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Configurational Optimization and Configurational Force in Thermoelasticity: Theory and Computational Procedure

Chung Shuo Lee (20443736) 18 December 2024 (has links)
<p dir="ltr">Stress concentration represents a considerable challenge in 2.5D/ 3D integration systems, primarily due to the inherent structural and material heterogeneities. Discontinuities at interfaces between different materials and at corners lead to the formation of localized stress regions. Furthermore, coefficients of thermal expansion mismatch among materials such as silicon, copper, and polymers exacerbate these stress concentrations, particularly at critical locations including edges, corners, and interfaces. The presence of these localized stresses from both thermal and mechanical loadings heightens the risk of mechanical failure such as crack initiation or crack propagation, thereby underscoring the necessity for meticulous design and analysis to ensure the reliability of these advanced systems.</p><p dir="ltr">Numerical modeling provides insights into the relationship between design, loading, and material behavior leading to failure. Isogeometric analysis (IGA) offers a significant advantage over traditional finite element methods (FEM) by integrating Computer-Aided Design (CAD) and Computer-Aided Engineering (CAE) using NURBS-based approximations. Enriched Isogeometric Analysis (EIGA) enhances this framework by incorporating known behaviors at critical features like crack tips or interfaces to facilitate accurate modeling of flux/stress singularities.</p><p dir="ltr">Asymptotic analysis of flux singularity is systematically studied in order to capture the local thermal behavior around crack tips or junction of multi-material wedges. The general expressions of temperature and flux in polar coordinates are derived. Formulation of EIGA around crack tips or junction of multi-material wedges then presented. A bi-material wedge model is demonstrated to show that singular flux/stress can be obtained in EIGA with a very coarse discretization compared with FEM.</p><p dir="ltr">Configurational force, a key concept in fracture mechanics, describes the energy-driven force that dictates crack propagation and helps predict crack paths and material failure under varying loads and conditions. To develop configurational force for thermoelasticity, configurational optimization problem is introduced. Configurational optimization problem is proposed for determining the optimal location, orientation, and the scaling of a finite-sized heterogeneity inserted into a homogeneous domain. The derivation leads to some important results: a generalized Eshelby energy-momentum tensor, path-independent integral forms for sensitivity, and representation of <i>J-</i>, <i>L-</i> and <i>M-</i>integrals of fracture mechanics. Several illustrative examples of fracture resistant design are solved with EIGA. </p><p dir="ltr">The generalized configurational force for thermoelasticity is derived by solving the configurational optimization problem. Using the general form of Helmholtz free energy potential for thermoelasticity, the generalized configurational force and generalized Eshelby energy-momentum tensor for thermoelasticity are obtained practically without needing the assumption of thermal displacement made in prior literature. </p><p dir="ltr"><br></p><p dir="ltr">Finally, a multiscale modeling for 2.5D/3D integration is demonstrated with all the developed techniques: asymptotic analysis of flux/stress singularities, enriched isogeometric analysis as well as configurational force in thermoelasticity. The one-way coupled multiscale modeling is applied to solve the length scale spanning of package to line. By transferring the global nodal value such as displacement or temperature to the local model as boundary conditions, the one-way coupled is achieved. In local model, a fined-mesh model with EIGA provides more details, and post-processing of configurational force computation leads to a prediction of the direction of crack driving force.</p>
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Ett nytt perspektiv på Strategic Human Resource Management : En komparativ studie om tillverknings- och tjänstebranschen.

