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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-24Bitstream added on 2014-06-13T20:14:42Z : No. of bitstreams: 1 buchweitz_ed_me_jabo.pdf: 457129 bytes, checksum: fa6a9d6b3e092340a34ec3de2d5161cc (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A baixa freqüência de genes recessivos deletérios e letais e a grande proporção de locos favoráveis já fixados nos híbridos comerciais, associado a uma seleção fenotípica eficiente entre e dentro de linhagens pode permitir a obtenção de híbridos promissores. Em média, são gastos de 8 a 10 anos para que um novo híbrido chegue ao mercado, o que implica diretamente no custo final das sementes. Para reduzir esse tempo é interessante viabilizar a utilização de linhagens parcialmente endogâmicas nos cruzamentos para agilizar o processo de obtenção de híbridos superiores e reduzir os custos da produção de sementes híbridas. Diante da necessidade de identificar híbridos de destaque e de encontrar alternativas que conduzam à redução dos custos e do tempo para a obtenção de sementes híbridas, o objetivo desse trabalho foi avaliar o potencial de linhagens parcialmente endogâmicas de milho com três (S3) e quatro (S4) gerações de autofecundação, obtidas de híbridos simples comerciais, com relação à heterose dos híbridos resultantes / The low frequency of deleterious recessive and lethal genes and the large proportion of favorable loci already set in commercial hybrids combined with an efficient phenotypic selection among and within strains may allow the achievement of promising lines. On average, spending 8 to 10 years for a new hybrid to reach the market, which directly implies the final cost of the seeds. To reduce this time it is interesting to enable the use of partly inbred lines at intersections to expedite the process of obtaining superior hybrids and reduce the costs of producing hybrid seeds. Faced with the need to identify hybrids highlighted and to find alternatives that lead to the reduction of costs and time required for the production of hybrid seeds, the purpose of this study was to evaluate the potential of partly inbred lines of maize with three (S3) and four (S4) generations of selfing, obtained from commercial single cross hybrids, with respect to the follow-on hybrid heterosis

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:47:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1735193 bytes, checksum: e3475200b7337e8ee03abe701c637829 (MD5) Previous issue date: 2013-04-02 / With this study aimed to determine the age at puberty of heifers and bulls Gir created field (a semi-extensive) and the relation of body measurements, ultrasound, testicular and andrologic with reproductive events in system management conditions semi-extensive. A group of 115 animals, including 66 females and 49 males, pure origin and genealogical register, aged between 14 and 24 months. Reviews and gynecological andrologic were carried out fortnightly and monthly, respectively, on a cattle ranch Elite Gir located in São Pedro dos Ferros, the state of Minas Gerais, in the period from July to November 2012. The records of the animals used for the assessments were provided by the Brazilian Agricultural Research Corporation - National Research Center for Dairy Cattle (Embrapa CNPGL) - Juiz de Fora-MG and the Brazilian Association of Breeders of Gir Dairy (ABCGIL) - Uberaba-MG. To study the variation observed in reproductive variables measured, variance analysis was performed using the statistical procedures available in using SAS ® (SAS, 2009). The animals were evaluated between the ages of 14 to 24 months, females evaluated between 9.1% (6/66 heifers) were pubescent, while in males 69.4% (34/49) were classified as pubescent. / Com presente estudo objetivou-se determinar a idade à puberdade de novilhas e tourinhos da raça Gir criados a campo (regime semi-extensivo) e verificar a relação das mensurações corporais, ultrassonográficas, testiculares e andrológicas com os eventos reprodutivos em condições de manejo do sistema semi-extensivo. Foram avaliados 115 animais, sendo 66 fêmeas e 49 machos, puros de origem e com registro genealógico, com idade entre 14 e 24 meses. Avaliações ginecológicas e andrológicas foram realizadas quinzenalmente e mensalmente, respectivamente, em uma fazenda de gado elite da raça Gir localizada no município de São Pedro dos Ferros,interior do estado de Minas Gerais, no período de julho a novembro de 2012. Os registros dos animais utilizados para as avaliações foram cedidos pela Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária Centro Nacional de Pesquisa em Gado de Leite (Embrapa CNPGL) Juiz de Fora- M.G. e Associação Brasileira de Criadores da Raça Gir Leiteiro (ABCGIL) Uberaba-MG. Para estudo da variação observada nas variáveis reprodutivas aferidas, foi realizada análise variância, usando os procedimentos estatísticos disponíveis no pacote computacional SAS® (SAS, 2009). Os animais forma avaliados entre as idades de 14 a 24 meses, entre fêmeas avaliadas 9,1% (6/66 novilhas) apresentaram-se púberes, enquanto nos machos 69,4% (34/49) foram classificados como púberes.

