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Síntese e atividade antimicobacteriana de ésteres do ácido pirazinóico e quinolonas / Synthesis and antimycobacterial activity of pyrazinoic acid esters and quinolonesFernandes, João Paulo dos Santos 12 September 2006 (has links)
A tuberculose afeta mais de um bilhão de pessoas em todo o mundo. Desde a descoberta da rifampicina, em 1965, nenhum outro fármaco importante foi introduzido na terapêutica. A pirazinamida, um dos fármacos disponíveis na terapia da tuberculose, é atualmente considerada um bioprecursor do ácido pirazinóico, porque bactérias resistentes não expressam uma enzima, pirazinamidase, responsável pela conversão da pirazinamida no derivado ácido. Ésteres do ácido pirazinóico apresentam atividade antimicobacteriana, provavelmente por melhor penetração pela parede celular das micobactérias que o derivado ácido. Desta forma, podem ainda atuar em cepas resistentes por serem ativados por esterases. Algumas fluorquinolonas apresentam atividade antimicobacteriana, como o ciprofloxacino, ofloxacino e levofloxacino. O trabalho teve por objetivo obter formas latentes de ácido pirazinóico unindo-o a quinolonas com atividade antimicobacteriana, através de ligação éster, obtendo-se pró-fármacos recíprocos. Um dos compostos sintetizados apresentou atividade in vitro, com concentração inibitória mínima comparável ao ciprofloxacino, um dos fármacos mais ativos. / Tuberculosis affects over than one billion people around the world. Since the discovery of rifampin, in 1965, no one another important drug was introduced in therapeutics. Pyrazinamide, one of the drugs available in therapy of tuberculosis, is nowadays considered a bioprecursor of pyrazinoic acid, because resistant bacterias do not express an enzyme, pyrazinamidase, responsible by the conversion of pyrazinamide to pyrazinoic acid. Pyrazinoic acid esters exhibit antimycobacterial activity probably to better penetration through mycobacterial cell wall than the acid derivative. So, it could act in resistant strains because is activated by esterases. Some fluoroquinolones exhibit antimicobacterial activity, like ciprofloxacin, ofloxacin and levofloxacin. This work had as objective to obtain latent forms of pyrazinoic acid linking it to quinolones with antimycobacterial activity, through an ester bond, obtaining mutual prodrugs. One of the synthesized compounds showed activity in vitro, with minnimal inhibitory concentration comparable to ciprofloxacin, one of most active drugs.
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Investigação dos mecanismos de resistência às fluorquinolonas em isolados bacterianos ambientais / Investigation of resistance mechanisms to fluorquinolones in environmental bacterial isolatesSanchez, Danilo Garcia 03 August 2018 (has links)
As fluorquinolonas são antimicrobianos frequentemente prescritos no Brasil e em outros países e utilizados no tratamento de diversos tipos de infecções, principalmente naquelas do trato urinário e gastrintestinal. A ação desses compostos ocorre devido a interação dos mesmos com a DNA-girase e a topoisomerase IV bacterianas. A DNA girase é codificada pelos genes gyrA e gyrB e a topoisomerase IV, pelos genes parE e parC. Estudos evidenciaram existir nesses genes regiões nas quais as mutações ocorrem de modo mais frequente, sendo esses sítios chamados de Quinolone Resistance Determining Regions (QRDR). Mutações nas QRDR levam a substituição de aminoácidos nas topoisomerases, diminuindo a afinidade destas enzimas pelas quinolonas, acarretando, portanto, em um fenótipo de resistência para essa classe de antimicrobianos. Este mecanismo de resistência mostrou-se um dos principais responsáveis pela resistência antimicrobiana para essa classe de antimicrobiano em isolados clínicos. Entretanto, outros mecanismos de resistência podem estar presentes, entre eles a aquisição de determinantes plasmidiais (qnrA, qnrB, qnrS, qepA, oqxA e oqxB). A maioria dos estudos foi realizada utilizando isolados bacterianos clínicos, contudo, pouco tem sido investigado sobre os mecanismos de resistência com bactérias de origem ambiental. Diante disso, o presente trabalho objetivou identificar os principais mecanismos de resistência às quinolonas em isolados bacterianos ambientais e os principais gêneros dessa microbiota que os albergam. Para tanto, 69 isolados bacterianos ambientais foram selecionados. Os principais gêneros bacterianos selecionados foram Stenotrophomonas, Achromobacter, Ochrobactrum e Escherichia para os quais foram pesquisados além dos genes Plasmid Mediated Quinolone Resistance (PMQR), mutações nos genes gyrA, gyrB, parE e parC e a tipagem plasmidial. No conjunto os resultados permitem evidenciar um padrão de mutações nos genes codificadores das topoisomerases semelhante ao observado em isolados bacterianos clínicos, atuando os genes PMQR de modo sinérgico na contribuição da elevação da concentração inibitória mínima (CIM) frente às fluorquinolonas. No entando, mecanismos adicionais que possam contribuir com os níveis de resistência não podem ser descartados, sobretudo sistemas de efluxo. A tipagem plasmidial evidenciou que a maioria dos isolados apresenta plasmídeos da família ColE-like. / Fluoroquinolones are antimicrobials frequently prescribed in Brazil and in other countries and used in the treatment of various types of infections, especially those of the urinary tract and gastrointestinal tract. The action of these compounds occurs due to their interaction with bacterial DNA-gyrase and topoisomerase IV. The DNA gyrase is encoded by the gyrA and gyrB genes and the topoisomerase IV, by the parE and parC genes. Studies have shown that there are regions in which the mutations occur more frequently, these sites being called