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Seleção sequencial em cana-de-açúcar. / Sequential selection in sugarcane.

José Antonio Bressiani 28 August 2001 (has links)
Com a finalidade de avaliar o programa de melhoramento da cana-de-açúcar, este trabalho teve como objetivos: determinar o grau da interação famílias x ambientes (FA); comparar métodos de seleção na etapa inicial em termos de resposta esperada à seleção; e propor o método de seleção sequencial modificado. Para isso, foram avaliados 4752 'seedlings' pertencentes a 33 famílias (irmãs germanas e meia irmãs), em dois locais do Estado de São Paulo, Piracicaba e Jaú. Os caracteres estimados foram altura e diâmetro dos colmos, número de perfilhos, Brix % caldo da cana, toneladas de cana por hectare (TCH) e toneladas de Brix por hectare (TBH). Para validar a resposta esperada à seleção sequencial modificada, 40 famílias foram selecionadas por este método e os clones foram multiplicados até a etapa III do programa de melhoramento, a fim de fornecer a resposta realizada à seleção. Os resultados mostraram interação FA significativa para todos os caracteres avaliados. A opção por uma seleção específica implicou em aumentos de ganhos de 4,1% e 5,8% para TBH, para Piracicaba e Jaú, respectivamente, em relação à seleção de famílias generalistas, ou seja, baseada na média dos dois locais. A seleção sequencial modificada, proposta neste trabalho e a seleção combinada através de índices apresentaram pouca vantagem em relação à seleção massal, na condição de seleção direta (sem avaliação visual). Nessas mesmas condições, a seleção sequencial tradicional e a australiana foram inferiores à seleção massal, em termos de progresso esperado, para todos os caracteres. Incluindo a seleção indireta (com avaliação visual) o método sequencial modificado foi sempre superior à seleção massal, para os principais caracteres avaliados (TCH e TBH). Para os métodos australiano e tradicional, houve vantagem apenas quando a correlação genética entre a avaliação visual e o caráter principal foi igual ou inferior a 0,7. Dessa forma, e devido à dificuldade prática de utilizar índices (seleção combinada), concluiu-se que o método proposto de seleção sequencial modificada é perfeitamente viável, sendo, portanto, recomendado. Na comparação entre as respostas estimada e a realizada com a seleção sequencial modificada, houve concordância dos resultados, na condição de correlação genética igual a 0,62. Isso veio reforçar a confiabilidade das estimativas obtidas no trabalho, bem como assegurar as vantagens do método proposto sobre os demais aqui apresentados. Se considerada uma correlação genética entre o critério de avaliação visual e o caráter principal variando entre 0,5 a 0,7, a superioridade do método proposto em relação ao massal é da ordem de 3% a 5%, em termos de ganho esperado para TCH, em um ciclo de seleção. Para alcançar estes mesmos ganhos com a seleção massal, ter-se-ia que aumentar a população inicial entre 36% a 100%. Alternativamente, mantendo os mesmos tamanhos populacionais, o número provável de clones no final do processo seletivo seria aumentado em 85% a 150%, apenas com a substituição do método de seleção massal pelo sequencial modificado na etapa inicial. / Aiming at the evaluation of the sugarcane breeding program, this study had the following objectives: to determine the degree of the family x environments interaction (FE); to compare selection methods in the initial phase, in terms of expected response to selection, and to propose the modified sequential selection method. For this, 4752 seedlings, originated from 33 families (full-sibs and half-sibs), were evaluated in two sites of the State of São Paulo: Piracicaba and Jaú. The traits evaluated were stalk height and diameter, number of stalks, Brix % cane juice, tons of cane per hectare (TCH) and tons of brix per hectare (TBH). To validate the expected response to the modified sequential selection, 40 families were selected by this method and the clones were multiplied until phase III of the breeding program and the realized gains in selection measured. The results showed significant FE interaction for all evaluated traits. The option for a site specific selection would increase gains by 4.1% and 5.8% for TBH in Piracicaba and Jau, respectively, in relation to the generalized family selections, that is, based on the average of the two sites. The proposed modified sequential selection and the combined selection using indices showed little advantage over the mass selection using direct selection (without visual selection). In these conditions, the traditional sequential selection and the Australian one were inferior to the mass selection, in terms of expected progress, for all traits. Allowing for the indirect selection (with visual selection) the modified sequential method was always superior to the mass for the main traits evaluated (TCH and TBH). The Australian method and the Traditional one, were advantageous in relation to the mass selection only when the genetic correlation between visual selection and the main trait was equal or inferior to 0.7. For this reason, and given the practical difficulty of applying indices (combined selection), it was concluded that the proposed method of modified sequential is perfectly viable and was reccommended. Comparing the estimated and realized response of the modified sequential selection, there was correspondence of results, given rG equals to 0.62. This result confirmed the reliance of the estimates obtained in this study, and assured the advantages of the proposed method over those compared. Considering a genetic correlation (rG), between the visual selection criterion and the main character, varying from 0.5 to 0.7, the superiority of the proposed method over the mass one, varies from 3 to 5%, in terms of expected gain, for TCH in one selection cycle. To obtain these same gains with mass selection, one would have to increase the initial population between 36% and 100%. Alternatively, keeping the same population sizes, the likely number in the end of the selection process would be increased in 85% to 150%, just with the substitution of the method of mass selection by the modified sequential one, in the initial phase.