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV14MA135.pdf: 966363 bytes, checksum: 7ae19a20d65ccf7289abab243866784f (MD5) Previous issue date: 2014-07-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The seeds quality refers to genetic, physical, physiological and sanitary aspects. When looking for better quality seed is crucial to identify the genetic gain on each of these characteristics, ensuring gigh quality seeds at the end of the process. This work proposed determines the genetic gain for seed hybrid physiological quality according to characterization of their maize lines. Eight lines and three hybrids were evaluated from breeding program of Coxilha, RS. The analyzes were conducted at the Laboratory of Seed Analysis of the State University Santa Catarina UDESC. The seeds were evaluated by physiological tests of germination and vigor: accelerated aging, electrical conductivity, cold test and chemical composition (starch, total protein, total phosphorus, iron, zinc). The accelerated aging test contributed to genetic divergence for seed quality, with 48.6% and for the characteristic chemical composition of the starch contributed 46.7%. genetic gains were identified for hybrids: triple modified and triple, which were promising for the aspect of seed quality with 99% germination and vigor of 96% and 99%, respectively, cleary demonstrating the genetic gain. And, the characteristic of the chemical composition for the majority of the evaluated parameters (starch, phosphorus, iron and zinc), the simple hybrid showed higher heterosis, which allows the hybrid to indicate the most promising in the production of hybrid seed corn / A qualidade de sementes se refere a aspectos genéticos, físicos, fisiológicos e sanitários. Quando se busca melhor qualidade de sementes é fundamental determinar o ganho genético sobre cada uma destas características, garantindo sementes de alta qualidade no final do processo. Este trabalho tem a proposta de determinar o ganho genético para qualidade fisiológica em sementes de milho híbrido em função da caracterização prévia das respectivas linhagens. Foram avaliadas oito linhagens e três híbridos provenientes da sede de melhoramento genético localizado no município de Coxilha RS. As análises foram conduzidas no laboratório de Análise de Sementes da Universidade do Estado de Santa Catarina UDESC. As sementes foram avaliadas pelos testes fisiológicos de germinação e vigor: envelhecimento acelerado, condutividade elétrica, teste de frio e composição química (teor de amido, proteína total, fósforo total, ferro, zinco). O teste de envelhecimento acelerado contribuiu na divergência genética para qualidade fisiológica das sementes com 48,6% e para a característica de composição química o teor de amido contribuiu com 46,47%. Os ganhos genéticos foram identificados para os híbridos: triplo modificado e triplo, os quais foram promissores para o aspecto de qualidade fisiológica das sementes, com germinação de 99% e vigor de 96% e 99%, respectivamente, demonstrando claramente o ganho genético. E, para a característica de composição química para a maioria das características avaliadas (teor de amido, fósforo, ferro e zinco), o híbrido simples apresentou maior heterose, o que permite indicar o híbrido como o mais promissor na obtenção de sementes híbridas de milho

Submitted by Mateus Olivo null (mateusolivo@hotmail.com) on 2017-07-18T13:56:47Z No. of bitstreams: 1 tese (1).pdf: 2245536 bytes, checksum: 64aa616bea707c6d61006cf0b00b4d6f (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-07-19T17:04:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 olivo_m_dr_bot.pdf: 2245536 bytes, checksum: 64aa616bea707c6d61006cf0b00b4d6f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-19T17:04:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 olivo_m_dr_bot.pdf: 2245536 bytes, checksum: 64aa616bea707c6d61006cf0b00b4d6f (MD5) Previous issue date: 2017-06-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O cártamo (Carthamus tinctorius L.) membro da família Asteraceae, atualmente é cultivado principalmente como planta oleaginosa. Pode ser utilizado como cultura de inverno em