Gunnarsson, Eric, Gustafsson, Josefine, Mujkic, Ilda, Purbe, Wilhelm January 2016 (has links)
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Indicador de hierarquia regional

Calvetti, Fernando dos Santos January 2016 (has links)
A troca e o comércio estão associados na sua origem ao próprio conceito de cidade, a partir de uma relação mútua, de atividades que definem e são definidas pelos locais onde acontecem. A troca, a compra e venda de produtos, assim como o fluxo de pessoas, entre diferentes centros urbanos, tende a influenciar o crescimento das cidades. A cidade então não pode ser entendida como isolada do seu entorno, e o seu estudo passa, portanto, pelo entendimento das suas relações regionais. A presente pesquisa propõe o desenvolvimento de uma metodologia para identificação e avaliação da hierarquia regional a partir das relações entre as cidades. Para tanto, se utiliza de um indicador espacial descrito com o uso de modelos configuracionais. A partir de pesquisa bibliográfica se considera que a interação espacial entre as cidades acontece como consequência das relações de distância, ofertas de serviços e demandas das populações. A hipótese central da pesquisa é de que a abordagem configuracional do espaço dispõe de medidas que são capazes de descrever a hierarquia em um sistema de cidades. Utilizando o estado do Rio Grande do Sul como caso empírico, se constrói a sua representação espacial a partir da teoria dos grafos, carregando o sistema gerado com dados socioeconômicos dos municípios a fim de reproduzir o fluxo entre as cidades. A partir da análise e da comparação destes resultados com o volume médio de tráfego nas praças de pedágio do estado, se utiliza o Método dos Mínimos Quadrados como técnica de ajuste e ponderação dos dados socioeconômicos. O trabalho é finalizado comparando o indicador de hierarquia regional desenvolvido com a hierarquia de cidades apresentada no Estudo de Regiões de Influências do IBGE. Verificou-se que a metodologia proposta obteve uma descrição adequada da hierarquia regional, fazendo uso de menos dados em uma aplicação mais rápida do que as abordagens mais conhecidas. / Exchange and commerce are associated in their origin with the very concept of a city, based on a mutual relation, of activities that define and are defined by the places where they happen. The exchange, buying and selling of products as well as the flow of people, between different urban centers, tends to influence the growth of cities. The city cannot then be understood as isolated from its surroundings, and its study therefore depends on the understanding of its regional relations. The present research proposes the development of a methodology for identification and evaluation of the regional hierarchy based on the relations between cities. To do so, we use a spatial indicator described with the use of configurational models. From a bibliographical research it is considered that the spatial interaction between cities happens as a consequence of distance relations, service offerings and demands of the populations. The central hypothesis of the research is that the configurational approach of space has measures that are able to describe the hierarchy in a system of cities. Using the state of Rio Grande do Sul as an empirical case, its spatial representation is constructed from the theory of graphs, loading the system generated with socioeconomic data from the cities in order to reproduce the flow between them. From the analysis and comparison of these results with the average volume of traffic in the toll points of the state, the Least Squares Method is used as adjustment technique and weighting of socioeconomic data. The work is completed by comparing the regional hierarchy indicator developed with the city hierarchy presented in Influence Regions Study from IBGE. It was found that the proposed methodology obtained an adequate description of the regional hierarchy, making use of less data in a faster application than the most known approaches.
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Indicador de hierarquia regional

Calvetti, Fernando dos Santos January 2016 (has links)
A troca e o comércio estão associados na sua origem ao próprio conceito de cidade, a partir de uma relação mútua, de atividades que definem e são definidas pelos locais onde acontecem. A troca, a compra e venda de produtos, assim como o fluxo de pessoas, entre diferentes centros urbanos, tende a influenciar o crescimento das cidades. A cidade então não pode ser entendida como isolada do seu entorno, e o seu estudo passa, portanto, pelo entendimento das suas relações regionais. A presente pesquisa propõe o desenvolvimento de uma metodologia para identificação e avaliação da hierarquia regional a partir das relações entre as cidades. Para tanto, se utiliza de um indicador espacial descrito com o uso de modelos configuracionais. A partir de pesquisa bibliográfica se considera que a interação espacial entre as cidades acontece como consequência das relações de distância, ofertas de serviços e demandas das populações. A hipótese central da pesquisa é de que a abordagem configuracional do espaço dispõe de medidas que são capazes de descrever a hierarquia em um sistema de cidades. Utilizando o estado do Rio Grande do Sul como caso empírico, se constrói a sua representação espacial a partir da teoria dos grafos, carregando o sistema gerado com dados socioeconômicos dos municípios a fim de reproduzir o fluxo entre as cidades. A partir da análise e da comparação destes resultados com o volume médio de tráfego nas praças de pedágio do estado, se utiliza o Método dos Mínimos Quadrados como técnica de ajuste e ponderação dos dados socioeconômicos. O trabalho é finalizado comparando o indicador de hierarquia regional desenvolvido com a hierarquia de cidades apresentada no Estudo de Regiões de Influências do IBGE. Verificou-se que a metodologia proposta obteve uma