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Caracterização da interação Musa acuminata-Pseudocercospora musae / Characterization of the Musa acuminata-Pseudocercospora musae interaction

Rego, Erica Cristina Silva 27 February 2018 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2018. / Texto parcialmente liberado pelo autor. Conteúdo restrito: páginas 51, 52, 53, 55, 57 e anexos. / Submitted by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-08-30T18:16:15Z No. of bitstreams: 1 2018_EricaCristinaSilvaRego_PARCIAL.pdf: 2019467 bytes, checksum: 947f4fafb34f1929db0e14ebbcfd84ad (MD5) / Rejected by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br), reason: Boa tarde, Rejeitado a pedido do submetedor. on 2018-08-30T18:17:42Z (GMT) / Submitted by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-08-30T18:23:27Z No. of bitstreams: 1 2018_EricaCristinaSilvaRego_PARCIAL.pdf: 2019467 bytes, checksum: 947f4fafb34f1929db0e14ebbcfd84ad (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-09-10T17:32:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_EricaCristinaSilvaRego_PARCIAL.pdf: 2019467 bytes, checksum: 947f4fafb34f1929db0e14ebbcfd84ad (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-10T17:32:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_EricaCristinaSilvaRego_PARCIAL.pdf: 2019467 bytes, checksum: 947f4fafb34f1929db0e14ebbcfd84ad (MD5) Previous issue date: 2018-08-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES); Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) e Fundação de Apoio a Pesquisa do Distrito Federal (FAPDF). / A bananeira (Musa spp.) é uma das principais fontes de alimento do mundo. A banana é uma das frutas mais consumidas na maioria dos países tropicais e subtropicais, sendo componente básico da alimentação de mais de 400 milhões de pessoas. Um grande número de patógenos causam doenças na cultura da bananeira, dentre os principais agentes estão os vírus, bactérias, nematoides e fungos. Os fungos se destacam como um dos principais causadores de perdas na produção por causarem doenças como a Sigatoka-amarela, Sigatoka-negra, e Mal do Panamá. Pseudocercospora musae (Zimm.) Deighton é o agente causal da Sigatoka-amarela, e se destaca como a principal doença fúngica da bananeira. P. musae é um patógeno hemibiotrófico, e sua a infecção ocorre por meio dos estômatos. O objetivo geral desse trabalho é caracterizar os componentes moleculares presentes na interação M. acuminata – P. musae que exerçam possíveis papéis na defesa da planta frente à infecção. Desta forma foram validados nove pares de primers para oito genes de referência com o objetivo de normalizar a expressão gênica de genes alvos em RT-qPCR em Musa. Os genes utilizados foram Actina 1 (ACT1), Adenina Fosforibosil Transferase (APT), Fator de elongação 1 alfa (EF), Gliceraldeído-3-Fosfato Desidrogenase (GAPDH), Tubulina alfa (TUBA), GTP-Binding Nuclear Protein (RAN), Ubiquitina 1 (UBIQ1) e Ubiquitina 2 (UBIQ2). As análises demostraram que os genes mais estáveis foram Ubiquitina 2 e RAN. As análises de expressão diferencial de seis genes alvos por RT-qPCR demostraram que a maioria dos genes potencialmente envolvidos em processo de defesa não foram modulados. Foi realizado também sequenciamento Illumina de isolado de P. musae in vitro a fim de identificar os microRNAs (miRNAs) do fungo. Um total de 101 pré-miRNAs candidatos foram identificados, e os alvos potenciais desses miRNAs foram preditos usando a ferramenta psRNATarget, onde foram identificados um total de 381 genes alvos no genoma de Musa acuminata. Foi observado que alguns desses genes alvos tem papel potencial em resistência a estresse biótico, tais como, NBS-LRR, fatores de transcrição da superfamília WRKY, genes análogos em resistência (RGAs) tais como, RGA1 e RGA3, citocromo P450 e quinases. A identificação contínua de genes envolvidos em resposta ao estresse biótico em M. acuminata, junto com a caracterização de miRNAs no patógeno e seu papel na modulação de expressão gênica, contribuirão para o desenvolvimento de métodos de controle da doença Sigatoka-amarela. / Banana (Musa spp.) is one of the world's most important crops, and the most popular fruit in many tropical and subtropical countries. It is a staple food for millions of people throughout the developing world. Musa spp. are hosts to many infectious diseases caused bv a vast array of phytopathogenic fungi, bacteria, viruses, and nematodes. Fungal diseases may cause considerable yield losses in banana. They are responsible for diseases such as Yellow Sigatoka, Black Sigatoka, and Panama Disease. Pseudocercospora musae (Zimm.) Deighton is the causal agent of Yellow Sigatoka, and stands out as one of the main fungal diseases of banana. P. musae is a hemibiotrophic pathogen, and its´ infection occurs through the stomata. The aim of this study is to characterize molecular compounds of the interaction Musa acuminata - P. musae that may exert possible roles in defense of the plant against infection. Nine pairs of primers were validated for eight potential reference genes with the objective of enabling accurate normalization of gene expression of target genes in RT-qPCR for Musa. The genes used were Actin 1 (ACT1), Adenine phosphoribosyltransferase (APT), Elongation factor 1-alpha (EF), Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), Alpha-tubulin (TUBA), GTP-Binding Nuclear Protein (RAN), Ubiquitin 1 (UBIQ1) e Ubiquitin 2 (UBIQ2). The results showed that the most stable genes were Ubiquitin 2 and GTP-binding nuclear protein RAN. Differential expression analysis of six target genes demonstrated that most of the genes potentially involved in the defense process were not modulated. Illumina sequencing of P. musae in vitro was also carried out to identify microRNAs (miRNAs). A total of 101 candidate pre-miRNAs were identified, and potential gene targets of these miRNAs were predicted using psRNATarget. A total of 381 target genes in M. acuminata genome were identified. Some of these target genes are likely involved in resistance, such as NBS-LRRs, WRKY transcription factors, resistance gene analogs (RGAs) such as RGA1 and RGA3, cytochrome P450 and kinases. The continued characterization of resistance gene candidates in M. acuminata, together with the characterization of miRNAs in the pathogen and their role in gene expression modulation, will contribute towards the development of efficient methods for control of Yellow Sigatoka disease.
