Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-05T18:51:14Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 281678 bytes, checksum: 141b60e53d7b10eac349bec016034571 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-05T18:51:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 281678 bytes, checksum: 141b60e53d7b10eac349bec016034571 (MD5) Previous issue date: 2003-06-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O comportamento agronômico de onze cultivares e uma linhagem de soja foi avaliado durante dois anos agrícolas, 1999/2000 e 2000/2001, em quatro municípios do Estado de Goiás: Chapadão do Céu, Itumbiara, Portelândia e Rio Verde. Os ensaios foram delineados em blocos casualizados com três repetições. O trabalho objetivou avaliar o desempenho dos cultivares e da linhagem com ênfase na produtividade, estimar a adaptabilidade, a estabilidade, o coeficiente de determinação genotípico e a correlação genotípica, fenotípica e ambiental entre as características consideradas em cada ensaio. Utilizaram-se quatro métodos de análise de adaptabilidade e estabilidade: EBERHART e RUSSELL (1966), LIN e BINNS (1988) modificado por CARNEIRO (1998), ANNICCHIARICO (1992) modificado por SCHMILDT (2000) e MURAKAMI e CRUZ (2001). Os genótipos tenderam a manter um comportamento semelhante, quando considerados em condições amplas e de ambientes favoráveis, pelos métodos de LIN e BINNS (1988) modificado por CARNEIRO (1998) e ANNICCHIARICO (1992) modificado por SCHMILDT (2000), contudo, em condições desfavoráveis, alterou-se expressivamente o comportamento da maioria dos cultivares. Os cultivares que se destacaram como de ampla adaptabilidade foram UFV-17 (Minas Gerais), UFV-19 (Triângulo) e UFVS-2003. CAC-1 é indicado a condições favoráveis de ambientes e Garimpo RCH a ambientes desfavoráveis. UFV-20 (Florestal) foi o cultivar de pior desempenho, seguido por UFV-16 (Capinópolis) e Doko RC. Pela metodologia de MURAKAMI e CRUZ (2001), em Chapadão do Céu e Portelândia, não foi possível indicar os melhores genótipos, pois estes ambientes apresentaram alta correlação negativa (r = - 0,3986) entre si, para produtividade de grãos. Em Itumbiara, destacaram-se: UFV-19 (Triângulo), UFV-17 (Minas Gerais), UFVS-2003 e a linhagem UFV-95 370A2121R6; e em Rio Verde: UFV-19 (Triângulo), CAC-1, UFVS-2002, UFV-17 (Minas Gerais) e UFV-16 (Capinópolis). Cultivares de ciclo precoce, como UFV-20 (Florestal), UFV-16 (Capinópolis) e Garimpo RCH, produziram menos, principalmente em condições favoráveis de ambiente. Ocorreram correlações fenotípicas positivas e significativas entre número de dias para floração com número de dias para maturação, altura de plantas e altura de inserção da primeira vagem e correlação negativa entre produtividade e altura de inserção da primeira vagem. / The agronomic behavior of eleven soy cultivars and one line was evaluated during the agricultural years of 1999/2000and 2000/2001, in four municipalities of the state of Goiás: Chapadão do Céu, Itumbiara, Portelândia, and Rio Verde. The experiments were arranged in randomized blocks with three repetitions. The objective of the work was to evaluate the performance of the soybean cultivars and line, focusing on productivity yield, and to estimate the adaptability, stability, genotypic determination coefficient, and genotypic, phenotypic and environmental correlation among the characteristics evaluated in each assay. Four methods of adaptability and stability analysis were used: EBERHART and RUSSELL (1996), LIN and BINNS (1998), modified by CARNEIRO (1998), ANNICCHIARICO (1992), modified by SCHMILDT (2000) and MURAKAMI and CRUZ (2001). The genotypes tended to maintain a similar behavior, when considered under ample and favorable environment conditions, by the methods of LIN and BINNS (1998), modified by CARNEIRO (1998) and ANNICCHIARICO (1992), modified by SCHMILDT (2000). However, under unfavorable conditions, the behavior of most of these cultivars was markedly altered. The cultivars showing high adaptability were UFV-17 (Minas Gerais), UFV-19 (Triângulo) and UFVS-2003. CAC-1 is indicated to favorable environmental conditions and Garimpo RCH to unfavorable environments. UFV-20 (Florestal) had the worst performance, followed by UFV-16 (Capinópolis) and Doko RC. Based on the methodology of MURAKAMI and CRUZ (2001), it was not possible to indicate the best genotypes in Chapadão do Céu and Portelândia, due to the high negative correlation presented by these environments (r=0.3986) for grain productivity. The cultivars UFV-19 (Triângulo), UFV-17 (Minas Gerais), UFVS-2003 and the line UFV -95 370A2121R6 had a high performance in Itumbiara and the cultivars UFV-19 (Triângulo), CAC-1, UFV-17 (Minas Gerais) and UFV-16 (Capinópolis) in Rio Verde. Early–cycle cultivars, such as UFV-20 (Florestal), UFV-16 (Capinópolis) and Garimpo RCH yielded less, especially under favorable environmental conditions. Positive and significant phenotypic correlations occurred between number of days for flowering and number of days for maturation, plant height and height of insertion of the first pod, with negative correlation occurring between productivity and height of insertion of the first pod.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-09T18:27:59Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 545585 bytes, checksum: 84e8d5f8542f3f0c928cc05bd2e74a49 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-09T18:28:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 545585 bytes, checksum: 84e8d5f8542f3f0c928cc05bd2e74a49 (MD5) Previous issue date: 2005-12-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A alta demanda por alimentos pode trazer sérios riscos à qualidade de vida da população mundial. No entanto, o crescimento da oferta dos produtos agrícolas pode ser obtido através do aumento da área e, ou, da produtividade. Um meio economicamente viável para atingir esta meta é utilizar cultivares que sejam produtivos em ambientes tecnificados e, ou, que não reduzam sua produção quando na presença de algum tipo de estresse. Em geral, as novas áreas agrícolas não têm condições ideais para o cultivo. O manejo do solo tem se apresentado como um dos principais componentes para melhorar o ambiente, aliado ao uso de variedades de plantas que adquiram e utilizem eficientemente os nutrientes disponíveis na solução e sob adsorção nos minerais do solo, principalmente o fósforo (P). Os objetivos deste trabalho também foram identificar genótipos de milho produtivos em solo com baixa disponibilidade de P e verificar a eficácia dos métodos de classificação na seleção das plantas produtivas e eficientes e na seleção precoce de plantas (casa de vegetação). Dois experimentos foram conduzidos em Viçosa-MG, um em casa de vegetação (seleção precoce), em 2002, e o outro em campo, em 2002/2003, considerando dois níveis de disponibilidade de P no solo. Outros