Made available in DSpace on 2016-06-02T19:52:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6045.pdf: 14667118 bytes, checksum: f13a2c0983ea271f2e60ed298b158806 (MD5) Previous issue date: 2014-05-26 / Agência Nacional de Petróleo / This work studies the ship routing and scheduling problem in oil transportation from offshore platforms to inland terminals. It is motivated by a real situation in a Brazilian oil company. Brazil is one of the world's greatest oil producers and has around 80% of its oil explored in offshore mode. Thus, transportation costs play an important role in achieving operational excellence, and the recent growth trends for oil exploration in Brazil has transformed its operations and demanded agile and effective decision support systems for addressing the oil sector dynamism. This work's goal consists in developing and applying an optimization-based approach using a mixed integer linear programming model in real decision-making situations, along with a solution method based on mathematical programming (MIP-heuristics) in order to solve the model, such as relax-and-fix. The proposed model is inspired in a problem formulation for pickup and delivery with time windows (PDPTW) and heterogeneous fleet, where costs incurred for fuel consumption and fleet contracts is the objective function to be minimized. The pickup and delivery pairs are predetermined and the model's main decision refers to ship allocation to these pairs compounding a route. Furthermore, some additional constraints are modeled and proposed, such as terminal access and platform mooring limitation according to ship types, as well as product blend incompatibility. The model was implemented in a modeling language along with an optimizarion software. Computational experiments with the model and the heuristics are presented for different data sets supplied by the case study company. These experiments show the potential benefits of this approach for finding good solutions for the problem as well as the dificulty in finding solutions for realistic instances due to its NP-hard characteristics. / Este trabalho estuda o problema de roteirização e programação de navios que realizam o escoamento de petróleo das plataformas marítimas para terminais terrestres, motivado por uma situação real de uma empresa brasileira da indústria petrolífera. O Brasil é um dos maiores produtores mundiais de petróleo, e cerca de 80% de seu petróleo é explorado no mar. Dentro deste contexto, os custos de transporte desempenham um papel importante na busca pela excelência operacional e as tendências de crescimento da exploração de petróleo no Brasil têm tornado as operações mais complexas e demandantes de sistemas de apoio à decisão ágeis e eficazes que contemplem o dinamismo do setor petrolífero. O objetivo deste trabalho consiste em desenvolver e aplicar uma abordagem de otimização baseada em um modelo de programação linear inteira mista em situações reais de tomada de decisão, em conjunto com métodos de solução baseados em programação matemática (MIP-Heuristics) para resolver o modelo, como relax-and-fix. O modelo proposto é inspirado em uma formulação de problemas de coleta e entrega com janelas de tempo (pickup and delivery with time windows PDPTW) e frota heterogênea, no qual busca-se minimizar os custos decorrentes do consumo de combustível dos navios e contratos de afretamento. O modelo é do tipo origem-destino, no qual os pares coleta/entrega são pré-determinados e a decisão do modelo refere-se à alocação de navios para os diferentes pares, compondo uma rota. Além disso, são propostas restrições adicionais que contemplam limitações de acesso a terminais e de atracação em plataformas de acordo com os tipos de navio, além da incompatibilidade de mistura de produtos, entre outros. O modelo foi implementado utilizando uma linguagem de modelagem em conjunto com um software de otimização. Experimentos computacionais com o modelo e as heurísticas são apresentados para diferentes conjuntos de dados fornecidos pela empresa e comprovam o potencial das abordagens para encontrar boas soluções para o problema, mas também suas dificuldades para encontrar soluções para exemplares de tamanho realista, por tratar-se de um problema NP-difícil do ponto de vista de teoria de complexidade.

