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The Genetic Consequences of ex situ Conservation of Exceptional Plant Species

Philpott, Megan 29 October 2018 (has links)
No description available.
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Avaliação das afecções odontológicas em pequenos felídeos neotropicais mantidos em cativeiro / Evaluation of dental diseases in small neotropical felids kept in captivity

Prazeres, Rodrigo Filippi 08 May 2014 (has links)
Foram estudados 50 pequenos felídeos neotropicais adultos (25 machos e 25 fêmeas) de quatro espécies distintas - 15 jaguatiricas (Leopardus pardalis), 15 gatos-do-mato-pequenos (Leopardus tigrinus), 10 gatos-maracajás (Leopardus wiedii) e 10 gatos-mouriscos (Puma yagouaroundi), provenientes de quatro coleções zoológicas do Estado de São Paulo. A finalidade foi identificar alterações odontológicas macroscópicas, divididas em quatro grupos: 1. variações, anomalias e ausências dentárias; 2. doença periodontal; 3. traumatismos; 4. lesões de reabsorção dentária. Verificou-se que tais alterações são frequentes, mesmo em animais assintomáticos, sendo a halitose a manifestação clínica aparentemente mais comum. Dentre as alterações verificadas, a doença periodontal (88,0%) foi a mais prevalente, sendo cálculo dental e gengivite os principais achados clínicos, acometendo principalmente a face vestibular dos dentes maxilares. O segundo grupo de alterações odontológicas de maior prevalência foi o de traumatismos (66,0%), principalmente em Leopardus pardalis e Puma yagouaroundi, com destaque para a abrasão dentária, e maior acometimento dos dentes caninos. Ausência de dentes foi o achado mais prevalente no grupo das variações, anomalias e ausências dentárias (54,0%), predominando ausência de incisivo superior medial direito, segundo pré-molar superior direito, canino superior esquerdo e incisivos inferiores laterais, esquerdo e direito, com maior frequência em Puma yagouaroundi. Lesões de reabsorção dentária foram pouco prevalentes (10,0%), sendo observadas principalmente em dentes pré-molares e molares mandibulares. / There were studied 50 adult small neotropical felids (25 males and 25 females) from four species - 15 Leopardus pardalis, 15 Leopardus tigrinus, 10 Leopardus wiedii and 10 Puma yagouaroundi from four zoological collections of the State of São Paulo, Brazil. The objective was to identify macroscopic dental changes, divided into four groups: 1. variations, anomalies and missing teeth; 2. periodontal disease; 3. trauma; 4. resorptive lesions. It was found that such changes are frequent, even in asymptomatic animals, and halitosis is apparently the most common clinical manifestation. Among the changes, periodontal disease (88.0%) was the most prevalent, with dental calculus and gingivitis as major clinical findings, affecting mainly the vestibular surface of the maxillary teeth. The second group of higher prevalence dental findings was trauma (66.0%), mainly observed in Leopardus pardalis and Puma yagouaroundi mainly tooth abrasion, with prevalence of canine teeth. Dental absence was the most prevalent finding in the group of variations, anomalies and missing teeth (54.0%), predominating absence of right medial incisor, second right premolar, upper left incisors and lower right and left canine teeth, with major frequency in Puma yagouaroundi. Resorptive lesions were less prevalent (10.0%), being mainly observed in premolars and mandibular molars.
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Fragmentos florestais e testes de progênies : opções para a coleta de sementes em espécies arbóreas nativas do Cerrado no Bolsão Sul-Mato-Grossense /

Cambuim, José. January 2017 (has links)
Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Abstract: The forest fragment and progeny tests, with the function of assisting conservation, rehabilitation of ecological processes and promoting biodiversity conservation, play an important role in the restoration of degraded areas and reduce the negative effects of the destruction of natural environments. This work aimed to know the population structure, spatial distribution and effective size of native tree species present in a cerrado forest fragment, besides estimating the genetic variability in a test of mixed progenies of Myracrodruon urundeuva; Terminalia argentea and Astronium fraxinifolium; from silvicultural characters in Selvíria - MS, with a view to transforming them into an area to subsidize seed collection. In the forest fragment were measured and identified 1187 individuals with DBH ≥ 10 cm, which make up the arboreal forest canopy. In an area of 0,89 ha were sampled, belonging to 60 species distributed in 31 families, with emphasis on the Fabaceae family with 11 species. The Shannon-Weaver index showed a H '= 2,98 nats ind-1, which can be considered as a mean diversity. The species with the highest Import Value Index (IVI) were Copaifera landesdorffii, Diptychandra aurantiaca, Parapiptadenia rigida, Qualea grandiflora, Qualea parviflora, Vochysia tucanorum, Tapirira guianensis, Astronium fraxinifolium, Xylopia aromatica, and Mabea fistulifera. Thus, among the species found with the highest IVI can be classified as potential for the lease of matrix trees to subsidize t... