Orientador: Cesar Martins / Resumo: As células possuem um conjunto regular de cromossomos denominados cromossomos do complemento A e, eventualmente cromossomos extras a esse complemento. Uma destas classes de elementos extras é denominada de cromossomos B (Bs) e ocorrem em uma ampla diversidade de eucariotos incluindo fungos, plantas e animais. Desde sua descrição, os Bs tem atraído a atenção dos pesquisadores. Para ser classificado com um um cromossomo B, este deve apresentar algumas características como: ter uma morfologia distinta dos cromossomos As, número da cópia pode variar entre os indivíduos que o possuem, muitas vezes são heterocromáticos, não são homólogos ao complemento A, não se pareiam ou se recombinam aos As, e frequentemente exibem herança não-Mendeliana. Os cromossomos B tem sido descritos em diversos vertebrados, incluindo o peixe ciclídeo Astatotilapia latifasciata, natural dos lagos Kyoga e Nawampasa, lagos satélites ao lago Vitória no leste Africano, este ciclídeo possui 44 cromossomos e a presença de 1 a 2 cromossomos B. O objetivo deste trabalho foi investigar o comportamento meiótico dos cromossomos B via imunocoloração com anticorpos específicos contra proteínas do complexo sinaptonêmico, coesinas e modificações de histonas; cruzamentos direcionados entre machos e fêmeas com e sem B; e análise de expressão dos genes synaptonemal complex protein 2-like, mitochondrial cardiolipin hydrolase-like, separin-like, tubulin beta-1 chain-like e kinesin-like. A imunocoloração com os anticorpos H3K... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The cells have a regular set of chromosomes known as A chromosomes. However, there are extra chromosomes and one of them is the extra elements called B-chromosomes (Bs) that occurs in a wide variety of eukaryotes including fungi, plants and animals. Since its description, Bs have attracted the attention of the researchers. To be classified as a B, some characteristics must be present such as: distinct morphology of A chromosomes, number of copy can vary between the individuals bearing it, they are often heterochromatic, they are not homologous to the A complement set, they did not pare or recombine with As, and often exhibit non-Mendelian heritage. B chromosomes have been described in several vertebrates, including the cichlid fish Astatotilapia latifasciata, native to Kyoga and Nawampasa lakes, satellite lakes to Victoria lake in East Africa, which has 44 chromosomes and the presence of 1 to 2 B chromosomes. This work aimed to investigate the meiotic behavior of B chromosomes via immunostaining with specific antibodies against synaptonemic complex proteins, coesins and histone modifications; directed crosses between males and females with and without B; and gene expression analysis: synaptonemal complex protein 2-like, mitochondrial cardiolipin hydrolase-like, separin-like, tubulin beta-1 chain-like and kinesin-like. Immunostaining with antibodies H3K27me3 and H3K4me3 showed a global distribution in the pachytene phase. The H3K9ac antibody was dispersed throughout all the re... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Eduardo Daruge Junior / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-03T09:15:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Almeida_IsaAzevedode_M.pdf: 4484053 bytes, checksum: e5137b49df6ad4e6c1204bd7f37d39a9 (MD5) Previous issue date: 2003 / Resumo: Nas últimas décadas, as Ciências Forenses vêm evoluindo de maneira a esclarecer e auxiliar cada vez mais precisamente a justiça. O presente trabalho, através da utilização de 25 amostras de sangue de cadáveres do Instituto Médico Legal de Cuiabá-MT, teve como objetivos: estabelecer a forma de coleta do material biológico através da utilização de cartões FTA@; aprimorar a extração do DNA em amostras de sangue, utilizando a Resina Quelante CHELEX@; aprimorar a PCR utilizando os primers para os loei DYS 3851/11, DYS 3891/11, DYS 390, DYS 391, DYS 392, DYS 393, DYS 19 através da padronização do Nanoplex; comprovar a importância do estudo do cromossomo Y nos casos de investigação de paternidade e em casos forenses. Com o desenvolvimento do trabalho, pôde se observar que os métodos de coleta das amostras de sangue e extração do DNA foram satisfatórios, pois obteve-se uma quantidade de