Os roedores subterrâneos do gênero Ctenomys, popularmente conhecidos como tuco-tucos, são endêmicos ao sul da região Neotropical e apresentam a maior riqueza de espécies do mundo dentre os mamíferos subterrâneos, cerca de 60. Na região da planície costeira do sul do Brasil, a espécie Ctenomys minutus ocupa o maior gradiente latitudinal dentre os tuco-tucos da região. Esta espécie, objeto do presente estudo, foi muito estudada do ponto de vista evolutivo e molecular, mas negligenciada quanto a aspectos ecológicos básicos. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi determinar e descrever as principais características ecológicas de C. minutus, bem como as relações da espécie com aspectos físicos e biológicos do ambiente. Este estudo visou à ampliação do conhecimento ecológico da espécie, no que se refere à ecologia espacial, seleção de habitat e implicações da presença deste roedor na planície costeira do Sul do Brasil, além de aspectos conservacionistas. Os dados obtidos ampliaram o conhecimento ecológico da espécie. Os modelos de distribuição gerados obtiveram sucesso ao identificar áreas com alta adequabilidade ambiental ao longo de sua distribuição. O modelo de máxima entropia (Maxent) indicou que existem áreas de alta adequabilidade ambiental ao longo da primeira linha de dunas e nos campos arenosos ao longo de toda a distribuição da espécie. As variáveis que determinam a distribuição potencial de C. minutus são os tipos de solo, tipos de vegetação e a altitude. Ao longo da planície costeira, observou-se um padrão de associação entre áreas com alta adequabilidade ambiental e maior variabilidade genética, o que indica que maiores valores de diversidade genética estão associados a estas áreas. Também se observou que a especulação imobiliária e fragmentação do ambiente de dunas ao norte da distribuição da espécie, e a silvicultura de Pinus sp. ao sul, são as principais ameaças para a espécie. Nos locais habitados por C. minutus, a presença da espécie afeta a biomassa de plantas, cobertura de gramíneas, proporção de solo exposto, dureza do solo e as concentrações de nutrientes nos campos onde habita. A biomassa de plantas e a cobertura de gramíneas são significativamente inferiores nos locais habitados pelos indivíduos, assim como a proporção de solo exposto é maior. O solo se torna menos compacto nos perfis superficiais (10 e 20 cm), mas não em profundidades maiores (50 cm) nos mesmos locais onde os indivíduos estão presentes. Em relação à disponibilidade de nutrientes no solo, os locais habitados por C. minutus apresentam maior disponibilidade de P e K, assim como um pH significativamente menor. Todos estes efeitos observados são uma consequência das atividades de forrageio e escavação dos animais. Consequentemente, os locais onde os animais estão presentes sofrem um efeito significativo na dinâmica e composição da vegetação, assim como nas propriedades do solo, o que vai afetar diretamente processos ecossistêmicos, como decomposição e produtividade. Além disso, observou-se que a seleção de habitat da espécie é determinada principalmente com base em duas variáveis: umidade do solo e vegetação (disponibilidade de recursos). As características ambientais, tanto superficiais quanto subterrâneas, desempenharam um papel importante na ocorrência deste roedor subterrâneo. Acima da superfície do solo, um fator determinante é a oferta de recursos alimentares, que no caso do presente estudo foi caracterizado pela cobertura das espécies vegetais.