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Alternativas de controle do mofo-cinzento e do oídio em mudas de eucalipto

Bizi, Rafaela Mazur 27 June 2013 (has links)
O eucalipto participa de modo importante na silvicultura brasileira pela sua adaptabilidade, rápido crescimento e produtividade. Além disso, possui outras características como qualidade, diversidade e adequação de sua madeira para a indústria. A continuidade dos reflorestamentos com eucalipto demanda uma produção contínua de mudas. Entretanto, nos viveiros estas podem ser atacadas por doenças, como o mofo-cinzento e o oídio, causados por Botrytis cinerea e Oidium sp., respectivamente, principais doenças fúngicas que ocorrem na região Sul. O controle destas doenças é feito com fungicidas em outras culturas e em eucalipto o seu uso não é recomendado pela falta de produtos registrados. Além disso, podem surgir efeitos indesejáveis, como a poluição ambiental e a intoxicação do homem e de animais. O objetivo deste trabalho foi o estudo e a seleção de produtos eficientes para o controle alternativo dessas doenças. Para a execução dos experimentos foram utilizadas mudas de Eucalyptus dunnii nos experimentos com B. cinerea e mudas de E. benthamii com Oidium sp. Estas foram pulverizadas com fungicidas (parâmetro de controle), produtos químicos não fungicidas, óleos essenciais, extratos de plantas, leite e derivados e microrganismos. De cada um destes grupos foi selecionado o tratamento com menor valor de severidade, que foram testados entre si. A avaliação consistiu da medição da severidade das doenças, que foi determinada por meio de escalas descritivas de 0 (ausência de sintomas) a 4 (sintomas muito severos), específicas para cada patógeno. Verificou-se, em testes preliminares, os menores valores de severidade das doenças para o tanino e Mentha x villosa no controle do mofo -cinzento e para o leite de vaca e Lecanicillium sp. no controle do oídio. No experimento final, os produtos alternativos que apresentaram os menores valores de severidade foram: tanino controlando o mofo-cinzento e leite de vaca e Lecanicillium sp. controlando o oídio
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Wheat resistance to blast using a non-host selective toxin and host metabolic reprogramming through a successful infection by Pyricularia oryzae / Resistencia do trigo à brusone usando uma toxina não selectiva e o sucesso da infecção por Pyricularia oryzae através da reprogramação metabólica do hospedeiro

Aucique Pérez, Carlos Eduardo 25 August 2016 (has links)
Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-08-15T18:29:36Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1510730 bytes, checksum: 754986579a43c0d4c754880228c9a25d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-15T18:29:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1510730 bytes, checksum: 754986579a43c0d4c754880228c9a25d (MD5) Previous issue date: 2016-08-25 / A brusone, causada por Pyricularia oryzae, é considerada uma doença economicamente importante para trigo na América do Sul. Uma das estratégias de manejo para minimizar as perdas causadas por essa doença é o uso de cultivares resistentes. Alternativamente, pode-se utilizar indutores de resistência para aumentar o nível basal de resistência do trigo à brusone. O presente estudo teve como objetivos: i) determinar as alterações fisiológicas e bioquímicas em plantas de trigo pulverizadas com uma concentração não fitotóxica do ácido α-picolinico (AP), o qual é uma toxina não seletiva produzida por P. oryzae e ii) verificar a manipulação metabólica exercido por P. oryzae quando infectando cultivares de trigo com diferentes níveis de resistência basal à brusone. Nas folhas de trigo pulverizadas com uma concentração não fitotóxica de AP (0.1 mg mL -1 ), os sintomas da brusone desenvolveram menos em associação com um melhor desempenho fotossintético, melhoria do metabolismo antioxidante e redução nas concentrações de H 2 O 2 , O 2 ●- e MDA. As cultivares BR-18 e EMBRAPA- 16 foram mais resistentes à brusone do que a cultivar BRS-Guamirim. O desempenho fotossintético das plantas infectadas foi alterado devido a limitações de natureza difusiva e bioquímica para uma eficiente fixação do CO 2 . Durante a fase assintomática da infecção por P. oryzae, mudanças drásticas no metabolismo de carboidratos e nos níveis de aminoácidos, compostos intermediários do ciclo de Krebs e poliaminas ocorreram nas plantas das três cultivares sugerindo, assim, uma manipulação metabólica exercida por P. oryzae. No entanto, um metabolismo antioxidativo mais eficiente foi importante para neutralizar os efeitos deletérios da infecção por P. oryzae em associação com maiores atividades da fenilalanina amônia liase e polifenoloxidase e maiores concentrações de compostos fenólicos e lignina. Com base nesses resultados e possível concluir que a concentração não fitotóxica de AP foi capaz de potencializar a defesa das plantas de trigo e reduzir a severidade da brusone. A infecção do trigo por P. oryzae ocasionou distúrbios no metabolismo primário das plantas e alguns deles foram semelhantes entre as cultivares independentemente do nível basal de resistência delas. / Blast, caused by Pyricularia oryzae, has