quatro experimentos foram realizados em condições de campo, em Viçosa, Capinópolis, Coimbra e Florestal (Minas Gerais), considerando os níveis de adubação utilizados pelos agricultores. Como tratamentos foram considerados 23 genótipos de milho, sendo 15 combinações híbridas (CH) e oito cultivares. As 15 CH foram advindas da combinação de seis desses cultivares. Nos genótipos foram avaliados, em casa de vegetação, as massas secas e os teores e acúmulos de P na parte aérea, raiz e planta inteira, como também as relações parte aérea/raiz de massa seca e P acumulado. Em campo, foram avaliadas a produtividade de grãos e as alturas de planta e de espiga. Os dados foram submetidos às análises de variância simples e conjunta, ao teste de médias e às análises de correlação e dialélicas, bem como a alguns índices de eficiência nutricionais (IEN), para comparação dos genótipos quanto à tolerância e ao uso de P. Na seleção precoce de plantas, considerando a massa seca da parte aérea, as combinações híbridas CH 3 x 6 e CH 3 x 5 e os genitores AG 9010 e Caiano foram classificados como importantes para obtenção de cultivares produtivos quando em baixa disponibilidade de P. Em campo, quanto à produtividade de grãos, destacaram-se novamente os genótipos CH 3 x 6, AG 9010 e, também, o CH 1 x 3. A seleção precoce foi eficiente, pois possibilitou a presença de diferenças entre plantas quanto à aquisição e ao uso de P, assemelhando-se, em alguns casos, com os resultados obtidos em campo. Houve diferença na classificação dos genótipos, dependendo dos IEN, portanto devem-se utilizar aqueles com maior correlação com os dados de produtividade. / The high demand for foods can lead to severe risks to the quality of life of the worldwide population. However, the increase in the supply of agricultural products can be obtained by the increase of the area and / or yield. An economically viable method to reach this goal is to use high yielding cultivars in technified environments and / or that do not reduce its yield in the presence of some type of stress. In general, new agricultural frontiers do not have the ideal conditions for cultivation. Soil management has presented as one of the main components to improve the environment, along with the use of plant varieties that acquire and use the available nutrients efficiently in the solution and under adsorption in soil minerals, especially phosphorus (P). The objectives of this work were also to identify high yielding corn genotypes in soils presenting low P availability and verify the efficacy of the methods of classification in the selection of high yielding and efficient plants and of the early selection of plants (greenhouse). Two experiments were conducted in Viçosa-MG: one under greenhouse conditions (early selection), in 2002, and the other in the field, in 2002/2003, considering two levels of P availability in the soil. Other four experiments were conducted under field conditions, in Viçosa, Capinópolis, Coimbra and Florestal (Minas Gerais), considering the levels of fertilizers used by the producers. Twenty-three corn genotypes were considered as the treatments, being 15 hybrid combinations (HC) and eight cultivars. The 15 HC proceeded from the combination of six of these cultivars. For the genotypes under greenhouse conditions, the dry matter and the amount of P accumulated in the canopy, root and entire plant, as well as the canopy/root ratio of dry matter and accumulated P, were evaluated. In the field, grain yield and plant and ear height were evaluated. The data was submitted to simple and combined variance analysis, average tests and diallel and correlation analysis as well as to some nutritional efficiency indexes (NEI), for the comparison of the genotypes regarding tolerance and P use. In the early selection of plants, considering dry matter of canopy, the hybrid combinations HC 3 x 6 and HC 3 x 5 and the genitors AG 9010 and Caiano, were considered important for the obtainment of productive cultivars under low P availability. In the field, regarding grain yield, again, the genotypes HC 3 x 6, AG 9010 and also HC 1 x 3, were pointed out. The early selection was efficient, for it enabled the obtainment of differences between plants regarding the acquisition and use of P, resembling, in some cases, the results obtained in the field. There was difference in the classification of the genotypes depending on the NEI, therefore, those presenting greater correlation with the yield data should be used.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-12-01T15:19:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2159462 bytes, checksum: b0441893ed64ffdb6b2ab859e1b8ffd2 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-01T15:19:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2159462 bytes, checksum: b0441893ed64ffdb6b2ab859e1b8ffd2 (MD5) Previous issue date: 2015-04-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O “carrapato do boi” é um parasito que causa danos substanciais na produção de bovinos em áreas tropicais. Embora países como o Brasil tenham progredido em avaliações genéticas para a resistência ao carrapato, essas avaliações normalmente não tem considerado a interação genótipo x ambiente (G*A), o que pode afetar diretamente no ganho genético uma vez que a comparação entre os valores genéticos dos animais é dependente do ambiente. O objetivo desse estudo foi investigar a presença de G*A, utilizando modelos com diferentes pressuposições de variância genética e residual. Foram utilizados 10.673 contagens de carrapatos de 4.363 animais Hereford e Braford e um pedigree que continha 11.967 indivíduos. Nove modelos, sendo dois modelos animais tradicionais (MA) e sete modelos hierárquicos de normas de reação (MHNR) foram investigados. Modelos de um passo e dois passos foram usados para inferir sobre a sensibilidade dos valores genéticos ao ambiente via MHNR. O critério de informação da deviance (DIC) foi utilizado como critério estatístico na escolha do melhor modelo. O modelo de melhor ajuste foi o modelo de normas de reação de um passo com 10 classes de variâncias residuais baseados em percentis das estimativas de grupo de contemporâneos utilizadas como gradiente ambiental. Os modelos de normas de reação de um passo apresentaram as maiores estimativas de variância genética. As estimativas de variância do efeito de ambiente permanente foram, em geral, similares entre os modelos testados e variaram de 0,007 a 0,010. As estimativas de correlações genéticas entre o intercepto e a inclinação para ambos os efeitos variaram de baixa a média magnitude e apresentaram altos desvios padrão o que pode ser um indicativo de independência paramétrica. Estimativas de herdabilidades foram maiores para MHNR em comparação com MA. As estimativas de repetibilidade variaram ao longo do gradiente ambiental (de 0,18 a 0,45), o que implica na