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: O fragmento florestal e os testes de progênies, com a função de auxiliar a conservação, reabilitação dos processos ecológicos e promover a conservação da biodiversidade, tem um papel importante nos processos de restauração de áreas degradadas e diminuir os efeitos negativos da destruição dos ambientes naturais. Este trabalho objetivou conhecer a estrutura populacional, distribuição espacial e tamanho efetivo de espécies arbóreas nativas presente em um fragmento florestal de cerrado, além de estimar a variabilidade genética num teste de progênies misto de Myracrodruon urundeuva; Terminalia argentea e Astronium fraxinifolium; a partir dos carácteres silviculturais em Selvíria – MS, com vistas de transformá-las em área para subsidiar coleta de sementes. No fragmento florestal foram mensurados e identificados 1187 indivíduos com DAP ≥ 10 cm, que compõem o dossel arbóreo da floresta. Em uma área de 0,89 ha foram amostrados, pertencentes a 60 espécies distribuídas em 31 famílias, com destaque para a família Fabaceae com 11 espécies. O índice de ShannonWeaver apresentou um H’ = 2,98 nats ind-1 , o que pode ser considerado como uma diversidade média. As espécies de maior Índice de Valor de Importância (IVI) foram Copaifera landesdorffii, Diptychandra aurantiaca, Parapiptadenia rigida, Qualea grandiflora, Qualea parviflora, Vochysia tucanorum, Tapirira guianensis, Astronium fraxinifolium, Xylopia aromatica, e Mabea fistulifera. Assim, dentre as espécies encontradas com o maior IVI pod... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor
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Proporção sexual em populações de Myracrodruon urundeuva para fins de formação de pomares de sementes por mudas /

Sant'Ana, Vanessa Zaffani. January 2017 (has links)
Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Resumo: A aroeira (Myracrodruon urundeuva) é uma espécie dioica e se encontra na lista de espécies ameaçadas de extinção, devido ao seu alto valor econômico e à destruição do seu habitat. Dessa forma, se faz necessária a adoção de estratégias para a conservação ex situ dessa espécie arbórea nativa, de tal modo que a variabilidade genética das populações seja mantida. O objetivo deste trabalho foi quantificar a proporção sexual, a sobrevivência e a variação genética do diâmetro à altura do peito (DAP), em seis testes de progênies de M. urundeuva provenientes de seis populações distintas originárias de três biomas (Caatinga, Cerrado e Mata Atlântica). O delineamento utilizado, em cada teste de progênies, foi o de bloco casualizado. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos, para os caracteres quantitativos para os caracteres quantitativos, DAP e sobrevivência, foram realizadas pelo método REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita / melhor predição linear não viciada). O tamanho efetivo da população foi calculado com base no número de indivíduos com flores masculinas e femininas, em um modelo que não há controle de gametas (RS). Verificou-se com base nas estimativas dos parâmetros genéticos que as procedências de Itarumã e Seridó expressam maior variação genética para o caráter DAP, o que possibilita sua utilização na conservação e no melhoramento genético. Foram encontrados altos percentuais de sobrevivência o que caracteriza uma ótima adaptação da espécie no l... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aroeira (Myracrodruon urundeuva) is a dioecious species and is on the list of endangered species due to its high economic value and the destruction of its habitat. That way, becomes necessary the adoption of strategies for the ex situ conservation of native tree species, such that the genetic variability of populations is maintained. The objective of this work was to quantify the sex ratio, the survival and the genetic variation of the diameter at breast height (DBH), on six test progenies of Myracrodruon urundeuva from six distinct populations originating three biomes (Caatinga, Cerrado and Atlantic Forest). The design used, in each progeny test, was a randomized block design. Estimates of variance components and genetic parameters, for quantitative traits DBH and survival, were obtained by REML / BLUP method (restricted maximum likelihood / best linear prediction untainted). The effective population size was calculated based on the number of individuals with male and female flowers in the population, in a model that there is no control of gametes (RS). It was verified based on the estimates of the genetic parameters that the Itarumã and Seridó provenances express greater genetic variation for the DBH character, which allows their use in conservation and genetic improvement. High survival percentages were found, which characterizes an optimal adaptation of the species at the planting site. The sex ratio was biased, with predominance of male flowering plants (3♂:1♀), but ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Fragmentos florestais e testes de progênies: opções para a coleta de sementes em espécies arbóreas nativas do Cerrado no Bolsão Sul-Mato-Grossense / Forest fragments and progeny tests: options for the collection of seeds in native tree species Bolsão Sul-Mato-Grossense

Cambuim, José [UNESP] 02 May 2017 (has links)
Submitted by Jose Cambuim null (jcambuim@adm.feis.unesp.br) on 2017-06-30T14:04:04Z No. of bitstreams: 1 Jose_Cambuim_2017_Doc_Agronomia_VF.pdf: 2793103 bytes, checksum: 1e3d9b4c1f86030fbfa1d8761130e797 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-06-30T14:29:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 cambuim_j_dr_ilha.pdf: 2793103 bytes, checksum: 1e3d9b4c1f86030fbfa1d8761130e797 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-30T14:29:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 cambuim_j_dr_ilha.pdf: 2793103 bytes, checksum: 1e3d9b4c1f86030fbfa1d8761130e797 (MD5) Previous issue date: 2017-05-02 / O fragmento florestal e os testes de progênies, com a função de auxiliar a conservação, reabilitação dos processos ecológicos e promover a conservação da biodiversidade, tem um papel importante nos processos de restauração de áreas degradadas e diminuir os efeitos negativos da destruição dos ambientes naturais. Este trabalho objetivou conhecer a estrutura populacional, distribuição