QRDR (Quinolone Resistance Determining Regions). Mutations in QRDR lead to amino acid substitution in topoisomerases, reducing the affinity of these enzymes for the quinolones, thus leading to a resistance phenotype for this class of antimicrobials. This mechanism of resistance was shown to be one of the main factors responsible for antimicrobial resistance for this class of chemotherapy in clinical isolates. However, other mechanisms of resistance may be present, among them the acquisition of plasmid determinants (qnrA, qnrB, qnrS, qepA, oqxA and oqxB). Most studies were carried out using clinical bacterial isolates, however, little research has been done on the mechanisms. The present work aimed to identify the main mechanisms of resistance to quinolones in environmental bacterial isolates and the main genera of this microbiota that harbor them. For this purpose, 69 bacterial isolates were selected from environmental samples. The main bacterial genera selected were Stenotrophomonas, Achromobacter, Ochrobactrum and Escherichia for which the genes PMQR, gyrA, gyrB, parE and parC and the plasmid typing were investigated. The results pattern of mutations in the genes coding for topoisomerases are similar to that observed in clinical bacterial isolates, acting PMQR genes synergistically in the contribution of MIC elevation to fluoroquinolones. However, additional mechanisms that may contribute to resistance levels cannot be discarded, especially efflux systems. Plasmid typing evidenced that most of the isolates present plasmids from the ColE-like family
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Análise químico-farmacêutica de cloridrato de ciprofloxacino em solução oftálmicaCazedey, Edith Cristina Laignier [UNESP] 02 February 2009 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2009-02-02Bitstream added on 2014-06-13T20:33:02Z : No. of bitstreams: 1
cazedey_ecl_me_arafcf.pdf: 802368 bytes, checksum: 7af4d6526e6d1c491bb231f706185aea (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O cloridrato de ciprofloxacino, um antibacteriano quinolônico, apresenta amplo espectro de ação e é eficaz in vitro contra praticamente todos os patógenos Gram-negativos, incluindo Pseudomonas aeruginosa. Mostra-se também eficaz contra microrganismos Gram-positivos, como estafilococos e estreptococos. A importância de desenvolver e validar métodos analíticos para este fármaco é justificada por seu potencial terapêutico, grande emprego em terapias microbianas e baixo custo, assim como pelo conhecimento de que a baixa qualidade dos produtos anti-infecciosos está relacionada ao desenvolvimento de cepas resistentes, como consequência da administração de doses subterapêuticas. Por tal razão, é de enorme importância o desenvolvimento de métodos analíticos eficazes e confiáveis para o controle de qualidade dos medicamentos comercializados. Neste trabalho foram desenvolvidos métodos de análise para o cloridrato de ciprofloxacino em solução oftálmica. Os métodos desenvolvidos e validados foram: (i) doseamento microbiológico, método turbidimétrico na faixa de concentração de 14,0 a 56,0 μg/mL, utilizando Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 IAL 2150, com exatidão de 99,71% e teor de 102,27%; (ii) método espectrofotométrico na região do UV a 275 nm com faixa de concentração de 2,0 a 7,0 μg/mL, utilizando água como solvente, com exatidão de 101,51% e teor de 99,79%; (iii) método espectrofotométrico derivativo na região do visível a 386,4 nm, na primeira derivada, com faixa de concentração de 50,0 a 100,0 μg/mL, utilizando cloreto férrico 1,0% como reagente, com exatidão de 99,83% e teor de 106,72%; (iv) método por cromatografia líquida de alta eficiência com detector UV a 275 nm, com fase móvel composta por ácido acético 2,5% v/v, metanol e acetonitrila (70:15:15, v/v/v) e faixa de concentração de 1,0 a 6,0 μg/mL, exatidão... / Ciprofloxacin hydrochloride, a quinolone antibiotic, presents a wider spectrum of activity and is effective against practically all Gram-negative pathogens, including Pseudomonas aeruginosa. It is potent against Grampositive microorganisms, as Staphylococcus and Streptococcus. Analytical methods for quantitative determination of ciprofloxacin hydrochloride is important due to its therapeutic potential, wide use in antimicrobial therapy and low cost. Moreover, it is known that the poor quality antibiotic product is direct related development of resistant strains, as consequence of subtherapeutic doses administration. Thus, it is important to develop efficient analytical methods for quality control commercialized products. In this work, analytical methods for determination of ciprofloxacin hydrochloride were validated: (i) microbiological assay, turbidimetric method at concentration range 14.0 to 56.0 μg/mL, using Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 IAL 2150 as indicator microorganism, accuracy 99.71% and quantitation of 102.27; (ii) UV spectrophotometry at 275 nm with concentration range of 2.0 to 7.0 μg/mL, using water as solvent, with accuracy of 101.51% and quantitation of 99.79%; (iii) Derivative visible spectrophotometric method at 386.4 nm, in first derivate, with concentration range of 50.0 a 100.0 μg/mL, using 1.0% ferric chloride as reagent, with accuracy of 99.83% and quantitation of 106.72%; (iv) HPLC method with UV detector at 275 nm using 2.5 M acetic acid (v/v), methanol and acetonitrile (70: 15: 15, v/v/v) as mobile phase and concentration range of 1.0 to 6.0 μg/mL, accuracy of 100.11%, quantitation 103.25% and mean retention time of 2.6 minutes; (v) Indirect titrimetric method using bromate/bromide solution in acid medium as reagent in concentration range of 1.0 to 11.0 mg/mL, with accuracy of 100.28% and quantitation of 98.97%.