importância do efeito de ambiente permanente para a característica de resistência ao carrapato. As médias a posteriori das correlações genéticas ao longo do gradiente ambiental apresentaram um grande platô com valores acima de 0,80 para ambientes de baixa infestação de carrapatos. Os MHNR são uma poderosa ferramenta na identificação e quantificação da G*A além de ser uma alternativa promissora para as avaliações genéticas para resistência ao carrapato em bovinos Hereford e Braford, podendo elevar a eficiência de seleção e progresso genético. Melhores respostas à seleção são também esperadas em MHNR que consideram heterogeneidade de variância residual. Em um segundo estudo, foi incorporada a informação de marcador para comparar a eficiência de modelos animais convencionais e modelos de normas de reação utilizando o procedimento de um passo que combina a informação de marcador a de pedigree e também comparar o desempenho das predições de valores genéticos genômicos (GEBV) obtidos utilizando apenas o fenótipo e a informação de pedigree, como também incorporando a informação de marcador. Quatro diferentes modelos foram testados: dois modelos convencionais (BLUP) e dois de normas de reação de um passo (MNR), sendo um BLUP e um MNR com e sem informação de marcador SNP. Os modelos convencionais apresentaram um pior ajuste em comparação com os modelos de normas de reação. O modelo de normas de reação que incluiu a informação de marcador apresentou estimativa de variância genética inferior ao modelo de normas de reação que não a incluía. Estimativas de herdabilidade e repetibilidade foram, em geral, similares em ambos os modelos e variaram ao longo do gradiente ambiental de 0,07 a 0,46 e 0,20 a 0,60, respectivamente. As correlações genéticas foram notoriamente baixas entre ambientes extremos, o que indica a presença de interação genótipo x ambiente (G*A) para a característica de resistência ao carrapato. As predições de acurácias em um estudo de validação cruzada para os modelos testados foram altas e superiores a 0,55 e 0,59 para os procedimentos de partições “K-means” e partições aleatórias, respectivamente. Esses resultados sugerem que a informação de marcador não contribui para o aumento da acurácia de predição em que estas decrescem à medida que a infestação de carrapatos aumenta e, ou a relação de parentesco entre animais na população de referência e da população de validação diminui. Em um terceiro estudo, os objetivos foram: obter predições de valores genéticos em bovinos Hereford e Braford usando o procedimento de passo único que combina informação de pedigree a de marcador (ssBLUP), estimar os efeitos de marcador das normas de reação associadas com a resistência ao carrapato, bem como identificar genes candidatos derivados dos marcadores SNP mais relevantes. Um modelo de normas de reação de um passo foi ajustado para a estimação dos componentes de (co)variância e parâmetros genéticos. Para estudar os efeitos de marcadores SNP ao longo de diferentes níveis de infestação de carrapato, foram identificados os 1% SNPs mais relevantes em cada nível de infestação de carrapato e apontadas a similaridade entre estes marcadores ao longo dos níveis. Os efeitos genéticos e de ambiente permanente apresentaram significantes inclinações confirmando a presença de G*A. As correlações entre o intercepto e a inclinação foram positivas e de alta (0,52±0,18) e média (0,26±0,15) magnitudes, respectivamente, para os efeitos genéticos e de ambiente permanente. Dos 410 (1%) de SNPs identificados, 75 foram constantemente relevantes em todos os níveis ambientais e indicaram presença de interação SNP x ambiente. Os SNPs mais relevantes estão localizados nos cromossomos 1, 2, 6, 7, 9, 11, 14, 21 e 23 e genes encontrados próximos a esses marcadores apresentaram variadas funções como metabolismo energético, pigmentação do epitélio da retina, integridade e manutenção de células fotorreceptoras e diferenciação celular. / The cattle tick is a parasite that adversely affects livestock performance in tropical areas. Although countries such as Australia and Brazil have provided genetic evaluations for tick resistance, these evaluations have not typically considered genotype by environment interaction (G*E); hence genetic gains could be adversely affected as breedstock comparisons are environmentally- dependent in the presence of G*E, particularly if residual variability is also heterogeneous across environments. The objective of this study was to investigate the existence of G*E based on various models with different assumptions on genetic and residual variability. Data were collected by the Delta G Connection improvement program including 10,673 tick count phenotypes on 4,363 animals. Nine models including two traditional animal models (AM) and seven different hierarchical Bayesian reaction norm models (HBRNM) were investigated. One-step and two-step modeling approaches were used to infer upon G*E. Model choice was based on the deviance criterion information (DIC). The best-fitting model specified heterogeneous residual variances across 10 subclasses as delimited by every decile of the contemporary group estimates of tick count effects. One-step models generally had the highest estimated genetic variances. Estimates of heritabilities were generally higher for HBRNM than AM. Furthermore, one- step models based on heterogeneous residual variances also generally lead to higher heritability estimates, especially in harsh environments. Estimates of repeatability varied along the environmental gradient (range 0.18-0.45) implying that the relative importance of additive and permanent environment effects for tick resistance is environmentally influenced. The posterior means of the genetic correlations across environmental tick infestation surface plot demonstrated a large plateau above 0.80. HBRNM represent powerful tools to infer G*E and account for their effects for genetic evaluations of tick resistance. Additional increases in accuracies on estimated breeding values are also expected based on HBRNM analyses that additionally consider heterogeneity of residual variances across environments. In a second study, we incorporated marker information to compare a conventional genomic- based single step BLUP model with its one-step genomic reaction norm model extension on tick infestation phenotypes and to compare the performance of genomic estimates breeding values (GEBV) predictions obtained from using only phenotypes and phenotypes plus marker information. Four different models were tested: two conventional animal models, and two one-step reaction norm model with and without genomics. The non reaction norm models seem to be poorer fitting in comparison with its one-step extensions. The reaction norm model including marker information presented lower intercept and slope genetic variance estimates in comparison with the models