become an economically important disease in wheat in South America. One of the management strategies for minimizing the losses caused by blast includes the use of resistant cultivars. Alternatively, the use of inducers of resistance showed the potentiation to increase wheat resistance to blast. This study aimed: i) to determine the physiological and biochemical alterations in wheat plants sprayed with a non-phytotoxic concentration of α-picolinic acid (PA), which is a non-host selective toxin produced by P. oryzae and ii) to establish the degree of metabolic manipulation exerted during the infection by P. oryzae on plants from cultivars with different levels of basal resistance to blast. The spray of leaves of plants with a non-phytotoxic concentration of PA (0.1 mg mL -1 ) resulted in less blast symptoms in association with a better photosynthetic performance, an improvement on the antioxidant metabolism and reduced concentrations of H 2 O 2 , O 2 ●- and malondialdehyde. The cultivars BR-18 and EMBRAPA-16 were more resistant to blast in comparison to cultivar BRS-Guamirim. The photosynthetic performance of the infected plants was altered due to diffusional and biochemical limitations for CO 2 fixation. During the asymptomatic phase of P. oryzae infection, drastic changes in the carbohydrates metabolism and on the levels of amino acids, intermediates compounds of Krebs cycle and polyamines occurred on plants from the three cultivars suggesting a metabolic manipulation exerted by the pathogen. However, amore efficient antioxidant metabolism was able to help the wheat plants to counteract against the deleterious effects of P. oryzae infection in association with great phenylalanine ammonia lyases and polyphenoloxidases activities and high concentrations of phenolics and lignin. Based on this information, it is possible to conclude that a non- phytotoxic concentration of PA elicited the activation of host defense mechanisms that reduced blast severity. Likewise, the infection of leaves by P. oryzae induced remarkable disturbances in the primary metabolism and some of them were conserved among the cultivars regardless of their basal level of resistance to blast.
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Influência de biotecnologia e sistema de produção na dinâmica populacional de Diabrotica spp. em Parecis-MT /

Jardim, Joice, 1984. January 2018 (has links)
Orientador: Carlos Gilberto Raetano / Banca: Edson Luiz Lopes Baldin / Banca: Evandro Pereira Prado / Resumo: Infestações de Diabrotica spp. (Coleoptera: Chrysomelidae) podem causar danos severos nas culturas e comprometer as expectativas de rendimentos. O conhecimento da dinâmica populacional do inseto, em culturas hospedeiras é fundamental para determinação do planejamento estratégico para altos rendimentos. Campo Novo do Parecis - MT é uma importante região agrícola, onde se emprega a semeadura de soja no verão e milho, feijão, algodão e girassol, na segunda safra. O objetivo desse trabalho foi avaliar dentro dos sistemas produtivos da Chapada do Parecis, a ocorrência de Diabrotica spp. e a eficiência do uso de biotecnologia no sistema de produção, fornecendo recomendações que auxiliam no gerenciamento das propriedades. Nesse sistema foi observado uma crescente incidência do gênero Diabrotica nos cultivos e o desafio de entendimento da mudança na dinâmica da praga. A influência de Diabrotica spp. no sistema de produção da região do Parecis - MT e os processos de interações entre seis épocas de semeadura, 5 tipos de tecnologia e dois sistemas de produção soja-milho (SM) e soja-milho-feijão (SMF) em dois anos agrícolas, foram analisados nesse experimento. Esse trabalho identificou as diferenças da dinâmica populacional de Diabrotica spp. nos sistemas de produção SM e SMF nas safras 2014/2015 e 2015/2016 e quantificou os momentos de maior incidência da praga no sistema, que correspondem ao período de janeiro a março, auxiliando na estratégia de planejamento agrícola e suas medidas de... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Diabrotica spp. infestations can cause severe damage to crops and jeopardize income expectations. Knowledge of insect population dynamics in crops is important to determine strategic planning for high productivity. Campo Novo do Parecis - MT is an important agricultural region, where soybeans are planted in summer and corn, beans, cotton and sunflower in the second harvest. The objective of this work was to evaluate the occurrence of Diabrotica spp. with the productive systems of the Chapada do Parecis and the efficiency of the use of biotechnology in the production system, providing recommendations that assist the properties management. This system had an increasing incidence of the genus Diabrotica in its crops and a challenge of understanding the change in the dynamics of this pest. This experiment analyzed the influence of Diabrotica spp in the production system of the Parecis - MT region and the interaction processes between six planted seasons, five types of technology and two production systems of soybean - corn (SC) and soybean - corn - bean (SCB) in two agricultural years. This work identified the differences in the population dynamics of Diabrotica spp. in SC and SCB production systems in the 2014/2015 and 2015/2016 harvests and quantified the periods of greatest incidence of the pest in the system, which corresponds to the period from January to March, that assists in the agricultural planning and the control measures for the region. There were 480 observations, where more than 2000 adults of Diabrotica spp. were collected by counting in yellow non-pheromone adhesive traps. The productivity damages were correlated by the effects of the planting season, production system and technology adopted (CV - OGM free; RR - cp4 epsps; PRO - Cry1A.105 + Cry2Ab2; PRO2 - Cry1A.105 + Cry2Ab2 + cp4 epsps e PRO3 - Cry1A.105 + Cry2Ab2 + cp4 epsps + Cry3Bb1) to the damage caused by ... / Mestre