locais de temperaturas amenas e como cultura de primavera em locais de temperaturas mais baixas, apresenta boa adaptação em ambientes de clima mais seco. Atributos que podem torná-lo uma cultura de importante expressão no cerrado brasileiro, local o qual possui um longo período seco com temperaturas elevadas durante o inverno, dificultando o cultivo de outras espécies. Destaca-se como uma cultura estratégica, apresenta boa tolerância a estresse por déficit hídrico em especial no final de ciclo, além de características adequadas para mecanização facilitando o uso dos mesmos equipamentos utilizados nos demais cultivos como soja e milho. O objetivo deste trabalho é realizar um estudo genético para gerar informações aos programas de melhoramento genético. Foram avaliadas 10 combinações em dialelo completo sem recíprocos, em F1 e F2. Na geração F1 foram avaliadas as características de número de capítulos por planta, número de ramos por planta e produção de grãos por planta. Na geração F2 repetiram-se as avaliações realizadas em F1 acrescentando altura de planta, número de grãos por planta, número de grãos por capítulo e percentagem de óleo nos grãos. Após foi determinado a capacidade geral e específica de combinação e análise de correlação simples. As principais conclusões são: Os melhores cruzamento para produção de grãos formam PI537697/PI653152 e PI572450/PI653152 e para teor de óleo formam PI572450/PI572470 e PI572470/PI653152; para todas as características avaliadas em F1 e F2, exceto número de ramos, foi possível observar a contribuição da capacidade geral de combinação na variação genética das populações e para as características altura de planta, produção de grãos por planta, número de grãos por planta, número de grãos por capítulo e percentagem de óleo nos grãos, existe a contribuição da capacidade específica de combinação na variação genética das populações e evidenciando ações gênicas não aditivas e o teor de óleo nos grãos não possui correlação significativa com demais características agronômicas avaliadas. / Safflower (Carthamus tinctorius L.), a member of the Asteraceae family, it is currently cultivated mainly as an oilseed plant. It can be used as a winter crop in mild temperatures and as a spring crop in lower temperature. It is well adapted in drier climates. Attributes that can make it a crop of important expression in the Brazilian “Cerrado Area”, a place that has a long dry period with high temperatures, making difficult the cultivation of other species. In this scenario the safflower is configured as a strategic crop that presents good stress tolerance due to water deficit, especially at the end of the season, besides characteristics suitable for mechanization, using the same equipment already used in other crops as corn and soybeans. The objective of this study is to perform a genetic study to provide information to breeding programs. We evaluated 10 combinations in complete diallel without reciprocal, in F1 and F2. In the F1 generation were evaluated: number of head per plant, number of branches per plant and seed production per plant. In the F2 generation the evaluations performed in F1 were repeated, and added plant height, number of seeds per plant, number of seeds per chapter and percentage of oil in the seeds. After general and specific combining ability were determined, also a simple correlation analysis was performed. The main conclusions are: The best crossing to seed production were PI537697/PI653152 e PI572450/PI653152 and to oil content were PI572450/PI572470 e PI572470/PI653152. For all the characteristics evaluated in F1 and F2, except for number of branches, it was possible to observe the general combining ability contribution in the genetic variation of the populations and for the characteristics plant height, seed production per plant, number of seeds per plant, number of seeds by head and percentage of oil in the seeds, there is the contribution of the specific combining ability in the genetic variation of the populations and showing non-additive gene actions and the oil content in the seeds does not have significant correlation with other evaluated agronomic.