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Distribuição empírica dos autovalores associados à matriz de interação dos modelos AMMI pelo método bootstrap não-paramétrico / Empirical distribution of eigenvalues associated with the interaction matrix of the AMMI models for non-parametric bootstrap method

Kuang Hongyu 25 January 2012 (has links)
A interação genótipos ambientes (G E) foi definido por Shelbourne (1972) como sendo a variação entre genótipos em resposta a diferentes condições ambientais. Sua magnitude na expressão fenotípica do caráter pode reduzir a correlação entre fenótipo e genótipo, in acionando a variância genética e, por sua vez, parâmetros dependentes desta, como herdabilidade e ganho genético com a seleção. Estudos sobre a adaptabilidade e a estabilidade fenotípica permitem particularizar os efeitos da interação GE ao nível de genótipo e ambiente, identificando a contribuição relativa de cada um para a interação total. Varias metodologias estatísticas têm sido propostas para a interpretação da interação G E proveniente de um grupo de cultivares testados em vários ambientes. Entre essas metodologias destaca-se os modelos AMMI (Additive Main Eects and Multiplicative Interaction Model), que vem ganhando grande aplicabilidade nos últimos anos. O modelo AMMI e um método uni-multivariado, que engloba uma analise de variância para os efeitos principais, que são os efeitos dos genótipos (G) e os ambientes (E) e para os efeitos multiplicativos (interação genótipo ambiente), para a qual utiliza-se a decomposição em valor singular (DVS). Essa técnica multivariada baseia-se no uso dos autovalores e autovetores provenientes da matriz de interação G E. Araujo e Dias (2005) verificaram o problema de superestimação e subestimação de autovalores estimados da maneira convencional. Efron(1979) propôs uma técnica de simulação numérica chamada Bootstrap para avaliar tais incertezas. O método Bootstrap consiste em uma técnica de reamostragem que permite aproximar a distribuição de uma função das observações a partir da distribuição empírica dos dados. Por meio desse método, podem ser estimados o erro-padrão da referida estimativa e os intervalos de confiança, com o intuito de fazer inferência sobre os parâmetros em questão. O objetivo deste trabalho será estudar o efeito da interação G E, avaliar a adaptabilidade e estabilidade de genótipos em diferentes ambientes através do modelo AMMI, com as analises através dos gráficos Biplot, encontrar a distribuição empírica dos autovalores e calcular o intervalo de confiança através o método Bootstrap não-paramétrico. Com o estudo da distribuição empírica dos autovalores poder-se-a validar os testes de hipóteses propostos na literatura para identificar o numero de IPCA (Incremental Principal Component Analysis) para seleção dos modelos AMMI, e propor um teste para seleção dos modelos. / The genotype environment interaction (G E) was dened by Shelbourne (1972) as the variation among genotypes in response to dierent environmental conditions. Its magnitude in phenotypic expression of the character can reduce the correlation between genotype and phenotype, in ating the genetic variance and, in turn, dependent on the parameters, as heritability and genetic gain with selection. Studies on the phenotypic adaptability and stability allow particularize the eects of interaction G E at the level of genotype and environment, identifying the relative contribution of each to the total interaction. There are several methods of analysis and interpretation for the genotype environment interaction from a group of genotype tested in several environments. These methods include AMMI models (Additive Main Eects and Multiplicative Interaction Model), coming gaining great applicability past years. The AMMI model is a uni-multivariate method, that includes an analysis of variance for the main eects (the eects of the genotypes (G) and environments (E)) and assumes multiplicative eects for the genotype environment interaction, using a singular value decomposition (DVS). This method estimates the eigenvalues and eigenvectors deriving from the matrix of genotype environment interaction. Araujo and Dias (2005) found an overestimation and underestimation problem with the eigenvalues in the conventional way. Efron (1979) proposed a numerical resampling technique called Bootstrap for evaluate such uncertainties. The bootstrap method consists of a resampling technique that allows to approximate the distribution of a function of the observations from the empirical distribution of the data. Through this method, can be estimated by the standard error of that estimate and condence intervals, in order to make inferences about the parameters in question. The aim of this work was to study the eect of genotype environment interection (GE), evaluate the adaptability and stability of genotypes in dierent environments through the AMMI model, with the analysis through the Biplot graphs, nd the empirical distribution of eigenvalues and calculate the condence interval using the nonparametric bootstrap, the study of the empirical distribution of eigenvalues serve to validate the hypothesis tests proposed in the literature to identify the number of IPCA (Incremental Principal Component Analysis) for selecting the AMMI model, and propose a test for selection of models.