Submitted by Fernando Souza (fernandoafsou@gmail.com) on 2017-08-15T11:46:12Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 884446 bytes, checksum: 92314027dddef8365b4a2e655b65bd78 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-15T11:46:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 884446 bytes, checksum: 92314027dddef8365b4a2e655b65bd78 (MD5) Previous issue date: 2016-05-20 / The Static Bike Rebalancing Problem (SBRP) is a recent problem motivated by the task of repositioning bikes among stations in a self-service bike-sharing systems. This problem can be seen as a variant of the one-commodity pickup and delivery vehicle routing problem, where multiple visits are allowed to be performed at each station, i.e., the demand of a station is allowed to be split. Moreover, a vehicle may temporarily drop its load at a station, leaving it in excess or, alternatively, collect more bikes (even all of them) from a station, thus leaving it in default. Both cases require further visits in order to meet the actual demands of such station. This work deals with a particular case of the SBRP, in which only a single vehicle is available and the objective is to nd a least-cost route that meets the demand of all stations and does not violate the minimum (zero) and maximum (vehicle capacity) load limits along the tour. Therefore, the number of bikes to be collected or delivered at each station should be appropriately determined in order to respect such constraints. This is a NP-Hard problem since it contains other NP-Hard problems as special cases, hence, using exact methods to solve it is intractable for larger instances. Several methods have been proposed by other authors, providing optimal values for small to medium sized instances, however, no work has consistently solved instances with more than 60 stations. The proposed algorithm to solve the problem is an iterated local search (ILS) based heuristic combined with a randomized variable neighborhood descent (RVND) as local search procedure. The algorithm was tested on 980 benchmark instances from the literature and the results obtained are quite competitive when compared to other existing methods. Moreover, the method was capable of nding most of the known optimal solutions and also of improving the results on a number of open instances. / O Problema do Rebalanceamento Est atico de Bicicletas (Static Bike Rebalancing Problem, SBRP) e um recente problema motivado pela tarefa de reposicionar bicicletas entre esta c~oes em um sistema self-service de compartilhamento de bicicletas. Este problema pode ser visto como uma variante do problema de roteamento de ve culos com coleta e entrega de um unico tipo de produto, onde realizar m ultiplas visitas a cada esta c~ao e permitido, isto e, a demanda da esta c~ao pode ser fracionada. Al em disso, um ve culo pode descarregar sua carga temporariamente em uma esta c~ao, deixando-a em excesso, ou, de maneira an aloga, coletar mais bicicletas (at e mesmo todas elas) de uma esta c~ao, deixando-a em falta. Em ambos os casos s~ao necess arias visitas adicionais para satisfazer as demandas reais de cada esta c~ao. Este trabalho lida com um caso particular do SBRP, em que apenas um ve culo est a dispon vel e o objetivo e encontrar uma rota de custo m nimo que satisfa ca as demandas de todas as esta c~oes e n~ao viole os limites de carga m nimo (zero) e m aximo (capacidade do ve culo) durante a rota. Portanto, o n umero de bicicletas a serem coletadas ou entregues em cada esta c~ao deve ser determinado apropriadamente a respeitar tais restri c~oes. Trata-se de um problema NP-Dif cil uma vez que cont em outros problemas NP-Dif cil como casos particulares, logo, o uso de m etodos exatos para resolv^e-lo e intrat avel para inst^ancias maiores. Diversos m etodos foram propostos por outros autores, fornecendo valores otimos para inst^ancias pequenas e m edias, no entanto, nenhum trabalho resolveu de maneira consistente inst^ancias com mais de 60 esta c~oes. O algoritmo proposto para resolver o problema e baseado na metaheur stica Iterated Local Search (ILS) combinada com o procedimento de busca local variable neighborhood descent com ordena c~ao aleat oria (randomized variable neighborhood descent, RVND). O algoritmo foi testado em 980 inst^ancias de refer^encia na literatura e os resultados obtidos s~ao bastante competitivos quando comparados com outros m etodos existentes. Al em disso, o m etodo foi capaz de encontrar a maioria das solu c~oes otimas conhecidas e tamb em melhorar os resultados de inst^ancias abertas.