Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 1993. / Vita. Includes bibliographical references (leaves [121]-133).

Th. 3e cycle--Océanogr. biol.--Aix-Marseille 2, 1980.

Graduation date: 2005

Population genetic variation of cultured oyster Crassostrea spp. in Taiwan and neighborhood Cheng-Pin Yu ¡]Advisor¡GDr. Jin-Hua Cheng¡^ Institute of Marine Biology, National Sun Yat-sen University, Kaohsuang 804 Taiwan R.O.C. Thesis Abstract The genetic variations among oyster populations of Taiwan, Ginmen and Fu-kein coast are analyzed using molecular method. Firstly, DNA sequences of mitochondrial 16S rRNA and COI genes are analyzed according to nucleotide differences and restriction enzyme recognition site. Then, population variations were analyzed by the lane pattern of restriction enzyme fragment¡]RFLP¡^. The sequences of 530 bp DNA fragment of 16S rRNA gene showed little difference¡]0-1 bp¡^between Portuguese oyster and oyster cultured in Taiwan, both have larger differences¡]3-4 bp¡^compared with C. gigas. The sequences of 700 bp DNA fragment of COI gene showed similar results. C. angulata is found in Ginmen and Fu-kein coast for the first time which is identified by the PCR-RFLP of COI gene fragment. PCR-RFLP analysis of COI gene fragment showed C. angulata from Portugal are genetically closest to the oysters collected from Ginmen and Fu-kein.

Thesis (M.S.)--Universidad de Puerto Rico, Recinto Universitario de Mayagüez, 2005. / Tables. Printout. Abstract in Spanish and English. Includes bibliographical references (leaves 64-70).

A organização dos bivalves em geral sempre foi muito confusa e, em se tratando de ostreídeos, a variação intraespecífica dificulta ainda mais a identificação das distintas espécies que ocorrem no litoral brasileiro. Neste caso, as ostras do gênero Crassostrea são um bom exemplo. Este trabalho visa a revisão taxonômica das espécies do Brasil, Crassostrea rhizophorae e C. brasiliana, e das espécies exóticas C. gigas, cultivada no sul do país, e C. virginica. Foram aplicadas técnicas de análise e comparação de anatomia detalhada, através de dissecções. Por serem economicamente importantes, a diferenciação entre as espécies é fundamental, o que garante conhecimentos para uma melhor produção. As diferenças morfo-anatômicas encontradas em quase todas as estruturas foram suficientes para a separação entre as quatro espécies, duas nativas e duas exóticas. A ocorrência da espécie africana C. gasar no Brasil não foi confirmada. O material testemunho de artigos que fizeram tal citação foi examinado, evidenciando tratar-se de C. brasiliana de ambiente estuarino. A distribuição geográfica das espécies estudadas é a seguinte: C. rhizophorae ocorre do Caribe ao Rio Grande do Sul, exclusiva de manguezais. C. brasiliana endêmica da costa brasileira, ocorrendo tanto em costões rochosos quanto em manguezais, do Maranhão a Santa Catarina. C. virginica ocorre da costa Atlântica do Canadá até o Caribe. C. gigas, é originária de todo o Indo-Pacífico, mas é cultivada no sul do Brasil. Material de várias regiões da distribuição das espécies nativas do Brasil foi estudado. / The organization of the bivalves in general has always been very confused, and in the case of the ostreidae, the intra-specific variation makes even harder the identification of the distinct species that occur in the Brazilian seashore. In such case, the oysters of the Crassostrea genus are good examples. This work aims at the taxonomic review of the Brazilian species Crassostrea rhizophorae and C. brasiliana, and the exotic species C. gigas, cultivated in the Southern region of the country, and C. virginica. Techniques of detailed anatomy analysis and comparison have been applied through dissections. By being economically important, the differentiation between species is critical, which ensures the knowledge for a better production. The morphoanatomical differences found in almost all structures were sufficient for the seggregation among the four species, two native and two exotic. The occurrence of the African species C. gasar in Brazil was not confirmed. The testimonial material of articles that made such mention was examined, evidencing that it is a C. brasiliana of estuarine environment. The geographic distribution of the studied species is the following: C. rhizophorae occurs from the Caribbean to the State of Rio Grande do Sul, only in mangroves. C. brasiliana is endemic of the Brazilian coast, occurring both in rocky coasts and mangroves, from the States of Maranhão to Santa Catarina. C. virginica appears from the Atlantic coast of Canada to the Caribbean. C. gigas is originating from the whole Indian-Pacific, but is cultivated in the Southern region of Brazil. Material of several distribution regions of the Brazilian native species was studied.