that included the pedigree-based relationship matrix. Heritability and repeatability estimates were, in general, similar for both models and ranged over the environmental gradient (EG) from 0.07 to 0.46 and from 0.20 to 0.60, respectively. Genetic correlations were remarkably low between extreme EG, indicating the presence of G*E for tick resistance. Cross validation estimates were in average 0.66±0.02, 0.67±0.02, 0.67±0.02 and 0.66±0.02 for BLUP, GBLUP, GLRNM and LRNM, respectively, based on K-means partitioning, whereas GLRNM was 0.71±0.01 and tend to better than BLUP (0.67±0.01), GBLUP (0.70±0.01) and LRNM (0.70±0.01) based on random partitioning. However, no statistical significance was reported between GLRNM and LRNM. Our results also suggest that marker information do not lead for higher prediction accuracies which decreased as the tick infestation level increased and as the relationship between animals in training and validation datasets decreased. In third and last study, was aimed to perform genome-enabled predictions for tick resistance in Hereford and Braford cattle by using single step genomic BLUP methodology (ssGBLUP), to estimate marker effects from reaction norms associated with tick resistance as well as to identify candidate genes derived from the most relevant SNP markers. A one-step reaction norm model was fitted to estimate the (co)variance components and genetic parameters. To study SNP effects across different tick infestation (TI) levels, we identified the top 1% of SNPs in each TI and pointed out to the similarity between these markers across the levels. The additive genetic and permanent environment effects showed significant slope confirming the presence of G*E. Correlations between intercept and slope were positive with high (0.52±0.18) and moderate (0.26±0.15) magnitude for genetic and permanent environment effects, respectively. From the top 1% SNPs (410), 75 were consistently relevant across TI and indicated SNP by environment interaction. The most relevant SNPs were located on chromosomes 1, 2, 6, 7, 9, 11, 14, 21 and 23 and the annotated genes closest these markers showed functions related to energy metabolism, retinal pigment epithelium, maintenance and integrity of the photoreceptor cells, and cell differentiation.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-12-02T09:00:18Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1174620 bytes, checksum: 417e95559ef7632bbe3dfcc8032b71e8 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-02T09:00:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1174620 bytes, checksum: 417e95559ef7632bbe3dfcc8032b71e8 (MD5) Previous issue date: 2014-02-07 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A seleção de genótipos para eficiência no uso (EU) é fundamental, pois permite alcançar produtividades satisfatórias, com menores custos e de modo sustentável. Assim, muitos programas de melhoramento para estresse nutricional fazem seleção de genótipos para dois ou mais estresses simultaneamente. No entanto é necessário entender o efeito do tipo e da intensidade do estresse nutricional para a composição da interação genótipo-ambiente (GxA). Neste contexto, uma ferramenta muito utilizada é a modelagem via GGE Biplot (efeitos principais dos genótipos (G) mais interação genótipo-ambiente (GA)) combinada com as equações de modelos mistos. Entretanto, é necessário entender como a predição e correção dos valores genéticos para os efeitos fixos interfere nas análises da interação GxA via GGE Biplot. Diante do exposto, o objetivo foi estudar o efeito do tipo e intensidade do estresse nutricional e do tratamento estatístico nos dados utilizados para compreensão da interação genótipo-ambiente em milho tropical. Para isto, foram avaliadas 41 combinações híbridas em dois experimentos, em baixa e alta disponibilidade de N e P, delineados em blocos ao acaso com duas repetições, em esquema fatorial simples (híbridos x níveis de N ou P). Os experimentos foram conduzidos em casa de vegetação (20o45'14"S; 42o52'53"W), na Universidade Federal de Viçosa, durante o mês de outubro de 2010. As plantas foram colhidas no estádio de seis folhas completamente expandidas (V6). Foram estimados a massa de parte aérea seca (MPS) e o comprimento de raiz lateral (CRLAT). Os dados obtidos foram submetidos a análises estatísticas via REML/BLUP (Máxima Verossimilhança Restrita/Melhor Preditor Linear Não Viesado) para a obtenção dos componentes de variância e as estimativas dos parâmetros genéticos e posteriormente submetido à análise via GGE Biplot. Foi possível concluir que a avaliação e seleção de genótipos de milho tropical deve ser realizada para cada nível de disponibilidade dentro de cada tipo de estresse nutricional e a utilização de médias fenotípicas apresenta maior confiabilidade em relação aos valores genotípicos nas análises da interação GxA via GGE Biplot. / The selection of genotypes for use efficiency (UE) is essential because it allows achieving satisfactory yields with lower costs and sustainably. Thus, many nutritional stress breeding programs make a selection of genotypes for two or more stress simultaneously. However it is necessary to understand the effect of the type and intensity of nutritional stress for the composition of the genotype by environment interaction (GE). In this context, a commonly used tool is modeling via GGE biplot (genotype main effect (G) plus genotype by environment interaction (GE)) combined with mixed models. However, is necessary understand how the prediction and correction of breeding values for fixed effects change the analysis of GE interaction via GGE Biplot. Given the above, the objective was to study the effect of the type and intensity of nutritional stress and the statistical treatment given to the data used to understand the genotype-environment interaction in tropical maize. For this, 41 hybrids were evaluated in two experiments in high and low availability of N and P, using complete blocks design with two replications in a two-way scheme (hybrids x N or P levels). The experiments were conducted in a greenhouse (20o45'14"S; 42o52'53"W; 650 m), at the Federal University of Viçosa, during the month of October 2010. Plants were harvested at the V6 stage. The measured characters were dry shoot mass (MPS) and the length of lateral root (CRLAT). The data was subjected to statistical analysis via REML/BLUP (Restricted Maximum Likelihood/Best Linear Unbiased Predictor) for obtaining the variance components and estimation of genetic parameter and after subjected to analysis via GGE Biplot. Thus, we conclude that evaluation and selection of tropical maize genotypes should be performed for each level of availability within each type of nutritional stress and the use of phenotypic means has better reliability compared to the genotypic values in the analysis of GE interaction via GGE Biplot.