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Biologia de Spodoptera eridania (Cramer) (Lepidoptera : Noctuidae) em diferentes cultivares de soja e culturas de entressafra

Favetti, Bruna Magda 06 August 2013 (has links)
Resumo: Spodoptera eridania (Cramer) (Lepidoptera: Noctuidade) é um inseto desfolhador polífago, que eventualmente era encontrado na cultura da soja. No entanto, surtos populacionais fizeram com que esta espécie se tornasse um problema, sendo necessário seu controle, feito através de inseticidas químicos. As possíveis causas para estas infestações seriam o excesso no uso de inseticidas, bem como a rotação e sucessão de culturas, que provêm uma oferta contínua de alimento, o que mantém esta espécie nos agroecossistemas. Outro fator que poderia estar contribuindo para estas infestações, é o fato de que diferentes cultivares de soja são plantadas em uma mesma área. A partir disso, para testar a hipótese de que as práticas agrícolas citadas anteriormente podem estar interferindo no desenvolvimento, sobrevivência e reprodução de S. eridania, este trabalho objetiva investigar a biologia de S. eridania em diferentes cultivares de soja e culturas de entressafra, para propor táticas de manejo para esta espécie na cultura da soja. Para tanto, esta pesquisa foi dividida em dois capítulos: I - Biologia e capacidade reprodutiva de S. eridania em diferentes cultivares de soja; II - Desenvolvimento e reprodução de S. eridania em culturas de entressafra da soja. No primeiro capítulo as cultivares utilizadas foram: FMT Tabarana, FMT Tucunaré, BRS/MT Pintado e Monsoy 8757. Os resultados mostraram que todas as cultivares proporcionaram a sobrevivência de S. eridania, porém a cultivar Monsoy 8757 foi a menos adequada, uma vez que juntamente com FMT Tabarana e FMT Tucunaré acresceu instares, alongou o desenvolvimento larval e pupal e reduziu o peso pupal. As culturas de entressafra da soja propostas para os experimentos foram: algodão (FMT 701), milho (Dekalb 370), crotalária (Crotalaria spectabilis), milheto (ADR-300) e girassol (Embrapa 122-V2000). Das culturas avaliadas, somente no algodão e girassol S. eridania completou o seu ciclo de vida. No milho e crotalária, as larvas morreram ainda no 1º instar e, no milheto, houve uma alta mortalidade larval, e somente dois indivíduos atingiram a fase adulta. Levando em consideração os resultados constatados nesta pesquisa, a cultivar de soja Monsoy 8757, bem como as culturas de entressafra, milho, crotalária e milheto interferiram no desenvolvimento e sobrevivência de S. eridania. Sendo assim, estas culturas podem ser indicadas em um plano de manejo para o controle deste inseto, com o intuito de reduzir a multiplicação de S. eridania no campo.
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Controle da mancha angular do feijoeiro com fungicidas e efeito na produção de plantas

Demant, Luis Alfredo Rauer [UNESP] 05 September 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-09-05Bitstream added on 2014-06-13T20:37:44Z : No. of bitstreams: 1 demant_lar_me_botfca.pdf: 166946 bytes, checksum: 10c7009f4c2c3e911fc3562005ee56a7 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A mancha angular, causada por Phaeoisairopsis griseola, é uma doença de grande importância para a cultura do feijoeiro, visto pelos danos que causa em cultivares suscetíveis, sob condições climáticas propícias para o desenvolvimento da doença. O presente trabalho teve por objetivos: a) avaliar a eficácia de alguns fungicidas registrados para a cultura no controle da mancha angular e sobre alguns parâmetros agronômicos (massa de 100 grãos, número de grãos por vagem e número de vagens por plantas) do feijoeiro cultivar Pérola, b) verificar a ação dos fungicidas sobre alterações fisiológicas das plantas de feijoeiro (índices de fotossíntese líquida e condutividade estomática). Para tanto, dois ensaios foram conduzidos em condições de telado e dois ensaios sob condições de campo. As aplicações dos fungicidas nos ensaios iniciaram-se aos 30 dias após a semeadura, sendo realizadas três pulverizações com intervalo de 15 dias. Os fungicidas testados foram: procimidone - 200 g.i.a.ha-1, hidróxido de cobre - 1076 g.i.a.ha-1, azoxystrobina - 60 g.i.a.ha-1, metiran + piraclostrobina - 825 +75 g.i.a.ha-1, piraclostrobina - 75 g.i.a.ha-1, trifloxistrobina - 150 g.i.a.ha-1, tebuconazole - 40 g.i.a.ha-1, hidróxido de fentina - 330 g.i.a.ha-1, tebuconazole + trifloxistrobina - 150 +75 g.i.a.ha-1 e testemunha (água). Nos experimentos conduzidos em campo, foram realizadas as avaliações da da severidade de doença nas folhas e calculada a área abaixo da curva de progresso da doença e realizada a colheita para a avaliação do número de vagens por planta e a massa de 100 grãos. Os experimentos em casa de vegetação foram avaliados quanto aos índices de fotossíntese líquida, condutividade estomática, número de vagens por planta, massa de 100 grãos... / The angular leaf spot caused by Phaeoisairopsis griseola is an important disease for drybeans crop because it promotes many losses in susceptible cultivars under specific weather conditions for progress of this disease. This present work has as objectives: a) evaluate efficacy of some fungicides registered for control of angular leaf spot in drybeans and effect of these products in agronomic parameters (weight of 100 grains, Number of grains per pod, number of pods per plant) of cultivar Perola. b) Verify the action to fungicides about physiology of drybeans plants (liquid Photosynthesis and stomatic conductivity). For these two trials in greenhouse and two trials in the field were development. The fungicides application began 30 days after planting, and three applications were done with 15 days interval. The fungicide tested was: procimidone - 200 g.a.i.ha-1, hidróxido de cobre - 1076 g.a.i.ha-1, azoxystrobina - 60 g.a.i.ha-1, metiran+ piraclostrobina - 825 +75 g.a.i.ha-1, piraclostrobina - 75 g.a.i.ha-1, trifloxistrobina - 150 g.a.i.ha-1, tebuconazole - 40 ga.i.ha-1, hidróxido de fentina - 330 g.a.i.ha-1, tebuconazole + trifloxistrobina - 150 +75 g.a.i.ha-1 and Untreated check (water). In trials in the field was done evaluation of the severity of the disease was done on the leaves and area under curve disease progress (AUDCPD) and in the harvest evaluation was done on the number of pods per plants and weight of 100 grains. The trial in greenhouse was evaluated liquid photosynthesis, stomatic conductivity, number of pods per plant and weight of 100 grains. After these results were obtained, it was constated that photosynthesis is more significantly when drybeans plants were in the stage of grain filling and beginning of maturation; Piraclostrobina, Tebuconazole and Tebuconazole+Trifloxistrobina... (Complete abstract click electronic access below)
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Caracterização e patogenicidade de grupos de anastomose de Rhizoctonia spp. associados a hortaliças

Buzeto, Alexandre Luis [UNESP] 10 1900 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2001-10Bitstream added on 2014-06-13T19:37:30Z : No. of bitstreams: 1 buzeto_al_me_botfca.pdf: 500408 bytes, checksum: c4806a453d209bba8b3c3db4cc072c79 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Rhizoctonia spp. caracterizam-se por serem patógenos muito importantes em hortaliças, principalmente se cultivadas sucessivamente na mesma área de produção. As hortaliças testadas foram tomate, espinafre, melão, alface, brócolos e couve-manteiga. Estabeleceu-se uma coleção de isolados de Rhizoctonia spp. destas hortaliças, e foram avaliados as características citológicas, através da contagem de núcleos, as características quanto ao grupo de anastomose, através de anastomose de hifas, RAPD e através do teste de patogenicidade. Na contagem de núcleos, verificou-se que os isolados de tomate, espinafre, alface, melão e brócolos foram caracterizados como sendo Rhizoctonia solani, enquanto que os isolados de couve-manteiga foram caracterizados como sendo de Rhizoctonia sp. binucleada. Quanto ao grupamento de anastomose, verificou-se que os isolados de espinafre e tomateiro pertenciam ao grupo AG 4 HGI, os isolados de melão e brócolos paertenciam ao AG 4 HGII, os de alface pertenciam ao AG 1 IA, sendo corroborada através da técnica de RAPD, enquanto os de couve-manteiga ao AG G. No teste de patogenicidade, todos os isolados foram patogênicos nas hortaliças dos quais foram isolados. O presente trabalho teve como objetivo principal a caracterização de isolados de Rhizoctonia spp. de hortaliças. As hortaliças testadas foram tomate, espinafre, alface, melão, brócolos e couve-manteiga. / Rhizoctonia spp. are characterized for being of the very important pathogens on vegetables, mainly in their sucessive cultivation on the same production area. The main objective of the present study was the characterization of isolates of Rhizoctonia spp. from vegetables. The vegetables tested were tomato, lettuce, broccoli, spinach, melon, and kale. A collection of isolates of Rhizoctonia spp. of those vegetables was obtained, and each isolate was characterized by the nuclei number, hiphal anastomosis reactinon, RAPD techinique, and by pathogenicity tests. Isolates from tomato, spinach, lettuce, melon and broccoli were characterized as Rhizoctonia solani, while the isolates of kale were characterized as binucleate Rhizoctonia sp. Through anastomosis reaction, it was determined that the isolates from tomato and spinach belong to the group AG 4 HGI, the isolates from melon and broccoli belong to AG 4 HGII, the isolates from lettuce belong to AG-1-IA, by RAPD thecnique and, isolates from kale belong to AG-G. All isolates were pathogenic to their respectives hosts.