descrição adequada da hierarquia regional, fazendo uso de menos dados em uma aplicação mais rápida do que as abordagens mais conhecidas. / Exchange and commerce are associated in their origin with the very concept of a city, based on a mutual relation, of activities that define and are defined by the places where they happen. The exchange, buying and selling of products as well as the flow of people, between different urban centers, tends to influence the growth of cities. The city cannot then be understood as isolated from its surroundings, and its study therefore depends on the understanding of its regional relations. The present research proposes the development of a methodology for identification and evaluation of the regional hierarchy based on the relations between cities. To do so, we use a spatial indicator described with the use of configurational models. From a bibliographical research it is considered that the spatial interaction between cities happens as a consequence of distance relations, service offerings and demands of the populations. The central hypothesis of the research is that the configurational approach of space has measures that are able to describe the hierarchy in a system of cities. Using the state of Rio Grande do Sul as an empirical case, its spatial representation is constructed from the theory of graphs, loading the system generated with socioeconomic data from the cities in order to reproduce the flow between them. From the analysis and comparison of these results with the average volume of traffic in the toll points of the state, the Least Squares Method is used as adjustment technique and weighting of socioeconomic data. The work is completed by comparing the regional hierarchy indicator developed with the city hierarchy presented in Influence Regions Study from IBGE. It was found that the proposed methodology obtained an adequate description of the regional hierarchy, making use of less data in a faster application than the most known approaches.
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Indicador de hierarquia regional

Calvetti, Fernando dos Santos January 2016 (has links)
A troca e o comércio estão associados na sua origem ao próprio conceito de cidade, a partir de uma relação mútua, de atividades que definem e são definidas pelos locais onde acontecem. A troca, a compra e venda de produtos, assim como o fluxo de pessoas, entre diferentes centros urbanos, tende a influenciar o crescimento das cidades. A cidade então não pode ser entendida como isolada do seu entorno, e o seu estudo passa, portanto, pelo entendimento das suas relações regionais. A presente pesquisa propõe o desenvolvimento de uma metodologia para identificação e avaliação da hierarquia regional a partir das relações entre as cidades. Para tanto, se utiliza de um indicador espacial descrito com o uso de modelos configuracionais. A partir de pesquisa bibliográfica se considera que a interação espacial entre as cidades acontece como consequência das relações de distância, ofertas de serviços e demandas das populações. A hipótese central da pesquisa é de que a abordagem configuracional do espaço dispõe de medidas que são capazes de descrever a hierarquia em um sistema de cidades. Utilizando o estado do Rio Grande do Sul como caso empírico, se constrói a sua representação espacial a partir da teoria dos grafos, carregando o sistema gerado com dados socioeconômicos dos municípios a fim de reproduzir o fluxo entre as cidades. A partir da análise e da comparação destes resultados com o volume médio de tráfego nas praças de pedágio do estado, se utiliza o Método dos Mínimos Quadrados como técnica de ajuste e ponderação dos dados socioeconômicos. O trabalho é finalizado comparando o indicador de hierarquia regional desenvolvido com a hierarquia de cidades apresentada no Estudo de Regiões de Influências do IBGE. Verificou-se que a metodologia proposta obteve uma descrição adequada da hierarquia regional, fazendo uso de menos dados em uma aplicação mais rápida do que as abordagens mais conhecidas. / Exchange and commerce are associated in their origin with the very concept of a city, based on a mutual relation, of activities that define and are defined by the places where they happen. The exchange, buying and selling of products as well as the flow of people, between different urban centers, tends to influence the growth of cities. The city cannot then be understood as isolated from its surroundings, and its study therefore depends on the understanding of its regional relations. The present research proposes the development of a methodology for identification and evaluation of the regional hierarchy based on the relations between cities. To do so, we use a spatial indicator described with the use of configurational models. From a bibliographical research it is considered that the spatial interaction between cities happens as a consequence of distance relations, service offerings and demands of the populations. The central hypothesis of the research is that the configurational approach of space has measures that are able to describe the hierarchy in a system of cities. Using the state of Rio Grande do Sul as an empirical case, its spatial representation is constructed from the theory of graphs, loading the system generated with socioeconomic data from the cities in order to reproduce the flow between them. From the analysis and comparison of these results with the average volume of traffic in the toll points of the state, the Least Squares Method is used as adjustment technique and weighting of socioeconomic data. The work is completed by comparing the regional hierarchy indicator developed with the city hierarchy presented in Influence Regions Study from IBGE. It was found that the proposed methodology obtained an adequate description of the regional hierarchy, making use of less data in a faster application than the most known approaches.