Os roedores subterrâneos do gênero Ctenomys, popularmente conhecidos como tuco-tucos, são endêmicos ao sul da região Neotropical e apresentam a maior riqueza de espécies do mundo dentre os mamíferos subterrâneos, cerca de 60. Na região da planície costeira do sul do Brasil, a espécie Ctenomys minutus ocupa o maior gradiente latitudinal dentre os tuco-tucos da região. Esta espécie, objeto do presente estudo, foi muito estudada do ponto de vista evolutivo e molecular, mas negligenciada quanto a aspectos ecológicos básicos. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi determinar e descrever as principais características ecológicas de C. minutus, bem como as relações da espécie com aspectos físicos e biológicos do ambiente. Este estudo visou à ampliação do conhecimento ecológico da espécie, no que se refere à ecologia espacial, seleção de habitat e implicações da presença deste roedor na planície costeira do Sul do Brasil, além de aspectos conservacionistas. Os dados obtidos ampliaram o conhecimento ecológico da espécie. Os modelos de distribuição gerados obtiveram sucesso ao identificar áreas com alta adequabilidade ambiental ao longo de sua distribuição. O modelo de máxima entropia (Maxent) indicou que existem áreas de alta adequabilidade ambiental ao longo da primeira linha de dunas e nos campos arenosos ao longo de toda a distribuição da espécie. As variáveis que determinam a distribuição potencial de C. minutus são os tipos de solo, tipos de vegetação e a altitude. Ao longo da planície costeira, observou-se um padrão de associação entre áreas com alta adequabilidade ambiental e maior variabilidade genética, o que indica que maiores valores de diversidade genética estão associados a estas áreas. Também se observou que a especulação imobiliária e fragmentação do ambiente de dunas ao norte da distribuição da espécie, e a silvicultura de Pinus sp. ao sul, são as principais ameaças para a espécie. Nos locais habitados por C. minutus, a presença da espécie afeta a biomassa de plantas, cobertura de gramíneas, proporção de solo exposto, dureza do solo e as concentrações de nutrientes nos campos onde habita. A biomassa de plantas e a cobertura de gramíneas são significativamente inferiores nos locais habitados pelos indivíduos, assim como a proporção de solo exposto é maior. O solo se torna menos compacto nos perfis superficiais (10 e 20 cm), mas não em profundidades maiores (50 cm) nos mesmos locais onde os indivíduos estão presentes. Em relação à disponibilidade de nutrientes no solo, os locais habitados por C. minutus apresentam maior disponibilidade de P e K, assim como um pH significativamente menor. Todos estes efeitos observados são uma consequência das atividades de forrageio e escavação dos animais. Consequentemente, os locais onde os animais estão presentes sofrem um efeito significativo na dinâmica e composição da vegetação, assim como nas propriedades do solo, o que vai afetar diretamente processos ecossistêmicos, como decomposição e produtividade. Além disso, observou-se que a seleção de habitat da espécie é determinada principalmente com base em duas variáveis: umidade do solo e vegetação (disponibilidade de recursos). As características ambientais, tanto superficiais quanto subterrâneas, desempenharam um papel importante na ocorrência deste roedor subterrâneo. Acima da superfície do solo, um fator determinante é a oferta de recursos alimentares, que no caso do presente estudo foi caracterizado pela cobertura das espécies vegetais.

Os roedores subterrâneos do gênero Ctenomys, popularmente conhecidos como tuco-tucos, são endêmicos ao sul da região Neotropical e apresentam a maior riqueza de espécies do mundo dentre os mamíferos subterrâneos, cerca de 60. Na região da planície costeira do sul do Brasil, a espécie Ctenomys minutus ocupa o maior gradiente latitudinal dentre os tuco-tucos da região. Esta espécie, objeto do presente estudo, foi muito estudada do ponto de vista evolutivo e molecular, mas negligenciada quanto a aspectos ecológicos básicos. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi determinar e descrever as principais características ecológicas de C. minutus, bem como as relações da espécie com aspectos físicos e biológicos do ambiente. Este estudo visou à ampliação do conhecimento ecológico da espécie, no que se refere à ecologia espacial, seleção de habitat e implicações da presença deste roedor na planície costeira do Sul do Brasil, além de aspectos conservacionistas. Os dados obtidos ampliaram o conhecimento ecológico da espécie. Os modelos de distribuição gerados obtiveram sucesso ao identificar áreas com alta adequabilidade ambiental ao longo de sua distribuição. O modelo de máxima entropia (Maxent) indicou que existem áreas de alta adequabilidade ambiental ao longo da primeira linha de dunas e nos campos arenosos ao longo de toda a distribuição da espécie. As variáveis que determinam a distribuição potencial de C. minutus são os tipos de solo, tipos de vegetação e a altitude. Ao longo da planície costeira, observou-se um padrão de associação entre áreas com alta adequabilidade ambiental e maior variabilidade genética, o que indica que maiores valores de diversidade genética estão associados a estas áreas. Também se observou que a especulação imobiliária e fragmentação do ambiente de dunas ao norte da distribuição da espécie, e a silvicultura de Pinus sp. ao sul, são as principais ameaças para a espécie. Nos locais habitados por C. minutus, a presença da espécie afeta a biomassa de plantas, cobertura de gramíneas, proporção de solo exposto, dureza do solo e as concentrações de nutrientes nos campos onde habita. A biomassa de plantas e a cobertura de gramíneas são significativamente inferiores nos locais habitados pelos indivíduos, assim como a proporção de solo exposto é maior. O solo se torna menos compacto nos perfis superficiais (10 e 20 cm), mas não em profundidades maiores (50 cm) nos mesmos locais onde os indivíduos estão presentes. Em relação à disponibilidade de nutrientes no solo, os locais habitados por C. minutus apresentam maior disponibilidade de P e K, assim como um pH significativamente menor. Todos estes efeitos observados são uma consequência das atividades de forrageio e escavação dos animais. Consequentemente, os locais onde os animais estão presentes sofrem um efeito significativo na dinâmica e composição da vegetação, assim como nas propriedades do solo, o que vai afetar diretamente processos ecossistêmicos, como decomposição e produtividade. Além disso, observou-se que a seleção de habitat da espécie é determinada principalmente com base em duas variáveis: umidade do solo e vegetação (disponibilidade de recursos). As características ambientais, tanto superficiais quanto subterrâneas, desempenharam um papel importante na ocorrência deste roedor subterrâneo. Acima da superfície do solo, um fator determinante é a oferta de recursos alimentares, que no caso do presente estudo foi caracterizado pela cobertura das espécies vegetais.