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Uma abordagem probabilística do número de reprodução básica em modelos epidemiológicos com aplicação na ferrugem do eucalipto /

Kodaira, Juliana Yukari. January 2011 (has links)
Orientador: José Raimundo de Souza Passos / Banca: Edson Luiz Furtado / Banca: Laécio Carvalho de Barros / Resumo: Na epidemiologia matemática, uma importante medida derivada do modelo determinístico associado à dinâmica de transmissão de uma doença infecciosa é o número esperado de infecções secundárias produzidas por um caso indexado em uma população completamente suscetível, conhecido como número de reprodução básica R0. Utilizando simulações de Monte Carlo, estudamos o efeito da incerteza sobre R0 em modelos compartimentos de transmissão de doenças, associando variáveis aleatórias uniformemente distribuídas a cada parâmetro constituinte de R0. Esta pertubação sobre os parâmetros corresponde à imprecisão intrínseca de seus valores na natureza. Neste trabalho também consideramos diferentes intervalos para as taxas de transmissão de doença com o intuito de avaliar seus efeitos dinâmicos. Aplicamos este método à modelagem da ferrugem do eucalipto, que é uma doença muito comum e severa em plantações de Eucalyptus spp. e outras mirtáceas, transmitida pelo fungo Puccinia psidii Winter. Hoje o eucalipto possui importância significativa tanto no mercado nacional quanto internacional e, portanto, iniciativas que auxiliem seu manejo integrado de doenças são imprescindíveis. Nossos resultados mostram que o método utilizado é eficiente, pois representa a influência das taxas de transmissão de doença no padrão da distribuição de probabilidade aproximada de R0, permitindo a obtenção das funções empíricas percentílicas complementares para os modelos considerados / Abstract: In mathematical epidemiology, an important measure derived from the deterministic model associated with the transmission dynamics of an infectious disease is the expected number of secondary infections produced by an indexed case in a completely susceptible population, known as the basic reproduction number R0. Using Monte Carlo simulations, we studied the effect of the uncertainty on R0 in compartmental disease transmission models, associating random variables uniformly distributed to each constituent parameter of R0. This perturbation on the parameters correspond to the intrinsic imprecision of their values in nature. In this work we also consider different ranges for the disease transmission rates in order to evaluate their dynamical effects. We apply this method to the eucalyptus rust, which is a very common and severe disease in plantations of Eucalyptus spp. and others Myrtaceae, transmitted by the fungus Puccinia psidii Winter. Today, eucalyptus has significant importance in both national and international market. Therefore, initiatives to help its integrated disease management are essential. Our results show that the method is efficient, since it represents the influence of the disease transmission rates in the approximated probability distribution pattern of R0, allowing us to obtain the empirical percentile complementary functions for the considered models / Mestre
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Progresso temporal e espacial de begomovirose e crinivirose em tomateiro / Temporal and spatial progress of begomovirus and crinivirus in tomatoes

Macedo, Mônica Alves de 22 March 2016 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-05-10T16:28:52Z No. of bitstreams: 1 2016_MônicaAlvesdeMacedo.pdf: 2460081 bytes, checksum: 2dc1ee3be1e436c154643736063b6c8a (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2016-05-11T11:41:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_MônicaAlvesdeMacedo.pdf: 2460081 bytes, checksum: 2dc1ee3be1e436c154643736063b6c8a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-11T11:41:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_MônicaAlvesdeMacedo.pdf: 2460081 bytes, checksum: 2dc1ee3be1e436c154643736063b6c8a (MD5) / Até meados da última década, as tospoviroses e begomoviroses eram as duas viroses que mais preocupavam os tomaticultores brasileiros. No entanto, em 2006, outra virose, a crinivirose, foi identificada em plantas de tomate no estado de São Paulo. Hoje, as viroses com maior incidência em tomateiro são a begomovirose e a crinivirose. O manejo adequado de doenças transmitidas por vetores ainda é um desafio devido à grande carência de informações sobre os processos epidemiológicos dessas doenças sob condições de campo. Em vista dessa carência de informação, os principais objetivos desse trabalho foram estudar os processos epidemiológicos envolvidos na begomovirose e crinivirose em tomateiro com o intuito de obter informações que possam ajudar na elaboração de estratégias de manejo para a redução dos prejuízos causados por viroses em tomateiro. Os temas deste trabalho foram divididos em três capítulos. O capítulo 1 foi destinado à revisão bibliográfica. O capítulo 2 descreve o estudo do progresso espacial e temporal de begomovirose em tomateiro de crescimento determinado. O capítulo 3 foi destinado ao estudo do progresso temporal e espacial de begomovirose e crinivirose em tomateiro de crescimento do tipo indeterminado. Nos estudos de distribuição e espacial de viroses, parcelas de 15 x 15 plantas foram demarcadas e avaliadas semanalmente, quanto à presença ou ausência de sintomas característicos das viroses. Um monitoramento da população de moscas-brancas, coleta e detecção de vírus em plantas daninhas e cultivadas presentes dentro e/ou ao redor das parcelas experimentais foi realizado. Tomatosevererugosevirus (ToSRV) e Tomatochlorosisvirus (ToCV) foram respectivamente a espécie de begomovirus predominante e a única espécie de crinivirus encontrada nas amostras coletadas. Algumas plantas cultivadas e não cultivadas estavam infectadas com ToSRV ou ToCV, indicando que são potenciais plantas hospedeiras alternativas. Não foi observada correlação positiva entre a incidência de begomovirose ou crinivirose e a flutuação das populações de mosca-branca. Nas áreas monitoradas, o progresso da doença foi invariavelmente rápido, com um padrão levemente agregado das plantas sintomáticas de begomovirus (tomateiro estaqueado e rasteiro) / ou crinivirus (tomateiro estaqueado). Não