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Implementação e desenvolvimento de algoritmo eficiente para deformação intramolecular com o método Monte Carlo / Implementation and development of efficient Monte Carlo algorithm for intramolecular deformation

Cezar, Henrique Musseli 27 September 2018 (has links)
Com o avanço do poder computacional nas últimas décadas, a modelagem molecular de problemas em diversas áreas se tornou mais acessível, sendo hoje uma ferramenta fundamental para o entendimento de diversos processos. Em especial, simulações moleculares com campos de força clássicos vem sendo importante para a amostragem de propriedades termodinâmicas, para a determinação de estruturas e população de confôrmeros, e seleção de configurações para utilização com métodos que combinam mecânica quântica com mecânica molecular. Os principais métodos de simulação atualmente utilizados são a dinâmica molecular (MD, do inglês molecular dynamics) e o Monte Carlo (MC). Ambos os métodos são a princípio equivalentes quando o objetivo é a amostragem configuracional, tendo a MD a vantagem de permitir a análise da dinâmica e evolução temporal, e o MC a vantagem de poder gerar configurações de forma probabilística, sem a necessidade de seguir um caminho sobre a superfície de energia potencial, o que pode resultar em uma amostragem mais eficiente. Contudo, não há ainda uma metodologia de MC que possa ser considerada eficiente e bem estabelecida para a amostragem dos graus de liberdade internos de moléculas com complexidade arbitrária. Visando avançar no desenvolvimento de métodos que trabalham nesse sentido, neste trabalho o método apresentado por Shah e Maginn [1] foi implementado e aprimorado. No método, a molécula é fragmentada em partes menores, formadas de graus de liberdade rígidos, que não variam drasticamente durante a simulação. Esses fragmentos por sua vez são conectadas por graus de liberdade maleáveis, os diedros e termos não ligados da energia. Durante a simulação a molécula tem fragmentos apagados, e então é reconstruída utilizando um esquema de Configurational Bias Monte Carlo (CBMC). A contribuição deste trabalho para a metodologia consiste em generalizar os tipos de fragmentos possíveis dentro do método, a simplificação do critério de aceitação e extensões com vieses adicionais, como é o caso do viés no potencial eletrostático e no critério de aceitação da amostragem preferencial com o CBMC. A validade da implementação do método foi avaliada através de simulações em dois sistemas simples: o octano e o 1,2-dicloroetano. Comparando a amostragem e os resultados obtidos para as populações de confôrmeros com resultados de MD e experimentais ou obtidos com outros métodos de MC da literatura foi possível verificar que a implementação reproduz os resultados esperados. Além disso, o equilíbrio conformacional da molécula de óxido mesityl (MOx) que possui duas conformações: syn e anti, foi estudado. Graças a barreira de potencial entre as duas conformações de cerca de 10 kcal/mol, a MD não é capaz de realizar uma amostragem ergódica, enquanto o CBMC realiza a amostragem sem problemas. Na simulação CBMC, a inversão da população dominante em fase gasosa e em água foi observada. Simulações do MOx em acetonitrila e metanol mostraram que a população de confôrmeros anti de fato aumenta conforme a polaridade do solvente. Entretanto, devido ao estiramento da ligação C = O do MOx em metanol devido as ligações de hidrogênio, a contribuição conformacional à posição do máximo da banda de absorção não segue a tendência da polaridade, tendo um deslocamento para o azul maior na acetonitrila do que em metanol. O estiramento da ligação C = O só pode ser observado graças a introdução da amostragem de fragmentos com deslocamentos Cartesianos e algoritmo de Metropolis ao método CBMC original. Esse efeito devido ao estiramento é compensado pelo efeito solvente, de modo que a contribuição total à energia de transição segue a polaridade do solvente. De uma maneira geral, concluímos que o desempenho do método CBMC utilizado é excelente para os casos estudados, e é inclusive superior ao da MD em alguns casos. A implementação no software DICE deixa um legado importante para diversos