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Síntese e atividade antimicobacteriana de ésteres do ácido pirazinóico e quinolonas / Synthesis and antimycobacterial activity of pyrazinoic acid esters and quinolonesJoão Paulo dos Santos Fernandes 12 September 2006 (has links)
A tuberculose afeta mais de um bilhão de pessoas em todo o mundo. Desde a descoberta da rifampicina, em 1965, nenhum outro fármaco importante foi introduzido na terapêutica. A pirazinamida, um dos fármacos disponíveis na terapia da tuberculose, é atualmente considerada um bioprecursor do ácido pirazinóico, porque bactérias resistentes não expressam uma enzima, pirazinamidase, responsável pela conversão da pirazinamida no derivado ácido. Ésteres do ácido pirazinóico apresentam atividade antimicobacteriana, provavelmente por melhor penetração pela parede celular das micobactérias que o derivado ácido. Desta forma, podem ainda atuar em cepas resistentes por serem ativados por esterases. Algumas fluorquinolonas apresentam atividade antimicobacteriana, como o ciprofloxacino, ofloxacino e levofloxacino. O trabalho teve por objetivo obter formas latentes de ácido pirazinóico unindo-o a quinolonas com atividade antimicobacteriana, através de ligação éster, obtendo-se pró-fármacos recíprocos. Um dos compostos sintetizados apresentou atividade in vitro, com concentração inibitória mínima comparável ao ciprofloxacino, um dos fármacos mais ativos. / Tuberculosis affects over than one billion people around the world. Since the discovery of rifampin, in 1965, no one another important drug was introduced in therapeutics. Pyrazinamide, one of the drugs available in therapy of tuberculosis, is nowadays considered a bioprecursor of pyrazinoic acid, because resistant bacterias do not express an enzyme, pyrazinamidase, responsible by the conversion of pyrazinamide to pyrazinoic acid. Pyrazinoic acid esters exhibit antimycobacterial activity probably to better penetration through mycobacterial cell wall than the acid derivative. So, it could act in resistant strains because is activated by esterases. Some fluoroquinolones exhibit antimicobacterial activity, like ciprofloxacin, ofloxacin and levofloxacin. This work had as objective to obtain latent forms of pyrazinoic acid linking it to quinolones with antimycobacterial activity, through an ester bond, obtaining mutual prodrugs. One of the synthesized compounds showed activity in vitro, with minnimal inhibitory concentration comparable to ciprofloxacin, one of most active drugs.
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“Síntese e caracterização de complexos de paládio(II), platina(II), zinco(II) e cobre(II) com ligantes do grupo das fluorquinolonas”Vieira, Lígia Maria Mendonça 30 March 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-03-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As fluorquinolonas constituem uma importante classe de agentes antimicrobianos sintéticos utilizados clinicamente por mais de 30 anos. Além da atividade antibacteriana, algumas fluorquinolonas vêm sendo utilizadas no desenvolvimento de drogas anticâncer, tendo também apresentado boa atividade anti-HIV. Visando obter novos compostos de platina(II) e outros íons metálicos que apresentem atividade biológica, este trabalho promove a síntese de complexos utilizando ligantes do grupo das fluorquinolonas. As interações das fluorquinolonas com íons metálicos têm sido muito estudadas devido ao interesse em suas propriedades biológicas e químicas, além do estudo da atividade biológica destes complexos metálicos. Tais estudos têm sido direcionados principalmente para a identificação de grupos diretamente ligados ao metal e no estabelecimento da estrutura formada por estes compostos de coordenação.
Nesse contexto, o presente trabalho descreve a síntese de complexos de paládio(II), platina(II), zinco(II) e cobre(II) com ligantes do grupo das fluorquinolonas. Para a caracterização dos compostos foram utilizadas técnicas de análise como: espectroscopia na região do infravermelho, RMN de 1H, RMN de 13C, RMN de 195Pt, termogravimetria, espectrometria de massa, difração de raios X de monocristal, difração de raios X em estado sólido, condutimetria e análise elementar. / Fluoroquinolones are part of an important family of synthetic anti-microbial
agents being clinically used over the past thirty years.
In addition, some fluoroquinolones have been used in the development of anticancer drugs, and others have demonstrated anti-HIV activity.
Aiming to obtain novel platinum(II) and other metal ion complexes that exhibit biological activity, we have synthesized complexes using fluoroquinolones as ligands. The interactions between fluorquinolones and metal ions have been investigated due to the interest in their biological and chemical properties. Investigations have conducted to identify the groups directly bound to the metal and in the structure of
the coordination compounds formed.