ALMEIDA, W. S. Potencial de genótipos de feijão-caupi para a produção de feijão verde no norte do estado do Ceará. 2013. 80 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fitotecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2013. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-08-04T23:39:19Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_wsalmeida.pdf: 1044486 bytes, checksum: 250293a9bb9d6212ab823bf06cf0556d (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-08-06T20:46:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_wsalmeida.pdf: 1044486 bytes, checksum: 250293a9bb9d6212ab823bf06cf0556d (MD5) / Made available in DSpace on 2014-08-06T20:46:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_wsalmeida.pdf: 1044486 bytes, checksum: 250293a9bb9d6212ab823bf06cf0556d (MD5) Previous issue date: 2013 / The objective of this study was to evaluate the yield potential of cowpea genotypes for the production of green beans, and select the most appropriate to recommend to farmers how to cultivate the state of Ceará. We evaluated 16 genotypes of cowpea at Pentecost and Low Acaraú municipalities of Ceará. The experimental design was a randomized block with four replications. The variables evaluated were: green pod length, green pod mass, bulk grain green pod, number of pod green beans, green beans 100 mass index, green beans, yield of green pods and grain yield green. Was performed to correct moisture from green pods, being performed by the method of soaking water from beans and green beans until constant weight. Analyses of variance were combined and used to determine the genetic variability among the genotypes. Mean values for each variable were grouped by Scott-Knott. Correlations were estimated using path analysis following the model proposed by Li, determining the direct and indirect effects of yield components. Regarding the correction of moisture pods and green beans after harvest, it was observed that the original data have higher representativeness of the dry mass and require increased experimental precision, and correction of moisture from the pods of green beans and environmental conditions evaluated not necessary. With respect to yield and its components, we observed differential response of genotypes for all traits, indicating the presence of genetic variability. The BRS Tumucumaque genotype had the highest average grain yield components and green primary production in comparison with other genotypes at Pentecost. As for the municipality of Low Acaraú genotypes MNC05-841B-49 and Paulistinha had the highest average grain yield components and green primary production in comparison with other genotypes. Observed differential response of genotypes in the environments, indicating the necessity of performing path analysis for each situation. A selection of more productive genotypes in Low Acaraú should be done through indirect selection for grain yield component of green pod, since it presents greater direct effect on productivity, high heritability and high genetic variability coefficient and CVg / CVe greater than unity. Have a selection of more productive genotypes at Pentecost must be performed by indirect selection component yield of green pods, because this has high positive correlation with grain yield green. / O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial produtivo de genótipos de feijão-caupi para a produção de feijão-verde, e selecionar o mais adequado para recomendar como cultivar aos produtores do estado do Ceará. Foram avaliados 16 genótipos de feijão-caupi em Pentecoste e Baixo Acaraú, municípios do estado do Ceará. O delineamento experimental adotado foi o de blocos casualizados com quatro repetições. As variáveis avaliadas foram: comprimento de vagem verde, massa de vagem verde, massa de grãos de vagem verde, número de grãos de vagem verde, massa de 100 grãos verdes, índice de grãos verdes, produtividade de vagens verdes e produtividade de grãos verdes. Realizou-se a correção de umidade das vagens verdes, sendo esta realizada pelo método da embebição de água das vagens e grãos verdes até atingir peso constante. As análises de variância univariada e conjunta foram utilizadas para a determinação da variabilidade genética entre os genótipos avaliados. Os valores médios de cada variável foram agrupados pelo teste de Scott-Knott. As correlações foram estimadas por meio da análise de trilha seguindo o modelo proposto por Li, determinando-se os efeitos diretos e indiretos dos componentes da produtividade. Em relação à correção de umidade das vagens e grãos verdes após a colheita, observou-se que os dados originais apresentam maiores representatividades da massa seca e pressupõem uma maior precisão experimental, sendo a correção de umidade das vagens e dos grãos verdes nas condições ambientais avaliadas desnecessária. Com relação à produtividade e seus componentes, observou-se resposta diferenciada dos genótipos para todos os caracteres avaliados, demonstrando presença de variabilidade genética. O genótipo BRS Tumucumaque apresentou as maiores médias de produtividade de grãos verdes e componentes primários da produção em relação aos demais genótipos em Pentecoste. Já para o município de Baixo Acaraú, os genótipos MNC05-841B-49 e Paulistinha apresentaram as maiores médias de produtividade de grãos verdes e componentes primários da produção em relação aos demais genótipos. Observou-se resposta diferenciada dos genótipos nos ambientes, indicando a necessidade da realização da análise de trilha para cada situação. A seleção de genótipos mais produtivos em Baixo Acaraú deve ser realizada por meio de seleção indireta pelo componente massa de grãos de vagem verde, pelo fato de apresentar maior efeito direto sobre a produtividade, alta herdabilidade e alto coeficiente de variabilidade genético e relação CVg/CVe maior que a unidade. Já a seleção de genótipos mais produtivos em Pentecoste deve ser realizada por meio de seleção indireta do componente produtividade de vagens verdes, pelo fato de apresentar correlação positiva alta com a produtividade de grãos verdes.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-16Bitstream added on 2014-06-13T18:29:30Z : No. of bitstreams: 1 guidolin_dgf_me_jabo.pdf: 239613 bytes, checksum: 25503ca97d099f8707e7f0c6cd325324 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A identificação de interação genótipo-ambiente em bovinos de corte pode auxiliar o processo de seleção, aumentando a eficiência da avaliação genética de reprodutores submetidos à ambientes distintos. Características medidas pós-desmame estão mais sujeitas aos efeitos da interação genótipoambiente do que na fase pré-desmame. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar a existência do efeito da interação genótipo-ambiente sobre os pesos corporais aos 365 (P365), 450 (P450) e aos 550 (P550) dias de idade de bovinos Nelore criados nos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais, Pará e São Paulo. Os componentes de (co)variância, parâmetros genéticos e os valores genéticos preditos foram estimados para cada característica, por estado e para o conjunto total de dados, pelo método da máxima verossimilhança restrita. Correlações de Spearman entre as classificações dos touros por estado quanto ao valor genético para cada característica ou considerando cada estado individualmente e em conjunto (todos os estados), assim como a correlação genética entre observações da mesma característica, medida em dois estados distintos foram utilizadas para avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre as características estudadas. Correlações de Spearman não significativas indicaram mudança de posição na classificação de touros e conseqüente existência de interação genótipo-ambiente. A ocorrência desta interação também foi constatada em algumas ocasiões por estimativas de correlação genética entre observações da mesma característica em estados diferentes, para P365 foi observada indícios de interação entre SP e GO (0,71), SP e MT (0,68) e também entre SP e PA (-0,11), para P450, MT e MG (-0,28), GO e PA (0,62) e SP e PA (0,66), para a característica P550, MT e MG (-0,38), MG e PA (0,73), MG e SP (-0,34) e para... / The properly identification of genotype-environment interaction in beef cattle herds can help the selection process and improve genetic evaluation of sires submitted in different environments. Post weaning traits may be more influenced by the genotype-environment interactions than others. So, this paper objective was verify genotype-environment interaction in, beef cattle, body weight at 365 (P365), 450 (P450) and 550 (P550) days of age in herds distributed in six Brazilian states, Goiás (GO), Mato Grosso (MT), Mato Grosso do Sul (MS), Minas Gerais (MG), Pará (PA) and São Paulo (SP). Genetic parameters, (co)variance components and genetic values were estimated for each trait, each state and for all states together, using maximum restricted likelihood method. Spearman correlations among sire’s classifications due to its genetic value, for each trait, by state individually or in group (using data from all states), genetic correlation between the same trait measured in two different states were used to evaluate genetic-environment interaction over the traits studied. Non significant Spearman’s correlation indicated position changes at sires classification and consequently genotype-environment interaction. This interaction occurrence was also observed between genetic correlations of the same trait measured in two different states. Genetic correlation for P365, between SP and GO states were (0, 71), SP and MT (0, 68) and also between SP and PA (-0, 11). For P450, MT and MG (-0, 28), GO and PA (0, 62) and SP and PA (0, 66). P550, MT and MG (-0, 38), MG and PA (0, 73), MG and SP (-0, 34) and SP and PA (-0, 86). There so, selection conduced considering data obtained in one state could be different than one based in others. Beef cattle summary organized by state would be indicated if this one would be economically viable.

A raça Holandesa apresenta alto rendimento na produção de leite, por isto, diversos países têm optado pela importação de sêmen para substituir as raças leiteiras locais. Esta estratégia seria eficaz se o sêmen importado fosse utilizado nas mesmas circunstâncias em que foram selecionados. Caso exista interação genótipo ambiente significativa, é esperada uma nova classificação dos touros, porém se o efeito da interação genótipo ambiente não é levada em consideração, os valores genéticos preditos (EBVs) podem ser tendenciosos, reduzindo a resposta de seleção. Diante disso, os objetivos deste trabalho foram comparar modelos de diferentes ordens de ajuste por meio de funções polinomiais de Legendre, utilizando modelos de regressão aleatória e estimar os coeficientes de herdabilidade para os teores de gordura, proteína, ácido graxo saturado, ácido graxo insaturado, e produção de leite. Além de estimar o valor genético dos animais, sob a interferência do estresse térmico. Foram utilizadas informações fenotípicas coletadas mensalmente ao longo da lactação e modelos com polinômios ortogonais de Legendre de primeira a sexta ordem, para verificar a interferência de estresse térmico, foram utilizadas informações de temperatura e umidade do dia de coleta. Os modelos que melhor se ajustaram foram os de primeira e segunda ordem. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,02 a 0,52 para teor de gordura; de 0,03 a 0,63 para teor de proteína; de 0,05 a 0,63 para ácido graxo saturado; de 0,019 a 0,364 para ácido graxo insaturado e de 0,133 a 0,390 para produção de leite nos diferentes modelos estudados. As estimativas de valores genéticos variaram de -0,5 a 0,5 em ambiente sem estresse térmico e de -0,2 a 0,2 em ambiente com estresse térmico para o teor de gordura; de -0,4 a 0,4 para ambiente sem estresse térmico e de -0,2 a 0,2 em ambiente com estresse térmico para o teor de proteína; de -0,3 a 0,3 em ambiente sem estresse térmico e de -0,2 a 0,2 em ambiente com estresse térmico para ácido graxo saturado; de -0,1 a 0,1 em ambiente sem estresse térmico e de -0,1 a 0,1 em ambiente com estresse térmico para ácido graxo insaturado e de - 6 a 6 em ambiente sem estresse térmico e de -2 e 2 em ambiente com estresse térmico para produção de leite. De acordo com os resultados, as herdabilidades indicam que o teor de gordura, proteína, ácido graxo saturado produção de leite podem ser utilizados como critério de seleção. Com o uso de informações de temperatura e umidade do ar, foi possível verificar a presença de interação genótipo ambiente para teor de gordura, proteína, ácido graxo saturado e produção de leite aos 205 dias em lactação. / Due to the high milk production of Holstein cattle, many countries have chosen to import semen to replace local dairy breeds. This strategy would be effective if these semen was used in the same circumstances in which they were selected. However, if there is significant genotype environment interaction, it is expected a new bulls ranking, but if the effect of genotype environment interaction is not considered, the estimated breeding values (EBVs) may be tendentious, reducing the selection response. The objectives of this study were estimate breeding value under heat stress and heritability coefficients, and also to compare models of different adjustment orders through Legendre polynomials, using random regression models for fat, protein, saturated fatty acid, unsaturated fatty acid and milk production. There were used phenotypic information collected monthly through the lactation period and Legendre orthogonal polynomials models from the first to sixth order. To verify the interference of heat stress, there was used temperature and humidity information on the day of the evaluation was performed. The first and second order models were the ones that better fitted. Heritability estimates were from 0.02 to 0.52 for fat; 0.03 to 0.63 for protein; 0.05 to 0.63 for saturated fatty acid; 0.019 to 0.364 for unsaturated fatty acid and 0.133 to 0.390 for milk production on the different models tested. Estimates of the genetic value were from -0.5 to 0.5 on environment without heat stress and -0.2 to 0.2 on environment with heat stress for fat; -0.4 to 0.4 on environment without heat stress and -0.2 to 0.2 on environment with heat stress for protein; -0.3 to 0.3 on environment without heat stress and -0.2 to 0.2 on environment with heat stress for saturated fatty acid; -0.1 to 0.1 on environment without heat stress and of -0.8 to 0.8 on environment with heat stress for unsaturated fatty acid; -6 to 6 on environment without heat stress and -2 to 2 on environment with heat stress for milk production. The heritability indicates that the fat, protein, saturated fatty acid and milk production can be used as selection criteria. With the use of temperature and humidity information, it was possible to verify the presence of genotype environment interaction for fat, protein, saturated fatty acid and milk production at 205 days in milk.