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Interação genótipo-ambiente na densidade de gemas e comprimento de ramos de pessegueiro / Interaction genotype-environment in bud density and lenght shoot in peach tree

Penso, Gener Augusto 05 February 2016 (has links)
A instabilidade do ambiente entre anos nas regiões subtropicais dificulta a obtenção de genótipos de pessegueiro com ampla adaptação e produção estáveis, contribuindo para limitar o cultivo. A instabilidade do clima pode afetar etapas de desenvolvimento como a formação de gemas florais e vegetativas. A compreensão dos fatores que controlam a formação das gemas apresenta fundamental importância para a busca de soluções efetivas a esses problemas. Nesse sentido o objetivo desse trabalho foi verificar o efeito da temperatura, umidade relativa do ar e precipitação sobre a densidade de gemas e comprimento de ramos produtivos (brindilas) e identificar genótipos com maior adaptabilidade e estabilidade quanto à essas variáveis. Foram utilizados 12 genótipos de pessegueiro cultivados no pomar experimental da Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Câmpus Pato Branco no clima do tipo Cfa segundo a classificação de Köppen. Dados horários de precipitação, temperaturas e umidade relativa do ar foram coletadas através da estação meteorológica do SIMEPAR. Foram selecionadas três plantas por genótipo (repetições), marcando-se cinco ramos por planta, em maio de cada ano. Foram realizadas avaliações de comprimento de ramos, CR (cm), contagem do número de gemas florais (GF) e vegetativas (GV). Também foi calculada a relação entre GF/GV e as densidades de gemas vegetativas (DGV) e florais (DGF). As avaliações foram realizadas anualmente, de 2007 a 2014. Com esses dados foram realizadas análises de adaptabilidade e estabilidade utilizando metodologia Biplot e analise de correlação (Pearson) com as variáveis climáticas. Utilizaram-se os dados climáticos para cálculo das somas das horas com temperaturas inferiores a 20 °C, temperaturas entre 20-25 °C, temperaturas entre 25-30 °C e acima 30 °C, considerando o período de 1° de agosto à 28 de fevereiro do ano seguinte. Os coeficientes de correlação de Pearson foram utilizados na análise de trilha, sendo utilizado GF e DGF como variáveis básicas. Para o CR, GV e GF as maiores médias ocorreram no ciclo de 2009/10. Os genótipos ‘BRS Kampai’ e ‘BRS Libra’ apresentaram os maiores CR. São considerados estáveis e adaptados quanto ao CR os genótipos ‘Casc. 967’ e ‘BRS Kampai’. Observou-se correlação negativa do CR e de GV para a Σh <20 °C, Σh >30 °C e Σh com URA <50% e correlação positiva entre essas variáveis e a Σh de 25-30 °C e Σh com URA >70%. Na avaliação de GV ‘Cons. 681’ e ‘Casc. 1055’ podem ser considerados adaptados e estáveis. A menor média foi apresentada pelo genótipo ‘Sta. Áurea’ que pode ser considerado estável. Na avaliação de GF são considerados adaptados os genótipos ‘BRS Bonão’, ‘Casc. 1055’, ‘Cons. 681’, com adaptabilidade a todos os ciclos avaliados. Na análise de trilha houve resposta de efeito direto da Σh de 25-30 °C sobre as gemas florais. Na avaliação de DGV e DGF as variações são devido ao efeito genético. Os genótipos mais adaptados e estáveis para DGV foram ‘T. Beauty’, ‘T. Snow’, ‘Casc. 1055’ e ‘Cons. 681’. Para DGF foram adaptados e estáveis os genótipos ‘BRS Bonão’, ‘Casc. 1055’, ‘Cons. 681’. As variáveis de CR e GV são fortemente influenciadas pelo ambiente. GF é fortemente influenciado pelo fator genético e moderadamente influenciado pelo fator ambiental. DGV e DGF são influenciadas basicamente pelo fator genético. / The instability of environment between years in climates of subtropical regions difficult to obtain peach trees genotypes with wide adaptation and stable production, contributing to poor crop. The climate instability can affect development stages as flower bud and vegetative bud formation. The factors understanding that control the bud formation, presents elementary importance for effective solutions search to these problems. The objective this work is verify the temperature effect, relative humidity and rainfall on bud density and length shoot (Brindilas) and identify genotypes with more adaptability and stability for this character. Was used 12 peach trees genotypes growing in experimental orchard in the Technology Federal of Paraná State University, Campus Pato Branco with Cfa Köppen climate according to the classification. Data of rainfall, hourly temperature were collected by the weather station of Simepar. They were used three plants for genotype (rehearsal), identify five shoots per tree, in May of each year. Were carried analyzes of length shoot CR (cm), count number of flower bud (GF) and vegetative bud (GV). Also calculated the relationship between GF/GV and flower bud density and vegetative bud density. Evaluations were performer annual 2007-2014. With these data adaptability and stability analyzes were performed using Biplot methodology and correlations analyzes (Pearson) with climates variables. They used the weather data to calculate the sums of hours with temperatures below 20 °C, temperatures between 20-25 °C, temperature between 25-30 °C and temperature above 30 °C, considering the period of August 1fst of the previous period to February 28 of the following year. Pearson correlation coefficients were used for path analysis, GF and DGF as basic variables. For CR, GV and GF the highest average occurred in 2009/10 period. The genotypes ‘BRS Kampai’ and ‘BRS Libra’ highest CR. They are considered stable and adapted as the CR genotypes ‘Casc. 967’ and ‘BRS Kampai’. There was negative correlation between CR and GV for Σh <20 ° C, Σh> 30 °C and Σh with URA <50% and positive correlation between these variables and Σh 25-30 °C and Σh with URA> 70%. The evaluation of GV ‘Cons. 681’ and ‘Casc. 1055’ can be considered adapted and stable. The lowest average was presented by the genotype ‘Sta. Áurea’ though the genotype is also stable. In GF evaluation genotypes are considered adapted ‘BRS Bonão’, ‘Casc. 1055’, ‘Cons. 681’ with adaptability to all evaluated period. In path analysis was direct effect Σh 25-30 °C on flower bud density. In evaluating DGV and DGF and the variations are due to genetic effect. The most adapted and stable genotypes for DGV were ‘T. Beauty’, ‘T. Snow’, ‘Casc. 1055’ and ‘Cons. 681’. CR and GV variables are strongly affected by environment. GF is strongly affected by genetic conditions and moderately affected by environment. DGV and DGF are affected basically by genetic conditions.