Resumo: A baixa freqüência de genes recessivos deletérios e letais e a grande proporção de locos favoráveis já fixados nos híbridos comerciais, associado a uma seleção fenotípica eficiente entre e dentro de linhagens pode permitir a obtenção de híbridos promissores. Em média, são gastos de 8 a 10 anos para que um novo híbrido chegue ao mercado, o que implica diretamente no custo final das sementes. Para reduzir esse tempo é interessante viabilizar a utilização de linhagens parcialmente endogâmicas nos cruzamentos para agilizar o processo de obtenção de híbridos superiores e reduzir os custos da produção de sementes híbridas. Diante da necessidade de identificar híbridos de destaque e de encontrar alternativas que conduzam à redução dos custos e do tempo para a obtenção de sementes híbridas, o objetivo desse trabalho foi avaliar o potencial de linhagens parcialmente endogâmicas de milho com três (S3) e quatro (S4) gerações de autofecundação, obtidas de híbridos simples comerciais, com relação à heterose dos híbridos resultantes / Abstract: The low frequency of deleterious recessive and lethal genes and the large proportion of favorable loci already set in commercial hybrids combined with an efficient phenotypic selection among and within strains may allow the achievement of promising lines. On average, spending 8 to 10 years for a new hybrid to reach the market, which directly implies the final cost of the seeds. To reduce this time it is interesting to enable the use of partly inbred lines at intersections to expedite the process of obtaining superior hybrids and reduce the costs of producing hybrid seeds. Faced with the need to identify hybrids highlighted and to find alternatives that lead to the reduction of costs and time required for the production of hybrid seeds, the purpose of this study was to evaluate the potential of partly inbred lines of maize with three (S3) and four (S4) generations of selfing, obtained from commercial single cross hybrids, with respect to the follow-on hybrid heterosis / Orientador: José Roberto Moro / Coorientador: Flávio Trevizoli Silveira / Banca: Herberte Pereira da Silva / Banca: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Mestre

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-06-08T20:29:50Z No. of bitstreams: 2 Tese - Alex Silva da Cruz - 2015.pdf: 4189617 bytes, checksum: f21e8815a51e44f144dd811005f32bdd (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-06-09T11:41:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Alex Silva da Cruz - 2015.pdf: 4189617 bytes, checksum: f21e8815a51e44f144dd811005f32bdd (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-09T11:41:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Alex Silva da Cruz - 2015.pdf: 4189617 bytes, checksum: f21e8815a51e44f144dd811005f32bdd (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) Previous issue date: 2015-10-19 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Genomic selection in a dairy cattle breeding is a new strategy in national livestock. Genome wide association study (GWAS) is known as a strategy that involve the use of molecular markers panels distributed throughout the genome which are selected for the identification of chromosomal regions that are important for the interest traits. The aim of this study was apply the GWAS strategy for 305-day milk yield in Girolando cows. We did the genotype from 404 Girolando and after quality control analysis remained 337 individuals and 45.622 markers. The GWAS analysis resulted in 52 SNPs associated to 305-day milk yield. Of these, 23 SNPs were linked to Known genes and only 3 SNPs were linked to NUB1, SLC24A2 and DGAT1 genes that already were associated with cattle lactation. The other SNPs have no relationships described in the cattle lactation literature. In addition, the milk production QTL analysis resulted in 52 SNPs and 14 genes linked or close to 1Mb of the SNP marker. The ARS-BFGL-NGS-414 SNP on BTA19 at 47.9Mbp is located near to GH1 gene. This gene is commonly accepted as causal gene for Quantitative Character Locus of milk production mainly affecting the yield in liters and solid milk components. Thus, our data suggest that NUB1 and SLC24A2 genes could be considered as candidate genes to understand the milk production in Girolando breed. Like this DGAT1 and GH1 genes are valuable predictive markers to be added to genomic selection of dairy cattle in breeding program. / A seleção genômica, aplicada em bovino em associação à produção de leite é uma inovação estratégica na pecuária nacional, e que poderá se tornar uma ferramenta prática importante para a atividade. Estudos de Associação Ampla do Genoma (GWAs) caracteriza-se como uma estratégia que envolve o uso de painéis de marcadores moleculares distribuídos por todo o genoma, selecionados para a identificação de regiões dos cromossomos associadas com um fenótipo de interesse. O objetivo deste estudo foi aplicar a estratégia de GWAS para a característica de lactação total ajustada em 305 dias de vacas Girolando. Inicialmente, foram genotipados 404 vacas Girolando que após procedimento de controle de qualidade resultou em um total de 337 indivíduos e 45.622 marcador. O GWAS resultou em 52 SNPs associados a lactação ajustada em 305 dias. Destes, 23 SNPs apresentaram-se ligados a genes conhecidos e somente 3 SNPs estão ligados aos genes NUB1, SLC24A2 e DGAT1, descritos relacionados a lactação em bovinos. Os demais SNPs não apresentam relações descrita na literatura a lactação em bovinos. Para o QTL de produção de leite (MY), dos 52 SNPs, foram identificados 14 genes ligados ou próximos a 1Mb de distância do SNP marcador. Em particular, o SNP ARS-BFGL-NGS-414 associado ao QTL de lactação bovina, constituído de aproximadamente 47,9 Mbp localizado no BTA19 está localizado muito próximo do gene GH1 (Hormônio do Crescimento 1), comumente aceito como gene causal para o Lócus de Caráter Quantitativo (QTL) de produção de leite, afetando principalmente o rendimento em litros e componentes sólidos do leite. Dessa forma, nossos dados sugerem que os genes NUB1, e SLC24A2 poderiam ser considerados como genes candidatos para ajudar a explicar a produção de leite em animais da raça Girolando, assim como os genes DGAT1 e GH1, são considerados como valiosos marcadores preditivos a serem adicionados à seleção genômica do gado leiteiro em programas de melhoramento.