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-12-15T16:27:02Z No. of bitstreams: 1 ManoelPedroDeMedeirosNeto_DISSERT.pdf: 3664081 bytes, checksum: f1856f73174bde3b90b40604d7d1ae0e (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-12-15T16:36:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ManoelPedroDeMedeirosNeto_DISSERT.pdf: 3664081 bytes, checksum: f1856f73174bde3b90b40604d7d1ae0e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-15T16:36:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ManoelPedroDeMedeirosNeto_DISSERT.pdf: 3664081 bytes, checksum: f1856f73174bde3b90b40604d7d1ae0e (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Ve?culos n?o tripulados est?o cada vez mais presentes no cotidiano das empresas e das pessoas, pois esse tipo de ve?culo est? de forma crescente desempenhando atividades que anteriormente eram apenas executadas por seres humanos. No entanto, para se compreender melhor o potencial de ve?culos n?o tripulados, ? importante conhecer seus tipos, caracter?sticas, aplica??es, limita??es e desafios, pois somente com esse conhecimento pode-se entender as potencialidades do uso de ve?culos dessa natureza em aplica??es variadas. Nesse contexto, na primeira parte desta pesquisa foram estudados os diferentes tipos de ve?culos n?o tripulados, i.e. terrestres, aqu?ticos, a?reos e h?bridos. Durante a segunda fase da pesquisa, foi realizado um aprofundamento tendo como foco as interfaces de usu?rio para controle dos ve?culos a?reos n?o tripulados. Esses dois levantamentos iniciais do dom?nio, permitiram a identifica??o de desafios e oportunidades para o desenvolvimento de novas aplica??es para esse contexto. Com base no conhecimento adquirido com esses estudos, ent?o, foi desenvolvido um sistema de entrega automatizada de objetos para o campus de Universidades, denominado de PostDrone University, e desenvolvido um ve?culo a?reo n?o tripulado para realizar as entregas, denominado de PostDrone University UAV K-263. O sistema possui uma interface de usu?rio de f?cil uso, que n?o requer conhecimentos de dom?nios espec?ficos como avia??o ou controle de aeronaves para sua opera??o. Por fim, diversos testes foram realizados com o intuito de validar e identificar as limita??es da solu??o desenvolvida nesta pesquisa. / Unmanned vehicles are increasingly present in the daily of companies and people, because this kind of vehicle is performing ever more tasks that were previously only executed by human beings. However, to better understand the potential of unmanned vehicles, it is important to know their types, features, applications, limitations and challenges, thus with this knowledge it is possible to comprehend the possibilities of use of these vehicles in several applications. In this context, the first step of the present research consists in studying the different kinds of unmanned vehicles, i.e., ground, surface and underwater, aerial, and hybrid. During the second step of the research, a deepening study was accomplished, with focus on user interfaces of unmanned aerial vehicles. These two initial reviews of the domain allowed the identification of challenges and opportunities to the development of new applications for this context. Based on the acquired knowledge from these studies, then, an automated goods delivery system was developed for universities? campuses, called PostDrone University, and an unmanned vehicle to make the deliveries, called PostDrone University UAV K-263, was also developed. The system has an easy use UI, which does not require the user to have knowledge about specific domains, as aviation or aircraft control, for the operation of the system. Lastly, several test were accomplished aiming to validate the solution proposed in the present research and identify its limitations / 2018-03-31

Neste trabalho abordamos o problema de programação de tarefas em um ambiente flow shop permutacional com mais de duas máquinas. Restringimos o estudo para o caso em que todas as tarefas têm uma data de entrega comum e restritiva, e onde o objetivo é minimizar a soma total dos adiantamentos e atrasos das tarefas em relação a tal data de entrega. É assumido também um ambiente estático e determinístico. Havendo soluções com o mesmo custo, preferimos aquelas que envolvem menos tempo de espera no buffer entre cada máquina. Devido à dificuldade de resolver o problema, mesmo para instâncias pequenas (o problema pertence à classe NP-difícil), apresentamos uma abordagem heurística para lidar com ele, a qual está baseada em busca local e faz uso de um algoritmo linear para atribuir datas de conclusão às tarefas na última máquina. Este algoritmo baseia-se em algumas propriedades analíticas inerentes às soluções ótimas. Além disso, foi desenvolvida uma formulação matemática do problema em programação linear inteira mista (PLIM) que vai permitir validar a eficácia da abordagem. Examinamos também o desempenho das heurísticas com testes padrões (benchmarks) e comparamos nossos resultados com outros obtidos na literatura. / In this work we approach the permutational flow shop scheduling problem with more than two machines. We restrict the study to the case where all the jobs have a common and restrictive due date, and where the objective is to minimize the total sum of the earliness and tardiness of jobs relative to the due date. A static and deterministic environment is also assumed. If there are solutions with the same cost, we prefer those that involve less buffer time between each machine. Due to the difficulty of solving the problem, even for small instances (the problem belongs to the NP-hard class), we present a heuristic approach to dealing with it, which is based on local search and makes use of a linear algorithm to assign conclusion times to the jobs on the last machine. This algorithm is based on some analytical properties inherent to optimal solutions. In addition, a mathematical formulation of the problem in mixed integer linear programming (MILP) was developed that will validate the effectiveness of the approach. We also examined the performance of our heuristics with benchmarks and compared our results with those obtained in the literature.