Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-04-04T18:42:15Z No. of bitstreams: 1 EdsonSoaresDaSilvaJunior_DISSERT.pdf: 3462839 bytes, checksum: 8d21d202beb3732a0d6b66bd9394d7cc (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-04-12T21:58:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 EdsonSoaresDaSilvaJunior_DISSERT.pdf: 3462839 bytes, checksum: 8d21d202beb3732a0d6b66bd9394d7cc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-12T21:58:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EdsonSoaresDaSilvaJunior_DISSERT.pdf: 3462839 bytes, checksum: 8d21d202beb3732a0d6b66bd9394d7cc (MD5) Previous issue date: 2016-12-19 / As cinco esp?cies de tartarugas marinhas que ocorrem no litoral brasileiro est?o classificadas como esp?cies em risco de extin??o pelas listas mundiais de esp?cies amea?adas. Tal status ? decorrente das diferentes amea?as que esses animais v?m sofrendo no decorrer das ?ltimas d?cadas, dentre estas a destrui??o do habitat, fotopolui??o, pesca incidental, tr?fego de ve?culos e preda??o de ovos. Outra consider?vel amea?a a esses animais, descrita na literatura, ? a ocorr?ncia da fibropapilomatose. Esta doen?a acomete as tartarugas marinhas, em especial indiv?duos juvenis da esp?cie Chelonia mydas, embora tenha sido descrito tamb?m nas demais esp?cies. Este trabalho pretende investigar a distribui??o espacial e temporal dos registros de tartarugas marinhas com fibropapilomatose que encalham, vivos ou mortos, entre as praias dos munic?pios de Icapu?/CE at? Cai?ara do Norte/RN, bem como analisar os aspectos histopatol?gicos das les?es. Para isso foram realizados monitoramentos di?rios, utilizando-se quadriciclos, a fim de registrar a ocorr?ncia de tartarugas marinhas nas praias da Bacia Potiguar RN / CE. Os animais que foram encontrados mortos, dependendo do estado da carca?a, foram avaliados quanto ? esp?cie, ao n?mero e posicionamento dos tumores, fotografados e georreferenciados. Os animais vivos foram resgatados e translocados para a Base de Reabilita??o do Projeto Cet?ceos da Costa Branca/UERN-Areia Branca onde foi realizado o procedimento de contagem e localiza??o dos tumores. Para o desenvolvimento da pesquisa est?o sendo utilizados dados coletados entre os anos de 2011 e 2015. Dentre as 3.960 tartarugas marinhas encalhadas, 680 apresentaram tumores sugestivos de fibropapilomatose, valores estes que apresentaram crescimento durante os anos estudados. No que diz respeito a varia??o por trecho de monitoramento, a maior frequ?ncia de animais acometidos pela doen?a foi registrada no trecho C correspondente a "Guamar?-Macau?. Quanto a fase de desenvolvimento, a maior parte dos indiv?duos acometidos estavam no est?gio juvenil, por?m tamb?m houve registro de animais adultos e subadultos acometidos pela doen?a. As les?es se configuram por apresentarem hiperplasia da epiderme, do conjuntivo, desorganiza??o de fibras col?genas, hiperqueratiniza??o de regi?es dentro do tecido conjuntivo e vacuoliza??o no citoplasma. Al?m disso, foram observados ovos de parasitas presentes dentro da estrutura do fibropapiloma, al?m das proje??es papilares que marcam de maneira peculiar a estrutura tumoral. A Bacia Potiguar RN / CE mostrou-se como sendo um trecho com caracter?sticas compartilhadas por outras ?reas de registros da fibropapilomatose e com fatores que podem ter contribu?do para o aumento dos registros de animais acometidos. Por se tratar de uma doen?a debilitante, que acomete principalmente animais juvenis e com etiologia ainda n?o bem definida, a fibropapilomatose impulsiona pesquisas que visam melhor entendimento da doen?a para conserva??o das esp?cies de tartarugas marinhas. / The five species of sea turtles that occur in the brazilian coast are classified as species at risk of extinction by global lists of threatened species. Such status is due to the different threats that these animals have suffered over the past decades, among them the destruction of natural habitat, fotopolui??o, incidental fishing, vehicle traffic and predation of eggs. Another significant threat to these animals, described in the literature, is the occurrence of fibropapillomatosis. This disease affects sea turtles, especially juveniles of the species Chelonia mydas, although it was also described in other species. This work intends to investigate the spatial and temporal distribution of records of sea turtles with fibropapilamatose stranding, living or dead, from the beaches of the municipalities of Icapu? / CE by Cai?ara do Norte / RN, and to characterize the histology of these lesions. For this daily monitoring were performed, using quads in order to record the occurrence of sea turtles in the Bacia Potiguar RN / CE of beaches. Dead animals, depending of the decomposition state, they were evaluated for the type, number and positioning of tumors, photographed and georeferenced. The live animals were rescued and translocated to the rehabilitation base of the project Cet?ceos da Costa Branca / UERN-Areia Branca where we performed the count procedure and location of the tumors. For the development of the research are being used data collected between 2011 and 2015. Among the 3.960 stranded sea turtles, 680 had tumors caused by fibropapillomatosis, values which grew during the years studied. In relation to the variation between the monitored sectors, the highest frequency of animals affected by the disease was recorded in the sector ?C? "Guamar?-Macau." As the development phase, most of the affected individuals were in the immature stage, but there were also adult animals record and subadult affected by the disease. The lesions are configured for presenting papillary projections and epidermal hyperplasia, hyperkeratinisation regions within the connective tissue and points with suggestive of inflammation erythrocyte clusters. In addition, we observed parasites and leech eggs present within tumor structure. The Bacia Potiguar RN / CE has been shown to be an excerpt with features shared by other areas of fibropapillomatosis occurrence and with factors that may have contributed to the increase of the records of affected animals. Because it is a debilitating disease, which affects mainly juvenile animals with etiology not yet well defined, fibropapillomatosis promotes research aimed at a better understanding of the disease for the conservation of sea turtle species.