O composto GN-04 foi utilizado no presente trabalho, tendo por objetivo: a) avaliar o efeito do processo dispersivo em subpopulações de milho com diferentes tamanhos efetivos, e submetidas previamente à seleção divergente para alta e baixa produção; b) avaliar a capacidade de combinação e o potencial heterótico dessas subpopulações e c) estimar componentes da variância genética no composto GN-04, usando o esquema de cruzamento em cadeia. Um lote do referido composto foi plantado visando à obtenção de três diferentes progênies: S1, por autofecundação; irmãos germanos, cruzamento planta a planta e cruzamentos em cadeia, seguindo o esquema 1 x 2, 2 x 3 e 3 x 1. Foram obtidas 77 progênies S1, 75 de irmãos germanos e 72 cadeias, contituidas de três cruzamentos. As progênies de cada tipo foram avaliadas em ensaios distintos, em dois locais, de acordo com o delineamento em blocos casualizados, com três repetições. Os caracteres avaliados foram: altura da planta (AP), altura da espiga (AE), comprimento da espiga (CE), diâmetro da espiga (DE), peso de espigas (PE) e prolificidade (PR). Com base nos valores médios do caráter PE, foram selecionadas 10 progênies de irmãos germanos,10 de S1 e 10 cadeias, sendo cada grupo de materiais constituído das cinco progênies ou cadeias mais produtivas, e das cinco menos produtivas. A recombinação das progênies selecionadas ou cadeias ensejou a obtenção de subpopulações com diferentes tamanhos efetivos: N1, N2 e N3, que correspondem a taxas de endogamia de 50%, 25% e 17%, para S1’s, irmãos germanos e cadeias, respectivamente. Essas subpopulações foram avaliadas posteriormente com base no seu desempenho per se e em cruzamentos ‘topcrosses’ e dialélicos. Os resultados desta avaliação mostraram que o tamanho reduzido das subpopulações provocou o surgimento de valores médios inferiores ou superiores à média estimada da população original, em conseqüência da deriva genética. Os valores médios de todos os caracteres foram afetados pela redução no tamanho efetivo das subpopulações, em conseqüência da depressão por endogamia, a qual se expressou com mais intensidade no caráter PE: em subpopulações com N3 e N1, no nível de seleção positiva, o efeito da depressão foi de 5,20% e 20,07%, respectivamente, e no nível de seleção negativa, 15,98% e 55,76%, respectivamente. A seleção divergente entre subpopulações resultou em diferenciação genética suficiente para expressar heterose em cruzamentos entre subpopulações com o mesmo tamanho efetivo. As estimativas da variância aditiva do composto GN-04, com base na análise da variância conjunta dos experimentos com progênies de cruzamentos em cadeia, para os caracteres PE, CE, DE, PR, AP e AE foram, respectivamente: 128,00 (g/pl)², 1,490 (cm/esp.)², 0,1704 (cm/esp.)², 0,0200 (esp./pl)², 256,55 (cm/pl)² e 136,80 (cm/pl)². Estimativas negativas da variância aditiva foram obtidas para os caracteres CE, DE, AP e AE; para os caracteres PE e PR as estimativas foram 185,00 (g/pl)² e 0,0188 (esp./pl)², respectivamente. O delineamento de cruzamentos em cadeia de tamanho 3, tendo em vista a facilidade de execução, pode ser uma alternativa a delineamentos de execução mais complexa para estimar componentes da variância. / The composite GN-04 was used in the present work with the objetives: a) evaluation of the effect of the dispersive process in subpopulations of maize with different effective sizes, and submitted to divergent selection for higth and low yield; b) evaluation of the combining ability and heterotic potential of the subpopulations; and c) to estimate components of the genetic variance in the composite GN-04, using chain crosses. A pollination block of the base population was planted for the development of three different progenies: S1 progenies obtained by selfing, full-sib progenies obtained by plant-to-plant crosses, and chain crosses following the scheme: 1 x 2, 2 x 3 e 3 x 1. The numbers of progenies were: 77 S1´s, 75 full-sibs and 72 chains represented by three crosses in each chain. The progenies