Existem atualmente oito espécies de tuco-tucos, roedores subterrâneos do gênero Ctenomys descritas para o Brasil. Quatro delas, que habitam a região sul, são bem conhecidas e estudadas: C. flamarioni, C. minutus, C. lami e C. torquatus. As outras: C. brasiliensis, C. nattereri, C. rondoni e C. bicolor, que habitam a região noroeste possuem como conhecimento científico apenas a descrição de cada uma delas. Pouco ou nenhum material testemunho de suas descrições e um abandono por parte da ciência em uma lacuna de tempo de mais de cem anos sem que seu status taxonômico, evolutivo ou qualquer tipo de conhecimento tenha sido pesquisado levaram ao questionamento destas entidades como espécies válidas. Sabendo da existência de populações de tuco-tucos habitando os estados de Mato-Grosso e Rondônia, foram realizadas expedições de levantamento e coleta de dados objetivando abranger a distribuição noroeste brasileira do gênero Ctenomys tratando de elucidar as questões evolutivas e taxonômicas existentes. Foram coletados cinquenta indivíduos em cinco populações distintas e analisados quanto ao cariótipo, através de análises moleculares utilizando o DNA mitocondrial, quanto a morfologia externa e a morfometria geométrica craniana dos espécimes encontrados. Com base nos resultados obtidos este trabalho eleva novamente ao nível de espécie C. nattereri, que havia sido sinonimizado a C. boliviensis por falta de trabalhos mais consistentes de comparação entre as duas espécies. Também redescobrimos e validamos como espécie C. bicolor, a espécie que habita mais ao norte dentre as 60 espécies conhecidas do gênero. Propõesse a descrição de uma nova espécie, C. amazonicus, habitando o interior da floresta amazônica na sua porção leste, o que é uma novidade para o gênero, que habitualmente ocupa áreas de vegetação aberta. O presente trabalho aduda a resolver questões importantes ao entendimento de parte da biodiversidade brasileira, que só pode ser realizado com o uso de diferentes abordagens, que permitiram um parecer irrevogável da situação destas entidades biológicas e traz a luz do conhecimento científico um novo grupo de espécies que possui características evolutivas únicas. / There are currently eight species of tuco-tucos, subterranean rodents of the genus Ctenomys described for Brazil. Four of them, who inhabit the southern region, are well known and studied: C. flamarioni C. minutus, C. lami and C. torquatus. The others: C. brasiliensis, C. nattereri, C. rondoni and C. bicolor, inhabiting the northwest have only the description of each as scientific knowledge. Little or no material witness to their description and abandonment by science in a time gap of more than one hundred years without their taxonomic status, evolution or any kind of knowledge has been investigated led to the questioning of these entities as valid species. Knowing the existence of populations of tuco-tucos inhabiting the states of Mato Grosso and Rondonia, expeditions were carried out to survey and collect data aiming to cover the distribution of the genus Ctenomys in the northwestern Brazil trying to clarify the existing taxonomic and evolutionary questions. Fifty individuals were collected in five distinct populations and analyzed for karyotype, molecular analysis using mitochondrial DNA, plus external morphology and cranial geometric morphometrics of specimens. This work elevates to the level of species C. nattereri, which had been synonymized to C. boliviensis for lack of more consistent comparison between the two species. Also rediscovered and validated as a species C. bicolor, the species that inhabits farther north among the 60 known species of the genus. A new species was discovered, C. amazonicus, inhabiting the interior of the Amazon rainforest in its eastern portion, which is new to the genus, which usually occupies open vegetated areas. Necessary issues were resolved to the understanding of Brazilian biodiversity, which can only be achieved by using different approaches, which allowed an irrevocable opinion of the situation of these biological entities and bring the light of scientific knowledge to a new group of species that have exclusive evolutionary characteristics.

Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.

Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.

Existem atualmente oito espécies de tuco-tucos, roedores subterrâneos do gênero Ctenomys descritas para o Brasil. Quatro delas, que habitam a região sul, são bem conhecidas e estudadas: C. flamarioni, C. minutus, C. lami e C. torquatus. As outras: C. brasiliensis, C. nattereri, C. rondoni e C. bicolor, que habitam a região noroeste possuem como conhecimento científico apenas a descrição de cada uma delas. Pouco ou nenhum material testemunho de suas descrições e um abandono por parte da ciência em uma lacuna de tempo de mais de cem anos sem que seu status taxonômico, evolutivo ou qualquer tipo de conhecimento tenha sido pesquisado levaram ao questionamento destas entidades como espécies válidas. Sabendo da existência de populações de tuco-tucos habitando os estados de Mato-Grosso e Rondônia, foram realizadas expedições de levantamento e coleta de dados objetivando abranger a distribuição noroeste brasileira do gênero Ctenomys tratando de elucidar as questões evolutivas e taxonômicas existentes. Foram coletados cinquenta indivíduos em cinco populações distintas e analisados quanto ao cariótipo, através de análises moleculares utilizando o DNA mitocondrial, quanto a morfologia externa e a morfometria geométrica craniana dos espécimes encontrados. Com base nos resultados obtidos este trabalho eleva novamente ao nível de espécie C. nattereri, que havia sido sinonimizado a C. boliviensis por falta de trabalhos mais consistentes de comparação entre as duas espécies. Também redescobrimos e validamos como espécie C. bicolor, a espécie que habita mais ao norte dentre as 60 espécies conhecidas do gênero. Propõesse a descrição de uma nova espécie, C. amazonicus, habitando o interior da floresta amazônica na sua porção leste, o que é uma novidade para o gênero, que habitualmente ocupa áreas de vegetação aberta. O presente trabalho aduda a resolver questões importantes ao entendimento de parte da biodiversidade brasileira, que só pode ser realizado com o uso de diferentes abordagens, que permitiram um parecer irrevogável da situação destas entidades biológicas e traz a luz do conhecimento científico um novo grupo de espécies que possui características evolutivas únicas. / There are currently eight species of tuco-tucos, subterranean rodents of the genus Ctenomys described for Brazil. Four of them, who inhabit the southern region, are well known and studied: C. flamarioni C. minutus, C. lami and C. torquatus. The others: C. brasiliensis, C. nattereri, C. rondoni and C. bicolor, inhabiting the northwest have only the description of each as scientific knowledge. Little or no material witness to their description and abandonment by science in a time gap of more than one hundred years without their taxonomic status, evolution or any kind of knowledge has been investigated led to the questioning of these entities as valid species. Knowing the existence of populations of tuco-tucos inhabiting the states of Mato Grosso and Rondonia, expeditions were carried out to survey and collect data aiming to cover the distribution of the genus Ctenomys in the northwestern Brazil trying to clarify the existing taxonomic and evolutionary questions. Fifty individuals were collected in five distinct populations and analyzed for karyotype, molecular analysis using mitochondrial DNA, plus external morphology and cranial geometric morphometrics of specimens. This work elevates to the level of species C. nattereri, which had been synonymized to C. boliviensis for lack of more consistent comparison between the two species. Also rediscovered and validated as a species C. bicolor, the species that inhabits farther north among the 60 known species of the genus. A new species was discovered, C. amazonicus, inhabiting the interior of the Amazon rainforest in its eastern portion, which is new to the genus, which usually occupies open vegetated areas. Necessary issues were resolved to the understanding of Brazilian biodiversity, which can only be achieved by using different approaches, which allowed an irrevocable opinion of the situation of these biological entities and bring the light of scientific knowledge to a new group of species that have exclusive evolutionary characteristics.