foi verificada diferença significativa nas análises temporais e espaciais entre as duas espécies virais ou entre áreas de produção. No entanto, foi observada uma diferença significativa entre parcelas experimentais localizadas no centro (PC) e na borda (PE) dos pivôs centrais (área de cultivo) em tomateiro para processamento. Os resultados de análises temporais mostraram que os valores de incidência e área abaixo da curva de progresso da doença de begomovirus foram menores em PC do que em PE. Em análises espaciais, plantas sintomáticas em PC foram mais agregadas que em PE. Todos esses resultados sugerem fortemente que a distribuição de plantas sintomáticas de begomovirus em PC e PE é governada por diferentes mecanismos de disseminação. Embora essas análises temporal e espacial comparativas entre parcelas localizadas na borda e centro só tenham sido realizadas em tomateiro rasteiro, acredita-se que a dinâmica das begomoviroses e criniviroses em tomateiro estaqueado segue mesmo padrão. Em especial, verificou-se que o padrão de distribuição da crinivirose e da begomovirose é semelhante, mesmo as duas viroses apresentando modos de transmissão distintos pela mosca-branca. Esse padrão foi similar ao observado em PE, indicando que a dispersão primária assume papel relevante na disseminação das duas doenças. Levando em consideração os resultados obtidos no trabalho recomenda-se como manejo de viroses em tomateiro: a realização de um planejamento de plantio evitando associação de cultivos susceptíveis a begomovirus e também com bons hospedeiros do inseto-vetor; a prevenção de plantio escalonado; a eliminação de restos culturais e plantas de tomate voluntárias; e o controle do inseto vetor durante todo o cultivo do tomateiro dentro e fora da lavoura até a eliminação total das plantas. Todas essas medidas de manejo devem ser realizadas de forma integrada e regional para o sucesso de controle das viroses em tomateiro. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Tospovirus and begomovirus diseases are the two most important viral diseases that affect Brazilian tomato crops in the last two decades. However, in 2006, another viral disease caused by a crinivirus was identified infecting tomato plants in the state of São Paulo, Brazil. Today, the viral diseases with higher incidence in tomato are the ones caused by begomoviruses and criniviruses. Management of vector-borne diseases remains a challenge due to the great lack of information on epidemiological aspects of these diseases under field conditions. In view of this lack of information, the main objectives of this work were to study the epidemiological processes involved in begomovirus and crinivirus diseases in tomato; evaluate the effect of a tomato-free-period in the incidence of the diseases caused by begomovirus and tospovirus in this crop; and evaluate the potential of five plant species as alternative host for Tomato severe rugose virus (ToSRV) and Bean golden mosaic virus (BGMV) in order to obtain information that could help in the development of management strategies to reduce the losses caused by these viral diseases. The subjects of this study were divided into five chapters. Chapter 1 contains the literature review. The chapter 2 describes the spatial and temporal distribution of the begomovirus disease in processing tomato production areas. Chapter 3 reports the temporal and spatial progress of begomovirus and crinivirus diseases in fresh market tomato production areas. In chapters 2 and 3, plots of 15 x 15 plants were marked and weekly evaluated for the presence or absence of characteristic symptoms of these diseases in the plants. Monitoring of the whitefly populations, collection and detection of viruses in weeds and in cultivated plants present inside or around of the experimental plots were carried out. These studies revealed that ToSRV and Tomato chlorosis virus (ToCV) were the predominant begomovirus species and the only crinivirus species found in the areas. Some cultivated and uncultivated plants were infected with ToSRV or ToCV, indicating that they are potential alternative host plants. There was no positive correlation between the incidence of begomovirus or crinivirus disease and the fluctuation of the whitefly population. In the monitored areas, the progress of the diseases was invariably fast, with a slightly aggregated pattern of symptomatic plants infected by begomovirus or crinivirus. There was no significant difference in the temporal and spatial analysis between the two viral species or among the tomato production areas. However, a significant difference was observed between the experimental plots located in the center (PC) and the edge (PE) of the central pivot described in Chapter 2. These results have shown that the values of incidence and the area under disease progress curve of begomovirus were lower in PC than in PE. In the spatial analyses, symptomatic plants in PC were more aggregated than in PE. All these results strongly suggest that the distribution of begomovirus symptomatic plants in PC and PE is ruled out by different spreading mechanisms. Although these temporal and spatial analyses of comparative plots located at the edge and in the center have only been carried out in processing tomato areas, it is believed that the spread of begomovirus and crinivirus disease in fresh market tomato crops follows the same pattern. In particular, it was found that the distribution pattern of crinivirus and begomovirus is similar, although they have different transmission mechanisms by whiteflies. The spatial distribution pattern of these diseases was similar to that observed in begomovirus disease in PE in processing tomato areas, indicating that the primary dispersion assumes an important role in the spread of the two diseases. In Taking all these results together, for the management of tomato viruses it is recommended: avoid areas with susceptible hosts for begomoviruses and good insect-vector hosts; prevention of continuous planting; elimination of crop residues and voluntary tomato plants; insect vector control during the cultivation of tomato inside and outside the field until the total elimination of the crop. All these management measures should be undertaken in an integrated and regional basis for a successful control of these viruses in tomato.