from each type were evaluated in different experiments in two locations following the randomized complete block design with three replications. The following traits were analysed: plant height (AP), ear height (AE), ear length (CE), ear diameter (DE), ear weight (PE) and prolificacy (PR). Observed means of PE were used for selection of 10 full-sib progenies, 10 S1´s progenies and 10 complete chains, each group being represented by five high yielding and five low yielding progenies or chains. The recombination of the selected progenies or chains, individually, led to the development of subpopulations with different effective sizes: N1, N2 and N3, corresponding to inbreeding rates of 50%, 25% and 17% for S1´s, full-sibs and chain crosses, respectively. The subpopulations were later evaluated based on their performance per se, in the topcrosses and in diallel crosses. Results showed that the reduced size of the subpopulations led to changes in the means of the evaluated traits, which were smaller or higher than the original means as a consequence of genetic drift. On the average, all traits showed a decrease in the mean as a consequence of inbreeding depression. The most depressive trait was PE and the depression effects in subpopulations with N3 and N1 were 7.17% and 22.94% in the positive selection and 16.85% and 55.91% in the negative selection. The divergent selection among subpopulations led to a genetic differentiation sufficient for the expression of heterosis in crosses between subpopulations in the same level of effective size. The estimates of the additive genetic variance in the composite GN-04 were obtained from the analysis of chain crosses. The estimates for the traits PE, CE, DE, PR, AP and AE were, respectively: 128.00 (g/pl)², 1.490 (cm/esp.)², 0.1704 (cm/esp.)², 0.0200 (esp./pl)², 256.55 (cm/pl)² and 136.80 (cm/pl)². Negative estimates of the dominance variance were obtained for the traits CE, DE, AP and AE; for the traits PE and PR, the estimates were 185.00 (g/pl)² and 0.0188 (esp./pl)², respectively. The mating design based on chain crosses with size 3 was considered feasible and easy to be used and can be a reliable alternative as compared with other more complex designs.

Habitat fragmentation is one of the main threats to semi-natural grasslands all over Europe, causing reductions in both numbers of populations and numbers of individuals withinpopulations. Small isolated populations are particularly vulnerable to fluctuations that reducespopulation size and could lead to loss of genetic variation due to inbreeding depression, orfixation of harmful alleles due to genetic drift. The aim of this study was to investigate if thecritically endangered eyebright Euphrasia stricta var. suecica experiences pollen limitation,inbreeding depression and heterosis or outbreeding depression. Low pollen limitation waspredicted as well as low inbreeding depression due to high selfing rate. Outbreedingdepression or heterosis was expected based on previous studies indicating strong geneticdifferentiation among populations. This study was conducted in two traditionally managedmeadows in the central part of Gotland, Sweden, using supplemental hand-pollinations andcontrolled crosses. Individuals were collected when the flowering period was over and seedswere counted and weighed. There were no signs of either pollen limitation, inbreedingdepression, heterosis or outbreeding depression in any of the two wooded hay meadows. Thedegree of autonomous selfing was high, indicating that E. stricta var. suecica is not dependenton pollinators for seed production. A significant difference between the meadows was foundin proportion of viable seeds. As there were no signs of local adaptation, individuals could betranslocated between the two studied populations or seed sowings could be used to increasepopulation size. However, before such conservation efforts are undertaken, it is important toconduct further studies that investigate several populations including more life-stages.