Existem atualmente oito espécies de tuco-tucos, roedores subterrâneos do gênero Ctenomys descritas para o Brasil. Quatro delas, que habitam a região sul, são bem conhecidas e estudadas: C. flamarioni, C. minutus, C. lami e C. torquatus. As outras: C. brasiliensis, C. nattereri, C. rondoni e C. bicolor, que habitam a região noroeste possuem como conhecimento científico apenas a descrição de cada uma delas. Pouco ou nenhum material testemunho de suas descrições e um abandono por parte da ciência em uma lacuna de tempo de mais de cem anos sem que seu status taxonômico, evolutivo ou qualquer tipo de conhecimento tenha sido pesquisado levaram ao questionamento destas entidades como espécies válidas. Sabendo da existência de populações de tuco-tucos habitando os estados de Mato-Grosso e Rondônia, foram realizadas expedições de levantamento e coleta de dados objetivando abranger a distribuição noroeste brasileira do gênero Ctenomys tratando de elucidar as questões evolutivas e taxonômicas existentes. Foram coletados cinquenta indivíduos em cinco populações distintas e analisados quanto ao cariótipo, através de análises moleculares utilizando o DNA mitocondrial, quanto a morfologia externa e a morfometria geométrica craniana dos espécimes encontrados. Com base nos resultados obtidos este trabalho eleva novamente ao nível de espécie C. nattereri, que havia sido sinonimizado a C. boliviensis por falta de trabalhos mais consistentes de comparação entre as duas espécies. Também redescobrimos e validamos como espécie C. bicolor, a espécie que habita mais ao norte dentre as 60 espécies conhecidas do gênero. Propõesse a descrição de uma nova espécie, C. amazonicus, habitando o interior da floresta amazônica na sua porção leste, o que é uma novidade para o gênero, que habitualmente ocupa áreas de vegetação aberta. O presente trabalho aduda a resolver questões importantes ao entendimento de parte da biodiversidade brasileira, que só pode ser realizado com o uso de diferentes abordagens, que permitiram um parecer irrevogável da situação destas entidades biológicas e traz a luz do conhecimento científico um novo grupo de espécies que possui características evolutivas únicas. / There are currently eight species of tuco-tucos, subterranean rodents of the genus Ctenomys described for Brazil. Four of them, who inhabit the southern region, are well known and studied: C. flamarioni C. minutus, C. lami and C. torquatus. The others: C. brasiliensis, C. nattereri, C. rondoni and C. bicolor, inhabiting the northwest have only the description of each as scientific knowledge. Little or no material witness to their description and abandonment by science in a time gap of more than one hundred years without their taxonomic status, evolution or any kind of knowledge has been investigated led to the questioning of these entities as valid species. Knowing the existence of populations of tuco-tucos inhabiting the states of Mato Grosso and Rondonia, expeditions were carried out to survey and collect data aiming to cover the distribution of the genus Ctenomys in the northwestern Brazil trying to clarify the existing taxonomic and evolutionary questions. Fifty individuals were collected in five distinct populations and analyzed for karyotype, molecular analysis using mitochondrial DNA, plus external morphology and cranial geometric morphometrics of specimens. This work elevates to the level of species C. nattereri, which had been synonymized to C. boliviensis for lack of more consistent comparison between the two species. Also rediscovered and validated as a species C. bicolor, the species that inhabits farther north among the 60 known species of the genus. A new species was discovered, C. amazonicus, inhabiting the interior of the Amazon rainforest in its eastern portion, which is new to the genus, which usually occupies open vegetated areas. Necessary issues were resolved to the understanding of Brazilian biodiversity, which can only be achieved by using different approaches, which allowed an irrevocable opinion of the situation of these biological entities and bring the light of scientific knowledge to a new group of species that have exclusive evolutionary characteristics.

Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.