In this context, this work describes the synthesis of palladium(II), platinum(II), zinc(II), and cupper(II) complexes with fluorquinolones. The compounds were characterized using IR spectroscopy, 1H NMR, 13C NMR, 195Pt NMR, mass spectroscopy, x-ray crystallography, conductimetric, thermogravimetric and elemental analysis.
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Caracterização de bactérias gram-negativas multirresistentes produtoras de β-lactamase-de-espectro-extendido (ESBL) em cavalos saudáveis e doentes. / Characterization of Multidrug-Resistant Gram-negative Bacteria producing Extended-Spectrum β-Lactamase (ESBL) in healthy and infected horses.Santos, Lucianne Leigue dos 30 August 2016 (has links)
O objetivo deste estudo foi caracterizar bactérias multirresistentes (MDR) isoladas de cavalos saudáveis (fezes) e doentes no Brasil e na França. De março de 2012 a dezembro de 2014, amostras clínicas coletadas de cavalos saudáveis e doentes no Brasil foram selecionadas para pesquisa da presença de bactérias MDR. A investigação sobre as amostras franceses foi restria a isolados de Escherichia coli (EC) recuperados a partir de amostras clínicas coletadas entre 2014 e 2015. Nos cavalos brasileiros, a análise de amostras de fezes de animais saudáveis revelou a presença de clones de EC não relacionados pertencentes aos filogrupos A, D ou B2 que carreavam genes como: blaCTX-M-1, blaCMY-2, qnr- e genes add-tipo (amino-transferases); enquanto que nos cavalos doentes foram encontradas EC, Proteus mirabilis, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa e Serratia marcescens carreando genes blaCTX-M-15, blaCTX-M-1, rmtD 16S rRNA metilase, qnr-tipo, aac(6´)-Ib-cr e aad-tipo. Nos cavalos doentes franceses de EC MDR foram positivas para CTX-M-1, seguido de M-2- e M-9. Estes resultados destacam a importância de cavalos como um novo reservatório de bactérias MDR. / The aim of this study was to characterize multidrug-resistant (MDR) bacteria isolated from healthy and infected horses in Brazil and France. From March 2012 to December 2014, clinical samples collected from healthy and infected horses, in Brazil, were screened for the presence of MDR bacteria. Investigation on French isolates was restricted to E. coli strains recovered from clinical samples collected between 2014 and 2015. In Brazilian horses, the analysis of fecal samples from healthy animals revealed the presence of clonally unrelated A, D or B2 phylogroups of E. coli strains carrying blaCTX-M-1, blaCMY-2, qnr- and aminoglycoside adenyl transferase (aad)-type genes, whereas in infected horses, E. coli, Proteus mirabilis, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and Serratia marcescens isolates carrying blaCTX-M-15, blaCTX-M-1, rmtD 16S rRNA methylase, qnr-type, aac(6´)-Ib-cr and aad-type genes. In French infected horses, most MDR E. coli isolates were positive for CTX-M-1-, followed by CTX-M-2- and CTX-M-9-type extended-spectrum beta-lactamases. These results highlight the importance of horses as a new reservoir of MDR bacteria.
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Caracterização de bactérias gram-negativas multirresistentes produtoras de β-lactamase-de-espectro-extendido (ESBL) em cavalos saudáveis e doentes. / Characterization of Multidrug-Resistant Gram-negative Bacteria producing Extended-Spectrum β-Lactamase (ESBL) in healthy and infected horses.Lucianne Leigue dos Santos 30 August 2016 (has links)
O objetivo deste estudo foi caracterizar bactérias multirresistentes (MDR) isoladas de cavalos saudáveis (fezes) e doentes no Brasil e na França. De março de 2012 a dezembro de 2014, amostras clínicas coletadas de cavalos saudáveis e doentes no Brasil foram selecionadas para pesquisa da presença de bactérias MDR. A investigação sobre as amostras franceses foi restria a isolados de Escherichia coli (EC) recuperados a partir de amostras clínicas coletadas entre 2014 e 2015. Nos cavalos brasileiros, a análise de amostras de fezes de animais saudáveis revelou a presença de clones de EC não relacionados pertencentes aos filogrupos A, D ou B2 que carreavam genes como: blaCTX-M-1, blaCMY-2, qnr- e genes add-tipo (amino-transferases); enquanto que nos cavalos doentes foram encontradas EC, Proteus mirabilis, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa e Serratia marcescens carreando genes blaCTX-M-15, blaCTX-M-1, rmtD 16S rRNA metilase, qnr-tipo, aac(6´)-Ib-cr e aad-tipo. Nos cavalos doentes franceses de EC MDR foram positivas para CTX-M-1, seguido de M-2- e M-9. Estes resultados destacam a importância de cavalos como um novo reservatório de bactérias MDR. / The aim of this study was to characterize multidrug-resistant (MDR) bacteria isolated from healthy and infected horses in Brazil and France. From March 2012 to December 2014, clinical samples collected from healthy and infected horses, in Brazil, were screened for the presence of MDR bacteria. Investigation on French isolates was restricted to E. coli strains recovered from clinical samples collected between 2014 and 2015. In Brazilian horses, the analysis of fecal samples from healthy animals revealed the presence of clonally unrelated A, D or B2 phylogroups of E. coli strains carrying blaCTX-M-1, blaCMY-2, qnr- and aminoglycoside adenyl transferase (aad)-type genes, whereas in infected horses, E. coli, Proteus mirabilis, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and Serratia marcescens isolates carrying blaCTX-M-15, blaCTX-M-1, rmtD 16S rRNA methylase, qnr-type, aac(6´)-Ib-cr and aad-type genes. In French infected horses, most MDR E. coli isolates were positive for CTX-M-1-, followed by CTX-M-2- and CTX-M-9-type extended-spectrum beta-lactamases. These results highlight the importance of horses as a new reservoir of MDR bacteria.