grupos de pesquisa, não somente por introduzir o CBMC, mas também por melhorias gerais como paralelização, lista de vizinhos e modernização do código, que foram introduzidas ao decorrer do projeto. / With the increase of computational power in the last decades, the molecular modeling of problems in several areas has become more accessible, being today a fundamental tool used to understand several processes. In particular, molecular simulations with classical force fields have been important for the sampling of thermodynamic properties, for the determination of structures and population of conformers, and for the selection of configurations to be used with methods that combine quantum mechanics with molecular mechanics. The most common simulation methods used nowadays are molecular dynamics (MD) and Monte Carlo (MC). Both methods are in principle equivalent when the goal is configurational sampling, with MD having the advantage of allowing the analysis of the dynamics and temporal evolution, while MC has the advantage of generating the configurations in a probabilistic manner, not necessarily following a path in the potential energy surface, possibly resulting in a more efficient sampling. However, there is no MC methodology that can be considered efficient and established to sample the internal degrees of freedom of molecules with arbitrary complexity. In order to advance in the development of methods that want to achieve this goal, in this work the method presented by Shah e Maginn [1] has been implemented and improved. In the method, the molecule is fragmented into smaller parts, each one composed by the hard degrees of freedom, which do not vary dramatically during the simulation. Those fragments are then connected by soft degrees of freedom, the dihedral and non-bonded terms of the energy. During the simulation the molecule has some of its fragments deleted, and is reconstructed using a Configurational Bias Monte Carlo (CBMC) approach. The contribution of this work to the methodology is generalizing the fragment types within the method, the simplification of the acceptance criteria and some extensions with additional biases, such as electrostatic potential bias and the acceptance criterion of the preferential sampling with the CBMC. The implementation was evaluated through simulations in two simple systems: octane and 1,2-dichloroethane. Comparing the sampling and results obtained for the populations of conformers with MD results, experimental data or values obtained with different MC methods present in the literature, we verified that the implementation reproduces the expected results. Beyond that, the conformational equilibrium of the mesityl oxide (MOx) molecule which has two conformers: syn and anti, was investigated. Due to the potential energy barrier between the two conformers of about 10 kcal/mol, the MD does not perform an ergodic simulation, while the CBMC does the same sampling accordingly. In the CBMC simulation, the inversion of the dominant conformer in gas phase and water was observed. The MOx simulation in acetonitrile and methanol showed that the frequency of the anti conformer indeed increases with the solvent polarity. Nonetheless, due to the stretch of the C = O bond of MOx in methanol, attributed to the hydrogen bonds formed with the solvent, the conformational contribution to the maximum of the absorption band does not follow the polarity tendency, having a larger blue shift in acetonitrile than in methanol. The C = O bond stretch can only be seen because the Cartesian displacement sampling with the Metropolis method was introduced to the original CBMC method. This effect attributed to the stretch is compensated by the solvent, in a way that the total contribution to the transition energy follows the solvent polarity. In general, we conclude that the performance of the developed CBMC method is excellent to the studied cases, being even superior to MD in some cases. The implementation in DICE leaves an important legacy to several research groups, not only for introducing the CBMC method, but also due to general improvements such as parallelization, neighbor list and code modernization, which were introduced during the project.