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-03-16T12:48:08Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Filipe_Versao_Final_Pos_Defesa_Deposito.pdf: 1855793 bytes, checksum: 366a64a51c618d78933bc62349a182cc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-16T12:48:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Filipe_Versao_Final_Pos_Defesa_Deposito.pdf: 1855793 bytes, checksum: 366a64a51c618d78933bc62349a182cc (MD5) Previous issue date: 2015-08-21 / Hoje as organizações de T.I. estão enfrentando um sério desafio, por um lado temos mercados cada vez mais competitivos, com mudanças quase que rotineiras nos softwares e uma variedade imensa de dispositivos e sistemas operacionais; por outro, os sistemas ficam cada vez mais complexos, integrados a outros serviços e exigindo um alto grau de confiabilidade e disponibilidade dos mesmos, exigindo assim um processo de implantação cada vez mais eficiente e robusto. Nos últimos anos o termo DevOps – colaboração entre desenvolvimento e operação - e suas práticas foram amplamente usados e discutidos sob diferentes aspectos. Assim como no movimento ágil, DevOps também nasceu na indústria e a partir da necessidade da mesma. Por mais que várias organizações já adotem práticas que ficaram conhecidas como DevOps, seu uso ainda não é prescritivo, existindo assim uma variedade de diferentes manifestações de uso em termos de definição e padrão dentre as organizações. Diante disso, esta dissertação teve por objetivo realizar um mapeamento sistemático da literatura e um survey em busca do movimento DevOps, áreas de concentração dos estudos, os principais autores da área e as principais práticas e formas de uso de DevOps nas organizações. Como contribuição, esta pesquisa identificou que dentre as principais áreas de DevOps podem-se destacar (i) entrega, (ii) integração, (iii) e testes contínuos, além da (vi) automação da infraestrutura. Como principais práticas foram possíveis destacar: (a) implantações através de máquinas virtuais, (b) visibilidade do pipeline de implantação, (c) processos robustos de roolbacks, além de técnicas como (d) canary release, (e) toogled features e (f) blue-green deployments. / Today's IT organizations are facing a serious challenge, on the one hand we increasingly competitive markets with routine software’s changes and a wide variety of devices and operating systems; on the other hand, the systems are increasingly complex, integrated with other services and requiring a high degree of reliability and availability requiring a deploy process increasingly efficient and robust. In recent years the DevOps term - a clipped compound of development and operations - and DevOps’s practices were widely used and discussed under different aspects. As agile movement, the DevOps term was also born in the industry’s need. Today many organizations already adopt practices that became known as DevOps its use is not prescriptive, so there is a variety of different manifestations of use in terms of definition and standard among organizations. Therefore, this work aimed to carry out a mapping study and a survey in search of the state of the art DevOps movement, concentration areas of study, the main authors of the area and the main practices and the use of DevOps in organizations. As a contribution, this research found that among the main DevOps area can highlight: (i) continuous delivery; (ii) continuous integration; (iii) continuous testing; and (vi) infrastructure’s automation. Additionally, we can emphasize the main practices in the DevOps adoption: (a) deploys through virtual machines; (b) visibility’s deployment pipeline; (c) robust processes roolbacks, and techniques such as (d) canary release, (e) toogled features and (f) blue-green deployments.