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Estudo epidemiológico molecular da resistência a carbapenêmicos e fluorquinolonas e sua associação com sistema de secreção tipo III em Pseudomonas aeruginosaFerreira, Melina Lorraine 29 August 2014 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Introduction: Has been observed the global spread of different variants of P. aeruginosa that is often associated with increased virulence or the emergence of new antimicrobial resistance genotypes. There are few studies describing the association of the Type III Secretion System (TTSS) with antibiotic resistance and outcome of patients with pneumonia and bacteremia. Objectives: Determine the relation among resistance to carbapenems and fluoroquinolones and the Type III Secretion System (TTSS) effector genotype and its association with the poor prognostic in patients with ventilator-associated pneumonia (VAP) and bacteremia, identify mutations in the Quinolone Resistance Determining Regions (QRDRs), Metallo-β-Lactamase genes (MβL), virulence genes (algD, lasB e toxA) and clonal spread of isolates producing MβL. Material and Methods: A retrospective cohort was conducted to determine the risk factors for 30-day mortality in patients with the first episode of bacteremia (157 patients) and VAP (60 patients) caused by P. aeruginosa. Genes blaIMP, blaVIM, blaSIM, blaGIM and blaSPM, TTSS genes (exoT, exoS, exoY, exoU ) and virulence genes (lasB, algD, toxA) were detected by PCR; the sequencing was conducted for QRDR genes (gyrA e parC) on fluoroquinolone-resistant strains and the Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) for molecular typing of positive strains for the MβL genes Results: The multivariate analysis showed that predictors independently associated with death in patients with bacteremia were inappropriate therapy and cancer. Carbapenem resistance was more frequent among strains of VAP (53.3%), however with the detection of MβL genes in one isolate (blaIMP), unlike blood, where the frequency of these genes was 16.1%, being 10.7% blaSPM genotype and 5.4% blaVIM genotype. The exoS gene was found in all blood and lung isolates and the exoU gene only in 9.4%. Substitution of threonine to isoleucine at position 83 in gyrA was the most frequent mutation among fluoroquinolone-resistant strains. It was detected a mutation at position 91 in parC gene (Glu91Lys) associated with mutation in gyrA (Thre83Ile) in a strain of extensively drug-resistant P. aeruginosa, exoT+exoS+exoU+ genotype, isolate from lung, not described in Brazil yet. Among the strains that harboring the TTSS virulence genes it was observed high resistance to gentamicin (93.7%) and low for amikacin (37.5%). The evaluation of the clonal relationship between isolates producing blaSPM, blaVIM and blaIMP genes showed similarity (more than 80%) among the blaSPM strains, which was not observed for those producing blaVIM gene. Conclusions: Our results confirm previous findings regarding the spread of blaSPM clone, with indirect evidence of its cross-spread in our hospital and polyclonal those containing the blaVIM gene. Inappropriate therapy is significant factor for poor prognosis among patients with bacteremia caused by multidrug-resistant P. aeruginosa , independent of the virulence TTSS genotype associated. / Introdução: Vem sendo observado a disseminação global de diferentes variantes de P. aeruginosa que está frequentemente associada a maior virulência ou a emergência de novos genótipos de resistência aos antimicrobianos. Há poucos estudos descrevendo a associação do Sistema de Secreção Tipo III (TTSS) com resistência aos antibióticos e evolução dos pacientes com pneumonia e bacteremia. Objetivos: Determinar a relação entre resistência a fluorquinolonas e carbapenêmicos e a virulência de Pseudomonas aeruginosa pelo Sistema de Secreção Tipo III e sua associação com pior prognóstico em pacientes com Pneumonia Associada a Ventilação Mecânica (PAV) e bacteremia, identificar mutações na Região Determinante de Resistência as Quinolonas (QRDR), genes para Metalo-β-Lactamase (MβL), genes de virulência (algD, lasB e toxA) e disseminação clonal das amostras produtoras de MβL. Material e Métodos: Foi realizada uma coorte retrospectiva para determinar os fatores de risco para mortalidade em 30 dias em pacientes com primeiro episódio de bacteremia (157 pacientes) e PAV (60 pacientes) por P. aeruginosa. Os genes blaIMP, blaVIM, blaSIM, blaGIM e blaSPM, os genes do TTSS (exoT, exoS, exoY, exoU ) e os genes de virulência (lasB, algD, toxA) foram detectados por PCR; o sequenciamento foi realizado para os genes do QRDR (gyrA e parC) nas cepas resistentes a fluorquinolonas e o Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) para tipagem molecular das amostras positivas para o gene produtor de MβL. Resultados: A análise multivariada mostrou que os preditores independentemente associados com mortalidade