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Ganho genético e seleção em gerações iniciais e em linhagens de trigo por meio de modelos mistos / Genetic gain and selection in early generations and lines of wheat using mixed models

Woyann, Leomar Guilherme 05 March 2018 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A cultura do trigo apresenta grande importância econômica no Brasil, sendo que o país produz, anualmente, cerca de 6 milhões de toneladas. Contudo, essa produção é suficiente para atender a aproximadamente 50% da demanda. Essa situação faz com que o Brasil seja um dos maiores importadores deste cereal. O melhoramento genético da cultura tem grande importância na tentativa de aumentar a produção, a produtividade e a qualidade do trigo produzido. Além disso, aumentar a eficiência dos programas de melhoramento é essencial para reduzir os custos e o tempo necessários para o lançamento de novas cultivares. Neste sentido, soluções para a correta avaliação em etapas onde há baixa disponibilidade de sementes ou onde o número de linhagens a serem avaliadas é grande são necessárias. Desta forma, os objetivos deste trabalho foram: 1) avaliar o ganho genético para a cultura do trigo no Brasil, nos últimos 30 anos; 2) utilizar modelos aditivo-dominantes, em gerações F2 e F3, na identificação dos melhores genitores para caracteres de importância agronômica e 3) avaliação de linhagens homozigotas em ensaios multi-ambientes sem o uso de repetições. Para todas estas análises foram utilizados modelos mistos. Para a análise do ganho genético foram utilizados dados de 126 cultivares brasileiras de trigo, lançadas entre 1984 e 2014. Estas cultivares foram avaliadas em 187 ensaios, conduzidos em 25 locais, distribuídos na Região Sul do Brasil, entre os anos de 2002 e 2014. O ambiente foi responsável por mais de 70% da variância e os genótipos apresentaram comportamento similar entre os ambientes avaliados. O ganho genético obtido foi de 33,9 kg ha-1 ano-1,o que representa 1,28% ano-1. Além disso, os dados indicam que não há estagnação no ganho genético para a cultura do trigo no Brasil. A análise, via modelos aditivo-dominantes, de gerações heterozigotas (F2 e F3) indicou cultivares e linhagens que apresentam elevados efeitos aditivos, que são os principais efeitos quando o objetivo é o lançamento de cultivares a partir de linhagens homozigotas. Para o caractere rendimento de grãos, se destacaram as cultivares TBIO Seleto, Mirante, TBIO Mestre, Sinuelo e Ametista, além das linhagens UTFT 0932, UTFT 0908 e UTFT 0944. Na análise de adaptabilidade, estabilidade e produtividade, as linhagens UTFT 1110, UTFT 1608, UTFT 1620, UTFT 1025 e UTFT 1691 se destacaram e seriam selecionadas em cada um dos ambientes avaliados. Contudo, as linhagens UTFT 1634 e UTFT 1405 estiveram entre as linhagens selecionadas no conjunto de locais, mas poderiam ter sido eliminadas caso o ensaio tivesse sido conduzido em um único local, com repetições. / Wheat crop has great economic importance in Brazil, producing annually about 6 million tons. However, this production is only sufficient to meet ~ 50% of demand. This condition makes Brazil one of the largest importers of this cereal worldwide. The genetic improvement of this crop has great importance in the attempt of increasing production, productivity and quality of wheat produced in Brazil. Furthermore, increasing the efficiency of breeding programs is essential to reduce costs and the time required to release new cultivars. In this sense, solutions are necessary for the correct evaluation in steps where limited seeds are available or where the number of lines to be evaluated is very hight. Thus, the objectives of this work were: 1) to evaluate the genetic gain of wheat crop in Brazil in the last 30 years; 2) to use additive-dominant models, in generations F2 and F3, to identify the best parents for agronomic traits, i.e., grain yield, hectoliter mass, thousand grain mass, plant height, among others; and 3) to evaluate homozygous lines in designs without repetitions in multi-environment trials. For all analyses, mixed models were used. Genetic gain was evaluated using 126 Brazilian wheat cultivars released 1984 and 2014. Cultivars were evaluated in 187 trials, conducted in 25 locations, distributed in the Southern Region of Brazil, between 2002 and 2014. Environment effects was responsible for more than 70% of the total variance and genotypes presented similar behavior in the evaluated environments. Genetic gain was of 33.9 kg ha-1 year-1, which represents 1.28% year-1. Moreover, results indicated absence of stagnation in the genetic gain in Brazil. Analysis of F2 and F3 generations with additive-dominant models show cultivars and lines with high additive effects, which are the main effects when the objective is to release homozygous cultivars. For grain yield, cultivars TBIO Seleto, Mirante, TBIO Mestre, Sinuelo and Ametista and lines UTFT 0932, UTFT 0908 and UTFT 0944 presented the highest additive effects. In the analysis of adaptability, stability and productivity, lines UTFT 1110, UTFT 1608, UTFT 1620, UTFT 1025 and UTFT 1691 would be selected in each of the evaluated environments. However, lines UTFT 1634 and UTFT 1405 were among the selected lineages in the set of locations but could have been eliminated if the trial had been conducted in a design with replications in a single location.
