Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-19Bitstream added on 2014-06-13T19:49:32Z : No. of bitstreams: 1 agostinho_dc_me_sjrp.pdf: 495600 bytes, checksum: dc2744471f2af5eee829ecb31eab7a6a (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Três espécies da seção Virescentia do gênero Batrachospermum foram anteriormente reconhecidas para o Brasil com base em caracteres morfológicos: B. helminthosum Bory, B. sirodotii Reis e B. vogesiacum Schultz. No entanto, em um estudo posterior da seção com base em análises morfométricas de populações da América do Norte, B. sirodotii e B. vogesiacum foram tratadas como sinônimos de B. helminthosum. O presente estudo teve como objetivo inferir as relações filogenéticas, bem como os limites de variação intra e interespecífico das espécies da seção Virescentia no Brasil com base na análise morfológica e molecular, utilizando caracteres diagnósticos atualmente aceitos e dois marcadores moleculares: gene plastidial que codifica a subunidade grande da RUBISCO (rbcL – 1.282 pares de base, pb) e região de “barcode” do gene mitocondrial que codifica a subunidade 1 da citocromo c oxidase (cox1 – 664 pb). Foram analisadas 13 amostras provenientes das regiões sul e sudeste do Brasil, além dos espécimes-tipo da seção, provenientes do Herbário PC (Paris, França). Os espécimes foram coletados em águas com baixa concentração de nutrientes e bem oxigenadas (condições oligotróficas e oligossapróbicas) sugerindo serem bioindicadores de rios/riachos de boa qualidade. Não foi possível distinguir as três espécies anteriormente reconhecidas para o Brasil com base em caracteres morfológicos. As dimensões dos carpogônios, carposporófitos e carposporângios dos espécimes brasileiros foram consideravelmente superiores às dos espécimes-tipo, indicando que o material brasileiro representa uma espécie distinta. As análises moleculares geraram os seguintes dados: rbcL - 11 sequências novas e 19 do GenBank (1 do Brasil, 13 dos E.U.A. e 5 do Japão); cox1 - 12 sequências novas e 7 do GenBank (E.U.A.). Análises... / Three species of Batrachospermum section Virescentia were previously recognized for Brazil based on morphological characters: B. helminthosum Bory, B. sirodotii Reis and B. vogesiacum Schultz. A further revisionary study of the section based on morphometric analysis for populations from North America treated B. sirodotii and B. vogesiacum as synonyms of B. helminthosum. The goals of this study were to infer the phylogenetic relationships, as well as the limits of intra and interspecific variation among the species of Virescentia section in Brazil, based on morphological and molecular analyses, using the diagnostic characters currently accepted and two molecular markers: the plastidial gene that encodes the RUBISCO large subunit (rbcL) and the “barcode” region of the mitochondrial gene cox1 that encodes the cytochrome c oxidase sub-unity 1). We analyzed 13 samples from the south and southeast regions of Brazil and six dried archival samples (type specimens) from PC Herbarium (Paris, France). The specimens were collected in well oxygenated waters with low concentration of nutrients (oligotrophic and oligosaprobic conditions), suggesting to be bioindicators of good quality environments. It was not possible to distinguish the three species previously recognized in Brazil based on morphological characters. Carpogonium, carposporophyte and carposporangium dimensions among Brazilian specimens were considerably higher in comparison to type specimens, indicating that they probably represent distinct species. Molecular analysis yielded the following data: rbcL – 11 new sequences and 19 from GenBank (1 from Brazil, 13 from USA and 5 from Japan); cox1 – 12 new sequences and 7 from GenBank (USA). Analyses based on rbcL sequences (1,282 base pairs, bp) and cox1 (664 bp) were congruent and showed section Virescentia as a clear... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Odair Correa Bueno / Banca: Denise S. Scheepmaker / Banca: Ana Eugenia de Carvalho Campos / Banca: José Chaud Netto / Banca: Osmar Malaspina / Resumo: Interações insetos/micro-organismos são amplas e ocorrem das mais diversas maneiras, com as bactérias simbiontes de insetos desempenhando vários papéis, na maioria desconhecidos, na biologia do hospedeiro. O que se considerava apenas um único organismo eucariótico é na verdade um agregado de vários diferentes organismos, o que levou a uma mudança na maneira de se estudar esses organismos, culminando em uma abordagem mais holística. Dentro desse vasto mundo, relativamente pouco conhecido dos micro-organismos em associação com insetos, estão as bactérias do gênero Wolbachia (Classe Alphaproteobacteria, Ordem Rickettsiales), amplamente distribuídas nos artrópodes e transmitidas maternalmente, causadoras de diversas alterações reprodutivas no hospedeiro, sendo que sua ocorrência em populações naturais pode ser de grande interesse no controle biológico. A distribuição dessas bactérias em formigas é pouco explorada e existe carência de informações sobre a interação com formigas do gênero Solenopsis, que inclui espécies nativas da América do Sul. Este gênero possui espécies distribuídas de forma cosmopolita e no Brasil estão amplamente disseminadas, associadas preferencialmente a áreas de atividade humana. Este trabalho teve como objetivo analisar a diversidade genética da Wolbachia de amostras de ninhos de populações nativas de espécies do gênero Solenopsis, através do sequenciamento de cinco genes que compõe o multilocus de Wolbachia, além do gene wsp, a fim de caracterizar as cepas e estabelecer inferências filogenéticas entre elas. Além disso, testar as hipóteses de coevolução entre as cepas e as formigas e de recombinação entre as cepas encontradas. Com o sequenciamento e análises dos cinco genes que compõem o multilocus de Wolbachia (gatB, coxA, hcpA, ftsZ e fbpA), totalizando 2079 pb, destacam-se os seguintes resultados: i. o registro de 15 novas cepas; ii. o registro de 11 alelos... / Abstract: Insects/microorganisms interactions are broad and occurs in many different ways with symbiont bacteria of insects playing many roles, most unknown, on the biology if its host. What was considered a single eukaryotic organism is actually an aggregate of many different organisms which lead to a change in the way we study organisms, leading to a more holistic approach. Within this vast but relatively unknown world of microorganisms in association with insects are the bacteria of the genus Wolbachia (Class Alphaproteobacteria, Order Rickettsiales) widely distributed in arthropods and maternally transmitted, causing several reproductive alterations in the host, and their occurrence in natural populations being of great interest in the biological control of insects. Its distribution in ants is poorly explored and little is known about the interaction with the Solenopsis genus which includes native species from South America. This genus includes species cosmopolitan distributed and in Brazil they are widely distributed being preferentially associated with areas of human activity. This study aimed to analyze the genetic diversity of samples of nests from native populations of Solenopsis species infected by Wolbachia by sequencing the five genes comprising the Wolbachia multilocus, and also the wsp gene in order to characterize the strains and establish phylogenetic inferences between them. Furthermore test the hypothesis of coevolution between ants and its Wolbachia strains and recombination between found strains. With the sequencing and analysis of five genes comprising the Wolbachia multilocus (gatB, coxA, hcpA, ftsZ e fbpA) totaling 2079 bp the following results are highlighted: i. the record of 15 previously unknown new strains, ii. the record of 11 previously unknown new alleles, iii. phylogenetic relationship between the strains found here presents a polyphyletic pattern, indicative of the complexity of the evolutionary history of strains ... / Doutor

Orientadora: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos / Banca: Maria José Valarini / Banca: Jaime Maia dos Santos / Resumo: A crescente demanda de alimentos causada pelo aumento populacional, aliado a alto custo de fertilizantes industrializados e impacto ambiental causado por eles leva, mundialmente, à utilização em grande escala de inoculantes de bactérias fixadoras de nitrogênio. Os inoculantes utilizados no Brasil (coleção SEMIA- IPAGRO) ainda não estão suficientemente caracterizados geneticamente. O objetivo deste trabalho foi avaliar e confrontar as seqüências parciais dos genes 16S rDNA e nifH de 26 estirpes padrões já classificadas, com 70 estirpes de rizóbios recomendadas e autorizadas para a produção de inoculantes no Brasil. Para esta finalidade, a partir das amostras de DNA extraídos destas bactérias foram realizadas reações de PCR