nos pacientes com bacteremia foram terapia antimicrobiana inapropriada e câncer. A resistência aos carbapenêmicos foi maior entre as amostras de PAV (53,3%), porém com a detecção dos genes que codificam MβL em apenas um isolado (blaIMP), ao contrário do sangue, onde a frequência desses genes foi de 16,1%, sendo 10,7% blaSPM e 5,4% blaVIM. O gene exoS foi encontrado em todas as amostras avaliadas de sangue e pulmão e o gene exoU em apenas 9,4% das mesmas. A substituição de uma treonina por isoleucina na posição 83 no gene gyrA foi a mais frequente entre as cepas resistentes a fluorquinolonas. Foi detectada uma mutação na posição 91 no gene parC (Glu91Lys) associada com a mutação em gyrA (Thre83Ile) em uma amostra de P. aeruginosa ,isolada do pulmão, extensivamente resistente, do genótipo exoT+exoS+exoU+ , ainda não descrita no Brasil. Entre as amostras que carreavam os genes de virulência TTSS observou-se alta resistência a gentamicina (93,7%) e baixa para amicacina (37,5%). A avaliação da relação clonal entre as amostras contendo os genes blaSPM, blaVIM e blaIMP , apresentou alta similaridade (maior que 80%), naquelas contendo blaSPM, o que não foi observado para as amostras contendo o gene blaVIM. Conclusões: Nossos resultados confirmam achados prévios com relação a disseminação do clone blaSPM, com evidências indiretas da sua disseminação cruzada no nosso hospital e policlonal daquelas contendo o gene blaVIM. A terapia inapropriada é fator significativo para pior prognóstico entre os pacientes com bacteremia por P. aeruginosa multirresistente, independente do genótipo de virulência TTSS associado. / Mestre em Imunologia e Parasitologia Aplicadas
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Caracterização fenotípica e genotípica da resistência a antimicrobianos em micobactérias de crescimento rápido / Phenotypic and genotypic characterization of antimicrobial resistance in rapidly growing mycobacteriaCampos, Juliana Coutinho 17 May 2013 (has links)
As micobactérias de crescimento rápido causam infecções pulmonares, infecções relacionadas a traumas cutâneos e aos cuidados com a saúde. Ha um número reduzido de opções terapêuticas para o tratamento dessas infecções e os dados nacionais sobre os determinantes genéticos dessa resistência são escassos. Duas classes de antimicrobianos importantes no tratamento são as fluorquinolonas e os macrolídeos. Enquanto a maioria dos isolados do Grupo M. chelonae-abscessus apresenta resistência intrínseca às fluorquinolonas, e são sensíveis aos macrolídeos, a maioria dos isolados do Grupo M. fortuitum é sensível às fluorquinolonas e expressa RNA-metilases que impedem a ação dos macrolídeos. Os determinantes da resistência às fluorquinolonas conhecidos em micobactérias são mutações no gene gyrA e para os macrolídeos é a expressão de genes erm, que codificam RNA-metilases. Nos dois casos os determinantes tem localização cromossômica. Outros determinantes de resistência podem ter localização plasmidial, a exemplo do gene aacA4\'-8, presente em plasmídio do grupo de incompatibilidade IncP, detectado em M. abscessus, que codifica resistência à kanamicina e tobramicina. Neste estudo foram avaliados: a correlação entre à susceptibilidade ao ciprofloxacino e moxifloxacino e presença de mutações nos genes gyrA e gyrB; a susceptibilidade à claritromicina e presença de genes que codificam RNA-metilases; a presença de plasmídios do grupo de incompatibilidade IncP em diferentes espécies de micobactérias; a estabilidade e a transferência por conjugação do plasmídio pBRA-100; a relação clonal entre isolados que albergam plasmídios IncP e o perfil de susceptibilidade antimicrobiana de uma coleção de isolados da espécie M. abscessus. Cento e vinte e dois isolados dos Grupos M. abscessus e M. fortuitum foram analisados quanto às concentrações inibitórias mínimas, por microdiluição, utilizando-se o painel RAPMYCO®. As sequências parciais dos genes gyrA e gyrB e a presença de genes que codificam RNA-metilases foram determinadas em 69 e 59 desses isolados, respectivamente. A presença de plasmídios do grupo IncP foi determinada por PCR e os produtos de amplificação tiveram suas sequencias caracterizadas. A estabilidade do plasmídio pBRA-100 em Escherichia coli TOP10® foi avaliada realizando-se repiques sucessivos por 57 dias e semeadura em agar LB contendo kanamicina. A transferência horizontal foi avaliada por ensaio de conjugação com E. coli J53 resistente à azida sódica. Em M. abscessus não houve diferença entre as sequencias da região QRDR de GyrA e GyrB entre isolados sensíveis e resistentes ao ciprofloxacino. Em M. abscessus subsp. abscessus e M. abscessus subsp. bolletii todos os isolados testados apresentaram genes erm; entretanto não foi observada correlação entre a presença dos genes e resistência indutiva a claritromicina. O gene erm(45), descrito neste trabalho, foi detectado apenas em M. abscessus subsp. bolletii. Os ensaios