Os herpesvírus são normalmente adaptados a um único grupo de hospedeiros, e esta associação parasita-hospedeiro está ligada à sua seleção e coevolução. Estes agentes podem causar infecções latentes, onde normalmente o vírus não se replica. Durante o ciclo lítico, no entanto, outras células são infectadas e liberam partículas virais capazes de infectar outros indivíduos. O CFPHV (Chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus) tem sido apontado como principal agente infeccioso ligado a fibropapilomatose em tartarugas-marinhas. A doença caracteriza-se por uma proliferação cutânea benigna mas que, dependendo da sua severidade, pode comprometer a sobrevivência do indivíduo afetado, sendo por isso apontada como importante ameaça a conservação de tartarugas-marinhas, particularmente de tartarugas verdes (Chelonia mydas), a principal espécie acometida pela doença. Alguns aspectos da biologia do CFPHV e sua relação com as tartarugas verdes foram estudados no presente trabalho. Primeiramente, a capacidade deste agente em se disseminar pelo ambiente e infectar outros indivíduos, e as possíveis vias envolvidas nesta dispersão. Em seguida, avaliou-se os possíveis tecidos em que o herpesvírus pode estabelecer a infecção latente. Por fim, determinou-se a prevalência de indivíduos de Chelonia mydas infectados pelo CFPHV em duas áreas de alimentação (Ubatuba-SP e Vitória-ES) e em uma áreas mista - de alimentação e reprodução (Fernando de Noronha-PE). No primeiro estudo, observou-se que a prevalência de CFPHV nas amostras de secreções de Chelonia mydas variou entre 0%, no Espírito Santo, a 25%, em São Paulo. Os haplótipos afetados foram CMA-3 e CMA-8, e a variante viral encontrada não havia sido detectada anteriormente no Brasil, mas possui elevada similaridade com vírus provenientes do Golfo da Guiné e de Porto Rico. Os resultados sugerem que estes vírus podem ser transmitidos por secreções e também circular entre diferentes regiões. No segundo estudo, detectou-se a presença de CFPHV no cérebro de 5 animais necropsiados e também na pele e em lesões fibropapilomatosas. Em um dos animais foi detectada a presença de uma única variante de CFPHV no cérebro, pele e tumores. Esta variante ainda não havia sido detectada no Brasil e apresentou 100% de identidade com a variante detectada nas secreções. Para avaliar a relação entre haplótipos e variantes virais, o terceiro estudo determinou a prevalência de CFPHV em pele e tumores de 136 indivíduos - 9,56% de indivíduos sadios apresentavam o agente em tecido epitelial e 45,58% dos animais foram positivos para CFPHV, quando considerados também animais com fibropapilomatose. Duas novas variantes de herpesvírus foram encontradas: Var. 7, em Ubatuba-SP e Vitória-ES e Var. 8, em Vitória-ES. Não houve associação entre uma variante viral e um haplótipo. Os resultados observados permitem apontar que o CFPHV pode estabelecer infecções latentes; o vírus pode \"migrar\" entre diferentes regiões, junto com seus hospedeiros; partículas virais podem ser liberadas por secreções; duas novas variantes foram identificadas. Altas taxas de substituição de nucleotídeos em CFPHV podem indicar o surgimento das variantes destas áreas, mas a alta similaridade entre as variantes detectadas e àquelas de Porto Rico e Golfo da Guiné sugerem também a entrada de novas variantes na costa brasileira. / Herpesviruses are usually adapted to a single group of hosts, and this host-parasite association is linked to its selection and co-evolution. These agents can cause latent infections, where the virus usually does not replicate. During the lytic cycle, however, other cells are infected and release viral particles capable of infecting other individuals.The CFPHV (Chelonid fibropapilloma-associated herpesviru) has been indicated as the main infectious agent linked to fibropapillomatosis on sea turtles. The disease is characterized by a benign skin proliferation, but, depending on its severity, can compromise the survival of the affected individual, therefore considered an important threat to the conservation of sea turtles, especially green turtles (Chelonia mydas), the main species affected by the disease. Some aspects of the CFPHV biology and its relation to green turtles were studied in this work. Firstly, the ability of this agent to spread in the environment and infect other individuals, and the possible pathways involved in this dispersion. Then, potential tissues wherein the herpesvirus can establish latent infection were assessed. Finally, we determined the prevalence of Chelonia mydas individuals infected by CFPHV in two feeding areas (Ubatuba-SP and Vitória-ES) and in a mixed area of feeding and reproduction (Fernando de Noronha-PE). In the first study, it was observed that the prevalence of CFPHV in samples of Chelonia mydas secretions ranged from 