espacial e tamanho efetivo de espécies arbóreas nativas presente em um fragmento florestal de cerrado, além de estimar a variabilidade genética num teste de progênies misto de Myracrodruon urundeuva; Terminalia argentea e Astronium fraxinifolium; a partir dos carácteres silviculturais em Selvíria – MS, com vistas de transformá-las em área para subsidiar coleta de sementes. No fragmento florestal foram mensurados e identificados 1187 indivíduos com DAP ≥ 10 cm, que compõem o dossel arbóreo da floresta. Em uma área de 0,89 ha foram amostrados, pertencentes a 60 espécies distribuídas em 31 famílias, com destaque para a família Fabaceae com 11 espécies. O índice de ShannonWeaver apresentou um H’ = 2,98 nats ind-1 , o que pode ser considerado como uma diversidade média. As espécies de maior Índice de Valor de Importância (IVI) foram Copaifera landesdorffii, Diptychandra aurantiaca, Parapiptadenia rigida, Qualea grandiflora, Qualea parviflora, Vochysia tucanorum, Tapirira guianensis, Astronium fraxinifolium, Xylopia aromatica, e Mabea fistulifera. Assim, dentre as espécies encontradas com o maior IVI podem ser classificadas como potenciais para a locação de árvores matrizes para subsidiar a coleta de sementes. Portanto, dispõem de tamanho efetivo que permite a formação de novas populações, a partir da coleta de sementes nessa área de Reserva legal. No teste de progênies misto aos 22 anos, os valores altos observados para o caráter SOB (M. urundeuva - 88,0%, A. fraxinifolium – 85,9% e T. argentea - 59,6%), indicam boa adaptação das espécies em estudo e potencial para uso em reflorestamentos. As estimativas do coeficiente de variação genética oscilaram de 3,03% a 49,50%, estimando o menor valor obtidos para a variável DAP nas três espécies. As herdabilidades individuais variaram de baixa (0,14) para T. argentea, e alta (>0,40) para M. urundeuva e A. fraxinifolium no caráter DAP. A proporção sexual para as duas espécies foi tendenciosa para sexo masculino, sendo que a proporção geral foi de 1,5 machos para 1 fêmea. O tamanho efetivo populacional variou conforme a proporção de machos e fêmeas, sendo que o que mais se aproximou do valor real de indivíduos reprodutivos foi Myracrodruon urundeuva. Portanto, a seleção dos indivíduos dentro dos testes de progênies não deve considerar apenas o caráter de crescimento (DAP), mas também com base na proporção sexual e no tamanho efetivo populacional para a sua futura transformação em um Pomar de Sementes por Mudas. As informações obtidas com este estudo são úteis para fins de conservação e melhoramento genético das espécies, como também para seleção de matrizes potenciais para recuperação ambiental, o que será fundamental para restauração ecológica em áreas do Bolsão Sul-Mato-Grossense. / The forest fragment and progeny tests, with the function of assisting conservation, rehabilitation of ecological processes and promoting biodiversity conservation, play an important role in the restoration of degraded areas and reduce the negative effects of the destruction of natural environments. This work aimed to know the population structure, spatial distribution and effective size of native tree species present in a cerrado forest fragment, besides estimating the genetic variability in a test of mixed progenies of Myracrodruon urundeuva; Terminalia argentea and Astronium fraxinifolium; from silvicultural characters in Selvíria - MS, with a view to transforming them into an area to subsidize seed collection. In the forest fragment were measured and identified 1187 individuals with DBH ≥ 10 cm, which make up the arboreal forest canopy. In an area of 0,89 ha were sampled, belonging to 60 species distributed in 31 families, with emphasis on the Fabaceae family with 11 species. The Shannon-Weaver index showed a H '= 2,98 nats ind-1, which can be considered as a mean diversity. The species with the highest Import Value Index (IVI) were Copaifera landesdorffii, Diptychandra aurantiaca, Parapiptadenia rigida, Qualea grandiflora, Qualea parviflora, Vochysia tucanorum, Tapirira guianensis, Astronium fraxinifolium, Xylopia aromatica, and Mabea fistulifera. Thus, among the species found with the highest IVI can be classified as potential for the lease of matrix trees to subsidize the collection of seeds. Therefore, they have an effective size that allows the formation of new populations, from the collection of seeds in this area of legal reserve. In the progenies test mixed at 22 years, the high values observed for SOB (M. urundeuva – 88,0%, A. fraxinifolium – 85,9% and T. argentea – 59,6%) indicated a good adaptation of the Species and potential for use in reforestation. Estimates of the coefficient of genetic variation ranged from 3,03% to 49,50%, estimating the lowest value obtained for the DAP variable in the three species. The individual heritabilities ranged from low (0,14) for T. argentea, and high (> 0,40) for M. urundeuva and A. fraxinifolium on the DAP character. The sex ratio for both species was biased for males, with the general proportion being 1,5 males for 1 female. The effective population size varied according to the proportion of males and females, and the one that most approached the real value of reproductive individuals was Myracrodruon urundeuva. Therefore, the selection of individuals within progeny tests should not only consider the growth character (DBH), but also on the basis of the sex ratio and the effective population size for its future transformation into a Seedling Seed Orchard. The information obtained from this study is useful for the conservation and genetic improvement of the species, as well as for the selection of potential matrices for environmental restoration, which will be fundamental for ecological restoration in areas of the Bolsão Sul-mato-grossense.