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-03-16T14:48:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Filipe_Versao_Final_Pos_Defesa_Deposito.pdf: 1855793 bytes, checksum: 366a64a51c618d78933bc62349a182cc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-16T14:48:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Filipe_Versao_Final_Pos_Defesa_Deposito.pdf: 1855793 bytes, checksum: 366a64a51c618d78933bc62349a182cc (MD5) Previous issue date: 2015-08-21 / Hoje as organizações de T.I. estão enfrentando um sério desafio, por um lado temos mercados cada vez mais competitivos, com mudanças quase que rotineiras nos softwares e uma variedade imensa de dispositivos e sistemas operacionais; por outro, os sistemas ficam cada vez mais complexos, integrados a outros serviços e exigindo um alto grau de confiabilidade e disponibilidade dos mesmos, exigindo assim um processo de implantação cada vez mais eficiente e robusto. Nos últimos anos o termo DevOps – colaboração entre desenvolvimento e operação - e suas práticas foram amplamente usados e discutidos sob diferentes aspectos. Assim como no movimento ágil, DevOps também nasceu na indústria e a partir da necessidade da mesma. Por mais que várias organizações já adotem práticas que ficaram conhecidas como DevOps, seu uso ainda não é prescritivo, existindo assim uma variedade de diferentes manifestações de uso em termos de definição e padrão dentre as organizações. Diante disso, esta dissertação teve por objetivo realizar um mapeamento sistemático da literatura e um survey em busca do movimento DevOps, áreas de concentração dos estudos, os principais autores da área e as principais práticas e formas de uso de DevOps nas organizações. Como contribuição, esta pesquisa identificou que dentre as principais áreas de DevOps podem-se destacar (i) entrega, (ii) integração, (iii) e testes contínuos, além da (vi) automação da infraestrutura. Como principais práticas foram possíveis destacar: (a) implantações através de máquinas virtuais, (b) visibilidade do pipeline de implantação, (c) processos robustos de roolbacks, além de técnicas como (d) canary release, (e) toogled features e (f) blue-green deployments. / Today's IT organizations are facing a serious challenge, on the one hand we increasingly competitive markets with routine software’s changes and a wide variety of devices and operating systems; on the other hand, the systems are increasingly complex, integrated with other services and requiring a high degree of reliability and availability requiring a deploy process increasingly efficient and robust. In recent years the DevOps term - a clipped compound of development and operations - and DevOps’s practices were widely used and discussed under different aspects. As agile movement, the DevOps term was also born in the industry’s need. Today many organizations already adopt practices that became known as DevOps its use is not prescriptive, so there is a variety of different manifestations of use in terms of definition and standard among organizations. Therefore, this work aimed to carry out a mapping study and a survey in search of the state of the art DevOps movement, concentration areas of study, the main authors of the area and the main practices and the use of DevOps in organizations. As a contribution, this research found that among the main DevOps area can highlight: (i) continuous delivery; (ii) continuous integration; (iii) continuous testing; and (vi) infrastructure’s automation. Additionally, we can emphasize the main practices in the DevOps adoption: (a) deploys through virtual machines; (b) visibility’s deployment pipeline; (c) robust processes roolbacks, and techniques such as (d) canary release, (e) toogled features and (f) blue-green deployments.

Submitted by MARCIA ROVADOSCHI (marciar@unifra.br) on 2018-08-20T12:55:10Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_MarianaZancanTonel.pdf: 6177598 bytes, checksum: e830fe652c79ad380053f80cae3e2382 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-20T12:55:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_MarianaZancanTonel.pdf: 6177598 bytes, checksum: e830fe652c79ad380053f80cae3e2382 (MD5) Previous issue date: 2017-08-25 / Graphene is a nanomaterial that has several applications including drug delivery and pollutant remover. However, graphene is hydrophobic, which makes it difficult to apply in biological media, and one of the alternatives is through functionalization. At the same time, aromatic molecules are precursors of several essential compounds for life, and are also important in industry. However, some of them are pollutants that can severely affect people and the environment, so developing effective removal methods is extremely interesting. Some molecules of biological interest like dopamine and serotonin have an aromatic part, recent studies show the use of these molecules as mediators for specific and selective drug delivery. Therefore, the study of the interaction of these molecules as pure and modified graphene is of great importance in the biomedical area as well as for diagnostic and treatment studies. In this work, we perform a theoretical study through the density functional theory; initially we analyze the changes caused by the effect of the concentration of the functional groups -COOH, -COH, -OH, -O- or -NH2 on graphene. The results show that in all cases it is possible to modulate the electronic properties depending on the number and location of