La variabilité phénotypique existante au sein d’une population est d’une importance cruciale ; elle permet l’adaptation à de nouvelles conditions par la sélection naturelle de traits bénéfiques. La variabilité phénotypique est le résultat du polymorphisme génétique de chaque individu, couplé à l’influence de divers facteurs environnementaux. Ces travaux ont pour objectif d’élucider quels sont les facteurs génétiques responsables de la variabilité phénotypique de chaque individu afin de comprendre comment celle-ci évolue de génération en génération et peut s’accentuer au-delà des prédispositions parentales. Finalement, les résultats obtenus seront utilisés pour prédire un phénotype à partir d’un génotype inconnu. Nous avons utilisé des techniques de phénomique et de génomique de haut débit pour décomposer avec une précision inédite la variabilité phénotypique d’une large population de souches diploïdes de Saccharomyces cerevisiae. Le génotype exact de plus de 7000 souches uniques a ainsi été obtenu via le croisement et le séquençage de souches haploïdes distinctes. Nous avons mesuré la capacité de croissance de ces souches et identifié les composants génétiques influant sur ce trait. De plus, nous avons identifié des « loci de caractères quantitatifs » additifs et non-additifs, et étudié la fréquence du phénomène d’hétérosis et ses mécanismes. Enfin, en utilisant les données phénotypiques et génotypiques de la même population de levures, nous avons pu prédire les traits de chaque individu avec une presque parfaite exactitude. Ces travaux ont ainsi permis d’identifier avec précision les facteurs génétiques modulant la variation phénotypique d’une population diploïde, et de prédire un trait à partir du génotype et de l’ensemble des données phénotypiques. En plus de ce projet, nous travaillons aussi sur l’identification des bases génétiques à l’origine de la non-viabilité des gamètes, ainsi que sur la compréhension des caractères complexes chez des souches hybrides intra-espèce. De par l’étude de 9000 gamètes séquencés issus de six hybrides différents, nous avons pour objectif de caractériser leur profil de recombinaison et d’observer quelle est l’influence du fond génétique sur ce dernier. De plus, nous avons caractérisé la capacité de croissance de ces gamètes dans neuf conditions environnementales différentes et nous prévoyons de disséquer l’architecture génétique de ces traits dans différents fonds génétiques. / The phenotypic variation between individuals in a population is of crucial importance. It allows populations to evolve to novel conditions by the natural selection of beneficial traits. Variation in traits can be caused by genetic or environmental factors. This work endeavors to study the genetic factors that underlie phenotypic variation in order to understand how variation can be created from one generation to the next; to know what genetic mechanisms are most prominent; to learn how variation can extend beyond the parents; and finally, to use this in order to predict phenotypes of unknown genetic constellations. We used large scale phenomics and genomics to give an unprecedented decomposition of the phenotypic variation in a large population of diploid Saccharomyces cerevisiae strains. Constructing phased outbred lines by large scale crosses of sequenced haploid strains allowed us to infer the genetic makeup of more than 7,000 colonies. We measured the growth of these strains and decomposed the phenotypic variation into its genetic components. In addition, we mapped additive and nonadditive quantitative trait loci, we investigated the occurrence of heterosis and its genetic basis, and using the same populations we used phenotypic and genetic data to predict traits with near perfect accuracy. By using the phased outbred line approach, we succeeded in giving a conclusive account of what genetic factors define phenotypic variation in a diploid population, and in accurately predicting phenotypes from genetic and phenotypic data. Beyond the phased outbred line project, I am currently investigating the genetic basis of gamete inviability and complex traits in intraspecies yeast hybrids. Using 9,000 sequenced gametes from six different hybrids we aim to characterize their recombination landscape and how the genetic background influences it. Furthermore, we have phenotyped these gametes in nine conditions and will dissect the genetic architecture of these traits across multiple genomic backgrounds.