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Avaliação da mancha de ramulária em três safras no Mato Grosso e sua influência na produção e qualidade de fibra do algodoeiro

Moura, Joyce Dorneles 12 July 2016 (has links)
O Mato Grosso é o estado responsável pela maior área plantada e elevada produtividade de caroço e fibra de algodão do país. Apesar das terras que possuem fertilidade entre as melhores do Brasil e das condições climáticas que propiciaram sua soberania como produtor de algodão, algumas pragas, condições climáticas atípicas e doenças como a mancha de ramulária contribuem para a queda de produtividade e, por conseguinte, de área plantada ano após ano. Os programas de melhoramento são a melhor forma, em longo prazo, de resolver ou pelo menos amenizar esses problemas. Além da resistência às doenças, o desempenho quanto ao rendimento e à qualidade da fibra e a adaptabilidade do material à região são importantes. A mancha de ramulária, até meados de 2007, era uma doença secundária que não incomodava os produtores; porém, com o advento de variedades resistentes a outras de enfermidades que até então eram primárias, houve uma diminuição da necessidade de aplicação de fungicidas na lavoura. Com a migração da cultura para outros estados além de São Paulo e Paraná, essa doença encontrou condições mais favoráveis ao seu surgimento e começou a incomodar os produtores e interferir de forma bastante negativa na produtividade. O objetivo deste trabalho foi analisar o comportamento de três variedades comerciais de algodão no que concerne à severidade causada pela mancha de ramulária durante três safras no estado do Mato Grosso – 2011-12, 2013-14 e 2014-15 – e sua influência na produção, no rendimento e na qualidade de fibra. Foram testadas três variedades comerciais (DeltaOPAL, FM993 e FMT705) em três fazendas situadas nos municípios de Campo Verde, Sapezal e Primavera do Leste. As avaliações para quantificação da mancha de ramulária foram realizadas aproximadamente 100 dias após a emergência. Além da colheita para avaliar a produção de algodão em caroço por parcela, uma amostra de 30 capulhos foi utilizada, com vistas a realizar os testes de porcentagem e qualidade de fibra. De acordo com os resultados observados, a safra 2011-12, que historicamente obteve melhores condições climáticas (beneficiando tanto a cultura quanto a doença), apresentou os maiores valores de produção do algodão em caroço e de severidade à mancha de ramulária. Os índices de porcentagem e qualidade de fibra estudados tiveram certas diferenças entre variedades e localidades, mas se mantiveram dentro dos valores aceitáveis de mercado. No que tange à resposta a essa moléstia, foi possível observar, durante as três safras, um comportamento estável das variedades testadas, sendo a FMT705 a mais resistente e a DeltaOPAL de maior suscetibilidade à mancha de ramulária. / Mato Grosso is the Brazilian state responsible for the largest planted area and greatest productivity of cotton seed and fiber in the country. Although Mato Grosso has the best fertility areas of the country and favorable weather conditions for cotton development and production, some pests, atypical climatic conditions and diseases, such as Ramularia, have contributed to the decrease of yield and planted area. Breeding programs are the best way, in the long term, to solve these problems. In addition to resistance to disease, improving performance in terms of yield and fiber quality, and adaptability of the germplasm to the region are very important. Ramularia was considered a secondary disease until 2007; however, with the advent of other varieties resistant to diseases that were previously primary ones - Ramulose, for example – a decreased need for fungicide application occurred and, furthermore, the migration of the crop to other states besides São Paulo and Paraná, with more favorable conditions for disease, it began to bother producers and interfere negatively on productivity. This study analyzed the behavior of three commercial cotton varieties in relation to the severity caused by Ramularia during 3 crops in Mato Grosso state: seasons 2011-12, 2013-14 and 2014-15, and its influence on production, yield and fiber quality. Three commercial cotton varieties, DeltaOpal, FM993 and FMT705, were tested in three farms located in Campo Verde, Sapezal and Primavera do Leste. The evaluations to quantify Ramularia were performed approximately 100 days after emergence. A sample of 30 bolls was used to perform tests of lint percent, fiber quality, and the production per plot was quantified through weighing plot production. According to results observed, the 2011-12 season - historically presented the best weather, benefiting both the culture and the disease - was the one with the greatest cotton production values and also the greatest severity values for Ramularia. The values of lint percent and fiber showed some differences among cultivars and locations, but still remained within acceptable market values. Regarding the response to the disease, it was observed during the three seasons a stable behavior of the tested varieties, FMT705 performed as the most resistant, while DeltaOPAL was the most susceptible to Ramularia. / Dissertação (Mestrado)
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Comparação de métodos no estudo da estabilidade fenotípica / Comparasion of methods for the study of phenotypic stability

Elton Rafael Mauricio da Silva Pereira 04 February 2010 (has links)
É comum o estudo da estabilidade fenótipica em genoótipos de cana-de-açúcar. Varias são as metodologias para estudar a interação genótipos x ambientes (G x E). O desafio para os melhoristas é encontrar variedades de cana-de-açúcar com desempenho superior em diversos ambientes, ou seja, que sejam altamente produtivas e também responsivas com a melhoria do ambiente. O estudo das metodologias permite verificar se determinada técnica biométrica é eficiente para expressar o comportamento de genótipos em vários ambientes e tambem permite aprimorá-las para que as conclusões sejam mais confiáveis. Este trabalho teve como objetivo comparar dois métodos de regressão utilizados para avaliar a estabilidade fenótipica em variedades de cana-de-açúcar: o linear, de Cruz, Torres e Vencovsky (1989) e o não-linear, de Toler e Burrows (1998). Foram utilizados dados da variável tonelada de cana por hectare - TCH, fornecidos pelo Programa de Melhoramento Genetico da Cana-de- Acucar da UFSCar, compreendendo sete locais e 18 genótipos de cana-de-açúcar. Quando se realizou o enquadramento dos genotipos nos diferentes grupos, 17 genotipos dos 18 avaliados enquadraram-se nos mesmos grupos em ambos os métodos. Os coeficientes de determinação foram similares, sendo que 11 genótipos apresentaram melhor ajuste ao modelo de Cruz et al., enquanto que este numero foi de sete para o modelo de Toler e Burrows. As análises indicaram que ambas metodologias produziram resultados similares. / It is common to study the phenotypic stability of sugarcane genotypes. There are several methods to study the genotype by environment interaction . The challenge for breeders is to nd varieties of sugarcane with superior performance dierent environments, i.e, that are highly productive and responsive to environmental improvement. The study of methodologies allows to verify whether certain technique biometrics is eective to express the behavior of genotypes in several environments and it also allows improving them so that the conclusions are more reliable. This study aimed to compare two regression methods used to evaluate the phenotypic stability of varieties of sugarcane: the linear method by Cruz, Torres e Vencovsky (1989), and non-linear, by Toler and Burrows (1998). We used the variable data tons of cane per hectare - TCH, which were provided by the Genetic Improvement Program of Sugarcane in UFSCar, including seven locations and 18 genotypes. When genotypes were grouped according to stability and yield, 17 of the 18 genotypes evaluated were classied in the same groups, in both methods. The coecients of determination were similar, 11 genotypes showing better adjustment to the model of Cruz et al., while this number was seven for the Toler and Burrows\' model. The analysis indicated that both methodologies produced similiar results.