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Proporção sexual em populações de Myracrodruon urundeuva para fins de formação de pomares de sementes por mudas / Sex ratio in populations of Myracrodruon urundeuva for purposes of training of seed orchards by seedlings

Sant'ana, Vanessa Zaffani [UNESP] 14 August 2017 (has links)
Submitted by Vanessa Zaffani Sant'Ana null (vanessazsbio@gmail.com) on 2017-10-10T19:00:01Z No. of bitstreams: 1 Vanessa Zaffani Sant'Ana..pdf: 1913553 bytes, checksum: a1dccd2bae0ad9102e270554ce3d6aee (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-10-11T18:12:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 santana_vz_me_ilha.pdf: 1913553 bytes, checksum: a1dccd2bae0ad9102e270554ce3d6aee (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-11T18:12:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 santana_vz_me_ilha.pdf: 1913553 bytes, checksum: a1dccd2bae0ad9102e270554ce3d6aee (MD5) Previous issue date: 2017-08-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A aroeira (Myracrodruon urundeuva) é uma espécie dioica e se encontra na lista de espécies ameaçadas de extinção, devido ao seu alto valor econômico e à destruição do seu habitat. Dessa forma, se faz necessária a adoção de estratégias para a conservação ex situ dessa espécie arbórea nativa, de tal modo que a variabilidade genética das populações seja mantida. O objetivo deste trabalho foi quantificar a proporção sexual, a sobrevivência e a variação genética do diâmetro à altura do peito (DAP), em seis testes de progênies de M. urundeuva provenientes de seis populações distintas originárias de três biomas (Caatinga, Cerrado e Mata Atlântica). O delineamento utilizado, em cada teste de progênies, foi o de bloco casualizado. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos, para os caracteres quantitativos para os caracteres quantitativos, DAP e sobrevivência, foram realizadas pelo método REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita / melhor predição linear não viciada). O tamanho efetivo da população foi calculado com base no número de indivíduos com flores masculinas e femininas, em um modelo que não há controle de gametas (RS). Verificou-se com base nas estimativas dos parâmetros genéticos que as procedências de Itarumã e Seridó expressam maior variação genética para o caráter DAP, o que possibilita sua utilização na conservação e no melhoramento genético. Foram encontrados altos percentuais de sobrevivência o que caracteriza uma ótima adaptação da espécie no local de plantio. A proporção sexual foi tendenciosa, com predominância de plantas com florescimento masculino (3♂:1♀), porém a maior parte dos indivíduos de M. urundeuva, procedentes dos diferentes biomas, não floresceram em Selvíria-MS. O tamanho efetivo populacional variou conforme a razão sexual, sendo que os testes de progênies que se aproximaram mais do valor real de indivíduos reprodutivos foram aqueles originários de Seridó (RN), Itarumã (GO) e Petrolina (PE). As subpopulações dos testes de progênies de Itarumã e Selvíria são as mais próximas geneticamente da população de referência (T), ou seja, possuem a mesma representatividade genética. Portanto, a seleção dos indivíduos dentro dos testes de progênies não deve considerar apenas o caráter de crescimento (DAP), mas também basear-se na razão sexual e no tamanho efetivo populacional, para a sua futura transformação em um pomar de sementes por mudas. / The aroeira (Myracrodruon urundeuva) is a dioecious species and is on the list of endangered species due to its high economic value and the destruction of its habitat. That way, becomes necessary the adoption of strategies for the ex situ conservation of native tree species, such that the genetic variability of populations is maintained. The objective of this work was to quantify the sex ratio, the survival and the genetic variation of the diameter at breast height (DBH), on six test progenies of Myracrodruon urundeuva from six distinct populations originating three biomes (Caatinga, Cerrado and Atlantic Forest). The design used, in each progeny test, was a randomized block design. Estimates of variance components and genetic parameters, for quantitative traits DBH and survival, were obtained by REML / BLUP method (restricted maximum likelihood / best linear prediction untainted). The effective population size was calculated based on the number of individuals with male and female flowers in the population, in a model that there is no control of gametes (RS). It was verified based on the estimates of the genetic parameters that the Itarumã and Seridó provenances express greater genetic variation for the DBH character, which allows their use in conservation and genetic improvement. High survival percentages were found, which characterizes an optimal adaptation of the species at the planting site. The sex ratio was biased, with predominance of male flowering plants (3♂:1♀), but most of M. urundeuva individuals, from the different biomes, did not flower in Selvíria-MS. The effective population size varied according to the sex ratio, being that the progeny tests that approached more of the real value of reproductive individuals were those originating from Seridó (RN), Itarumã (GO) and Petrolina (PE). The subpopulations of the tests progenies of Itarumã and Selvíria are the closest genetically of the reference population (T), that is, they have the same genetic representativeness. Therefore, the selection of individuals within the progeny tests should not only consider the growth trait (DBH), but also be based on sex ratio and effective population size for its future transformation into a Seed Orchard. / FAPESP: 2015/15693-7
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Diversidade genética em populações de Myracrodruon urundeuva Fr. All., sob diferentes tipos de perturbação antrópica