com oligonucleotídeos iniciadores relativos à região codificadora do gene 16S rDNA e do nifH, sendo então seqüenciadas com o objetivo de detectar diferenças nucleotídicas entre as diferentes bactérias estudadas. Para a comparação dos resultados do seqüenciamento com a consulta de similaridade de nucleotídeos no BLASTn, foram geradas árvores filogenéticas através de ferramentas de bioinformática. Foi observado que a classificação taxonômica das estirpes SEMIA recomendadas para inoculação de leguminosas previamente disponível na FEPAGRO, com base em propriedades morfológicas e especificidade hospedeira, não foi confirmada em todas as estirpes pelos sequenciamentos parciais dos genes estudados. Sugerimos revisão da classificação destas estirpes. Concluímos também que a consulta de similaridade ao BLASTn pelo seqüenciamento parcial dos genes 16S rDNA e nifH é, na maioria dos casos, consistente com a classificação proposta pela construção de árvores filogenéticas destas sequências. Estas ferramentas apresentaram-se muito confiáveis para obtenção de classificação em nível de gênero das estirpes estudadas. / Abstract: The growing demand for food caused by population growth, combined with high cost of fertilizers and industrial environmental impacts caused by them leading, worldwide, the large scale use of inoculants different nitrogen-fixing bacteria. The inoculants used in Brazil (SEMIA-IPAGRO collection) are not yet sufficiently characterized genetically. The purpose of this study was to evaluate and compare the sequences of partial 16S rDNA and nifH of 26 strains already classified, with 70 strains of rhizobia recommended and authorized for the production of inoculants in Brazil. For this purpose, from DNA samples taken from these bacteria were performed with PCR reactions with primers on the coding region of the gene 16S rDNA and nifH, and sequencing with the aim of detecting nucleotide differences between different bacteria studied. To compare the results of the consultation of similarity of sequences of nucleotides in BLASTn, phylogenetic trees were generated through bioinformatics tools. It was observed that the taxonomic classification of strains SEMIA recommended for inoculation of legumes previously available in FEPAGRO, based on morphological properties and host specificity, it wasn't confirmed in all strains by partial sequencing of the genes studied. We suggest reviewing the classification of these strains. We concluded that the similarity of the consultation BLASTn by partial sequencing of 16S rDNA and nifH is, in most cases, consistent with the classification proposed by the construction of phylogenetic trees of these sequences. These tools were very reliable for obtaining classified in the genus level of strains studied. / Mestre

Resumo: Estudos morfológicos e moleculares direcionados a indivíduos da família Loricariidae, popularmente conhecidos com cascudos, têm revelado incertezas nos padrões de relacionamentos de algumas de suas subfamílias. Baseado nestes questionamentos foi realizado uma análise filogenética incluindo representantes de todos os gêneros da subfamília Neoplecostominae. Tal análise, baseada em Máxima Parcimônia, Análise Bayesiana e Análise de Distancia Genética (Neighbor-joining) foi executada em uma matriz de 4676 caracteres com sequências parciais dos genes COI, CytB, 16S rRNA, 12S rRNA e F-4 Reticulon. Nesta matriz 1155 caracteres apresentaram-se informativos nas análises de parcimônia. Como grupos externos foram utilizadas as espécies Hemipsilichthys gobio e Hemipsilichthys papilatus, subfamília Delturinae, amostras de Hypostomus nigromaculatus (subfamília Hypostominae), Hypoptopoma inexpectatum (subfamília Hypoptopomatinae) e Corumbataia cuestae (subfamília Otothyrinae). Segundo proposta recente de relações na família Loricariidae o gênero Pseudotocinclus foi incluído nas análises. Os resultados mostraram que a subfamília Neoplecostominae é monofilética, com sua atual composição, incluindo Pseudotocinclus. Três subgrupos foram reconhecidos no grupo interno. O primeiro é formado pelas espécies Pareiorhina carrancas, uma nova espécie de Pareiorhina (Pareiorhina sp. 1), um novo gênero de Neoplecostominae e as espécies do gênero Neoplecostomus exceto Neoplecostomus ribeirensis. O segundo pelos gêneros ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Morphological and molecular studies of samples of the family Loricariidae revealed