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Interação genótipo-ambiente em bovinos de corte compostos / Genotype-environment interaction in composite beef cattle

Mário Luiz Santana Júnior 29 July 2011 (has links)
Objetivou-se com o presente estudo foram caracterizar e definir ambientes homogêneos de produção de bovinos de corte compostos no Brasil com relação às variáveis climáticas e geográficas, utilizando técnicas exploratórias multivariadas. Verificar a presença de interação genótipo-ambiente (GxE) nas características peso ao nascimento (PN), peso a desmama (PD), ganho de peso da desmama ao sobreano (GP), perímetro escrotal (PE) e musculosidade (MUS). Pela análise de agrupamento não-hierárquico foram agrupadas as regiões similares com relação às variáveis ambientais. Foram formados seis grupos de fazendas. A inclusão do efeito de interação touro-grupo foi avaliada em análises uni-característica. Comparou-se um modelo com o efeito de interação touro-grupo com outro sem esse efeito. Incluir o efeito de interação touro-GEO no modelo de avaliação genética do PN, PD e PE não resultou melhor ajuste aos dados, no entanto não deve ser descartada a hipótese de se considerar outros tipos de efeitos de GxE. Foram estimados parâmetros genéticos por meio de análises multi-característica, considerando-se a mesma característica como diferente em cada grupo de fazendas. Foi verificada heterogeneidade de variância para todas as características. Os coeficientes de herdabilidade nos grupos de fazendas para PN, PD, GP, PE e MUS variaram de 0,15 a 0,25; 0,16 a 0,25; 0,10 a 0,20; 0,17 a 0,31 e 0,17 a 0,24, respectivamente. As correlações genéticas variaram de 0,19 a 0,90 para PN, -0,02 a 0,92 para PD, 0,31 a 0,93 para GP, 0,64 a 0,89 para PE e de 0,18 a 0,80 para MUS nos grupos fazendas. As diferentes estimativas de herdabilidade obtidas entre grupos de fazendas implicam resposta à seleção diferenciada conforme o ambiente em que os animais são criados e selecionados. Pelas correlações genéticas entre as características nas diversas regiões, constatou-se GxE, indicando que os melhores reprodutores para uma determinada região não são sempre os mesmos para as demais. Um modelo hierárquico de norma de reação sob abordagem Bayesiana também foi utilizado para estimação dos componentes de variância, parâmetros genéticos e verificação da existência de GxE. Os gradientes ambientais baseados nas soluções para o efeito de grupo de contemporâneos para PN, PD, GP e PE foram -6,45 a +4,75 kg, -65 a +65 kg, -72 a +112 kg e -6.5 a +5.5 cm, respectivamente. As estimativas de herdabilidade foram crescentes no gradiente ambiental, PN (0,04 a 0,55), PD (0,39 a 0,47), GP (0,01 a 0,43) e PE (0,21 a 0,23). A correlação entre o nível e a inclinação da norma de reação para PN e GP foi de alta magnitude, indicando que os animais de maior valor genético médio foram os que apresentaram maior resposta à melhoria das condições ambientais, caracterizando o efeito de escala da GxE. Para PD e PE, a correlação entre intercepto e inclinação foi baixa implicando reclassificação dos animais em ambientes diferentes. O modelo hierárquico de normas de reação foi útil para descrever alterações nos componentes de variância decorrentes do ambiente e para descrever a presença de GxE nas características estudadas de bovinos compostos. Existe variação genética com respeito à sensibilidade dos animais, o que possibilita a seleção de genótipos mais plásticos ou mais robustos. / The objectives of this study were to characterize and define homogenous production environments of composite beef cattle in Brazil in terms of climatic and geographic variables using multivariate exploratory techniques; to evaluate the presence of genotype by environment interaction (GxE) for birth weight (BW), weaning weight (WW), postweaning gain (PWG), scrotal circumference (SC) and muscling. Nonhierarchical cluster analysis was used to group farms located in regions with similar environmental variables into clusters. Six clusters of farms were formed. The effect of sire-cluster interaction was tested by single-trait analysis. The inclusion of sire-cluster interaction in the genetic evaluation model may not result in better fit to the data for BW, WW and SC. Genetic parameters were estimated by multiple-trait analysis considering the same trait to be different in each cluster. The heritability coefficient in the clusters for BW, WW, PWG, SC and muscling ranged from 0.15 to 0.25; 0.16 to 0.25; 0.10 to 0.20; 0.17 to 0.31 and 0.17 to 0.24, respectively. The genetic correlations ranged from 0.19 to 0.90 for BW, -0.02 to 0.92 for WW, 0.31 to 0.93 for PWG, 0.64 a 0.89 for SC and 0.18 to 0.80 for muscling in the clusters of farms. The different heritability estimates between groups of farms indicates that the response to selection varies with the environment in which animals are selected. The low genetic correlations between traits in the different regions demonstrated the presence of GxE, indicating that the best sires in a certain region are not the same for the other regions. A reaction norm hierarchical model using Bayesian approach was also used for estimation of variance components, genetic parameters and to verify the existence of GxE. Environmental gradients based in solutions for the effect of contemporary groups for BW, WW, PWG and SC were -6.45 to +4.75 kg, -65 kg to +65, -72 to +112 kg and -6.5 to +5.5 cm, respectively. Heritability estimates were increasing in the environmental gradient, BW (0.04 to 0.55), WW (0.39 to 0.47), PWG (0.01 to 0.43) and SC (0.21 to 0.23). The correlation between the level and slope of reaction norm for BW and PWG was of high magnitude, indicating that animals of higher average breeding value were the ones which presented a best response to environmental improvement, characterizing a scale effect on GxE. For WW and SC, the correlation between intercept and slope was low implying reranking of animals in different environments. The reaction norm hierarchical model has been useful to describe changes in the variance components due to the environment and to describe the presence of GxE traits in composite beef cattle. There is genetic variation with respect to the sensitivity of the animals, which enables the selection of genotypes most plastics or more robust.
