Submitted by Maykon Nascimento (maykon.albani@hotmail.com) on 2016-04-13T18:31:06Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Lorena Carnielli.pdf: 1224533 bytes, checksum: 5ce69a9e54fbbc313add5eab9ac14e1b (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-05-16T14:30:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Lorena Carnielli.pdf: 1224533 bytes, checksum: 5ce69a9e54fbbc313add5eab9ac14e1b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-16T14:30:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Lorena Carnielli.pdf: 1224533 bytes, checksum: 5ce69a9e54fbbc313add5eab9ac14e1b (MD5) / CAPES / A cultura do abacaxi tem grande destaque para o Brasil devido sua importância econômica. No entanto, doenças que atingem os abacaxizeiros têm causado elevados prejuízos e dentre elas, destaca-se a fusariose. O agente etiológico da fusariose é o fungo Fusarium guttiforme. A dificuldade com o diagnóstico convencional para a correta identificação tem levado à busca de novas metodologias. Nesse trabalho, utilizou-se a técnica de PCR em tempo real com o objetivo de desenvolver uma metodologia rápida, sensível e específica para o diagnóstico do F. guttiforme. Os isolados foram avaliados quanto às características morfológicas e também identificados por PCR multiplex (β-tubulina e fator de elongação 1-α) e pela patogenicidade. No diagnóstico realizado por PCR em Tempo Real usou-se o corante SYBRGreen e um par de primer específico para o gene fator de elongação 1-α (tef1). Os resultados obtidos na caracterização morfológica demonstraram que as estruturas micromorfológicas dos isolados avaliados estavam de acordo com os descritores para espécie e verificou-se variabilidade no crescimento dos isolados nas temperaturas de 25 ºC e 30 ºC. No teste de patogenicidade em mudas da cv. Pérola (suscetível) houve variação entre os isolados em relação à severidade de doença. A presença de dois pares de primers contribui para um menor número de falsos negativos, mas o teste teve uma especificidade muito baixa. Entretanto o diagnóstico por meio da PCR em tempo real teve uma excelente sensibilidade (90,5%), especificidade (100%) com nível de significância de p<0,0001. A simplicidade do método, a especificidade e a sensibilidade, com a utilização do SYBRGreen, levam à recomendação do método como rápido, de reduzido risco de contaminação pós-amplificação e detecção de quantidades relativamente pequenas de DNA alvo. A facilidade de quantificação e a melhoria nos protocolos faz com que a tecnologia de PCR em tempo real seja referência para a detecção do Fusarium guttiforme em abacaxizeiro. / The pineapple crop has high significance in Brazil, due to its economic magnitude. However, diseases of the pineapple plant have caused major economic losses, and among those, the fusariosis is the most important. The etiological agent of the fusariosis is the fungus Fusarium guttiforme. The difficulty with the conventional diagnosis for correct identification has led to the search for new methods. In this study, the real time PCR method was tested with the goal of developing a rapid, specific and sensitive method for the diagnose of the F. guttiforme. The isolates were analyzed on its morphological characteristics and also identified by multiplex PCR (β-tubulin and factor 1-α gene) and by pathogenicity tests. In the diagnosis by real time PCR, SYBRGreen dye along with and a specific pair of primers for the elongation factor 1-α gene (tef1). The result obtained on the morphological characterization demonstrated that the micromorphological structures analyzed agreed with those described for the species and that there is variability in the growth of the isolates at 25ºC and 30ºC. In the pathogenicity test in seedlings of cv. Perola (susceptible) there was variation among isolates. The presence of two pairs of primers contributed to a low false number of negatives, but the test also had low specificity. However, the diagnostic by real time PCR showed good results, with high sensitivity (90,5%) and specificity (100%) with statistically significant p-value (p < 0,0001). The simplicity of the method, the specificity and the sensitivity using the SYBRGreen dye, indicates that de real time PCR technologies is recommended as fast, reduced risk of contamination and post-amplification detection of relatively low amount of target DNA. The ease of quantification and improving protocols makes real time PCR is a reference for the detection of Fusarium guttiforme in the pineapple plant.