the groups. Subsequently, we analyzed the graphene pure and functionalized with a group -COOH, -COH, -OH, -O- or -NH2, with the molecules of biological interest as dopamine, serotonin and the pollutants: benzene, aniline, benzoic acid and phenol. The results show that all interactions occur under a physical adsorption regime, there are no changes in the original geometric structures of the molecules after adsorption, it may be of interest to create possible routes as mediators for the delivery of drugs and to assist in the treatment of various diseases or in a system of removal of pollutants based on pristine and modified graphene. Finally, we developed a method to parameterize the benzene-benzene and benzene-graphene force field through the data obtained from the ab initio calculations, the results obtained agree with studies described in the literature. Thus, this work presents the understanding through the simulation of the biomedical part for drug delivery systems, and removal of pollutants, in addition to the parameterization to be used in simulations of the biological environment which may aid in the development of future experimental studies. / O grafeno é um nanomaterial que possui diversas aplicações tecnológicas entre elas como carreador de fármacos e removedor de poluentes. No entanto, o grafeno é hidrofóbico, o que dificulta sua aplicação em meios biológicos, sendo que uma das alternativas para controlar este problema é através de funcionalizações. Paralelamente, moléculas aromáticas são precursoras de diversos compostos imprescindíveis para a vida, e também são importantes na indústria. No entanto, algumas delas são poluentes que podem afetar severamente as pessoas e o meio ambiente. Assim, o desenvolvimento de métodos efetivos para remoção desses é extremante importante. Algumas moléculas de interesse biológico como a dopamina e serotonina apresentam parte aromática. Estudos recentes têm mostrado a utilização dessas moléculas como mediadoras para entrega de fármacos específica e seletiva. Portanto, o estudo dessas moléculas visando este tipo de aplicação é de grande importância na área biomédica. Realizamos um estudo teórico através da Teoria do Funcional da Densidade. Inicialmente, analisamos as alterações causadas pelo efeito da concentração de grupos funcionais -COOH, -COH, -OH, -O- ou -NH2 no grafeno. Os resultados mostram que em todos os casos é possível modular as propriedades eletrônicas dependendo do número e do local dos grupos. Posteriormente, analisamos o grafeno puro e funcionalizado com um grupo –COOH, -COH, -OH, –O- ou -NH2, com as moléculas de interesse biológico dopamina, serotonina e os poluentes benzeno, anilina, ácido benzóico e fenol. Os resultados mostram que todas as interações ocorrem sob um regime de adsorção física, sem alterações nas estruturas geométricas originais das moléculas após adsorção. Esses resultados são de interesse para criar possíveis rotas como mediadores para a entrega de fármacos e auxiliar no tratamento de várias doenças ou ainda em um sistema de remoção de poluentes baseados no grafeno puro e modificado. E, por fim, desenvolvemos um novo método para parametrizar campo de força do benzeno-benzeno e benzeno-grafeno através dos dados obtidos dos cálculos ab initio. Os resultados obtidos concordam com estudos descritos na literatura. Dessa forma, este trabalho apresenta a compreensão através da simulação da parte biomédica para sistemas de drug delivery, e remoção de poluentes, além da parametrização para ser usado em simulações do meio biológico o que poderá auxiliar no desenvolvimento de estudos experimentais futuros.

Orientadores: Adriano Rodrigues Azzoni, Anete Pereira de Souza / Texto em português e inglês / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-21T01:06:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Favaro_MariannaTeixeiradePinho_M.pdf: 18876970 bytes, checksum: 4953fcf4a875c09d8246f6deb457b544 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Entrega gênica é uma estratégia muito promissora com grande potencial médico, que consiste na introdução de ácidos nucléicos exógenos, e pode ser aplicada tanto para terapia gênica quanto para vacina de DNA. Contudo seu uso ainda é limitado pela falta de um vetor de entrega ideal, que seja ao mesmo tempo eficiente e seguro. Embora muito mais eficientes, os vetores virais ainda despertam preocupações a respeito de sua segurança. Por outro lado, vetores não-virais são muito mais seguros e facilmente manipuláveis, ainda que menos eficientes. Neste contexto, "vírus artificiais" são uma opção interessante, uma vez que são vetores não-virais desenvolvidos para explorar a arquitetura celular de uma forma eficiente, superando uma série de barreiras físicas, enzimáticas e difusionais, mas mantendo a segurança do DNA plasmidial (pDNA). O principal objetivo da abordagem estudada é explorar os motores moleculares, como dineína, para transportar cargas da periferia para o centrossoma de células de mamíferos através