de microdiluição evidenciaram que os antimicrobianos mais ativos contra M. abscessus subsp. abscessus foram amicacina (89%), tigeciclina (96%) e claritromicina (86%). Apenas nos dois isolados da espécie M. fortuitum resistentes ao ciprofloxacino foi detectada a substituição S83W na proteína GyrA. Trata-se de substituição ainda não descrita em micobactérias. Nao foi observada correlação entre substituições em GyrB e resistência ao ciprofloxacino ou moxifloxacino. O gene erm(46), descrito neste estudo, foi detectado em 65% dos isolados. Nos demais isolados foram detectados três outros genes: erm(47), erm(48) e erm(49), ainda nao descritos. Os plasmídios IncP foram detectados apenas em \"M. massiliense\" pertencentes a três grupos clonais distintos com índice de similaridade maior que 92%, quando analisados por ERIC-PCR. Houve sucesso na conjugação entre E. coli TOP-Myco e E. coli J53. Os ensaios de estabilidade evidenciaram que o plasmídio pBRA-100 é estável em E. coli com aproximadamente 100% da população bacteriana albergando o plasmídio após 57 subcultivos. / The rapidly growing mycobacteria cause lung infections, skin infections related to trauma and health care associated infections. There are a limited number of therapeutic options for treating these infections and national data on the genetic determinants of this resistance are scarce. Two major classes of antimicrobials used in treatment of these infections are macrolides and fluoroquinolones. While the majority of the isolates from M. chelonae-abscessus Group have intrinsic resistance to fluoroquinolones, and are sensitive to macrolides, most isolates from M. fortuitum Group are sensitive to fluoroquinolones and express RNA methylases that prevent the action of macrolides. The known fluoroquinolones resistance determinants in to mycobacteria are mutations in thegyrA gene and for macrolides the main determinant is the expression of erm genes which encode RNA methylases. In both cases the determinants are located at the chromosome. Other resistance determinants may have a plasmidial location, such as aacA4\'-8 gene, present in the pBRA100 plasmid detected in M. abscessus, which encodes resistance to kanamycin and tobramycin. This study evaluated the correlation between the susceptibility to ciprofloxacin and moxifloxacin and mutations in genes gyrA and gyrB; susceptibility to clarithromycin and the presence of RNA-methylases encodinggenes , the presence of plasmids of the incompatibility group IncP in different species mycobacteria; stability and conjugal transfer of plasmid pBRA-100; the clonal relationship between isolates harboring plasmids IncP and antimicrobial susceptibility profile of a collection of isolates of M. abscessus. One hundred and twenty-two isolates of M. chenolae-abscessus and M. fortuitum Groups were analyzed for their minimal inhibitory concentrations by microdilution, using the RAPMYCO® Panel. The partial sequences of the genes gyrA and gyrB and the presence of genes encoding RNA methylases were determined in 69 and 59 isolates, respectively. The presence of IncP group plasmids was determined by PCR and the sequence of PCR products were characterized. The stability of the pBRA-100 plasmid in Escherichia coli TOP10® was evaluated by performing successive subcultures for 57 days, and plating on LB agar containing kanamycin. The horizontal transfer was evaluated by conjugation with E. coli J53 a sodium azide resistant strain. In M. abscessus no differences between the sequences of the QRDR region of gyrA or gyrB among isolates susceptible and resistant to ciprofloxacin were observed. In M. abscessus subsp. abscessus and M. abscessus subsp. bolletii all isolates tested had erm genes; however there was no correlation between the presence of these genes and inducible resistance to clarithromycin. The erm(45), gene described in this paper, was only detected in M. abscessus subsp. bolletii. Microdilution tests showed that the most active antibiotics against M. abscessus subsp. abscessus were amikacin (89%), tigecycline (96%) and clarithromycin (86%). In only in two M. fortuitum isolates resistant to ciprofloxacin the amino acid substitution S83W was detected in GyrA. This substitution had not been described mycobacteria. No correlation was observed between substitutions in GyrB and resistance to ciprofloxacin or moxifloxacin. The erm(46) gene described in this study, was detected in 65% of the isolates. In the remaining isolates other three not yet described genes were detected: erm(47), erm(48) and erm(49). IncP plasmids were detected only in \"M. massiliense\" belonging to three clonal groups with at similarity index greater than 92% when analyzed by ERIC-PCR.We succeeded in conjugating E. coli TOP-Myco and E. coli J53. The stability tests showed that the plasmid pBRA-100 is stable in E. coli since approximately 100% of the bacterial population harbored the plasmid after 57 subcultures.