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura. / Made available in DSpace on 2012-10-21T08:24:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 198908.pdf: 631955 bytes, checksum: 88e3adce645c0730b87629bf0ac7f821 (MD5) / Ostras (Crassostrea rhizophorae e Crassostrea gigas) foram estudadas quanto à presença de parasitas. Os animais foram obtidos do cultivo localizado na Praia da Ponta do Sambaqui - Florianópolis/SC. De agosto de 2002 a maio de 2003, 30 indivíduos adultos de cada espécie foram coletados sazonalmente, totalizando 240 ostras. Os animais, provenientes de desova em laboratório, tinham aproximadamente a mesma idade. Foram mantidos em lanternas de cultivo, em sistema suspenso tipo espinhel, com densidade de 40 ostras/andar. Após as análises macroscópicas, os tecidos foram submetidos a exames histopatológicos. A infestação por Polydora websteri, em C. gigas foi de 100% durante todo o período, enquanto em C. rhizophorae a maior infestação (100%) foi registrada em fevereiro e maio. O "mal do pé" foi observado em novembro (3,3%) e maio (23,3%) para C. gigas e, para C. rhizophorae, em maio (6,6%). As maiores prevalências de Nematopsis foram de 70 e 60% para C. gigas e C. rhizophorae, respectivamente. O protozoário Trichodina ocorreu em 1,6% do total de C. rhizophorae, enquanto larvas do Cestoda Tylocephalum foram observadas em 2,5% de C. gigas. Um exemplar de C. rhizophorae apresentou uma larva de metazoário, em reabsorção. Nenhum dos parasitas encontrados foi associado à mortalidade das ostras.

A organização dos bivalves em geral sempre foi muito confusa e, em se tratando de ostreídeos, a variação intraespecífica dificulta ainda mais a identificação das distintas espécies que ocorrem no litoral brasileiro. Neste caso, as ostras do gênero Crassostrea são um bom exemplo. Este trabalho visa a revisão taxonômica das espécies do Brasil, Crassostrea rhizophorae e C. brasiliana, e das espécies exóticas C. gigas, cultivada no sul do país, e C. virginica. Foram aplicadas técnicas de análise e comparação de anatomia detalhada, através de dissecções. Por serem economicamente importantes, a diferenciação entre as espécies é fundamental, o que garante conhecimentos para uma melhor produção. As diferenças morfo-anatômicas encontradas em quase todas as estruturas foram suficientes para a separação entre as quatro espécies, duas nativas e duas exóticas. A ocorrência da espécie africana C. gasar no Brasil não foi confirmada. O material testemunho de artigos que fizeram tal citação foi examinado, evidenciando tratar-se de C. brasiliana de ambiente estuarino. A distribuição geográfica das espécies estudadas é a seguinte: C. rhizophorae ocorre do Caribe ao Rio Grande do Sul, exclusiva de manguezais. C. brasiliana endêmica da costa brasileira, ocorrendo tanto em costões rochosos quanto em manguezais, do Maranhão a Santa Catarina. C. virginica ocorre da costa Atlântica do Canadá até o Caribe. C. gigas, é originária de todo o Indo-Pacífico, mas é cultivada no sul do Brasil. Material de várias regiões da distribuição das espécies nativas do Brasil foi estudado. / The organization of the bivalves in general has always been very confused, and in the case of the ostreidae, the intra-specific variation makes even harder the identification of the distinct species that occur in the Brazilian seashore. In such case, the oysters of the Crassostrea genus are good examples. This work aims at the taxonomic review of the Brazilian species Crassostrea rhizophorae and C. brasiliana, and the exotic species C. gigas, cultivated in the Southern region of the country, and C. virginica. Techniques of detailed anatomy analysis and comparison have been applied through dissections. By being economically important, the differentiation between species is critical, which ensures the knowledge for a better