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Desempenho agronômico e reação a verrugose e à virose do endurecimento dos frutos de genótipos de maracujazeiro-azedo cultivados no Distrito Federal / Agonomic performance and reaction to fruit scab and to woodiness virus in sour passion fruit genotypes cultivated in Distrito Federal

Maia, Thales Eduardo de Godoy 04 1900 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2008. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-09-24T20:21:29Z No. of bitstreams: 1 2008_ThalesEduardoGMaia_noPW.pdf: 4244771 bytes, checksum: 7e7e063a521bf96198ccc6af14c56dc4 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-05-21T15:40:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_ThalesEduardoGMaia_noPW.pdf: 4244771 bytes, checksum: 7e7e063a521bf96198ccc6af14c56dc4 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-21T15:40:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_ThalesEduardoGMaia_noPW.pdf: 4244771 bytes, checksum: 7e7e063a521bf96198ccc6af14c56dc4 (MD5) Previous issue date: 2008-04 / O Brasil é o maior produtor mundial de maracujá, porém, apresenta sérios problemas fitossanitários. O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar a produtividade e a reação de genótipos de maracujazeiro-azedo à verrugose ou cladosporiose (Cladosporium herbarum Link.), e à virose do endurecimento dos frutos (Cowpea aphid-borne mosaic virus - CABMV) adaptados ao cultivo no Distrito Federal. O experimento foi realizado na Fazenda Água Limpa, pertencente à Universidade de Brasília (UnB). Utilizou-se o delineamento experimental de blocos casualizados, com quatro repetições, 14 tratamentos (genótipos), 8 plantas úteis por parcela. Foram avaliados os 14 genótipos: [PCF-2, EC-RAM, MAR 20#03, MAR 20#09, MAR 20#23, MAR 20#36, MAR 20#46, AR-01, AR-02, YM FB-200, FP-01, RC- 3, GA-2, AP-1], totalizando 1111 plantas por hectare, plantados em setembro de 2006. Foi efetuada irrigação suplementar a partir do mês de março de 2007. Os parâmetros analisados, após 20 colheitas ou 9 meses, foram: produtividade estimada (kg/ha); massa média de frutos (g); classificação dos frutos em 5 classes, frutos de primeira, 1B, 1A, 2A e 3A de acordo com o diâmetro; número de frutos e coloração externa, amarelo, rosa e roxo. Foram avaliadas a incidência e a severidade de verrugose (Cladosporium herbarum) nos meses de Abril, Maio e Junho de 2007 e da virose do endurecimento dos frutos (Cowpea aphid-borne mosaic virus - CABMV) nos meses de Julho, Setembro, Outubro e Novembro de 2007. Os genótipos PCF-2 (15.877kg/ha) e EC-RAM (13.968kg/ha) foram os mais produtivos em 20 colheitas. Todos os genótipos apresentaram um maior rendimento de frutos amarelos, seguido de frutos rosas e roxos. O peso médio dos frutos variou de 105g (PCF-2) a 192g (AR-01). Sob condições de campo o genótipo GA-2 foi moderadamente susceptível. Os genótipos YM FB-200 e MAR 20#23 foram altamente XVIII susceptíveis a verrugose (Cladpsporium herbarum), enquanto que os demais genótipos foram susceptíveis. Todos os genótipos foram moderadamente susceptíveis à virose do endurecimento dos frutos (Cowpea aphid-borne mosaic virus – CABMV). __________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Brazil is the largest passion fruit producer, however, presents serious fitosanitary problems. The objective of this work was evaluating the yield and the reaction of sour passion fruit genotypes, adapted to Distrito Federal's cultivar, to fruit scab or cladosporiose (Cladosporium herbarium Link.), and to woodiness virus (Cowpea aphid-borne mosaic virus – CABMV). The experiment was carried on at University of Brasilia's Água Limpa Farm. A design with randomized blocks with four repetitions, 14 treatments (genotypes), 8 plants per plot was used. Fourteen genotypes were assessed: [PCF-2, ECRAM, MAR 20#03, MAR 20#09, MAR 20#23, MAR 20#36, MAR 20#46, AR 01, AR 02, YM FB 200, FP-01, RC-3, GA-2, A-1], totaling 1,111 plants per hectare, planted in September 2006. Supplementary irrigation was performed, starting on March 2007. The parameters analyzed, after twenty harvests or 9 months, were: estimated yield (kg/ha); average fruit weight (g); classification of fruits into 5 categories according to its diameter (prime fruits, 1B, 1A, 2B and 3A), number of fruits and external color: yellow, pink and purple. The incidence and the severity of fruit scab (Cladosporium herbarum) were assessed in April, May and June 2007, while the incidence and the severity of woodiness virus (Cowpea aphid-borne mosaic virus - CABMV) in July, September, October and November 2007. The genotypes PCF-2 (15,877kg/ha) and EC-RAM (13,968kg/ha) were the most productive in 20 harvests. All genotypes showed better performance of yellow fruits, followed by pink and purple ones. The average fruit weight ranged from 105g (PCF-2) to 192g (AR-01). Under field conditions, genotype GA-2 was moderately susceptible. Genotypes YM FB- 200 and MAR 20#23 were highly susceptible to fruit scab (Cladpsporium herbarum), meanwhile the other genotypes were susceptible. All genotypes XX were moderately susceptible to woodiness virus (Cowpea aphid-borne mosaic virus – CABMV).

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