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-23T15:24:11Z No. of bitstreams: 1 Susan Satie Tsuji.pdf: 801633 bytes, checksum: f830ce7fba5b8d7999b6897bb595841a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-23T15:24:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Susan Satie Tsuji.pdf: 801633 bytes, checksum: f830ce7fba5b8d7999b6897bb595841a (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fusarium guttiforme (sin. Fusarium subglutinans f. sp. ananas) is the causal agent of fusariosis on pineapple (Ananas comosus). This disease, considered the most important to this crop, has the exudation of gum as the most common symptom. Most of the published studies focus on the evaluation of the resistance of pineapple varieties against F. guttiforme. The estimative of genetic diversity in Fusarium populations is fundamental to understand the population structure, the movement of pathogen genetic material between producing regions, as well as understanding the processes that lead to resistance against pesticides and overcoming genetics resistance of pineapple cultivars. This fungus, which can be found in most regions of the country, does not have a known teleomorph and belongs to the Gibberella fujikuroi species complex, a group with heterogeneous characteristics. This study aimed: a) to obtain a collection of Fusarium isolates associated with pineapple fusariosis in the country; b) to reconstruct the phylogeny of Fusarium isolates that causes fusariosis on pineapple from Northeast and Southeast regions; c) to test the pathogenicity of isolates. DNA sequences of translation elongation fator 1-α (tef1) and calmodulin (cmd) were analyzed, and the history of the alleles was inferred by phylogenetic methods. Tef1 gene sequences were used to estimate the number of haplotypes from isolates collected in different regions. It was observed that the F. guttiforme is the causal agent of fusariosis on pineapple in Brazil, and the tef1 gene allowed a better infraspecific group distinction than cmd gene. / A fusariose do abacaxizeiro (Ananas comosus) tem como agente etiológico o fungo Fusarium guttiforme (sin. Fusarium subglutinans f. sp. ananas). Esta doença, considerada a mais importante da cultura, tem como sintoma a exsudação de goma, sendo conhecida também como gomose ou resinose fúngica. A maior parte dos estudos publicados avaliou a resistência de variedades de abacaxizeiro a F. guttiforme. A estimativa da diversidade genética em populações de Fusarium é fundamental para o entendimento da estrutura populacional, do movimento de material genético do patógeno entre regiões produtoras através da disseminação do mesmo, bem como do entendimento dos processos que levam a resistência a defensivos e superação da resistência genética de cultivares de abacaxi. Esse fungo, que se encontra disseminado por todas as regiões produtoras do país, ainda não possui o teleomorfo conhecido e pertence ao complexo Gibberella fujikuroi, um grupo com características heterogêneas. O presente trabalho teve como objetivos: a) obter uma coleção de isolados de Fusarium associados à fusariose do abacaxizeiro no país; b) avaliar a filogenia de isolados de Fusarium das regiões Nordeste e Sudeste; c) testar a patogenicidade dos isolados obtidos. Foram analisadas sequências parciais de DNA dos genes fator de elongação 1-α (tef1) e calmodulina (cmd), inferindo-se a história dos alelos através de métodos filogenéticos. Sequências parciais do gene tef1 foram utilizadas para estimar o número de haplótipos dos isolados coletados em diferentes regiões produtoras. Observou-se que a espécie F. guttiforme é o agente causal da gomose do abacaxizeiro no Brasil e que o gene tef1 possibilitou uma melhor distinção de grupos infraespecíficos que o gene cmd.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-15T16:06:33Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 961319 bytes, checksum: 7d014e330a43dbe89b8c6551cd06a0cb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T16:06:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 961319 bytes, checksum: 7d014e330a43dbe89b8c6551cd06a0cb (MD5) Previous issue date: 2015-03-31 / O Pará é o maior estado produtor de abacaxi no Brasil. No município paraense de Conceição do Araguaia, o cultivo de abacaxi é a principal atividade econômica, e a cultivar Pérola é a mais plantada. A fusariose, causada pelo fungo Fusarium guttiforme, é uma das principais doenças da cultura. Apesar da importância da cultura e da fusariose, pouco se conhece sobre ambas em Conceição do Araguaia. Assim, efetuaram-se entrevistas estruturadas, para identificar o perfil dos abacaxicultores, e levantamento da incidência da fusariose, para quantificar a importância da doença. Em torno de 70% dos abacaxicultores têm mais de 41 anos, baixo nível de escolaridade, expressiva participação em associações comunitárias, recebem informações principalmente via televisão, esporadicamente fornecem ou compram mudas dos vizinhos e comercializam os frutos com atravessadores. A incidência da fusariose nas lavouras de Conceição do Araguaia, durante a fase de desenvolvimento vegetativo, foi menor que a observada em outras regiões, com aumento progressivo nos primeiros meses após o plantio até a indução floral com etefom. / Pará state is the major Brazilian pineapple producer. In the Conceição do Araguaia county in Pará, pineapple cropping is the main economic activity, and ‘Pérola’ is the most planted cultivar. Gummosis, caused by the fungus Fusarium guttiforme, is a major disease of the crop. Despite the importance of both pineapple and gummosis for the county, little is known about them. Thus we set structured interviews, to characterize the profile of pineapple producers, and surveyed the disease incidence. About 70% of the growers are older than 41, have low level of education, participate actively in community associations, receive information mainly through television, use their own slips or suckers or buy them from neighbors and commercialize the fruits through intermediaries. The incidence of gummosis in Conceição do Araguaia crops during the vegetative growth was lower than that from other regions. The incidence gradually increases from the first months after planting up to the floral induction with ethephon.