that the relationship between it members are not well resolved. Based on this fact, in the present work we realized an analysis including samples of all genera of the subfamily Neoplecostominae. The analysis based in Maxima Parsimonious, Bayesian Analysis and Genetic Distance (Neighbor-joining) in a matrix of 4676 characters with partial sequences of the genes COI, CytB, 16S rRNA, 12S rRNA and F-4 Reticulon. In this matrix 1155 characters was parsimonious informative. We used as outgroups samples of the species Hemipsilichthys gobio and Hemipsilichthys papilatus (subfamily Delturinae), Hypostomus nigromaculatus (subfamily Hypostominae), Hypoptopoma inexpectatum (subfamily Hypoptopomatinae), and Corumbataia cuestae (subfamily Otothyrinae). Following recent results about the relationship of the family Loricariidae the genus Pseudotocinclus was included in the present analysis. The results showed that the subfamily Neoplecostominae is monophyletic, including Pseudotocinclus. Three subgroups were recognized. The first one is composed by the species Pareiorhina carrancas, Pareiorhina sp. 1 (new species), a new genus of Neoplecostominae and all species of Neoplecostomus genus except Neoplecostomus ribeirensis. The second group is composed by Kronichthys, Isbrueckerichthys and Pareiorhaphis genera and the species Neoplecostomus ribeirensis. Kronichthys formed sister group with Pareiorhaphis and these two formed sister group with Isbrueckerichthys plus Neoplecostomus ribeirensis. The third group is the most basal found in the subfamily Neoplecostominae, composed by the species Pareiorhina rudolphi, Pareiorhina sp. 2, Pseudotocinclus juquiae and Pseudotocinclus tietensis. Thus, the genera Pareiorhina and Neoplecostomus do not appeared monophyletic, and we found ... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Claudio de Oliveira / Coorientador: Claudio Henrique Zawadzki / Banca: Ricardo Cardoso Benine / Banca: Francisco Langeani Neto / Mestre

Orientador: Eliana Morielle Versute / Banca: Eliane Cristina Vicente / Banca: Wagner André Pedro / Resumo: O presente trabalho analisou a viabilidade da extração de DNA de tecidos fixados em formalina e sua aplicabilidade em experimentos de PCR e sequenciamento. Um total de 123 amostras de tecidos de 54 espécimes depositados em coleção científica (DZBSJRP) foram utilizados para a extração de DNA. Os tecidos passaram por pré-tratamentos antes da extração de DNA em diferentes temperaturas e pHs, na tentativa de minimizar os efeitos da fixação sobre os ácidos nucléicos. Os resultados demonstraram que o tratamento em soluções neutras à 37oC, por no mínimo quatro dias melhora a qualidade do DNA extraído e seu desempenho nas reações de amplificação e de sequenciamento. As seqüências geradas foram utilizadas em uma análise filogenética de parcimônia das espécies brasileiras de grandes Artibeus. Os alinhamentos das seqüências e as árvores produzidas apresentaram altos valores de "bootstrap" para a maioria dos clados, evidenciando que as seqüências obtidas de tecidos fixados também podem gerar dados confiáveis e que podem contribuir para o esclarecimento de aspectos evolutivos de muitos grupos animais que encontram-se bem representados em coleções científicas. / Abstract: The present work analyzed the viability of the extraction of DNA of formalin fixed tissues and the applicability in PCR and sequencing experiments. A totality of 123 samples of tissues representing 54 specimens deposited in scientific collection (DZBSJRP) were used for the extraction of DNA. The tissues were exposed to different treatments before extraction of DNA involving different temperatures and pHs, in the attempt of minimizing the effects of the fixation on the nucleic acids. The results demonstrated that the treatment in neutral solutions at 37oC during at least four days improve the quality of extracted DNA and the conditions of amplification reactions and sequencing. The sequences obtained after amplifications were used in a phylogenetic analysis of parsimony involving Brazilian species of great Artibeus. The alignments of the sequences and the trees produced evidenced that the sequences of amplified of formalin-fixed tissue can also generate reliable data and than contribute to the explanation of evolutionary aspects of many animal groups that are archived in scientific collections. / Mestre

Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Osvaldo Oiakawa / Banca: Anderson Luiz Alves / Resumo: A família Loricariidae, uma das mais especiosas famílias de peixes do mundo, com cerca de 700 espécies, tem sido objeto de vários estudos taxonômicos e sistemáticos, o que tem auxiliado na compreensão da diversidade e dos padrões gerais de relacionamento entre seus gêneros e espécies. Todavia, dada a ampla diversidade do grupo, muitos dos problemas da família ainda estão por serem resolvidos. Dentro de Loricariidae, a subfamília Loricariinae tem sido reconhecida como um grupo monofilético, porém o conhecimento da relação entre seus gêneros é ainda incipiente. Atualmente essa subfamília compreende cerca de 210 espécies distribuídas em 31 gêneros encontrados na América Central e do Sul. O presente trabalho teve como objetivo principal procurar ampliar o conhecimento sobre a diversidade e os padrões de relacionamento dos gêneros da subfamília Loricariinae e em especial estudar as relações entre espécies do gênero Harttia. Para isso foram analisadas quatro matrizes de dados, construídas a partir de seqüências parciais do gene nuclear F-Reticulon 4 e dos genes mitocondriais COI, 16S e 12S mais o RNA transportador da Valina que existe entre eles. Cada matriz foi construída com um conjunto de genes e de amostras particulares, para testar diferentes hipóteses. Graficamente, pela análise de transversão e transição, observou-se que os conjuntos de dados não se encontram saturados, possibilitando seu emprego para análise filogenética. Amostras das subfamílias Hypoptopomatinae, Neoplecostominae, Delturinae e Hypostominae foram utilizadas como grupo externo nas diferentes análises. As hipóteses de relacionamento filogenético obtidas por Máxima Parcimônia e Máxima Verossimilhança apresentaram topologias idênticas em todas as análises, tendo sido testadas estatisticamente pela técnica de bootstrap. Os resultados corroboram as hipóteses de relacionamento... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Not available / Doutor

Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Francisco Langeani Neto / Banca: Anderson Luis Alves / Banca: Osvaldo Takeshi Oyakawa / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Resumo: A subfamília Hypoptopomatinae, considerada monofilética desde a sua descrição, incluí cerca de 100 espécies distribuídas em 17 gêneros que se dividem atualmente em duas tribos, Hypoptopomatini e Otothyrini. A tribo Hypoptopomatini é composta pelos gêneros Acestridium, Hypoptopoma, Oxyropsis, Niobichthys, Nannoptopoma e Otocinclus e a tribo Otothyrini por Corumbataia, Eurycheilichthys, Epactionotus, Hisonotus, Microlepidogaster, Otothyris, Otothyropsis, Parotocinclus, Pseudotocinclus, Pseudotothyris e Schizolecis. Os Hypoptopomatinae apresentam tamanho pequeno a moderado e geralmente compartilham uma fisionomia adulta distinta para Loricariidae. Diferentes estudos realizados nos últimos anos apontam a necessidade de novas reconstruções filogenéticas para a subfamília, devido a evidências levantadas por diferentes metodologias de análises que não corroboram o monofiletismo para o grupo em questão. Baseado nesses questionamentos, o presente trabalho objetivou realizar uma análise filogenética baseada em caracteres moleculares englobando o maior número de gêneros da subfamília Hypoptopomatinae, e de seus gêneros diretamente relacionados, a fim de se testar o monofiletismo para o grupo. Nossos resultados, baseados em sequências parciais do gene nuclear F-Reticulon4 e dos genes mitocondriais Citocromo oxidase I e 16S rRNA, não corroboram a hipótese de que Hypoptopomatinae é um grupo monofilético, quando os dados foram analisados por Máxima Parcimônia e Análise Bayesiana, devido a inclusão dos representantes de Neoplecostominae entre as duas tribos Otothyrini e Hypoptopomatini. Analisando as topologias obtidas para as tribos de Hypoptopomatinae, evidenciamos o monofiletismo para Hypoptopomatini, tendo Otocinclus como gênero basal para o grupo. 0 mesmo não pôde ser encontrado para Otothyrini devido à exclusão do gênero Pseudotocinclus que aparece mais relacionado à Neoplecostominae em todas as análises realizadas. / Abstract: not available / Doutor