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Implementação e desenvolvimento de algoritmo eficiente para deformação intramolecular com o método Monte Carlo / Implementation and development of efficient Monte Carlo algorithm for intramolecular deformation

Henrique Musseli Cezar 27 September 2018 (has links)
Com o avanço do poder computacional nas últimas décadas, a modelagem molecular de problemas em diversas áreas se tornou mais acessível, sendo hoje uma ferramenta fundamental para o entendimento de diversos processos. Em especial, simulações moleculares com campos de força clássicos vem sendo importante para a amostragem de propriedades termodinâmicas, para a determinação de estruturas e população de confôrmeros, e seleção de configurações para utilização com métodos que combinam mecânica quântica com mecânica molecular. Os principais métodos de simulação atualmente utilizados são a dinâmica molecular (MD, do inglês molecular dynamics) e o Monte Carlo (MC). Ambos os métodos são a princípio equivalentes quando o objetivo é a amostragem configuracional, tendo a MD a vantagem de permitir a análise da dinâmica e evolução temporal, e o MC a vantagem de poder gerar configurações de forma probabilística, sem a necessidade de seguir um caminho sobre a superfície de energia potencial, o que pode resultar em uma amostragem mais eficiente. Contudo, não há ainda uma metodologia de MC que possa ser considerada eficiente e bem estabelecida para a amostragem dos graus de liberdade internos de moléculas com complexidade arbitrária. Visando avançar no desenvolvimento de métodos que trabalham nesse sentido, neste trabalho o método apresentado por Shah e Maginn [1] foi implementado e aprimorado. No método, a molécula é fragmentada em partes menores, formadas de graus de liberdade rígidos, que não variam drasticamente durante a simulação. Esses fragmentos por sua vez são conectadas por graus de liberdade maleáveis, os diedros e termos não ligados da energia. Durante a simulação a molécula tem fragmentos apagados, e então é reconstruída utilizando um esquema de Configurational Bias Monte Carlo (CBMC). A contribuição deste trabalho para a metodologia consiste em generalizar os tipos de fragmentos possíveis dentro do método, a simplificação do critério de aceitação e extensões com vieses adicionais, como é o caso do viés no potencial eletrostático e no critério de aceitação da amostragem preferencial com o CBMC. A validade da implementação do método foi avaliada através de simulações em dois sistemas simples: o octano e o 1,2-dicloroetano. Comparando a amostragem e os resultados obtidos para as populações de confôrmeros com resultados de MD e experimentais ou obtidos com outros métodos de MC da literatura foi possível verificar que a implementação reproduz os resultados esperados. Além disso, o equilíbrio conformacional da molécula de óxido mesityl (MOx) que possui duas conformações: syn e anti, foi estudado. Graças a barreira de potencial entre as duas conformações de cerca de 10 kcal/mol, a MD não é capaz de realizar uma amostragem ergódica, enquanto o CBMC realiza a amostragem sem problemas. Na simulação CBMC, a inversão da população dominante em fase gasosa e em água foi observada. Simulações do MOx em acetonitrila e metanol mostraram que a população de confôrmeros anti de fato aumenta conforme a polaridade do solvente. Entretanto, devido ao estiramento da ligação C = O do MOx em metanol devido as ligações de hidrogênio, a contribuição conformacional à posição do máximo da banda de absorção não segue a tendência da polaridade, tendo um deslocamento para o azul maior na acetonitrila do que em metanol. O estiramento da ligação C = O só pode ser observado graças a introdução da amostragem de fragmentos com deslocamentos Cartesianos e algoritmo de Metropolis ao método CBMC original. Esse efeito devido ao estiramento é compensado pelo efeito solvente, de modo que a contribuição total à energia de transição segue a polaridade do solvente. De uma maneira geral, concluímos que o desempenho do método CBMC utilizado é excelente para os casos estudados, e é inclusive superior ao da MD em alguns casos. A implementação no software DICE deixa um legado importante para diversos grupos de pesquisa, não somente por introduzir o CBMC, mas também por melhorias gerais como paralelização, lista de vizinhos e modernização do código, que foram introduzidas ao decorrer do projeto. / With the increase of computational power in the last decades, the molecular modeling of problems in several areas has become more accessible, being today a fundamental tool used to understand several processes. In particular, molecular simulations with classical force fields have been important for the sampling of thermodynamic properties, for the determination of structures and population of conformers, and for the selection of configurations to be used with methods that combine quantum mechanics with molecular mechanics. The most common simulation methods used nowadays are molecular dynamics (MD) and Monte Carlo (MC). Both methods are in principle equivalent when the goal is configurational sampling, with MD having the advantage of allowing the analysis of the dynamics and temporal evolution, while MC has the advantage of generating the configurations in a probabilistic manner, not necessarily following a path in the potential energy