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-29T12:48:57Z No. of bitstreams: 1 Luiz Gustavo de Lima Melo.pdf: 836887 bytes, checksum: cbc505c9efbb7bb9c4a2a41195c6571e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-29T12:48:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luiz Gustavo de Lima Melo.pdf: 836887 bytes, checksum: cbc505c9efbb7bb9c4a2a41195c6571e (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fusarium guttiforme and Thielaviopsis ethacethica are responsible for numerous losses regarding the cultivation of pineapple. Despite the fusarium be considered a pre-harvest disease, the damage to the fruit, negatively reflecton marketing; T. ethacethica already responsible for black rot of pineapple fruit is typically a disease of post-harvest, causing losses mainly fruit for both industry and the fresh market. Thus the two plant pathogens in question cover the entire production chain of the pineapple. Given the importance of these etiological agents and the high level soft infection in the producing regions of the fruit this study evaluated effect of alternative products in the management of fusarium wilt of pineapple and black pineapple rot, as well as checking the possible physical-chemical and biochemical changes they can cause the fruit. In the first article, the effect of alternative products in the management of fusarium wilt was analyzed in the pre-harvest by natural infection in the field, as well as lifting incidence of fusarium wilt of pineapple. In these article, the effect of alternative products in the management of black rot was analyzed in post-harvest checking its action on these verities of the lesions in the fruits and possible changes in mycelia growth and sporulation of T. ethacethica. The products tested were potassium phosphite (FK), calcium phosphite (FCA), copper phosphide (FCU), Agro-Mos (AGM), calcium silicate (CAS), Biopirol®, Bion® and carbendazim CCAB 500 SC applied at recommended dosages by manufacturers. For the analysis of natural infection by Fusarium results show edth at FK, FCU and Biopirol were efficient in controlling the incidence of the disease. The physico-chemical analysis show edth at the treatments did not promote change in the pH of the fruit, while in biochemistry only FK promoted the expression of β-1,3-glucanase enzyme in pineapple fruit. Related to T. ethacethica, the results show edth at Bion®, agro- and FK we were able to control black rot in the fruit. FK inhibited mycelia growth and sporulation of the pathogen. The applied products provided changes in pH levels, SST and ATT. Biochemical changes were not observed by the application of the products. / Fusarium guttiforme e Thielaviopsis ethacethica são responsáveis por inúmeras perdas no que concerne o cultivo do abacaxi. Apesar da fusariose ser considerada uma doença de pré-colheita, seus danos ao fruto, refletem negativamente na comercialização; já T. ethacethica, responsável pela podridão negra do fruto do abacaxizeiro, é uma doença tipicamente de pós-colheita, causando perdas principalmente em frutos destinados tanto a indústria como ao consumo in natura. Dessa forma os dois fitopatógenos em questão abrangem toda a cadeia produtiva do abacaxi. Diante da relevância desses agentes etiológicos e dos altos níveis de infecção nas regiões produtoras do fruto este trabalho buscou avaliar efeito de produtos alternativos no manejo da fusariose do abacaxizeiro e da podridão negra do abacaxi, bem como verificar as possíveis alterações físico-quimicas e bioquímicas que estes possam causar nos frutos. No primeiro artigo, o efeito de produtos alternativos no manejo da fusariose foi analisado na fase pré-colheita, por infecção natural em campo, bem como levantamento de incidência da fusariose do abacaxizeiro. No segundo artigo, o efeito de produtos alternativos no manejo da podridão negra foi analisado na fase pós-colheita verificando sua ação sobre a severidade das lesões nos frutos e possíveis alterações no crescimento micelial e esporulação de T.ethacethica. Os produtos testados foram fosfito de potássio (FK), fosfito de cálcio (FCa), fosfito de cobre (FCu), Agro-Mós (AGM), silicato de cálcio (SCa), Biopirol®, Bion®e carbendazim ccab 500 sc, aplicados nas dosagens recomendadas pelos fabricantes. Para as análises de infecção natural por Fusarium os resultados mostraram que FK, FCu e biopirol foram eficientes no controle da incidência da doença. As análises físico-químicas mostraram que os tratamentos não promoveram alteração no pH dos frutos, enquanto que na bioquímica apenas FK promoveu a expressão da enzima β-1,3‑glucanases em frutos de abacaxi. Relacionado à T. ethacethica, os resultados mostraram que Bion®, Agro-mos e FK foram capazes de controlar a podridão negra no fruto. FK inibiu o crescimento micelial e a esporulação do patógeno. Os produtos aplicados proporcionaram alterações nos teores de pH, SST e ATT. Alterações bioquímicas não foram observadas pela aplicação dos produtos.