DNA suficiente para o seu estudo. O estudo do Nanoplex fez-se com sucesso, pois, por meio de sua análise em um seqüenciador automático (ASI PRISM DNA Sequencer 377), pôde se detectar os fragmentos, estipulando-se, assim, seus respectivos alelos / Abstract: In the last decades, the Forensic Sciences come evolving in way to clarify and to assist the justice. The present work through the use of 25 samples of corpse blood of the Legal Medical Institute of Cuiabá-MT had as objective: to establish the fonn of collection of the biological material through the use of cards FT A@; to improve the extraction of the DNA in samples of blood being used the Resin Quelante CHELEX@; to improve the PCR using primers for locus DYS 385 1/11, DYS 389 1/11, DYS 390, DYS 391, DYS 392, DYS 393, DYS 19 through the standardization of the Nanoplex; to prove the importance of Y chromosome study in the cases of patemity and in forensic cases. Wlth the development of the work it could be observed that the methods of collection of blood samples and extration of the DNA had been satisfactory, therefore got a enough amount of DNA for its study. The study of the Nanoplex one became successfully, therefore through its analysis in an automatic sequencer (ASI PRISM DNA Sequencer 377), it could be detected the fragments, stipulating its respective alleles / Mestrado / Odontologia Legal e Deontologia / Mestre em Odontologia Legal e Deontologia

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:05:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6233_1.pdf: 2126575 bytes, checksum: 74545cd2d1f68fa1820f18784c87de22 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Os microssatélites do cromossomo Y têm sido reconhecidos como ferramentas valiosas na caracterização genética de populações humanas. No entanto, poucos são os trabalhos com esse cromossomo no Nordeste do Brasil. Por isso, estudamos 11 marcadores do cromossomo Y, visando criar um banco de dados para caracterizar a população de Pernambuco quanto ao grau de variabilidade genética, fornecendo informações para investigações forenses e de paternidade. Assim, a amostra foi constituida por 250 homens pernambucanos não aparentados e um filho (sexo masculino) de cada um deles. O DNA genômico foi obtido de sangue periférico e extraído por mini salting out. Os sítios de interesse foram amplificados por PCR e os produtos da PCR submetidos à eletroforese vertical em PAGE, com revelação por impregnação com AgNO3. Os resultados encontrados são consistentes com a história da população do Nordeste do Brasil. Freqüências e diversidades alélicas/haplotípicas foram determinadas. Os locos DYS385 e DYS464 foram os mais informativos com diversidade genética (h) acima de 80%, e os locos DYS389I e DYS393 os menos informativos, com h inferior a 50%. Foram observados 227 haplótipos distintos, dos quais os mais freqüentes foram encontrados em quatro indivíduos e 211 haplótipos foram únicos, sendo o haplótipo estendido bastante informativo. Outros haplótipos foram construídos e analisados, mostrando uma contribuição maior que o haplótipo mínimo também estudado. Estes resultados fornecem informações úteis para investigações de paternidade e forense, bem como para análise histórica da população pernambucana.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:05:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6275_1.pdf: 1470797 bytes, checksum: aa39f70d5f235c59d832a639818d2235 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Microssatélites localizados na região não recombinante do cromossomo Y (NRY) são amplamente utilizados em estudos forenses e populacionais. Neste trabalho foi feita a análise do polimofismo e da taxa de mutação de 15 microssatélites do cromossomo Y (haplótipo mínimo mais DYS447, DYS458, DYS464) numa amostra da população de Alagoas constituída por 255 duplas pai/filho. Foi observado um total de 230 haplótipos diferentes dos quais 207 ocorreram apenas uma vez. Através da análise de pais e filhos foram detectadas mutações em oito das 3.825 transmissões alélicas analisadas, com uma taxa de mutação média estimada em 2,092 × 10-3. O haplótipo mínimo mais comum ocorreu 16 vezes e é também o haplótipo mais comum entre caucasianos das populações do Rio de Janeiro e São Paulo bem como nas populações européias do sul de Portugal, Madri (Espanha) e Ligúria (Itália). O haplótipo mínimo mais comum das populações Yanomami, Bantu e de Moçambique não foi encontrada nenhuma vez na amostra analisada