surface, possibly resulting in a more efficient sampling. However, there is no MC methodology that can be considered efficient and established to sample the internal degrees of freedom of molecules with arbitrary complexity. In order to advance in the development of methods that want to achieve this goal, in this work the method presented by Shah e Maginn [1] has been implemented and improved. In the method, the molecule is fragmented into smaller parts, each one composed by the hard degrees of freedom, which do not vary dramatically during the simulation. Those fragments are then connected by soft degrees of freedom, the dihedral and non-bonded terms of the energy. During the simulation the molecule has some of its fragments deleted, and is reconstructed using a Configurational Bias Monte Carlo (CBMC) approach. The contribution of this work to the methodology is generalizing the fragment types within the method, the simplification of the acceptance criteria and some extensions with additional biases, such as electrostatic potential bias and the acceptance criterion of the preferential sampling with the CBMC. The implementation was evaluated through simulations in two simple systems: octane and 1,2-dichloroethane. Comparing the sampling and results obtained for the populations of conformers with MD results, experimental data or values obtained with different MC methods present in the literature, we verified that the implementation reproduces the expected results. Beyond that, the conformational equilibrium of the mesityl oxide (MOx) molecule which has two conformers: syn and anti, was investigated. Due to the potential energy barrier between the two conformers of about 10 kcal/mol, the MD does not perform an ergodic simulation, while the CBMC does the same sampling accordingly. In the CBMC simulation, the inversion of the dominant conformer in gas phase and water was observed. The MOx simulation in acetonitrile and methanol showed that the frequency of the anti conformer indeed increases with the solvent polarity. Nonetheless, due to the stretch of the C = O bond of MOx in methanol, attributed to the hydrogen bonds formed with the solvent, the conformational contribution to the maximum of the absorption band does not follow the polarity tendency, having a larger blue shift in acetonitrile than in methanol. The C = O bond stretch can only be seen because the Cartesian displacement sampling with the Metropolis method was introduced to the original CBMC method. This effect attributed to the stretch is compensated by the solvent, in a way that the total contribution to the transition energy follows the solvent polarity. In general, we conclude that the performance of the developed CBMC method is excellent to the studied cases, being even superior to MD in some cases. The implementation in DICE leaves an important legacy to several research groups, not only for introducing the CBMC method, but also due to general improvements such as parallelization, neighbor list and code modernization, which were introduced during the project.
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Erechim, processo e projeto : relações estruturais entre traçado viário e desenvolvimento urbano

Aver, Ivana Karine January 2008 (has links)
A temática escolhida para este estudo concentra-se nas relações espaciais e temporais supostamente existentes entre o desenho original de uma cidade e seu desenvolvimento a partir dele. Foi escolhida como estudo de caso a cidade de Erechim, ao norte do Rio Grande do Sul, com traçado viário projetado e que se diferencia das tradicionais cidades luso-brasileiras por apresentar vias diagonais sobrepostas ao traçado em grelha. O estudo foi viabilizado pela aplicação de modelos configuracionais urbanos à cidade, possibilitando a análise das características do seu projeto inicial e sua evolução ao longo de noventa anos, tomada em cinco momentos históricos. O resultado dos cálculos da acessibilidade e centralidade permitiu verificar que, dependendo do momento, o previsto/acontecido vai ao encontro das teorias de Hillier (1993), Krafta (1994) e/ou Polidori (2004), as quais se referem às relações entre traçado viário e desenho urbano. Também foi possível analisar se a cidade seguiu, nos anos subseqüentes à implantação do seu projeto inicial, o padrão imaginado pelo seu idealizador. / The chosen subject for this study focuses on the spatial and temporal relationships between the supposedly original design of a city and its development starting from it. Erechim city, on north of Rio Grande do Sul, was chosen as case of this present study due its designed road layout, which differs from the traditional Brazilian- Portuguese cities by presenting ways to track overlapping diagonals chess. The study was possible by means of the configurational models application to the city, allowing its original design characteristics analysis and its evolution over ninety years, taken in five historic moments. The accessibility and centrality calculations results allowed verifying that the planned/happened meets the Hillier (1993), Krafta (1994) and/or Polidori (2004) theories, which ones refer to relations between track road and urban design, according to the moment. It was also possible to analyze if the city followed its creator imagined pattern in subsequent years to the deployment of its initial project.