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Severidade de Phaeosphaeria maydis e rendimento de grãos de milho (Zea mays L.) em diferentes ambientes e doses de nitrogênio. / Severity of phaeosphaeria maydis and grain yield of maize (Zea mays L.) in several environments and nitrogen doses.

Flávio Murilo Pereira da Costa 15 January 2002 (has links)
O manejo da cultura de milho (Zea mays L.) tem incorporado os recentes avanços tecnológicos em agricultura, o que tem proporcionado aumentos significativos de rendimento. Procedimentos relativos à redução da severidade de doenças, como a causada por Phaeosphaeria maydis, tornam-se prementes. O fungo é um agente biótico que promove redução de produtividade. Tal fato está relacionado com o estresse da planta, com a severidade da doença e com as condições climáticas, principalmente umidade relativa e temperatura do ar. A ênfase da pesquisa é a de nortear mais detalhadamente as ações de manejo levando em consideração esses fatores, estabelecendo técnicas culturais racionais quando da utilização de genótipos susceptíveis. Por outro lado, mesmo utilizando genótipos tolerantes, um manejo nutricional inadequado da cultura sob condições climáticas favoráveis à doença, pode ser constatada a incidência de P. maydis com maior severidade. Sendo assim, com o objetivo de avaliar cinco diferentes genótipos de milho, sendo quatro tolerantes a P. maydis e um susceptível, foram conduzidos ensaios em quatro épocas de semeadura, as duas primeiras no campus "Luiz de Queiroz" (Local 1) e as duas últimas na Estação Experimental de Anhembi (Local 2), ambos no município de Piracicaba, sob a influência de cinco doses de nitrogênio (0; 60; 120; 180 e 240 kg/ha). De acordo com os resultados obtidos, concluiu-se que: (i) o desempenho do genótipo é dependente da época de Semeadura, e a adubação nitrogenada propicia aumento no rendimento de grãos apenas quando a condição ambiental não é limitante; e (ii) a severidade de P. maydis é dependente da época de semeadura, da dose de nitrogênio e do material genético. O estresse da planta provocado por elevadas temperaturas predispõe a cultura à incidência da doença com maior severidade. / Maize (Zea mays L.) crop management is incorporating the ultimate technological advances in Agriculture, resulting in higher yield. Procedures to reduce diseases severity, as those caused by Phaeosphaeria maydis, are becoming more important. The fungus is a biotic agent that reduces productivity due to plant stress. This is related to disease severity and climatic conditions, mainly air temperature and relative humidity. The research had the emphasis of getting better orientation for management actions, using rational agricultural techniques when susceptible genotypes are used. Under favorable climatic condition for P. maydis, the inadequate crop nutritional management results in higher severity even using tolerant genotypes. Therefore, with the purpose of evaluating five different maize genotypes (four tolerant and one susceptible to P. maydis), the field experiments were carried out in four sowing dates, the first two at "Luiz de Queiroz" campus (Location 1) and the last two at Anhembi Experimental Station (Location 2), both in Piracicaba county, São Paulo State, Brazil, making four environments, all under the influence of five nitrogen doses (0; 60; 120; 180 e 240 kg/ha). According to the results, we concluded: (i) the genotype performance depends on the sowing date, and the nitrogen fertilization increases grain yield only without environmental limitation to plant growth; and (ii) the P. maydis severity depends on the sowing date, nitrogen fertilization dose and genotype susceptibility. The stress caused by high air temperature results in higher severity incidence of P. maydis.
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Análise da interação genótipo X ambiente assistida por marcadores moleculares em milho (Zea mays L.). / Genotipe x environment interaction analysis assisted by molecular markers in maize (Zea mays L.).