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:07:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6426_1.pdf: 593808 bytes, checksum: a6bf1f60f7abe41e74d8b95f8e4921ff (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003 / Um total de 240 indivíduos não relacionados da população do Estado de Pernambuco (Nordeste do Brasil) foram estudados quanto ao polimorfismo dos locos de STRs (Short Tandem Repeats) ligadas ao cromossomo Y DYS19, DYS390, DYS391, DYS392 e DYS393 para construção de haplótipos. O DNA foi amplificado com a utilização de primers específicos e os genótipos identificados através de eletroforese vertical em gel de poliacrilamida desnaturante, seguida de coloração com nitrato de prata. Os alelos mais freqüentes foram DYS19*14 (0,629), DYS390*24 (0,513), DYS391*10 (0,575), DYS392*13 (0,413) e DYS393*13 (0,758). Foram observados 150 haplótipos diferentes, dos quais 110 apareceram apenas uma vez. O haplótipo mais comum (DYS19*14, DYS390*24, DYS391*10, DYS392*13, DYS393*13) teve freqüência de 9% na amostra. As diversidades alélicas variaram entre 0,401 para DYS393 e 0,696 para DYS392 e a capacidade de discriminação foi de 98%. Os resultados mostram que esses locos são adequados para análise forense e investigação de paternidade no Estado de Pernambuco

Orientador: Maricilda Palandi de Mello / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T21:08:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Assumpcao_JulianaGodoy_M.pdf: 4702103 bytes, checksum: 280d5cab693fa0542b835e852d403b19 (MD5) Previous issue date: 1998 / Mestrado

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:03:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3683_1.pdf: 1592006 bytes, checksum: 68ed86d07c7cc77c29b5df28d20f47a3 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A síndrome de Turner (ST) que resulta de uma alteração cromossômica caracterizada pela perda parcial ou total do segundo cromossomo sexual. Essa síndrome afeta exclusivamente o sexo feminino, possuindo como principais alterações clínicas a baixa estatura, disgenesia gonadal, atraso no desenvolvimento das características sexuais secundárias femininas e esterilidade. Neste trabalho foi realizada a análise citogenética e molecular de 26 pacientes com suspeita clínica da ST atendidas no Serviço de Genética Médica do Instituto Materno Infantil Prof. Fernando Figueira, no período de maio de 2006 a setembro de 2007. Realizamos um levantamento dos dados clínicos de cada paciente e esses foram relacionados com o cariótipo para definir a potencialidade de cada cariótipo na expressão fenotípica. A análise molecular foi realizada nas pacientes 45,X, com alterações estruturais do cromossomo X e portadoras do cromossomo Y e/ou Y-derivado para verificar a presença de materiais derivados do Y, logo que sua presença tem sido associada ao aumento do risco de desenvolver o gonadoblastoma. Das 26 pacientes cariotipadas, 10 possuíam o cariótipo normal (46,XX) e uma com inversão do cromossomo 9 (46,XX,inv(9)(p11q13), sendo descartada nessas pacientes a suspeita da ST. Uma paciente apresentou o cariótipo 46,XY, revelando uma disgenesia gonadal pura (DGP), sendo positiva para os genes SRY (gene de determinação sexual do cromossomo Y) e DAZ (gene deletado na azoospermia) e negativa para AMGY (gene Amelogenin Y). A ST foi confirmada em 14 pacientes, entre estas, nove possuem o cariótipo 45,X e a análise molecular foi negativa para todos os segmentos do cromossomo Y (SRY, DAZ e AMGY) sendo descartada a possibilidade do desenvolvimento do gonadoblastoma nessas pacientes. Uma paciente apresentou isocromossomo Xq em todas as metáfases analisadas e quatro pacientes foram mosaicos apresentando os seguintes cariótipos: 46,X,dup(X)(q22)[18]/45,X[10]; 45,X[21]/46,XX[3]; 46,X,i(Xq)[20]/45,X[10] e 46,X,i(Yq)[20]/45,X[11], nesta última, a análise molecular revelou ausência do gene SRY, sendo diagnosticada como portadora da disgenesia gonadal mista (DGM). Concluimos que através desse estudo foi possível estabelecer um diagnóstico completo para as pacientes, determinando a presença da ST ou de outras alterações cromossômicas que levaram ao quadro clínico. Ressaltamos a importância de uma avaliação mais precisa da constituição cromossômica com o objetivo de proporcionar às mulheres com ST aconselhamento e tratamento adequados