A produtividade e a qualidade tecnológica do trigo são influenciadas por fatores genéticos, ambientais e de manejo. A participação do ambiente na definição de caracteres componentes do rendimento e atributos qualitativos de farinha requer extensiva avaliação de genótipos em vários locais durante anos. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de anos (2007 a 2011) e regiões de cultivo (Abelardo Luz- SC, Cascavel-PR, Castro-PR, Guarapuava-PR, Não Me Toque- RS e Palotina-PR) sobre a qualidade industrial e produtividade de grãos em conjuntos de ensaios de trigo (Triticum aestivum L.), com vistas a recomendação de cultivares e identificação de regiões que maximizem a qualidade de panificação. Foram realizadas as análises de variância conjunta e calculadas as estatísticas de comparação de médias, associação entre caracteres e adaptabilidade e estabilidade dos genótipos às diferentes regiões de cultivo, utilizando analises gráficas GGE Biplot e análises AMMI. Os resultados indicam que todos os caracteres avaliados foram influenciados pelo genótipo (G), ambiente (E) interação GxE. Os caracteres determinantes da qualidade de panificação de trigo têm sua variação fenotípica controlada principalmente pelo efeito genético. As cultivares CD 150, CD 108 e IPR 85 apresentaram excelente comportamento quanto à qualidade de panificação. O ambiente de teste Não-Me-Toque é ideal para seleção de genótipos com foco no rendimento de grãos e massa do hectolitro. Ambientes ideais para a seleção de genótipos com foco na qualidade de panificação incluem, em ordem, Abelardo Luz, Cascavel e Guarapuava. / The productivity and technological quality of wheat is influenced by genetic, environmental and management factors. The environmental contribution in the definition of component traits of yield and quality attributes of flour requires extensive evaluation of genotypes in multiple locations for years. The objective of this study was to evaluate the effect of years (2007-2011) and growing regions (Abelardo Luz- SC , Cascavel - PR, Castro - PR, Guarapuava - PR , Não-Me-Toque - RS and Palotina - PR) on the quality industrial and grain yield in sets of trials of wheat ( Triticum aestivum L.), with a view to recommending cultivars and identification of regions that maximize the quality of baking. Analyses of joint variance and calculated statistical comparison of means , association between character and adaptability and stability of genotypes to different growing regions, using graphical GGE Biplot analysis and AMMI analysis were performed. The results indicate that all traits were influenced by genotype (G), environment (E) interaction GxE. The determinants of quality characters of wheat bread have their phenotypic variation mainly controlled by genetic effects. The CD 150, CD 108 and IPR 85 cultivars showed excellent behavior in relation to baking quality. The test environment Não-Me-Toque is ideal for selection of genotypes with a focus on yield and hectoliter mass. Ideal environments for the selection of genotypes with a focus on quality of bread making, in order, Abelardo Luz, Cascavel and Guarapuava.

