhibited enzyme and displacing it. However, such compounds show toxic effects, and its use is limited by the high specificity, with each oxime acting only in the reactivation of AChE induced by specific OP coumponds. These limitations raise the need of development of new compounds with AChE reactivator potency, with minor side effects. In this way, have been utilized a series of computational tools (in silico models), with the aim of understand the interaction occurring at a molecular level and, so, rationalize the new compounds development. Thus, the aim of this thesis is to evaluate the activity of three new compounds in reactivate the AChE inhibited by methamidophos, in comparison with two others oximes used in clinical (obidoxime and pralidoxime), both in in silico and in vitro models. Our work demonstrate that the newly synthesized compounds are able to reactivate human erythrocyte AChE, however less efficiently than pralidoxime and obidoxime, and reactivate human plasma butyrylcholinesterase (BChE), where the classical oximes failed. We also show that pralidoxime, which obtained the best reactivation constant among all tested compounds, attack the phosphorus-oxygen moiety (formed between the methamidophos and the AChE catalytic triad residue Ser203) via a region known as oxyanion-hole , composed by the residues Gly120, Gly121 and Ala204. Such found may help in the development of new compounds with better reactivatory activity on AChE inhibited by OP compounds. Furthermore, we show for the first time the individual contribution of each amino acid of AChE, in a radii of 14 Å from the ligand, to the oxime bonding to its active site, using quantum chemistry methods. Here, we demonstrate the important of a quaternary nitrogen to the stabilization of the oximes into the active site; as well as, we obtained evidences that the active form of oximes should be the unprotonated one, instead the protonated, which has been target of debate in the scientific society. Particularly important, we show the critical contribution of amino acids that lies distant from the ligand to the adopted conformation and stabilization of the compounds into the active site of AChE, which has been neglected until far. Finally, our study also evaluates the toxic effects of the compound isatin-3-N4-benzilthiosemicarbazone (IBTC) in mice, which presented low toxicity, with median lethal dose superior at 500 mg/kg. Concluding, this study contributes significantly to the development of new drugs able to restore the AChE activity with minor toxic effects. / A enzima acetilcolinesterase (EC 3.1.1.7, AChE) é responsável por terminar a ação da acetilcolina nas junções das terminações nervosas com seus órgãos efetores ou sítios pós-sinaptícos. A atividade desta enzima pode ser inibida por compostos organofosforados (OP), e sua inativação resulta em um acúmulo de acetilcolina nos receptores colinérgicos, levando a crise colinérgica que pode levar a morte. No Brasil, se destaca o uso do composto OP metamidofós, que é largamente utilizado no controle de pragas em culturas agrícolas e tem sido relacionado com altas taxas de intoxicação. Atualmente, os únicos compostos capazes de reverter a inibição da AChE por OP são as oximas, tais compostos podem reativar a enzima devido a seu alto poder nucleofílico, podendo atacar e retirar o grupamento fosforil da enzima inibida. Porém, tais compostos apresentam efeitos tóxicos, e tem seu uso limitado pela alta especificidade, com cada oxima atuando na AChE inibida por apenas alguns compostos OP. Tais limitações criam a necessidade do desenvolvimento de novos fármacos com potencial reativador da AChE com menores efeitos colaterais. Neste sentido, se tem utilizado uma série de ferramentas computacionais (modelos in silico), com o objetivo de entender as interações que ocorrem em nível molecular e, desta forma, racionalizar o desenvolvimento de novos compostos. Sendo assim, o objetivo desta tese consiste em avaliar a atividade de três novos compostos, em comparação com duas oximas já utilizadas na clínica (obidoxima e pralidoxima), sobre a atividade da AChE inibida por metamidofós, tanto em modelos in silico como in vitro. Como resultados, observamos que os três novos compostos foram capazes de reativar a AChE de eritrócitos humanos inibida por metamidofós, contudo com menor eficiência que as oximas já utilizadas na clínica. Porém, todos os novos compostos foram capazes de reativar a enzima butirilcolinesterase (BChE), uma enzima acessória à AChE no sistema colinérgico, inibida por metamidofós, enquanto nenhumas das oximas clássicas tiveram qualquer atividade reativadora nesta enzima. Nosso trabalho também demonstrou que a pralidoxima, que obteve a melhor constante de reativação entre todos os compostos testados, ataca a ligação fosforo-oxigênio (formada entre o metamidofós e o resíduo Ser203, da tríade catalítica da AChE) via uma região conhecida como oxyanion-hole , que compreende os resíduos Gly120, Gly121 e Ala204. Tal achado pode ajudar no desenvolvimento de novos compostos com melhor atividade reativatória na AChE inibida por OPs. Além disso, mostramos aqui pela primeira vez, a contribuição de cada resíduo de aminoácido da AChE, num raio de 14 Å do ligante, para a ligação das oximas no seu sítio ativo, usando métodos de química quântica. Tais achados mostraram a importância da presença de um nitrogênio quaternário para a estabilização das oximas no sítio ativo; assim como colheu evidências que a forma ativa das oximas seria a sua forma desprotonada, ao invés da forma protonada, o que tem sido alvo de algum debate no meio cientifico. Particularmente importante, foi demonstrado a contribuição fundamental de aminoácidos que se encontram distantes do ligante, para a estabilização e conformação adotada pelos compostos, e que até o momento tem sido negligenciados em estudos in silico. Por fim, nosso estudo também avaliou os efeitos tóxicos do composto isatina-3-N4-benziltiosemicarbazona (IBTC) em camundongos, o qual apresentando baixa toxicidade, com valores de dose letal mediana (LD50) superiores a 500 mg/kg. Desta forma, este estudo contribui para a desenvolvimento de novos fármacos capazes de reativar a AChE e que apresentem menos efeitos tóxicos.
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[en] DEVELOPMENT AND EVALUATION OF A COMPUTER GAME FOR TEACHING VOCABULARY TO CHILDREN WITH AUTISM / [pt] DESENVOLVIMENTO E AVALIAÇÃO DE UM JOGO DE COMPUTADOR PARA ENSINO DE VOCABULÁRIO PARA CRIANÇAS COM AUTISMO

RAFAEL MOREIRA CUNHA 15 June 2012 (has links)
[pt] O autismo é um transtorno global do desenvolvimento infantil que afeta a capacidade de comunicação do indivíduo, de estabelecer relacionamentos e de responder apropriadamente ao ambiente. A Ciência da Computação e, em particular, a área de Interação Humano-Computador (IHC) podem auxiliar na construção de ferramentas com alta qualidade de uso capazes de ajudar no desenvolvimento de crianças com autismo. Este trabalho tem por objetivo analisar o impacto de um programa de computador desenvolvido exclusivamente para ajudar crianças com autismo na aquisição de vocabulário. Os resultados obtidos demonstram que as crianças foram capazes de aprender novas palavras, retendo e generalizando o conhecimento. / [en] Autism is a global development disorder that affects children s ability to communicate, to establish relationships and to respond appropriately to the environment. Within Computer Science, the area of Human-Computer Interaction (HCI) can assist in building high quality tools that can help the development of children with autism. This work aims to analyze the impact of a computer game developed exclusively to help children with autism in vocabulary acquisition. The results obtained show that children were able to effectively learn new words. Evidence of generalization and retention has been shown.

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