da rede de microtúbulos. Para isso, a cadeia leve Rp3 da dineína foi fusionada a um domínio de interação com DNA (DNA-binding) no N-terminal, e ao peptídeo membrano-ativo TAT no C-terminal. A proteína, nomeada T-Rp3, tem ainda um His-Tag. Esta proteína recombinante construída contém então diferentes domínios para promover condensação do pDNA (DNA binding), para facilitar a entrada na célula e no núcleo (TAT) e para aumentar o escape endossomal (His- Tag), além da própria Rp3 que deve assistir no tráfego intracelular, agindo assim diretamente na maioria dos principais obstáculos intracelulares enfrentados pelos vetores. Estudos de expressão indicam que a proteína recombinante é corretamente expressa em E. coli BL21(DE3). Experimentos de mobilidade em gel de agarose ("gel retardation assay") combinados com estudos de espalhamento de luz e potencial zeta indicam que a proteína efetivamente interage com o pDNA, formando complexos que são pequenos (~95 nm) e positivamente carregados (+28 mV na relação molar de pDNA:proteína 1:8000). Ensaios de transfecção em cultura de células HeLa indicam que T-Rp3 atinge uma eficiência de transfecção muito maior que a proteína nuclear Protamina (aqui usada como controle), chegando a ser 900 vezes maior a expressão relativa do gene repórter na relação molar de pDNA:proteína 1:8000. Na comparação com Lipofectamina 2000TM, um reagente bem caracterizado de transfecção aqui usado como controle positivo, a T-Rp3 demonstrou atingir níveis similares de eficiência, com a vantagem adicional de ser menos citotóxica, conforme evidenciado em ensaios de viabilidade celular. Transfecções realizadas na presença da droga Nocodazol indicam que a eficiência da T-Rp3 depende fortemente da rede de microtúbulos, uma vez que a eficiência é reduzida em 92% quando os microtúbulos estão despolimerizados. A partir das transfecções na presença da droga Cloroquina, pudemos observar que o aprisionamento no endossomo ainda é um fator limitante. Finalmente, ensaios de cromatografia de afinidade realizados com o domínio da cadeia intermediária de dineína imobilizado indicam que a cadeia leve recombinante T-Rp3 mantém a capacidade de interagir com o complexo da dineína. Analisados em conjunto, os resultados apontam para uma grande participação da rede de microtúbulos na eficiência de transfecção de T-Rp3, objetivo inicial deste trabalho / Abstract: Gene delivery is a promising technique with great medical potential that consists in the introduction of exogenous nucleic acids, and can be applied for gene therapy as well as DNA vaccination. However, its use is still limited by the lack of an ideal delivery vector, which is both safe and efficient. Although much more effective, viral vectors still raise several concerns about its safety. On the other hand, non-viral vectors are safer and easier to manipulate, but less efficient. In this context "artificial viruses" are an interesting option, since they are non-viral vectors intended to explore the cell's architecture in an efficient way, to overcome a series of physical, enzymatic and diffusional barriers, while still preserving the safety of plasmid DNA (pDNA) vectors. The main objective herein is to exploit molecular motors, like dynein, to transport cargoes from the periphery to the centrosome of mammalian cells via the microtubule network. For that, human dynein light chain Rp3 was fusioned to a N-terminal DNA binding domain and a C-terminal membrane active peptide, TAT. The protein, named T-Rp3, has additionally a His.Tag. The shuttle protein built contains therefore different domains to promote pDNA condensation (DNA binding), to increase cell and nucleus penetration (TAT) and to enhance endosomal escape (His.Tag), besides the Rp3 to assist in the cytosol trafficking, thus covering most of the major obstacles to the vectors in intracellular level. Expression studies indicate that the fusion protein was correctly expressed in soluble form using E. coli BL21(DE3) strain. Gel retardation assays, dynamic light scattering and zeta potential studies indicate an efficient complex formation between pDNA and the fusion protein, resulting in a particle that is both small (~95 nm) and potivelly charged (+28 mV in the molar ratio of pDNA:protein 1:8000) Transfection of cultured HeLa cells indicates that T-Rp3 has a much higher transfection efficiency when compared to the nuclear protein Protamine (here used as a control), reaching a 900-fold increase in expression of transfected reporter gene, both in the same molar ratio of pDNA:protein 1:8000. When compared to Lipofectamine 2000TM, a well-known transfection reagent here used as a control, T-Rp3 showed to reach similar levels of efficiency, but with the further advantage of being less cytotoxic, as observed in cell viability assays. Transfections performed in the presence of the drug Nocodazole indicate that T-Rp3 efficiency largely depends on the microtubule network, since its efficiency is reduced by 92% when microtubules are depolymerized. From transfections in the presence of Choroquine we can deduce that endosomal entrapment remains a limiting factor. Finally, affinity chromatography experiments performed with the immobilized domain of dynein intermediate chain demonstrate that the recombinant light chain T-Rp3 retains the ability to interact with the dynein complex. Taken together, these results point to a strong participation of the microtubule network in the enhanced efficiency of T-Rp3 / Mestrado / Genetica de Microorganismos / Mestre em Genética e Biologia Molecular