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:07:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6405_1.pdf: 191338 bytes, checksum: 8ada7aaf9fa68c2c6801bad5016e6b7d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003 / 154 indivíduos não relacionados da população do Estado de Pernambuco (Nordeste do Brasil) foram estudados quanto ao polimorfismo de cinco locos de short tandem repeats (STR). A metodologia usada foi PCR-PAGE seguida de coloração com nitrato de prata. Os alelos mais freqüentes foram: 15 (0.3403), 11 (0.3264), 13 (0.2718), 15 (0.1753) e 30 (0.2247), para os locos D3S1358, D5S818, D8S1179, D18S51e D21S11, respectivamente. Em todos os locos a distribuição genotípica observada encontra-se de acordo com o equilíbrio de Hardy-Weinberg. Com relação aos parâmetros forenses, as heterozigosidades observadas foram: 0,857 para o loco D3S1358, 0,802 para D5S818, 0,805 para D8S1179, 0,890 para D18S51 e 0,904 para D21S11. O poder de exclusão, seguindo a ordem dos locos descrita anteriormente, foi 0,709; 0,603; 0,609; 0,774 e 0,803. O conteúdo de informação do polimorfismo (PIC) foi 0,72 para D3S1358, 0,70 para D5S818, 0,80 para D8S1179, 0,86 para D18S51 e 0,80 para D21S11. O poder de exclusão e o poder de discriminação combinado foi 0,9980 e 0,999998, respectivamente. Comparando-se Pernambuco com suas populações ancestrais, baseado nas distâncias genéticas, pode-se dizer que a população Pernambucana está geneticamente mais próxima das populações Caucasianas Européias (D = 0,0278) do que das Africanas (D = 0,0446). Todos os locos se mostraram bons marcadores para estudos de genética forense e populacional.

Orientador: Diogo Cavalcanti Cabral de Mello / Banca: Rita de Cássia de Moura / Banca: Patricia Pasquali Parise Maltempi / Banca: Ricardo Utsunomia / Banca: Maria Cristina de Almeida / Resumo: Os hemipteros da infraordem Cicadomorpha são representados por aproximadamente 30.000 espécies de insetos sugadores distribuídos mundialmente. Apesar de se destacarem por causarem muitos prejuízos na agricultura e pecuária pouco se sabe sobre a variabilidade genética e cromossômica desses animais que apresentam cromossomos holocentricos. Os DNAs repetitivos são uma ferramenta útil em estudos de diversificação cariotípica, organização e evolução dos genomas. Deste modo, este trabalho teve como objetivo contribuir com o conhecimento sobre a dinâmica dos cariótipos de representantes de Cicadomorpha e a organização de DNAs repetitivos, especificamente: I. analisar o cariótipo de espécies pertencentes a quatro famílias de Cicadomorpha, bem como caracterizar a heterocromatina constitutiva quanto a riqueza de pares de base; II. inferir a respeito da dinâmica evolutiva de famílias gênicas por meio do mapeamento cromossômico; III. analisar a organização cromossômica e testar a conservação interespecífica da sequência telomérica TTAGGn do pool de DNAs repetitivos obtidos (fração C0t) de espécies do gênero Mahanarva e das sequências teloméricas; IV. Analisar o satelitoma de Mahanarva quadripunctata e comparar os diferentes DNAs satélites de seu genoma com o de outras espécies do gênero visando entender a organização e evolução dos satDNAs neste grupo. Os dados obtidos revelam ampla variabilidade cromossômica entre as distintas famílias, causada principalmente por fusões cromossômicas, e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The hemipterans of the Cicadomorpha infraorder are represented by approximately 30.000 species of sucking insects distributed worldwide. Although they stand out by cause many damages in agriculture and livestock, they are poorly studied regarding the genetic and chromosomal variability of these animals that present holocentric chromosomes. Repetitive DNAs are a useful tools in studies of karyotypic diversification, organization and evolution of genomes. The aim of this work was to contribute with knowledge about the dynamics of the karyotypes of Cicadomorpha and the organization of repetitive DNAs, specifically: I. Analyze the karyotype of species belonging to four families of