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:11:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000431680-Texto+Completo-0.pdf: 16463641 bytes, checksum: 5d308424aa6204847b79a46e56df2868 (MD5) Previous issue date: 2011 / The Belonidae includes 48 species of fishes that share an elongated body, dorsal and anal fins displaced posteriorly, pelvic fin with six rays, and thin, elongate jaws with large conical teeth. Despite the great morphological homogeneity, molecular techniques have suggested that Belonidae is not monophyletic. In order to test the monophyly of Belonidae, this study was designed to perform a comprehensive, total evidence phylogenetic analysis of the family. To accomplish that, we performed a maximum parsimony analysis, without differential character weighting, based on a matrix of 257 morphological characters and 4808 base pairs from seven DNA fragments (nuclear - RAG2, CK and TMO-4C4 and mitochondrial - 12S, 16S, ATPase 6 and 8, citb) encoded for 104 terminal taxa. The ingroup included all valid species of living and fossil Belonidae and representative populations of some species that are widely distributed. The outgroup was selected to include almost all genera of Beloniformes and three representatives of the Cyprinodontiformes. The analysis resulted in nine most parsimonious trees with 8465 steps (CI = 0. 35, RI = 0. 67).Our results corroborate the monophyly of the order Beloniformes, the superfamily Scomberesocoidea, and the families Exocoetidae, Scomberesocidae, and Zenarchopteridae, and refute the monophyly of the superfamily Exocoetoidea and the families Belonidae and Hemiramphidae. For this reason we propose a new composition for the family Belonidae, with the inclusion of the genera presently in Scomberesocidae. This new classification restores the monophyly of the Belonidae, which is strongly supported by 20 molecular and 19 morphological synapomorphies. The newly arranged family Belonidae consists of 14 genera distributed in four subfamilies: Beloninae, Platybeloninae, Potamorrhaphinae, and Strongylurinae. All belonid genera are monophyletic, with the exception of Strongylura, which needs to have its species allocated in four genera to be restored monophyletic: Strongylura, Dorybelone, and two new genera. Phylogenetic diagnoses are presented for all subfamilies and genera, and hypotheses for the evolution of major morphological characters are discussed. / Belonidae é composta por 48 espécies de peixes que compartilham o corpo alongado, as nadadeiras dorsal e anal posicionadas posteriormente, nadadeiras pélvicas com seis raios e as maxilas finas e compridas, com dentes grandes e cônicos. Apesar da grande homogeneidade morfológica, técnicas moleculares sugeriram que Belonidae não é monofilética. Com o objetivo de testar a monofilia de Belonidae este estudo foi concebido para realizar uma abrangente análise filogenética de evidência total. Para isto, foi realizada uma análise de máxima parcimônia sem pesagem diferencial dos caracteres, baseada numa matriz com 257 caracteres morfológicos e 4808 pares de bases de sete fragmentos de DNA (nuclear- RAG2, CK e TMO 4C4 e mitocondrial- 12S, 16S, ATPase 6 e 8, Citb) codificados a partir de 104 táxons terminais. O grupo interno foi composto por todas as espécies recentes e fósseis válidas de Belonidae e as populações mais representativas de algumas espécies que apresentam ampla distribuição. Para grupo externo foram selecionadas espécies de quase todos os gêneros válidos de Beloniformes e três representantes da ordem Cyprinodontiformes. A análise encontrou nove árvores igualmente mais parcimoniosas com 8465 passos (IC= 0,35; IR= 0,67). Nossos resultados corroboram a monofilia da superfamília Belonoidea e das famílias Exocoetidae, Scomberesocidae e Zenarchopteridae, e refutam a monofilia da superfamília Exocoetoidea e das famílias Belonidae e Hemiramphidae. Por este motivo, é aqui proposta uma nova composição para a família Belonidae, com a anexação dos gêneros atualmente em Scomberesocidae. Esta nova classificação restaura a monofilia de Belonidae, que é fortemente suportada por 20 sinapomorfias morfológicas e 19 moleculares. Em seu novo arranjo, a família Belonidae está composta por 14 gêneros distribuídos em quatro subfamílias: Beloninae, Platybeloninae, Potamorrhaphinae e Strongylurinae. Todos os gêneros de Belonidae são monofiléticos, a exceção de Strongylura, que para tornar-se monofético deve ter suas espécies alocadas em quatro gêneros: Strongylura, Dorybelone e dois gêneros novos. São apresentadas diagnoses filogenéticas para todas as subfamílias e gêneros, além de discutidas hipóteses de evolução dos principais caracteres morfológicos.