Glauce Cristina Ricardo Rumin 02 May 2005 (has links)
A produtividade de grãos em milho é um caráter altamente complexo e muito dependente das condições ambientais. Neste trabalho de pesquisa, buscouse identificar regiões cromossômicas relacionadas à produtividade de grãos em milho por meio de análises de regressão múltipla stepwise, em vários ambientes. Os dados genotípicos advém da genotipagem de linhagens S2 por 163 locos RFLP, enquanto os dados fenotípicos foram obtidos de experimentos com repetições instalados em 11 locais distintos, nos quais foram avaliados os topcrosses das linhagens com quatro testadores diferentes. Foram selecionadas marcas associadas ao caráter nos diferentes ambientes, posteriormente comparadas a fim de verificar a consistência na expressão de genes das regiões detectadas. De maneira geral, observou-se que a maioria delas é ambiente-específica. Após a seleção das marcas, foi aplicado um índice de seleção de linhagens, baseado nos valores bj da regressão múltipla. O índice é composto pelo valor próprio das linhagens em topcrosses e por uma medida da complementaridade genotípica entre linhagens. As melhores linhagens, segundo o índice de seleção, foram agrupadas por testador e verificouse que a coincidência de linhagens entre locais variou de 48,5% a 80,0%. O emprego de marcadores permitiu verificar que a interação genótipo x ambiente foi devida à alta inconsistência na manifestação das regiões cromossômicas responsáveis pela produtividade de grãos em milho ao longo dos locais. Porém, a coincidência entre as linhagens indica que, mesmo na presença de interação, foi possível selecionar linhagens generalistas. / Grain yield in maize is a complex trait, highly dependent on environmental conditions. Identification of consistent chromosomal regions across environments related to this trait is desirable in the context of marker assisted selection. This work was aimed at identifying regions associated with maize grain yield by stepwise multiple regression analysis in several environments. Maize S2 lines were genotyped by 163 RFLP loci and topcrossed to four different testers. These top crosses were evaluated in 11 locations. Grain yield associated markers were identified for each environment and the consistency of expression of associated genes was verified. Most of the chromosome regions were environment specific. After marker identification for each environment, a selection index was applied, which was composed by the performance of a line in topcross and a measure of genetic complementarity. The best lines were grouped by tester across locations and the coincidence of superior lines varied from 48.5% to 80.0%. The use of molecular markers showed that genotype x environment interaction was due to a high expression inconsistency of chromosome regions related to grain yield in maize across environment. Nonetheless, the coincidence between superior lines indicated the possibility to selecting lines with good performance along environments, even in the presence of genotype x environment interaction.
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Estabilidade fenotípica de cultivares de algodoeiro herbáceo em diferentes sistemas de produção no estado do Mato Grosso. / Phenotypic stability of cotton cultivars under different production systems in the Mato Grosso state, Brazil.

Eulália Soler Sobreira Hoogerheide 08 October 2004 (has links)
No estado do Mato Grosso o cultivo do algodão herbáceo ocorre em diferentes condições edafoclimáticas e sob dois sistemas de produção: o sistema empresarial que compreende grandes áreas (entre 100 e 5.000 ha) com uso intensivo de insumos e mecanização, e o sistema familiar caracterizado por pequenas áreas (até 5 ha), menor quantidade de insumos e uso de mão-de-obra familiar. O objetivo deste trabalho foi avaliar a magnitude da interação entre cultivares e locais, o componente predominante da interação (simples ou complexa) e a estabilidade e adaptabilidade fenotípica para o caráter produção de algodão em caroço, nos dois sistemas de produção, através da metodologia de Eberhart e Russell (1966). Os experimentos foram constituídos por 28 cultivares avaliados no delineamento em blocos ao acaso com quatro repetições, em 19 municípios do Estado do Mato Grosso, em três anos agrícolas: 1998/99, 1999/00 e 2000/01. Verificou-se que a ocorrência predominante da interação foi o complexo. Os cultivares ideais, caracterizados por maior produtividade, estabilidade e adaptabilidade ampla () foram IAC/96-319, CNPA 96/1202, ITA-96, ANTARES, FMT-SATURNO e IPR-94 para o sistema empresarial; e EPAMIG PREC-1, CNPA-7H, IAC 97-86 e IPR-96 para o sistema familiar, em 1998/99, 1999/00 e 2000/01, respectivamente, indicando, também, a ocorrência de interação entre cultivares e sistemas de produção. Conseqüentemente, a avaliação de cultivares do programa de melhoramento do algodoeiro deve adotar critérios específicos para cada sistema de produção, empresarial ou familiar. / In the state of Mato Grosso, cotton is grown under different environmental conditions and two production systems: the high input system in large areas (100 to 5,000 ha), and the low input system in small areas (up to 5 ha), where only the family labor is used. The objective of this research was to evaluate the magnitude of the cultivar by location interaction, the main component of the interaction (simple or complex) and the phenotypic stability and adaptability for the trait cotton seed yield for both systems, based on Eberhart & Russell (1966)’s method. The yield trials were carried out in 19 locations of the Mato Grosso state, across three crop seasons: 1998/99, 1999/00 and 2000/01. Each experiment consisted of 28 cultivars, evaluated in a randomized block design with four replications. Cultivar by location interaction was detected for the three crop seasons, while the complex component explained most of this interaction, since the cultivar performances were not consistent over different locations. The best cultivars, characterized by higher yield, stability and broad adaptability (1=b), were IAC/96-319, CNPA 96/1202, ITA-96, ANTARES, FMT-SATURNO and IPR-94 under the high input system and EPAMIG PREC-1, CNPA-7H, IAC 97-86 and IPR-96 under the low input system, respectively for 1998/99, 1999/00 e 2000/01 crop seasons, indicating the occurrence of cultivar by production system interaction as well. Consequently, the evaluation of cultivars in cotton breeding programs must take into account the two production systems, with specific criteria for each one of them.

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