0% in Espírito Santo, to 25% in São Paulo. Affected haplotypes were CM-A3 and CM-A8, and viral variant found had not been previously detected in Brazil, but it is significantly similar to viruses found in the Gulf of Guinea and Puerto Rico. The results suggest that these viruses can be transmitted by secretions and can also circulate among different regions. Considering the low maintenance of the agent within the environment, they are probably brought by individuals with the latent virus, being capable of releasing viral particles during the herpesvirus replication cycle. In the second study, the presence of CFPHV was detected inside the brain of 5 necropsied animals, besides the detection of the virus on the skin and fibropapillomatosis lesions. In one of the animals, it was possible to characterize the CFPHV and the presence of a single viral variant inside the brain, tumors and on the skin of the same animal was detected. This variant had not yet been detected in Brazil and showed 100% identity with the variant detected in secretions. These results indicate that the virus may establish a latent infection in nerve tissue. To evaluate the relationship between haplotypes and viral variants, the third study determined the prevalence of CFPHV on skin and tumors of 136 individuals - 9.56% of healthy individuals showed the agent in epithelial tissue and 45.58% of the animals were positive for CFPHV, when also considered animals with fibropapillomatosis. Two new variants of the herpesvirus were found, Var. 7 in Ubatuba-SP and Vitória-ES and Var. 8 only in Vitória-ES. C. mydas individuals of different haplotypes were infected, and there was no association between a viral variant and a haplotype. The observed results permitted to point that CFPHV can establish latent infections in Chelonia mydas; the virus can \"migrate\" among different regions, along with its hosts; viral particles can be released by secretion; viral variants previously detected were not found in these areas, but two new variants were detected. The high nucleotide substitution rates observed in CFPHV may indicate the emergence of these variants in these areas, but the high similarity among the detected variants and those identified in Puerto Rico and Gulf of Guinea also suggest the entry of new variants into the Brazilian coast.

A fibropapilomatose é uma neoplasia caracterizada pela formação de múltiplos tumores que acomete, mais frequentemente, a espécie de tartaruga marinha Chelonia mydas. Estudos recentes apontam o Chelonid herpesvirus 5 (ChHV5) como o provável agente etiológico dessa doença, embora a associação com ambientes antropogenicamente alterados parecem contribuir para o desenvolvimento da doença. Nesse estudo, biópsias de tumores e secreções de tartarugas verdes capturadas no litoral do Estado de São Paulo, Brasil, foram submetidas a análises histológicas e moleculares visando detectar e caracterizar ChHV5. Em 45,5 % dos casos, os achados histopatológicos revelaram células epiteliais balonizantes com corpúsculos de inclusão intranucleares. ChHV5 foram detectados nas biópsias de pele e oculares dos animais e em secreções oculares e saliva por PCR. A análise das sequências parciais do gene da polimerase do ChHV5 detectadas revelou duas sequências gênicas distintas entre si. A análise filogenética indicou que as amostras brasileiras são similares às amostras de ChHV5 do grupo filogeográfico do Atlântico, compartilhando o mesmo clado que amostras provenientes do Golfo da Guiné e de Porto Rico, sugerindo um possível fluxo dos vírus entre essas três regiões. / Fibropapillomatosis is a neoplastic disease characterized by the formation of multiple tumors affecting different species of sea turtles and, most often, Chelonia mydas. Recent studies indicate that Chelonid herpesvirus 5 (ChHV5) is the etiological agent of this disease, though its association with anthropogenically altered environments also appears to contribute to disease expression and tumor formation. In this study, tumor biopsy and secretions from green turtles captured off the coast of São Paulo State, Brazil, were used in histological and molecular analyses to detect and characterize ChHV5. In 45.5 % of cases, the tumor histopathological findings revealed ballooning degeneration with intranuclear inclusion bodies. ChHV5 was detected using polymerase chain reaction on the animals skin, ocular tumor biopsies, and ocular and oral secretions. The analysis of the detected ChHV5 sequences revealed two distinct genetic sequences together. Phylogenetic analysis indicated that Brazilian samples were similar to ChHV5 samples described for the Atlantic phylogeographic group and are therefore part of the same clade as the Gulf of Guinea and Puerto Rico samples. This similarity suggests a possible flow of the virus between these three regions.