Cicadomorpha, as well as to characterize the constitutive heterochromatin regarding base pairs richess; II. Infer about the evolutionary dynamics of multigene families through the chromosomal mapping; III. Analyze the chromosomal organization and test the interspecific conservation of the telemetric repeat TTAGGn from the pool of repetitive DNA fraction (C0t fraction) of Mahanarva species and telomeric sequences; IV. Analyze the satellitome of Mahanarva quadripunctata and compare the different satellite DNAs of its genome with that from other species of the genus in order to understand the organization and evolution of satDNAs in this group. The data obtained reveal a wide chromosomal variability among the different families, caused mainly by chromosomal fusions, however within a same family the karyoty... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Regina Maria Barretto Cicarelli / Banca: Gilka Jorge Figaro Gattás / Banca: Rogério Nogueira de Oliveira / Resumo: A identificação humana através da análise do ácido desoxirribonucléico (DNA) é realizada pelo estudo de regiões polimórficas do DNA, transferidas dos pais para os filhos pelo mecanismo de herança genética. Os marcadores mais utilizados na rotina forense são regiões microssatélites ou STRs (Short Tandem Repeats) e se classificam em STRs autossômicos (AS STRs), do cromossomo Y (Y-STRs) e do cromossomo X (X-STRs). Estes últimos são de utilização recente nos testes de identificação humana, sendo aplicados com a finalidade de complementar os dados obtidos com os demais marcadores. Tendo em vista a necessidade de ampliação dos dados da população brasileira em relação aos marcadores genéticos, este projeto teve o objetivo de determinar as freqüências alélicas e os parâmetros estatísticos de interesse na prática forense e em testes de paternidade para 5 X-STRs. Para isto foram analisados 120 indivíduos não aparentados, classificados segundo o grupo de cor de pele (30 brancos, 30 pretos, 30 pardos e 30 amarelos) e residentes em Araraquara. Através dos resultados obtidos neste estudo, verificou-se que a população brasileira de Araraquara apresenta particularidades na sua distribuição alélica, havendo diferenças entre esta e demais populações de outros países, sendo que uma maior distância genética foi obtida com a população asiática. Em relação aos marcadores X-STRs analisados, o DXS101 foi o mais polimórfico, seguido por DXS7424, DXS6854, DXS7132 e DXS6808. O poder de discriminação obtido foi de 0,9999928 e 0,9990702 em mulheres e homens, respectivamente, constituindo tal sistema em uma poderosa ferramenta para a prática forense e testes de paternidade. / Abstract:Human identification by examining the desoxirribonucleic acid (DNA) is held by the study of polymorphic regions of the DNA, transferred from the parents to their children by mechanism of genetic inheritance. The more used markers in forensic routine are microsatellites regions or STRs (Short Tandem Repeats) and they can be classified into STRs autosomal (AS STRs), Y chromosome (Y-STRs) and X chromosome (X-STRs). These last two are for use in the recent identification of human testing, being implemented with the aim to complement the data obtained with other markers. Because the needs of expansion of the Brazilian population data in relation to genetic markers, this project aimed to determine the allelic frequencies and the statistical parameters of interest in forensic and paternity tests to 5 X-STRs. To do this were analyzed 120 individuals not related, classified according to its skin color group (30 European Brazilians, 30 Pardo Brazilians, 30 African Brazilians and 30 Oriental Brazilians) and residents in Araraquara. Through the results obtained in this study, it was found that the Brazilian population of Araraquara presents features in its allelic distribution, and there are differences between it and other populations from other countries, and that greater genetic distance was obtained with the Asian population. For X-STRs markers analyzed, DXS101 was the most polymorphic, followed by DXS7424, DXS6854, DXS7132 and DXS6808. The power of discrimination obtained was 0.9999928 and 0.9990702 in women and men, respectively, constituting such a system into a powerful tool for forensic and paternity tests. / Mestre