En la presente tesis se investigó sobre si las mejoras en la gestión de abastecimiento de filtros y alistamientos, optimizaría el tiempo de entrega al área de servicio técnico de la empresa CGM RENTAL S.A.C., ya que estas demoras han suscitado que el área de servicio técnico no pueda realizar los mantenimientos oportunos de los equipos ocasionando que los equipos presenten problemas por mal funcionamiento, desmovilización de equipos en obra , retrasos en los despachos de los equipos, entre otras lo que representa una pérdida considerable de ingresos para la empresa. Se expone como objetivo mejorar la gestión de abastecimiento; para lo cual se plantea identificar el nivel de rotación de los filtros y alistamientos; calcular sus stocks de seguridad e implementar una correcta planificación de compras. Se utilizó la información obtenida del sistema SAP (Sistemas, Aplicaciones y Producto) para poder comparar el estado de las atenciones al inicio de la tesis con el estado de las atenciones una vez aplicadas las mejoras; para ello se tomó una muestra de 341 OTS (ordenes de trabajo del área de servicio técnico) se utilizaron tablas dinámicas, diagrama de Pareto entre otros conocimientos propios de la ingeniería así como un análisis detallado de la información Se logró confirmar nuestra hipótesis ya que identificando los repuestos de alta rotación, calculando sus stocks de seguridad y mejorando la gestión de compras, se llegó a reducir el tiempo de entrega a servicio técnico. In this thesis we investigated whether improvements in the management of supply of filters and setups, optimize the time of delivery to the area of technical service of the company CGM RENTAL SAC, as these delays have raised the area of service no can make timely maintenance of equipment causing equipment malfunction problems arise, demobilization of equipment on site, delays in deliveries of equipment, including representing a considerable loss of revenue for the company. It is exposed aimed at improving the management of supply; which it is proposed to identify the level of rotation filters and setups; calculating their stocks up and implement proper procurement planning. Information obtained from SAP (Systems, Applications and Products) was used to compare the state of the attention at the beginning of the thesis with the state of the attention once implemented improvements; For this, a sample of 341 OTS (work orders service area) took pivot tables were used, among others Pareto own knowledge of engineering and a detailed analysis of the information They managed to confirm our hypothesis as identifying parts of high rotation, calculating their safety stocks and improving procurement management, it was to reduce the time for service delivery.

Hoy en día, las empresas de manufactura lidian con un entorno de producción dinámico, en los cuales el tiempo de entrega es el criterio fundamental para captar pedidos. Los sistemas de planificación y control de la producción (PPC) han venido jugado un papel crucial, sin embargo, en este nuevo contexto, los modelos más conocidos de PPC ya no satisfacen las necesidades de las organizaciones. Es así como este artículo propone un modelo de PPC basado en el sistema Demand-Driven MRP apoyado por las etapas del ciclo PDCA a fin de que se pueda desempeñar de manera óptima en entornos dinámicos como los modelos de fabricación make-to-order. Como resultado de la simulación en el caso de estudio se obtuvo el 100% de cumplimiento de entregas a tiempo y una reducción del lead time en 50.33%. Por tanto, se concluye que el modelo propuesto es aplicable y beneficioso en dicho contexto. / Nowadays, manufacturing companies deal with a dynamic production environment, in which delivery time is the fundamental criterion to get orders. Production planning and control (PPC) systems have played a crucial role, however, in this new context, the most popular PPC models no longer meet the needs of organizations. This is how this article proposes a PPC model based on the Demand-Driven MRP system supported by the stages of the PDCA cycle so that it can perform optimally in dynamic environments such as make-to-order manufacturing models. As a result of the simulation in the case study, 100% compliance with deliveries on time was obtained and a reduction in lead time by 50.33%. Therefore, it is concluded that the proposed model is applicable and beneficial in this context. / Trabajo de investigación