production. The morphoanatomical differences found in almost all structures were sufficient for the seggregation among the four species, two native and two exotic. The occurrence of the African species C. gasar in Brazil was not confirmed. The testimonial material of articles that made such mention was examined, evidencing that it is a C. brasiliana of estuarine environment. The geographic distribution of the studied species is the following: C. rhizophorae occurs from the Caribbean to the State of Rio Grande do Sul, only in mangroves. C. brasiliana is endemic of the Brazilian coast, occurring both in rocky coasts and mangroves, from the States of Maranhão to Santa Catarina. C. virginica appears from the Atlantic coast of Canada to the Caribbean. C. gigas is originating from the whole Indian-Pacific, but is cultivated in the Southern region of Brazil. Material of several distribution regions of the Brazilian native species was studied.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:48:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 323937.pdf: 1855969 bytes, checksum: 906b3e82e70687a66d3bdfdbab615d2b (MD5) Previous issue date: 2013 / O crescimento demográfico mundial em regiões costeiras tem causado uma série de ameaças à qualidade de vida de organismos estuarinos e marinhos, particularmente pelo lançamento de efluentes contendo esgoto sanitário. Este fato tem também posto em risco o desenvolvimento de atividades relacionadas à maricultura. A complexidade de estimar o impacto do esgoto sanitário em áreas costeiras está relacionada com a variabilidade de sua composição e volume. Análises de biomarcadores bioquímicos e moleculares em ostras têm sido propostas porque estes organismos-sentinela são sésseis, filtradores e bioacumuladores de contaminantes. Crassostrea gigas é o principal e mais estudado bivalve marinho cultivado no mundo. Análises de biomarcadores nos animais expostos auxiliam na avaliação dos efeitos tóxicos e riscos de exposição aos xenobióticos presentes no ambiente. Técnicas de qRT-PCR, proteômicas e de análises enzimáticas podem ser utilizadas para elucidação de respostas dos organismos frente à exposição aos contaminantes. O objetivo deste trabalho foi avaliar diferentes respostas moleculares e bioquímicas da ostra C. gigas frente à exposição ao esgoto sanitário e alquilbenzenos lineares (LABs), a fim de identificar e validar potenciais novos biomarcadores de exposição. Ostras expostas in situ em ambiente contaminado por esgoto sanitário bioacumularam principalmente HPAs e LABs. Os genes FABP e GST-O se apresentam como potenciais biomarcadores moleculares de exposição ao esgoto sanitário. Em nível proteômico, as respostas observadas sugerem que a exposição ao esgoto sanitário pode promover apoptose e interferências no sistema imune das ostras. Apesar da capacidade da ostra C. gigas em bioacumular LABs, esse poluente parece não ser o responsável pelas respostas transcricionais observadas em ostras expostas ao esgoto sanitário. As alterações observadas na atividade das enzimas dos animais expostos aos LABs sugerem uma adaptação das enzimas auxiliares do sistema antioxidante enzimático para compensar um possível estado pró-oxidante intracelular gerado pela exposição a esses compostos. A necessidade de informações sobre a influência dos contaminantes na ativação de vias metabólicas específicas em moluscos bivalves torna-se fundamental para a compreensão da modulação da transcrição gênica, das respostas observadas em biomarcadores moleculares/bioquímicos e interação entre as respostas observadas.<br> / Abstract : The world population growth in coastal regions has caused a number of threats to the quality of life of estuarine and marine organisms, particularly caused by the discharge of effluents containing wastewater. This fact has also jeopardized the development of activities related to mariculture. The complexity of estimating the impact of wastewater in coastal areas is related to the variability of its composition and volume. Analysis of biochemical and molecular biomarkers in oysters has been proposed because these sentinel organisms are sessile, filter feeding and bio-accumulators of contaminants. Crassostrea gigas is the principal and most studied marine bivalve cultivated worldwide. Analysis of biomarkers in animals exposed to