Perez Viegas, Michele [UNESP] 06 February 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-06Bitstream added on 2014-06-13T19:18:12Z : No. of bitstreams: 1 perezviegas_m_me_ilha.pdf: 402677 bytes, checksum: bbfc07fa77debb297881fa5d75487697 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os marcadores de microssatélites tem sido utilizados com grande freqüência como ferramenta efetiva para estudos de estrutura genética de populações, fluxo gênico, parentesco e para quantificar os efeitos da fragmentação de habitats e guiar estratégias de conservação e melhoramento genético. Este trabalho teve como objetivo avaliar a diversidade genética e o sistema reprodutivo em progênies de duas populações de Myracrodruon urundeuva, procedentes de Aramina-SP e Selvíria-MS, assim como verificar os efeitos da ação antrópica sobre estas populações. Foram avaliadas 25 progênies de cada população, cada uma com 17 a 20 indivíduos, sendo analisados oito locos polimórficos de regiões microssatélites. Observouse 118 alelos nas duas populações e o número efetivo por loco ( e A ∧ = 4,05) foi inferior ao número médio de alelos por loco ( ∧A= 14,75), indicando elevado número de alelos em baixa freqüência. O índice de fixação (F = 0,210 e 0,107, respectivamente para Aramina e Selvíria) foi positivo, relativamente alto e significativamente diferente de zero. A taxa de cruzamento multilocos ( ∧ m t = 1,000 e ∧ m t = 1,000) e unilocos ( ∧ s t = 0,989 e ∧ s t = 0,999) para as populações de Aramina e Selvíria, respectivamente, foram altos, confirmando que a espécie é obrigatoriamente de cruzamento. A diferença entre a taxa de cruzamento multilocos e unilocos indicam cruzamentos entre indivíduos aparentados na população de Aramina. 9 Entretanto, as duas populações apresentaram alta diversidade genética, o que as qualifica para utilização em programas de conservação e melhoramento genético da espécie. / The microsatellite markers has been often employed as effective tool for studies of genetic structure of populations, gene flow, relationship and also for to quantify environmental fragmentation effects and to outline strategies for conservation and breeding. This study aimed to evaluate the genetic diversity and mating system in progenies of two Myracrodruon urundeuva populations from Aramina-SP and Selvíria-MS, as well as verify the effects of antropic action on these populations. From each population were evaluated 25 progenies, with 15-20 individuals each, using genetic data from 8 microsatellite loci. There was 118 alleles in both populations and the actual number per locus ( e A ∧ = 4.05) was lower than the average number of alleles per locus ( ∧A = 14.75), indicating high number of alleles in low frequency. The fixation index (F = 0,210 e 0,107, respectively for Aramina and Selvíria) was positive, relatively high and significantly different from zero. The multilocus outcrossing rate ( ∧ m t = 1,000 e ∧ m t = 1,000) single-locus ( ∧ s t = 0,989 e ∧ s t = 0,999) for the populations for Aramina and Selvíria, respectively, they were high, confirming that the species is obligatorily for outcrossing. The difference between the multilocus outcrossing rates and single-locus outcrossing rate indicates mating among relatives in the Aramina population. Meanwhile, the 11 two populations had high genetic diversity, which qualifies them for use in programs for conservation and breeding of this species.
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Avaliação das afecções odontológicas em pequenos felídeos neotropicais mantidos em cativeiro / Evaluation of dental diseases in small neotropical felids kept in captivity

Rodrigo Filippi Prazeres 08 May 2014 (has links)
Foram estudados 50 pequenos felídeos neotropicais adultos (25 machos e 25 fêmeas) de quatro espécies distintas - 15 jaguatiricas (Leopardus pardalis), 15 gatos-do-mato-pequenos (Leopardus tigrinus), 10 gatos-maracajás (Leopardus wiedii) e 10 gatos-mouriscos (Puma yagouaroundi), provenientes de quatro coleções zoológicas do Estado de São Paulo. A finalidade foi identificar alterações odontológicas macroscópicas, divididas em quatro grupos: 1. variações, anomalias e ausências dentárias; 2. doença periodontal; 3. traumatismos; 4. lesões de reabsorção dentária. Verificou-se que tais alterações são frequentes, mesmo em animais assintomáticos, sendo a halitose a manifestação clínica aparentemente mais comum. Dentre as alterações verificadas, a doença periodontal (88,0%) foi a mais prevalente, sendo cálculo dental e gengivite os principais achados clínicos, acometendo principalmente a face vestibular dos dentes maxilares. O segundo grupo de alterações odontológicas de maior prevalência foi o de traumatismos (66,0%), principalmente em Leopardus pardalis e Puma yagouaroundi, com destaque para a abrasão dentária, e maior acometimento dos dentes caninos. Ausência de dentes foi o achado mais prevalente no grupo das variações, anomalias e ausências dentárias (54,0%), predominando ausência de incisivo superior medial direito, segundo pré-molar superior direito, canino superior esquerdo e incisivos inferiores laterais, esquerdo e direito, com maior frequência em Puma yagouaroundi. Lesões de reabsorção dentária foram pouco prevalentes (10,0%), sendo observadas principalmente em dentes pré-molares e molares mandibulares. / There were studied 50 adult small neotropical felids (25 males and 25 females) from four species - 15 Leopardus pardalis, 15 Leopardus tigrinus, 10 Leopardus wiedii and 10 Puma yagouaroundi from four zoological collections of the State of São Paulo, Brazil. The objective was to identify macroscopic dental changes, divided into four groups: 1. variations, anomalies and missing teeth; 2. periodontal disease; 3. trauma; 4. resorptive lesions. It was found that such changes are frequent, even in asymptomatic animals, and halitosis is apparently the most common clinical manifestation. Among the changes, periodontal disease (88.0%) was the most prevalent, with dental calculus and gingivitis as major clinical findings, affecting mainly the vestibular surface of the maxillary teeth. The second group of higher prevalence dental findings was trauma (66.0%), mainly observed in Leopardus pardalis and Puma yagouaroundi mainly tooth abrasion, with prevalence of canine teeth. Dental absence was the most prevalent finding in the group of variations, anomalies and missing teeth (54.0%), predominating absence of right medial incisor, second right premolar, upper left incisors and lower right and left canine teeth, with major frequency in Puma yagouaroundi. Resorptive lesions were less prevalent (10.0%), being mainly observed in premolars and mandibular molars.