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[en] SPECTROSCOPIC STUDIES OF FLUOROQUINOLONES AND THEIR COPPER(II) COMPLEXES: INTERACTION WITH MICELLES, LIPOSOMES AND GOLD NANOCOMPOSITES / [pt] ESTUDOS ESPECTROSCÓPICOS DE FLUORQUINOLONAS E SEUS COMPLEXOS DE COBRE(II): INTERAÇÃO COM MICELAS, LIPOSSOMAS E NANOCOMPÓSITOS DE OUROJIMMY LLONTOP INCIO 10 January 2019 (has links)
[pt] Norfloxacina (NFX) é um antibiótico fluorescente de amplo espectro bacteriológico, membro da família das fluorquinolonas (FQs). A interação das FQs com íons metálicos pode incrementar a ação bactericida e agir contra a resistência das bactérias frente aos antibióticos. Diversos exemplos de complexos mistos de norfloxacina e Cu(II) podem ser encontrados na literatura. A compreensão dos mecanismos moleculares de interação desses antibióticos com os diferentes componentes das células e com nanopartículas de ouro, como transportadores do fármaco, é extremamente importante. Para entender essas interações, neste trabalho utilizamos diferentes técnicas espectroscópicas, como espectroscopia de fluorescência estacionária e resolvida no tempo, absorção de luz UV-Visível e ressonância paramagnética eletrônica (RPE). A interação de NFX e do complexo ternário Cu(II):L:NFX, onde o ligante L é a 1,10-fenantrolina (Phen) ou 2,2-bipiridina (Bipy), com micelas e lipossomas unilamelares pequenos de fosfatidilcolina de ovo (PC) foi estudada usando espectroscopia de fluorescência em estado estacionário e resolvida no tempo. Foi estudada a estabilidade dos complexos ternários formados em micelas. Foram obtidas constantes de estabilidade no interior de micelas de SDS, as quais mostraram valores muito maiores do que em tampão. Já os espectros de RPE deram maiores detalhes sobre a estrutura dos complexos e confirmaram a formação do complexo ternário dentro das micelas. Foram estudadas as interações de FQs e seus complexos de cobre com lipossomas de PC preparados com diferentes densidades superficiais de carga elétrica negativa. No estudo da interação de FQs com nanopartículas de ouro sintetizadas por ablação a laser (nanocompósitos, AuNCs), NFX mostrou maiores mudanças, tanto na absorbância como na fluorescência, do que as FQs ciprofloxacina (CFX) e levofloxacina (LFX). Os resultados sugerem mudanças no índice de refração na superfície dos AuNCs, por associação com o fármaco e/ou formação de aglomerados como resultado da interação. Observou-se também uma supressão lenta, porém significativa, na fluorescência da NFX, sem mudança na posição do pico, indicando que NFX mantém o seu estado inicial de protonação ligando-se à superfície dos AuNCs. Também foi observada a liberação de FQs ligadas à superfície de AuNPs mediante substituição por tióis, que ocasiona recuperação parcial da fluorescência da fluorquinolona. Por último, como o surfactante aniônico SDS se mostrou promissor na interação com NFX, em comparação com surfactantes catiônicos e neutros, e como os AuNCs são estáveis em SDS, estudamos a interação de NFX com AuNCs sintetizados em presença de SDS e, para comparação, com AuNCs colocados em solução de SDS após a síntese. / [en] Norfloxacin (NFX) is a fluorescent antibiotic of broad bacteriological spectrum, member of the fluoroquinolone (FQ) family. The interaction of FQs with metal ions can increase the bactericidal action and act against antibiotics bacterial resistance. Several examples of mixed-ligand norfloxacin Cu (II) complexes can be found in the literature. Understanding the molecular mechanisms of interaction of these antibiotics with different cell components and with gold nanoparticles as drug transporters is extremely important. To clarify these interactions, we used different spectroscopic techniques, such as steady-state and time-resolved fluorescence spectroscopy, UV-Visible light absorption, and electron paramagnetic resonance (EPR). The interaction of NFX and the ternary complex Cu(II):L:NFX, where the L is the ligand 1,10-phenanthroline (Phen) or 2,2-bipyridine (Bipy), with micelles and small unilamellar liposomes of egg phosphatidylcholine (PC) was studied using steady-state and time-resolved fluorescence spectroscopy. The stability of the ternary complexes formed in micelles was studied, and stability constants were obtained inside SDS micelles, which showed values much larger than in buffer. The EPR spectra gave further details on the structure of the complexes, and confirmed the formation of the ternary complex inside the micelles. The interactions of FQs and their copper complexes with PC liposomes prepared with different surface densities of negative electrical charge were studied. In the study of the interaction of FQs with gold nanoparticles synthesized by laser ablation (nanocomposites, AuNCs), NFX showed greater changes than FQs ciprofloxacin (CFX) and levofloxacin (LFX) in both absorbance and fluorescence. The results suggest changes in the surface refractive index of the AuNCs and/or cluster formation, as result of the interaction with the drug. A slow but significant quenching of NFX fluorescence was also observed, with no change in peak position, indicating that NFX maintains its initial state of protonation by binding to the surface of the AuNCs. Release of FQs attached to the surface of AuNCs by thiols has also been observed, which causes partial recovery of FQ fluorescence. Finally, as the anionic surfactant SDS showed to be promising in the interaction with NFX, compared to cationic and neutral surfactants, and because the AuNCs are stable in SDS, we studied the interaction of NFX with AuNCs synthesized in the presence of SDS and, for comparison, with AuNCs placed in SDS solution after synthesis.
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