wastewater effluents helps in the evaluation of toxic effects and risk of exposure to xenobiotics present in the environment. QRT-PCR techniques, proteomic analysis and enzyme assays can be used to elucidate responses of organisms following exposure to contaminants. The aim of this study was to evaluate different biochemical and molecular responses of the oyster C. gigas against exposure to sewage or linear alkylbenzenes (LABs) in order to identify and validate potential new biomarker of exposure. Oysters exposed in situ to an environment contaminated by sewage bio-accumulate primarily PAHs and LABs. The FABP genes and GST- are presented as potential molecular biomarkers of exposure to sewage. At proteomic level, the observed responses suggest that exposure to sewage can promote apoptosis and interference in the oysters immune system. Despite the ability of the oyster C. gigas bioaccumulate LABs, this pollutant does not seem to be responsible for the transcriptional responses observed in oysters exposed to sewage. The observed changes in the enzyme activities of animals exposed to LABs suggest an adaptation of the auxiliary enzymes from the antioxidant system to compensate for a possible intracellular pro-oxidant state generated by exposure to these compounds. The need for information on the influence of contaminants in the activation of specific metabolic pathways in bivalve mollusks is fundamental for understanding the modulation of gene transcription, the responses observed in biomarkers molecular / biochemical and interaction between observed responses.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-04-29T21:04:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 333003.pdf: 998076 bytes, checksum: 477efe7f934eaa0b2eae081763fe0882 (MD5) Previous issue date: 2014 / Foram realizados estudos visando a implantação de um sistema de recirculação de água na larvicultura de ostras Crassostrea gigas. Testou-se a resistência das larvas a compostos nitrogenados, foram avaliados os parâmetros físico-químicos e presença de compostos nitrogenados da água de cultivo e também avaliou-se a densidade de estocagem e alimentação. As CL`s50 para amônia e nitrito foram respectivamente 2,66 mg.L-1 e 123,47 mg.L-1. Os parâmetros físico-químicos se mostraram constantes, não foram detectados níveis de compostos nitrogenados (<0,02 mg.L-1) e a sobrevivência foi de 25 ± 8% em larvicultura com duração de 14 dias. Não foram encontradas diferenças estatísticas entre as densidades de estocagem e alimentação sobre o número médio de larvas, contudo houve diferença estatística entre as densidades de estocagem e alimentação na sobrevivência larval. A sobrevivência das larvas na concentração de microalgas 1 a 4,5 x104 células.mL-1 é equivalente à concentração de microalgas 5,2 a 140 x104 células.mL-1, entretanto difere estatisticamente (p<0,05) da observada na concentração de microalgas 2 a 9 x104 células.mL-1, ou seja, a sobrevivência larval foi superior na concentração 1 a 4,5 x104 células.mL-1 e 5,2 a 140 x104 células.mL-1, seguido pela concentração 2 a 9 x104 células.mL-1.<br> / Abstract : Studies aiming to implement a water recirculation system in larvae of Crassostrea gigas oysters were performed. The resistance of the larvae to nitrogen compounds was tested, physical and chemical parameters and the presence of nitrogen compounds of water culture were evaluated and the stocking density and feeding were also assessed. The LC`s50 for ammonia and nitrite were respectively 2.66 mg.L-1 and 123.47 mg.L-1. Physical and chemical parameters showed constant, no level of nitrogenous compounds were found (<0.02 mg.L-1) and survival was 25 ± 8% in larvae lasting 14 days. There were no statistical differences between the storage and feeding densities on the average number of larvae, however there was statistical difference between stocking and feeding densities in larval survival. Larval survival in a microalgae concentration of 1 to 4.5 x104 cells.mL-1 is equivalent to a microalgae concentration of 5.2 to 140 x104 cells.mL-1, however differs statistically (p <0.05) of the observed in a microalgae concentration of 2 to 9 x104 cells.mL-1, i.e., larval survival was higher in concentration of 1 to 4.5 x104 cells.mL-1 and 5.2 to 140 x104 cells.mL-1, followed by concentration of 2 to 9 x104 cells.mL-1.