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Variação genética quantitativa e estrutura populacional de Hymenaea stigonocarpa (Mart. Ex Hayne) no cerrado / Quantitative genetic variation and population structure of Hymenaea stigonocarpa (Mart. Ex Hayne) in the cerrado

Castro, Rodrigo Soares de 30 May 2016 (has links)
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No. of bitstreams: 2 Tese - Rodrigo Soares de Castro - 2016.pdf: 5776299 bytes, checksum: 5c221af09289c691e9ae2d0146748a62 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-05-30 / This study aimed to analyze the quantitative genetic variation within and between natural subpopulations of Hymenaea stigonocarpa (Mart. Ex Hayne), fruit tree from the Cerrado region. Six mother trees were sampled in each of the 25 subpopulations from the states of Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais and Bahia, covering a large area of the Cerrado biome. In each tree they were collected twenty fruits, which served for evaluation of biometric data of fruits and seeds. Twenty seeds of each mother tree were sown in a nursery, with five seeds per plot in four randomized blocks, constituting a test of provenances and progenies of half sibs. Analysis of variance were performed using the hierarchical model for the characters of initial development. With the produced seedlings it was planted a germplasm collection in vivo in Escola de Agronomia of Universidade Federal de Goias.The major phenotypic variation coefficients in fruits and seeds were found in the characters number of seed (47,87%) weight of the pulp (47.74%) and fruit weight (44.06%). The analysis of variance of the physical characteristics of the fruits and seeds revealed the existence of significant variation for all characters in all levels analyzed: among subpopulations, between mother trees within subpopulations and between fruit within mother tree. Of the ten characters analyzed in six the greatest variation was found between fruit within mother tree. Significant variability was found between subpopulations and between progenies within subpopulations for most quantitative traits studied, showing a great genetic variability of the sampled material, which is important for sustainability of the species and future breeding program. The heritability estimates of traits were also high, indicating success in the selection of desirable traits in a breeding program for the species. The comparative analysis between the estimated value of the QST and FST index showed no significant difference for eight of ten characters analyzed, demonstrating that there is no evidence of the action of natural selection in the differentiation between the studied subpopulations and that the differentiation found can be explained by the action of genetic drift combined with gene flow restriction between subpopulations. The value of correlation coefficient between phenotypic and geographical matrix was 0.164 (p <0.05) by Mantel test, indicating a weak correlation between the phenotypic subpopulations means and the distances between them. / O trabalho teve o objetivo de analisar a variação genética quantitativa entre e dentro de subpopulações naturais de Hymenaea stigonocarpa (Mart. ex Hayne), árvore frutífera da região do Cerrado conhecida como jatobá, jatobá do cerrado ou jatobá do campo. Foram amostradas seis árvores matrizes em cada uma das 25 subpopulações distribuídas pelos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerias e Bahia, abrangendo uma grande área do bioma Cerrado. Em cada árvore foram coletados vinte frutos, que serviram para avaliação dos dados biométricos de frutos e sementes. Vinte sementes de cada matriz foram semeadas em uma área telada, sendo cinco sementes por parcela em quatro blocos ao acaso, constituindo um teste de progênies de meio irmãos hierarquizado. Foram feitas análises de variância e seus componentes pelo modelo hierárquico para os caracteres de desenvolvimento inicial das plântulas. Com as mudas produzidas foi plantado um banco de germoplasma in vivo na Escola de Agronomia da Universidade Federal de Goiás. Os maiores coeficientes de variação fenotípica dos frutos e sementes foram encontrados nos caracteres número de sementes (47,87%), peso da polpa (47,74%) e peso do fruto (44,06%). A análise de variância dos caracteres físicos dos frutos e sementes revelou a existência de variação significativa para todos os caracteres em todos os níveis hierárquicos analisados: entre subpopulações, entre matrizes dentro de subpopulações e entre frutos dentro de matrizes. Dos dez caracteres analisados, em seis a maior variação foi encontrada entre frutos dentro de matrizes. Foram constatadas variabilidades significativas entre subpopulações e entre progênies dentro das subpopulações para a maioria dos caracteres quantitativos de desenvolvimento inicial de plântulas estudadas. Tal resultado denota variabilidade genética do material amostrado, que é importante para a preservação da espécie e também para um futuro programa de melhoramento visando o seu aproveitamento econômico. As estimativas de herdabilidade encontradas nos caracteres estudados também foram altas e adequadas para o sucesso na seleção de caracteres desejáveis em um programa de melhoramento para a espécie. A análise comparativa entre os valores estimados dos índices QST e FST não diferiram significativamente em oito dos dez caracteres analisados, demonstrando que não existe forte evidência da ação da seleção natural na diferenciação entre as subpopulações estudadas e que a diferenciação encontrada pode ser explicada pela ação da deriva genética combinado com a restrição de fluxo gênico entre as subpopulações. O valor encontrado no teste de mantel feito entre as matrizes fenotípica e geográfica foi de 0,164 (p<0,05), denotando uma fraca correlação entre os dados fenotípicos das subpopulações avaliadas e as distâncias entre elas. Pelo correlograma de mantel verificou-se que a correlação entre as matrizes embora fraca, ela diminui constantemente através das classes de distância, chegando a zero por volta dos 500 km. Tal diminuição constante da influência da distância na diferença fenotípica entre as subpopulações caracteriza um padrão clinal.
