Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

L'estimation de paramètres génétiques est un problème important dans le domaine de la génétique mathématique et statistique. Il existe plusieurs méthodes s'attaquant à ce problème. Certaines d'entre elles utilisent la méthode du maximum de vraisemblance. Celle-ci peut être calculée à l'aide des équations exactes de Griffiths-Tavaré, équations de récurrence provenant du processus de coalescence. Il s'agit alors de considérer plusieurs histoires possibles qui relient les données de l'échantillon initial de séquences d'ADN à un ancêtre commun. Habituellement, certaines des histoires possibles sont simulées, en conjonction avec l'application des méthodes Monte-Carlo. Larribe et al. (2002) utilisent cette méthode (voir chapitre IV). Nous explorons une nouvelle approche permettant d'utiliser les équations de Griffiths-Tavaré de façon différente pour obtenir une estimation quasi exacte de la vraisemblance sans avoir recours aux simulations. Pour que le temps de calcul nécessaire à l'application de la méthode demeure raisonnable, nous devons faire deux compromis majeurs. La première concession consiste à limiter le nombre de recombinaisons permises dans les histoires. La seconde concession consiste à séparer les données en plusieurs parties appelées fenêtres. Nous obtenons ainsi plusieurs vraisemblances marginales que nous mettons ensuite en commun en appliquant le principe de vraisemblance composite. À l'aide d'un programme écrit en C++, nous appliquons notre méthode dans le cadre d'un problème de cartographie génétique fine où nous voulons estimer la position d'une mutation causant une maladie génétique simple. Notre méthode donne des résultats intéressants. Pour de très petits ensembles de données, nous montrons qu'il est possible de permettre un assez grand nombre de recombinaisons pour qu'il y ait convergence dans la courbe de vraisemblance obtenue. Aussi, il est également possible d'obtenir des courbes dont la forme et l'estimation du maximum de vraisemblance sont similaires à celles obtenues avec la méthode de Larribe et al. Cependant, notre méthode n'est pas encore applicable dans son état actuel parce qu'elle est encore trop exigeante en termes de temps de calcul. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Équations exactes de Griffiths-Tavaré, Paramètres génétiques, Processus de coalescence, Vraisemblance composite.

Ce mémoire traite de modèles d'arborescences en régression logistique 4-nomiale pour rendre compte du cas où les résultats proviennent de séquences d'expérience multinomiales consécutives ou parallèles. Dans le premier chapitre, nous rappelons le modèle général de régression logistique multinomiale et présentons une méthode d'estimation individuelle des paramètres. Le chapitre suivant rapporte les recherches de Rousseau et Sankoff sur les modèles d'arborescences en régression logistique et présente du même coup le cadre dans lequel la présente étude s'inscrit.. Le troisième chapitre porte sur différents résultats qui caractérisent les paramètres pour lesquels certaines structures d'arborescences sont équivalentes. Finalement, le dernier chapitre présente une étude de simulations Monte-Carlo effectuée pour comprendre et mettre en évidence les facteurs influençant l'ordre (selon le maximum de vraisemblance) dans lequel les arborescences sont sélectionnées. Ces simulations ont permis d'identifier certains principes auxquels cet ordre obéit, selon la forme du vecteur des paramètres et la grandeur de ces derniers. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Régression logistique, Arborescences, Modèles réduits.

Thèse doctorat : Génétique moléculaire : Nancy 1 : 2005. / Titre provenant de l'écran-titre.

Thèse de doctorat : Sciences du Vivant. Biologie cellulaire et moléculaire des Plantes : Strasbourg 1 : 2007. / Thèse soutenue sur un ensemble de travaux. Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. 17 p.