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Erechim, processo e projeto : relações estruturais entre traçado viário e desenvolvimento urbano

Aver, Ivana Karine January 2008 (has links)
A temática escolhida para este estudo concentra-se nas relações espaciais e temporais supostamente existentes entre o desenho original de uma cidade e seu desenvolvimento a partir dele. Foi escolhida como estudo de caso a cidade de Erechim, ao norte do Rio Grande do Sul, com traçado viário projetado e que se diferencia das tradicionais cidades luso-brasileiras por apresentar vias diagonais sobrepostas ao traçado em grelha. O estudo foi viabilizado pela aplicação de modelos configuracionais urbanos à cidade, possibilitando a análise das características do seu projeto inicial e sua evolução ao longo de noventa anos, tomada em cinco momentos históricos. O resultado dos cálculos da acessibilidade e centralidade permitiu verificar que, dependendo do momento, o previsto/acontecido vai ao encontro das teorias de Hillier (1993), Krafta (1994) e/ou Polidori (2004), as quais se referem às relações entre traçado viário e desenho urbano. Também foi possível analisar se a cidade seguiu, nos anos subseqüentes à implantação do seu projeto inicial, o padrão imaginado pelo seu idealizador. / The chosen subject for this study focuses on the spatial and temporal relationships between the supposedly original design of a city and its development starting from it. Erechim city, on north of Rio Grande do Sul, was chosen as case of this present study due its designed road layout, which differs from the traditional Brazilian- Portuguese cities by presenting ways to track overlapping diagonals chess. The study was possible by means of the configurational models application to the city, allowing its original design characteristics analysis and its evolution over ninety years, taken in five historic moments. The accessibility and centrality calculations results allowed verifying that the planned/happened meets the Hillier (1993), Krafta (1994) and/or Polidori (2004) theories, which ones refer to relations between track road and urban design, according to the moment. It was also possible to analyze if the city followed its creator imagined pattern in subsequent years to the deployment of its initial project.
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Erechim, processo e projeto : relações estruturais entre traçado viário e desenvolvimento urbano

Aver, Ivana Karine January 2008 (has links)
A temática escolhida para este estudo concentra-se nas relações espaciais e temporais supostamente existentes entre o desenho original de uma cidade e seu desenvolvimento a partir dele. Foi escolhida como estudo de caso a cidade de Erechim, ao norte do Rio Grande do Sul, com traçado viário projetado e que se diferencia das tradicionais cidades luso-brasileiras por apresentar vias diagonais sobrepostas ao traçado em grelha. O estudo foi viabilizado pela aplicação de modelos configuracionais urbanos à cidade, possibilitando a análise das características do seu projeto inicial e sua evolução ao longo de noventa anos, tomada em cinco momentos históricos. O resultado dos cálculos da acessibilidade e centralidade permitiu verificar que, dependendo do momento, o previsto/acontecido vai ao encontro das teorias de Hillier (1993), Krafta (1994) e/ou Polidori (2004), as quais se referem às relações entre traçado viário e desenho urbano. Também foi possível analisar se a cidade seguiu, nos anos subseqüentes à implantação do seu projeto inicial, o padrão imaginado pelo seu idealizador. / The chosen subject for this study focuses on the spatial and temporal relationships between the supposedly original design of a city and its development starting from it. Erechim city, on north of Rio Grande do Sul, was chosen as case of this present study due its designed road layout, which differs from the traditional Brazilian- Portuguese cities by presenting ways to track overlapping diagonals chess. The study was possible by means of the configurational models application to the city, allowing its original design characteristics analysis and its evolution over ninety years, taken in five historic moments. The accessibility and centrality calculations results allowed verifying that the planned/happened meets the Hillier (1993), Krafta (1994) and/or Polidori (2004) theories, which ones refer to relations between track road and urban design, according to the moment. It was also possible to analyze if the city followed its creator imagined pattern in subsequent years to the deployment of its initial project.

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