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Biorremediação de solos contaminados com hidrocarbonetos totais de petróleo - enfoque na aplicação do processo terraferm

Berger, Thomas Michael January 2005 (has links)
Bodenkontaminationen durch Mineralölkohlenwasserstoffe sind ein weltweites Umweltproblem. Die Kontaminatiosquellen stehen im Zusammenhang mit Förderung, Lagerung, Transport, Verteilung und Endlagerung von Erdöl und Erdölprodukten. Brasilien beginnt zurzeit einen Prozess der Altlastenerfassung und –erkundung und in Konsequenz dessen auch die Suche nach geeigneten Sanierungstechniken. Biologische Prozesse spielen eine immer stärkere Rolle insbesondere bei der Sanierung von Bodenkontaminationen mit organischen Substanzen. Diese Prozesse gelten als “ökologisch korrekter” und sind im Vergleich mit anderen Techniken mit geringeren Kosten und technischen Aufwand durchführbar. Ziel dieser Arbeit war es, die Anwendungsmöglichkeiten der biologischen Bodensanierung mittels des Terraferm® Verfahrens unter den Umweltbedingungen des Bundesstaates São Paulo, Brasilien zu überprüfen. Zu diesem Zweck wurde der Boden einer MKW-kontaminierte Fläche (Mina de Argila) in der Raffinerie REPLAN der PETROBRÁS S/A in Paulínia -SP ausgekoffert. Es wurden zehn Bodenproben in Bezug auf ihre physikalisch-chemischen Eigenschaften MKW, PAK, BTEX, Metalle (Cr, Zn, Pb, Ni, Cu, Cd, As, Hg, Fe, Ta), Wassergehalt, pH, Korngröße analysiert. Drei Proben mit durchschnittlichen MKW-gehalten wurden zur Überprüfung der biologischen Sanierbarkeit und der Bestimmung der Kontrollparameter für den später Sanierungsdurchführung Säulenversuchen unterzogen. Insgesamt wurden 72.384t kontaminierten Bodens ausgekoffert, wovon 21.050t der Abfallklasse II (nach NBR 10004) zugeordnet wurden und direkt auf eine Mülldeponie verbracht wurden. Es wurden 51.334t der Abfallklasse 1 in die Bodenreinigungsanlage der Firmen SAPOTEC/ESTRE in Paulínia - SP mittels des Terraferm® Verfahrens behandelt. Dieses Verfahren ist darauf ausgelegt, alle für den biologischen Abbau nötigen Prozessparameter im Optimum zu halten. Die Behandlung erfolgt in Hallen auf versiegeltem Untergrund und die dabei freigesetzten Schad- und Geruchsstoffe werden gefasst und einer Abluftreinigung zugeführt. Nach der Vorbehandlung (Aussortierung von Störstoffen, Zugabe von Strukturmaterial, Durchmischung) mittels speziellem Aufbereitungsaggregat wurden insgesamt elf Behandlungsmieten aufgesetzt. Der Sauerstoffgehalt, Bodenfeuchte und Nährstoffgehalte wurden im Optimalbereich gehalten. Die Analysen und die Säulenversuche bestätigten die biologische Sanierbarkeit des Bodens. Die Abbauraten in den Säulenversuchen lagenzwischen 70,2% und 88,6% in 14 Tagen. Diese hohen Abbauraten lassen sich durch die Zusammensetzung der MKW begründen, die sich hauptsächlich aus gut abbaubaren n-Alkanen und iso-Alkanen bestehen. Die durchschnittliche Abbaurate bei den elf Behandlungsmieten lag bei 80,88%, wobei die niedrigste bei 54,71% und die höchste Abbaurate bei 97,97% lagen. Die statistische Auswertung ergab, dass sich die Mittelwerte der MKW-gehalte während der Behandlung signifikant voneinander unterscheiden (<0,01). Die im Rahmen dieser Arbeit durchgeführten Versuche bestätigen den erfolgreichen Einsatz des Terraferm® Verfahrens unter Umweltbedingungen des Bundesstaates São Paulo, Brasilien. Die starke Variabilität der Abbauraten in den Behandlungsmieten deutet aber auf einen weiteren Forschungsbedarf, insbesondere hinsichtlich des Temperatur-einflusses, hin. / Contaminações de solos com hidrocarbonetos de petróleo são um problema ambiental com abrangência mundial devido à alta demanda de produtos refinados de petróleo. As fontes são múltiplas e estão relacionadas à exploração, produção, armazenamento, transporte, distribuição e à destinação final de petróleo e seus derivados. Hoje o Brasil está iniciando um processo de avaliação e cadastramento de suas áreas contaminadas e, conseqüentemente, está procurando alternativas para a remediação das mesmas. Processos biológicos estão ganhando cada vez mais importância no tratamento, especialmente de solos contaminados com compostos orgânicos. Estes métodos são favorecidos por serem mais limpos, com custos baixos e de mais fácil aplicação em escala industrial. Assim, com o objetivo de verificar a aplicabilidade da biorremediação através do processo Terraferm® às condições ambientais do Estado de São Paulo, Brasil, foi realizada a remediação ex situ de uma área contaminada com TPH, chamada Mina de Argila na Refinaria de Paulínia – REPLAN da PETROBRÁS S/A, em Paulínia - SP. Foram analisadas dez amostras de solo contaminado em relação aos parâmetros físico-químicos TPH, PAH, BTEX, metais (Cr, Zn, Pb, Ni, Cu, Cd, As, Hg, Fe, Ta), umidade, pH, oxigênio e granulometria. Três amostras com valores médios de TPH foram submetidas a ensaios de coluna para verificação da biotratabilidade do material e para definição de parâmetros de controle do processo em escala industrial. Foram removidos um total de 72.384t de material contaminado. Deste total, 21.050t foram classificadas como resíduo classe II segundo a NBR 10004 e encaminhadas para um aterro