Capes; CNPq; Fundação Araucária / As condições ambientais do cultivo do café, como clima, tipo de solo e altitude, associadas a práticas agrícolas, são responsáveis pela composição química final do grão. Além disso, o genótipo cultivado também influencia diretamente nas características essenciais da bebida, aumentando o seu valor agregado. Portanto, comprovações da origem geográfica e genotípica da genótipo do café devem ser realizadas utilizando métodos confiáveis. A espectroscopia no infravermelho próximo (NIRS), na região de 1100 a 2498 nm, foi utilizada na análise de genótipos de café arábica, cultivadas em diferentes cidades do estado do Paraná, Brasil. Como primeira aproximação, os métodos lineares, análise de componentes principais (ACP) e mínimos quadrados parciais com análise discriminante (PLS-DA), foram utilizados para a interpretação dos dados devido à complexidade e elevada quantidade de informação contida nos espectros. Os modelos PLS-DA obtidos para a classificação geográfica apresentaram uma sensibilidade média de 93,75% e uma especificidade de 100%. Já para a classificação dos genótipos a performance do PLS- DA foi de 93,75% para sensibilidade e 97,13% para a especificidade. Na tentativa de melhorar a performance e a confiabilidade de classificação foram desenvolvidos modelos de dois estágios. Tanto os scores da ACP como as variáveis latentes do PLS-DA foram alimentados em dois tipos diferentes de redes neurais artificiais, o perceptron de múltiplas camadas (MLP) e a rede de funções de base radial (RBF) que são modelos inerentemente não-lineares. Os respectivos parâmetros de arquitetura dessas redes foram otimizados através do método de busca direta simplex sequencial. Os modelos de dois estágios, linear com PLS-DA e não-linear com RBF, foram capazes de classificar geograficamente e genotipicamente com 100% de seletividade e especificidade todas as amostras de treinamento e de teste. As variáveis latentes do PLS-DA por serem determinadas levando-se em consideração a resposta desejada contêm mais informação que os scores da ACP. Já a rede RBF, por possuir um número menor de parâmetros livres e uma estrutura mais simples quando comparada à MLP, possui um treinamento mais rápido e convergente. Quando comparados com os resultados obtidos na espectroscopia de infravermelho médio (FTIR), os modelos obtidos usando os espectros NIRS apresentaram uma performance melhor e mais confiável. Estes resultados indicam que os espectros NIRS contêm informações importantes que aliadas a métodos adequados de reconhecimento de padrões resultam em uma classificação eficiente de amostras de café arábica verde por genótipo e local de cultivo. Além disso, uma análise dos loadings das variáveis latentes do PLS-DA permite associar quais bandas são características em cada classe. Essa informação pode ser correlacionada com a composição química das amostras fornecendo, assim, dados preliminares para avaliar o efeito da região de cultivo e do tipo de genótipo selecionado nas características químicas do grão de café verde. / The environmental conditions in coffee cultivation, such as climate, soil type and altitude, associated with agronomic practices, are responsible for influence the final chemical composition of the bean. They directly influence the essential features of the beverage, increasing its aggregate price. Proof of geographic and genotypic origin of the coffee genotypes must be done using reliable methods. Thus, the near infrared spectroscopy (NIRS), in the 1100 to 2498nm range, was used for analyze different coffee genotypes that were cultivated in different cities (Brazil - Paraná State). As first approach linear methods, principal components analysis (PCA) and partial least squares with discriminant analysis (PLS-DA), were used for data interpretation due to the high complexity and amount of information contained in the spectra. The obtained PLS-DA models had an average sensitivity of 93.75% and a specificity of 100% for the geographical classification. While for genopyte classification, the PLS-DA performance was 93.75% for sensitivity and 97.13% for specificity. In an attempt to improve the performance and reliability of the developed classifiers, both the PCA scores and the PLS-DA latent variables were fed into two artificial neural networks, the multilayer perceptron (MLP) and radial basis function network (RBF), that are nonlinear models. The architecture parameters of these networks were optimized using the sequential simplex method. The two-stage models, linear with PLS-DA and nonlinear with RBF, were able to classify geographically and genotypically with 100% of selectivity and specificity all the training and test samples. The latent variables of the PLS-DA are determined by taking into account the desired response, so it contains more information than the scores of the PCA. While the RBF network, by having fewer free parameters and a simpler architecture compared to the MLP, has a faster and covergente training. The spectra analysis in near-infrared region showed better results than mid-infrared spectra. These results indicate that NIRS spectra contain important information that, combined with appropriate methods of pattern recognition, allow the classification of green arabica coffee samples by genotype and growing region. Besides, the PLS-DA loadings analysis allows associating which NIRS bands are specific of each class. This information can be correlated with the samples chemical composition, providing preliminary data to evaluate the effect of growing region and genotype in the selected green coffee chemical composition.

A produtividade e a qualidade tecnológica do trigo são influenciadas por fatores genéticos, ambientais e de manejo. A participação do ambiente na definição de caracteres componentes do rendimento e atributos qualitativos de farinha requer extensiva avaliação de genótipos em vários locais durante anos. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de anos (2007 a 2011) e regiões de cultivo (Abelardo Luz- SC, Cascavel-PR, Castro-PR, Guarapuava-PR, Não Me Toque- RS e Palotina-PR) sobre a qualidade industrial e produtividade de grãos em conjuntos de ensaios de trigo (Triticum aestivum L.), com vistas a recomendação de cultivares e identificação de regiões que maximizem a qualidade de panificação. Foram realizadas as análises de variância conjunta e calculadas as estatísticas de comparação de médias, associação entre caracteres e adaptabilidade e estabilidade dos genótipos às diferentes regiões de cultivo, utilizando analises gráficas GGE Biplot e análises AMMI. Os resultados indicam que todos os caracteres avaliados foram influenciados pelo genótipo (G), ambiente (E) interação GxE. Os caracteres determinantes da qualidade de panificação de trigo têm sua variação fenotípica controlada principalmente pelo efeito genético. As cultivares CD 150, CD 108 e IPR 85 apresentaram excelente comportamento quanto à qualidade de panificação. O ambiente de teste Não-Me-Toque é ideal para seleção de genótipos com foco no rendimento de grãos e massa do hectolitro. Ambientes ideais para a seleção de genótipos com foco na qualidade de panificação incluem, em ordem, Abelardo Luz, Cascavel e Guarapuava. / The productivity and technological quality of wheat is influenced by genetic, environmental and management factors. The environmental contribution in the definition of component traits of yield and quality attributes of flour requires extensive evaluation of genotypes in multiple locations for years. The objective of this study was to evaluate the effect of years (2007-2011) and growing regions (Abelardo Luz- SC , Cascavel - PR, Castro - PR, Guarapuava - PR , Não-Me-Toque - RS and Palotina - PR) on the quality industrial and grain yield in sets of trials of wheat ( Triticum aestivum L.), with a view to recommending cultivars and identification of regions that maximize the quality of baking. Analyses of joint variance and calculated statistical comparison of means , association between character and adaptability and stability of genotypes to different growing regions, using graphical GGE Biplot analysis and AMMI analysis were performed. The results indicate that all traits were influenced by genotype (G), environment (E) interaction GxE. The determinants of quality characters of wheat bread have their phenotypic variation mainly controlled by genetic effects. The CD 150, CD 108 and IPR 85 cultivars showed excellent behavior in relation to baking quality. The test environment Não-Me-Toque is ideal for selection of genotypes with a focus on yield and hectoliter mass. Ideal environments for the selection of genotypes with a focus on quality of bread making, in order, Abelardo Luz, Cascavel and Guarapuava.