Dans cette thèse, nous présentons l'ensemble de nos contributions relatives à la mise en oeuvre et à la validation de techniques d'extraction d'une courbe de l'activité d'un traceur radioactif, dite courbe d'entrée (CE), à partir des images enregistrées par tomographie d'émission par positrons (TEP). Cette courbe est primordiale pour la quantification de paramètres physiologiques et métaboliques comme le métabolisme du glucose au niveau du myocarde chez le petit animal. La modalité d'imagerie TEP sert à déceler, à des phases souvent précoces, le dysfonctionnement d'un organe par un examen médical. L'examen consiste en une injection d'un élément radioactif, émetteur de positrons attachés à une molécule caractérisée par les mêmes propriétés chimiques et biologiques qu'une molécule naturelle, et de suivre son activité temporelle. La quantité du traceur mesurée dans le plasma sanguin en fonction du temps constitue la CE, tandis que la radioactivité mesurée dans les tissus par la TEP constitue la réponse des tissus. La CE et la réponse des tissus sont les fonctions fondamentales d'un modèle mathématique appelé "le modèle pharmacocinétique" qui estime les paramètres physiologiques et métaboliques. Habituellement la CE est obtenue d'une manière invasive par un prélèvement sanguin qui se fait parallèlement à l'acquisition des données. En plus, elle nécessite une chaîne de préparation pour enregistrer la concentration du traceur radioactif dans le plasma et une fréquence d'échantillonnage corrélée avec le découpage de la séquence d'images. Dans le cadre de nos recherches, nous avons développé des techniques d'extraction de la CE directement à partir d'une séquence d'images TEP. Cette approche présente l'avantage d'être non-invasive et permet un contrôle sur la fréquence d'échantillonnage temporel. Néanmoins, la résolution spatiale, les limites physiques, les limites physiologiques et les limites méthodologiques reliées à la reconstruction d'images sont des facteurs qui détériorent la qualité de la courbe. Dans un premier temps, nous avons appliqué un concept probabiliste à l'intérieur de deux régions d'intérêts (Ris) tracées sur la séquence d'images délimitant le ventricule gauche et le myocarde. La méthode estime la fraction du sang dans les deux régions pour déterminer une CE non dégradée par les effets mentionnés précédemment. Cette approche a permis de corriger la courbe en tenant compte des effets causés par la contamination spatiale. Dans un deuxième temps, nous avons travaillé sur la réduction de l'effet du mouvement du coeur et des poumons sur la qualité de la CE. Pour cela, nous avons utilisé une acquisition de données synchronisée par rapport à l'électrocardiogramme (ECG). Cette acquisition nécessite un suivi automatique des RIs sur les différents cadres synchronisés. Pour remédier aux effets de la faible résolution spatiale des images, nous avons développé un modèle particulier d'un contour déformable qui répond aux faiblesses des images TEP. Notre modèle est capable de délimiter le ventricule gauche et le myocarde sur les images d'une façon quasi-automatique. Finalement, nous avons généralisé l'idée de l'extraction de la CE pour différents traceurs tels que le glucose marqué au fluor ([indice supérieur 18]F-FDG), l'ammoniaque marqué à l'azote ([indice supérieur 13]N-ammoniaque), le [indice supérieur 82] rubidium ([indice supérieur 82]Rb) et l'acétate marqué au carbone ([indice supérieur 11]C-acétate). Le modèle que nous avons développé est basé sur l'estimation de la CE par l'analyse en composante indépendante (ACI) et la distribution gaussienne généralisée (DGG). Tous nos résultats pour le traceur [indice supérieur 18]F-FDG sont comparés à la méthode de référence classique, à savoir le prélèvement sanguin. Les résultats de l'extraction de la CE par l'ACI ont été comparés à ceux extraits par la méthode de référence et par la moyenne de l'activité d'une RI segmentée manuellement sur les images. Les résultats montrent l'apport de la méthode sur l'amélioration de la courbe lorsque celle-ci est dégradée par la contamination croisée. Le travail accompli dans cette thèse montre la possibilité de contourner les limites de l'imagerie TEP par l'utilisation d'approches statistiques dans le but d'extraire une CE fiable. Les méthodes développées représentent une alternative à la méthode invasive d'échantillonnage sanguin.

The theme of this study is the power of women as evidenced in the novels of Andrée Maillet, particularly in one of her later novels, A la mémoire d'un héros. In order to establish the purpose of the author, it was imperative to define power as it is generally understood, as its meaning has evolved and as it is defined by the women specifically concerned with regaining their independence, in this case the feminists of America. During the analysis of the novel selected, it becomes evident that the study of power necessarily leads to the study of powerlessness in women and to the discovery of the roots of their surrender to the control of others. The research on patriarchy, the force that keeps women down, well documented by women writers such as Simone de Beauvoir, Carolyn Heilbrun, Lisa Hobbs and Caroline Bird sheds new light on Maillet's novel, which at first reading appears to be a simple romantic tale of a young woman studying abroad, meeting people of a different culture and falling in love. Maillet's novel goes much deeper, as she reveals the struggle of the heroine whose stern upbringing prevents her from adapting comfortably to the freedom of her new environment. The study of the three women who have tried to prepare their young charge for life helps understand why this heroine is at an impasse, why she eventually opts for a career rather than for love. In a subtle way, Maillet brings out the grief and hardships of women, their difficulty in dealing with relationships, with war and death, and with the acquisition of greater freedom, independence and power. In this slim volume, the author incorporates a portrait of the French-Canadian bourgeoisie; she sheds light on Quebec culture and introduces many well-known personalities of Quebec while punctuating her tale with intriguing symbols and myths of the world. The depth and originality of her writing, her style which has been widely admired, justify an in-depth analysis of this novel. The feminist angle in this analysis situates the author and her work in relation to other North American women writing in a similar context. / Arts, Faculty of / French, Hispanic, and Italian Studies, Department of / Graduate

Thèse (M. Serv. Soc.)--Université Laval, 2008. / Bibliogr.: f. 61-62. Publié aussi en version électronique dans la Collection Mémoires et thèses électroniques.

Dans ce travail, j'ai étudié l'analyse des régressions linéaire et logistique comme méthodes de traitement des facteurs de confusion, qui ont servi à déterminer les effets d'une erreur de mesure dans une variable de confusion.

Les parents qui apprennent que leur enfant est atteint d'une condition médicale incurable vivent de profonds bouleversements personnels, émotifs, sociaux et spirituels. Le but de cette étude doctorale est de trouver une piste explicative à l'évolution de leur attitude envers la vie. Le cadre théorique se base sur les concepts de récit et d'identité de Ricoeur. La spiritualité fut retenue pour expliquer l'évolution (ou non) des parents vers une sérénité. A l'aide d'entrevues, une typologie en trois modèles d'identité spirituelle fut établie. Les parents du modèle « Toute-puissance » délèguent à l'A-autre la résolution de leur problème et ainsi ne participent pas activement à la construction de leur récit, ne permettant pas d'accéder à un sens réparateur. Les parents du modèle « Moi » ne croient qu'en eux-mêmes; ils ne délèguent aucune décision. Ces parents vivent un stress constant. Le troisième modèle « Guide » est constitué des parents les plus sereins. Ils présentent une spiritualité mature, ils se sentent guidés et protégés et envisagent avec joie leur évolution spirituelle. Cette typologie tripartite est retrouvée dans la littérature scientifique à plusieurs reprises. Les perspectives pour les soignants s'occupant de ces enfants sont discutées.