sanitário, e 51.334t foram classificadas como resíduo classe I, sendo destinadas à estação de biorremediação das empresas SAPOTEC/ESTRE, em Paulínia - SP. O solo contaminado foi tratado com o processo Terraferm®, que visa à otimização dos parâmetros que influenciam diretamente a atividade microbiana necessária para a biodegradação. O tratamento é feito em galpões com piso impermeabilizado e com um sistema de captação e tratamento das emissões geradas durante o processo de biodegradação. Após o pré-tratamento em máquina especial, que consiste na separação dos materiais não-tratáveis, na homogeneização e na adição de material estrutural, o solo contaminado foi colocado em onze pilhas de tratamento. Os fatores chave como o teor de oxigênio, a umidade e os nutrientes foram mantidos nas faixas consideradas ótimas. A caracterização química e o ensaio de coluna comprovaram a biotratabilidade do solo. Noensaio em coluna, obteve-se taxas de degradação entre 70,2% e 88,6% em 14 dias. Essas taxas altas são explicadas pela composição do TPH que consiste, neste caso, basicamente de n-alcanos e iso-alcanos considerados de fácil degradação biológica. A taxa média de degradação obtida no tratamento das onze pilhas foi de 80,88%, sendo a menor de 54,71% e a maior de 97,97%. Na análise estatística, verificou-se que as médias das concentrações de TPH durante cada período de tratamento diferem significativamente (<0,01). O trabalho conclui que o processo Terraferm® foi aplicado com sucesso nas condições ambientais do Estado de São Paulo, Brasil. Entretanto, os resultados do tratamento mostram uma alta variabilidade das taxas de degradação nas pilhas, que indica a necessidade de novas pesquisas, especialmente sobre a influência da temperatura no processo. / Soil contaminations with petroleum hydrocarbons are a worldwide environmental problem due to the high demand for refined petroleum products. Contamination sources are multiple and related to the exploration, production, storage, transportation, distribution, and final disposal of petroleum and its derivatives. Nowadays Brazil is starting to assess and record its contaminated areas and consequently search for alternatives for their remediation. Biological processes are gaining more and more importance, specially in the treatment of soils contaminated by organic compounds. These methods are favored for being cleaner, with lower costs, and more easily applicable to industrial scale. Therefore, with the objective of verifying the applicability of bioremediation to the environmental conditions of São Paulo State, Brazil, the ex situ remediation of a contaminated area by TPH was carried out by using the Terraferm® process. The area called Mina de Argila was located in the Paulínia Refinery – REPLAN, which belongs to PETROBRÁS S/A (the country's leader in the exploration, production, and distribution of petroleum products). Ten samples of contaminated soil were analyzed in relation to the physical-chemical parameters TPH, PAH, BTEX, metals (Cr, Zn, Pb, Ni, Cu, Cd, As, Hg, Fe, Ta), humidity, pH, oxygen and texture. Three samples with average values of TPH were submitted to column tests in order to assess the material biotreatability and define the control parameters of the process on industrial scale. A total of 72,384t of contaminated soil were removed. From this total, 21,050t were classified as class II waste according to NBR 10004 and sent to a landfill, and 51,334t were classified as class I waste and sent to the bioremediation plant of the companies SAPOTEC/ESTRE, in Paulínia – São Paulo State. The contaminated soil was treated with the Terraferm® process whose purpose is to optimize the parameters which directly influence the microbial activity necessary for biodegradation. The treatment was carried out in sheds with waterproof floor and a collection and treatment system for the emissions generated in the biodegradation process. After the treatment in a special machine, which consists in separating non-treatable materials, homogenizing, and adding structural material, the soil was placed into eleven treatment piles. The oxygen content, humidity, and nutrients were kept within a range considered optimum. The chemical characterization and the column test proved the soil biotreatability. In the column test, the degradation rates were between 70.2% and 88.6% in 14 days. These high rates are due to the TPHcomposition, which in this case basically consists in n-alkenes and iso-alkenes of easy biological degradation. The average degradation rate verified in the treatment of the eleven piles was of 80.88%, the lowest being 54.71% and the highest 97.97%. In the statistical analysis, it was verified that the average concentrations of TPH during each treatment period differ significantly (<0.01). The conclusion of this work is that the Terraferm® process was successfully applied to the environmental conditions of São Paulo State. However, the treatment results show a high variability in the degradation rates of the piles, which indicates the need for further research, specially on the influence of temperature on the process.

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