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000422339-Texto+Completo-0.pdf: 8258255 bytes, checksum: 39b3a077af73929c6c9e936558f81673 (MD5) Previous issue date: 2009 / The Echinantherini tribe has recently been proposed to allocate the South American Echinanthera and Taeniophallus genera, which are represented by six and eight species, respectively. The need for a systematic study in order to assess the phylogenetic relationship and the taxonomy was stressed by the existence of a probable complex of species under the name T. occipitalis, the disagreement among researchers as for the taxonomic positioning of the species belonging to the early “brevirostris” group, the possible polyphiletism of Taeniophallus, and the hypothetical monophyletic relationship between the genera of the tribe. In the present study the aim was characterize the T. occipitalis group and propose a phylogenetic relationship for the Echinantherini species drawing on phenotypic characters. After the analysis of the external morphological characters (scaling, coloring and scale ultrastructure) and internal (hemypenis) of several specimens of T. occipitalis, including specimens type, we have identified the presence of further taxons under this name. As a result of the present study, five species are currently acknowledged for the T. occipitalis group: Taeniophallus sp. nov. 1, Taeniophallus sp. nov. 2, T. miolepis (revalidated), T. occipitalis and T. quadriocellatus. A significant sexual dimorphism was found (P < 0. 05) in the number of ventrals (VE), subcaudal (SC), snout-vent length (SVL) and the relative tail length (TL/SVL) in the species of the group. Significant differences among the five species were found in the number of VE, SC, SVL and TL/SVL. In a multivariate analysis using 16 body measures, including the cephalic shields, we have found that the species of the T. occipitalis group are partially discriminated. However, when comparing the gross data of the species, the majority of these differences are not perceptible. In the present paper, a phylogenetic study of the Echinantherini tribe is presented based on phenotypic characters. The anatomical and biological studies resulted in a data matrix of 57 characters scored for 34 terminal taxa: 19 of Echinantehrini tribe, 14 the others tribes of the Xenondontinae (Alsophiini, Hydrodynastini, Hydropsini, Philodryadini, Pseudoboini, and Xenodontini) and one species of Dipsadinae subfamily. Parsimony analysis resulted in two equally parsimony trees with 231 steps, consistency index of 37 and retention index of 62. The only terminals that presented conflict between the two topologies found were species of the Echinanthera genus. The topology of the strict consensus tree of the most parsimonic trees was: (T. nebularis ((T. brevirostris, T. nicagus) ((E. amoena, E. cephalomaculata, E. cephalostriata, E. cyanoleura, E. melanostigma e E. undulata) ((T. bilineatus (T. affinis (T. persimilis, T. poecilopogon))) (T. miolepis (Taeniophallus sp. nov. 1 “imaculado”, T. quadriocellatus (Taeniophallus sp. nov. 1 “maculado” (Taeniophallus sp. nov. 2, T. occipitalis)))))))). We have proposed a classification for Echinatherini consistent with the phylogenetic hypothesis obtained in this study. The following changes were made for the new taxonomic proposal: (1) Taeniophallus is redefined as circumscribed to T. brevirostris and T. nicagus; (2) a new genus is proposed for T. nebularis; (3) a new genus is proposed for the species of the T. affinis group; and (4) a new genus is proposed for the species of the T. occipitalis group. The genus Echinanthera is maintained according to the current taxonomy. / A tribo Echinantherini foi recentemente proposta para alocar os gêneros Sul-americanos Echinanthera e Taeniophallus, os quais estão representados por seis e oito espécies, respectivamente. A necessidade de um estudo sistemático a fim de avaliar o status taxonômico desses gêneros foi acentuda com a existência de um provável complexo de espécies sob o nome T. occipitalis, as discordâncias entre pesquisadores quanto à posição taxonômica das espécies do antigo grupo “brevirostris”, o possível polifiletismo de Taeniophallus e o hipotético relacionamento monofilético dos gêneros da tribo. No presente estudo objetivou-se caracterizar o grupo de T. occipitalis e propor um relacionamento filogenético para as espécies de Echinantherini baseado em caracteres fenotípicos. Após a análise de caracteres da