A Ordem Rodentia é considerada a mais diversa entre os mamíferos, compreendendo cerca de 2.277 espécies descritas, distribuídas em 34 famílias. Roedores subterrâneos têm representantes distribuídos em todos os continentes, à exceção da Oceania e da Antártida. Na América do Sul, são representados pela família Ctenomyidae e seu único gênero, Ctenomys, o mais diverso entre os roedores subterrâneos, com cerca de 60 espécies descritas. Ctenomídeos são territorialistas, em geral solitários, e dependentes de um sistema de galerias para sobrevivência, deixando esses sistemas apenas para buscar alimento, procurar parceiro para reprodução ou para migração. Tais características refletem na estruturação genética entre populações, que podem ser divididas em subpopulações, ou demes. Neste estudo foram analisados 91 indivíduos de Ctenomys, distribuídos em nove populações localizadas nos estados do Mato Grosso populações PL (Pontes e Lacerda), CA (Cáceres), SP (Sapezal), NO (Nova Olímpia), NU1 (Nova Ubiratã 1), NU2 (Nova Ubiratã 2), FN (Feliz Natal) e NM (Nova Mutum) e de Rondônia; PB (Pimenta Bueno), para quatro loci de DNA mitocondrial e 14 loci de microssatélites, de modo a inferir padrões estruturação genética ancestral e atual para as populações conhecidas, posicionando-as numa filogenia expandida para o gênero Ctenomys. Análises dos marcadores mitocondriais revelam estruturação genética ancestral entre a maioria dos pares populacionais, à exceção de populações geograficamente próximas, para alguns marcadores; filogenias interpopulacionais formam dois grandes clados, o Norte populações NO, NU1, NU2 e FN e o Sul populações PL, CA e SP. PB e NM compartilham ancestral comum mais recente para alguns dos loci mitocondriais, mas variam de posição nas filogenias, não constituindo um clado. Na filogenia interespecífica, as populações de estudo constituem as espécies mais derivadas do grupo boliviensis, sendo um grupo monofilético, que compartilha ancestral comum mais recente com o grupo de espécies do oeste e sudoeste da Bolívia, norte do Chile e norte da Argentina (grupo opimus). Análises com microssatélites encontram estruturação genética atual entre todos os pares de populações do Clado Norte e do Clado Sul, mesmo entre populações geograficamente próximas. O padrão de estruturação genética encontrado não pode ser explicado apenas pela disposição geográfica das populações, sendo propostas algumas barreiras geográficas, que, em conjunto com o acúmulo aleatório de mutações nas sequências de DNA dos marcadores analisados, possam explicar o padrão de estruturação genética observado. Análises acessórias às análises com marcadores moleculares, como identificação do padrão cariotípico e da morfologia craniana de cada indivíduo, são necessárias para confirmar o número de espécies presentes na área de estudo, que são estimadas em, no mínimo três, com base nas análises moleculares conduzidas neste estudo e em estudos anteriores, e conhecimento prévio do padrão cariotípico e da morfologia craniana de algumas populações. / The Order Rodentia is considered to be the most diverse among mammals, comprising approximately 2,277 known species, sorted among 34 families. Subterranean rodents are distributed in all continents, except for Oceania and Antartida. In South America they are represented by the Family Ctenomyidae and its single genus, Ctenomys, the most diverse genus of subterranean rodents, comprising approximately 60 known species. Individuals of the genus Ctenomys are generally solitary, territorialist, and rely upon a system of galleries to survive, emerging only to secure food, mate, or migrate. Such characteristics result in genetic structuring among populations, which can be subdivided in subpopulations or demes. 91 individuals from nine populations from the states of Mato Grosso PL (Pontes e Lacerda), CA (Cáceres), SP (Sapezal), NO (Nova Olímpia), NU1 (Nova Ubiratã 1), NU2 (Nova Ubiratã 2), FN (Feliz Natal) and NM (Nova Mutum) populations and Rondônia PB (Pimenta Bueno) population were amplified for four mitochondrial DNA loci, and 14 microsatellite loci, allowing the inference of patterns of ancestral and present genetic structure for the known populations, and positioning them in an expanded phylogeny for the genus Ctenomys. Mitochondrial markers reveal genetic structure between most pairs of population comparisons, except for geographically close populations, given the marker. Population level phylogenies structure populations into two major clades, the Northern Clade NO, NU1, NU2 and FN populations and the Southern Clade PL, CA and SP populations. The PB and NM populations share their most recent common ancestor depending on the locus being analyzed, but do not occupy a fixed position in the phylogenies neither comprise a clade of their own. A species level phylogeny considers the study populations to be the most recently diverged populations among the boliviensis group, a monophyletic group of species, and share their most recent common ancestor with the opimus group, which comprise species distributed in West and Southwest Bolivia, Northern Chile and Northern Argentina. Microsatellite analysis of present population structure reveal genetic structuring between all pairs of populations from the Southern and Northern clades. Overall patterns of genetic structuring cannot be resolved by the geographic distance between populations, and so geographic barriers have to be proposed in order to explain the patterns of genetic structure observed, complementing the random accumulation of mutations in diverging DNA sequences of neutrally evolving molecular markers. Analysis which are complementary to molecular analysis, such as karyotype and skull morphometry analysis, are required to confirm the number of species present at the study area, which is estimated at at least three species and previous knowledge of karyotype and skull morphometry patterns available for some of the populations.