morfologia externa (escamação, coloração e ultra-estrutura das escamas) e interna (hemipênis) de vários espécimes de T. occipitalis, incluindo espécimes tipo, identificamos a presença de outros táxons sob esse nome. Como resultados do presente estudo cinco espécies são atualmente reconhecidas para o grupo de T. occipitalis: Taeniophallus sp. nov. 1, Taeniophallus sp. nov. 2, T. miolepis (revalidada), T. occipitalis e T. quadriocellatus. Foi observado dimorfismo sexual significante (P < 0,05) no número de ventral (VE), subcaudal (SC), comprimento rostrocloacal (CRC) e comprimento relativo da cauda (CCA/CRC) nas espécies do grupo. Diferenças significativas entre as cinco espécies foram observadas no número de VE, SC, CRC e CCA/CRC. Em uma análise multivariada utilizando 16 medidas corpóreas, inclusive de escudos cefálicos, constatamos que as espécies do grupo de T. occipitalis são parcialmente discriminadas. No entanto, quando comparamos os dados brutos das espécies, a maioria dessas diferenças não é perceptível. No estudo filogenético uma análise de máxima parcimônia foi realizada utilizando 57 caracteres fenotípicos e 33 táxons terminais: 19 pertencentes à tribo Echinantherini, 14 de outras tribos de Xenodontinae (Alsophiini, Hydrodynastini, Hydropsini, Philodryadini, Pseudoboini e Xenodontini) e uma espécie de Dipsadinae. Como resultado obteve-se duas árvores igualmente parcimoniosas com 231 passos, índice de consistência de 37 e índice de retenção de 62. Os únicos terminais que apresentaram conflitos entre as duas topologias encontradas foram as espécies do gênero Echinanthera. A topologia da árvore de consenso estrito das duas árvores mais parcimoniosas foi: (T. nebularis ((T. brevirostris, T. nicagus) ((E. amoena, E. cephalomaculata, E. cephalostriata, E. cyanoleura, E. melanostigma e E. undulata) ((T. bilineatus (T. affinis (T. persimilis, T. poecilopogon))) (T. miolepis (Taeniophallus sp. nov. 1 “imaculado”, T. quadriocellatus (Taeniophallus sp. nov. 1 “maculado” (Taeniophallus sp. nov. 2, T. occipitalis)))))))). Baseados na topologia encontrada mudanças taxonômicas para os membros de Echinantherini foram propostas. Foram realizadas as seguintes mudanças: (1) Taeniophallus é redefinido sendo restito para T. brevirostris e T. nicagus; (2) um novo gênero é proposto para T. nebularis; (3) um novo gênero é proposto para as espécies do grupo de T. affinis; e (4) um novo gênero é proposto para as espécies do grupo de T. occipitalis. O gênero Echinanthera é mantido conforme a atual taxonomia.

Os heteropteros são o maior grupo de insetos hemimetábolos. Pentatomidae é composta por cerca de 4.700 espécies com hábito predominantemente fitosuccívoro. Estudos filogenéticos nesta família são escassos, sendo os agrupamentos taxonômicos baseados principalmente em similaridades morfológicas. Euschistus Dallas é um dos mais especiosos gêneros de Pentatomidae e tem distribuição no novo mundo. Algumas espécies do gênero podem causar danos a plantas cultivadas, sendo consideradas espécies pragas. Nesta tese, são descritas três espécies dentro de Carpocorini: Euschistus. (Euschistus) baranowskii sp. nov., Euschistus (Mitripus) saramagoi sp. nov., e Ladeaschistus borgesi sp. nov. Também são abordadas as relações entre quatro os subgêneros de Euschistus (Euschistus, Euschistomorphus, Lycipta, Mitripus) e gêneros relacionados em uma análise filogenética de evidência total utilizando quatro marcadores meleculares e 85 caracteres morfológicos. Euschistus é recuperado como não monofilético, sendo os subgêneros Euschistomorphus e Mitripus indicados como taxa fora de Euschistus. O relacionamento entre Ladeaschistus, Sibaria e Euschistus (Mitripus) é corroborado. Com base nos resultados, Mitripus new rank é elevado a gênero, e Adustonotus gen. n. é proposto. Uma análise filogenética utilizando seis marcadores moleculares é realizada para testar a hipótese de monofilia do grupo-Euschistus proposto inicialmente por L. Rolston. Este agrupamento de gêneros não foi recuperado na nossa análise, no entanto, relações genéricas destes carpocorineos, que até então eram baseadas em similaridades taxonômicas, agora possuem uma hipótese filogenética testada. Analisamos a evolução de caractéres de genitália interna de fêmea. As estruturas da espermateca apresentam grande variação dentro da nossa amostra. A reconstrução de estado ancestral detectou muitas mudanças de estado para maior parte dos caracteres.